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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4241 | 2025-10-05 |
A Spatially Coordinated Keratinocyte-Fibroblast Circuit Recruits MMP9+ Myeloid Cells to Drive IFN-I-Driven Inflammation in Photosensitive Autoimmunity
2025-Aug-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.19.670635
PMID:40894544
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学等技术,揭示了光敏性自身免疫疾病中角质形成细胞-成纤维细胞-髓系细胞的炎症级联反应机制 | 首次发现MMP9+ CD14+髓系细胞在光敏性自身免疫中的核心作用,并阐明其通过角质形成细胞-成纤维细胞轴被招募至真皮-表皮连接处的空间协调机制 | 研究主要基于体外模型和有限临床样本,需要更大规模的临床验证 | 阐明紫外线B暴露引发皮肤特异性自身免疫的分子机制 | 皮肤红斑狼疮和皮肌炎患者的皮肤组织及体外细胞模型 | 数字病理学 | 自身免疫性皮肤病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学(seqFISH+), 体外建模 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 未明确样本数量,包括患者皮肤组织和体外细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | seqFISH+空间转录组技术 |
| 4242 | 2025-10-05 |
High-Resolution Spatial Transcriptomics Unveils Spatially Resolved Gene Modules and Fatty Acid Metabolism Dysregulation in Human Skin Aging
2025-Aug-23, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.08.011
PMID:40850650
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研究论文 | 通过高分辨率空间转录组技术揭示人类皮肤衰老过程中空间分辨的基因模块和脂肪酸代谢失调 | 首次利用高分辨率空间转录组技术构建人类眼睑皮肤衰老图谱,发现表皮脂肪酸合成减少是皮肤衰老的新特征 | 研究主要聚焦于眼睑皮肤,其他皮肤区域的变化可能有所不同 | 解析人类皮肤衰老的分子机制和空间特征 | 人类眼睑皮肤组织、原代人角质形成细胞、重建全层皮肤模型(T-Skin) | 空间转录组学 | 皮肤衰老 | 空间增强分辨率组学测序、多重FISH | NA | 空间转录组数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4243 | 2025-10-05 |
Integrated spatial and functional metabolic profiling identified the thick ascending limb as a mitochondrial vulnerability hub in acute kidney injury
2025-Aug-22, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.07.021
PMID:40850621
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研究论文 | 本研究通过整合空间和功能代谢分析,发现肾小管粗升支是急性肾损伤中的线粒体脆弱性枢纽 | 首次通过整合空间转录组学、单细胞转录组学和同位素示踪成像技术,系统揭示了肾小管粗升支在急性肾损伤中的特殊代谢脆弱性 | 研究主要基于动物模型和有限的临床样本,需要在更大规模的人群研究中进一步验证 | 探索急性肾损伤的代谢机制和肾脏能量代谢的空间分布特征 | 小鼠模型和人类肾移植患者的肾脏组织 | 空间生物学 | 急性肾损伤 | 空间转录组学, 单细胞转录组学, 免疫荧光, 同位素示踪成像 | NA | 转录组数据, 图像数据, 代谢数据 | 小鼠模型和人类肾移植患者样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4244 | 2025-10-05 |
FAHD1-mediated pyruvate metabolism in hepatocellular carcinoma: Multi-omics and causal genetic evidence
2025-Aug-14, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2025.100494
PMID:40814172
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了FAHD1在肝细胞癌中调控丙酮酸代谢的因果机制及其在肿瘤微环境中的空间分布特征 | 首次整合单细胞转录组学、空间定位和遗传因果推断方法,识别出丙酮酸高活性上皮亚群及其与肿瘤核心区域的代谢分区特征,发现FAHD1作为丙酮酸代谢的因果驱动因子 | 研究主要基于观察性数据和体外模型验证,需要进一步的体内实验和临床试验确认FAHD1靶向治疗的临床价值 | 探索肝细胞癌中丙酮酸代谢的因果调控机制及其在肿瘤微环境中的空间分布特征 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的上皮细胞亚群、癌症相关成纤维细胞及其相互作用 | 多组学整合分析 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组、孟德尔随机化分析、分子对接 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4245 | 2025-10-05 |
Loeys-Dietz syndrome subtypes exhibit distinct clinical behavior and aortic cellular transcriptomic profiles
2025-Aug, JTCVS open
DOI:10.1016/j.xjon.2025.06.013
PMID:40923070
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研究论文 | 本研究整合Loeys-Dietz综合征患者主动脉根部置换术后的纵向临床结果与主动脉平滑肌细胞转录组分析,探讨不同亚型特异性主动脉脆弱性的机制 | 首次通过单细胞RNA测序比较TGFBR1/2和SMAD3变异患者的主动脉平滑肌细胞表型,揭示亚型特异性基因调控模式 | 单机构研究,样本量有限(特别是单细胞RNA测序仅8例样本),随访时间中位6.16年 | 研究Loeys-Dietz综合征不同亚型的临床行为差异及其分子机制 | Loeys-Dietz综合征患者(62例,包括TGFBR1/2和SMAD3变异亚型) | 单细胞转录组学 | Loeys-Dietz综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据和单细胞RNA测序数据 | 62例患者(其中59例基因确认),单细胞RNA测序分析8例(3例TGFBR1/2,5例SMAD3) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4246 | 2025-10-05 |
CREB drives acinar cells to ductal reprogramming and promotes pancreatic cancer progression in preclinical models of alcoholic pancreatitis
2025-Jul-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.05.574376
PMID:38903082
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研究论文 | 本研究揭示了CREB在酒精性胰腺炎中驱动腺泡细胞向导管重编程并促进胰腺癌进展的机制 | 首次阐明CREB与致癌Kras在慢性炎症环境下协同促进胰腺癌进展的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究CREB在酒精性胰腺炎促进胰腺癌进展中的作用机制 | 遗传修饰小鼠模型(Ptf1aCreERTM/+;LSL-KrasG12D/+)和腺泡细胞 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, Western blotting, 磷酸激酶阵列, 定量PCR, 谱系追踪 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据, 组织学图像, 蛋白质印迹数据 | 多种遗传背景的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4247 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis of dup15q syndrome reveals developmental and postnatal molecular changes in autism
2025-Jul-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61184-4
PMID:40615364
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研究论文 | 通过单细胞分析研究dup15q综合征在自闭症中的发育和出生后分子变化 | 首次结合皮质类器官和死后脑样本的单细胞测序,揭示dup15q综合征在胎儿期和青少年-成人期的细胞类型特异性分子变化 | 研究样本数量未明确说明,且依赖死后脑组织可能存在保存质量问题 | 研究dup15q综合征在自闭症发病机制中的分子基础 | dup15q患者来源的iPSCs皮质类器官和死后脑样本 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学,基因共表达网络分析 | NA | RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 4248 | 2025-10-05 |
SpaceBF: Spatial coexpression analysis using Bayesian Fused approaches in spatial omics datasets
2025-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.29.646124
PMID:40236135
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研究论文 | 提出一种名为SpaceBF的贝叶斯融合建模框架,用于分析空间组学数据中的分子共表达模式 | 开发了首个基于贝叶斯融合方法的局部和全局分子共表达分析框架,相比主要依赖地理空间指标的传统方法具有更优的特异性和检测能力 | NA | 解决空间组学数据中分子对空间共表达检测方法不足的问题 | 空间转录组学和蛋白质组学数据集中的分子对共表达模式 | 空间组学数据分析 | 多种癌症 | 贝叶斯融合建模 | 贝叶斯融合模型 | 空间组学数据(空间转录组学、蛋白质组学) | NA | NA | 空间转录组学, 质谱成像 | NA | NA |
| 4249 | 2025-10-05 |
An engineered viral protein activates STAT5 to prevent T cell suppression
2025-05-23, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adn9633
PMID:40408430
|
研究论文 | 本研究通过工程化病毒蛋白激活STAT5来增强T细胞功能并防止其耗竭 | 利用工程化的疱疹病毒TIP蛋白构建非经典平台,强制招募LCK激酶直接激活STAT蛋白,实现细胞因子非依赖的STAT激活 | 研究主要关注STAT5激活,对其他STAT蛋白的应用效果需要进一步验证 | 开发增强T细胞疗法效力的新策略 | CD8+ T细胞 | 免疫工程 | 癌症 | 单细胞转录组学、蛋白质工程 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4250 | 2025-10-05 |
Chronic hyperactivation of midbrain dopamine neurons causes preferential dopamine neuron degeneration
2025-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.05.588321
PMID:38645054
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研究论文 | 本研究通过化学遗传学方法慢性激活中脑多巴胺神经元,揭示了帕金森病中多巴胺神经元退化的新机制 | 首次建立了慢性激活多巴胺神经元的化学遗传学小鼠模型,证明了神经活动增强会导致黑质多巴胺神经元优先退化 | 动物模型研究,需要进一步验证在人类中的适用性 | 探究慢性神经活动改变在多巴胺神经元退化中的作用机制 | 中脑多巴胺神经元,特别是黑质致密部多巴胺神经元 | 神经科学 | 帕金森病 | 化学遗传学(DREADD),电生理记录,空间转录组学 | DREADD小鼠模型 | 电生理数据,行为数据,钙成像数据,转录组数据 | DREADD转基因小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4251 | 2025-10-05 |
Unveiling the mechanism of Pogostemon cablin (Blanco) Benth in treating heat illnesses via network pharmacology and molecular simulation
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0331401
PMID:40920657
|
研究论文 | 本研究通过网络药理学和分子模拟技术揭示广藿香治疗热射病的作用机制 | 首次整合网络药理学、单细胞RNA测序和分子动力学模拟系统解析广藿香治疗热射病的分子靶点 | 样本量较小(11例患者和14例健康志愿者),需要更大规模研究验证 | 阐明广藿香治疗热射病的分子作用机制 | 热射病患者和健康志愿者的外周血样本 | 生物信息学 | 热射病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 分子对接, 分子动力学模拟 | 网络药理学分析, 分子对接模型 | RNA测序数据, 分子结构数据 | 25例(11例热射病患者+14例健康志愿者) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4252 | 2025-10-05 |
Construction of a gene-metabolite-microbiome regulatory network reveals novel therapeutic targets in bladder cancer through multi-omics analysis
2025-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2025.2553220
PMID:40908816
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研究论文 | 通过多组学分析构建膀胱癌的基因-代谢物-微生物调控网络并识别新的治疗靶点 | 首次整合转录组、外显子组、代谢组和微生物组数据构建膀胱癌调控网络,发现成纤维细胞作为核心调控因子 | 样本来源相对有限,需要更大规模验证 | 阐明膀胱癌的发病机制并识别新的治疗靶点 | 膀胱癌患者的肿瘤组织和癌旁组织 | 多组学分析 | 膀胱癌 | 转录组测序,全外显子组测序,代谢组学,微生物组分析,单细胞测序 | 调控网络分析,分子分型 | 基因组数据,转录组数据,代谢组数据,微生物组数据 | 膀胱癌患者组织样本,结合公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,全外显子组测序,代谢组学,微生物组分析 | NA | NA |
| 4253 | 2025-10-05 |
KAT6A Promotes Macrophage Inflammation and Periodontitis
2025-Oct, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.14203
PMID:40635126
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研究论文 | 本研究揭示KAT6A通过调控巨噬细胞炎症反应促进牙周炎进展的机制 | 首次发现KAT6A在牙周炎巨噬细胞中表达上调,并通过基因敲除小鼠模型证实其在牙周炎发病中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究KAT6A在牙周炎发病机制中的作用 | 巨噬细胞、牙周炎小鼠模型 | 表观遗传学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, RNA-seq, 流式细胞术, Cut&tag | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4254 | 2025-10-05 |
Integrated 'omics analysis reveals human milk oligosaccharide biosynthesis programs in human lactocytes
2025-Sep-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113269
PMID:40894860
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据和HMO浓度测量,揭示人类乳腺细胞中母乳寡糖的生物合成程序 | 首次在单细胞水平识别HMO合成基因的差异表达模式,发现新的候选基因和转录因子,提出HMO合成可能通过乳腺细胞亚型特化实现 | HMO生物合成通路在哺乳期乳腺中的复杂机制仍未被完全阐明 | 解析人类母乳寡糖在乳腺细胞中的生物合成机制 | 人类乳腺上皮细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,HMO浓度测量数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4255 | 2025-10-05 |
Adaptive individualized gene pair signatures distinguishing melanoma and predicting response to immune checkpoint blockade
2025-Sep-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113329
PMID:40917881
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研究论文 | 提出自适应个体化基因对特征方法,用于区分黑色素瘤亚型并预测免疫检查点阻断治疗反应 | 开发基于基因对逆转的自适应特征选择方法,相比现有方法提高分类准确率5%以上,预测性能提升6% | 研究样本量相对有限(850个样本用于分类,252个样本用于预测),需要更多独立队列验证 | 开发稳健的基因特征方法以区分相似癌症亚型并预测免疫治疗反应 | 黑色素瘤患者样本 | 机器学习 | 黑色素瘤 | RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 850个样本来自24个队列用于分类,252个样本来自7个队列用于预测 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 4256 | 2025-10-05 |
TREM-1 as a novel immunotherapeutic target to treat pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Sep-18, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2025.201034
PMID:40917508
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研究论文 | 本研究探讨TREM-1激活在胰腺导管腺癌中改变肿瘤微环境和增强肿瘤免疫的潜力 | 首次发现TREM-1激活能通过重编程免疫抑制性肿瘤微环境来治疗胰腺导管腺癌 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚不充分 | 探索TREM-1作为胰腺导管腺癌免疫治疗新靶点的潜力 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的肿瘤微环境和免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | Pan02小鼠模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类PDAC组织样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4257 | 2025-10-05 |
Integrative analysis identifies FERMT3 as a key regulator of metabolic reprogramming in keloid scarring and metabolic syndrome
2025-Sep-10, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01705-y
PMID:40928556
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研究论文 | 通过整合分析识别FERMT3作为瘢痕疙瘩和代谢综合征中代谢重编程的关键调控因子 | 首次发现瘢痕疙瘩和代谢综合征之间的共享转录组特征,并确定FERMT3作为调控代谢和炎症表型的关键基因 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证FERMT3的调控机制 | 识别瘢痕疙瘩和代谢综合征之间的共同调控基因,探索新的治疗靶点 | 瘢痕疙瘩组织、代谢综合征组织及相应健康对照组织 | 生物信息学 | 瘢痕疙瘩, 代谢综合征 | 微阵列分析, 单细胞RNA测序, LASSO回归, 机器学习, 体外实验 | WGCNA, 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自公共数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 4258 | 2025-10-05 |
Tumor microenvironment differences between diagnostic and relapsed classic Hodgkin lymphoma revealed by scRNA-seq
2025-Sep-09, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025017107
PMID:40924921
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示经典霍奇金淋巴瘤诊断期与复发期肿瘤微环境的差异 | 首次发现早期复发CHL中LGALS9+幼稚B细胞与HAVCR2+调节性T细胞的免疫抑制性相互作用 | 样本量有限,需要更大规模研究验证 | 探究经典霍奇金淋巴瘤复发过程中肿瘤微环境的变化 | 配对的诊断期和复发期经典霍奇金淋巴瘤样本 | 单细胞基因组学 | 经典霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,成像质谱流式细胞术,免疫组织化学 | 细胞-细胞相互作用分析,空间分析 | 单细胞转录组数据,空间蛋白质数据 | 配对诊断和复发CHL样本及独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 4259 | 2025-10-05 |
Type 1 regulatory cells suppress T-cell cytotoxicity to alleviate liver injury during acute hepatitis B virus infection in mice
2025-Sep-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf229
PMID:40925590
|
研究论文 | 本研究揭示了1型调节性T细胞通过调节T细胞毒性在急性乙肝病毒感染中保护肝脏免受免疫病理损伤的机制 | 首次发现Tr1细胞通过IL-10依赖的方式抑制T细胞毒性反应,在清除病毒的同时保护肝脏免受免疫损伤 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探索急性HBV感染期间调节T细胞反应以避免免疫病理损伤的机制 | 小鼠急性乙肝病毒感染模型中的HBsAg特异性CD4+ T细胞 | 免疫学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,细胞因子中和实验 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4260 | 2025-10-05 |
Cancer-associated fibroblast marker signatures and stromal composition in usual interstitial pneumonia-associated lung adenocarcinoma: an analysis using a proteomic-immunohistochemical approach
2025-Sep-09, Virchows Archiv : an international journal of pathology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s00428-025-04254-8
PMID:40926109
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和免疫组织化学方法分析普通型间质性肺炎相关肺腺癌中癌症相关成纤维细胞标志物特征和基质组成 | 首次结合激光显微切割蛋白质组分析和公开单细胞RNA测序数据,揭示UIP相关LUAD中ACAN和HAPLN1等新型基质蛋白的表达特征 | 样本量较小(仅32例),且为回顾性研究 | 表征普通型间质性肺炎相关肺腺癌的肿瘤微环境特征 | 肺腺癌患者组织样本(16例伴UIP,16例不伴UIP) | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组织化学, 蛋白质组学分析, 单细胞RNA测序 | NA | 组织图像, 蛋白质组数据, 基因表达数据 | 32例肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | 激光显微切割技术 |