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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2026-03-01 |
Single-cell transcriptomics reveals dynamic reprogramming of testicular immunity in Brucella-infected goat testis
2025-Nov-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了布鲁氏菌感染的山羊睾丸组织中免疫微环境的动态转录重编程 | 首次在单细胞分辨率下描绘了布鲁氏菌感染后睾丸免疫微环境的动态重塑,并识别出硫氧还蛋白相互作用蛋白(TXNIP)作为潜在的免疫治疗靶点 | 研究仅在山羊模型中进行,结果向其他物种或人类的直接外推需谨慎;机制验证实验(如功能缺失/获得)未在文中报告 | 阐明布鲁氏菌感染导致睾丸免疫病理的分子机制,并寻找免疫调节干预的潜在靶点 | 山羊睾丸组织(生理状态与布鲁氏菌感染状态) | 数字病理学 | 布鲁氏菌病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 402 | 2026-03-01 |
Integrated single-nuclei and spatial transcriptomic profiling of human sacrococcygeal teratomas reveals heterogeneity in cellular composition and X-chromosome inactivation
2025-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.21.665156
PMID:40777431
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研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术,揭示了人类骶尾部畸胎瘤的细胞组成异质性和X染色体失活状态 | 首次结合单核RNA-seq和空间转录组学分析SCTs,发现X染色体双等位基因表达与细胞身份和性别偏见的关联 | 样本量较小(仅8个肿瘤),且未检测到假定的多能细胞群 | 探究骶尾部畸胎瘤的细胞起源、临床分层和性别偏见机制 | 人类骶尾部畸胎瘤组织样本 | 数字病理学 | 骶尾部畸胎瘤 | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间数据 | 8个SCTs样本(6个产后,2个产前) | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 403 | 2026-03-01 |
Mutual Regulation of Cardiovascular and Hematopoietic Development
2025-Apr-22, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-025-02236-5
PMID:40261519
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综述 | 本文探讨了心血管与造血系统在发育中的相互调控关系,特别聚焦于心内膜造血这一进化保守过程及其在心脏发育和巨噬细胞形成中的作用 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了心内膜细胞具有独立于已知造血器官的内在造血程序,并阐明了心内膜来源巨噬细胞在心脏形态发生中的独特贡献 | NA | 探讨心血管与造血系统发育的分子机制和调控相互作用 | 心内膜造血过程、心脏发育、巨噬细胞形成 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 404 | 2026-03-01 |
Spatial Transcriptomics Identifies Immune-Stromal Niches Associated with Cancer in Adult Dermatomyositis
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.19.644147
PMID:40166232
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研究论文 | 本研究通过整合空间和单细胞转录组学分析,揭示了成人皮肌炎中与癌症相关的独特免疫和基质微环境 | 首次提供了成人皮肌炎中免疫和基质细胞的空间映射,发现了与癌症相关的DM皮肤病变中分散的免疫浸润特征,以及非癌症相关DM中独特的细胞对和IFN-β表达 | NA | 探究成人皮肌炎的免疫和基质微环境特征及其与癌症的关联 | 成人皮肌炎患者的皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肌炎 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 405 | 2026-03-01 |
Comprehensive biomarker profiles in hematological malignancies: improving diagnosis, prognosis, and treatment
2025-Mar, Biomarkers in medicine
IF:1.9Q3
DOI:10.1080/17520363.2025.2471745
PMID:40015744
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综述 | 本文全面概述了血液系统恶性肿瘤中生物标志物的最新进展及其在诊断、预后和治疗中的应用 | 整合了从传统形态学到先进分子技术(如PCR、NGS、质谱和单细胞RNA测序)的生物标志物发现历程,并强调了新兴技术在揭示先前无法检测的生物标志物方面的作用 | NA | 提供血液系统恶性肿瘤生物标志物的全面概述,探讨其诊断和治疗应用及未来发展方向 | 血液系统恶性肿瘤及其相关生物标志物 | NA | 血液系统恶性肿瘤 | 聚合酶链反应(PCR)、下一代测序(NGS)、质谱、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 406 | 2026-03-01 |
Multi-omics integration in disease research
2025, Progress in brain research
DOI:10.1016/bs.pbr.2025.08.012
PMID:41314746
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综述 | 本章强调多组学整合在理解阿尔茨海默病、帕金森病和肌萎缩侧索硬化等神经退行性疾病生物学中的价值 | 通过整合基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据,结合单细胞测序、空间转录组学和高通量质谱等工具,重建分子网络并实现患者分子亚型分层 | 面临数据异质性和标准化不足等挑战 | 推动神经退行性疾病研究中的个性化策略 | 阿尔茨海默病、帕金森病和肌萎缩侧索硬化(ALS) | 多组学整合 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序、空间转录组学、质谱分析 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 407 | 2026-03-01 |
Precision medicine in neurodegenerative diseases: From research to clinical practice
2025, Progress in brain research
DOI:10.1016/bs.pbr.2025.08.006
PMID:41314744
|
综述 | 本章概述了精准医学如何重塑神经退行性疾病的理解、诊断和治疗方式 | 整合了遗传、分子、生物标志物、影像技术和数字工具等多维度信息,推动精准医学从研究向临床实践转化 | 面临试验设计、数据整合、不平等获取和监管障碍等挑战 | 探讨精准医学在神经退行性疾病中的应用,旨在改善诊断、治疗和疾病管理 | 阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症和亨廷顿病等神经退行性疾病 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学、影像技术、数字工具 | NA | 遗传数据、分子数据、生物标志物数据、影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 408 | 2026-02-28 |
Transcriptomic plasticity of cholinergic adipose macrophages in the acute thermogenic response
2025-12, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110925
PMID:41207622
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了小鼠皮下白色脂肪组织中胆碱能脂肪巨噬细胞在急性冷暴露下的转录组动态、细胞亚群及其混合起源 | 首次在单细胞水平上全面解析了胆碱能脂肪巨噬细胞在急性冷暴露下的转录组可塑性,并揭示了其混合起源(成年骨髓和胚胎来源) | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证;且主要关注急性冷暴露,长期效应未知 | 探究胆碱能脂肪巨噬细胞在急性产热反应中的转录组动态、细胞亚群和起源 | 小鼠皮下白色脂肪组织中的ChAT-eGFP+细胞(表达胆碱乙酰转移酶) | 单细胞转录组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,但涉及热中性或急性冷暴露条件下的小鼠脂肪组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 409 | 2026-02-28 |
Myocardial reprogramming by HMGN1 underlies heart defects in trisomy 21
2025-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09593-9
PMID:41125893
|
研究论文 | 本研究通过人类多能干细胞和小鼠模型,揭示了HMGN1在唐氏综合征相关先天性心脏缺陷中的关键作用 | 首次将HMGN1鉴定为染色体21上的剂量敏感基因,通过单细胞转录组学和CRISPR激活筛选技术,阐明了其在房室管心肌细胞重编程和心脏间隔缺陷中的机制 | 研究主要基于体外细胞模型和小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 解析唐氏综合征中先天性心脏缺陷的遗传机制 | 人类多能干细胞、小鼠模型、染色体21基因 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞转录组学、CRISPR激活筛选、CROP-seq | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 410 | 2026-02-28 |
Single-cell transcriptomics showed that maternal PCB exposure dysregulated ER stress-mediated cell type-specific responses in the liver of female offspring
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.04.657944
PMID:40501930
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了母体多氯联苯暴露如何通过内质网应激途径,在雌性后代肝脏中引起细胞类型特异性的代谢与免疫功能失调 | 首次在单细胞分辨率下系统阐明了围产期PCB暴露对雌性后代肝脏不同细胞类型的特异性转录重编程效应,并揭示了内质网应激通路的关键介导作用 | 研究仅针对雌性后代且观察时间点为出生后28天,未评估雄性后代、更长期效应或剂量依赖性反应 | 探究母体多氯联苯暴露对后代肝脏发育的细胞类型特异性影响 | 围产期暴露于多氯联苯混合物的雌性小鼠(出生后28天)的肝脏组织 | 单细胞转录组学 | 代谢功能障碍 | 单细胞RNA测序,RT-qPCR | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 围产期PCB暴露的雌性小鼠肝脏组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 411 | 2026-02-27 |
WNT10A-SMOC2-LRP4 network affects permanent tooth development via potential tooth-bone interaction
2025-Dec-17, BMC oral health
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12903-025-06451-y
PMID:41408627
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研究论文 | 本文通过一例非综合征性牙齿缺失病例,探讨了WNT10A、SMOC2和LRP4基因变异如何通过牙-骨相互作用影响恒牙发育 | 首次报道了LRP4基因的新变异与牙齿缺失的关联,并通过单细胞RNA-seq和免疫荧光揭示了LRP4阳性牙槽骨细胞通过FGF信号调控WNT10A和SMOC2阳性牙髓细胞的潜在机制 | 研究基于单一病例,样本量有限,需要更大规模的研究验证 | 探究下颌环境对非综合征性牙齿缺失的影响,特别是基因变异在牙-骨相互作用中的作用 | 一名19岁非综合征性牙齿缺失患者及其基因变异 | 数字病理学 | 牙齿缺失 | 全外显子组测序、Sanger测序、单细胞RNA-seq、免疫荧光染色 | NA | 基因序列数据、单细胞RNA-seq数据、影像数据 | 1名患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 412 | 2026-02-27 |
A defined bacterial consortium and spatial transcriptomics highlight the complex interaction between Campylobacter jejuni and the murine intestine
2025-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2600053
PMID:41411657
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研究论文 | 本研究通过建立定义的细菌群落并结合空间转录组学技术,揭示了空肠弯曲菌与小鼠肠道之间的复杂相互作用 | 首次使用定义的13种细菌群落结合空间转录组学,在单细胞水平上解析宿主、微生物群和病原体在肠道感染中的相互作用 | 研究仅使用小鼠模型,结果可能无法完全适用于人类;定义的细菌群落可能无法完全模拟自然微生物群的复杂性 | 阐明特定肠道细菌与空肠弯曲菌介导的宿主反应之间的相互作用机制 | 无菌小鼠、定义的13种细菌群落、空肠弯曲菌81-176菌株 | 空间转录组学 | 肠道感染 | 16S rRNA基因测序、荧光原位杂交、RNAscope、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 三组无菌小鼠:C13组、C13+空肠弯曲菌组、无菌对照组 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 413 | 2026-02-27 |
Engineering a spatiotemporal macrophage circuit via STING phase separation to override immune suppression in pancreatic cancer
2025-Nov-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2504718122
PMID:41264244
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研究论文 | 本研究开发了一种基于STING相分离的时空巨噬细胞重编程平台,用于克服胰腺癌的免疫抑制微环境 | 首次利用STING相分离原理构建时空可控的巨噬细胞回路,实现TAMs的序贯重编程并防止过度炎症反应 | 研究目前处于临床前模型阶段,尚未进行人体临床试验验证 | 开发新型巨噬细胞靶向免疫治疗策略以克服胰腺癌免疫抑制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)及其肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 414 | 2026-02-27 |
Genetically Engineered Mouse Models for Alzheimer Disease and Frontotemporal Dementia: New Insights from Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2025-Nov, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.11.006
PMID:39743215
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综述 | 本文综述了阿尔茨海默病和额颞叶痴呆的基因工程小鼠模型,并基于单细胞和空间转录组学研究总结了主要发现 | 整合了最新的单细胞转录组学、多组学和空间转录组学数据,为神经退行性疾病模型提供了新的分子和细胞层面见解 | 没有模型是完美的,可能存在物种差异和病理不完全模拟的问题 | 研究神经退行性疾病的病因和潜在治疗方法 | 基因工程小鼠模型,特别是阿尔茨海默病和额颞叶痴呆模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学, 多组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞 RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 415 | 2026-02-27 |
GreenCells: A comprehensive resource for single-cell analysis of plant lncRNAs
2025-10, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110678
PMID:40912654
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研究论文 | 本文介绍了GreenCells数据库,一个专门用于在单细胞水平探索植物长非编码RNA的综合资源 | 开发了首个专注于植物lncRNA的单细胞分析数据库,整合了多物种数据并识别了lncRNA标记基因及共表达网络 | NA | 研究植物lncRNA在单细胞分辨率下的表达和功能 | 八种植物物种的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 416 | 2026-02-27 |
Computational Drug Repurposing for Alzheimer's Disease via Sheaf Theoretic Population-Scale Analysis of snRNA-seq Data
2025-Sep-29, ArXiv
PMID:41256885
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研究论文 | 本文提出了一种基于鞘理论的计算药物重定位模型,用于阿尔茨海默病的治疗,通过分析大规模单核RNA测序数据来识别药物靶点 | 首次将持久鞘拉普拉斯算子应用于阿尔茨海默病的药物重定位,结合群体水平的单核RNA测序数据进行蛋白质-蛋白质相互作用分析 | 研究依赖于公共数据集,可能未涵盖所有阿尔茨海默病亚型或细胞类型,且药物预测模型需进一步实验验证 | 开发一种计算药物重定位方法,以针对阿尔茨海默病的分子靶点筛选现有药物 | 阿尔茨海默病相关的微胶质细胞和脑血管组织中的多种细胞类型,涉及数十万个细胞核 | 计算生物学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序 | 机器学习模型 | 单核RNA测序数据 | 涉及多患者、多区域研究的数十万个细胞核 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 417 | 2026-02-27 |
The urokinase receptor/uPAR is a major effector of p53 gain-of-function mutations in gemcitabine-treated pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-09, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110561
PMID:40759369
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研究论文 | 本文研究了在胰腺导管腺癌中,TP53功能获得性突变通过上调uPAR表达,促进吉西他滨治疗后癌细胞侵袭和转移的机制 | 揭示了TP53功能获得性突变通过上调PLAUR/uPAR表达,驱动吉西他滨治疗后胰腺癌细胞的侵袭性增强和化疗耐药,并利用单细胞RNA测序技术验证了PLAUR在特定恶性上皮细胞簇中的表达增加 | 研究主要基于细胞系和TCGA数据,缺乏体内实验验证,且EGFR沉默对uPAR介导的ERK1/2激活无影响的机制未完全阐明 | 探究TP53功能获得性突变在胰腺导管腺癌化疗耐药和侵袭转移中的作用机制 | 胰腺导管腺癌细胞系(PANC1和MIA PaCa-2)及TCGA数据库中的患者数据 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、基因沉默、细胞迁移和侵袭实验 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | TCGA数据库中的胰腺导管腺癌样本及PANC1、MIA PaCa-2细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 418 | 2026-02-27 |
SMAD1/5-mediated recruitment of the histone demethylase KDM1A controls cell fate programs in embryonic stem cells
2025-09, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110591
PMID:40812426
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研究论文 | 本研究揭示了SMAD1/5通过招募组蛋白去甲基化酶KDM1A来调控小鼠胚胎干细胞中细胞命运程序的转录抑制机制 | 发现了SMAD1/5通过招募KDM1A去除增强子相关的H3K4me1/2标记,从而调控细胞类型特异性基因表达程序的新机制 | 研究主要基于小鼠胚胎干细胞模型,在人类细胞或其他生物系统中的普适性尚需验证 | 探究SMAD1/5在小鼠胚胎干细胞中调控细胞命运的具体分子机制 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs) | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq) | NA | 基因表达数据,染色质修饰数据 | Smad1/5双敲除(S1/5 dKO)和野生型(WT)小鼠胚胎干细胞 | NA | 单细胞RNA测序,染色质免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 419 | 2026-02-27 |
CREB Drives Acinar to Ductal Cells Reprogramming and Promotes Pancreatic Cancer Progression in Preclinical Models of Alcoholic Pancreatitis
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101606
PMID:40812683
|
研究论文 | 本研究探讨了在酒精性慢性胰腺炎背景下,CREB与致癌KrasG12D/+在促进胰腺癌进展中的分子相互作用 | 揭示了CREB在酒精性胰腺炎模型中驱动腺泡细胞向导管细胞重编程并加速胰腺癌进展的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 阐明慢性炎症下CREB与Kras*协同促进胰腺癌进展的分子机制 | 胰腺腺泡细胞、导管病变、胰腺上皮内瘤变 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、Western blotting、磷酸激酶阵列、定量PCR、谱系追踪 | 遗传工程小鼠模型(KC, KCC-/-) | 基因表达数据、组织学图像 | 多种遗传背景的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 420 | 2026-02-26 |
Single-cell RNA sequencing informs precision targeting of monogenic lupus associated with IKZF1 haploinsufficiency
2025-Dec-15, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70017
PMID:41392616
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探究了IKZF1单倍体不足驱动的单基因狼疮患者的免疫失调机制 | 首次利用单细胞RNA测序结合生物信息学分析,揭示了IKZF1单倍体不足患者中B细胞和T细胞的异常分化轨迹及IFN-JAK-STAT信号通路过度激活 | 研究仅基于一名儿科患者,样本量较小,可能限制结果的普遍性 | 探究单基因狼疮(IKZF1单倍体不足)的免疫失调机制,以指导精准靶向治疗 | IKZF1单倍体不足的儿科狼疮患者、无已知基因突变的狼疮病例及健康对照者的外周免疫细胞 | 数字病理学 | 狼疮 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA) | 单细胞RNA测序数据 | 一名IKZF1单倍体不足患者、多例无已知基因突变的狼疮病例及健康对照者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |