单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 10776 篇文献，本页显示第 3941 - 3960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3941 | 2025-10-05 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Cell Heterogeneity and Altered Signaling Pathways in Jellyfish Sting Patients
2025-Sep-15, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23090358
PMID:41003327
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示水母蜇伤患者免疫细胞异质性和信号通路改变 | 首次在单细胞分辨率下揭示水母蜇伤后的免疫失调图谱，发现MMP9+单核细胞和S100A12+中性粒细胞的关键作用 | 仅分析一名严重患者样本，样本量较小 | 探究水母蜇伤后的免疫机制和信号通路变化 | 水母蜇伤患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 中毒性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 一名严重患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3942 | 2025-10-05 |
Morphological and Transcriptomic Analyses of the Adrenal Gland in Acomys cahirinus: A Novel Model for Murine Adrenal Physiology
2025-Sep-12, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14181431
PMID:41002397
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研究论文 | 本研究通过形态学和转录组学分析比较了Acomys cahirinus与小鼠的肾上腺结构与基因表达差异 | 首次在Acomys cahirinus中发现明确的网状带结构，其肾上腺基因表达谱与人类肾上腺皮质高度相似 | 需要进一步进行单细胞转录组学和功能验证实验来充分评估其转化潜力 | 评估Acomys cahirinus作为人类肾上腺疾病模型的适用性 | Acomys cahirinus和小鼠的肾上腺组织 | 转录组学 | 肾上腺疾病 | RNA-seq, qRT-PCR, CAGE-seq, 通路分析 | NA | 转录组数据, 形态学数据 | NA | NA | 转录组测序 | NA | NA |
| 3943 | 2025-10-05 |
Comprehensive Characterization of Long Non-Coding RNAs in Porcine Tissues: Expression Patterns and Functional Insights During Oocyte Development
2025-Sep-09, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14181409
PMID:41002376
|
研究论文 | 本研究系统表征了猪组织中长链非编码RNA的表达模式及其在卵母细胞发育中的功能 | 首次系统分析14种猪组织的lncRNA表达谱，并鉴定卵母细胞发育过程中的关键lncRNA | 研究主要基于表达谱分析，功能验证实验相对有限 | 阐明猪组织中lncRNA的表达特征及其在生殖生物学中的功能 | 猪多种组织样本及卵母细胞发育不同阶段的单细胞数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 607个组织RNA-seq数据集，63个单细胞RNA-seq数据集，以及37个人鼠比较数据集 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3944 | 2025-10-05 |
Piezo1 promotes M1 macrophage polarization and impairs osteogenic differentiation in bone infection
2025-Sep-07, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2025.168042
PMID:40925468
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研究论文 | 本研究探讨Piezo1在骨感染中促进巨噬细胞M1极化并损害成骨分化的机制 | 首次揭示Piezo1在骨感染微环境中调控巨噬细胞极化并通过PANoptosis影响成骨分化的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，需要进一步临床验证 | 探究Piezo1在骨感染过程中对巨噬细胞极化和成骨分化的调控作用 | 大鼠骨感染模型、人类感染骨组织、小鼠单核巨噬细胞和骨髓间充质干细胞 | 骨生物学 | 骨感染 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 细胞共培养 | NA | RNA测序数据, 细胞实验数据 | 大鼠模型和人类组织样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 3945 | 2025-10-05 |
Dissecting microbial communities with single-cell transcriptome analysis
2025-Sep-04, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adp6252
PMID:40906858
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综述 | 本文综述了单细胞转录组分析技术在微生物群落研究中的应用进展与挑战 | 将单细胞基因表达分析技术从人类生物学领域拓展应用于微生物群落功能解析 | 在微生物群落应用中仍面临技术挑战 | 探讨单细胞转录组技术在微生物群落功能研究中的应用 | 微生物群落及其亚群 | 单细胞组学 | 肠道微生物相关疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3946 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis of human fibrous dysplasia bone reveals a fibrotic transcriptome and GNAS variants in endothelial, perivascular, and stromal cells
2025-Sep-04, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.07.018
PMID:40848713
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类纤维性发育不良骨组织，揭示纤维化转录组特征和GNAS变异在多种细胞类型中的表达 | 首次在骨骼基质谱系外的内皮细胞和周细胞中发现GNAS c.602G>A和c.601C>T变异，并识别出跨FD细胞谱系的共同纤维化转录组特征 | 样本量有限，仅分析了非造血细胞 | 研究体细胞嵌合对纤维性发育不良疾病机制的细胞和分子影响 | 人类纤维性发育不良和非纤维性发育不良骨组织中的非造血细胞 | 单细胞组学 | 纤维性发育不良 | 单细胞RNA测序，GNAS基因分型，BaseScope检测 | NA | 单细胞RNA测序数据 | FD和非FD人类骨组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3947 | 2025-10-05 |
A Human Immuno-Lung Organoid Model to Study Macrophage-Mediated Lung Cell Senescence Upon SARS-CoV-2 Infection
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503932
PMID:40712141
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研究论文 | 本研究开发了免疫-肺类器官模型，研究SARS-CoV-2感染后巨噬细胞介导的肺细胞衰老机制 | 建立了包含hPSC来源肺泡和气道类器官与巨噬细胞共培养的免疫-肺类器官模型，并首次发现THBS1-(ITGA3+ITGB1)信号轴在驱动肺细胞衰老中的作用 | NA | 研究SARS-CoV-2感染后巨噬细胞介导的肺损伤机制 | 非COVID和COVID-19肺组织外植体和尸检样本，免疫-肺类器官模型 | 数字病理 | COVID-19 | 空间转录组测序 | 类器官模型 | 空间转录组数据 | 非COVID和COVID-19肺组织样本 | NanoString | 空间转录组学 | CosMx | NanoString CosMx空间分子成像平台 |
| 3948 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptional analysis of murine mesenteric lymph nodes following oral lyso-phosphatidylserine nanoparticle administration reveals cellular heterogeneity in tolerance features
2025-Sep, Journal of pharmaceutical sciences
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.xphs.2025.103919
PMID:40712826
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析口服含溶血磷脂酰丝氨酸纳米颗粒后小鼠肠系膜淋巴结的免疫细胞反应 | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示LysoPS纳米颗粒通过TGF-β反应诱导B细胞、T细胞和NK细胞耐受性特征的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型，人体内的生物过程和细胞通讯机制仍不明确 | 阐明LysoPS介导的口服耐受性中的免疫细胞相互作用和潜在耐受机制 | 小鼠肠系膜淋巴结中的免疫细胞（B细胞、T细胞、NK细胞） | 单细胞组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3949 | 2025-10-05 |
SmartImpute is a targeted imputation framework for single-cell transcriptome data
2025-Aug-18, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101122
PMID:40763742
|
研究论文 | 提出一种针对单细胞转录组数据的靶向插补框架SmartImpute | 采用改进的生成对抗插补网络(GAIN)与多任务判别器，专注于预定义标记基因，在填补缺失值的同时保留真实生物零值 | NA | 提高单细胞RNA测序数据的生物学相关性和计算效率 | 头颈鳞状细胞癌、人骨髓和肺癌的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 头颈癌, 骨髓疾病, 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 生成对抗网络(GAIN) | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 超过一百万细胞的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3950 | 2025-10-05 |
From injury to recovery: Spatiotemporal dynamics of the visual pathway during spontaneous structural and functional regeneration after optic nerve transection in zebrafish
2025-07-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究系统揭示了斑马鱼视神经横断后视觉通路自发再生过程中的时空动态变化 | 首次在成年斑马鱼中系统描绘了从视网膜到视神经再到大脑的完整视觉通路再生时空动态，并建立了结构与功能恢复的关联 | 研究仅限于斑马鱼模型，在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 阐明斑马鱼视觉系统自发再生的时空协调机制 | 成年斑马鱼的视觉通路（视网膜、视神经、大脑） | 神经科学 | 视神经损伤 | 苏木精-伊红染色,免疫组织化学,透射电子显微镜,单细胞RNA测序,视动反应行为评估 | NA | 组织切片图像,基因表达数据,行为数据 | 成年斑马鱼在5周时间内的系列观察 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3951 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA-seq provides insight into the underdeveloped immune system of germ-free mice
2025-Jul-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示无菌小鼠免疫系统发育不全的分子机制 | 首次使用液滴单细胞RNA测序系统比较无菌小鼠与特定病原体自由小鼠的免疫细胞差异，发现微生物缺失导致中性粒细胞凋亡增加和干扰素反应受损的新机制 | 研究主要聚焦于骨髓和外周血细胞，未涉及其他免疫器官；机制验证仍需进一步功能实验 | 探究微生物群缺失导致免疫系统发育不全的分子机制 | 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠的骨髓及外周血免疫细胞 | 单细胞组学 | 免疫缺陷 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 无菌小鼠和特定病原体自由小鼠的骨髓及外周血样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 液滴单细胞RNA测序平台 |
| 3952 | 2025-10-05 |
Phenotypic, transcriptomic, and genomic analyses reveal the spatiotemporal patterns and associated genes of coarse hair density in goats
2025-07-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了大足黑山羊粗毛密度的时空变化模式及其相关基因 | 创新应用高分辨率微型相机成像技术，结合转录组、基因组和单细胞RNA测序等多组学数据解析粗毛密度调控机制 | 研究主要聚焦于单一山羊品种，结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 探究山羊粗毛密度的遗传调控机制和时空变化规律 | 大足黑山羊 | 基因组学 | NA | RNA-seq, 全基因组测序, 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹, 免疫组织化学染色 | NA | 图像, 转录组, 基因组 | 905张皮肤图像, 33个皮肤转录组, 272个全基因组序列, 182个下载转录组 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 全基因组测序 | NA | NA |
| 3953 | 2025-10-05 |
CXCL12 Drives Reversible Fibroimmune Remodeling in Androgenetic Alopecia Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Jul-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26146568
PMID:40724819
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示CXCL12在雄激素性脱发中驱动可逆性纤维免疫重塑的作用机制 | 首次在雄激素性脱发模型中系统阐明CXCL12通过自分泌和旁分泌信号通路协调调控成纤维细胞和免疫细胞的核心作用 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明CXCL12在雄激素性脱发纤维免疫病理过程中的分子机制 | 睾酮诱导的雄激素性脱发小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 雄激素性脱发 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3954 | 2025-10-05 |
Conserved spatial subtypes and cellular neighborhoods of cancer-associated fibroblasts revealed by single-cell spatial multi-omics
2025-May-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.03.004
PMID:40154487
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研究论文 | 通过单细胞空间多组学技术揭示癌症相关成纤维细胞在多种癌症类型中保守的空间亚型和细胞邻域结构 | 首次在10种癌症类型中鉴定出四种保守的空间CAF亚型，这些亚型具有跨癌症类型和空间组学平台的普适性 | 研究涉及多种平台和技术，可能存在技术偏差；样本来源的癌症类型有限 | 探索癌症相关成纤维细胞在肿瘤微环境中的空间组织特征和相互作用网络 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs)及其在肿瘤微环境中的空间分布 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 超过1400万个细胞，涵盖10种癌症类型 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞多组学 | 7种空间组学平台 | 7种不同的空间转录组学和蛋白质组学平台技术 |
| 3955 | 2025-10-05 |
Cutting-edge tools for unveiling the dynamics of plasmid-host interactions
2025-May, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.12.013
PMID:39843314
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综述 | 本文探讨了用于揭示质粒-宿主相互作用动态的前沿技术工具 | 批判性评估单细胞测序、荧光技术和Hi-C等先进方法在质粒-宿主相互作用研究中的应用，并探讨CRISPR-based噬菌体工程等新兴技术的潜力 | NA | 研究抗生素抗性基因在复杂微生物组中的质粒介导传播机制 | 质粒-宿主相互作用和抗生素抗性基因传播动态 | 微生物组学 | 抗生素耐药性 | 单细胞测序,荧光技术,高通量染色质构象捕获,CRISPR-based噬菌体工程 | NA | 基因组数据,染色质构象数据 | NA | NA | 单细胞测序,Hi-C | NA | NA |
| 3956 | 2025-10-05 |
Local genetic covariance analysis with lipid traits identifies novel loci for early-onset Alzheimer's Disease
2025-Mar, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011631
PMID:40096060
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研究论文 | 本研究通过局部遗传协方差分析发现早发性阿尔茨海默病与脂质性状之间存在共享遗传结构 | 首次使用SUPERGNOVA方法系统分析EOAD与脂质性状的局部遗传协方差，并识别出3个新的候选致病基因 | 样本量相对有限，EOAD病例数较少，功能验证实验不足 | 探索早发性阿尔茨海默病与脂质代谢途径的共享遗传机制 | 早发性阿尔茨海默病患者和血脂性状人群 | 遗传学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组关联分析，遗传协方差分析，eQTL共定位分析，单细胞RNA测序 | SUPERGNOVA | 基因组汇总统计数据 | EOAD: 19,668例；血脂性状: 1,320,016例 | NA | 单细胞RNA测序，DNA甲基化分析 | NA | NA |
| 3957 | 2025-10-05 |
ScLineageAtlas: a comprehensive single-cell genomics database for characterizing cellular clones in cancer
2025-Jan-18, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf046
PMID:40996711
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研究论文 | 开发了一个综合性单细胞基因组学数据库ScLineageAtlas，用于表征多种癌症类型中的细胞克隆 | 整合了24个处理过的单细胞RNA测序数据集，涵盖13种不同癌症类型，并提供细胞克隆的空间可视化分析 | 目前仅包含24个数据集，样本规模相对有限 | 构建一个用户友好的细胞克隆数据分析平台，促进对肿瘤异质性、分化轨迹和进化的理解 | 多种癌症类型中的细胞克隆 | 单细胞基因组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 24个处理过的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3958 | 2025-10-05 |
Single-cell splicing QTL analysis in pancreatic islets
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1657895
PMID:41000275
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胰腺胰岛中的剪接数量性状位点 | 首次在单细胞水平识别胰腺胰岛α和β细胞中的剪接QTL，发现了批量分析中未观察到的CDC42基因变异 | 样本量有限，统计功效有待提升 | 探索遗传变异对单细胞水平选择性剪接的调控机制 | 胰腺胰岛α细胞和β细胞 | 单细胞基因组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 基因分型, 异构体定量分析 | sQTLseeker2 | 单细胞RNA测序数据 | 8个全长单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3959 | 2025-10-05 |
Novel diagnostic biomarkers associated with macrophage-microglia in spinal cord injury
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1634014
PMID:41000385
|
研究论文 | 本研究通过机器学习算法识别脊髓损伤中与巨噬细胞-小胶质细胞相关的诊断生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法识别脊髓损伤中巨噬细胞-小胶质细胞相关的关键枢纽基因 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于体外模型 | 探索脊髓损伤中巨噬细胞-小胶质细胞相关的诊断生物标志物 | 脊髓损伤相关的基因表达数据和巨噬细胞-小胶质细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, qPCR, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | GEO数据库中的脊髓损伤相关数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3960 | 2025-10-05 |
Integrated analysis of single-cell and bulk transcriptomics reveals the prognostic value and underlying mechanisms of crotonylation in ovarian cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1596080
PMID:41000388
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组学分析，揭示巴豆酰化在卵巢癌中的预后价值及潜在机制 | 首次系统研究巴豆酰化在卵巢癌微环境中的作用，并构建基于巴豆酰化的预后模型 | 未在独立队列中进行实验验证 | 开发基于巴豆酰化的卵巢癌预后模型并探索其治疗潜力 | 卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序，批量转录组测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |