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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4281 | 2025-10-05 |
The prognostic model based on tumor-associated neutrophils contributes to the stromal landscape and influences metabolic reprogramming in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1587947
PMID:40963631
|
研究论文 | 基于肿瘤相关中性粒细胞构建结直肠癌预后模型,并分析其对基质景观和代谢重编程的影响 | 首次基于单细胞RNA测序数据识别18个TAN相关基因构建结直肠癌预后模型,并系统分析其与基质浸润、代谢特征和治疗反应的关系 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 开发结直肠癌预后分层标志物并探索肿瘤微环境特征 | 结直肠癌患者 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序,LASSO回归 | 预后风险评分模型,列线图 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 4282 | 2025-10-05 |
Integrating scRNA-seq and GWAS data reveals potentially critical endothelial cells in large artery atherosclerotic stroke
2025, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2025.1646993
PMID:40963808
|
研究论文 | 整合单细胞RNA测序和全基因组关联研究数据,揭示大动脉粥样硬化性卒中中潜在的关键内皮细胞亚型 | 首次整合脑血管分区结构的单细胞RNA测序数据与多种卒中类型的GWAS数据,通过遗传力分区分析卒中风险SNP位点在各类细胞中的富集情况 | 研究中使用的细胞类型和GWAS数据集有限,需要进一步验证关键内皮细胞亚型的功能作用 | 探索卒中的分子机制并确定主要的致病细胞类型 | 脑血管细胞(包括内皮细胞、平滑肌细胞、周细胞和胶质细胞) | 生物信息学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 基因集富集分析, 伪时间轨迹建模, 转录调控网络分析 | CELLEX, Monocle2, SCENIC | 基因表达数据, 基因型数据 | 14个血管细胞簇,三个GWAS数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4283 | 2025-10-05 |
Integrated single-cell and bulk RNA-seq analysis reveals prognostic stemness genes in leiomyosarcoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1604413
PMID:40963856
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA-seq数据,识别子宫肉瘤中的预后干性基因 | 首次结合单细胞和批量RNA-seq数据系统分析子宫肉瘤干性特征与预后的关系 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证 | 识别子宫肉瘤的可靠预后标志物和治疗靶点 | 子宫肉瘤患者样本 | 生物信息学 | 子宫肉瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 机器学习, Cox回归, Lasso回归 | 基因表达数据, 临床数据 | 来自GEO和TCGA数据库的子宫肉瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4284 | 2025-10-05 |
Case Report: A large granular cell tumor of the cervical esophagus with single cell RNA sequencing analysis
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1580121
PMID:40963874
|
病例报告 | 本研究报道一例大型宫颈食管颗粒细胞瘤病例,通过肌皮游离瓣修复术后缺损,并首次采用单细胞RNA测序分析肿瘤组织 | 首次对食管颗粒细胞瘤进行单细胞RNA测序分析,发现肿瘤中神经样细胞亚群富集及X染色体区域显著拷贝数变异增加 | 单一样本病例报告,结果需要更大样本量验证 | 研究食管颗粒细胞瘤的恶性潜能标志物以指导临床治疗选择 | 宫颈食管颗粒细胞瘤患者及其肿瘤组织 | 数字病理 | 食管肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者(肿瘤及癌旁组织) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4285 | 2025-10-05 |
Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis Reveals a Pathological Niche Formed by FAP+ Fibroblasts, Immune, and Endothelial Cells in Psoriatic Lesions
2025, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S541106
PMID:40963886
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组分析揭示银屑病病变中由FAP+成纤维细胞、免疫细胞和内皮细胞形成的病理生态位 | 发现银屑病病变皮肤特有的CD4+组织驻留记忆T细胞亚群和新型静脉内皮细胞亚群Venous endo2,并首次揭示这些细胞与FAP+成纤维细胞、T细胞和抗原呈递细胞在空间上的共定位形成病理生态位 | NA | 阐明银屑病病变中免疫微环境的细胞和分子相互作用机制 | 银屑病患者的病变皮肤组织 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | 基因表达数据,空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 4286 | 2025-10-05 |
Nociceptive Neurons Promote Myeloid-Derived Suppressor Cell Mobilization to Alleviate Post-Stroke Neuroinflammation
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.119474
PMID:40963921
|
研究论文 | 本研究揭示了伤害性神经元通过释放CGRP调控骨髓免疫反应缓解脑卒中后神经炎症的机制 | 首次发现伤害性神经元在脑梗死后通过CGRP信号促进髓系偏向造血和MDSC动员的神经免疫调控机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;靶向递送系统的长期安全性需进一步评估 | 探究伤害性神经元在脑卒中后免疫调控中的作用及治疗策略 | MCAO小鼠模型和卒中患者颅骨骨髓样本 | 神经免疫学 | 脑卒中 | 流式细胞术、免疫荧光、单细胞RNA测序、受体敲除、纳米颗粒递送 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、免疫荧光图像 | 小鼠模型和人类卒中患者骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4287 | 2025-10-05 |
Dimeric CCK2R radiotheranostic tracers synergize with mTOR inhibition for enhanced tumor therapy
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.117021
PMID:40963930
|
研究论文 | 本研究开发了一种新型二聚体CCK2R靶向放射性示踪剂,并探索其与mTOR抑制剂联合使用的放射增敏治疗效果 | 首次开发二聚体CCK2R靶向放射性示踪剂,并发现其与mTOR抑制剂联合使用可通过抑制谷胱甘肽介导的解毒作用和增加氧化应激来增强治疗效果 | NA | 开发新型放射性诊疗剂并探索其与mTOR抑制剂联合治疗CCK2R阳性肿瘤的协同效应 | 神经内分泌肿瘤,特别是甲状腺髓样癌和小细胞肺癌 | 放射性诊疗 | 甲状腺髓样癌,小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 分子影像数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4288 | 2025-10-05 |
Bioinformatics Analysis and Experimental Validation of Lactylation Related Genes in Lung Adenocarcinoma
2025, Cancer management and research
IF:2.5Q3
DOI:10.2147/CMAR.S533289
PMID:40964497
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证研究乳酸化修饰在肺腺癌中的作用 | 首次系统研究乳酸化修饰在肺腺癌中的表达水平及其预后价值,鉴定出5个乳酸化相关风险基因 | 样本量有限,需要更多临床样本验证,机制研究不够深入 | 探讨乳酸化修饰在肺腺癌中的表达特征及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 肺腺癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 免疫组织化学,免疫荧光,Western blot,单细胞RNA测序,多组学分析 | COX回归分析,差异表达分析 | 基因表达数据,蛋白质表达数据,单细胞测序数据 | TCGA数据库365例样本,组织芯片,H1299细胞系 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4289 | 2025-10-05 |
Research Progress of Natural Killer Cells in Hashimoto's Thyroiditis
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S545646
PMID:40964505
|
综述 | 本文综述了自然杀伤细胞在桥本甲状腺炎发病机制中的双重作用及最新研究进展 | 整合单细胞RNA测序技术揭示NK细胞功能异质性,阐明NK细胞通过不同机制在疾病不同阶段发挥促炎或调节作用 | NA | 探讨自然杀伤细胞在桥本甲状腺炎发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | 桥本甲状腺炎患者及自然杀伤细胞 | 自然语言处理 | 桥本甲状腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4290 | 2025-10-05 |
Immunobiology of primary sclerosing cholangitis
2025-Oct-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001080
PMID:39226402
|
综述 | 本文全面概述了原发性硬化性胆管炎(PSC)的免疫生物学研究进展 | 重点关注组织驻留免疫概念及单细胞RNA测序和空间转录组学等新技术带来的新认知 | 部分新发现免疫细胞类型的胆道定位及其在PSC免疫发病机制中的作用仍不完全清楚 | 探讨免疫系统在PSC发病机制中的关键作用 | 原发性硬化性胆管炎(PSC)患者肝脏免疫细胞 | 免疫生物学 | 原发性硬化性胆管炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4291 | 2025-10-05 |
Decoding the resistin-CAP1 pathway in intermediate monocytes mediating liver allograft rejection
2025-Oct, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.04.037
PMID:40345627
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示了中间单核细胞通过resistin-CAP1通路在肝移植排斥反应中的关键作用 | 首次在肝移植领域应用空间转录组学技术,发现中间单核细胞通过resistin-CAP1信号轴参与T细胞介导的排斥反应,并创新性地使用纳米金技术递送siRNA验证其治疗潜力 | 研究样本量相对有限(24个大鼠样本),主要在动物模型中进行验证,人类临床应用的可行性需要进一步验证 | 探索肝移植排斥反应的新免疫治疗靶点 | 大鼠移植肝脏和外周血单个核细胞样本,人类T细胞功能验证 | 数字病理 | 肝移植排斥反应 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术, 多因子检测, 纳米金技术 | CellChat配体-受体分析 | 基因表达数据, 空间分布数据 | 24个大鼠移植肝脏和外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4292 | 2025-10-05 |
Preterm Birth Conditions Alter Muscle Stem Cells and Their Niche, Causing Lasting Impairments in Muscle Regeneration and Function
2025-Oct, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.70058
PMID:40955870
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研究论文 | 本研究探讨早产相关条件如何通过改变肌肉干细胞及其微环境导致肌肉再生和功能持久性损伤 | 首次揭示早产通过TNF-α/NF-κB信号通路和巨噬细胞相互作用破坏肌肉干细胞功能的机制,并证明TNF-α抑制剂可恢复肌肉再生能力 | 人类样本数量有限,仅显示趋势;动物模型不能完全模拟人类早产的所有特征 | 理解早产相关条件对骨骼肌发育和功能的长期影响机制 | 啮齿动物模型和人类早产婴儿肌肉样本 | 发育生物学 | 早产相关并发症 | 单细胞转录组测序,体外细胞培养,离体肌肉收缩特性分析,体内肌肉损伤实验 | NA | 基因表达数据,细胞培养数据,肌肉功能数据 | 啮齿动物模型和人类婴儿肌肉样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4293 | 2025-10-05 |
Single-Cell Transcriptomic Atlas of Peripheral Blood Reveals B-Cell-Driven Signature Predictive of Acute Pancreatitis Severity
2025-Oct, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70350
PMID:40959459
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了外周血中B细胞驱动的特征可预测急性胰腺炎严重程度 | 首次发现MZB1表达浆细胞在急性胰腺炎中的扩张与疾病严重程度相关,并建立了九基因B细胞转录组特征预测模型 | 样本量相对有限(初始队列7例患者),需要更大规模研究验证 | 开发预测急性胰腺炎严重程度的免疫生物标志物 | 急性胰腺炎患者外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序,T细胞和B细胞受体分析 | 基因特征预测模型 | 单细胞转录组数据,血清免疫球蛋白和细胞因子数据 | 发现队列7例患者,验证队列14例患者,内部验证114例,外部验证AP患者87例,AP合并非AP败血症174例 | NA | 单细胞RNA-seq, 免疫受体分析 | NA | NA |
| 4294 | 2025-10-05 |
Deep learning-based feature discovery for decoding phenotypic plasticity in pediatric high-grade gliomas single-cell transcriptomics
2025-Oct, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110971
PMID:40848317
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研究论文 | 利用深度学习和图机器学习解码儿童高级别胶质瘤单细胞转录组中的表型可塑性特征 | 首次通过复杂网络动力学和图机器学习识别了pHGG亚型中谱系特异性可塑性的关键决定因素,发现了调控胶质瘤形态发生的网络相互作用 | NA | 解码儿童高级别胶质瘤单细胞转录组中的表型可塑性机制 | 儿童高级别胶质瘤(pHGGs)亚型:IDHWT胶质母细胞瘤和K27M突变型弥漫性中线胶质瘤 | 机器学习 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序 | 深度学习, 图机器学习 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4295 | 2025-10-05 |
Loss of BAP1 defines a unique subtype of TP53-mutated de novo AML and confers sensitivity to BCL-xL inhibitors
2025-Sep-18, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024026417
PMID:40540751
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研究论文 | 本研究揭示了BAP1缺失与TP53突变在急性髓系白血病中的协同作用机制 | 首次发现BAP1缺失与TP53突变在AML中的共现现象,并证明其通过基因组不稳定性和表观遗传失调共同促进红系白血病发生 | 未明确BAP1缺失与TP53突变协同作用的具体分子通路细节 | 探究TP53突变AML中BAP1缺失的致病机制和治疗靶点 | TP53突变急性髓系白血病患者样本和基因工程小鼠模型 | 癌症生物学 | 急性髓系白血病 | RNA测序, 染色质免疫沉淀测序, 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | TP53突变AML患者队列(其中1/3伴BAP1缺失) | NA | 单细胞RNA测序, 染色质免疫沉淀测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 4296 | 2025-10-05 |
A novel mouse model for LAMA2-related muscular dystrophy with analysis of molecular pathogenesis and clinical phenotype
2025-Sep-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.94288
PMID:40960171
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研究论文 | 本研究通过建立新型LAMA2相关肌营养不良症小鼠模型,分析其分子发病机制和临床表型 | 基于人类LAMA2-MD突变热点区域利用CRISPR-Cas9技术创建新型基因敲除小鼠模型,并首次结合单细胞和批量RNA测序分析分子机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类患者中验证相关发现 | 深入理解LAMA2相关肌营养不良症的分子发病机制 | LAMA2基因敲除小鼠(dy/dy)模型 | 数字病理学 | 肌营养不良症 | CRISPR-Cas9, scRNA-seq, bulk RNA-seq, 免疫荧光 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据, 图像数据 | 新型dy/dy小鼠模型及野生型对照 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 4297 | 2025-10-05 |
A Metabolism-Driven Prognostic Model and PSMD14-SP1-GYS1 Axis Reveal Therapeutic Vulnerabilities in Melanoma
2025-Sep-16, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.08.044
PMID:40967300
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习构建了黑色素瘤代谢相关预后模型,并揭示了PSMD14-SP1-GYS1调控轴的治疗潜力 | 开发了基于代谢相关基因的预后预测模型,首次阐明PSMD14通过K48连接去泛素化稳定SP1进而调控GYS1表达的分子机制 | 模型验证主要依赖公共数据库数据,需要更多前瞻性临床研究进一步验证 | 构建黑色素瘤预后预测模型并探索代谢相关治疗靶点 | 黑色素瘤患者和多组学数据 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 多组学分析,单细胞测序,机器学习算法 | Cox回归模型,多种机器学习算法组合 | 基因组数据,转录组数据,临床数据 | 来自TCGA、GEO、ENA等多个数据库的黑色素瘤患者数据 | NA | 单细胞测序,多组学分析 | NA | NA |
| 4298 | 2025-10-05 |
Machine learning model in multi-omics perspective demystifies the prognostic significance of crotonylation heterogeneity in clear cell renal cell carcinoma
2025-Sep-15, BMC urology
IF:1.7Q3
DOI:10.1186/s12894-025-01914-4
PMID:40954501
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了透明细胞肾细胞癌中巴豆酰化异质性的预后意义,并建立了稳健的预后模型 | 首次系统分析ccRCC中巴豆酰化异质性,整合10种机器学习算法构建5基因预后模型,结合空间转录组学和单细胞数据验证 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证和前瞻性临床研究确认模型的临床应用价值 | 阐明巴豆酰化异质性在透明细胞肾细胞癌中的预后意义并建立预后模型 | 透明细胞肾细胞癌患者和细胞系(786-O, HK-2) | 机器学习 | 肾癌 | 转录组分析, WGCNA, ssGSEA, qRT-PCR, 空间转录组学, 单细胞分析 | 机器学习集成模型(10种算法) | 转录组数据, 突变数据, 药物敏感性数据 | TCGA-KIRC队列和GEO队列(GSE40435, GSE167573, GSE29609)的多个数据集 | NA | 空间转录组学, 单细胞分析 | NA | NA |
| 4299 | 2025-10-05 |
Integrative Multiomics Identifies CD64⁺ Monocytes as Potential Contributors to Age-Related Macular Degeneration
2025-Sep-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.12.32
PMID:40952055
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研究论文 | 通过整合多组学方法识别CD64⁺单核细胞作为年龄相关性黄斑变性的潜在致病因素 | 首次结合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和流式细胞术验证,系统识别CD64⁺CD14⁻CD16⁻单核细胞在AMD中的致病作用 | 研究主要基于小鼠模型验证,人类样本验证仍需进一步开展 | 识别年龄相关性黄斑变性的致病免疫细胞群并阐明其功能作用 | 年龄相关性黄斑变性患者视网膜色素上皮/脉络膜组织、干性AMD小鼠模型 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | 轨迹分析, 配体-受体相互作用模型 | 基因组关联研究汇总统计数据, 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | AMD患者和健康对照的视网膜色素上皮/脉络膜组织单细胞测序数据(GSE230348),碘酸钠诱导的干性AMD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4300 | 2025-10-05 |
Multi-omic spatial profiling reveals the unique SARS-CoV-2 lung microenvironment and collagen VI as a predictive biomarker in severe COVID-19
2025-Sep, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01699-2023
PMID:40473310
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研究论文 | 通过多组学空间分析揭示COVID-19肺部微环境特征及胶原蛋白VI作为重症预测生物标志物 | 首次整合多种空间组学技术系统解析COVID-19肺部病毒分布、免疫微环境和细胞外基质变化 | 研究基于尸检肺组织样本,无法动态观察疾病进程;样本量有限 | 理解COVID-19肺部微环境相互作用及细胞外基质的致病作用 | 尸检肺组织(COVID-19患者与非呼吸道死亡对照)及患者血清样本 | 数字病理学 | COVID-19 | Quantseq Bulk RNA测序, Nanostring GeoMx空间转录组, RNAscope, 多重免疫荧光, 免疫组化, ELISA | NA | 空间转录组数据, 免疫组化图像, 血清蛋白数据 | 尸检肺组织(未明确数量)+ 215例COVID-19患者血清 + 54例健康对照血清 | Nanostring | 空间转录组学, 多重免疫荧光, 免疫组化, 血清蛋白检测 | GeoMx | Nanostring GeoMx空间转录组分析系统 |