单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10537 篇文献，本页显示第 4321 - 4340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4321 | 2025-10-05 |
High Treg and PMN-MDSC densities are a hallmark of tertiary lymphoid structures in fatal cases of cervical cancer
2025-Sep-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012613
PMID:40998518
|
研究论文 | 本研究通过分析三级淋巴结构在宫颈癌和头颈鳞癌中的密度、组成及预后影响，揭示其在HPV相关癌症中的免疫调节作用差异 | 首次发现宫颈癌中三级淋巴结构的高Treg和PMN-MDSC浸润与患者不良预后相关，不同于头颈鳞癌中三级淋巴结构密度与良好预后的正相关 | 样本来源限于HPV相关癌症，未涵盖其他癌症类型；空间转录组学分析范围有限 | 探究三级淋巴结构在HPV诱导的宫颈癌和头颈鳞癌中对抗肿瘤免疫的塑造作用及预后影响 | 宫颈癌和头颈鳞癌患者组织样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 多重免疫荧光、免疫组织化学、空间转录组学、流式细胞术 | NA | 组织切片图像、空间转录组数据、流式细胞数据 | 宫颈癌和头颈鳞癌患者组织样本（具体数量未明确） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4322 | 2025-10-05 |
Myasthenia thymus reprograms class-switched B cells into BAFF-dependent survivors
2025-Sep-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.19.677075
PMID:41000735
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示重症肌无力胸腺中B细胞通过转向BAFF依赖的生存机制逃避正常免疫耐受检查点 | 首次发现重症肌无力胸腺中发生免疫耐受检查点转换，B细胞从T细胞依赖性激活转向BAFF驱动的生存机制 | 研究样本仅限于人类胸腺组织，未验证BAFF-BCMA轴在其他自身免疫疾病中的普适性 | 解析重症肌无力中自身反应性B细胞逃避免疫耐受的分子机制 | 人类胸腺组织中的B细胞和滤泡辅助T细胞 | 单细胞组学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序,V(D)J repertoire分析,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,B细胞受体序列数据 | 237,661个细胞，来自人类胸腺样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 4323 | 2025-10-05 |
Decoding the Tumor Microenvironment: Insights and New Targets from Single-Cell Sequencing and Spatial Transcriptomics
2025-Sep-09, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090730
PMID:41020852
|
综述 | 本文探讨单细胞测序和空间转录组学技术在解析肿瘤微环境中的应用与进展 | 整合单细胞测序与空间转录组学技术，在单细胞分辨率下揭示肿瘤微环境的异质性和空间动态 | NA | 探索肿瘤微环境的分子机制并发现新的治疗靶点 | 肿瘤微环境中的细胞组成和空间结构 | 数字病理 | 癌症 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4324 | 2025-10-05 |
After the bite: cellular responses to mosquito blood feeding
2025-Sep, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2025.07.018
PMID:40803965
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和代谢组学分析埃及伊蚊吸血后中肠和脂肪体组织的细胞反应 | 首次在单细胞水平系统表征蚊子吸血后不同组织的转录组和代谢组响应，揭示了新型细胞类型和昆虫特异性病毒感染动态 | NA | 研究蚊子吸血后的细胞响应机制 | 埃及伊蚊的中肠和脂肪体组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学, 代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4325 | 2025-10-05 |
Plant metabolism: Zoom in to the single-cell level
2025-Sep-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf375
PMID:40889291
|
综述 | 本文综述了单细胞技术在植物代谢研究中的应用进展 | 整合单细胞转录组学与多组学技术揭示植物代谢产物的细胞类型特异性积累模式 | NA | 探索植物代谢产物在细胞水平上的积累规律及其调控机制 | 模式植物和药用植物 | 植物代谢组学 | NA | 质谱成像, 单细胞转录组学, 多组学 | NA | 代谢组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | NA |
| 4326 | 2025-10-05 |
TGF-β-Enriched Exosomes from Acute Myeloid Leukemia Activate Smad2/3-MMP2 and ERK1/2 Signaling to Promote Leukemic Cell Proliferation, Migration, and Immune Modulation
2025-Aug-27, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090690
PMID:41020812
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和外泌体转录组分析，揭示急性髓系白血病来源的TGF-β富集外泌体通过激活Smad2/3-MMP2和ERK1/2信号通路促进白血病进展 | 首次整合单细胞转录组与外泌体分析，发现AML外泌体通过TGF-β介导的信号通路同时增强白血病侵袭性和免疫微环境重塑的双重作用机制 | AML外泌体的精确功能特征仍未完全阐明，需要进一步研究验证 | 探究急性髓系白血病来源外泌体在肿瘤进展中的功能作用和分子机制 | 急性髓系白血病患者的骨髓穿刺样本和外泌体 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据, 外泌体转录组数据 | AML患者和健康捐赠者的骨髓穿刺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4327 | 2025-10-05 |
Histology-Based Virtual RNA Inference Identifies Pathways Associated with Metastasis Risk in Colorectal Cancer
2025-Apr-23, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.04.22.25326170
PMID:40313260
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于组织学图像的虚拟RNA推断方法，用于识别结直肠癌转移风险相关的通路 | 首次实现了直接从H&E染色组织图像推断空间转录组水平的分子信息，无需实际进行空间转录组测序 | 某些肿瘤相关通路仅靠组织学无法完全捕获 | 开发从组织学图像推断RNA表达的方法，识别结直肠癌转移风险相关通路 | 结直肠癌患者组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 虚拟RNA推断，空间转录组学 | UNI, ResNet-50, ViT, VMamba | 组织图像，基因表达数据 | 45名患者，超过300,000个Visium点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 4328 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies molecular biomarkers predicting late progression to CDK4/6 inhibition in patients with HR+/HER2- metastatic breast cancer
2025-Feb-15, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02226-9
PMID:39955556
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别预测HR+/HER2-转移性乳腺癌患者对CDK4/6抑制剂晚期进展的分子生物标志物 | 首次在单细胞水平分析CDK4/6抑制剂治疗前后肿瘤微环境变化，识别出预测晚期进展的分子特征和免疫细胞动态 | 样本量相对有限，需要更多独立队列验证生物标志物的临床适用性 | 开发预测HR+/HER2-转移性乳腺癌患者对CDK4/6抑制剂治疗反应的生物标志物 | HR+/HER2-转移性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自肝转移、胸腔积液、腹水和骨转移等多个转移部位的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4329 | 2025-10-05 |
Integrative Analysis of TLS-Associated Gene Signatures, Immune Infiltration and Drug Sensitivity in Pancreatic Cancer
2025 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70038
PMID:41016829
|
研究论文 | 本研究通过整合分析胰腺癌中三级淋巴结构相关基因特征、免疫浸润和药物敏感性，开发个性化治疗策略 | 首次系统鉴定9个TLS相关基因并建立TLS评分系统，结合单细胞RNA-seq揭示基因在免疫细胞中的分布，证明TLS评分可预测化疗药物敏感性 | 研究样本量有限，需要在更大队列中验证；机制研究尚不深入 | 开发胰腺癌个性化化疗选择策略 | 胰腺腺癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞测序数据 | 胰腺癌患者队列和Mia PaCa2、Jurkat细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4330 | 2025-10-05 |
The Single-Cell Triaptosis Regulatory Pattern in the Immune Microenvironment of Keloids
2025, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S536776
PMID:41024856
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据研究瘢痕疙瘩免疫微环境中三凋亡调控模式的作用 | 首次揭示三凋亡调控模式在瘢痕疙瘩免疫微环境中的作用，并鉴定ELMO2为关键致病基因 | NA | 探究三凋亡在瘢痕疙瘩免疫微环境形成中的调控机制 | 瘢痕疙瘩组织中的成纤维细胞和免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 公共数据库样本+自有瘢痕疙瘩样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4331 | 2025-10-05 |
Practical approaches to advanced molecular biology techniques
2025, Methods in cell biology
DOI:10.1016/bs.mcb.2025.02.022
PMID:41033726
|
研究论文 | 本章详细介绍了多种先进分子生物学技术的实验方案和应用 | 系统整合了包括CRISPR-Cas9、单细胞RNA测序等前沿分子生物学技术的实用操作指南 | NA | 为分子生物学研究提供先进技术的实践指导 | 分子生物学技术及其在细胞过程研究中的应用 | 分子生物学 | NA | CRISPR-Cas9, Real-Time PCR, 流式细胞术, ChIP-Seq, scRNA-Seq, 质谱分析, FISH | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序, 质谱蛋白质组学 | NA | NA |
| 4332 | 2025-10-05 |
CAR T cell engineering impacts antigen-independent activation and co-inhibition
2025-Dec-11, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2025.101586
PMID:41020262
|
研究论文 | 比较慢病毒载体和睡美人转座子系统在CAR-T细胞工程中的差异及其对T细胞特性的影响 | 首次系统比较病毒和非病毒CAR-T细胞工程技术对T细胞抗原非依赖性激活和共抑制状态的影响 | 样本量有限，主要基于健康供者和CLL患者的T细胞研究 | 评估不同CAR-T细胞工程技术对T细胞功能特性的影响 | 健康供者和慢性淋巴细胞白血病患者来源的T细胞 | 免疫工程 | 白血病 | 流式细胞术, 单细胞测序 | NA | 流式细胞数据, 单细胞测序数据 | 健康供者和CLL患者来源的T细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 4333 | 2025-10-05 |
Illuminating lymphoid tissue HIV reservoirs: advanced assays and their relevance to achieving an HIV cure
2025-Nov-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000974
PMID:40891589
|
综述 | 本综述探讨了用于可视化和表征淋巴组织中HIV病毒库的先进检测方法及其在实现HIV治愈中的意义 | 整合了活体显微镜、空间转录组学、新一代测序和多重单细胞分析等创新技术，揭示病毒库的异质性和病毒持久性机制 | NA | 评估当前和新兴检测方法在表征淋巴组织HIV病毒库中的应用价值 | 淋巴组织中的HIV病毒库 | NA | HIV/艾滋病 | 活体显微镜、空间转录组学、新一代测序、单细胞分析 | NA | 图像、序列数据、单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞分析 | NA | NA |
| 4334 | 2025-10-05 |
Integrated Analysis of Single-cell and Bulk RNA-Sequencing Identifies a Signature Based on Cancer-related Fibroblast Marker Genes to Predict Prognosis and Therapy Response in Lung Adenocarcinoma
2025 Nov-Dec 01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000577
PMID:40831319
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，基于癌症相关成纤维细胞标志基因构建了一个预测肺腺癌预后和治疗反应的签名 | 首次基于癌症相关成纤维细胞标志基因构建肺腺癌预后签名，整合单细胞和bulk RNA测序数据进行综合分析 | 研究样本量相对有限，需要更多独立队列验证签名的普适性 | 分析肺腺癌中癌症相关成纤维细胞标志基因表达并构建预后预测模型 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，qRT-PCR | 预后签名模型，列线图 | 基因表达数据 | 716例肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4335 | 2025-10-05 |
Single-cell multiomics reveals multiple adipogenic pathways and diverse multilineage specializations during embryonic fat tail morphogenesis
2025-Oct-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113496
PMID:41019374
|
研究论文 | 通过单细胞多组学技术揭示胚胎期脂肪尾形态发生过程中的多种脂肪生成途径和多样化的多谱系特化 | 首次在脂肪尾绵羊胚胎发育过程中应用单细胞多组学测序，揭示了脂肪沉积的三种主要细胞来源和关键增强子驱动的基因调控网络 | 研究受限于胚胎组织的时间敏感性、有限的组织体积和伦理考量 | 探究哺乳动物胚胎期脂肪生成的细胞起源和分子调控机制 | 脂肪尾绵羊胚胎发育过程中的脂肪组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞多组学测序, scRNA-seq, snATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 胚胎期E50至E80所有脂肪生成阶段的样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 4336 | 2025-10-05 |
The Role of p53 in Adipocyte Differentiation and Lipid Metabolism in Obese Mice via Transcriptional Regulation of Lgals3
2025-Oct, Obesity (Silver Spring, Md.)
DOI:10.1002/oby.24363
PMID:40897545
|
研究论文 | 本研究探讨p53通过转录调控Lgals3在肥胖小鼠脂肪细胞分化和脂质代谢中的作用 | 首次揭示p53通过转录抑制Lgals3调控脂肪细胞分化和脂质代谢的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和3T3-L1细胞系，人类临床相关性需进一步验证 | 研究p53对Lgals3表达的调控作用及其在肥胖代谢中的功能 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠和3T3-L1前脂肪细胞 | 分子生物学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 双荧光素酶报告基因检测, 染色质免疫沉淀, RT-qPCR, Western blot | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 代谢表型数据 | 6个肥胖相关微阵列数据集和单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 4337 | 2025-10-05 |
Alpha Linolenic and Stearic Acids Modulate Genes Related to Viral Entry and Inflammatory Response in THP-1 Derived Macrophages Exposed to SARS-CoV-2
2025-Oct, Food science & nutrition
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/fsn3.70529
PMID:41019181
|
研究论文 | 探讨α-亚麻酸和硬脂酸对THP-1来源巨噬细胞暴露于SARS-CoV-2时病毒进入和炎症反应相关基因的调控作用 | 首次通过单细胞RNA-seq数据发现巨噬细胞在COVID-19中基因表达的关键变化，并验证游离脂肪酸对病毒进入和炎症反应的调控作用 | 研究仅限于体外细胞实验，未进行动物模型或临床试验验证 | 阐明肥胖影响COVID-19预后的分子机制 | THP-1来源巨噬细胞和Beas2B支气管上皮细胞 | 分子生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 体外细胞实验 | NA | 基因表达数据, 细胞实验数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4338 | 2025-10-05 |
Platelet-derived growth factor signaling in porcine testicular tubular somatic cells
2025-Oct, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-025-04004-x
PMID:40839115
|
研究论文 | 本研究探讨血小板衍生生长因子信号通路在猪睾丸管状体细胞中的作用及其对细胞功能和形态发生的影响 | 首次在高等哺乳动物猪中系统研究PDGF信号通路在睾丸体细胞间的通讯机制，并发现其对细胞骨架和初级纤毛的调控作用 | 初级纤毛调控的PDGF信号在睾丸中的具体作用机制尚未明确 | 阐明PDGF信号通路在猪睾丸体细胞相互作用和形态发生中的功能 | 1周龄猪睾丸管状体细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4339 | 2025-10-05 |
Spatial Transcriptomics of Human Decidua Identifies Molecular Signatures in Recurrent Pregnancy Loss
2025-Oct-01, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf080
PMID:41031483
|
研究论文 | 通过空间转录组学分析人类蜕膜组织，揭示复发性妊娠丢失的分子特征 | 首次通过空间转录组学识别人类蜕膜中两个功能不同的空间区域，并发现FOSL2作为调控dNK1细胞空间转化的关键因子 | 研究样本仅限于早期妊娠组织，未涵盖其他妊娠阶段 | 探究人类蜕膜中免疫耐受的空间分布特征及其在复发性妊娠丢失中的失调机制 | 健康供者和复发性妊娠丢失患者的早期妊娠蜕膜组织 | 空间转录组学 | 复发性妊娠丢失 | 空间转录组学, 单细胞染色质可及性分析, 转录因子占据分析 | NA | 空间转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 健康供者和RPL患者的早期妊娠蜕膜组织 | NA | 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 4340 | 2025-10-05 |
The loss of microRNA-26b promotes aortic calcification through the regulation of cell-specific target genes
2025-Sep-29, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf117
PMID:40737220
|
研究论文 | 本研究首次揭示microRNA-26b缺失通过调控细胞特异性靶基因促进主动脉钙化的机制 | 首次发现miR-26b在主动脉钙化中的关键作用，结合单细胞转录组学和网络分析揭示细胞特异性靶点 | NA | 探索miR-26b在血管钙化中的潜在作用机制 | miR-26b基因敲除小鼠和主动脉瘤或瓣膜相关主动脉病变患者的主动脉组织 | 分子生物学 | 心血管疾病 | micro-PET/CT成像, 18F-氟化钠标记, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 网络分析 | NA | 基因表达数据, 影像数据 | miR-26bKO小鼠和人类主动脉组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |