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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-02-11
NOTCH gene pattern predicts prognosis, immune infiltration, and drug response in Head and Neck squamous cell carcinoma
2025-12, Journal of stomatology, oral and maxillofacial surgery
研究论文 本研究构建了一个基于NOTCH相关基因的预后风险模型(NOTCH评分),用于预测头颈部鳞状细胞癌患者的生存、免疫浸润和治疗反应 首次整合NOTCH信号通路相关基因构建预后模型,并系统评估其与肿瘤微环境、免疫治疗反应及药物敏感性的关联 研究基于回顾性数据,需要前瞻性临床验证;模型在单细胞和蛋白水平的验证样本量有限 开发头颈部鳞状细胞癌的预后预测工具并探索其与肿瘤微环境及治疗反应的关联 头颈部鳞状细胞癌患者 生物信息学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序、免疫组织化学 LASSO回归模型 基因表达数据、临床数据 未明确具体样本数量,但包含训练和验证队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
22 2026-02-11
Serum Procalcitonin: A Novel Tumor Biomarker for Diagnosis and Follow-Up in Fibrolamellar Hepatocellular Carcinoma
2025-Nov-20, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究探讨了血清降钙素原(PCT)作为纤维板层肝细胞癌(FLC)新型肿瘤生物标志物的诊断和随访价值 首次发现并验证了PCT在FLC中特异性高表达,可作为区分FLC与其他原发性肝癌的敏感且特异的血清和肿瘤标志物 样本量相对较小(18例FLC患者),且研究为观察性,需要更大规模的前瞻性研究验证 评估PCT作为FLC生物标志物的诊断和监测治疗反应的潜力 纤维板层肝细胞癌(FLC)患者、肝细胞癌(HCC)患者、胆管癌(CCA)患者、肝硬化患者及各类肝脏肿瘤组织样本 数字病理学 肝癌 RNA测序、空间转录组学、免疫组织化学 NA 血清样本、肿瘤组织样本 34份血清样本(来自18例FLC患者)、64例HCC、24例CCA、20例肝硬化患者;RNA测序分析27例FLC、331例HCC、39例CCA、71例肝母细胞瘤、34例肝细胞腺瘤、55例非肿瘤肝组织;空间转录组学分析3例FLC;免疫组化分析13例FLC和34例其他原发性或继发性肝癌 NA RNA测序, 空间转录组学 NA NA
23 2026-02-11
The NEAT1/miR-124-3p/CCL2 axis in chronic kidney disease progression: integrated bioinformatics analysis and experimental validation
2025-Oct, Epigenomics IF:3.0Q2
研究论文 本研究通过整合生物信息学分析和实验验证,揭示了NEAT1/miR-124-3p/CCL2轴在慢性肾病进展中的关键调控作用 首次构建并验证了NEAT1/miR-124-3p/CCL2这一ceRNA调控轴在慢性肾病进展中的作用机制 生物信息学和临床队列的样本量有限 识别慢性肾病的新型诊断生物标志物和治疗靶点 慢性肾病患者、健康对照者、TCMK1细胞系 生物信息学 慢性肾病 单细胞测序、双荧光素酶报告基因检测、生物信息学分析 NA 基因表达数据、临床样本数据 64名慢性肾病患者和20名健康对照者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
24 2026-02-11
Lipoxin B4 Mitigates TRPV4-Activated Müller Cell Gliosis During Ocular Hypertension
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了脂氧素B4(LXB4)在眼压升高期间如何调节TRPV4通道激活的Müller胶质细胞反应性,并揭示了Müller胶质细胞自身是视网膜中LXB4的重要来源 首次证实Müller胶质细胞是视网膜中抗炎和神经保护性脂质介质LXB4的内源性来源,并揭示了TRPV4机械应力激活同时触发胶质增生和保护性脂质信号传导的双重作用 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚未在人类临床样本中得到验证 探究LXB4是否调节TRPV4驱动的Müller胶质细胞激活和炎症,以及Müller胶质细胞自身是否参与视网膜脂氧素通路 小鼠Müller胶质细胞(原代和永生化细胞系)、小鼠视网膜组织 神经科学 青光眼 RNA bulk-sequencing, qPCR, LC-MS/MS脂质组学, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 免疫染色, 免疫印迹 NA 转录组数据, 脂质组数据, 蛋白质表达数据, 图像数据 小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
25 2026-02-11
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用TempO-LINC平台生成单细胞转录组数据,解码HepaRG细胞在多种化学物质暴露下的应激状态,以应用于毒理学分析 采用单细胞转录组学技术系统分析多种化学物质诱导的细胞应激反应通路,并通过聚类揭示细胞状态动态变化 研究仅针对HepaRG细胞系和24小时暴露时间,可能无法完全反映体内复杂环境或长期效应 解码细胞应激状态以应用于毒理学研究,揭示化学物质暴露下的细胞适应性反应和死亡过渡 HepaRG细胞系暴露于七种化学物质(如依托泊苷、布雷菲德菌素A等) 单细胞转录组学 毒理学相关细胞应激 单细胞转录组测序 基于文献基因签名的评分和广义Jaccard度量的聚类分析 单细胞转录组数据 约40,000个HepaRG细胞 TempO-LINC 单细胞RNA-seq TempO-LINC平台 用于生成单细胞转录组图谱的平台
26 2026-02-11
spRefine Denoises and Imputes Spatial Transcriptomics with a Reference-Free Framework Powered by Genomic Language Model
2025-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为spRefine的深度学习框架,利用基因组语言模型对空间转录组数据进行联合去噪和插补 开发了首个基于基因组语言模型的无参考框架,能够同时处理空间转录组数据的噪声和缺失值问题,并提高了空间衰老时钟估计的准确性 未明确说明框架的计算复杂度或对特定数据类型的适用性限制 解决空间转录组数据分析中的高噪声和基因测量缺失问题 空间转录组数据 空间转录组学 衰老相关疾病 空间转录组学 深度学习框架、基因组语言模型 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
27 2026-02-11
Targeting IGF1-Induced Cellular Senescence to Rejuvenate Hair Follicle Aging
2025-Jul, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究探讨了IGF-1信号通路通过诱导毛囊干细胞衰老来调控毛囊老化的机制,并提出了针对性的干预策略 首次在转基因小鼠模型中揭示了表皮过度表达IGF-1会直接导致毛囊干细胞衰老和毛囊早衰,并验证了通过调控下游通路或清除衰老细胞来逆转这一过程的可行性 研究主要基于小鼠模型,人类皮肤中的机制验证尚需进一步临床研究 探究IGF-1信号通路在器官老化特别是毛囊衰老中的作用机制 小鼠皮肤组织、人类皮肤样本、转基因小鼠模型 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
28 2026-02-11
Pyrroloquinoline Quinone Reprograms the Single-Cell Landscape of Immune Aging in Hematopoietic Immune System
2025-Jul, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了衰老对小鼠造血免疫系统的影响,并证明了抗氧化剂吡咯喹啉醌(PQQ)能够通过减轻氧化应激、逆转免疫衰老表型、恢复免疫稳态来改善免疫衰老 首次在单细胞分辨率下系统描绘了PQQ对衰老造血免疫系统的重编程作用,并鉴定了ASPP1、Yy1和CD62L等关键分子靶点,同时结合机器学习程序验证了PQQ的衰老细胞清除(senolytic)和衰老表型调节(senomorphic)效应 研究基于小鼠模型,其在人体中的效果和机制仍需进一步验证;单细胞测序仅聚焦于脾脏和骨髓细胞,未涵盖其他免疫器官或组织 探究衰老对造血免疫系统的影响,并评估抗氧化剂PQQ在改善免疫衰老、恢复免疫稳态方面的潜力 小鼠的脾脏和骨髓细胞 单细胞组学 免疫衰老 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 机器学习程序 单细胞转录组数据 小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
29 2026-02-11
Deciphering Immunosenescence From Child to Frailty: Transcriptional Changes, Inflammation Dynamics, and Adaptive Immune Alterations
2025-Jul, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究通过整合分析从儿童到衰弱老年人的PBMCs的bulk-cell和single-cell RNA-seq数据,揭示了免疫衰老的转录组变化、炎症动态和适应性免疫改变 首次结合bulk-cell和single-cell RNA-seq数据,全面描绘了从儿童到衰弱老年人PBMCs的免疫衰老动态变化,并识别了衰弱老年人特有的免疫细胞表型异常 研究仅基于PBMCs样本,可能无法完全反映组织特异性免疫变化;样本年龄跨度虽广,但未详细说明各年龄组样本量 探究年龄相关的免疫系统变化,特别是免疫衰老在健康衰老和衰弱状态中的机制 外周血单个核细胞(PBMCs) 生物信息学 老年疾病 RNA-seq NA 转录组数据 从儿童到衰弱老年人的PBMCs样本(具体数量未说明) NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
30 2026-02-11
Inactivation of Histone Chaperone HIRA Unmasks a Link Between Normal Embryonic Development of Melanoblasts and Maintenance of Adult Melanocyte Stem Cells
2025-Jul, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本文探讨组蛋白伴侣HIRA在小鼠色素系统中对胚胎期黑色素细胞发育和成年期黑色素干细胞维持的作用 首次揭示HIRA在胚胎期黑色素细胞发育中的功能缺陷会持续影响成年期黑色素干细胞的维持,建立了胚胎发育与成年组织干细胞衰老之间的直接遗传联系 研究主要基于小鼠模型,人类色素系统的相关性尚需进一步验证;单细胞RNA测序样本量可能有限 探究组蛋白伴侣HIRA在胚胎发育和成年组织干细胞维持中的双重作用机制 小鼠黑色素细胞谱系(包括黑色素母细胞和黑色素干细胞) 发育生物学 色素相关疾病 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 基因敲除 基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 小鼠胚胎和成年组织样本 NA 单细胞RNA-seq, ATAC-seq NA NA
31 2026-02-11
Tumoroid model recreates clinically relevant phenotypes of high grade serous ovarian cancer (HGSC) cells, carcinoma associated fibroblasts, and macrophages
2025-Jun-19, Research square
研究论文 本研究开发了一种包含高级别浆液性卵巢癌(HGSC)细胞、癌相关成纤维细胞和巨噬细胞的异质性三组分肿瘤球模型,用于模拟肿瘤微环境并研究其表型 创建了首个包含HGSC细胞、原代间充质干细胞和M2样巨噬细胞的异质性三组分肿瘤球模型,能够复现临床相关的化疗耐药、癌症干细胞富集、迁移、侵袭和上皮-间质转化等关键表型 模型中使用的是细胞系(如OVCAR3、OVCAR4、OVCAR8)和U937来源的巨噬细胞,而非原代肿瘤细胞,可能无法完全反映患者肿瘤的异质性 研究高级别浆液性卵巢癌(HGSC)肿瘤微环境中不同细胞组分间的复杂信号交互及其对化疗耐药、癌症干细胞特性、迁移和侵袭的影响 高级别浆液性卵巢癌(HGSC)细胞(OVCAR3、OVCAR4、OVCAR8)、原代间充质干细胞(MSCs)、U937来源的M2样巨噬细胞(M2-AAM) 肿瘤生物学 卵巢癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、条件培养基实验、侵袭实验 3D肿瘤球模型(肿瘤球) 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据、迁移和侵袭实验数据 使用了多种细胞系(OVCAR3、OVCAR4、OVCAR8)和原代细胞(MSCs、U937巨噬细胞)进行模型构建,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
32 2026-02-11
Spatial analysis of IPMNs defines a paradoxical KRT17-positive, low-grade epithelial population harboring malignant features
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术,分析了胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)的转录变化,发现了一个表达恶性特征的KRT17阳性低级别上皮细胞亚群 首次在组织学低级别IPMN中识别出表达KRT17、S100A10和CEACAM5等恶性转录特征的细胞亚群,并验证其广泛但斑片状分布 研究样本可能有限,且未详细探讨该细胞亚群的具体分子机制或临床干预策略 探究IPMN进展过程中的转录变化,以改善早期检测和患者管理策略 胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)患者样本,包括低级别异型增生、高级别异型增生和IPMN来源的癌组织 数字病理学 胰腺癌 空间转录组学,单细胞RNA测序,免疫荧光 NA 转录组数据,图像数据 包含IPMN疾病全谱的患者样本,具体数量未明确说明 Nanostring 空间转录组学,单细胞RNA-seq Nanostring GeoMx Nanostring GeoMx空间转录组平台
33 2026-02-11
Sex-dependent molecular landscape of Alzheimer's disease revealed by large-scale single-cell transcriptomics
2025-Feb, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究利用大规模单细胞转录组图谱揭示了阿尔茨海默病中显著的性别依赖性分子特征 首次通过大规模单细胞转录组学系统揭示阿尔茨海默病的性别依赖性分子景观,识别了性别特异性的基因表达模式、通路改变和细胞间通讯变化 研究仅基于人类前额叶皮层样本,可能无法完全反映其他脑区或疾病阶段的性别差异 探究阿尔茨海默病中性别差异的分子机制 人类前额叶皮层的单细胞转录组数据 单细胞转录组学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 大规模样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
34 2026-02-10
Identifying Potential Drug Targets in the Knee Osteoarthritis: Insights from the Druggable Genome
2025-Dec-31, Rejuvenation research IF:2.2Q3
研究论文 本研究通过整合可药基因组和孟德尔随机化分析,识别了膝骨关节炎的潜在药物靶点 结合多组织表达数量性状位点、单细胞MR分析、蛋白质组学验证及遗传信息空间映射框架,从外周和中枢组织角度系统识别并验证了KOA的潜在治疗靶点 需要未来进一步实验验证所识别靶点在KOA中的作用机制 寻找膝骨关节炎的潜在药物靶点 膝骨关节炎 生物信息学 骨关节炎 表达数量性状位点分析、孟德尔随机化分析、单细胞MR分析、蛋白质组学验证、遗传信息空间映射 孟德尔随机化模型、gsMap框架 基因组关联研究数据、空间转录组学数据、蛋白质定量性状位点数据 NA NA 空间转录组学 NA E16.5小鼠胚胎组织的空间转录组学
35 2026-02-10
Exploring hypoxia- and cuproptosis-related biomarkers in periodontitis based on transcriptome and single-cell analysis
2025-Dec-29, Clinical oral investigations IF:3.1Q1
研究论文 本研究通过转录组和单细胞分析,探索了牙周炎中与缺氧和铜死亡相关的生物标志物 首次将缺氧相关基因与铜死亡相关基因结合,在牙周炎中进行系统性生物标志物鉴定,并利用单细胞RNA测序数据在单细胞水平验证了关键基因的表达模式 研究依赖于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的实验验证和前瞻性临床研究来确认生物标志物的临床效用 识别和表征牙周炎中与缺氧和铜死亡相关的关键生物标志物,以深入理解其分子机制 牙周炎患者与健康对照的基因表达数据 生物信息学 牙周炎 转录组分析,单细胞RNA测序 机器学习(Boruta算法,LASSO回归,递归特征消除) 基因表达数据 来自GEO数据库的多个牙周炎数据集(包括GSE16134, GSE10334, GSE152042) NA 单细胞RNA-seq NA NA
36 2026-02-10
Molecular signatures and signaling interactions of the hair follicle stem cell niche
2025-Dec-15, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过高灵敏度单细胞转录组分析,定义了毛囊干细胞及其微环境中多种细胞类型的转录组特征,并揭示了细胞间通讯网络 首次通过流式分选结合高灵敏度转录组测序,对毛囊微环境中四种相邻区域的六种细胞群体进行系统分析,实现了前所未有的基因检测灵敏度 研究基于小鼠背部皮肤样本,人类数据的验证仍需进一步研究 揭示毛囊干细胞及其微环境的分子特征和信号相互作用机制 小鼠背部皮肤中的毛囊乳头细胞、隆突干细胞、毛胚干细胞、表皮细胞、毛囊上皮细胞和真皮成纤维细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序、流式细胞分选 NA 转录组数据 从小鼠背部4个相邻区域分选的6种细胞群体,共56个全转录组测量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
37 2026-02-10
Lifting regenerative barriers promotes epithelial cell fate plasticity supporting lineage conversion
2025-Nov-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究探讨了成年上皮细胞在再生过程中命运可塑性的调控机制,揭示了HIF1a-SOX9轴作为限制细胞身份转换的关键屏障 首次发现HIF1a-SOX9轴作为上皮细胞命运可塑性的关键调节因子,并证明解除再生屏障可促进食管细胞向皮肤细胞的谱系转换 研究基于3D再生培养系统,可能无法完全模拟体内复杂环境;谱系转换效率较低,机制仍需进一步验证 探究成年上皮细胞命运可塑性的调控机制及再生过程中的谱系转换限制因素 成年食管上皮细胞与真皮基质细胞 再生医学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
38 2026-02-10
Trypanosoma brucei cattle infections contain cryptic transmission-adapted bloodstream forms at low parasitaemia
2025-Nov-05, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和显微镜技术,揭示了牛感染布氏锥虫时存在隐秘的传播适应性血流形式,挑战了基于啮齿动物模型的传统假设 首次在牛的低寄生虫血症水平下,通过单细胞转录组学识别出具有细长型和粗短型相关转录组的混合寄生虫群体,揭示了宿主特异性差异 研究主要基于牛和鼠类感染模型,可能未完全覆盖所有自然宿主或环境条件下的寄生虫行为,且形态学标记蛋白表达未在粗短型样寄生虫中检测到 探究布氏锥虫在自然宿主(牛)中的发育和传播机制,特别是低寄生虫血症条件下的形式分化 布氏锥虫在牛和鼠类感染中的寄生虫群体,包括其转录组和形态特征 寄生虫学与传染病学 非洲动物锥虫病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、显微镜观察 NA 转录组数据、图像数据 牛和鼠类感染样本,具体数量未在摘要中指定 NA 单细胞RNA-seq NA NA
39 2026-02-10
Heterochronic transcription factor expression drives cone-dominant retina development in 13-lined ground squirrels
2025-Oct-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞转录组和染色质可及性测序,揭示了十三纹地松鼠视锥细胞优势视网膜发育的调控机制 发现了视锥细胞不仅来源于早期神经祖细胞,还来源于晚期神经祖细胞,这种延长生成期由转录因子表达的异时性转变驱动 未明确说明样本数量,且机制验证主要在基因表达层面,缺乏更深入的体内功能验证 探究地松鼠视锥细胞优势视网膜发育的分子调控机制 十三纹地松鼠的视网膜发育过程 发育生物学 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
40 2026-02-10
Single-Cell Multiome Impact of Prenatal Heavy Metal Exposure on Early Airway Development
2025-Jul-30, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞多组学测序和高分辨率代谢组学,揭示了产前镉和砷暴露对小鼠早期胚胎肺发育的多层面分子和细胞破坏机制 首次结合单细胞多组学测序(scATAC-seq+scRNA-seq)和高分辨率代谢组学,系统描绘了产前重金属暴露对早期气道发育的多层面影响,并整合RNA剪接和染色质动力学进行细胞命运轨迹分析 研究仅针对小鼠E12胚胎肺,且暴露剂量为固定浓度,未涵盖更广泛的发育时间点或剂量效应关系 探究产前镉和砷暴露对早期肺发育的细胞类型特异性机制和分子调控网络 产前暴露于镉和砷的小鼠胚胎肺组织(E12、E14.5、E17) 单细胞多组学 肺发育障碍 单细胞多组学测序(scATAC-seq+scRNA-seq)、高分辨率代谢组学、基因调控网络分析、细胞命运轨迹分析 NA 单细胞多组学数据(RNA-seq、ATAC-seq)、代谢组学数据 小鼠胚胎肺组织(对照组和处理组,具体数量未明确说明) NA 单细胞多组学测序(scATAC-seq+scRNA-seq) NA NA
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