单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
4301	2025-05-24	CAF-macrophage crosstalk in tumour microenvironments governs the response to immune checkpoint blockade in gastric cancer peritoneal metastases 2025-Feb-06, Gut IF:23.0Q1 DOI:10.1136/gutjnl-2024-333617 PMID:39537239	研究论文	本研究探讨了胃癌腹膜转移（GCPM）中肿瘤微环境内CAF-巨噬细胞间的相互作用如何影响免疫检查点阻断（ICB）治疗的响应	揭示了GCPM中独特的免疫抑制模式，主要由SPP1+肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）和THBS2+基质癌相关成纤维细胞（mCAFs）构成的基质-髓系生态位介导ICB耐药性	研究样本量有限，且为单中心II期临床试验，需要更大规模的多中心研究验证	阐明GCPM患者对ICB治疗产生耐药性的机制，并寻找潜在的治疗靶点	胃癌腹膜转移患者	肿瘤免疫学	胃癌	单细胞测序	NA	单细胞测序数据	II期临床试验患者样本（具体数量未明确说明）
4302	2025-05-24	TLR7 responses in glomerular macrophages accelerate the progression of glomerulonephritis in NZBWF1 mice 2025-Jan-27, International immunology IF:4.8Q2 DOI:10.1093/intimm/dxaf005 PMID:39868591	研究论文	本研究探讨了TLR7在肾小球巨噬细胞中的反应如何加速NZBWF1小鼠肾小球肾炎的进展	揭示了TLR7信号通过促进单核细胞迁移至肾小球及巨噬细胞产生IL-1β等机制加剧肾小球肾炎的新机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证	阐明巨噬细胞TLR7反应在肾小球肾炎进展中的作用机制	NZBWF1小鼠模型中的肾小球巨噬细胞	免疫学	系统性红斑狼疮/肾小球肾炎	scRNA-seq	基因敲除小鼠模型	基因表达数据	未明确说明样本量的NZBWF1小鼠
4303	2025-05-24	Plasticity in metastatic colorectal cancer 2025-01-20, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.018 PMID:39837278	research paper	该研究通过单细胞转录组测序技术，探索了结直肠癌（CRC）进展过程中癌细胞状态的变化	使用单细胞转录组测序技术绘制了CRC进展过程中癌细胞状态变化的图谱	NA	研究结直肠癌（CRC）进展和耐药性中癌细胞状态的变化	结直肠癌细胞	digital pathology	colorectal cancer	single-cell transcriptome sequencing	NA	transcriptomic data	NA
4304	2025-05-24	Comprehensive analysis of autophagy-related prognostic genes in breast cancer using bulk and single-cell RNA sequencing 2025, American journal of clinical and experimental immunology IF:1.4Q4 DOI:10.62347/XPCM9169 PMID:40401006	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和传统高通量RNA测序（bulk RNA-seq）分析了乳腺癌中的自噬相关基因（ARGs），并开发了一个基于3个自噬相关基因的预后模型	首次在乳腺癌中结合单细胞和批量RNA测序数据构建自噬相关基因的预后模型，并识别出FEZ1、STX11和ADAMTSL1这三个关键基因	研究样本量有限，外部验证数据集较少，且未进行功能实验验证基因的生物学机制	阐明乳腺癌中的自噬景观并开发预后模型	乳腺癌患者和肿瘤细胞	数字病理学	乳腺癌	scRNA-seq, bulk RNA-seq	Cox比例风险回归模型	RNA测序数据	TCGA数据集、GSE75688、GSE20685和GSE48390数据集中的样本
4305	2025-05-24	Erratum: Integrated Analysis of Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Combined with Multiple Machine Learning Identified a Novel Immune Signature in Diabetic Nephropathy [Corrigendum] 2025, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy DOI:10.2147/DMSO.S540734 PMID:40406633	correction	该文章是对先前发表的一篇关于糖尿病肾病免疫特征的论文的更正	NA	NA	NA	NA	NA	diabetic nephropathy	NA	NA	NA	NA
4306	2025-05-23	Mendelian randomization combined with single-cell sequencing data analysis of chemokines and chemokine receptors and key genes and molecular mechanisms associated with epilepsy 2025-Jun-04, Neuroreport IF:1.6Q4 DOI:10.1097/WNR.0000000000002168 PMID:40298633	研究论文	结合孟德尔随机化和单细胞测序数据分析趋化因子及其受体在癫痫中的作用及分子机制	首次结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，识别出与癫痫相关的关键基因和免疫细胞	研究结果需要进一步的实验验证，样本来源和数量未明确说明	探索趋化因子及其受体相关基因在癫痫中的功能和潜在调控机制	趋化因子及其受体相关基因、癫痫	生物信息学	癫痫	孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据	NA
4307	2025-05-23	Functional diversity of cardiac macrophages in health and disease 2025-Jun, Nature reviews. Cardiology DOI:10.1038/s41569-024-01109-8 PMID:39743564	review	本文综述了心脏巨噬细胞在健康和疾病中的功能多样性，探讨了它们的发育起源、转录特征以及在心脏稳态和疾病中的不同作用	利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了心脏巨噬细胞的新细胞状态和疾病相关细胞邻域	NA	探讨心脏巨噬细胞在心脏疾病发病机制中的作用，为新的治疗靶点和诊断工具的研发提供基础	心脏巨噬细胞	生物医学	心血管疾病	单细胞RNA测序, 空间转录组学	NA	基因表达数据	NA
4308	2025-05-23	The molecular mechanism by which CTSB degrades FPN to disrupt macrophage iron homeostasis and promote the progression of atherosclerosis 2025-Jun, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3 DOI:10.1007/s11010-025-05228-9 PMID:39960586	研究论文	本文研究了CTSB通过降解FPN破坏巨噬细胞铁稳态并促进动脉粥样硬化进展的分子机制	首次揭示了CTSB通过降解FPN调控巨噬细胞铁死亡进而影响动脉粥样硬化进展的分子机制	研究主要基于动物模型和体外实验，人类样本验证相对有限	阐明CTSB在动脉粥样硬化进展中的作用机制	巨噬细胞铁稳态和动脉粥样硬化斑块	分子病理学	心血管疾病	单细胞转录组分析、基因敲除、药理学抑制	ApoE敲除小鼠和高脂饮食SD大鼠模型	基因表达数据、蛋白质水平数据	两种动物模型（数量未明确）和人类AS组织单细胞数据
4309	2025-05-23	Integrated single-cell and spatial transcriptomic profiling reveals that CD177+ Tregs enhance immunosuppression through apoptosis and resistance to immunotherapy in hepatocellular carcinoma 2025-Jun, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-025-03330-2 PMID:40055567	research paper	该研究通过单细胞和空间转录组分析，发现CD177+ Tregs通过凋亡和免疫治疗抵抗增强肝细胞癌的免疫抑制	首次鉴定CD177作为肿瘤浸润Treg细胞的生物标志物，并揭示其在肝细胞癌免疫抑制中的关键作用	研究主要基于体外实验和小鼠模型，临床转化效果需进一步验证	探索肝细胞癌中Treg细胞的免疫抑制机制并寻找新的治疗靶点	CD177+ Treg细胞	癌症免疫学	肝细胞癌	单细胞转录组测序	CD177 Treg条件性敲除小鼠模型	转录组数据	NA
4310	2025-05-23	Ifosfamide alleviates autoimmune toxicity and enhances antitumor efficacy in melanoma immunotherapy 2025-06, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.bcp.2025.116851 PMID:40081767	研究论文	研究探讨了异环磷酰胺（IFO）在减轻自身免疫毒性及增强黑色素瘤免疫治疗效果中的作用	首次揭示了IFO在自身免疫条件下的广泛抑制作用，并展示了其增强CD8 T细胞活化的特异性免疫调节效应	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证IFO的效果	开发管理免疫相关不良事件（irAEs）的新策略，并增强免疫检查点抑制剂（ICI）的抗肿瘤效果	实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）小鼠模型和荷瘤小鼠	免疫治疗	黑色素瘤	单细胞RNA测序	EAU小鼠模型	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量
4311	2025-05-23	Swimming induces bone loss via regulating mechanical sensing pathways in bone marrow 2025-Jun, Mechanobiology in medicine DOI:10.1016/j.mbm.2025.100125 PMID:40395774	研究论文	该研究通过建立长期游泳训练模型，探讨了低负荷运动对骨稳态的影响机制	揭示了游泳通过调节骨髓中的机械感应通路（如Integrins和ERK1/2信号通路）诱导骨丢失的新机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探究低负荷运动（如游泳）对骨稳态的影响机制	小鼠的骨组织和骨髓细胞	骨生物学	骨丢失	单细胞测序、microCT扫描、组织学染色	小鼠长期游泳训练模型	基因表达谱数据、影像数据	未明确说明小鼠数量
4312	2025-05-23	Dual cytokine-engineered macrophages rejuvenate the tumor microenvironment and enhance anti-PD-1 therapy in renal cell carcinoma 2025-05-27, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114725 PMID:40294469	研究论文	研究开发了一种双细胞因子工程化的巨噬细胞，用于重编程肾细胞癌的肿瘤微环境并增强抗PD-1疗法的效果	开发了同时递送IL-12和CXCL-9的双细胞因子工程化巨噬细胞，能够重塑肿瘤微环境并显著增强抗PD-1疗法的效果	NA	克服肾细胞癌对抗PD-1疗法的耐药性	肾细胞癌的肿瘤微环境	肿瘤免疫治疗	肾细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
4313	2025-05-23	Bisecting GlcNAc expression by bone marrow stromal cells modulates TGF-β1-driven macrophage polarization in myeloid leukemias 2025-May-22, Haematologica IF:8.2Q1 DOI:10.3324/haematol.2024.287091 PMID:40400458	研究论文	研究骨髓基质细胞中双分N-乙酰葡萄糖胺（GlcNAc）表达如何通过TGF-β1调控髓系白血病中的巨噬细胞极化	揭示了骨髓基质细胞中特定糖链（减少的双分GlcNAc）通过TGFβ1分泌促进M2极化巨噬细胞亚型的机制，并发现这一过程提高了PD-L1表达，从而损害CD8+ T细胞功能	NA	探讨骨髓基质细胞中糖链修饰对髓系白血病肿瘤微环境中巨噬细胞极化的影响	骨髓基质细胞、肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）、CD8+ T细胞	肿瘤免疫学	髓系白血病（AML和MDS）	单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学	NA	RNA测序数据、流式细胞数据、免疫组织化学数据	NA
4314	2025-05-23	A conserved epilepsy-associated gene co-expression module identifies increased metabolic rate as a shared pathomechanism 2025-May-22, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1 DOI:10.1242/dmm.052307 PMID:40401642	研究论文	通过果蝇全脑单细胞RNA测序，研究癫痫相关基因共表达网络，揭示代谢率增加作为癫痫的共同病理机制	利用果蝇单细胞表达数据和行为验证人类基因共表达网络，首次将代谢率增加与癫痫易感性联系起来	研究结果主要基于果蝇模型，需要在人类样本中进一步验证	揭示癫痫的分子机制，特别是代谢与癫痫易感性的关系	果蝇和人类癫痫相关基因	神经科学	癫痫	单细胞RNA测序	果蝇基因敲低模型	RNA测序数据	26个基因的果蝇全脑单细胞RNA测序数据
4315	2025-05-23	Single-cell sequencing on PBMCs from HA & HB patients with inhibitors reveals different immune responses to FVIII & FIX 2025-May-22, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2025015799 PMID:40402102	研究论文	通过单细胞测序技术研究血友病A和血友病B患者对FVIII和FIX的不同免疫反应	首次在单细胞水平上比较了HA和HB患者对FVIII和FIX的免疫反应差异，揭示了淋巴细胞亚群组成和功能状态的差异	样本量较小（5例HA和5例HB患者），可能影响结果的普遍性	探索HA和HB患者对FVIII和FIX的不同免疫反应机制	血友病A和血友病B患者的外周血单个核细胞（PBMCs）	单细胞测序	血友病	单细胞测序	NA	单细胞转录组数据	5例HA患者和5例HB患者的PBMCs，共75,051个细胞
4316	2025-05-23	Myeloid Cells in Abdominal Aortic Aneurysm 2025-May-22, Current atherosclerosis reports IF:5.7Q1 DOI:10.1007/s11883-025-01302-1 PMID:40402405	review	综述了髓系细胞在腹主动脉瘤(AAA)发病机制中的关键作用及其治疗潜力	单细胞RNA测序揭示了AAA中髓系细胞的多样性，并阐明了不同髓系细胞亚群在疾病中的作用机制	临床转化面临微环境串扰和潜在脱靶效应的挑战	探讨髓系细胞在腹主动脉瘤发病机制中的作用及治疗靶向潜力	腹主动脉瘤中的髓系细胞	血管生物学	腹主动脉瘤	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
4317	2025-05-23	Gain-of-function PPM1D mutations attenuate ischemic stroke 2025-May-21, Cell death and differentiation IF:13.7Q1 DOI:10.1038/s41418-025-01523-6 PMID:40399534	研究论文	研究发现PPM1D基因的功能获得性突变可以减轻缺血性脑损伤，并验证了其药物稳定剂T2755作为缺血性中风的有前景疗法	首次发现PPM1D基因的功能获得性突变与缺血性中风患者的临床表型改善相关，并揭示了PPM1D通过PPARα途径保护内皮细胞功能的机制	研究中仅发现8例携带PPM1D突变的患者，样本量较小	探索缺血性中风的遗传基础及潜在治疗靶点	10,241名缺血性中风患者和Ppm1d缺陷小鼠	遗传学	缺血性中风	全基因组测序、空间转录组学、蛋白质组学分析	Ppm1d缺陷小鼠模型	基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据	10,241名缺血性中风患者（其中8例携带PPM1D突变）和Ppm1d缺陷小鼠
4318	2025-05-23	Synergistic effects of PA (S184N) and PB2 (E627K) mutations on the increased pathogenicity of H3N2 canine influenza virus infections in mice and dogs 2025-May-20, Journal of virology IF:4.0Q2 DOI:10.1128/jvi.01984-24 PMID:40183583	研究论文	本研究通过在小鼠体内连续传代H3N2犬流感病毒，建立了致死性感染模型，并揭示了PA(S184N)和PB2(E627K)突变协同增强病毒对狗和小鼠的致病性	首次揭示了PA(S184N)和PB2(E627K)突变在H3N2犬流感病毒中对哺乳动物适应性的协同作用，并通过单细胞RNA测序阐明了其逃避宿主抗病毒反应的机制	研究主要集中在小鼠和狗模型，对人类潜在风险的研究仍需进一步验证	阐明H3N2犬流感病毒适应哺乳动物的分子机制	H3N2犬流感病毒及其在小鼠和狗中的感染模型	病毒学	流感	单细胞RNA测序、病毒连续传代	动物感染模型	基因序列数据、病毒滴度数据	小鼠和狗的肺组织样本
4319	2025-05-23	Mucinous breast cancer organoids: an in vitro research model 2025-May-19, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02586-0 PMID:40388071	research paper	该研究建立了源自患者的黏液性乳腺癌类器官模型，用于临床药物筛选和科学研究	首次报道了黏液性乳腺癌类器官模型，并验证了其在早期传代中与原组织相似的特性	研究仅基于一名患者的样本，样本量有限	开发一种可靠的体外模型以解决纯黏液性乳腺癌的异质性问题	纯黏液性乳腺癌患者的手术肿瘤样本	digital pathology	breast cancer	single-cell RNA-Seq, histological staining, drug testing	organoid model	RNA sequencing data, histological images	1名64岁中国女性患者的肿瘤样本
4320	2025-05-23	Brain tumors induce immunoregulatory dendritic cells in draining lymph nodes that can be targeted by OX40 agonist treatment 2025-May-19, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2025-011548 PMID:40389372	research paper	该研究探讨了脑肿瘤引流淋巴结中免疫调节性树突状细胞的作用及其通过OX40激动剂治疗的潜在靶向性	揭示了脑肿瘤引流淋巴结中树突状细胞（DC-c）独特的免疫调节功能，并发现OX40信号通路在调节这些细胞功能中的关键作用	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	研究脑肿瘤免疫微环境中树突状细胞的免疫调节功能及其治疗潜力	小鼠模型中的胶质瘤和淋巴瘤	免疫学	脑肿瘤	高分辨率流式细胞术、单细胞RNA测序	小鼠模型	细胞和分子数据	NA