单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 4046 篇文献，本页显示第 3941 - 3960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3941 | 2025-01-03 |
Single-cell omics: experimental workflow, data analyses and applications
2025-Jan, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-023-2561-0
PMID:39060615
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综述 | 本文全面总结了单细胞组学技术的最新进展，特别是方法学部分 | 单细胞组学技术在生物医学领域具有突破性进展，提供了对复杂疾病（如癌症）的深刻理解 | NA | 指导研究人员选择适当的单细胞测序及相关数据分析方法 | 单细胞组学技术 | 生物医学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞组学数据 | NA |
| 3942 | 2025-01-03 |
A specific inflammatory suppression fibroblast subpopulation characterized by MHCII expression in human dilated cardiomyopathy
2025-Jan, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-024-04939-9
PMID:38462549
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，识别了人类扩张型心肌病（DCM）中一种特定的抗原呈递成纤维细胞亚群，并探讨了其在炎症抑制中的作用 | 首次识别并描述了DCM中一种特定的抗原呈递成纤维细胞亚群（apFB），并揭示了其在炎症抑制中的关键作用 | 研究样本量较小，仅包括4个健康供体和6个DCM患者的心脏组织 | 探讨扩张型心肌病（DCM）中成纤维细胞的异质性及其与免疫细胞的相互作用 | 人类左心室组织，包括健康供体和DCM患者的心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（ScRNA-Seq） | NA | RNA测序数据 | 10个心脏组织（4个健康供体和6个DCM患者） |
| 3943 | 2025-01-03 |
The heterogeneity of cellular metabolism in the tumour microenvironment of hepatocellular carcinoma with portal vein tumour thrombus
2025-Jan, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13738
PMID:39189673
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研究论文 | 本研究通过多组学组合全面分析了肝细胞癌（HCC）、门静脉癌栓（PVTT）和正常肝样本的代谢异质性 | 首次在多组学水平上描绘了HCC和PVTT中非恶性细胞的代谢异质性景观，并确定了PVTT形成和发展的代谢特征 | NA | 研究肝细胞癌及其门静脉癌栓的代谢异质性 | 肝细胞癌（HCC）、门静脉癌栓（PVTT）和正常肝样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、荧光多重免疫组化 | NA | RNA测序数据、空间转录组数据、免疫组化数据 | NA |
| 3944 | 2025-01-03 |
Dissecting the cell microenvironment of ovarian endometrioma through single-cell RNA sequencing
2025-Jan, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2638-9
PMID:39470923
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术解析卵巢子宫内膜异位囊肿的细胞微环境 | 首次在单细胞水平上对卵巢子宫内膜异位囊肿的细胞微环境进行了全面解析，并识别了与疾病相关的关键细胞类型和分子特征 | 研究样本量相对较小，且未涉及长期随访数据 | 揭示卵巢子宫内膜异位囊肿的分子和细胞机制，以改善诊断和治疗策略 | 卵巢子宫内膜异位囊肿患者的子宫内膜组织 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 超过52,000个单细胞，来自卵巢子宫内膜异位囊肿患者和健康捐赠者的子宫内膜组织 |
| 3945 | 2025-01-03 |
Resolving the developmental mechanisms of cardiac microthrombosis of SARS-CoV-2 based on single-cell transcriptome analysis
2025-Jan, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-023-2624-9
PMID:39470924
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，探讨了SARS-CoV-2感染引起的心脏微血栓形成的发育机制 | 首次通过单细胞测序技术揭示了SARS-CoV-2感染心脏微血栓形成过程中，MYO1ERASGEF1B单核细胞衍生巨噬细胞在免疫系统过度激活和外在凝血途径启动中的关键作用 | 研究样本量有限，且仅针对右心室游离壁组织，可能无法全面反映心脏其他部位的情况 | 研究SARS-CoV-2感染引起的心脏微血栓形成的分子机制 | 健康供体、在特征性凝血异常（CAC）高凝期死亡的患者、在CAC纤溶期死亡的患者的心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 61,187个细胞，包含24种免疫细胞亚群和13种心脏驻留细胞亚群 |
| 3946 | 2025-01-03 |
Bayesian Phylogenetic Lineage Reconstruction with Loss of Heterozygosity Mutations Derived from Single-Cell RNA Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4310-5_1
PMID:39745633
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研究论文 | 本文介绍了一种基于单细胞RNA测序的贝叶斯方法，用于从推断的杂合性缺失（LOH）事件重建细胞谱系 | 使用单细胞RNA测序数据，结合贝叶斯方法重建细胞谱系，并标注细胞表型和发育时间点 | 该方法目前仅应用于特定小鼠模型，尚未广泛验证 | 研究细胞谱系重建方法，以了解细胞发育历史 | Emx1+皮质投射神经元和胶质细胞谱系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯模型 | RNA测序数据 | C57Bl/6J (B6) 和 CAST/EiJ (CA) 杂交F1小鼠 |
| 3947 | 2025-01-03 |
Lineage Recording in Human Brain Organoids with iTracer
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4310-5_5
PMID:39745637
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研究论文 | 本文详细介绍了iTracer在人类大脑类器官中记录细胞谱系的应用协议 | iTracer结合了报告基因条形码和可诱导的CRISPR-Cas9标记，与单细胞和空间转录组学兼容，用于探索大脑类器官发育过程中的克隆性和谱系动态 | NA | 研究人类器官发育过程中的细胞谱系关系 | 人类大脑类器官 | 生物医学工程 | NA | iTracer, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞和空间转录组数据 | NA |
| 3948 | 2025-01-03 |
Clonal Tracking in the Mouse Brain with Single-Cell RNA-Seq
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4310-5_6
PMID:39745638
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用单细胞RNA测序技术在小鼠大脑中进行克隆追踪的方法 | 与传统基于稀疏荧光标记的方法相比，使用遗传条形码和单细胞RNA测序的克隆追踪方法具有超过100倍的吞吐量，并且使用的老鼠数量减少了10倍以上 | NA | 开发一种高吞吐量的克隆追踪方法，用于研究哺乳动物大脑中的细胞谱系关系 | 小鼠大脑中的细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 2周大的小鼠脑组织 |
| 3949 | 2025-01-03 |
LINNAEUS: Simultaneous Single-Cell Lineage Tracing and Cell Type Identification
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4310-5_12
PMID:39745644
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为LINNAEUS的策略，用于在数千个单细胞中同时进行谱系追踪和转录组分析 | LINNAEUS结合了单细胞RNA测序和谱系条码的计算分析，能够重建生物体范围内的单细胞谱系树 | NA | 理解细胞类型在发育、再生和疾病等过程中的起源 | 单细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 数千个单细胞 |
| 3950 | 2025-01-03 |
Paired Single-Cell Transcriptome and DNA Barcode Detection in Zebrafish Using ScarTrace
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4310-5_11
PMID:39745643
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研究论文 | 本文介绍了一种基于CRISPR/Cas9的遗传谱系追踪方法ScarTrace，用于在斑马鱼胚胎发育过程中对单细胞进行DNA条形码标记，并通过单细胞cDNA扩增和基因组DNA嵌套PCR分别捕获转录组和条形码序列 | ScarTrace方法结合了CRISPR/Cas9技术和单细胞转录组分析，能够在斑马鱼胚胎发育过程中对单细胞进行独特的DNA条形码标记，并实现克隆追踪和谱系树重建 | 该方法目前仅应用于斑马鱼模型，尚未在其他生物体中进行验证 | 研究斑马鱼胚胎发育过程中的细胞命运决定 | 斑马鱼胚胎和成体组织中的单细胞 | 遗传学 | NA | CRISPR/Cas9, 单细胞cDNA扩增, 基因组DNA嵌套PCR | NA | DNA序列, 转录组数据 | 斑马鱼胚胎和成体组织中的单细胞 |
| 3951 | 2025-01-03 |
Single-Cell Profiling of Lineages and Cell Types in the Vertebrate Brain
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4310-5_15
PMID:39745647
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研究论文 | 本文介绍了一种结合CRISPR-Cas9编辑和单细胞RNA测序的技术scGESTALTv2，用于在斑马鱼大脑发育过程中进行细胞谱系追踪 | 结合了累积CRISPR-Cas9编辑和基于液滴的单细胞RNA测序，实现了单细胞分辨率的谱系追踪 | 研究仅限于斑马鱼大脑发育，未涉及其他生物或组织 | 开发一种可扩展的细胞谱系追踪方法，以研究细胞关系 | 斑马鱼大脑发育过程中的细胞 | 单细胞测序 | NA | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 数千个斑马鱼大脑细胞 |
| 3952 | 2025-01-03 |
GEMLI: Gene Expression Memory-Based Lineage Inference from Single-Cell RNA-Sequencing Datasets
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4310-5_19
PMID:39745651
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研究论文 | 本文介绍了一种基于基因表达记忆的细胞谱系推断工具GEMLI，该工具仅需单细胞RNA测序数据即可预测细胞谱系 | GEMLI通过基因表达记忆现象预测细胞谱系，无需依赖遗传标记或物理细胞分离，极大地简化并扩展了谱系注释 | NA | 开发一种仅需单细胞RNA测序数据即可预测细胞谱系的工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达矩阵 | NA |
| 3953 | 2024-12-31 |
Selenium promotes neural development through the regulation of GPX4 and SEPP1 in an iPSC-derived neuronal model
2025-May, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本研究探讨了硒通过调控GPX4和SEPP1在iPSC衍生的神经元模型中对神经发育的促进作用 | 首次使用高生物利用度的硒纳米颗粒（SeNPs@LNT）在iPSC衍生的神经元模型中干预不同阶段的神经发育，并揭示了其通过激活PI3K/Akt/Nrf2信号通路调控硒蛋白的机制 | 研究主要基于体外模型，未在体内验证硒纳米颗粒的作用 | 探讨硒蛋白在不同神经元发育阶段的具体作用和机制 | iPSC衍生的神经元模型 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍（ASD） | 单细胞RNA测序 | iPSC-iNeuron模型 | 基因表达数据 | NA |
| 3954 | 2024-12-31 |
Spatial Transcriptomics: Integrating Morphology and Molecular Mechanisms of Kidney Diseases
2025-Jan, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.06.012
PMID:39097166
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综述 | 本文综述了当前可用的空间转录组学（ST）技术及其在肾脏疾病中的应用 | 通过整合形态学和分子生物学，ST技术提供了理解组织生物学和疾病的潜力，并可能提供有意义的临床见解 | 讨论了这些新兴技术的挑战和前景，但未具体说明其局限性 | 提高对组织生物学和疾病的理解，并探索其在肾脏疾病中的潜在医学应用 | 肾脏疾病 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学（ST） | NA | 分子和形态学数据 | NA |
| 3955 | 2024-12-30 |
Mouse Tail-Skin Dissociation and Preparation of Live Single-Cell Suspension for Downstream Analysis of Melanocytes
2025-Jan, Pigment cell & melanoma research
IF:3.9Q2
DOI:10.1111/pcmr.13216
PMID:39625901
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研究论文 | 本文开发了一种从小鼠尾皮中高效分离高质量活单细胞的方法，用于下游的黑色素细胞及其相互作用细胞的研究 | 开发了一种新的两阶段酶解步骤，结合碎片去除和活细胞富集，从小鼠尾皮中高效生成高活性的单细胞悬液 | 该方法主要针对小鼠尾皮，可能不适用于其他类型的皮肤组织 | 研究小鼠尾皮中黑色素细胞及其相互作用细胞的单细胞转录组分析 | 小鼠尾皮中的角质形成细胞、黑色素细胞和成纤维细胞 | 单细胞测序 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 3956 | 2024-12-29 |
CXC chemokine receptor 4 - mediated immune modulation and tumor microenvironment heterogeneity in gastric cancer: Utilizing multi-omics approaches to identify potential therapeutic targets
2025 Jan-Feb, BioFactors (Oxford, England)
DOI:10.1002/biof.2130
PMID:39431668
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研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨了CXCR4在胃癌中的免疫调节功能及肿瘤微环境异质性 | 首次全面揭示了CXCR4在胃癌肿瘤微环境中的免疫调节作用及其与T细胞耗竭的关系 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内实验验证 | 探索CXCR4在胃癌中的免疫调节功能及肿瘤微环境异质性，寻找潜在治疗靶点 | 胃癌细胞系AGS和SNU-1 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、ELISA、PCR、CCK8实验、细胞划痕实验、集落形成实验 | NA | 基因表达数据、细胞实验数据 | 两种胃癌细胞系（AGS和SNU-1） |
| 3957 | 2024-12-29 |
Construction of mitochondrial quality regulation genes-related prognostic model based on bulk-RNA-seq analysis in multiple myeloma
2025 Jan-Feb, BioFactors (Oxford, England)
DOI:10.1002/biof.2135
PMID:39446019
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研究论文 | 本文基于批量RNA测序分析，构建了与线粒体质量调控基因相关的多发性骨髓瘤预后模型 | 开发了一个与线粒体质量调控基因相关的预后模型，并利用多种生物信息学工具进行综合分析 | NA | 构建多发性骨髓瘤患者的线粒体质量调控基因相关预后模型 | 多发性骨髓瘤患者 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、突变分析、免疫浸润分析 | RiskScore模型 | RNA测序数据、突变数据、单细胞RNA测序数据 | NA |
| 3958 | 2024-12-29 |
Navigating the immune landscape with plasma cells: A pan-cancer signature for precision immunotherapy
2025 Jan-Feb, BioFactors (Oxford, England)
DOI:10.1002/biof.2142
PMID:39495620
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研究论文 | 本研究通过泛癌单细胞RNA测序分析，发现了一种新的浆细胞特征Plasma cell.Sig，能够显著预测患者对免疫治疗的反应 | 发现了一种新的浆细胞特征Plasma cell.Sig，并通过机器学习算法验证了其在预测免疫治疗反应中的优越性 | 未提及具体的研究局限性 | 提高对肿瘤微环境中内在和外在免疫景观的理解，并为更精确的生物标志物引导的免疫治疗方法铺平道路 | 癌症患者 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 多个队列的癌症患者 |
| 3959 | 2024-12-28 |
Deciphering distinct pathogenic mechanisms of ankylosing spondylitis and systemic sclerosis via shared biomarkers ZSWIM6 and CCL3L3: Insights from an integrative bioinformatics approach
2025-Dec, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2024.2445557
PMID:39727004
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研究论文 | 通过共享生物标志物ZSWIM6和CCL3L3，揭示强直性脊柱炎和系统性硬化症的不同致病机制 | 首次通过整合生物信息学方法，识别出ZSWIM6和CCL3L3作为强直性脊柱炎和系统性硬化症的潜在生物标志物，并深入探讨了它们在两种疾病中的不同分子机制 | 研究主要依赖于公开的RNA-seq数据集，样本来源和数量可能限制了结果的普适性 | 探索强直性脊柱炎和系统性硬化症的不同炎症致病机制，以提供新的治疗见解 | 强直性脊柱炎和系统性硬化症患者的外周血单核细胞 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | SVM, CIBERSORT | RNA-seq数据, 单细胞RNA测序数据 | GSE73754和GSE19617数据集中的外周血单核细胞样本，以及GSE194315数据集中的单细胞RNA测序数据 |
| 3960 | 2024-12-28 |
YAP Overcomes Mechanical Barriers to Induce Mitotic Rounding and Adult Cardiomyocyte Division
2025-Jan-07, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文研究了YAP5SA如何克服机械障碍，诱导成年心肌细胞的有丝分裂圆化和分裂 | 揭示了YAP5SA通过克服心肌微环境的机械约束，诱导心肌细胞有丝分裂圆化和分裂的新机制 | 研究主要基于细胞培养模型，可能无法完全反映体内复杂环境 | 探讨成年哺乳动物心肌细胞如何重新进入细胞周期 | 成年哺乳动物心肌细胞 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、标记基因分析、功能研究 | NA | 基因表达数据 | NA |