单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10572 篇文献，本页显示第 4161 - 4180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4161 | 2025-11-25 |
Characterization of immunosenescent alveolar macrophages in rhesus macaques
2025-Oct-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.10.681684
PMID:41279789
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序表征了恒河猴肺泡巨噬细胞在自然衰老过程中的免疫衰老特征 | 首次在非人灵长类动物模型中系统揭示肺泡巨噬细胞在自然衰老过程中的转录组和功能变化，并发现巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)作为潜在生物标志物 | 支气管肺泡灌洗液可能无法准确反映肺组织中肺泡巨噬细胞的真实状态，样本量未明确说明 | 研究自然衰老对肺泡巨噬细胞的影响及其在肺部衰老中的作用机制 | 年轻与老年恒河猴的肺泡巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序, 细胞因子分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 年轻和老年恒河猴(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4162 | 2025-11-25 |
Optimal transport modeling uncovers spatial domain dynamics in spatiotemporal transcriptomics studies
2025-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.06.680672
PMID:41278900
|
研究论文 | 提出了一种名为SpaDOT的计算方法，用于识别空间转录组学研究中的空间域并推断其跨时间点的动态变化 | 结合变分自编码器框架与最优传输理论，首次在空间转录组学中同时建模全局空间连续性和局部结构异质性，并能追踪空间域随时间的动态转变 | NA | 开发计算方法来识别和追踪空间转录组学数据中的空间域动态变化 | 时空转录组学数据 | 空间转录组学 | 心脏瓣膜发育 | 时空转录组学 | 变分自编码器(VAE), 高斯过程, 最优传输(OT) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4163 | 2025-11-25 |
A Phase I Trial of Evorpacept, Lenalidomide, and Rituximab for Patients with B-Cell Non-Hodgkin Lymphoma
2025-Oct-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-1826
PMID:40729376
|
研究论文 | 评估Evorpacept联合来那度胺和利妥昔单抗治疗B细胞非霍奇金淋巴瘤患者的安全性及抗肿瘤活性 | 首次将CD47阻断剂Evorpacept与来那度胺和利妥昔单抗联合用于治疗B细胞非霍奇金淋巴瘤，并证明其可逆转SIRPα+巨噬细胞介导的耐药机制 | 单臂I期研究，样本量较小（20例患者），缺乏对照组 | 评估Evorpacept联合来那度胺和利妥昔单抗在B细胞非霍奇金淋巴瘤患者中的安全性和初步疗效 | 接受过至少两种系统治疗的B细胞非霍奇金淋巴瘤成年患者 | 肿瘤免疫治疗 | B细胞非霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、单细胞RNA测序数据 | 20例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4164 | 2025-11-25 |
BTK Inhibitor Synergizes With CD19-Targeted Chimeric Antigen Receptor-T Cells in Patients With Relapsed or Refractory B-Cell Lymphoma: An Open-Label Pragmatic Clinical Trial
2025-Oct, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71321
PMID:41123227
|
研究论文 | 本研究评估BTK抑制剂联合CD19靶向CAR-T细胞治疗复发或难治性B细胞淋巴瘤的安全性和疗效 | 首次在临床试验中证实BTK抑制剂能够增强CAR-T细胞疗法的抗肿瘤效果，并发现BTKi治疗组T细胞更倾向于早期分化且衰竭程度更低 | 非随机化试验设计，样本量较小（n=37），组间分配基于患者自主选择 | 评估BTK抑制剂联合CD19-CAR-T细胞治疗B细胞淋巴瘤的安全性和临床疗效 | 37例复发或难治性B细胞淋巴瘤患者 | 临床医学 | B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据，单细胞转录组数据 | 37例患者（CAR-T单药组24例，联合治疗组13例） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4165 | 2025-11-25 |
Single-cell RNA sequencing reveals the role of immunoinflammatory cells in the progression of renal tubulointerstitial fibrosis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0337092
PMID:41269996
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了免疫炎症细胞在肾小管间质纤维化进展中的作用机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统描绘了UUO模型中免疫炎症细胞的动态变化及其与成纤维细胞的相互作用网络 | 研究仅基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 阐明免疫炎症细胞在肾小管间质纤维化进展中的具体作用机制 | 单侧输尿管梗阻模型小鼠的肾脏组织 | 单细胞测序分析 | 慢性肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同时间点（3天、7天、14天）的UUO模型小鼠和假手术组小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4166 | 2025-11-25 |
Multi-omics analysis indicates an association between TAPBP and prostate cancer
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0336438
PMID:41270069
|
研究论文 | 通过多组学分析鉴定与前列腺癌相关的关键基因TAPBP | 首次整合蛋白质组、转录组、单细胞测序和多种统计方法系统筛选前列腺癌相关基因 | 研究结果需要进一步实验验证，样本来源和数量未明确说明 | 识别导致前列腺癌发生的关键基因并寻找潜在药物靶点 | 前列腺癌相关基因和蛋白质 | 生物信息学 | 前列腺癌 | PWAS, TWAS, 单细胞测序, 孟德尔随机化, 贝叶斯共定位分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 4167 | 2025-11-24 |
Zebrafish: A Versatile and Powerful Model for Biomedical Research
2025-Dec, BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology
IF:3.2Q1
DOI:10.1002/bies.70080
PMID:41108536
|
综述 | 本文系统阐述了斑马鱼作为生物医学研究模型的优势、应用领域及最新技术进展 | 整合了CRISPR/Cas9、单细胞转录组学、计算建模和机器学习等前沿技术，拓展了斑马鱼在精准医疗中的应用场景 | 存在物种特异性脂质代谢差异和抗体可用性有限等问题 | 探讨斑马鱼模型在精准医疗和疾病建模中的应用价值 | 斑马鱼（Danio rerio）生物模型 | 生物医学研究 | 心血管疾病、神经系统疾病、代谢疾病、肿瘤疾病、传染性疾病、神经精神疾病 | CRISPR/Cas9、prime editing、morpholino、单细胞转录组学、计算建模、机器学习 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4168 | 2025-11-24 |
An injectable hyaluronic acid-silanol hydrogel containing arginine and puerarin for immune modulation and enhanced diabetic wound healing
2025-Dec, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.08.040
PMID:41268352
|
研究论文 | 本研究开发了一种含有精氨酸和葛根素的可注射透明质酸-硅醇水凝胶，用于糖尿病伤口愈合的免疫调节和促进治疗 | 首次将透明质酸、硅醇与精氨酸和葛根素结合制成可注射水凝胶，并通过单细胞RNA测序技术深入分析其对巨噬细胞极化的调节机制 | 研究主要基于糖尿病小鼠模型，尚未在临床环境中验证其安全性和有效性 | 开发新型糖尿病伤口愈合治疗方法 | 糖尿病伤口愈合过程及巨噬细胞极化调控 | 生物医学工程 | 糖尿病并发症 | 单细胞RNA测序，体外实验，组织学分析 | NA | 基因表达数据，组织图像数据 | 糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4169 | 2025-11-24 |
ASAH1-mediated sphingolipid metabolic reprogramming in venetoclax resistance of AML: beyond the monocytic phenotypes
2025-Nov-22, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15272-9
PMID:41275169
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了ASAH1介导的鞘脂代谢重编程在急性髓系白血病 Venetoclax耐药机制中的关键作用 | 首次发现单核细胞AML中鞘脂代谢异常与Venetoclax耐药相关，并证明ASAH1基因敲除可增强药物敏感性而不影响单核细胞表型标记 | 研究主要基于体外细胞系和动物模型，需要进一步临床验证 | 探索急性髓系白血病对Venetoclax耐药的分子机制 | 急性髓系白血病患者骨髓样本、患者来源异种移植模型和诱导耐药细胞系 | 生物医学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,脂质组学测序,基因敲除 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据,脂质组学数据 | AML患者骨髓样本、PDX模型和耐药细胞系 | NA | 单细胞RNA测序,脂质组学测序 | NA | NA |
| 4170 | 2025-11-24 |
Unveiling the role of gastric cancer-associated mesenchymal stem cells and neutrophil extracellular traps through multi-omics analysis
2025-Nov-20, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04768-7
PMID:41261408
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示胃癌相关间充质干细胞和中性粒细胞胞外诱捕网在肿瘤微环境中的作用机制 | 首次整合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和功能富集分析系统解析GC-MSCs与NETs在胃癌微环境重塑中的相互作用 | 基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 探究胃癌微环境中GC-MSCs和NETs的分子机制及治疗靶点 | 胃癌肿瘤微环境中的细胞组成和分子网络 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 功能富集分析 | NA | 转录组数据 | TCGA和GEO公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4171 | 2025-11-24 |
MRAP mediated adipocyte differentiation by thymic mesenchymal stromal cells contributes to thymic involution
2025-Nov-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64973-z
PMID:41266306
|
研究论文 | 本研究揭示了胸腺间充质基质细胞通过MRAP介导的脂肪细胞分化在年龄相关性胸腺退化中的作用机制 | 首次发现MRAP是胸腺间充质基质细胞脂肪生成的关键驱动因子，并阐明胸腺素-α1通过FoxO1信号通路促进MRAP表达的机制 | NA | 探究年龄相关性胸腺退化中脂肪沉积的细胞和分子机制 | 胸腺间充质基质细胞、小鼠和人类胸腺组织 | 细胞生物学 | 年龄相关性胸腺退化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和年老小鼠及人类胸腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4172 | 2025-11-24 |
Macrophage mitophagy-related genes predict prognosis and therapeutic response in lung adenocarcinoma
2025-Nov-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-24769-z
PMID:41266404
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和机器学习算法，开发了基于巨噬细胞线粒体自噬相关基因的肺腺癌预后模型 | 首次将巨噬细胞线粒体自噬相关基因与肺腺癌预后关联，并鉴定出TUBB6和CAT作为核心预后基因 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 识别关键的巨噬细胞线粒体自噬相关基因并建立肺腺癌预后模型 | 肺腺癌患者和巨噬细胞 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞转录组测序 | LASSO, SVM, 随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4173 | 2025-11-24 |
Integrative analysis identifies STX16 as a prognostic and immune-associated biomarker in ccRCC
2025-Nov-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-24921-9
PMID:41266441
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，系统探讨了STX16在肾透明细胞癌中的表达模式、预后价值和免疫功能 | 首次系统揭示STX16在ccRCC中的预后价值和免疫调节功能，并通过单细胞测序解析其在肿瘤微环境中的异质性表达 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，需要更多体内实验和临床样本验证 | 探究STX16在肾透明细胞癌中的表达特征、临床意义和生物学功能 | 肾透明细胞癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 肾癌 | 生物信息学分析，Western blot，免疫组化，siRNA敲低，单细胞测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据，临床数据，蛋白质数据 | TCGA等公共数据库中的ccRCC样本，实验室细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4174 | 2025-11-24 |
Single-cell RNA sequencing reveals age-related heterogeneity in the tumor microenvironment of breast cancer patients
2025-Nov-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-24720-2
PMID:41266463
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示乳腺癌肿瘤微环境中与年龄相关的异质性 | 首次在单细胞水平系统比较年轻与老年乳腺癌患者肿瘤微环境的差异，发现干扰素刺激基因在年轻患者肿瘤发生中的关键作用 | 样本量有限（仅10例患者） | 研究年龄对乳腺癌肿瘤微环境组成和功能的影响 | 乳腺癌患者的肿瘤组织 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组化染色，伪时间轨迹分析 | inferCNV | 单细胞转录组数据，临床生存数据，蛋白质表达数据 | 10例乳腺癌患者（5例≤40岁，5例≥70岁），包含33,664个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4175 | 2025-11-24 |
Integrative analysis reveals prognostic value of cuproptosis and copper hemostasis related genes in immunotherapy for non-small cell lung cancer
2025-Nov-20, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01138-7
PMID:41266534
|
研究论文 | 本研究通过整合分析五个NSCLC免疫治疗队列的RNA测序数据，开发了基于铜死亡和铜稳态相关基因的预后模型 | 首次发现铜依赖性增殖亚型与不良预后和免疫抑制肿瘤微环境相关，并构建了结合101种算法模型的机器学习流程进行风险分层 | 研究基于回顾性队列数据，需要前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 探索铜死亡和铜稳态相关基因在非小细胞肺癌免疫治疗中的预后价值 | 非小细胞肺癌患者和临床标本 | 生物信息学 | 肺癌 | RNA测序, 单细胞测序, 蛋白质印迹, 免疫组织化学 | 机器学习集成模型 | 基因表达数据, 单细胞数据, 临床数据 | 五个NSCLC免疫治疗队列 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4176 | 2025-11-24 |
Characterization of the bone marrow architecture of multiple myeloma using spatial transcriptomics
2025-Nov-20, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08975-z
PMID:41266582
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术表征多发性骨髓瘤骨髓结构的空间特征 | 开发了整合空间和单细胞转录组数据的定制分析框架，首次实现了矿化长骨组织中细胞组成和相互作用的原位映射 | Visium技术在表征空间调控机制方面存在能力限制 | 研究多发性骨髓瘤骨髓结构的空间特征及其在疾病进展中的作用 | 健康和多发性骨髓瘤小鼠模型的骨髓样本，以及多发性骨髓瘤患者样本 | 空间转录组学 | 多发性骨髓瘤 | 空间转录组学，单细胞转录组学 | 定制分析框架 | 空间基因表达数据，单细胞转录组数据 | 健康和多发性骨髓瘤小鼠模型，多发性骨髓瘤患者活检样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium Spatial Gene Expression | Visium Spatial Gene Expression平台用于福尔马林固定石蜡包埋骨髓切片 |
| 4177 | 2025-11-24 |
TPM2 regulates contractility and biomechanical properties in trabecular meshwork cells
2025-Nov-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-24993-7
PMID:41266745
|
研究论文 | 本研究探讨TPM2在小梁网细胞中对收缩相关分子表达和生物力学特性的调控作用 | 首次揭示TPM2通过调节小梁网细胞收缩性、改变细胞骨架结构和诱导生物力学特性变化来调控房水流出 | 分子调控机制尚未完全阐明 | 研究TPM2对小梁网细胞收缩性和生物力学特性的影响 | 人小梁网细胞(HTMCs) | 细胞生物学 | 原发性开角型青光眼(POAG) | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4178 | 2025-11-24 |
Benchmarking deep learning methods for biologically conserved single-cell integration
2025-Nov-20, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03869-z
PMID:41267095
|
研究论文 | 评估深度学习单细胞数据整合方法并改进基准测试框架 | 提出基于相关性的损失函数和增强的基准测试指标scIB-E，更好地保留生物信号 | 现有单细胞整合基准指数在保留细胞类型内信息方面存在局限 | 系统评估单细胞数据整合方法并改进基准测试策略 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 肺癌, 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器 | 基因表达数据 | 数百万细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4179 | 2025-11-24 |
Machine learning-powered discovery of a novel berberine derivative inducing SCD-dependent ferroptosis in osteosarcoma
2025-Nov-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07358-6
PMID:41267108
|
研究论文 | 本研究通过机器学习引导发现了一种新型小檗碱衍生物B1，可诱导骨肉瘤发生SCD依赖性铁死亡 | 首次将机器学习整合到蛋白质组学发现流程中，鉴定出SCD为关键靶点，并发现B1作为分子胶诱导SCD泛素化降解的新机制 | 研究主要基于体外细胞系和动物模型，尚未进行临床试验验证 | 开发针对耐药骨肉瘤的新型治疗策略 | 骨肉瘤细胞系(143B、U2OS、HOS)和BALB/c裸鼠模型 | 机器学习 | 骨肉瘤 | 蛋白质组测序、单细胞RNA测序、分子对接、热位移分析、表面等离子共振、免疫共沉淀、泛素化分析、脂质组学 | LASSO、Ridge、Elastic Net、mRMR | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、分子相互作用数据 | 多种骨肉瘤细胞系和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组测序 | NA | NA |
| 4180 | 2025-11-24 |
Toward a ToxAtlas of Carbon-Based Nanomaterials: Single-Cell RNA Sequencing Reveals Initiating Cell Circuits in Pulmonary Inflammation
2025-Nov-18, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c12054
PMID:41183169
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示碳基纳米材料引发肺部炎症的起始细胞回路 | 首次在单细胞分辨率下系统比较不同碳基纳米材料引发的特异性分子起始事件，并开发了ToxAtlas网络工具 | 仅关注急性炎症反应（12小时），未研究长期慢性炎症发展过程 | 理解纳米材料特性如何驱动急性肺部炎症反应 | 小鼠肺部细胞 | 单细胞组学 | 肺部炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肺部细胞（鉴定出41种细胞状态） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |