单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2024-12-20	Identification of cell-type specificity, trans- and cis-acting functions of plant lincRNAs from single-cell transcriptomes 2025-Jan, The New phytologist DOI:10.1111/nph.20269 PMID:39550625	研究论文	本文通过单细胞转录组数据识别了植物lincRNAs的细胞类型特异性及其顺反作用功能	首次利用单细胞RNA测序技术在单细胞分辨率下研究植物lincRNAs的细胞类型特异性及其在细胞分化中的作用，并构建了一个在线平台PscLncRNA用于搜索和可视化这些lincRNAs	NA	研究植物lincRNAs在单细胞水平上的细胞类型特异性及其顺反作用功能	植物lincRNAs及其在细胞分化中的作用	基因组学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	来自水稻、拟南芥、番茄和玉米等多种植物组织的单细胞转录组数据
22	2024-12-19	Abatacept Induces Long-Term Reconstitution of the B-Cell Niche in a Patient With CTLA-4 Haploinsufficiency: A Case Report 2025-Mar, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation DOI:10.1212/NXI.0000000000200351 PMID:39689284	病例报告	本文报告了一例CTLA-4单倍体不足患者在接受abatacept治疗后，B细胞微环境长期重建的病例	首次展示了abatacept在CTLA-4单倍体不足患者中对骨髓功能的长期影响，并通过单细胞RNA测序验证了B细胞的重建	由于是单一病例报告，缺乏对照组，证据级别较低	探讨abatacept在CTLA-4单倍体不足患者中的长期疗效及其对骨髓功能的影响	一名39岁CTLA-4单倍体不足女性患者，伴有中枢神经系统受累、多器官自身免疫和淋巴细胞减少	NA	自身免疫性疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	单一病例
23	2024-12-19	Dedifferentiation of vascular smooth muscle cells upon vessel injury 2025-Jan-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113691 PMID:39591824	综述	本文综述了血管平滑肌细胞在血管损伤后的去分化过程及其机制	利用单细胞RNA测序技术揭示了血管平滑肌细胞在健康和病理状态下的复杂多样性	NA	探讨血管损伤后血管平滑肌细胞去分化的动态过程及其机制	血管平滑肌细胞在血管损伤后的去分化过程	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
24	2024-12-19	RGS10 Deficiency Alleviated Intestinal Mucosal Inflammation Through Suppression of Th1/Th17 Cell Immune Responses in Ulcerative Colitis 2025-Jan, Immunology IF:4.9Q2 DOI:10.1111/imm.13869 PMID:39428350	研究论文	本研究探讨了RGS10在溃疡性结肠炎中的作用及其通过抑制Th1/Th17细胞免疫反应减轻肠道黏膜炎症的机制	首次揭示了RGS10在溃疡性结肠炎中的作用，并发现RGS10通过与PTPN2相互作用抑制Th1和Th17细胞的分化，从而减轻炎症	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证RGS10靶向治疗的疗效	探讨RGS10在溃疡性结肠炎中的作用及其机制	RGS10在溃疡性结肠炎中的表达及其对Th1/Th17细胞免疫反应的影响	NA	溃疡性结肠炎	qRT-PCR, 免疫组化, 免疫荧光分析, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 酶联免疫吸附测定, 共免疫沉淀分析	NA	RNA, 蛋白质	RGS10敲除小鼠, 溃疡性结肠炎患者及健康对照者的肠道黏膜样本
25	2024-12-18	A bipolar disorder-associated missense variant alters adenylyl cyclase 2 activity and promotes mania-like behavior 2025-Jan, Molecular psychiatry IF:9.6Q1 DOI:10.1038/s41380-024-02663-w PMID:39003412	研究论文	本文研究了与双相情感障碍相关的单核苷酸多态性rs13166360对腺苷酸环化酶2（ADCY2）活性和小鼠狂躁样行为的影响	首次展示了ADCY2错义突变通过改变亚细胞定位降低酶生成第二信使cAMP的能力，并建立了携带该突变的小鼠模型，揭示了其与狂躁样行为和认知障碍的关系	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨ADCY2基因突变与双相情感障碍的关联及其潜在机制	ADCY2基因突变对小鼠行为和神经生物学过程的影响	NA	双相情感障碍	CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	携带ADCY2基因突变的小鼠
26	2024-12-18	Blockade of purine metabolism reverses macrophage immunosuppression and enhances anti-tumor immunity in non-small cell lung cancer 2025-Jan, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1 DOI:10.1016/j.drup.2024.101175 PMID:39608215	研究论文	本研究探讨了非小细胞肺癌中巨噬细胞通过嘌呤代谢介导的免疫抑制作用及其对免疫治疗效果的影响	首次揭示了嘌呤代谢在巨噬细胞免疫抑制中的关键作用，并提出阻断嘌呤代谢与免疫检查点阻断联合治疗可能产生协同效应	研究主要基于小鼠模型，需进一步验证在人体中的效果	评估巨噬细胞通过与癌细胞的代谢交流调节非小细胞肺癌进展及其对免疫治疗效果的影响	非小细胞肺癌中的巨噬细胞及其代谢调控机制	数字病理学	肺癌	单细胞测序、流式细胞术、免疫荧光、ELISA、RNA测序	NA	单细胞数据、组织样本	C57BL/6 J小鼠模型
27	2024-12-17	Diagnosis of acute lymphoblastic leukaemia: an overview of the current genomic classification, diagnostic approaches, and future directions 2025-Jan, Histopathology IF:3.9Q1 DOI:10.1111/his.15338 PMID:39403021	综述	本文综述了B-急性淋巴细胞白血病的当前基因组分类、诊断方法及未来发展方向	介绍了下一代测序、全基因组转录组测序、光学基因组图谱、甲基化分析和单细胞测序等新技术在B-ALL诊断中的应用	NA	探讨B-ALL的最新诊断标准和技术，以及新技术和生物标志物在提高诊断准确性中的重要性	B-急性淋巴细胞白血病	数字病理学	血液疾病	下一代测序、全基因组转录组测序、光学基因组图谱、甲基化分析、单细胞测序	NA	基因组数据	NA
28	2024-12-15	Prospects of neutrophilic implications against pathobiology of chronic obstructive pulmonary disease: Pharmacological insights and technological advances 2025-Jan-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113634 PMID:39577220	综述	本文探讨了中性粒细胞在慢性阻塞性肺疾病（COPD）病理生物学中的关键作用，并强调了针对中性粒细胞的新型治疗策略的紧迫性	本文探讨了利用单细胞RNA测序技术进一步研究中性粒细胞及相关风险基因作为COPD治疗潜在生物标志物的可能性	NA	阐明中性粒细胞在COPD中的机制，为未来调节中性粒细胞功能的策略铺平道路	中性粒细胞在COPD中的作用及其作为治疗靶点的潜力	NA	慢性阻塞性肺疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
29	2024-12-15	Modulating Treg cell activity in prostate cancer via chitosan nanoparticles loaded with si-BATF/PRDM1 2025-Jan-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113445 PMID:39577215	研究论文	本研究探讨了通过装载si-BATF/PRDM1的壳聚糖纳米颗粒调节调节性T细胞活性以抑制前列腺癌发展的潜力	首次展示了壳聚糖纳米颗粒在体内外实验中有效递送siRNA，抑制BATF和PRDM1表达，从而抑制肿瘤生长和转移	研究主要集中在体外和体内实验，尚未进行临床试验验证其疗效	探索通过调节Treg细胞活性来抑制前列腺癌发展的方法	前列腺癌中的Treg细胞活性	数字病理学	前列腺癌	单细胞测序、基因沉默	NA	基因表达数据	具体样本数量未在摘要中提及
30	2024-12-15	ITGB4/GNB5 axis promotes M2 macrophage reprogramming in NSCLC metastasis 2025-Jan-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113564 PMID:39577216	研究论文	研究探讨了ITGB4/GNB5轴在调节M2巨噬细胞重编程及影响非小细胞肺癌（NSCLC）转移中的作用和潜在机制	首次揭示了ITGB4/GNB5轴通过促进M2巨噬细胞极化，增强其在肿瘤微环境中的功能，从而促进NSCLC的侵袭和转移	研究主要集中在体外细胞实验和体内小鼠模型，尚未在临床样本中验证其机制	探讨ITGB4/GNB5轴在NSCLC转移中的作用及其分子机制	非小细胞肺癌（NSCLC）中的M2巨噬细胞及其相关分子ITGB4和GNB5	数字病理学	肺癌	单细胞测序技术、流式细胞术、免疫组化、RNA测序、蛋白质组分析	NA	单细胞数据、RNA数据、蛋白质数据	包括体外细胞实验和体内小鼠模型
31	2024-12-15	Downregulation of CD36 alleviates IgA nephropathy by promoting autophagy and inhibiting extracellular matrix accumulation in mesangial cells 2025-Jan-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113672 PMID:39616852	研究论文	本研究探讨了CD36在IgA肾病中的作用，发现CD36下调通过促进自噬和抑制细胞外基质积累减轻了肾小球系膜细胞的损伤	首次揭示了CD36在IgA肾病中的关键作用，并证明了CD36下调通过抑制细胞外基质积累和恢复自噬来减轻肾小球系膜细胞的损伤	研究主要基于细胞实验和小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探讨CD36在IgA肾病中的作用及其潜在的治疗价值	IgA肾病患者肾组织和肾小球系膜细胞	NA	肾病	单细胞测序 RNA-seq	NA	基因表达数据	包括IgA肾病患者和正常对照的肾组织数据，以及小鼠肾小球系膜细胞
32	2024-12-15	Identification of an immune-related gene panel for the diagnosis of pulmonary arterial hypertension using bioinformatics and machine learning 2025-Jan-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113694 PMID:39616855	研究论文	本研究旨在通过生物信息学和机器学习筛选与肺动脉高压（PAH）诊断相关的免疫相关基因（IRG）面板，并开发一种新的诊断方法	本研究首次通过机器学习算法筛选出与PAH诊断相关的免疫相关基因面板，并验证了其在肺组织和外周血单核细胞中的诊断效用	本研究主要基于小鼠模型和公共数据库中的基因表达数据，未来需要在更大规模的人类样本中进行验证	筛选与肺动脉高压诊断相关的免疫相关基因面板，并开发新的诊断方法	肺动脉高压（PAH）的诊断	生物信息学	肺动脉高压	机器学习	LASSO, 随机森林, 提升回归树, XGBoost, 支持向量机递归特征消除	基因表达数据	36个上调和17个下调的免疫相关基因差异表达基因（IRG-DEGs），以及来自PAH小鼠模型的肺组织样本和外周血单核细胞样本
33	2024-12-15	SARS-CoV-2 N protein induces alveolar epithelial apoptosis via NLRP3 pathway in ARDS 2025-Jan-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113503 PMID:39591821	研究论文	本研究探讨了SARS-CoV-2核衣壳蛋白N通过NLRP3途径诱导肺泡上皮细胞凋亡，从而加重急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的分子机制	首次揭示了SARS-CoV-2 N蛋白通过激活NLRP3信号通路，促进M1巨噬细胞极化和释放促炎因子，导致肺泡上皮细胞凋亡	研究主要集中在体外和动物模型中，尚未在人体中进行验证	探讨SARS-CoV-2 N蛋白如何通过NLRP3途径诱导肺泡上皮细胞凋亡，从而加重ARDS	SARS-CoV-2 N蛋白、肺泡巨噬细胞、肺泡上皮细胞、ARDS患者和ARDS小鼠模型	数字病理学	急性呼吸窘迫综合征	单细胞RNA测序、免疫沉淀、拉下实验、酶联免疫吸附测定（ELISA）、逆转录定量PCR（RT-qPCR）、蛋白质印迹、流式细胞术	NA	RNA	ARDS患者的单细胞RNA测序数据、MH-S巨噬细胞和MLE-12上皮细胞的体外实验、CLP手术或N蛋白给药诱导的ARDS小鼠模型
34	2024-12-15	FAP+ gastric cancer mesenchymal stromal cells via paracrining INHBA and remodeling ECM promote tumor progression 2025-Jan-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113697 PMID:39615112	研究论文	研究探讨了FAP阳性胃癌间质细胞通过旁分泌INHBA和重塑ECM促进肿瘤进展的机制	首次揭示了FAP阳性胃癌间质细胞通过旁分泌INHBA和重塑ECM促进胃癌进展的机制	研究主要基于体外实验和临床病理数据，缺乏体内实验验证	探讨FAP阳性胃癌间质细胞在胃癌进展中的作用及其分子机制	FAP阳性胃癌间质细胞及其对胃癌细胞的影响	数字病理学	胃癌	流式细胞术、单细胞RNA测序、ELISA、免疫组化、Masson三色染色	NA	基因表达数据、蛋白质数据	临床病理数据和胃癌患者的单细胞RNA测序数据库
35	2024-12-15	Immunogenic clearance combined with PD-1 blockade elicits antitumor effect by promoting the recruitment and expansion of the effector memory-like CD8+T cell 2025-Jan, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.102209 PMID:39608213	研究论文	本研究探讨了免疫原性清除与PD-1阻断联合治疗在促进效应记忆样CD8+T细胞招募和扩增中的抗肿瘤作用	本研究通过单细胞RNA测序揭示了免疫原性清除联合PD-1阻断治疗在肿瘤微环境中增加效应记忆样CD8+T细胞的机制	研究中对免疫原性清除增强ICB反应的具体机制仍不完全清楚	阐明免疫原性清除增强免疫检查点阻断反应的细胞机制	效应记忆样CD8+T细胞在肿瘤微环境中的作用	免疫学	癌症	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
36	2024-12-14	scSFCL:Deep clustering of scRNA-seq data with subspace feature confidence learning 2025-Feb, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.compbiolchem.2024.108292 PMID:39591807	研究论文	提出了一种基于子空间特征置信度学习的深度聚类方法scSFCL，用于单细胞RNA测序数据的聚类分析	通过子空间特征置信度学习结合图卷积网络和加权方法，筛选出判别性特征子集，并利用相互监督的聚类方法融合通用结构信息和特异性信息	未提及具体限制	提高单细胞RNA测序数据的深度聚类性能	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	图卷积网络	基因表达数据	多个单细胞RNA测序数据集
37	2024-12-14	Combined single-cell RNA sequencing and mendelian randomization to identify biomarkers associated with necrotic apoptosis in intervertebral disc degeneration 2025-Jan, The spine journal : official journal of the North American Spine Society DOI:10.1016/j.spinee.2024.09.011 PMID:39332686	研究论文	本研究结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，识别与椎间盘退变中坏死性凋亡相关的生物标志物	首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，揭示了NT5E和TMEM158作为坏死性凋亡相关生物标志物与椎间盘退变的因果关系	研究为回顾性队列研究，样本量和数据集的多样性可能限制了结果的普适性	识别与椎间盘退变中坏死性凋亡相关的生物标志物，揭示其病理机制，并为诊断和治疗提供新方向	椎间盘退变中的坏死性凋亡相关生物标志物	数字病理学	脊柱疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、孟德尔随机化分析（MR）	NA	单细胞RNA测序数据	GSE205535数据集中包含16种不同的细胞群体，进一步注释为8种细胞类型
38	2024-12-14	Fam3a-mediated prohormone convertase switch in α-cells regulates pancreatic GLP-1 production in an Nr4a2-Foxa2-dependent manner 2025-Jan, Metabolism: clinical and experimental DOI:10.1016/j.metabol.2024.156042 PMID:39362520	研究论文	研究探讨了Fam3a在α细胞中的作用及其通过Nr4a2-Foxa2依赖性机制调节胰高血糖素样肽-1（GLP-1）生成的机制	揭示了Fam3a在α细胞中通过Nr4a2-Foxa2依赖性途径调节胰高血糖素样肽-1（GLP-1）生成的新机制，并提出了一种重新编程α细胞胰高血糖素加工输出为GLP-1的新策略	NA	探讨Fam3a在α细胞功能中的作用及其调节机制	Fam3a敲除小鼠、人胰岛单细胞RNA测序数据、αTC1.9细胞、Fam3aα-/-小鼠及其胰岛	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组分析、核转位实验、双荧光素酶报告基因实验	NA	RNA	Fam3a敲除小鼠、Fam3aα-/-小鼠、αTC1.9细胞、人胰岛单细胞RNA测序数据
39	2024-12-14	LRRC45 accelerates bladder cancer development and ferroptosis inhibition via stabilizing NRF2 by competitively KEAP1 interaction 2025-Jan, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2024.11.001 PMID:39522565	研究论文	研究揭示了LRRC45通过与KEAP1竞争性结合稳定NRF2，从而促进膀胱癌发展和抑制铁死亡的机制	首次揭示了LRRC45通过竞争性结合KEAP1来稳定NRF2，从而促进膀胱癌发展和抑制铁死亡	研究主要基于细胞实验，缺乏临床试验数据支持	探讨LRRC45在膀胱癌发展中的作用及其分子机制	膀胱癌细胞中的LRRC45及其与KEAP1和NRF2的相互作用	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	膀胱癌患者的单细胞RNA测序数据
40	2024-12-14	Apolipoprotein A1-encoding recombinant adenovirus remodels cholesterol metabolism in tumors and the tumor microenvironment to inhibit hepatocellular carcinoma 2025-Jan, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine IF:6.4Q1 DOI:10.1016/j.trsl.2024.10.003 PMID:39528003	研究论文	本研究构建了一种编码Apolipoprotein A1的重组溶瘤腺病毒Ad5-ApoA1，通过调控肿瘤和肿瘤微环境中的胆固醇代谢，抑制肝细胞癌	本研究首次将Apolipoprotein A1与溶瘤腺病毒结合，通过促进胆固醇外排和减少炎症因子，显著抑制肝细胞癌的生长并延长生存期	溶瘤腺病毒Ad5-ApoA1在裸鼠中未显示出治疗效果，仅在健康免疫和人类化免疫重建的NCG小鼠中有效	研究溶瘤腺病毒Ad5-ApoA1对肝细胞癌的治疗效果及其机制	肝细胞癌及其肿瘤微环境	数字病理学	肝细胞癌	流式细胞术、转录组测序、单细胞测序	NA	基因表达数据	体外实验和多种小鼠模型