单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10653 篇文献，本页显示第 4361 - 4380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4361 | 2025-10-05 |
Integrative scRNA-seq and transcriptomic analysis initially reveals monocyte/macrophage activation drives EV-A71-induced immune dysregulation and neural injury in severe HFMD
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1620633
PMID:40918094
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和转录组分析，揭示单核细胞/巨噬细胞激活驱动EV-A71诱导的免疫失调和重症手足口病神经损伤 | 首次结合单细胞测序和转录组分析系统揭示EV-A71感染中单核细胞/巨噬细胞早期激活机制及其与神经损伤的关联 | 样本量有限，仅比较一名重症患者和一名健康对照，需要更大规模验证 | 阐明EV-A71发展为重症手足口病的免疫机制，特别是巨噬细胞介导的免疫失调作用 | EV-A71病毒感染的单核细胞/巨噬细胞、外周血单个核细胞、神经细胞系SH-SY5Y | 单细胞生物学 | 手足口病 | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 生物信息学分析, 细胞共培养 | 细胞轨迹分析, GO注释, KEGG通路分析 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据, 细胞实验数据 | 一名EV-A71感染重症手足口病患者和一名健康对照的外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4362 | 2025-10-05 |
Exploring research trends in cancer immunotherapy via single-cell technologies: a scientometric perspective
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1640224
PMID:40918118
|
综述 | 通过文献计量学方法分析单细胞技术在癌症免疫治疗领域的研究趋势 | 首次从文献计量学角度系统分析单细胞技术在癌症免疫治疗领域的研究现状和发展趋势 | 仅基于Web of Science数据库文献，可能存在收录偏倚 | 探索单细胞技术在癌症免疫治疗领域的研究趋势和热点 | 4856篇相关科学文献 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序，空间转录组学 | 文献计量分析 | 文献元数据 | 4856篇文献 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 4363 | 2025-10-05 |
Gzmk+ CD8 T cells in inflammatory diseases
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1661755
PMID:40918115
|
综述 | 本文综述了Gzmk+ CD8 T细胞在炎症性疾病中的调控机制和功能作用 | 首次系统总结Gzmk+ CD8 T细胞这一新发现细胞亚群的非细胞毒性促炎功能 | NA | 阐明Gzmk+ CD8 T细胞在炎症性疾病中的调控机制和功能作用 | Gzmk+ CD8 T细胞 | 免疫学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4364 | 2025-10-05 |
Spatial transcriptomics uncovers immune-cell plasticity and dedifferentiation signatures in aggressive lung adenocarcinoma subtypes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1620886
PMID:40918135
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示肺腺癌亚型中免疫细胞可塑性和去分化特征 | 首次在肺腺癌中系统揭示不同组织学亚型的空间细胞组成特征和去分化状态 | 样本来源单一机构，样本量有限，需要更大规模验证 | 解析肺腺癌进展过程中亚型转变的分子特征 | 肺腺癌患者手术切除的肿瘤样本 | 空间转录组学 | 肺腺癌 | 空间转录组学 | 差异基因表达分析、空间配体-受体互作分析、轨迹推断 | 空间转录组数据 | 未明确具体样本数量 | Illumina | 空间转录组学 | Illumina NovaSeq 6000 | Illumina NovaSeq 6000测序系统 |
| 4365 | 2025-10-05 |
Exploring the biological functions and immune regulatory roles of IRAK3, TNFRSF1A, CX3CR1, and JUNB in T2DM combined with MAFLD: integrated bioinformatics and single-cell analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1587225
PMID:40918148
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学和单细胞分析，探索IRAK3、TNFRSF1A、CX3CR1和JUNB在2型糖尿病合并代谢相关脂肪肝病中的生物学功能和免疫调节作用 | 首次通过整合生物信息学分析和单细胞测序技术，系统鉴定并验证了T2DM合并MAFLD的四个自噬相关诊断生物标志物，并深入探索了细胞多样性和细胞通讯机制 | 研究主要基于公共数据库数据和动物实验，需要在人类临床样本中进一步验证 | 识别和验证与T2DM相关MAFLD的自噬相关诊断生物标志物，研究疾病进展中的调控机制 | 2型糖尿病合并代谢相关脂肪肝病的大鼠模型和人类基因表达数据 | 生物信息学 | 2型糖尿病合并代谢相关脂肪肝病 | 单细胞RNA测序, 实时荧光定量PCR, 免疫组织化学, 机器学习 | 机器学习, WGCNA分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 四个GEO数据集(GSE15653, GSE89632, GSE24807, GSE23343)和动物实验 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4366 | 2025-10-05 |
Multiomics Integration and Machine Learning Reveal Colony Stimulating Factor 3 Receptor as a Key Gene and Therapeutic Target in Crohn's Disease
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/1619237
PMID:40918404
|
研究论文 | 通过多组学整合和机器学习识别CSF3R作为克罗恩病的关键基因和治疗靶点 | 首次整合多组学数据和三种机器学习算法系统识别CSF3R在克罗恩病中的关键作用，并通过孟德尔随机化分析和实验验证其因果机制 | 样本来源和数量可能有限，需要进一步大样本验证 | 识别克罗恩病的关键分子驱动因子和潜在治疗靶点 | 克罗恩病患者和健康对照的肠道活检组织 | 机器学习 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序, qPCR, 蛋白质印迹, 免疫组织化学, 免疫荧光, 分子对接 | 随机森林, SVM-RFE, LASSO | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 克罗恩病患者和健康对照的肠道活检组织 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 4367 | 2025-10-05 |
Marker Gene-Guided Graph Neural Networks for Enhanced Spatial Transcriptomics Clustering
2025, AI medicine
DOI:10.53941/aim.2025.100001
PMID:40918416
|
研究论文 | 提出一种基于标记基因引导图神经网络的空间转录组学聚类增强方法 | 首次将标记基因信息融入图神经网络框架，通过对比学习和少量标记基因表达标注的微调来增强细胞嵌入学习和聚类效果 | 仅在两套真实数据集上验证，需要依赖标记基因的先验知识 | 提升空间转录组学数据的聚类分析性能 | 空间转录组学数据中的细胞/点 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 图神经网络(GNN), 对比学习 | 基因表达数据, 空间位置信息 | 两套真实数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4368 | 2025-10-05 |
Role of Meox1 in promoting lung tumor vascularization and impairing CD8+ T cell mediated immunity
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1645671
PMID:40919158
|
研究论文 | 本研究探讨Meox1转录因子在促进肺肿瘤血管形成和损害CD8+ T细胞介导的免疫中的作用 | 首次系统性地通过scRNA-seq和SCENIC框架揭示Meox1在非小细胞肺癌中的转录调控网络，并证实其双重功能 | 研究主要基于动物模型系统，需要进一步验证在人类临床样本中的适用性 | 探究Meox1转录因子在肺肿瘤血管形成和免疫调节中的功能机制 | 非小细胞肺癌肿瘤组织中的内皮细胞和免疫细胞 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, siRNA基因敲除, SCENIC调控网络分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4369 | 2025-10-05 |
Organelle stresses and energetic metabolisms promote endothelial-to-mesenchymal transition and fibrosis via upregulating FOSB and MEOX1 in Alzheimer's disease
2025, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2025.1605012
PMID:40919531
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了阿尔茨海默病中细胞器应激和能量代谢重编程通过上调FOSB和MEOX1促进内皮-间质转化和纤维化的分子机制 | 首次发现细胞器应激和能量代谢重编程通过FOSB和MEOX1驱动阿尔茨海默病中的内皮-间质转化、细胞死亡和纤维化 | 主要基于小鼠模型研究，人类数据验证相对有限 | 阐明阿尔茨海默病中内皮-间质转化、细胞死亡和纤维化的转录组机制 | 3xTg-AD小鼠模型脑组织和人类AD患者脑组织 | 转录组学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3xTg-AD小鼠模型和人类AD患者脑组织样本 | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4370 | 2025-10-05 |
BCAP31 promotes colorectal cancer metastasis via oxidative phosphorylation-dependent macrophage immunosuppression: A single-cell transcriptomic study
2025-Nov, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示BCAP31通过氧化磷酸化依赖性巨噬细胞免疫抑制促进结直肠癌转移的机制 | 首次发现BCAP31在结直肠癌转移中的关键作用，建立了10基因巨噬细胞相关预后特征，揭示了线粒体-免疫串扰新机制 | 研究样本量有限，功能验证需要进一步扩展 | 探究结直肠癌肿瘤微环境中巨噬细胞驱动的免疫抑制机制 | 结直肠癌组织和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 预后风险模型 | 单细胞转录组数据 | 结直肠癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4371 | 2025-10-05 |
Transcriptional profiling uncovers microglial HIF-1α signaling as a therapeutic target of radiation-induced brain injury
2025-Nov, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示颅脑放疗后小胶质细胞中HIF-1α信号通路的特异性激活及其在辐射性脑损伤中的关键作用 | 首次在单细胞水平发现辐射特异性激活小胶质细胞HIF-1α信号通路，该现象在传统批量分析中无法检测 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床样本中验证 | 探索辐射性脑损伤的细胞分子机制并寻找治疗靶点 | 接受颅脑放疗的小鼠模型及其小胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 辐射性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4372 | 2025-10-05 |
Multi-omics analysis of polyamine metabolism implicates NT5E/CD73 in the progression of pancreatic cancer
2025-Oct-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217887
PMID:40582491
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示多胺代谢在胰腺癌进展中的作用，并鉴定NT5E/CD73为关键调控基因 | 首次系统性地整合批量转录组学、单细胞RNA测序和功能实验，全面表征胰腺癌中多胺代谢的作用机制 | 多胺代谢在胰腺癌中的全面临床意义仍需进一步探索 | 研究多胺代谢在胰腺导管腺癌进展和免疫逃逸中的作用 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤细胞和肿瘤微环境 | 多组学分析 | 胰腺癌 | 批量转录组学,单细胞RNA测序,功能实验 | 随机森林算法,主成分分析 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 4373 | 2025-10-05 |
CEMIP2 sensitizes PDAC to chemotherapy through extracellular matrix remodeling by hyaluronan degradation
2025-Oct-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217898
PMID:40623543
|
研究论文 | 本研究揭示CEMIP2通过降解透明质酸重塑细胞外基质，增强胰腺导管腺癌对化疗的敏感性 | 首次阐明CEMIP2通过透明质酸降解调节肿瘤微环境并增强化疗疗效的分子机制 | CEMIP2在肿瘤微环境中具体作用机制仍需进一步验证 | 探究CEMIP2在胰腺导管腺癌化疗敏感性中的作用机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本和PDAC小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 飞行时间质谱流式细胞术(CyTOF) | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据 | 临床PDAC标本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 4374 | 2025-10-05 |
The greater splanchnic nerve preferentially regulates neutrophils over macrophages in a rat model of septic peritonitis
2025-Oct, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2025.05.015
PMID:40389038
|
研究论文 | 本研究通过大鼠败血症腹膜炎模型，揭示内脏大神经通过调节中性粒细胞亚群平衡来影响细菌清除的新机制 | 首次证明内脏大神经在感染急性期通过选择性调节中性粒细胞亚群平衡（激活态与静止态）来影响细菌清除，而非通过巨噬细胞 | 研究仅关注急性感染期（24小时内），未评估长期效应；机制研究主要基于相关性分析 | 阐明内脏大神经在败血症感染过程中的免疫调节作用 | 大肠杆菌诱导的败血症腹膜炎大鼠模型 | 免疫学 | 败血症 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 大鼠败血症模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4375 | 2025-10-05 |
Multimodal associations between brain morphology, immune-inflammatory markers, spatial transcriptomics, and behavioural symptoms in autism spectrum disorder
2025-Oct, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2025.07.021
PMID:40721173
|
研究论文 | 本研究通过多模态方法探讨自闭症谱系障碍中攻击行为与脑形态、免疫炎症标志物和空间转录组学的关联 | 首次结合神经内分泌标志物、脑结构差异和空间转录组学综合分析ASD攻击行为的神经生物学机制，识别了前额叶-边缘系统-纹状体网络失衡与促炎状态的复杂相互作用 | 样本量较小（42名男性参与者），缺乏纵向数据，未考虑遗传和环境因素的影响，研究结果可能不适用于更广泛的自闭症人群 | 识别自闭症谱系障碍中攻击行为的潜在机制并为治疗策略提供依据 | 42名11-38岁男性自闭症谱系障碍患者（21名攻击性患者和21名非攻击性对照） | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 多重检测分析、磁共振成像、变形基形态测量法、空间转录组学 | NA | 行为问卷数据、血浆生物标志物、脑影像数据、基因表达数据 | 42名男性ASD患者（21名攻击性，21名非攻击性），其中13名攻击性患者接受了MRI扫描 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4376 | 2025-10-05 |
Testis-specific protein HSF5 is essential for proper chromatin organization and transcriptional reprogramming to drive pachynema progression
2025-Sep-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了睾丸特异性蛋白HSF5在调控粗线期染色质组织和转录重编程中的关键作用 | 首次发现HSF5通过形成HSF5-USP7复合物抑制减数分裂性染色体上的H2AK119ub修饰，并揭示其在XY小体形成和精子蛋白酶体活性调控中的新功能 | HSF5调控转录调控网络的具体分子机制尚未完全阐明 | 阐明HSF5在哺乳动物减数分裂前期I粗线期进展中的分子调控机制 | 小鼠精母细胞 | 生殖生物学 | 男性不育症 | ATAC-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组学数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 4377 | 2025-10-05 |
Acrylamide-induced noradrenergic axon degeneration is promoted via a non-cell autonomous mechanism, involving microglial Tnfaip2/TNF-α and oxidative stress pathways
2025-Sep-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.139125
PMID:40664071
|
研究论文 | 本研究揭示了丙烯酰胺通过非细胞自主机制促进去甲肾上腺素能轴突退化的分子机制 | 首次发现丙烯酰胺通过小胶质细胞TNF-α和氧化应激通路以非细胞自主方式促进轴突退化 | 研究主要基于小鼠和细胞模型，人类相关性需进一步验证 | 探究环境毒物诱导认知功能障碍的神经退行性机制 | 小鼠脑组织、小胶质细胞BV2系、1C11神经元细胞系 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4378 | 2025-10-05 |
Mitoribosome-Targeting Antibiotics Suppress Osteoclastogenesis and Periodontitis-Induced Bone Loss by Blocking Mitochondrial Protein Synthesis
2025-Sep-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501619R
PMID:40923938
|
研究论文 | 本研究探讨靶向线粒体核糖体的抗生素雷德唑胺通过抑制线粒体蛋白质合成来抑制破骨细胞分化和牙周炎骨丢失 | 首次发现雷德唑胺通过靶向线粒体功能抑制破骨细胞分化，为牙周炎治疗提供新策略 | 研究主要基于细胞系和动物模型，尚未进行临床试验验证 | 研究雷德唑胺抑制破骨细胞分化和牙周炎骨丢失的机制 | RAW264.7细胞、骨髓来源巨噬细胞(BMM)和牙周炎大鼠模型 | 单细胞测序分析 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、电子显微镜 | NA | 基因表达数据、细胞图像 | 健康个体和重度慢性牙周炎患者的牙周组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4379 | 2025-10-05 |
Identifying potential therapeutic targets in periodontitis: a multi-omics approach integrating bulk and single-cell RNA sequencing with Mendelian randomization
2025-Sep-09, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04580-3
PMID:40921808
|
研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和转录组学分析，识别与牙周炎相关的关键基因特征 | 首次将孟德尔随机化与单细胞RNA测序相结合，识别出牙周炎的四个枢纽基因(CXCR4, ARHGDIB, PLAT, C19orf10) | 仅分析了GEO数据库中的三个独立数据集，样本来源有限 | 识别牙周炎的潜在治疗靶点和分子机制 | 牙周炎相关基因表达数据和细胞类型 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 转录组学分析, GO/KEGG富集分析 | LASSO, 随机森林 | RNA测序数据, 基因表达数据 | 三个独立数据集(来自GEO数据库) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 4380 | 2025-10-05 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics uncover the prognostic, epigenetic, and immunological roles of FANCC in low-grade glioma
2025-Sep-09, Neurological research
IF:1.7Q4
DOI:10.1080/01616412.2025.2556255
PMID:40923898
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术，揭示了FANCC在低级别胶质瘤中的预后、表观遗传和免疫调控作用 | 首次报道FANCC作为低级别胶质瘤的致癌驱动因子，通过免疫微环境重编程和DNA修复失调协同促进肿瘤进展 | NA | 全面研究FANCC在低级别胶质瘤中的临床意义、预后价值和分子机制，以确定新的治疗靶点 | 低级别胶质瘤患者样本 | 数字病理学 | 低级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, GSEA分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |