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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
381 2026-05-29
Extracellular Origins of Cognition: Lessons from Primate Neocortical ECM
2025-07, Proteomics IF:3.4Q2
评论 评论一篇关于灵长类新皮层细胞外基质在发育过程中的分子组成和空间组织的研究 通过多模态方法整合单细胞转录组学、蛋白质组学和免疫组织荧光技术,构建了人类和非人灵长类发育中新皮层的细胞外基质图谱 作为评论文章,未提供具体实验数据或验证研究结果 强调细胞外基质在早期大脑发育中的作用及其在神经发育障碍疾病中的潜在参与 人类和非人灵长类的新皮层细胞外基质 神经科学 神经发育障碍 单细胞转录组学,蛋白质组学,免疫组织荧光 NA 基因表达数据,蛋白质数据,图像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
382 2026-05-29
MIC-Drop-seq: Scalable single-cell phenotyping of mutant vertebrate embryos
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
research paper 提出了MIC-Drop-seq方法,将高通量基因破坏与多重单细胞RNA测序结合,用于斑马鱼胚胎的大规模表型分析 通过Multiplexed Intermixed CRISPR Droplets技术同时破坏50个转录调控因子,结合多重scRNAseq实现单细胞水平的大规模遗传筛选,能捕获细胞外效应并发现新功能 NA 开发可扩展的单细胞表型分析方法,用于大规模绘制脊椎动物胚胎基因功能图谱 斑马鱼胚胎中的50个转录调控因子突变体 machine learning NA CRISPR, 单细胞RNA测序(scRNAseq), 液滴微流控 NA RNA测序数据 1000个斑马鱼胚胎 Illumina 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq 多重单细胞RNA测序与液滴微流控系统结合
383 2026-05-29
Artificial variables help to avoid over-clustering in single-cell RNA sequencing
2025-04-03, American journal of human genetics IF:8.1Q1
研究论文 提出一种名为“recall”的方法,通过人工变量避免单细胞RNA测序数据中的过度聚类问题 利用人工变量控制双重使用数据的影响(即“double dipping”),防止过度聚类,可适用于多种聚类算法 未明确说明 开发一种保护单细胞RNA测序分析免受过度聚类影响的方法 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 使用模拟和真实数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
384 2026-05-29
Vagal Sensory Gut-Brain Pathways That Control Eating-Satiety and Beyond
2025-04, Comprehensive Physiology IF:4.2Q1
综述 挑战迷走神经仅传递饱腹信号的传统观点,强调其在编码膳食信息中更复杂的作用 整合单细胞转录组学、神经回路图谱和功能性成像的最新进展,系统揭示迷走神经传入神经元在膳食信息编码中的多样性亚群、多模态感知和下游脑回路,拓展了其超越饱腹感的功能 限于综述性质,可能未涵盖最新未发表研究或具体实验验证 全面更新迷走神经感觉通路在肠道-大脑沟通中的作用,特别是其作为膳食信息整合器的功能 迷走神经传入神经元及其相关神经回路 机器学习 NA 单细胞转录组学、神经回路图谱、功能性成像 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
385 2026-05-29
Integrated Mendelian Randomization and Single-Cell Transcriptomics Analysis Identifies Critical Blood Biomarkers and Potential Mechanisms in Epilepsy
2025-Jan, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 通过整合孟德尔随机化和单细胞转录组学分析,识别癫痫的关键血液生物标志物和潜在机制 首次通过孟德尔随机化结合单细胞转录组学,系统揭示了癫痫风险相关基因及其对免疫微环境的影响,并建立了抗癫痫药物反应预测模型 未提及具体局限性,但可能包括样本量有限、动物模型与人类的差异、以及预测模型需进一步临床验证 阐明癫痫的遗传因果因素及其与免疫环境的动态关系 癫痫患者外周血样本、癫痫小鼠模型的海马组织 自然语言处理 癫痫 孟德尔随机化、单细胞转录组学、CIBERSORT免疫浸润分析、RNA-seq 预测模型(具体类型未提及) 基因表达数据、免疫细胞组成数据 未明确说明,但涉及eQTLGen和GWAS数据、癫痫患者外周血样本及小鼠模型 NA 单细胞转录组学 NA NA
386 2026-05-28
A clinically relevant pan-cancer prognostic signature derived from T-cell activation immune genes: Experimental validation across malignancies with emphasis on breast cancer
2025-12, Pharmacological research IF:9.1Q1
研究论文 基于T细胞活化免疫基因建立泛癌预后模型,并在多种恶性肿瘤中实验验证,重点关注乳腺癌 创新性建立了一个包含23个T细胞活化相关免疫反应基因的泛癌预后特征,并通过单细胞RNA测序发现PTGER4基因主要表达于T细胞,揭示了其在PD-1免疫治疗中的潜在增效作用 研究主要基于公开数据库的转录组数据,缺乏大规模前瞻性临床验证;PTGER4的作用机制仅在动物模型中验证,需进一步在临床样本中确认 开发一个基于T细胞活化相关免疫反应基因的泛癌预后模型,并探索其在免疫治疗中的潜在应用价值 多种恶性肿瘤(泛癌),特别关注乳腺癌 机器学习 泛癌 RNA-seq LASSO Cox回归模型 转录组数据 泛癌转录组数据来自UCSC Xena数据库,包含多种癌症样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
387 2026-05-28
Decipherment of disulfidptosis-related mutation profile, chemosensitivity, and prognosis in diffuse large B-cell lymphoma
2025-11, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
研究论文 探索弥漫性大B细胞淋巴瘤中二硫化物凋亡相关突变谱、化疗敏感性和预后 首次系统分析二硫化物凋亡相关基因在30种肿瘤中的表达模式及其在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的突变谱、预后和化疗敏感性,并构建新的风险评分 未提及明确的局限性 研究二硫化物凋亡相关基因在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的突变、预后及化疗敏感性,构建风险评分以指导预后和治疗 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者及30种肿瘤类型 机器学习 弥漫性大B细胞淋巴瘤 转录组测序, 体细胞突变测序, 单细胞RNA测序 风险评分模型 转录组数据, 体细胞突变数据, 单细胞RNA测序数据 训练和验证队列(具体数量未在摘要中说明) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
388 2026-05-28
Gastric dilation following vertical sleeve gastrectomy reflects adaptive stem cell-driven regeneration without association with weight regain or increased cancer risk
2025-Oct-15, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 本研究利用小鼠模型和患者样本,揭示垂直袖状胃切除术后的胃扩张是一种由干细胞驱动的适应性再生反应,与体重反弹或癌症风险增加无关 通过单细胞RNA测序首次揭示VSG术后胃扩张的细胞机制,证明其是适应性再生而非病理反应,并发现肿瘤抑制基因上调可能提供抗癌保护 未提及 探究垂直袖状胃切除术后胃扩张的机制及其与体重反弹和癌症风险的关联 饮食诱导的肥胖小鼠模型和接受VSG手术的患者胃体上皮样本 机器学习 肥胖症 单细胞RNA测序、RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型及患者胃体上皮样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台进行胃体上皮细胞测序
389 2026-05-28
Fine particulate matter exacerbates asthma by activating STC2-mediated mitophagy through METTL3/YTHDF2-dependent m6A methylation
2025-09-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1
研究论文 研究探讨了细颗粒物通过METTL3/YTHDF2依赖的m6A甲基化激活STC2介导的线粒体自噬加剧哮喘的分子机制 首次揭示PM通过m6A甲基化调控STC2表达并激活线粒体自噬加剧哮喘的机制,以及METTL3/YTHDF2在此过程中的关键作用 未提及具体局限性 探究细颗粒物加剧哮喘的分子机制,重点关注m6A甲基化、线粒体自噬及STC2和SQSTM1的调控作用 暴露于PM的哮喘小鼠模型以及不同季节的哮喘患者外周血样本 机器学习 哮喘 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型及多个季节的哮喘患者外周血样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
390 2026-05-28
Multiparametric Profiling of Circulating Immune Cells Identifies an Expansion of CD25high Switched Memory B Cells in Osteoarthritis
2025-Sep, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 通过多参数分析循环免疫细胞,发现骨关节炎中CD25高表达的记忆B细胞扩增 首次在单细胞水平上通过质谱流式细胞术和单细胞RNA测序,鉴定出CD25高表达的记忆B细胞作为骨关节炎的潜在细胞生物标志物 研究样本量较小,且仅局限于骨关节炎和退行性半月板撕裂患者,结论的普适性需进一步验证 探索骨关节炎患者循环免疫细胞的表型特征,寻找可早期诊断的细胞生物标志物 健康供体、骨关节炎患者和退行性半月板撕裂患者的外周血单核细胞 数字病理学 骨关节炎 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 NA 单细胞免疫表型数据, 单细胞转录组数据 21名健康供体,17名骨关节炎患者,10名退行性半月板撕裂患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
391 2026-05-28
Astaxanthin promotes in vitro maturation of mouse oocytes by regulating mitochondrial functions and protein homeostasis†
2025-08-13, Biology of reproduction IF:3.1Q2
研究论文 本研究揭示虾青素通过调节线粒体功能和蛋白质稳态促进小鼠卵母细胞体外成熟 首次发现虾青素对小鼠卵母细胞体外成熟的促进作用,并揭示其通过调节线粒体功能和蛋白质稳态的分子机制,结合单细胞转录组测序和微量蛋白质组学技术 未提及具体局限性 研究虾青素对小鼠卵母细胞体外成熟的作用及其分子机制 小鼠卵母细胞 机器学习 NA 单细胞转录组测序, 微量蛋白质组学, 激光透明带穿孔 NA 转录组数据, 蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
392 2026-05-28
Mapping the peripheral immune landscape of Parkinson's disease patients with single-cell sequencing
2025-Aug-01, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1
研究论文 通过单细胞测序技术绘制帕金森病患者外周免疫图谱,揭示免疫细胞亚型变化和转录组特征 首次全面绘制帕金森病患者外周血单个核细胞的单细胞转录组图谱,发现AP-1应激反应转录因子复合物在帕金森病中上调,且该信号在非典型帕金森病中缺失 样本量较小(10名健康对照和14名帕金森病患者),未进行功能验证,仅描述性分析 解析帕金森病患者外周免疫细胞的转录组变化,寻找潜在的生物标志物 帕金森病患者和健康对照的外周血单个核细胞 数字病理学 帕金森病 单细胞RNA测序、T细胞受体测序 NA 单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据 78,876个细胞,来自10名健康对照和14名帕金森病患者 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq NA NA
393 2026-05-28
Enhancer-driven gene regulatory networks reveal transcription factors governing T cell adaptation and differentiation in the tumor microenvironment
2025-Jul-08, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 通过对感染和癌症模型中T细胞受体匹配的CD8 T细胞进行配对单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序,揭示了增强子驱动的基因调控网络,阐明了在肿瘤微环境中调节T细胞适应和分化的转录因子 首次通过多组学分析构建增强子驱动的调控子,揭示了KLF2和BATF在终末分化的组织驻留记忆样肿瘤浸润淋巴细胞形成中的拮抗作用 主要基于小鼠模型,未在人类肿瘤样本中验证;TGF-β信号和CD103表达对Trm样TIL形成的必要性结论可能受限于体外实验条件 阐明肿瘤微环境中组织驻留记忆样CD8 T细胞分化的表观遗传和转录调控机制 感染和癌症模型中的CD8 T细胞(特别是肿瘤浸润淋巴细胞) 机器学习, 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 多组学分析 调控子模型 基因表达数据, 染色质可及性数据 感染和癌症模型中T细胞受体匹配的CD8 T细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序平台
394 2026-05-28
Impaired primitive erythropoiesis and defective vascular development in Trim71-KO embryos
2025-04, Life science alliance IF:3.3Q1
研究论文 本研究揭示了Trim71基因敲除小鼠在器官发生初期出现中胚层衍生细胞严重缺陷,导致原始红细胞生成受损、卵黄囊血管发育异常及胚胎致死 首次发现Trim71通过NHL结构域直接抑制中胚层先锋转录因子Eomes的mRNA表达,阐明其在原肠胚阶段调控基因表达以支持器官发生的机制 未深入探究Trim71在特定细胞类型(如内皮祖细胞)中的非细胞自主性作用,且未能完全排除其他潜在靶基因的影响 阐明Trim71在胚胎发育从原肠胚到器官发生过渡期中的功能及其分子机制 Trim71基因敲除小鼠胚胎及其衍生细胞(中胚层细胞、原始红细胞、卵黄囊血管内皮细胞) 分子生物学与发育生物学 发育缺陷相关疾病 单细胞RNA测序、基因敲除小鼠模型、RNA免疫沉淀 基因敲除小鼠模型(全身性及条件性敲除) 单细胞转录组数据、胚胎表型数据 E7.5期Trim71全身敲除小鼠胚胎(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
395 2026-05-28
Single-cell transcriptomics reveals inter-ethnic variation in immune response to Falciparum malaria
2025-03-06, American journal of human genetics IF:8.1Q1
研究论文 通过单细胞转录组学揭示富拉尼族与莫西族儿童对恶性疟原虫免疫应答的种族差异 首次从单细胞层面系统解析非洲不同种族对疟疾免疫保护的细胞和分子基础,并鉴定出种族特异性的单细胞表达数量性状位点 研究中未提及针对机制验证的进一步实验,单细胞数据规模可能未完全覆盖免疫系统的全部异质性 探究不同种族人群对恶性疟原虫免疫应答差异的分子和细胞机制 布基纳法索农村126名感染和未感染恶性疟原虫的富拉尼族和莫西族儿童的外周血单核细胞 机器学习 疟疾 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 126名儿童(感染和未感染的富拉尼族与莫西族)及超过7万个单细胞,涵盖30种亚型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台对PBMC进行转录组分析
396 2026-05-28
Genome-wide prediction of dominant and recessive neurodevelopmental disorder-associated genes
2025-03-06, American journal of human genetics IF:8.1Q1
研究论文 该研究开发了一种基于机器学习的计算方法(mantis-ml),利用单细胞RNA测序数据与三百种正交特征,预测与神经发育障碍相关的显性和隐性风险基因 首次基于单细胞RNA测序数据训练模型,并整合300种正交特征,区分单等位和双等位遗传模式预测神经发育障碍风险基因 仅基于计算预测,尚未进行实验验证;模型准确性受限于训练数据的质量和规模 加速神经发育障碍风险基因的识别,并强调考虑遗传模式的重要性 神经发育障碍,包括自闭症谱系障碍、发育性和癫痫性脑病、发育迟缓 机器学习 神经发育障碍 单细胞RNA测序、机器学习 半监督机器学习模型(mantis-ml) 单细胞RNA测序数据、基因不耐受指标、蛋白质相互作用数据等 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
397 2026-05-28
Mural cell dysfunction contributes to diastolic heart failure by promoting endothelial dysfunction and vessel remodelling
2025-02-07, Cardiovascular diabetology IF:8.5Q1
研究论文 发现壁细胞功能障碍通过促进内皮功能障碍和血管重塑导致舒张性心力衰竭 首次探究壁细胞在射血分数保留的心力衰竭(HFpEF)中微血管功能障碍的作用,并揭示壁细胞通过TNFα依赖旁分泌信号诱导内皮细胞生长停滞和炎症的新机制 未提供明确局限性,但可能包括动物模型的代表性和临床转化潜力未知 确定壁细胞功能障碍在HFpEF发展中的作用及其分子机制 糖尿病db/db小鼠模型,给予1%盐后诱导舒张功能不全的小鼠心脏组织及壁细胞 心血管疾病研究 舒张性心力衰竭(HFpEF) 单细胞RNA测序、NicheNet分析、组织学分析 NA 基因表达数据、组织图像 小鼠模型实验,具体样本量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
398 2026-05-28
KLF2-dependent transcriptional regulation safeguards the heart against pathological hypertrophy
2025-02, Journal of molecular and cellular cardiology IF:4.9Q2
研究论文 本研究揭示了转录因子KLF2作为心脏肥大的负调控因子,通过直接调节相关基因保护心脏免受病理性肥大的影响 首次证明KLF2在心肌细胞中作为心脏肥大的负调控因子,并发现辛伐他汀通过提升KLF2表达缓解心肌细胞肥大 NA(摘要未明确说明局限性) 探究转录因子KLF2在心肌细胞生物学中的作用及其对心脏肥大的保护机制 成年小鼠心脏、新生大鼠心室肌细胞、人胚胎干细胞来源的心肌细胞 机器学习 心血管疾病 RNA-seq, CUT&Tag测序 NA RNA序列数据 雄性C57BL/6J小鼠(横向主动脉缩窄模型及对照组)与体外细胞模型(新生大鼠心室肌细胞、人胚胎干细胞来源的心肌细胞) Illumina bulk RNA-seq Illumina NovaSeq NovaSeq 6000平台进行RNA-seq测序
399 2026-05-28
A panoramic view of cell population dynamics in mammalian aging
2025-Jan-17, Science (New York, N.Y.)
研究论文 通过构建单细胞转录组图谱PanSci,分析了哺乳动物衰老过程中细胞种群动态变化 首次构建包含超过2000万个细胞、覆盖多个生命阶段、性别和基因型的综合单细胞转录组图谱,揭示3000多种细胞状态和200多种与衰老相关的细胞群,并识别免疫系统对衰老的调控作用 未明确说明局限性 阐明哺乳动物衰老过程中与细胞种群动态相关的机制 小鼠623个组织的细胞 机器学习 衰老相关疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 超过2000万个细胞,来自623个小鼠组织,涵盖不同生命阶段、性别和基因型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
400 2026-05-27
Single Cell and Spatial Transcriptomics Identify Novel Immune-Stromal Interactions in Cardiac Allograft Vasculopathy
2025-Nov-21, Research square
研究论文 通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,鉴定心脏同种异体移植物血管病中新的免疫-基质细胞相互作用 首次利用单细胞RNA测序和空间转录组学联合分析,揭示了心脏同种异体移植物血管病中独特的细胞和转录特征,并发现干扰素信号通路作为潜在治疗靶点 研究基于人类冠状动脉样本和小鼠模型,可能无法完全反映人类疾病长期进展的复杂性 阐明心脏同种异体移植物血管病的细胞和分子致病机制,寻找新的治疗靶点 人类冠状动脉样本(包括CAV、动脉粥样硬化及非疾病对照)和小鼠CAV模型 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据、空间转录数据 人类冠状动脉样本(包括CAV、动脉粥样硬化及非疾病对照组)和小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 10x Chromium单细胞RNA测序和10x Visium空间转录组学
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