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当前共找到 10617 篇文献，本页显示第 4261 - 4280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4261 | 2025-10-05 |
ANXA1 and ARG2 drive T cell proliferation in ischemia-reperfusion injury: integrated bulk and single-cell transcriptomic analysis
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1673163
PMID:40977888
|
研究论文 | 通过整合性转录组分析揭示ANXA1和ARG2在缺血再灌注损伤中驱动T细胞增殖的分子机制 | 首次通过整合性转录组分析识别ANXA1和ARG2作为缺血再灌注损伤中T细胞增殖的关键调控因子 | 研究主要基于转录组数据，需要进一步实验验证这些基因的功能机制 | 探究缺血再灌注损伤中T细胞增殖的分子机制 | 缺血再灌注损伤模型中的T细胞 | 生物信息学 | 缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 免疫浸润分析, 分子动力学模拟 | NA | 转录组数据 | 多个器官模型的转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 4262 | 2025-10-05 |
Multi-transcriptomics analysis of ferroptosis related genes reveals CAFs exosomal COX4I2 as a novel therapeutic target in osteosarcoma
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1620648
PMID:40977891
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研究论文 | 通过多转录组学分析发现CAFs外泌体COX4I2是骨肉瘤铁死亡治疗的新靶点 | 首次发现CAFs通过外泌体传递COX4I2蛋白抑制骨肉瘤细胞铁死亡的新机制 | 铁死亡在骨肉瘤中的预后意义和调控机制仍需进一步探索 | 探究铁死亡相关基因在骨肉瘤中的预后价值和调控机制 | 骨肉瘤细胞系143B、癌症相关成纤维细胞(CAFs)、裸鼠 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, Western blot, 共聚焦显微镜, 透射电子显微镜 | LASSO回归, SVM, RF, XGBoost, BORUTA | RNA测序数据, 蛋白质数据, 细胞成像数据 | 两个独立GEO队列(GSE21257和GSE39055), 体外细胞实验, 裸鼠体内实验 | NA | 单细胞RNA-seq, 外泌体分析 | NA | NA |
| 4263 | 2025-10-05 |
scAGG: Sample-level embedding and classification of Alzheimer's disease from single-nucleus data
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.08.009
PMID:40977903
|
研究论文 | 提出scAGG模型，利用单细胞RNA测序数据进行阿尔茨海默病的样本级分类 | 开发了样本级池化机制来聚合单细胞嵌入，能够从单细胞数据中学习疾病严重程度的细胞排序 | 注意力模型的解释性有限 | 利用单细胞RNA测序数据进行阿尔茨海默病的样本级分类和疾病机制研究 | 阿尔茨海默病患者和健康对照的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 样本级池化模型,注意力模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4264 | 2025-10-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Cellular Heterogeneity and Microenvironmental Remodeling in Human Ureteral Scar Stricture Tissue
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S540340
PMID:40979497
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了人类输尿管瘢痕狭窄组织的单细胞转录组图谱，揭示了细胞异质性和微环境重塑 | 首次构建了输尿管瘢痕狭窄组织的高分辨率单细胞图谱，揭示了细胞亚群动态变化和细胞间通讯网络 | 样本量较小（3例正常对照和3例患者），需要更大规模研究验证发现 | 揭示输尿管瘢痕狭窄组织的细胞异质性和微环境重塑机制 | 人类输尿管组织（正常对照和瘢痕狭窄患者） | 单细胞转录组学 | 输尿管瘢痕狭窄 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 免疫组织化学 | Seurat, Harmony, Monocle2, CellChat, SCP | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 6例样本（3例正常对照，3例患者） | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq 6000, MobiNova-100 | MobiNova-100单细胞平台，Illumina NovaSeq 6000测序系统 |
| 4265 | 2025-10-05 |
Integrative analysis of single-cell and microarray data reveals SPI1-centered macrophage regulatory signatures in ulcerative colitis
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1617834
PMID:40979590
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和微阵列数据分析，揭示了转录因子SPI1在溃疡性结肠炎巨噬细胞极化中的核心调控作用 | 首次构建了以SPI1为中心的巨噬细胞调控网络，并鉴定出IRAK3、IL1RN、CD55和PEA15等关键下游靶基因 | 研究主要基于体外实验，需要进一步的体内验证；样本量相对有限 | 探索溃疡性结肠炎中巨噬细胞极化的分子调控机制 | 溃疡性结肠炎患者的肠道组织巨噬细胞 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 微阵列, 基因调控网络分析, 机器学习算法 | LASSO, RFE-RF, SVM-RFE | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 4266 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing in studies of type 1 diabetes mellitus: modern state-of-the-art and technical peculiarities
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1663728
PMID:40979707
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综述 | 本文总结了单细胞RNA测序技术在1型糖尿病研究中的应用现状和技术特点 | 系统梳理了scRNA-seq在T1DM研究中的最新进展，重点关注不同免疫细胞亚群间的相互作用和疾病早期特异性基因表达 | 作为综述文章，不涉及原始研究数据的产生和分析 | 探讨scRNA-seq技术在1型糖尿病发病机制研究中的应用价值 | 1型糖尿病患者和模型动物的胰腺细胞、免疫细胞及外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4267 | 2025-10-05 |
Exosomal gene signature in esophageal carcinoma: Insights from single-cell and bulk RNA sequencing
2025-Nov, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102490
PMID:40816225
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，开发并验证了一个用于食管癌预后预测的外泌体相关九基因标志物 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序数据构建食管癌外泌体相关基因标志物，并验证其在免疫治疗预测中的潜在价值 | 免疫治疗相关性分析基于膀胱癌队列而非食管癌特异性队列，需要进一步在食管癌免疫治疗队列中验证 | 开发食管癌预后预测和免疫治疗反应预测的生物标志物 | 食管鳞状细胞癌(ESCA)患者 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, LASSO-Cox回归分析 | LASSO-Cox回归风险模型 | RNA测序数据 | TCGA-ESCA、GSE53625、GSE196756等多个公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4268 | 2025-10-05 |
Single-cell omics reveal the mechanisms of traditional Chinese medicines
2025-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157204
PMID:40916282
|
综述 | 本文综述了单细胞组学技术在中医药研究中的应用及其在揭示中药作用机制方面的潜力 | 首次系统探讨单细胞组学技术在解析中药复杂成分和作用机制中的变革性潜力 | 存在技术限制和数据复杂性等挑战 | 探索单细胞组学在中医药现代化和科学验证中的作用 | 传统中药及其活性成分 | 生物医学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 基因组, 转录组, 蛋白质组, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4269 | 2025-10-05 |
Integrated transcriptome and single-cell RNA sequencing analysis revealed the prognostic significance of GBP4 in pancreatic adenocarcinoma
2025-Nov, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102532
PMID:40944976
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序分析，揭示了GBP4在胰腺腺癌中的预后意义 | 首次系统性地确定了GBP4在胰腺腺癌中的预后价值，并通过单细胞分辨率揭示了其在肿瘤微环境中的表达动态 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步独立队列验证 | 确定GBP4基因对胰腺腺癌的影响 | 胰腺腺癌患者 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | Cox回归, LASSO回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4270 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals palmitoylation-driven cellular heterogeneity and prognostic biomarkers in lung adenocarcinoma
2025-Nov, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102501
PMID:40811979
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示棕榈酰化驱动的肺腺癌细胞异质性并建立预后生物标志物 | 首次在单细胞水平系统分析棕榈酰化对肺腺癌细胞异质性的影响，并开发了基于棕榈酰化特征的12基因风险模型 | 研究结果需要在更多独立队列中进一步验证，实验验证主要集中于ASPH基因 | 探索棕榈酰化修饰在肺腺癌细胞异质性和预后预测中的作用 | 肺腺癌患者肿瘤细胞 | 数字病理 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，GSVA，ssGSEA，拷贝数变异分析，伪时间序列分析，细胞互作分析 | 风险预测模型 | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据 | TCGA数据集和多个GEO数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 4271 | 2025-10-05 |
Elucidating the therapeutic mechanisms of resveratrol in benign prostatic hyperplasia via an integrated strategy of network pharmacology, multi-omics and molecular biology
2025-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157165
PMID:40839986
|
研究论文 | 通过整合网络药理学、多组学分析和分子生物学方法，阐明白藜芦醇治疗良性前列腺增生的作用机制 | 首次整合网络药理学、单细胞转录组、分子对接和分子动力学模拟等多种方法系统研究白藜芦醇对BPH的治疗机制 | 研究主要基于体外实验，需要进一步体内实验验证 | 阐明白藜芦醇治疗良性前列腺增生的药理机制和关键信号通路 | 良性前列腺增生疾病模型和前列腺细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌相关疾病 | 网络药理学, 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟, 体外实验验证 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据, 分子相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 4272 | 2025-10-05 |
Genistein ameliorates thoracic aortic dissection by inhibiting CB1 receptor hyperactivation and modulating its-mediated cAMP-PKA signaling
2025-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157178
PMID:40845589
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研究论文 | 本研究探讨染料木黄酮通过抑制CB1受体过度激活并调节其介导的cAMP-PKA信号通路来改善胸主动脉夹层的作用机制 | 首次揭示CB1受体在胸主动脉夹层中的过度表达及其通过抑制cAMP-PKA信号通路促进疾病发展的机制，并发现染料木黄酮通过靶向该通路发挥治疗作用 | 研究主要聚焦于CB1受体-cAMP-PKA信号轴，可能还存在其他未被探索的分子机制参与胸主动脉夹层的发病过程 | 研究染料木黄酮通过抑制CB1受体和调节cAMP-PKA信号通路缓解胸主动脉夹层进展的潜力 | 血管平滑肌细胞(VSMCs)和胸主动脉夹层动物模型 | 心血管疾病研究 | 胸主动脉夹层 | 单细胞RNA测序，体外和体内实验 | NA | 基因表达数据，病理学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4273 | 2025-10-05 |
Immune cell transcriptional profiles from pre-vaccination peripheral blood predict immune response to preventative MUC1 cancer vaccine
2025-Oct-01, European journal of cancer (Oxford, England : 1990)
DOI:10.1016/j.ejca.2025.115685
PMID:40815873
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析疫苗接种前外周血免疫细胞转录谱，预测MUC1癌症预防疫苗的免疫反应 | 首次使用单细胞RNA测序技术结合机器学习方法识别疫苗免疫反应的预测性生物标志物 | 样本量较小（16名应答者和16名无应答者），需要在更大队列中进一步验证 | 预测癌症预防疫苗的免疫反应并识别相关生物标志物 | 曾患晚期结肠腺瘤的个体 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序，机器学习 | 贝叶斯图分析 | 单细胞转录组数据 | 32个疫苗接种前外周血单个核细胞样本（16名应答者和16名无应答者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4274 | 2025-10-05 |
Selective EPAC1 activators enhance endothelial function in models of vascular inflammation
2025-Oct, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107923
PMID:40848957
|
研究论文 | 本研究通过体外和离体模型探讨选择性EPAC1激活剂在血管炎症中改善内皮功能的作用机制 | 首次系统验证选择性EPAC1激活剂在多种血管炎症模型中恢复内皮功能的作用，并揭示其通过上调SOCS3抑制JAK/STAT3信号通路的分子机制 | 研究主要基于体外和离体模型，缺乏在体动物模型的验证 | 探究EPAC1在调节血管炎症和损伤中的作用及其治疗潜力 | 小鼠主动脉、人冠状动脉、血管内皮细胞、平滑肌细胞和巨噬细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，三细胞共培养系统 | NA | 基因表达数据，功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4275 | 2025-10-05 |
Toxic Switch and Key Effectors of Cu in Zebrafish Gills: Coupling Single-Cell RNA Sequencing and Redox Imaging
2025-Sep-22, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.5c05966
PMID:40983989
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和氧化还原成像技术揭示了铜在斑马鱼鳃中的毒性开关机制 | 首次结合单细胞RNA测序与原位荧光探针技术，系统识别铜毒性开关和关键效应因子 | 研究仅针对斑马鱼鳃组织，结果在其他水生生物中的普适性需要进一步验证 | 探究铜污染对水生生物的毒性机制，特别是毒性开关和关键效应因子 | 斑马鱼鳃组织细胞 | 单细胞生物学 | 重金属中毒 | 单细胞RNA测序, 原位荧光成像 | NA | 单细胞转录组数据, 荧光成像数据 | 斑马鱼鳃组织细胞（6个显著变化的细胞群体） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4276 | 2025-10-05 |
Protocol for single-cell dissociation of head and neck cancer organoids
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103930
PMID:40616840
|
研究论文 | 本文介绍了一种将头颈部鳞状细胞癌患者来源类器官解离为可用于下游应用的活单细胞悬液的实验方案 | 开发了通过0.05%胰蛋白酶孵育和温和机械解离最大化单细胞产量的优化方案，避免高浓度胰蛋白酶和长时间孵育导致的细胞聚集和活力下降 | NA | 建立头颈部癌症类器官单细胞解离的实验方案 | 头颈部鳞状细胞癌患者来源类器官 | NA | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序，药物筛选，流式细胞术，活细胞成像 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4277 | 2025-10-05 |
Protocol for predicting single- and multiple-dose-dependent gene expression using deep generative learning
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103932
PMID:40650899
|
研究论文 | 提出使用深度生成学习预测单剂量和多剂量依赖性基因表达的协议 | 开发了scVIDR模型，一种专门用于模拟剂量依赖性化学扰动下单细胞基因表达的变分自编码器 | NA | 建立预测剂量依赖性基因表达的计算方法 | 单细胞基因表达数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | VAE（变分自编码器） | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4278 | 2025-10-05 |
Protocol for conducting a single-cell sequencing assay for transposase-accessible chromatin analysis
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103960
PMID:40700014
|
研究论文 | 本文提供了一个使用公开数据集进行单细胞ATAC测序分析的详细操作流程 | 为scATAC-seq分析新手提供了标准化的分析流程指南，包括数据预处理、下游分析和计算多组学整合 | 仅使用公开数据集作为示例，未涉及实验设计或数据生成阶段 | 建立标准化的单细胞ATAC测序分析流程 | 单细胞染色质可及性数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC测序 | NA | 基因组测序数据 | 公开数据集（未指定具体样本数量） | NA | single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 4279 | 2025-10-05 |
Protocol for automated graph-based clustering of single-cell RNA-seq data with application in mouse intestinal stem cells
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104000
PMID:40748762
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研究论文 | 提出一种从小鼠肠道分离高度纯化的隐窝上皮细胞并进行单细胞RNA测序的自动化流程 | 开发了ACDC Python软件包，实现大规模单细胞RNA测据集的自动化图论聚类分析 | 主要针对小鼠空肠优化，但可适用于其他肠道区域 | 建立单细胞RNA测序数据的自动化聚类分析流程 | 小鼠肠道隐窝上皮细胞 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞RNA测序 | 图论聚类算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4280 | 2025-10-05 |
Predicting the structural impact of human alternative splicing
2025-Sep-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03744-x
PMID:40963109
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研究论文 | 使用AlphaFold2预测人类选择性剪接异构体的结构影响 | 首次大规模预测人类选择性剪接异构体的三维结构，并系统分析剪接对结构特性的影响 | 仅基于计算预测，缺乏实验验证 | 研究选择性剪接对蛋白质结构和功能的影响 | 11,000多个人类剪接异构体 | 计算生物学 | NA | 蛋白质结构预测，单细胞RNA测序 | AlphaFold2 | 蛋白质序列，单细胞RNA-seq数据 | 超过11,000个人类剪接异构体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Tabula Sapiens项目的单细胞RNA-seq数据 |