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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4081 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptional analysis of murine mesenteric lymph nodes following oral lyso-phosphatidylserine nanoparticle administration reveals cellular heterogeneity in tolerance features
2025-Sep, Journal of pharmaceutical sciences
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.xphs.2025.103919
PMID:40712826
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析口服含溶血磷脂酰丝氨酸纳米颗粒后小鼠肠系膜淋巴结的免疫细胞反应 | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示LysoPS纳米颗粒通过TGF-β反应诱导B细胞、T细胞和NK细胞耐受性特征的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型,人体内的生物过程和细胞通讯机制仍不明确 | 阐明LysoPS介导的口服耐受性中的免疫细胞相互作用和潜在耐受机制 | 小鼠肠系膜淋巴结中的免疫细胞(B细胞、T细胞、NK细胞) | 单细胞组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4082 | 2025-10-05 |
SmartImpute is a targeted imputation framework for single-cell transcriptome data
2025-Aug-18, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101122
PMID:40763742
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研究论文 | 提出一种针对单细胞转录组数据的靶向插补框架SmartImpute | 采用改进的生成对抗插补网络(GAIN)与多任务判别器,专注于预定义标记基因,在填补缺失值的同时保留真实生物零值 | NA | 提高单细胞RNA测序数据的生物学相关性和计算效率 | 头颈鳞状细胞癌、人骨髓和肺癌的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 头颈癌, 骨髓疾病, 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 生成对抗网络(GAIN) | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 超过一百万细胞的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4083 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA-seq provides insight into the underdeveloped immune system of germ-free mice
2025-Jul-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示无菌小鼠免疫系统发育不全的分子机制 | 首次使用液滴单细胞RNA测序系统比较无菌小鼠与特定病原体自由小鼠的免疫细胞差异,发现微生物缺失导致中性粒细胞凋亡增加和干扰素反应受损的新机制 | 研究主要聚焦于骨髓和外周血细胞,未涉及其他免疫器官;机制验证仍需进一步功能实验 | 探究微生物群缺失导致免疫系统发育不全的分子机制 | 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠的骨髓及外周血免疫细胞 | 单细胞组学 | 免疫缺陷 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠的骨髓及外周血样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 液滴单细胞RNA测序平台 |
| 4084 | 2025-10-05 |
Phenotypic, transcriptomic, and genomic analyses reveal the spatiotemporal patterns and associated genes of coarse hair density in goats
2025-07-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了大足黑山羊粗毛密度的时空变化模式及其相关基因 | 创新应用高分辨率微型相机成像技术,结合转录组、基因组和单细胞RNA测序等多组学数据解析粗毛密度调控机制 | 研究主要聚焦于单一山羊品种,结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 探究山羊粗毛密度的遗传调控机制和时空变化规律 | 大足黑山羊 | 基因组学 | NA | RNA-seq, 全基因组测序, 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹, 免疫组织化学染色 | NA | 图像, 转录组, 基因组 | 905张皮肤图像, 33个皮肤转录组, 272个全基因组序列, 182个下载转录组 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 全基因组测序 | NA | NA |
| 4085 | 2025-10-05 |
CXCL12 Drives Reversible Fibroimmune Remodeling in Androgenetic Alopecia Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Jul-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26146568
PMID:40724819
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示CXCL12在雄激素性脱发中驱动可逆性纤维免疫重塑的作用机制 | 首次在雄激素性脱发模型中系统阐明CXCL12通过自分泌和旁分泌信号通路协调调控成纤维细胞和免疫细胞的核心作用 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 阐明CXCL12在雄激素性脱发纤维免疫病理过程中的分子机制 | 睾酮诱导的雄激素性脱发小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 雄激素性脱发 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4086 | 2025-10-05 |
Conserved spatial subtypes and cellular neighborhoods of cancer-associated fibroblasts revealed by single-cell spatial multi-omics
2025-May-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.03.004
PMID:40154487
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研究论文 | 通过单细胞空间多组学技术揭示癌症相关成纤维细胞在多种癌症类型中保守的空间亚型和细胞邻域结构 | 首次在10种癌症类型中鉴定出四种保守的空间CAF亚型,这些亚型具有跨癌症类型和空间组学平台的普适性 | 研究涉及多种平台和技术,可能存在技术偏差;样本来源的癌症类型有限 | 探索癌症相关成纤维细胞在肿瘤微环境中的空间组织特征和相互作用网络 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs)及其在肿瘤微环境中的空间分布 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 超过1400万个细胞,涵盖10种癌症类型 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞多组学 | 7种空间组学平台 | 7种不同的空间转录组学和蛋白质组学平台技术 |
| 4087 | 2025-10-05 |
Cutting-edge tools for unveiling the dynamics of plasmid-host interactions
2025-May, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.12.013
PMID:39843314
|
综述 | 本文探讨了用于揭示质粒-宿主相互作用动态的前沿技术工具 | 批判性评估单细胞测序、荧光技术和Hi-C等先进方法在质粒-宿主相互作用研究中的应用,并探讨CRISPR-based噬菌体工程等新兴技术的潜力 | NA | 研究抗生素抗性基因在复杂微生物组中的质粒介导传播机制 | 质粒-宿主相互作用和抗生素抗性基因传播动态 | 微生物组学 | 抗生素耐药性 | 单细胞测序,荧光技术,高通量染色质构象捕获,CRISPR-based噬菌体工程 | NA | 基因组数据,染色质构象数据 | NA | NA | 单细胞测序,Hi-C | NA | NA |
| 4088 | 2025-10-05 |
Local genetic covariance analysis with lipid traits identifies novel loci for early-onset Alzheimer's Disease
2025-Mar, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011631
PMID:40096060
|
研究论文 | 本研究通过局部遗传协方差分析发现早发性阿尔茨海默病与脂质性状之间存在共享遗传结构 | 首次使用SUPERGNOVA方法系统分析EOAD与脂质性状的局部遗传协方差,并识别出3个新的候选致病基因 | 样本量相对有限,EOAD病例数较少,功能验证实验不足 | 探索早发性阿尔茨海默病与脂质代谢途径的共享遗传机制 | 早发性阿尔茨海默病患者和血脂性状人群 | 遗传学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组关联分析,遗传协方差分析,eQTL共定位分析,单细胞RNA测序 | SUPERGNOVA | 基因组汇总统计数据 | EOAD: 19,668例;血脂性状: 1,320,016例 | NA | 单细胞RNA测序,DNA甲基化分析 | NA | NA |
| 4089 | 2025-10-05 |
Single-cell splicing QTL analysis in pancreatic islets
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1657895
PMID:41000275
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胰腺胰岛中的剪接数量性状位点 | 首次在单细胞水平识别胰腺胰岛α和β细胞中的剪接QTL,发现了批量分析中未观察到的CDC42基因变异 | 样本量有限,统计功效有待提升 | 探索遗传变异对单细胞水平选择性剪接的调控机制 | 胰腺胰岛α细胞和β细胞 | 单细胞基因组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 基因分型, 异构体定量分析 | sQTLseeker2 | 单细胞RNA测序数据 | 8个全长单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4090 | 2025-10-05 |
Novel diagnostic biomarkers associated with macrophage-microglia in spinal cord injury
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1634014
PMID:41000385
|
研究论文 | 本研究通过机器学习算法识别脊髓损伤中与巨噬细胞-小胶质细胞相关的诊断生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法识别脊髓损伤中巨噬细胞-小胶质细胞相关的关键枢纽基因 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于体外模型 | 探索脊髓损伤中巨噬细胞-小胶质细胞相关的诊断生物标志物 | 脊髓损伤相关的基因表达数据和巨噬细胞-小胶质细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, qPCR, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | GEO数据库中的脊髓损伤相关数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4091 | 2025-10-05 |
Integrated analysis of single-cell and bulk transcriptomics reveals the prognostic value and underlying mechanisms of crotonylation in ovarian cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1596080
PMID:41000388
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组学分析,揭示巴豆酰化在卵巢癌中的预后价值及潜在机制 | 首次系统研究巴豆酰化在卵巢癌微环境中的作用,并构建基于巴豆酰化的预后模型 | 未在独立队列中进行实验验证 | 开发基于巴豆酰化的卵巢癌预后模型并探索其治疗潜力 | 卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,批量转录组测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 4092 | 2025-10-05 |
Integrating single-cell omics and materials science for uveal melanoma: from mechanistic insights to precision therapeutics
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1661889
PMID:41001023
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综述 | 整合单细胞组学与材料科学前沿技术,推动葡萄膜黑色素瘤从机制研究到精准治疗的发展 | 首次系统整合单细胞多组学技术与智能生物材料在葡萄膜黑色素瘤治疗中的应用,提出跨学科协同治疗新范式 | NA | 探讨单细胞组学与材料科学协同推动葡萄膜黑色素瘤精准治疗的策略与前景 | 葡萄膜黑色素瘤的肿瘤异质性、免疫微环境及分子驱动机制 | 数字病理 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学, CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 单细胞组学数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4093 | 2025-10-05 |
Glycoprotein Ib-CD11b + monocyte-derived macrophages mediate atherosclerosis-exacerbated psoriatic inflammation
2025-Nov-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123960
PMID:40945652
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研究论文 | 本研究揭示了糖蛋白Ib-CD11b+单核细胞来源的巨噬细胞通过GPIb-CD11b轴介导动脉粥样硬化加剧银屑病炎症的机制 | 首次发现CD11b+单核细胞来源的巨噬细胞在动脉粥样硬化合并银屑病病变中显著增加,并阐明血小板来源的GPIb通过GPIb-CD11b轴促进巨噬细胞M1极化的新机制 | 研究样本量有限,主要基于初治患者,需要更大规模研究验证 | 阐明动脉粥样硬化与银屑病之间的炎症相互作用机制 | 银屑病合并动脉粥样硬化患者的皮肤活检组织、分离的巨噬细胞和血小板、咪喹莫特诱导的银屑病小鼠模型 | 单细胞生物学 | 银屑病, 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, 体外功能实验, 动物模型 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据, 实验数据 | 初治银屑病合并动脉粥样硬化患者的皮肤活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4094 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals early cell dynamics of MSC-based therapy in long bone critical-size defects in mice
2025-Nov, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2025.08.007
PMID:40995603
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究MSC疗法在小鼠长骨临界尺寸缺损早期愈合过程中的细胞动态变化 | 首次在临界尺寸骨缺损模型中应用单细胞RNA测序技术揭示MSC治疗早期免疫微环境变化和细胞间通讯网络 | 研究仅观察了治疗后1周时间点,样本量有限,且仅在雄性小鼠中进行 | 阐明MSC在骨缺损愈合早期如何调节局部骨微环境并与其他细胞相互作用 | 10-12周龄BALB/c雄性小鼠的股骨临界尺寸缺损模型 | 单细胞组学 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三组小鼠(空组、支架组、支架+MSC组),每组具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4095 | 2025-10-05 |
Integrated multi-omics profiling identifies Cmpk1 as a monocyte-specific therapeutic target for renal ischemia-reperfusion injury
2025-Nov-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123924
PMID:40848967
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析鉴定Cmpk1作为肾脏缺血再灌注损伤中单核细胞特异性治疗靶点 | 首次揭示单核细胞特异性核苷酸代谢重编程在肾脏缺血再灌注损伤中的关键作用,并确定Cmpk1为核心调控基因 | 研究主要聚焦于单核细胞,其他肾细胞类型的作用可能未被充分探索 | 解析肾脏缺血再灌注损伤中细胞特异性代谢重编程机制并识别治疗靶点 | 肾脏缺血再灌注损伤模型中的单核细胞及其他肾细胞类型 | 多组学整合分析 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,代谢组学,转录组学 | 机器学习 | 基因表达数据,代谢物数据,空间转录数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量转录组学,代谢组学 | NA | NA |
| 4096 | 2025-10-05 |
Tectorigenin could alleviate SA-AKI via reducing M1-like polarization of macrophages through KLF4/NF-κB pathway
2025-Oct-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115300
PMID:40829320
|
研究论文 | 本研究探讨鸢尾素通过KLF4/NF-κB通路调控巨噬细胞M1样极化缓解脓毒症相关急性肾损伤的作用机制 | 首次揭示鸢尾素通过KLF4/NF-κB通路调控巨噬细胞极化在SA-AKI中的治疗作用 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,尚未进行临床验证 | 探究鸢尾素对脓毒症相关急性肾损伤的治疗潜力及作用机制 | LPS诱导的SA-AKI小鼠模型、RAW264.7细胞、腹膜原代巨噬细胞、HK-2细胞 | 分子生物学 | 急性肾损伤 | 流式细胞术、单细胞测序、Transwell共培养、HE染色、透射电镜、siRNA转染 | 动物疾病模型、细胞共培养模型 | 单细胞测序数据、细胞表型数据、组织病理数据 | 小鼠模型、多种细胞系及原代细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | GSE 151658数据库单细胞测序数据 |
| 4097 | 2025-10-05 |
Novel role of splicing factor U2AF2 in the tumour microenvironment and its clinical prognostic value: a comprehensive pan-cancer analysis and experimental validation with a focus on COAD
2025-Oct-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115410
PMID:40854264
|
研究论文 | 通过整合多组学分析和实验验证,揭示了剪接因子U2AF2在结肠腺癌肿瘤微环境中的双重致癌机制及其临床预后价值 | 首次系统阐明U2AF2通过异常RNA剪接驱动恶性转化和通过重塑肿瘤免疫景观促进免疫抑制的双重致癌机制 | 研究主要聚焦于结肠腺癌,其他癌症类型验证相对有限 | 阐明U2AF2在结肠腺癌中的致癌机制及其作为治疗靶点和预后生物标志物的潜力 | 结肠腺癌患者样本、HCT116和HCT8结肠癌细胞系 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光,细胞功能实验 | NA | 转录组数据,临床数据,单细胞测序数据,免疫荧光图像 | 结肠腺癌患者队列和细胞系模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4098 | 2025-10-05 |
VCPIP1 ameliorates sepsis-associated encephalopathy by promoting microglia autophagy via the PI3K/AKT/mTOR pathway
2025-Oct-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115417
PMID:40865405
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研究论文 | 本研究探讨VCPIP1通过调控小胶质细胞自噬改善脓毒症相关脑病的作用机制 | 首次发现VCPIP1在SAE中通过PI3K/AKT/mTOR通路调控小胶质细胞自噬的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 阐明VCPIP1在脓毒症相关脑病中的作用机制 | 小鼠海马组织和小胶质细胞 | 神经科学 | 脓毒症相关脑病 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 基因表达数据,行为学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4099 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA Sequencing Demonstrates the Heterogeneity of Different Molecular Subtypes in Gastric Cancer
2025-Oct, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-024-10922-2
PMID:39311993
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胃癌不同分子亚型的异质性特征 | 首次在单细胞水平系统解析胃癌TCGA分子亚型的细胞组成异质性,并构建了亚型特异性lncRNA-基因调控网络 | 样本量相对有限,未进行实验验证 | 探究胃癌不同分子亚型的单细胞水平异质性 | 胃癌患者的不同分子亚型细胞 | 单细胞组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 119,878个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4100 | 2025-10-05 |
Tumor necrosis facilitates perihilar cholangiocarcinoma metastasis by ANGPTL6-augmented vessel permeability and tumor dissemination
2025-Oct, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101514
PMID:40995437
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研究论文 | 本研究探讨肿瘤坏死对肝门部胆管癌预后的影响及其通过ANGPTL6增强血管通透性促进肿瘤转移的机制 | 首次发现ANGPTL6在肿瘤坏死区域特异性富集并通过增强血管通透性促进肝门部胆管癌转移 | 研究样本量有限(306例),机制研究仍需进一步验证 | 探究肿瘤坏死在肝门部胆管癌中的预后意义及其分子调控机制 | 肝门部胆管癌患者组织样本及细胞/动物模型 | 数字病理学 | 胆管癌 | 激光捕获显微切割, 高分辨率质谱, 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 临床病理数据 | 306例肝门部胆管癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | NA |