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当前共找到 10549 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2026-04-24 |
Technologies for Decoding Cancer Metabolism with Spatial Resolution
2025-Jul-01, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a041553
PMID:39284668
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综述 | 本文讨论了三种新兴的代谢组学技术：空间代谢组学、单细胞代谢组学和细胞器代谢组学，及其在解码癌症代谢空间分辨率中的应用 | 系统性地阐述了空间代谢组学、单细胞代谢组学和细胞器代谢组学这三种新兴技术，并探讨了它们与单细胞转录组学和蛋白质组学等传统方法结合使用将如何推动癌症研究的新发现和新问题 | 未具体说明各技术的局限性，仅作为概述性综述 | 讨论新兴代谢组学技术在解码癌症代谢空间分辨率方面的进展和应用前景 | 癌症细胞代谢途径、代谢物谱、空间代谢组学、单细胞代谢组学、细胞器代谢组学 | 数字病理学 | 癌症 | 质谱法 | NA | 代谢物数据 | NA | NA | 空间代谢组学, 单细胞代谢组学, 单细胞转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 382 | 2026-04-24 |
Mechanisms of hematopoietic clonal dominance in VEXAS syndrome
2025-Jun, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-03623-9
PMID:40195449
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研究论文 | 本研究通过免疫表型分析和单细胞转录组学，揭示了VEXAS综合征中造血克隆优势的机制，并开发了人类化疾病模型 | 首次揭示UBA1突变造血干细胞的衰老样程序在炎症微环境中获得优势的克隆竞争机制，并利用碱基编辑技术构建了首个VEXAS综合征人类化模型 | 样本量有限（仅9名男性患者），且模型仅模拟单一突变的效应 | 阐明VEXAS综合征中驱动突变造血克隆优势的致病机制 | VEXAS综合征患者和基因编辑造血干细胞移植小鼠模型 | 数字病理学 | 自身炎症性疾病（VEXAS综合征） | 单细胞RNA测序、碱基编辑 | 人类化小鼠模型 | 单细胞转录组数据、免疫表型数据 | 9名VEXAS综合征男性患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 383 | 2026-04-24 |
Broad rim lesions are a new pathological and imaging biomarker for rapid disease progression in multiple sclerosis
2025-Jun, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-03625-7
PMID:40301560
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研究论文 | 本研究分析了多发性硬化症尸检队列，发现了一种新的病变类型，其特征为广泛的髓样细胞边缘，并与快速疾病进展相关，同时利用PET成像验证了其作为生物标记物的潜力 | 首次发现并定义了一种新的多发性硬化症病变类型——宽边缘病变，并利用空间转录组学和PET成像证实其与快速疾病进展的关联 | 尸检队列样本量有限，且仅基于荷兰脑库的数据；PET验证研究为独立队列，但缺乏纵向动态观察 | 探索多发性硬化症快速进展的病理机制并寻找新的影像学生物标记物 | 多发性硬化症患者的脑组织尸检样本（186例）和PET影像（114例） | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 空间转录组学 | NA | 组织切片和PET影像 | 尸检队列186例，PET队列114例 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 384 | 2026-04-24 |
Endothelial-to-mesenchymal transition gene signature derived from single-cell transcriptomics of human atherosclerotic tissue associates with stable plaque histological characteristics
2025-06, Vascular pharmacology
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.vph.2025.107498
PMID:40318741
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research paper | 利用单细胞转录组数据从人动脉粥样硬化组织中提取内皮-间质转化基因特征，并发现该特征与稳定斑块的组织学特征相关 | 通过计算机模拟谱系追踪从人斑块组织的单细胞转录组数据中识别内皮-间质转化过程中的上调基因，而非仅关注终末分化状态 | 未明确提及局限性，但可能包括依赖公开数据集、样本量有限、动物模型的外推性等 | 揭示人动脉粥样硬化中内皮-间质转化的分子机制，并定义其核心基因表达特征 | 人动脉粥样硬化斑块组织中的内皮细胞和血管平滑肌细胞亚群 | 计算机视觉 | 动脉粥样硬化 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 46个来自人颈动脉的单细胞转录组样本，632个来自人颈动脉的批量RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 385 | 2026-04-24 |
Deciphering the cell type-specific and zonal distribution of drug-metabolizing enzymes, transporters, and transcription factors in livers of mice using single-cell transcriptomics
2025-Feb, Drug metabolism and disposition: the biological fate of chemicals
DOI:10.1016/j.dmd.2024.100029
PMID:39919554
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研究论文 | 利用单细胞转录组学解析小鼠肝脏中药物代谢酶、转运蛋白及转录因子的细胞类型特异性和区域分布 | 首次系统表征小鼠肝脏中药物加工基因在不同细胞类型和肝小叶区域的基线mRNA富集情况，结合单细胞和空间转录组数据实现分区解析 | NA | 表征小鼠肝脏中药物加工基因的细胞类型特异性和区域分布 | 小鼠肝脏细胞类型包括肝细胞、胆管细胞、内皮细胞、库普弗细胞、星状细胞、肌成纤维细胞及免疫细胞 | 机器学习 | 药物性肝损伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 来自已发表数据集的单细胞和单核转录组样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | Seurat V5（分析软件） | 使用Seurat V5在R中进行过滤、标准化、聚类和差异表达分析，并基于已知区域标记物及空间转录组数据验证肝细胞分区 |
| 386 | 2026-04-24 |
Single-cell omics: experimental workflow, data analyses and applications
2025-01, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-023-2561-0
PMID:39060615
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综述 | 全面总结单细胞组学实验流程、数据分析方法及应用 | 系统梳理单细胞组学技术从基因组到代谢组的多层次扩展，以及空间转录组和CRISPR筛选等整合进展 | 未详细说明具体技术对比和性能评估 | 提供单细胞测序及相关数据分析的方法学选择指导 | 单细胞组学技术及其应用 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞基因组学, 单细胞表观基因组学, 单细胞蛋白质组学, 单细胞代谢组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 387 | 2026-04-24 |
Perspective on recent developments and challenges in regulatory and systems genomics
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf106
PMID:40626041
|
综述文章 | 讨论调控和系统基因组学的最新发展、技术局限与未来方向 | 系统评述了顺式调控密码的解读进展、序列-功能神经网络方法及新兴空间转录组学技术 | 指出当前计算方法的基准测试挑战、技术局限及知识空白 | 旨在推动更通用的顺式调控代码模型的构建 | 非编码区的顺式调控元件及基因调控网络 | 机器学习 | NA | 空间转录组学、三维染色质组织分析、基因组学检测 | 序列-功能神经网络 | 基因表达数据、染色质构象数据、基因组序列数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 388 | 2026-04-23 |
Matrix Stiffness Directs Early Injury and Ketogenesis Programs to Prime Kidney Repair
2025-Dec-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000967
PMID:41563281
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研究论文 | 本研究通过整合多种技术方法，揭示了细胞外基质刚度在急性肾损伤修复中的关键作用，并识别出Mfap2作为通过非经典Hippo通路调控酮体生成的重要修复介质 | 首次系统描绘了AKI肾脏基质支架的蛋白质组图谱，发现成纤维细胞/周细胞来源的Mfap2通过LATS1介导的非经典Hippo通路调控代谢重编程，提出了Mfap2-Esr2-Hmgcs2轴作为潜在药物靶点 | 研究主要基于动物模型，尚未在人体中验证；机制研究集中在特定信号通路，可能存在其他未被发现的调控网络 | 阐明细胞外基质如何通过机械代谢信号通路调控急性肾损伤修复过程 | 急性肾损伤动物模型、肾脏细胞外基质、成纤维细胞、周细胞、肾小管细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 数据非依赖性采集蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、空间转录组学、组织工程学 | NA | 蛋白质组数据、磷酸化蛋白质组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 389 | 2026-04-23 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and interactions of immune cells and Müller glia during zebrafish retina regeneration
2025-Dec-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-23-02083
PMID:38934409
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了斑马鱼视网膜再生过程中免疫细胞与Müller胶质细胞的异质性及相互作用 | 首次在斑马鱼视网膜再生中系统解析了Müller胶质细胞的两种静止亚型及其向激活状态或杆状前体细胞的转化，并鉴定了小胶质细胞的三种亚型及其动态变化，同时揭示了炎症通过Jak1-Stat3信号通路调控胶质细胞重编程的机制 | 研究主要基于斑马鱼模型，结果向哺乳动物视网膜再生的直接转化仍需进一步验证 | 探究炎症在视网膜再生过程中如何调控Müller胶质细胞重编程 | 斑马鱼视网膜中的免疫细胞（特别是小胶质细胞）和Müller胶质细胞 | 单细胞组学 | 视网膜损伤与再生 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，但涉及未损伤和损伤后的斑马鱼视网膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 390 | 2026-04-23 |
Dynamic development of microglia and macrophages after spinal cord injury
2025-Dec-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00063
PMID:39101644
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了脊髓损伤后小胶质细胞和巨噬细胞在动态发育过程中的不同演化路径和功能差异 | 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学技术，系统解析了脊髓损伤后小胶质细胞与巨噬细胞的差异化演化轨迹，并识别了巨噬细胞中与促炎效应（整合素β2）和神经保护效应（制瘤素M通路）相关的关键分子机制 | 研究主要基于动物模型，尚未在人类临床样本中得到验证；空间转录组学的分辨率可能不足以完全解析细胞间相互作用的微观空间结构 | 阐明脊髓损伤后继发性损伤过程中小胶质细胞与巨噬细胞的动态变化及其在炎症反应中的不同作用 | 脊髓损伤后的小胶质细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 391 | 2025-12-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies a peripheral monocyte subpopulation and its interaction with atrial macrophages via the CCL3-CCR1 axis during atrial remodeling
2025-12, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3023-9
PMID:40833709
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 392 | 2026-04-23 |
Role of long-chain acyl-CoA synthetases in MASH-driven hepatocellular carcinoma and ferroptosis
2025-Nov-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00096.2025
PMID:40875358
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研究论文 | 本研究通过整合多种组学技术，揭示了长链酰基辅酶A合成酶（ACSLs）在MASH驱动的肝细胞癌（MASH-HCC）脂质代谢重编程和铁死亡敏感性中的关键作用 | 首次在MASH-HCC中系统描绘了脂质代谢全景图，并在单细胞水平上揭示了ACSL4在肿瘤组织和免疫微环境中的特异性表达模式及其与铁死亡敏感性的关联 | 研究主要基于观察性数据，ACSLs在MASH-HCC中的具体功能机制和作为治疗靶点的潜力仍需进一步实验验证 | 探究MASH-HCC中脂质代谢重编程的特征及其与铁死亡敏感性的关系，以寻找新的治疗靶点 | 人类MASH-HCC组织样本、人类HCC细胞系、饮食诱导的小鼠MASH-HCC模型 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 人类MASH和MASH-HCC肝脏样本（具体数量未明确说明），人类HCC细胞系，小鼠MASH-HCC模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 393 | 2026-04-23 |
Disrupted developmental signaling induces novel transcriptional states
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2418351122
PMID:41118206
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为DAISEE的新算法，用于建模单细胞数据集中的扰动响应，并应用于斑马鱼胚胎中ERK信号通路的研究 | 开发了DAISEE算法，能更有效地在复杂实验设计中分离单细胞扰动响应与混杂变异，并揭示了过激活信号通路在发育胚胎中诱导新基因表达状态的能力 | NA | 研究发育信号通路扰动对单细胞转录状态的影响 | 斑马鱼胚胎中的细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解框架 | 单细胞转录组数据 | 5小时龄斑马鱼胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 394 | 2026-04-23 |
Single-cell sequencing uncovers sensory neuron-mediated CGRP signaling as a driver of sarcoma progression
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2500161122
PMID:41118222
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了感觉神经元介导的CGRP信号在肉瘤进展中的驱动作用 | 首次发现肿瘤相关感觉神经元在骨癌中除疼痛感知外的调控功能，并利用化学遗传学方法验证了TrkA抑制对肉瘤生长和转移的抑制作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限，且干预策略的长期效果和临床转化需进一步评估 | 探究感觉神经元在骨肉瘤进展中的调控机制及潜在治疗靶点 | 小鼠骨肉瘤模型和人类骨肉瘤骨样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组学、多模态多组学分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 395 | 2026-04-23 |
The acute myeloid leukemia microenvironment impairs neutrophil maturation and function through NF-κB signaling
2025-Oct-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024028199
PMID:40663784
|
研究论文 | 本研究揭示了急性髓系白血病（AML）微环境通过NF-κB信号通路损害中性粒细胞成熟和功能，导致免疫抑制和感染易感性增加 | 首次在非照射的宿主中使用中性粒细胞报告小鼠模型，结合单细胞转录组学和体外细胞因子筛选，系统阐明了AML微环境如何通过NF-κB信号通路重塑中性粒细胞的表观遗传和功能 | 研究主要基于小鼠模型，虽然患者样本验证了类似生物学现象，但人类AML的异质性可能带来更复杂的调控机制 | 探究AML微环境对健康中性粒细胞成熟和功能的影响及其分子机制 | AML暴露的中性粒细胞（来自小鼠模型和AML患者） | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组学、染色质重塑分析、基序发现、体外细胞因子筛选 | NA | 单细胞RNA-seq数据、表观遗传数据 | 临床前AML小鼠模型及AML患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 396 | 2026-04-23 |
Regulation of Collecting Lymphatic Vessel Contractile Function by TRPV4 Channels
2025-Sep, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322100
PMID:40371469
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验，揭示了TRPV4通道在收集淋巴管收缩功能调控中的新机制 | 首次在收集淋巴管中表征了TRPV4的表达，并发现其通过表达TRPV4的髓系细胞与淋巴肌细胞或淋巴内皮细胞之间的相互作用介导收缩失调 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本仅限于乳腺癌相关淋巴水肿患者，机制细节如其他血管舒张前列腺素的作用需进一步验证 | 探究TRPV4通道在淋巴系统疾病中的表达和功能作用 | 小鼠收集淋巴管及周围组织，以及乳腺癌相关淋巴水肿患者的活检样本 | 单细胞转录组学 | 淋巴水肿 | 单细胞RNA测序，共聚焦显微镜，细胞内钙活性测量 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据，功能实验数据 | 小鼠收集淋巴管样本及患者活检样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 397 | 2026-04-23 |
Integrating single-cell and single-nucleus datasets improves bulk RNA-seq deconvolution
2025-Aug-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.20.671333
PMID:40894744
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研究论文 | 本研究系统性地评估了整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）数据以改善批量RNA测序（bulk RNA-seq）反卷积性能的策略 | 首次系统性地比较了多种整合scRNA-seq和snRNA-seq数据的方法，并提出了针对不同场景的明确指导原则，包括基因过滤和条件变分自编码器（scVI）的应用 | 研究仅在四种组织类型中进行了验证，对于更广泛或更特殊的组织类型，方法的普适性有待进一步验证 | 提高批量RNA测序反卷积的准确性，特别是在缺乏完整scRNA-seq参考数据的情况下 | 批量RNA测序数据的细胞类型组成反卷积 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单核RNA测序（snRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | 条件变分自编码器（scVI），非条件变分自编码器，主成分分析 | RNA测序数据 | 四种不同的组织类型 | NA | 单细胞RNA-seq，单核RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 398 | 2026-04-23 |
Dual states of murine Bmi1-expressing intestinal stem cells drive epithelial development utilizing non-canonical Wnt signaling
2025-Aug-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.03.014
PMID:40262610
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠肠道发育早期Bmi1表达干细胞的功能及其通过非经典Wnt信号调控增殖状态的动态过程 | 首次在Lgr5表达干细胞出现之前鉴定出Bmi1细胞作为功能性干细胞，并发现其通过非经典Wnt信号调控增殖状态向慢周期状态的转变 | 研究主要基于小鼠模型，人类肠道发育中的类似机制仍需验证 | 探究肠道上皮发育过程中干细胞亚群的动态调控机制 | 小鼠肠道发育早期的Bmi1表达干细胞 | 发育生物学 | NA | 谱系追踪，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 399 | 2026-04-23 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Identified Fatty Acid-Binding Proteins Controlling Endothelial Glycolytic and Arterial Programming in Pulmonary Hypertension
2025-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321173
PMID:40401371
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术，揭示了脂肪酸结合蛋白FABP4和FABP5在肺动脉高压中调控内皮细胞糖酵解和动脉编程的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析，系统阐明了内皮细胞FABP4/5在肺动脉高压发病中的关键角色，特别是其通过调控糖酵解和动脉编程促进血管重塑的机制 | 研究主要基于动物模型和有限的患者样本，需要更大规模的人群研究验证；机制研究尚未完全揭示FABP4/5下游的具体信号通路 | 探究内皮细胞FABP4和FABP5在肺动脉高压发病机制中的作用 | 肺动脉内皮细胞、肺组织、患者血浆样本、Egln1Tie2Cre基因敲除小鼠模型 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 血浆蛋白质组分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 包括特发性肺动脉高压患者样本、肺动脉高压大鼠模型、Egln1Tie2Cre小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 400 | 2026-04-23 |
A pre-menopausal single-cell atlas for ovarian drug discovery
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660779
PMID:40666883
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研究论文 | 本研究构建了一个绝经前女性的单细胞图谱（PreMeno Atlas），用于卵巢生物学研究和药物靶点发现 | 首次创建了专注于绝经前女性的多组织单细胞图谱，并系统比较了卵巢细胞类型的转录组特征，识别了潜在的卵巢特异性药物靶点 | 样本来源和数量可能有限，未涵盖所有绝经前年龄段或病理状态 | 构建绝经前女性单细胞图谱以促进卵巢生物学理解和药物靶点发现 | 绝经前女性的卵巢及其他13种组织 | 单细胞组学 | 生育管理 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 511,365个细胞，来自14种组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |