单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
3921	2025-06-04	Integrated analyses uncover new features of atypical memory B cells and novel targets for intervention 2025-03, Immunobiology IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.imbio.2025.152877 PMID:39938454	research paper	该研究通过单细胞RNA测序和免疫表型分析，揭示了非典型记忆B细胞（AMB）的转录组特征、免疫表型及其在系统性风湿性疾病中的潜在作用	首次全面描述了AMB的转录组特征和免疫表型，并发现其在系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎和干燥综合征患者中的扩增现象	研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证AMB在疾病中的具体作用机制	探究非典型记忆B细胞的免疫特征及其在系统性风湿性疾病中的致病作用	非典型记忆B细胞（AMB）及其在系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎和干燥综合征患者中的表现	免疫学	系统性红斑狼疮, 类风湿性关节炎, 干燥综合征	单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 生物信息学分析, CyTOF免疫表型分析	NA	转录组数据, 免疫表型数据	未明确说明样本数量，但涉及系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎和干燥综合征患者的血液和组织样本
3922	2025-06-04	Lymphocyte Subpopulations in the Healthy Human Lacrimal Gland and Their Variations With Age and Sex, Systematic Review 1960-2023 2025-Mar, Immunity, inflammation and disease DOI:10.1002/iid3.70167 PMID:40105662	系统性综述	本文通过系统性综述和荟萃分析，探讨了健康人类泪腺中淋巴细胞亚群及其随年龄和性别变化的规律	首次系统性地总结了1960-2023年间关于健康人类泪腺淋巴细胞亚群的研究，并进行了年龄分组的荟萃分析	研究中40岁以下个体和女性样本代表性不足，各研究对淋巴细胞浸润的量化标准存在较大差异	明确人类泪腺中主要淋巴细胞亚群及其随年龄和性别的变化规律	774名健康个体（其中722具尸体）的泪腺组织	免疫学	NA	苏木精-伊红染色、免疫组织化学、免疫荧光	NA	组织学数据	774名健康个体（722具尸体样本）
3923	2025-06-04	Omics based technology application in poultry meat research 2025-Jan, Poultry science IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.psj.2024.104643 PMID:39662255	研究论文	本文探讨了组学技术在禽肉研究中的应用，包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学和脂质组学，旨在全面了解禽肉品质问题	综合运用多种组学技术和生物信息学方法，深入解析禽肉品质的分子机制，特别是针对鸡胸肌病变的研究	NA	提高禽肉产品的质量和组成	禽肉（特别是鸡肉）的品质和鸡胸肌病变	生物信息学	禽类疾病	基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、脂质组学、质谱分析	NA	分子生物学数据	NA
3924	2025-06-04	A novel Tc17 population recruited by tumor cells promotes tumor progression in gastric cancer 2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2025.1592328 PMID:40452847	研究论文	本文研究了胃癌微环境中Tc17细胞的作用及其与肿瘤细胞的相互作用	首次揭示了Tc17细胞在胃癌中的免疫抑制作用及其通过CXCL16-CXCR6轴被肿瘤细胞招募的机制	研究主要基于体外实验，需要进一步的体内实验验证	探索Tc17细胞在胃癌微环境中的角色及其对肿瘤进展的影响	胃癌微环境中的Tc17细胞	肿瘤免疫学	胃癌	单细胞测序、空间转录组学、多色免疫组化染色、SCENIC分析、伪时间分析、细胞间相互作用分析	NA	单细胞测序数据、空间转录组数据	65个胃癌样本的296,879个细胞和10个胃癌样本的空间转录组数据
3925	2025-06-04	Metabolic reprogramming signature predicts prognosis and immune landscape in small cell lung cancer: MOCS2 validation and implications for personalized therapy 2025, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fmolb.2025.1592888 PMID:40452920	研究论文	本研究通过多组学分析揭示了小细胞肺癌(SCLC)中代谢重编程的特征，并开发了一个基于梯度提升机的预后模型，验证了MOCS2在SCLC细胞生物学中的关键作用	首次通过单细胞RNA测序和多组学分析揭示了SCLC中化疗耐药与敏感样本间的代谢重编程差异，并建立了基于代谢特征的预后模型	研究主要基于公共数据集，需要进一步临床样本验证	探索代谢重编程在小细胞肺癌预后和免疫特征中的作用，并开发个性化治疗策略	小细胞肺癌患者样本和细胞系	数字病理学	肺癌	单细胞RNA测序，bulk RNA测序，WGCNA分析	GBM(梯度提升机)	RNA测序数据	来自GSE60052和cBioportal队列的批量RNA测序数据，以及未明确数量的单细胞RNA测序样本
3926	2025-06-04	Single-Cell Analysis Reveals Aspirin Restores Intervertebral Disc Integrity via Ferroptosis Regulation 2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S519218 PMID:40453974	研究论文	通过单细胞分析揭示阿司匹林通过调节铁死亡恢复椎间盘完整性	首次使用单细胞RNA测序技术揭示椎间盘退变中的细胞异质性，并发现阿司匹林通过靶向GPX4抑制铁死亡的治疗潜力	研究仅基于四个独立的单细胞测序数据集，样本量可能有限	探索椎间盘退变的分子机制及阿司匹林的治疗效果	椎间盘髓核细胞（NPC）亚群	数字病理学	椎间盘退变	单细胞RNA测序	Harmony算法	单细胞测序数据	四个独立的单细胞测序数据集
3927	2025-06-04	To Explore the Key Subgroup and Their Immune Microenvironment During the Formation of Coronary Plaque With scRNA-seq 2025, Cardiology research and practice IF:1.8Q3 DOI:10.1155/crp/3221767 PMID:40454289	研究论文	通过单细胞RNA测序技术探索冠状动脉斑块形成过程中的关键亚群及其免疫微环境	利用多种技术（包括单细胞RNA测序、CytoTRACE、monocle、slingshot、CellChat和SCENIC）研究了NK细胞中的关键亚群C1 RACK1+ NK细胞在冠状动脉斑块形成中的作用	样本量较小，仅包含15个个体标本	理解冠状动脉斑块形成过程中的细胞异质性及其免疫微环境	NK细胞中的C1 RACK1+亚群	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CytoTRACE、monocle、slingshot、CellChat、SCENIC	NA	单细胞RNA测序数据	15个个体标本
3928	2025-06-03	Paricalcitol plus hydroxychloroquine enhances gemcitabine activity and induces mesenchymal to epithelial transition in pancreatic ductal adenocarcinoma: A single cell RNA-seq analysis 2025-Aug-10, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217809 PMID:40409452	研究论文	本研究探讨了帕立骨化醇、羟氯喹与吉西他滨联合治疗对胰腺导管腺癌中上皮-间质转化（EMT）的影响	首次在单细胞RNA测序水平上揭示了GPH联合治疗通过下调纤维连接蛋白（Fn1）和相关信号通路减少EMT的分子机制	研究仅基于KPC-Luc小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证	探索针对胰腺导管腺癌EMT过程的新型联合治疗方案	KPC-Luc原位小鼠模型中的胰腺导管腺癌细胞	肿瘤学	胰腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）、细胞间通讯分析	KPC-Luc小鼠模型	单细胞转录组数据	未明确说明样本量（基于KPC-Luc小鼠模型）
3929	2025-06-03	Decoding the corneal immune microenvironment in healthy and diabetic mice during corneal wound healing 2025-Jul, The ocular surface DOI:10.1016/j.jtos.2025.02.010 PMID:40023495	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术解析了健康和糖尿病小鼠角膜在稳态和伤口愈合过程中免疫细胞的转录变化	首次建立了健康和糖尿病小鼠角膜伤口愈合过程中免疫细胞的全面单细胞RNA测序转录组图谱	研究仅针对小鼠模型，尚未在人类样本中验证	探究糖尿病角膜病变(DK)中免疫微环境的变化机制	健康和糖尿病小鼠的角膜免疫细胞	生物医学	糖尿病角膜病变	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	转录组数据	健康和糖尿病小鼠的角膜样本
3930	2025-06-03	Investigating the molecular mechanisms and clinical potential of APO+ endothelial cells associated with PANoptosis in the tumor microenvironment of hepatocellular carcinoma using single-cell sequencing data 2025-Jul, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102402 PMID:40318262	研究论文	该研究利用单细胞RNA测序数据探索了肝细胞癌肿瘤微环境中与PANoptosis相关的APO+内皮细胞的分子机制及临床潜力	首次系统性地研究了PANoptosis在肝细胞癌肿瘤微环境中的细胞分布和功能，并揭示了APO+内皮细胞在改善预后和免疫治疗效果中的潜在机制	样本量相对较小（16例患者），且研究结果需要进一步的实验验证	探究PANoptosis在肝细胞癌肿瘤微环境中的具体功能和分子机制	肝细胞癌患者的肿瘤微环境细胞	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序	AUCell算法、CytoTRACE、scMetabolism	单细胞RNA测序数据	16例肝细胞癌患者的单细胞RNA测序样本
3931	2025-06-03	SARS-CoV-2 Infection of Human Lung Air-Liquid Interface Cultures Reveals Basal Cells as Relevant Targets 2025-Jun-02, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1 DOI:10.1093/infdis/jiaf125 PMID:40065723	research paper	该研究通过感染人类原代鼻和支气管上皮细胞的空气-液体界面培养物，揭示了基底细胞在SARS-CoV-2感染中的重要作用	研究发现基底细胞是SARS-CoV-2的重要靶点，并证实了局部应用Camostat mesylate可有效抑制病毒感染和免疫激活	研究结果可能受供体特异性影响，且样本来源仅限于鼻和支气管上皮细胞	探究SARS-CoV-2感染上呼吸道时涉及的多种上皮细胞类型及其免疫反应	人类原代鼻和支气管上皮细胞的空气-液体界面培养物	NA	COVID-19	病毒复制分析、单细胞RNA测序、光谱显微镜	NA	RNA测序数据、显微镜图像	人类原代鼻和支气管上皮细胞培养物（未提供具体样本数量）
3932	2025-06-03	Cxcr3 promotes protection from colorectal cancer liver metastasis by driving NK cell infiltration and plasticity 2025-Jun-02, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI184036 PMID:40168086	research paper	该研究探讨了CXCR3在促进NK细胞浸润和可塑性中的作用，从而保护免受结直肠癌肝转移的影响	揭示了CXCR3/配体轴在促进巨噬细胞依赖性NK细胞积累和功能维持中的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	探究NK细胞在结直肠癌肝转移中的抗肿瘤机制	结直肠癌肝转移中的NK细胞和巨噬细胞	肿瘤免疫学	结直肠癌	scRNA-seq	MC38小鼠模型和SL4诱导的CRC转移模型	基因表达数据	未明确提及具体样本数量，包括小鼠模型和人类患者样本
3933	2025-06-03	Perivascular Niche-Resident Alveolar Macrophages Promote Interstitial Pneumonitis Related to Trastuzumab Deruxtecan Treatment 2025-Jun-02, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2021 PMID:40300097	research paper	该研究揭示了曲妥珠单抗德鲁替康（T-DXd）通过肺泡巨噬细胞引发间质性肺炎的机制，并提出了预防策略	首次发现T-DXd通过肺泡巨噬细胞的Fc-FcγR相互作用触发促间质性肺炎表型转变，并证实血管周围微环境预处理可减轻ADC肺部毒性	研究基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证	阐明抗体药物偶联物T-DXd引发间质性肺病的机制并开发预防策略	曲妥珠单抗德鲁替康（T-DXd）及其诱导的间质性肺病	免疫病理学	间质性肺病/乳腺癌	单细胞RNA测序、活体显微镜成像	免疫活性小鼠模型	基因表达数据/显微成像数据	NA
3934	2025-06-03	Wnt1's Differential Effects on Craniofacial Bone and Tooth Development 2025-Jun-02, Journal of dental research IF:5.7Q1 DOI:10.1177/00220345251336191 PMID:40454459	research paper	该研究探讨了Wnt1信号通路在小鼠颅面骨和牙齿发育中的不同作用	揭示了Wnt1在不同发育阶段对颅面骨和牙齿发育的差异性影响，并发现了其对破骨细胞生成的剂量依赖性抑制作用	研究仅基于小鼠模型，结果可能无法完全适用于人类	探究Wnt1信号通路在颅面骨和牙齿发育中的具体机制	小鼠颅面骨和牙齿	发育生物学	颅面发育异常	单细胞测序、RNA测序、显微CT	转基因小鼠模型	基因表达数据、影像数据	NA
3935	2025-06-03	Lung endothelial cell heterogeneity in health and pulmonary vascular disease 2025-Jun-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology DOI:10.1152/ajplung.00296.2024 PMID:39772753	mini-review	本文探讨了肺内皮细胞（ECs）在健康和肺血管疾病中的异质性，特别关注单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的应用	通过scRNA-seq技术揭示了肺内皮细胞的异质性，发现了新的细胞类型如aerocytes和general capillary ECs，并识别了与肺动脉高压（PH）发病机制相关的多个新途径和机制	NA	探索肺内皮细胞异质性在肺血管疾病中的作用，特别是肺动脉高压（PH）的发病机制	肺内皮细胞（ECs）	生物医学研究	肺动脉高压（PH）	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单核RNA测序、空间转录组学	NA	基因表达数据	NA
3936	2025-06-03	Characterization of the recombination activity in the pituitary and ovary of Prop1-iCre knockin mice 2025-Jun-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism DOI:10.1152/ajpendo.00049.2025 PMID:40327412	研究论文	本研究描述了Prop1-iCre敲入小鼠在垂体内分泌细胞和卵巢颗粒细胞中的重组活性	通过CRISPR/Cas9系统引入IRES-Cre盒，实现了Prop1和Cre重组酶的双顺反子表达，展示了在垂体内分泌细胞和卵巢颗粒细胞中的特异性重组活性	Prop1-iCre小鼠在卵巢颗粒细胞中的重组活性可能会对数据解释造成复杂影响	研究Prop1-iCre敲入小鼠的重组活性，为垂体生物学提供基因操作工具	Prop1-iCre敲入小鼠的垂体内分泌细胞和卵巢颗粒细胞	分子生物学	NA	CRISPR/Cas9系统，单细胞RNA测序分析	NA	基因表达数据	Prop1-iCre小鼠及其与Rosa-tdTomato报告鼠的杂交后代
3937	2025-06-03	Oncostatin-M: a novel leukocyte-derived factor facilitating the ovulatory process in the human ovary 2025-Jun-01, Human reproduction (Oxford, England) DOI:10.1093/humrep/deaf076 PMID:40327872	研究论文	研究探讨了白细胞衍生的Oncostatin-M (OSM)在人类优势卵泡排卵过程中的调控作用	首次揭示了OSM在人类排卵过程中的关键作用，特别是在激活信号通路、调节类固醇生成和前列腺素合成方面的功能	研究使用的是体外培养的人类颗粒/黄体细胞(hGLCs)，可能无法完全模拟体内排卵动态，且结果仅适用于人类样本，需要在其他哺乳动物物种中验证	探索白细胞衍生的OSM是否调控人类优势卵泡的排卵过程	人类优势卵泡和体外培养的人类颗粒/黄体细胞(hGLCs)	生殖生物学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、定量PCR(qPCR)、免疫组化、Western blotting、RNA测序	NA	基因表达数据、蛋白质数据	自然周期女性优势卵泡(n=19)和IVF患者卵泡抽吸物(n=12)
3938	2025-06-03	Dynamics of T Cell-Mediated Immune Signaling Network During Pathogenesis of Chronic Obstructive Pulmonary Disease 2025-Jun, Yonsei medical journal IF:2.6Q1 DOI:10.3349/ymj.2024.0227 PMID:40414827	研究论文	本研究通过RNA测序技术分析了慢性阻塞性肺病（COPD）从轻度到重度阶段的免疫信号网络动态，并探讨了COPD与COVID-19之间的相关性	首次通过单细胞RNA测序揭示了COPD从轻度到重度阶段的免疫反应变化，并发现中度COPD与COVID-19具有相似的生物学模式	样本量相对较小，尤其是重度COPD患者仅3例，可能影响结果的普遍性	识别COPD病情进展的特征标志物，并探索COPD与COVID-19之间的相关性	健康个体（43例）、COPD患者（39例）和COVID-19患者（20例）	生物医学	慢性阻塞性肺病（COPD）和COVID-19	Bulk RNA测序、单细胞RNA测序、单核RNA测序	NA	RNA测序数据	总计119例样本（43健康人+39 COPD+7轻度+7中度+3重度+20 COVID-19）
3939	2025-06-03	Anoikis in hepatocellular carcinoma: genetic alterations and immune microenvironment insights from single-cell and computational analysis 2025-May-31, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02770-2 PMID:40447878	研究论文	本研究通过单细胞测序和计算分析探讨了肝细胞癌中失巢凋亡的遗传变异和免疫微环境特征，并构建了一个基于机器学习的预后模型	利用单细胞测序技术揭示肝细胞癌中失巢凋亡相关基因的细胞异质性，并开发了一个基于101种机器学习算法的预后模型	研究依赖于公开数据库的数据，可能受到样本来源和数量的限制	分析肝细胞癌的细胞异质性并构建失巢凋亡相关的预后模型	肝细胞癌患者和Hep-3B细胞系	数字病理学	肝癌	单细胞测序、qPCR、shRNA介导的基因敲除	机器学习算法（101种）	单细胞测序数据、临床样本数据	来自GEO、TCGA和ICGC数据库的数据集及临床样本
3940	2025-06-03	GSTM1 suppresses cardiac fibrosis post-myocardial infarction through inhibiting lipid peroxidation and ferroptosis 2025-May-31, Military Medical Research IF:16.7Q1 DOI:10.1186/s40779-025-00610-6 PMID:40448227	research paper	该研究探讨了GSTM1在心肌梗死后心脏纤维化中的作用及其机制，发现GSTM1通过抑制脂质过氧化和铁死亡来减轻纤维化	首次揭示了GSTM1通过调节脂质代谢和铁死亡相关通路抑制纤维化的分子机制	研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体中进行验证	探究GSTM1在心肌梗死后心脏纤维化中的作用及其机制	心肌梗死后的小鼠心脏成纤维细胞和人类扩张型心肌病患者的心脏组织	心血管疾病	心血管疾病	蛋白质组学/scRNA-seq、Western blotting、免疫荧光、实时定量PCR、AAV9介导的基因过表达	小鼠冠状动脉结扎模型	蛋白质组学数据、单细胞RNA测序数据、分子生物学实验数据	小鼠模型和人类扩张型心肌病患者的心脏组织