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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4341 | 2025-11-16 |
Correction: Single-cell RNA sequencing unveils Lrg1's role in cerebral ischemia‒reperfusion injury by modulating various cells
2025-Nov-14, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03610-4
PMID:41239358
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4342 | 2025-11-18 |
Aldolase a in pan-cancer and lung squamous cell carcinoma: prognostic value and macrophage-driven immune suppression unveiled by multi-omics and cohort validation
2025-Nov-14, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04043-y
PMID:41239433
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和队列验证揭示了醛缩酶A在泛癌和肺鳞癌中的预后价值及其通过巨噬细胞驱动的免疫抑制机制 | 首次系统评估ALDOA在肺鳞癌中的预后价值,并通过空间转录组学和免疫荧光证实其与肿瘤相关巨噬细胞的共定位关系 | 机制研究仍需进一步深入,治疗干预策略需要更多实验验证 | 探究ALDOA在肺鳞癌中的预后价值和其在巨噬细胞介导的免疫抑制中的作用 | 泛癌数据集和肺鳞癌患者组织样本 | 生物信息学 | 肺鳞癌 | 免疫组织化学染色,单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫荧光染色 | 生物信息学算法 | 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据,临床数据 | 多个独立患者队列 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | TISCH2数据库 |
| 4343 | 2025-11-18 |
Pan-cancer analysis identifies LMBR1L as a prognostic and immunological biomarker with validation in colorectal cancer
2025-Nov-14, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03404-7
PMID:41239456
|
研究论文 | 通过泛癌分析鉴定LMBR1L作为预后和免疫生物标志物,并在结直肠癌中进行实验验证 | 首次系统揭示LMBR1L在肿瘤免疫微环境中的作用及其作为免疫治疗预测标志物的潜力 | 研究主要基于公共数据库和结直肠癌模型,需要在更多癌种中进一步验证 | 探索LMBR1L在肿瘤免疫微环境中的功能及其临床意义 | 多种癌症组织和结直肠癌细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞测序,生存分析,GSEA,GSVA,免疫浸润分析,体外实验,体内实验 | NA | 基因表达数据,临床样本数据 | 公共数据库中的多种癌症数据及结直肠癌临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4344 | 2025-11-18 |
Glutamine metabolism reprogramming promotes bladder cancer progression via PYCR1: a multi-omics and functional validation study
2025-Nov-13, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07386-2
PMID:41233804
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和功能验证揭示了谷氨酰胺代谢重编程通过PYCR1促进膀胱癌进展的机制 | 首次构建基于谷氨酰胺代谢的预后模型GMscore,并发现PYCR1作为关键调控基因通过P5CS促进脯氨酸合成并激活PI3K/AKT/mTOR信号通路 | 未明确说明样本规模,研究主要聚焦于PYCR1机制,可能忽略其他代谢调控因子 | 探索谷氨酰胺代谢在膀胱癌中的临床意义及其与免疫治疗反应的关系 | 膀胱癌细胞系、患者队列数据、异种移植模型 | 多组学分析 | 膀胱癌 | 靶向代谢组学、单细胞RNA测序、批量转录组分析、随机森林分析、PCA | 预后模型GMscore、随机森林 | 代谢组数据、RNA测序数据、功能实验数据 | 多个患者队列(包括IMvigor210和GSE91061免疫治疗队列) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 靶向代谢组学 | NA | NA |
| 4345 | 2025-11-18 |
Rs61731397-C in OR2A25 increases the risk of chronic rhinosinusitis in the Chinese population
2025-Nov, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.06.032
PMID:40669566
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研究论文 | 本研究通过全基因组关联分析发现OR2A25基因中的rs61731397-C变异会增加中国人群慢性鼻窦炎的发病风险 | 首次在中国人群中鉴定出OR2A25基因变异与慢性鼻窦炎的关联,并通过功能实验证实该变异通过降低蛋白稳定性影响疾病发生 | 研究主要聚焦于中国人群,结果在其他人群中的普适性需要进一步验证 | 识别中国人群慢性鼻窦炎的遗传风险变异并阐明其作用机制 | 中国人群(昆山队列和北京队列) | 遗传学 | 慢性鼻窦炎 | 全基因组关联分析、单细胞RNA测序、结构预测、体外表达研究、Western blot分析 | NA | 基因组数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据 | 两个独立队列(昆山队列和北京队列) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4346 | 2025-11-18 |
Novel Genetic Loci for Nontuberculous Mycobacterial Pulmonary Disease and Potential Protective Effect of Body Mass Index
2025-Nov, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202406-1253OC
PMID:40938630
|
研究论文 | 本研究通过全基因组关联分析识别了非结核分枝杆菌肺病的新遗传位点,并发现体重指数可能具有保护作用 | 发现了两个新的NTM-PD相关遗传位点,并验证了一个已知位点,首次通过孟德尔随机化证明体重指数与NTM-PD存在潜在因果关系 | 研究样本主要来自亚洲人群,欧洲队列样本量相对较小 | 识别NTM-PD的遗传结构并探索其与风险因素的关联 | 非结核分枝杆菌肺病患者和健康对照者 | 基因组学 | 肺部疾病 | 全基因组关联研究, 单细胞转录组测序, 孟德尔随机化 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 韩国队列: 1,949例患者和2,955例对照; 日本队列: 1,137例患者和1,546例对照; 欧洲队列: 243例患者和570例对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4347 | 2025-11-18 |
Integration of single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveals neutrophil diversity and spatial heterogeneity in acute kidney injury
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148478
PMID:41135905
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示急性肾损伤中中性粒细胞的多样性和空间异质性 | 首次在AKI中鉴定出6个中性粒细胞亚群,其中3个为全新发现;发现了以中性粒细胞为中心的新型微环境单元 | NA | 阐明急性肾损伤中中性粒细胞的异质性及其在疾病进展中的作用 | 急性肾损伤模型中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4348 | 2025-11-18 |
CluVar: clustering of variants using autoencoder for inferring cancer subclones from single cell RNA sequencing data
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf603
PMID:41240059
|
研究论文 | 提出基于自编码器的CluVar框架,用于从单细胞RNA测序数据中推断癌症亚克隆的系统发育关系 | 开发了针对scRNA-seq数据高缺失率特点的自定义损失函数和多隐藏层聚类优化方法 | 未明确说明样本规模和对不同癌症类型的普适性验证 | 从单细胞RNA测序数据重建癌症亚克隆的进化轨迹 | 肿瘤组织中的恶性亚克隆 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4349 | 2025-11-18 |
Integrated spatial transcriptome and metabolism study reveals metabolic heterogeneity in human bladder cancer
2025-Nov, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00947-z
PMID:40819112
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组和空间代谢组技术,揭示了人类膀胱癌的代谢异质性 | 首次结合空间转录组学和空间代谢组学技术系统研究膀胱癌的分子机制 | NA | 探索膀胱癌恶性转化的分子机制 | 人类膀胱癌组织及癌旁正常组织 | 空间生物学 | 膀胱癌 | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | 空间转录组数据, 空间代谢组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 4350 | 2025-11-18 |
Bone morphogenetic protein 1 as a macromolecular pan-cancer biomarker modulating the immune microenvironment and malignant phenotypes in glioblastoma
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148136
PMID:41067356
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示骨形态发生蛋白1(BMP1)在胶质母细胞瘤中的致癌作用,并发现AH.6809化合物能有效抑制肿瘤生长 | 首次系统阐明BMP1在胶质母细胞瘤免疫微环境中的调控机制,并通过分子对接发现新型抑制剂AH.6809 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,需要更多体内实验验证 | 探索BMP1在胶质母细胞瘤进展和肿瘤微环境中的作用机制 | 胶质母细胞瘤细胞和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,分子对接,动态模拟,基因集富集分析 | NA | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 利用TCGA、CGGA、GEO、CPTAC、TISCH、HPA、SpatialTME等多个公共数据库 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 4351 | 2025-11-18 |
GPX2 induces macrophage M2 polarization through the MIF signaling pathway to promote colorectal cancer progression
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148341
PMID:41106750
|
研究论文 | 本研究揭示了GPX2通过MIF信号通路诱导巨噬细胞M2极化从而促进结直肠癌进展的新机制 | 首次发现GPX2通过USP7介导的去泛素化稳定MIF表达,进而促进巨噬细胞M2极化的新信号轴 | NA | 阐明GPX2在结直肠癌进展中的作用机制 | 结直肠癌细胞、巨噬细胞、动物模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4352 | 2025-11-18 |
Disease-associated microglia in neurodegenerative diseases: Friend or foe?
2025-Oct, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003426
PMID:41118343
|
综述 | 本文探讨神经退行性疾病中疾病相关小胶质细胞(DAM)的动态特征、起源及其治疗潜力 | 首次系统讨论DAM是否在所有神经退行性疾病中发挥通用传感器作用 | DAM在阿尔茨海默病模型外的普适性尚未明确验证 | 阐明疾病相关小胶质细胞在神经退行性疾病中的功能角色 | 疾病相关小胶质细胞(DAM) | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4353 | 2025-11-18 |
Single-vessel transcriptome map pathological landscapes and reveal NR2F2-mediated smooth muscle cell phenotype acquisition in capillary malformations
2025-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.02.673874
PMID:40950147
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示了毛细血管畸形中血管病理景观及NR2F2介导的平滑肌细胞表型获得机制 | 首次在单血管水平构建毛细血管畸形的空间转录组图谱,发现NR2F2在调控平滑肌细胞表型获得中的核心作用 | 研究样本量有限,主要基于体外iPSC模型验证,需要更多临床样本验证 | 探究毛细血管畸形的血管发病机制及病理重塑过程 | 毛细血管畸形病变组织及iPSC分化的血管细胞 | 空间转录组学 | 血管畸形 | 空间全转录组分析,单细胞RNA测序,磷酸化蛋白质组学,免疫荧光染色 | iPSC分化模型,Tet-on系统基因调控 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,磷酸化蛋白质组数据,免疫荧光图像 | 未明确样本数量 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序,磷酸化蛋白质组学 | GeoMx | 空间全转录组分析平台 |
| 4354 | 2025-11-18 |
Single-Cell RNA Sequencing of Ewing Sarcoma Tumors Demonstrates Transcriptional Heterogeneity and Clonal Evolution
2025-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2040
PMID:40029262
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析尤文肉瘤肿瘤的转录异质性和克隆进化 | 首次在尤文肉瘤中应用单细胞RNA测序揭示肿瘤转录异质性、克隆进化及免疫抑制微环境,并发现TSPAN8作为潜在治疗靶点 | 样本量较小(7名未治疗患者),循环肿瘤细胞验证使用独立队列 | 探究尤文肉瘤肿瘤异质性及其对治疗的意义 | 尤文肉瘤患者肿瘤组织、肿瘤微环境和循环肿瘤细胞 | 单细胞测序分析 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 7名未治疗尤文肉瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4355 | 2025-11-17 |
Next generation DNA sequencing data analysis and its application in clinical genomics
2025-Dec, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.156280
PMID:41177096
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综述 | 本文综述了新一代测序技术在临床基因组学中的应用及其数据分析方法 | 系统梳理了NGS技术在癌症研究、罕见病诊断和个性化医疗等领域的广泛应用,并展望了多组学数据整合和单细胞测序的发展前景 | 作为综述文章,未涉及具体实验设计和数据验证 | 探讨新一代测序数据分析方法及其在临床基因组学中的应用价值 | 新一代测序技术及其产生的基因组数据 | 基因组学 | 癌症,罕见病 | 新一代测序(NGS) | NA | DNA序列数据,RNA序列数据 | NA | NA | 新一代测序,单细胞测序 | NA | NA |
| 4356 | 2025-11-17 |
EMC8 expression in head and neck squamous cell carcinoma: Implications for poor prognosis and deficient CD8+ T cell infiltration
2025-Dec, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.156255
PMID:41072210
|
研究论文 | 本研究探讨EMC8在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其与预后和CD8+ T细胞浸润的关系 | 首次揭示EMC8在HNSCC中高表达与不良预后和CD8+ T细胞浸润减少的关联 | EMC8促进免疫逃避和恶性肿瘤的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究EMC8在头颈部鳞状细胞癌中的临床意义和免疫功能 | 头颈部鳞状细胞癌组织和患者临床样本 | 癌症生物学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, Kaplan-Meier生存分析 | NA | mRNA表达数据, 蛋白质表达数据, 临床生存数据, 单细胞测序数据 | HNSCC患者组织样本和临床数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4357 | 2025-11-17 |
A newly developed Germlings Harvester (GEHA) in combination with metabarcoding analysis detected numerous plankton species, particularly HABs-causing species, from in-situ germination of resting stage cells
2025-Dec, Harmful algae
IF:5.5Q1
DOI:10.1016/j.hal.2025.103002
PMID:41241549
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研究论文 | 开发了新型Germlings Harvester (GEHA)设备并结合宏条形码技术,首次实现海洋沉积物中浮游生物休眠阶段细胞的原位萌发检测 | 首次开发GEHA设备实现原位检测浮游生物休眠细胞萌发,结合宏条形码技术发现128种新型休眠阶段细胞生产者,首次观测到9种有害藻华物种的原位萌发 | 未提及方法检测限和定量准确性,尚未进行大规模推广应用验证 | 研究浮游生物休眠阶段细胞萌发对群落组成和有害藻华形成的影响 | 海洋沉积物中的浮游生物休眠阶段细胞(包括甲藻孢囊、硅藻孢子等) | 环境微生物学 | NA | 宏条形码分析、单细胞测序、克隆培养 | NA | 基因序列数据、物种鉴定数据 | 从青岛湾沉积物中鉴定出220种浮游生物物种 | NA | 宏条形码测序、单细胞测序 | NA | NA |
| 4358 | 2025-11-17 |
A single-cell multi-omics framework identifies immune cell drivers of migraine and repurposable therapeutics
2025-Nov-13, The journal of headache and pain
IF:7.3Q1
DOI:10.1186/s10194-025-02179-w
PMID:41233745
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研究论文 | 本研究通过建立单细胞多组学分析框架,识别偏头痛的免疫细胞驱动因素和可重新利用的治疗药物 | 首次整合单细胞表达数量性状位点数据和单细胞孟德尔随机化分析,系统探索偏头痛的免疫介导调控机制 | 未在文中明确说明研究的具体局限性 | 探索偏头痛的免疫遗传学基础并识别潜在治疗靶点 | 14种免疫细胞类型和9,117个独特的sc-eQTL | 生物信息学 | 偏头痛 | 单细胞表达数量性状位点分析, 单细胞孟德尔随机化, 共定位分析, 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 全表型组关联研究 | 孟德尔随机化模型, 共定位分析模型 | 单细胞基因表达数据, 基因型数据, 表型数据 | 涉及9,117个sc-eQTL和14种免疫细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4359 | 2025-11-17 |
Single-cell transcriptome analysis profiles the enlarged subsets of myeloid-biased HSPCs with preleukemic characters in disuse osteoporosis mice
2025-Nov-12, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01499-3
PMID:41225641
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了废用性骨质疏松小鼠中具有白血病前特征的髓系偏态造血干细胞祖细胞亚群的扩增机制 | 首次在骨质疏松模型中系统鉴定并表征了具有白血病前特征的髓系偏态HSPC亚群,并发现BRD4染色质重塑蛋白在此过程中的关键调控作用 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类样本中验证;BRD4抑制剂仅部分恢复表型,可能存在其他调控机制 | 探究骨质疏松条件下髓系偏态造血的发生机制及其与白血病发生的关系 | 废用性骨质疏松小鼠模型的造血干细胞祖细胞 | 单细胞转录组学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 骨质疏松小鼠模型的造血干细胞祖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4360 | 2025-11-17 |
Distinct Tumor-Associated Macrophage Signatures Shape the Immune Microenvironment and Patient Prognosis in Renal Cell Carcinoma
2025-Nov-06, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14211740
PMID:41227385
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据开发了肾细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞特征,建立了预后风险模型 | 首次在肾细胞癌中系统鉴定8种不同的肿瘤相关巨噬细胞特征,并构建27基因风险预测模型 | 研究基于回顾性数据,需要前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞特征对肾细胞癌免疫微环境和患者预后的影响 | 肾细胞癌患者及其肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序,LASSO Cox回归分析 | LASSO Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据,临床生存数据 | TCGA数据集和多个独立肾细胞癌队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |