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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4381 | 2025-10-11 |
Inhibition of methylthioadenosine phosphorylase protects from experimental acute kidney injury
2025-Aug-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00138.2025
PMID:40602784
|
研究论文 | 本研究通过抑制甲基硫代腺苷磷酸化酶(MTAP)在小鼠急性肾损伤模型中展示保护作用 | 首次证明MTAP抑制在实验性急性肾损伤中的保护作用,并通过单细胞RNA测序在人类AKI活检中验证其表达特征 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅为观察性分析,缺乏临床干预验证 | 探索MTAP抑制对急性肾损伤的保护机制及治疗潜力 | 小鼠急性肾损伤模型和人类肾脏单细胞RNA测序数据 | 肾脏病学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | 基因表达数据,组织病理学数据 | 小鼠实验模型和人类肾脏活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4382 | 2025-10-11 |
Kidney organoids demonstrate that PTH1R drives a cystogenic cAMP-pPKA-pCREB axis in developmental polycystic kidney disease
2025-Aug-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00056.2025
PMID:40602764
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研究论文 | 本研究利用肾脏类器官模型揭示了PTH1R在发育性多囊肾病中驱动囊肿形成的cAMP-pPKA-pCREB信号轴 | 首次发现PTH1R作为G蛋白偶联受体在发育性多囊肾病中启动囊肿形成信号级联反应 | 研究主要基于体外类器官模型,缺乏体内验证 | 探索发育性多囊肾病的囊肿形成机制和潜在治疗靶点 | 人类诱导多能干细胞衍生的ARPKD类器官、等基因野生型类器官、人类ARPKD组织 | 发育生物学 | 多囊肾病 | 单细胞RNA测序、靶向机制研究 | 肾脏类器官模型 | 基因表达数据、组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4383 | 2025-10-08 |
The transcription factor LHX2 mediates and enhances oncogenic BMP signaling in medulloblastoma
2025-Oct, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-025-01488-6
PMID:40148468
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子LHX2在髓母细胞瘤中介导并增强致癌性BMP信号通路的分子机制 | 首次发现LHX2通过转录诱导BMP I型受体ACVR1表达,形成BMP信号的正反馈环路,并证实其在肿瘤干细胞特性和化疗耐药中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,临床转化价值需进一步验证 | 探索BMP信号通路在髓母细胞瘤中的作用机制 | 髓母细胞瘤患者来源的肿瘤样本和细胞模型 | 癌症生物学 | 髓母细胞瘤 | 空间转录组学、转录组分析、免疫组织化学、细胞移植 | 小鼠异种移植模型 | 基因表达数据、蛋白质定位数据 | 多个髓母细胞瘤亚组的患者来源肿瘤样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4384 | 2025-10-08 |
AI-Driven Analysis Unveils Functional Dynamics of Müller Cells in Retinal Autoimmune Inflammation
2025-May-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640907
PMID:40093069
|
研究论文 | 通过AI驱动的单细胞RNA测序分析揭示视网膜自身免疫炎症中Müller细胞的功能动态 | 首次使用AI辅助工具SCassist系统分析Müller细胞亚群功能,发现活化Müller细胞表达免疫检查点分子调控Th1细胞活性的新机制 | 研究基于Aire-/-小鼠模型,结果在人类视网膜中的适用性需要进一步验证 | 探究视网膜自身免疫炎症中Müller细胞的功能特性和与T细胞的相互作用 | Aire-/-小鼠视网膜中的Müller细胞和T细胞 | 单细胞转录组学 | 视网膜自身免疫炎症 | 单细胞RNA测序 | AI辅助分析工作流 | 单细胞转录组数据 | Aire-/-小鼠视网膜scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4385 | 2025-10-08 |
Machine learning predictions from unpredictable chaos
2025-Mar-19, ArXiv
PMID:40166748
|
研究论文 | 本文提出了一种名为混沌学习的新型多尺度拓扑范式,能够从混沌系统中实现准确预测 | 首次引入混沌学习概念,通过多尺度拓扑拉普拉斯算子将现实世界数据嵌入混沌动力系统,实现了对混沌系统的定量预测 | 仅使用了28个数据集和两种混沌动力系统进行概念验证,需要更多样化的数据集和系统验证 | 探索混沌系统的可预测性并建立拓扑、混沌与学习之间的桥梁 | 脑电波、蛋白质数据集、单细胞RNA测序数据和图像数据 | 机器学习 | NA | 多尺度拓扑拉普拉斯算子 | 混沌学习模型 | 脑电波、蛋白质数据、单细胞RNA测序数据、图像数据 | 28个数据集(10个脑电波、4个蛋白质数据集、13个单细胞RNA测序数据集、1个图像数据集) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4386 | 2025-10-07 |
scSTD: A Swin Transformer-Based Diffusion Model for Recovering scRNA-Seq Data
2025-Oct, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3570265
PMID:40366848
|
研究论文 | 提出一种基于Swin Transformer和扩散模型的单细胞RNA测序数据恢复方法scSTD | 首次将Swin Transformer架构与潜在扩散模型相结合用于scRNA-seq数据恢复 | 未明确说明方法在特定细胞类型或实验条件下的性能限制 | 解决单细胞RNA测序数据中的dropout事件和技术噪声问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Swin Transformer, 扩散模型, 自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4387 | 2025-10-07 |
Transcriptomic profiling of vitiligo patients shows polar immune dysregulation in involved and uninvolved skin
2025-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.06.002
PMID:40513622
|
研究论文 | 通过转录组分析揭示白癜风患者皮损和非皮损区域存在极化的免疫失调现象 | 首次全面揭示白癜风不仅皮损区域存在TH1/干扰素驱动的免疫异常,非皮损区域也表现出明显的TH2和TH17/22相关标志物上调 | 样本量相对有限(15例白癜风样本和14例健康对照),需要更大规模研究验证 | 获取白癜风皮损和非皮损区域的整体皮肤转录组特征 | 白癜风患者的皮损和非皮损皮肤活检样本 | 转录组学 | 白癜风 | RNA测序, 实时PCR, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据, 基因表达数据 | 15例白癜风皮损和非皮损样本,14例匹配健康对照 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4388 | 2025-10-06 |
An inducible model of human post-implantation development derived from primed and naive stem cells
2025-Oct-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.08.005
PMID:40885193
|
研究论文 | 本研究通过结合启动态和初始态人多能干细胞开发了可诱导干细胞胚胎模型,模拟人类植入后早期发育过程 | 首次通过结合启动态hPSC和初始态hPSC来源的转基因诱导胚外细胞,建立了可诱导的干细胞胚胎模型 | 模型尚不完美,存在一定局限性 | 研究人类植入后早期发育过程 | 人类干细胞胚胎模型 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 可诱导干细胞胚胎模型(iSCBEMs) | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4389 | 2025-10-06 |
Protocol for single-cell spatial transcriptomic profiling of cultured cells and engineered tissues without embedding or sectioning
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104074
PMID:40938748
|
研究论文 | 本文提出了一种无需包埋或切片即可对培养细胞和工程组织进行单细胞空间转录组分析的新方案 | 开发了适用于标准包埋切片不兼容的2D工程组织和细胞培养物的空间转录组分析新方法 | NA | 建立适用于特殊样本类型的空间转录组分析技术方案 | 2D工程组织和细胞培养物 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD空间技术 |
| 4390 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis reveals the attenuation of the interferon pathway as a driver of chemo-refractory ovarian cancer
2025-Sep-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102316
PMID:40885189
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示干扰素通路减弱是卵巢癌化疗耐药的关键驱动因素 | 首次发现化疗耐药卵巢癌中I型干扰素通路活性降低与缺氧通路增强的分子特征,并证实干扰素活性可独立预测化疗反应 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 探索卵巢高级别浆液性癌化疗耐药的分子机制 | DECIDER观察性试验中化疗耐药卵巢癌患者的治疗前活检样本 | 多组学分析 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,空间蛋白质分析,体外实验 | NA | 基因组学数据,转录组学数据,蛋白质组学数据 | DECIDER临床试验注册患者(NCT04846933) | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学分析 | NA | NA |
| 4391 | 2025-10-06 |
Appendiceal B lymphocytes contribute to the pathogenesis of experimental colitis through fueling colonic CD4+ T polarization
2025-Sep-11, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2025.09.001
PMID:40945653
|
研究论文 | 本研究揭示阑尾B淋巴细胞通过CCL20-CCR6轴迁移至结肠并促进CD4+ T细胞介导的Th1/Th17免疫反应,从而加剧实验性结肠炎 | 首次阐明阑尾B淋巴细胞通过特定迁移机制加剧结肠炎的具体病理机制,并提出阑尾口炎症可能代表溃疡性结肠炎的特殊亚型 | 研究主要基于动物模型,人类数据验证仍需进一步扩展 | 探究阑尾B淋巴细胞在实验性结肠炎发病机制中的作用 | 小鼠模型和溃疡性结肠炎患者的结肠组织 | 免疫学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序,免疫荧光共染色 | NA | 基因表达数据,组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4392 | 2025-10-05 |
Short-chain fatty acids from gut microbiota restore Th17/Treg balance in rheumatoid arthritis: Mechanisms and therapeutic potential
2025-Dec, Journal of translational autoimmunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.jtauto.2025.100316
PMID:41036443
|
综述 | 系统阐述肠道微生物来源的短链脂肪酸通过多重机制恢复类风湿关节炎中Th17/Treg平衡的作用及治疗潜力 | 首次系统整合多组学方法揭示肠道-关节轴机制,提出微生物组指导的个性化医疗新范式 | NA | 探讨短链脂肪酸调节Th17/Treg平衡的机制及其在类风湿关节炎治疗中的应用潜力 | 类风湿关节炎患者及临床前模型 | NA | 类风湿关节炎 | 代谢组学、单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序、空间转录组学、代谢组学 | NA | NA |
| 4393 | 2025-10-05 |
Loss of Prominin 2 expression inhibits AKT/mTOR signaling to limit glycolysis and drive ferroptosis in breast cancer cells
2025-Dec, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2025.120047
PMID:40818819
|
研究论文 | 本研究揭示了Prominin 2通过AKT/mTOR信号通路促进乳腺癌糖酵解和抑制铁死亡的致癌机制 | 首次发现PROM2通过与AKT相互作用激活mTOR信号通路,同时调控糖酵解和铁死亡两个关键生物学过程 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床转化价值需要进一步验证 | 阐明Prominin 2在乳腺癌中的致癌功能及分子机制 | 乳腺癌组织和细胞系 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,免疫组化,Western blot,RNA测序,GSEA,免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据,代谢指标数据 | 临床样本和细胞系(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 4394 | 2025-10-05 |
Meiotic cohesin RAD21L shapes 3D genome structure and transcription in the male germline
2025-Oct-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv2283
PMID:41032613
|
研究论文 | 本研究探讨减数分裂特异性黏连蛋白亚基RAD21L缺失对雄性生殖细胞3D基因组结构和基因表达的影响 | 首次揭示RAD21L在调控减数分裂染色质空间组织和异源染色体端粒相互作用中的关键作用 | 研究主要关注雄性生殖细胞,未涉及雌性生殖系统的相关机制 | 阐明RAD21L在精子发生过程中对3D基因组结构和转录调控的功能 | 雄性生殖细胞(精原细胞和初级精母细胞) | 基因组学 | 生殖系统疾病 | 荧光激活细胞分选, 高通量染色体构象捕获, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组三维结构数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 染色体构象捕获 | NA | NA |
| 4395 | 2025-10-05 |
Single-cell atlas of cervical organoids uncovers epithelial immune heterogeneity and intercellular cross-talk during Chlamydia infection
2025-Oct-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady1640
PMID:41042872
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示宫颈类器官在衣原体感染期间的免疫异性和细胞间通讯 | 首次整合患者来源宫颈类器官与单细胞转录组技术构建感染期间上皮细胞图谱,发现未感染旁观者细胞在免疫应答中的关键作用 | 研究主要聚焦上皮细胞,其他免疫细胞类型参与程度需进一步验证 | 解析宫颈上皮细胞在病原体感染过程中的免疫协调机制 | 患者来源宫颈类器官和天然宫颈组织 | 单细胞生物学 | 生殖道感染 | 单细胞RNA测序,三维类器官培养 | NA | 单细胞转录组数据,组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4396 | 2025-10-05 |
Padlock-designed MOFs triggers an "avalanche effect" to enhance apoptosis and suppress metastasis in central nervous system lymphoma
2025-Oct-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv2647
PMID:41042871
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研究论文 | 开发了一种靶向肠道巨噬细胞的卡铂锁设计MOF系统,通过肠脑轴实现中枢神经系统淋巴瘤的精准治疗 | 首次利用锁设计MOF触发“雪崩效应”,通过肠道巨噬细胞迁移实现脑靶向给药,重新定义了中枢神经系统淋巴瘤的治疗策略 | NA | 克服血脑屏障障碍,开发中枢神经系统淋巴瘤的新型治疗方法 | 中枢神经系统淋巴瘤 | 生物医学工程 | 中枢神经系统淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4397 | 2025-10-05 |
Identification of prognostic genes associated with phase separation in lung adenocarcinoma and construction of prognostic models
2025-Oct-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-17884-4
PMID:41044260
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研究论文 | 本研究通过识别与液-液相分离相关的预后基因构建了肺腺癌预后风险模型 | 首次将液-液相分离相关基因应用于肺腺癌预后预测,并整合单细胞RNA测序数据进行细胞类型特异性表达分析 | 使用公共数据库数据,缺乏外部验证队列 | 开发肺腺癌预后预测模型 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,差异表达分析,LASSO回归,多变量Cox回归 | Cox回归风险模型,列线图 | 基因表达数据,临床数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4398 | 2025-10-05 |
GWAS-informed data integration and non-coding CRISPRi screen illuminate genetic etiology of bone mineral density
2025-Oct-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03802-4
PMID:41044600
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研究论文 | 本研究通过整合GWAS数据和单细胞CRISPRi筛选,揭示了骨矿物质密度遗传病因中的效应基因 | 首次将GWAS信息与单细胞CRISPRi筛选相结合,系统识别BMD GWAS位点中的效应基因 | 研究主要基于人类胎儿成骨细胞,可能无法完全代表其他骨细胞类型或体内环境 | 阐明骨矿物质密度GWAS信号中的效应基因及其作用机制 | 人类胎儿成骨细胞和89个非编码调控元件 | 功能基因组学 | 骨质疏松症 | CRISPR干扰筛选, 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 分层LD评分回归 | CRISPRi | 基因组数据, 转录组数据 | 89个非编码元件筛选 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4399 | 2025-10-05 |
MNDA promotes immunosuppression in microsatellite instability-high colorectal cancer by facilitating PMN-MDSC infiltration via H3K18 lactylation
2025-Oct-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07097-8
PMID:41044625
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研究论文 | 本研究揭示了MNDA通过促进H3K18乳酸化修饰驱动PMN-MDSC浸润导致MSI-H结直肠癌免疫抑制的新机制 | 首次发现MNDA通过招募EP300介导CXCR2启动子H3K18乳酸化修饰,促进PMN-MDSC浸润和免疫抑制微环境形成 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本,需要更大规模的临床验证 | 探索MSI-H结直肠癌对PD-1抑制剂耐药机制并寻找新的治疗靶点 | 微卫星不稳定性高(MSI-H)结直肠癌 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, ChIP-seq, qRT-PCR, Co-IP | 小鼠MC38 MSI-H结直肠癌模型 | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 基因表达数据 | PD-1敏感和耐药结直肠癌患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4400 | 2025-10-05 |
Integrating bulk RNA-seq, scRNA-seq, and spatial transcriptomics data to identify novel post-translational modification-related molecular subtypes and therapeutic responses in hepatocellular carcinoma
2025-Oct-03, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03964-y
PMID:41044669
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |