单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10796 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2026-01-23 |
High-resolution single-cell RNA sequencing using canFam4 reveals novel immune subsets and checkpoint programs in healthy dogs
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680437
PMID:41488614
|
研究论文 | 本研究利用10x Genomics平台和canFam4基因组，构建了健康小型犬外周血白细胞的单细胞转录组图谱，揭示了新的免疫亚群和检查点程序 | 首次使用canFam4基因组进行高分辨率单细胞RNA测序，在健康犬中识别出51个独特的免疫亚群，包括在canFam3.1研究中未被充分代表的细胞类型，并揭示了免疫检查点机制 | 研究仅基于六只健康小型犬，样本量有限，可能无法完全代表所有犬种或健康状况 | 旨在通过单细胞RNA测序高分辨率解析健康犬的免疫异质性，并识别新的免疫亚群和功能特征 | 六只健康小型犬的外周血白细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 六只健康小型犬 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics平台用于单细胞RNA测序 |
| 402 | 2026-01-23 |
scVAR: integrating genomics and transcriptomics from single-cell RNA-seq -insights from leukemia case studies
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1604484
PMID:41555915
|
研究论文 | 本文介绍了scVAR，一种利用变分自编码器从单细胞RNA测序数据中学习和整合遗传变异的计算框架，应用于白血病案例研究 | 开发了基于交叉注意力融合层的编码器-解码器架构，将转录组和变异信息整合到统一潜在表示中，增强了在噪声和稀疏条件下检测细微细胞差异的能力 | 由于使用3' scRNA-seq，变异检测仅限于捕获区域 | 整合单细胞RNA测序中的基因组和转录组信息，以更好地表征细胞状态和疾病过程 | 急性髓系白血病（AML）和急性淋巴细胞白血病（ALL） | 机器学习 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 变分自编码器（VAE） | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 403 | 2026-01-23 |
Correction: High-resolution single-cell RNA sequencing using canFam4 reveals novel immune subsets and checkpoint programs in healthy dogs
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1773404
PMID:41567218
|
correction | 本文是对先前发表的一篇关于使用canFam4进行高分辨率单细胞RNA测序以揭示健康犬类新型免疫亚群和检查点程序的研究文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 404 | 2026-01-22 |
Temporal transcriptomic profiling of bone autograft healing reveals dynamic immune, vascular, and osteogenic programs
2025-Dec-30, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2025.117771
PMID:41478392
|
研究论文 | 本研究通过时序转录组分析揭示了骨自体移植愈合过程中的动态免疫、血管和成骨程序 | 首次结合bulk和单细胞RNA测序，在小鼠骨膜介导的自体移植模型中系统描绘了14天内移植相关组织的分子和细胞程序动态变化，并发现了神经血管交互作用的新证据 | 研究基于小鼠模型，结果在人体中的适用性有待验证；观察时间限于14天，长期愈合过程未涵盖 | 阐明早期骨自体移植整合的分子和细胞驱动机制 | 小鼠骨膜介导的自体移植模型中的移植相关组织 | 数字病理学 | 骨科疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠移植组织在14天内的多个时间点样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 405 | 2026-01-22 |
Transient interferon-driven NK cell activation in acute hepatitis C
2025-Dec-27, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf654
PMID:41453396
|
研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞测序技术，探讨了急性丙型肝炎病毒感染期间自然杀伤（NK）细胞的动态变化及其在抗病毒反应中的作用 | 首次在急性丙型肝炎患者中，通过纵向采样结合单细胞测序，识别出一个具有强烈I型干扰素印记的高度激活NK细胞亚群，并揭示了其在病毒清除后的动态变化 | 研究样本量可能有限，且未详细探讨NK细胞激活的具体分子机制或长期功能影响 | 探究急性丙型肝炎病毒感染期间NK细胞的免疫反应特征及其与病毒清除的关系 | 急性丙型肝炎患者、慢性丙型肝炎患者和健康对照者 | 数字病理学 | 丙型肝炎 | 流式细胞术, 单细胞RNA-seq | NA | 细胞表型数据, 转录组数据 | 纵向采样的急性丙型肝炎患者、慢性丙型肝炎患者和健康对照者（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 406 | 2026-01-22 |
Integrative analysis of bulk multiomics and single-cell transcriptomics reveals the value of neddylation in Skin Cutaneous Melanoma
2025-Dec-27, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2025.12.003
PMID:41558945
|
研究论文 | 本研究通过整合批量多组学和单细胞转录组学数据，揭示了neddylation在皮肤黑色素瘤中的预后价值，并构建了一个基于neddylation的预后模型 | 结合单细胞RNA测序和批量数据，首次将恶性细胞根据neddylation相关基因分为不同亚型，并建立了neddylation相关的预后特征 | 研究依赖于公共数据库数据，可能受样本异质性和技术偏差影响，且未进行实验验证 | 分析皮肤黑色素瘤的细胞异质性，并构建neddylation相关的预后模型 | 皮肤黑色素瘤样本 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 批量多组学分析 | 非负矩阵分解聚类算法 | RNA-seq数据 | 31,894个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 407 | 2026-01-22 |
Therapeutic reprogramming of circulating myeloid cells via signal regulatory protein α extracellular vesicles in acute kidney injury
2025-Dec-23, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.12.012
PMID:41448459
|
研究论文 | 本研究通过工程化表达高亲和力SIRPα变体的细胞外囊泡（SIRP-EVs），靶向CD47以调控循环髓系细胞，为急性肾损伤提供了一种新型免疫调节治疗策略 | 开发了靶向CD47的SIRPα细胞外囊泡，系统性地调控循环髓系细胞而非传统组织中心方法，实现炎症前干预 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床转化效果需进一步验证 | 探索通过靶向CD47调控髓系细胞治疗急性肾损伤的新方法 | 人类AKI组织样本、小鼠AKI模型（顺铂和双侧缺血/再灌注） | 单细胞组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序、CD47蛋白染色 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 | 人类AKI标本及两种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 408 | 2026-01-22 |
Single-cell and spatial transcriptomics implicate vascular cell orchestration of inflammatory changes after UV light exposure in skin
2025-Dec-17, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.11.024
PMID:41419052
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析，揭示了小鼠皮肤在急性UVB暴露后血管细胞协调炎症变化的机制 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，系统解析了UVB暴露后皮肤各层细胞（包括表皮、真皮、脂肪组织）的基因表达变化，并进行了跨物种（小鼠与人类）比较验证 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据验证有限；时间点仅关注了UVB暴露后12小时，缺乏更长时间动态观察 | 阐明急性紫外线辐射（UVR）对皮肤的复杂影响机制，特别是其在自身免疫过程（如皮肤狼疮）中的作用 | 小鼠皮肤组织（表皮、深层真皮、脂肪组织）及其中的细胞类型（CD45免疫细胞、细胞角蛋白表皮细胞、内皮细胞、成纤维细胞等） | 空间转录组学 | 皮肤狼疮 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析 | NA | 转录组数据 | 未明确具体样本数量，但涉及小鼠皮肤多个组织层的转录组分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 409 | 2026-01-22 |
Spatial transcriptomics uncovers unique tumor microenvironments in folliculotropic versus classic mycosis fungoides
2025-Dec-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.11.013
PMID:41338334
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，揭示了滤泡性蕈样肉芽肿与经典型蕈样肉芽肿之间肿瘤微环境的差异 | 首次应用空间转录组学技术，在空间分辨率上直接比较了滤泡性蕈样肉芽肿（FMF）和经典型蕈样肉芽肿（MF）的肿瘤微环境，明确了恶性T细胞在滤泡微环境中的独特表型和代谢适应性 | 研究样本量未明确说明，且研究结果主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平的功能验证 | 探究滤泡性蕈样肉芽肿（FMF）相较于经典型蕈样肉芽肿（MF）更具临床侵袭性的肿瘤微环境机制 | 滤泡性蕈样肉芽肿（FMF）和经典型蕈样肉芽肿（MF）患者的皮肤组织样本 | 空间转录组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤（蕈样肉芽肿） | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 410 | 2026-01-22 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Identifies a Novel OLR1+ SLC7A7+ Liver-Enriched Metastatic Subset With Immunometabolic Rewiring in Pancreatic Cancer
2025-Nov, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71345
PMID:41176774
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，识别出一种新型的OLR1+ SLC7A7+肝脏富集转移亚群（LEMS），并揭示了其在胰腺癌肝转移中的免疫代谢重编程机制 | 首次识别并验证了LEMS这一终末分化的恶性细胞亚群，其特征为代谢重编程和免疫抑制通路超活化，并发现其与SPP1+巨噬细胞通过配体-受体网络相互作用，驱动侵袭和免疫逃逸 | 需要扩大临床队列和体内模型来全面阐明LEMS与巨噬细胞之间的具体机制性相互作用 | 识别驱动PDAC肝转移的关键细胞亚群，阐明其与转移微环境的相互作用，并定义肝脏定植的潜在机制 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的原发肿瘤（PT）和肝转移（LM）样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 来自PDAC PT和LM患者的临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 411 | 2026-01-22 |
Integration of Transcriptome Profiling and Single-Cell Sequencing Analysis to Establish a CD8+ T Cell-Related Prognostic Model for Patients With NSCLC: From Assessment to Therapy
2025-Nov, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71337
PMID:41223031
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组分析和单细胞测序，构建了一个基于CD8+ T细胞的预后模型，用于非小细胞肺癌患者的精准预后评估和免疫治疗决策 | 首次结合加权基因共表达网络分析和单细胞测序技术，识别出CD52、CD69和PLIN2作为生物标志物，构建了高精度的CD8+ T细胞相关风险模型，并开发了临床预后列线图 | 研究依赖于公共数据集（TCGA-NSCLC、GSE183219、GSE42127），可能受到样本异质性和数据质量的限制，且模型需要在独立的前瞻性队列中进行进一步验证 | 开发一个CD8+ T细胞相关的预后模型，以改善非小细胞肺癌患者的预后评估和免疫治疗临床决策 | 非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组分析，单细胞测序 | LASSO回归，Cox回归，列线图 | 基因表达数据，单细胞数据 | 三个公共数据集（TCGA-NSCLC、GSE183219、GSE42127）中的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 412 | 2025-11-11 |
Spatial Transcriptomics Reveals Injured Cells, Signature Genes, and Communication Patterns in the Cyst Microenvironment of Polycystic Kidney Disease
2025-Oct-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000894
PMID:41071604
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 413 | 2026-01-22 |
Lyz1-Expressing Alveolar Type II Cells Contribute to Lung Regeneration
2025, Journal of respiratory biology and translational medicine
DOI:10.70322/jrbtm.2025.10011
PMID:41550210
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别并表征了一个表达Lyz1的肺泡II型细胞亚群，揭示了其在肺损伤后肺泡再生中的关键作用 | 首次发现并定义了表达Lyz1的AT2细胞作为一个先前未被识别的肺泡祖细胞群，扩展了肺泡再生的范式 | NA | 探究异质性肺泡II型细胞在肺修复中的贡献 | 小鼠肺组织中的肺泡II型细胞亚群 | 单细胞生物学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 414 | 2026-01-22 |
Single-cell RNA sequencing unraveled immune-related expression heterogeneity and lymphoid cell development dysregulation in childhood asthma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1606650
PMID:41550933
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了儿童哮喘患者与健康对照的外周血单个核细胞，揭示了免疫相关表达异质性和淋巴细胞发育失调在儿童哮喘中的作用 | 首次在单细胞水平上系统揭示了儿童哮喘中免疫细胞发育轨迹的异常模式，并识别了JUN、SPI1等关键基因及S100A家族蛋白的普遍上调，为理解哮喘的分子机制提供了新视角 | 样本量较小（仅3例患者和4例对照），且未涉及组织特异性分析，可能限制结果的普适性 | 阐明免疫失调在儿童哮喘发病机制中的作用 | 儿童哮喘患者和健康对照的外周血单个核细胞（PBMCs） | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例儿童哮喘患者和4例年龄匹配的健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 415 | 2026-01-22 |
Role of SUV39H2 in shaping the malignant phenotype of triple-negative breast cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1679640
PMID:41551146
|
研究论文 | 本研究探讨了SUV39H2在三阴性乳腺癌中的表达模式、临床相关性及功能作用 | 首次系统分析SUV39H2在多种癌症中的表达，并验证其在TNBC中的促癌功能 | 临床实用性需进一步验证，样本量有限 | 阐明SUV39H2在TNBC恶性表型中的作用 | 三阴性乳腺癌细胞系及患者样本 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、Western印迹、功能实验 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 5对TNBC患者样本，MDA-MB-231和Hs-578T细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 416 | 2026-01-22 |
Research progress of stem cells in the treatment of atherosclerosis
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1722416
PMID:41552013
|
综述 | 本文系统综述了干细胞在治疗动脉粥样硬化中的研究进展，包括其作用机制、动物实验与临床试验证据、当前面临的挑战以及未来的优化策略与应用前景 | 聚焦于2023-2025年的最新研究证据，并提出了结合单细胞测序、类器官模型和精准递送系统等前沿技术来推动干细胞临床转化的具体实施路径 | 本文为综述性文章，未报告原始实验数据，其分析基于对现有文献的总结 | 总结干细胞治疗动脉粥样硬化的研究进展，分析核心挑战，并探讨促进其临床转化的未来方向 | 间充质干细胞、诱导多能干细胞、内皮祖细胞等用于治疗动脉粥样硬化的干细胞类型 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 417 | 2026-01-22 |
Bu-Yi-Xin-Shen formula targets monocytes through PI3K-Akt/NF-κB signaling in post-percutaneous coronary intervention angina
2025, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/CMPK4691
PMID:41552316
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，探讨了补益心肾方治疗经皮冠状动脉介入术后心绞痛的机制 | 结合生物信息学、分子对接、单细胞RNA测序和体内实验，首次系统揭示了补益心肾方通过靶向单核细胞中的PI3K-Akt/NF-κB信号通路发挥治疗作用 | 研究主要基于动物实验和生物信息学预测，缺乏临床样本的直接验证，且活性成分的具体体内药效学需进一步确认 | 探究补益心肾方治疗经皮冠状动脉介入术后心绞痛的作用机制 | 单核细胞及相关信号通路（PI3K-Akt、NF-κB） | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、分子对接、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、功能富集分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 418 | 2026-01-22 |
Visualizing stability: a sensitivity analysis framework for t-SNE embeddings
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1719516
PMID:41552665
|
研究论文 | 本文提出一个计算框架，用于扩展标准t-SNE图，通过可视化线索展示t-SNE嵌入的稳定性 | 结合隐函数定理与自动微分进行敏感性分析，计算嵌入对输入数据的敏感性，并通过雅可比矩阵热图可视化特征影响和结构不稳定区域 | 未明确讨论框架的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性限制 | 开发一个框架来评估t-SNE嵌入的稳定性和可解释性，以增强生物信息学中的科学结论严谨性 | 高维生物数据，包括批量RNA-seq、蛋白质组学和单细胞转录组学数据集 | 机器学习 | NA | t-SNE, 敏感性分析, 自动微分 | t-SNE | 高维数据 | 三个不同的生物数据集 | NA | bulk RNA-seq, proteomics, single-cell transcriptomics | NA | NA |
| 419 | 2026-01-22 |
Emerging technologies and current challenges in intratumoral microbiota research
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1685862
PMID:41552720
|
综述 | 本文综述了肿瘤内微生物组研究中的新兴技术、当前挑战以及未来的发展方向 | 系统性地总结了用于克服肿瘤内微生物低生物量检测挑战的新兴技术，包括改进的污染控制策略、高分辨率检测方法以及人工智能辅助的多组学整合分析，并指出了该领域从描述性研究向机制理解和临床转化发展的趋势 | NA | 探讨肿瘤内微生物组研究领域的技术挑战、最新进展及未来前景，以推动该领域向机制研究和临床转化发展 | 肿瘤内微生物组 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 厌氧培养优化, 基因组解析分析, 酶水平分析, 人工智能辅助分析 | NA | 微生物组数据, 临床数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 420 | 2026-01-22 |
Tumor-like characteristics of vascular smooth muscle cells in atherosclerosis
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1734123
PMID:41552822
|
综述 | 本文综述了动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞表现出的类肿瘤特征，包括DNA损伤、基因组不稳定性、逃避衰老、过度增殖、迁移与侵袭激活、癌症干细胞样特性以及癌症相关信号通路激活 | 通过谱系追踪和单细胞转录组学技术，揭示了血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化中表现出高度可塑性和类肿瘤特征，这一发现挑战了传统观点 | NA | 探讨动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞的类肿瘤特征，为针对血管平滑肌细胞的新治疗策略提供理论基础 | 血管平滑肌细胞及其衍生细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 谱系追踪，单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |