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当前共找到 10572 篇文献,本页显示第 3861 - 3880 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3861 2025-12-05
Combinatorial BMP4 and activin direct the choice between alternate routes to endoderm in a stem cell model of human gastrulation
2025-Dec-01, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本研究结合单细胞转录组学、活细胞成像和数学模型,探索了激活素和骨形态发生蛋白4(BMP4)如何协同或拮抗地引导人类原肠胚形成过程中的命运决定,揭示了内胚层通过直接和间接两条路径产生的机制 揭示了BMP4在诱导中胚层基因的同时促进多能性退出的双重作用,并首次在人类干细胞模型中阐明了信号组合不仅决定细胞最终命运,还影响其发育路径的选择,表明谱系汇聚增强了命运决定的稳健性 研究基于干细胞模型,可能与体内实际发育过程存在差异;未全面探索其他可能参与的信号通路 探究组合信号(激活素和BMP4)如何引导人类原肠胚形成过程中的细胞命运决定 人类干细胞模型中的细胞 发育生物学 NA 单细胞转录组学、活细胞成像、数学建模 NA 转录组数据、成像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3862 2025-12-05
Joint profiling of cell morphology and gene expression during in vitro neurodevelopment
2025-Dec-01, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过联合分析诱导多能干细胞(iPSCs)衍生的皮质神经元在三个发育时间点的细胞形态和基因表达,揭示了形态特征与基因表达之间的关系,并评估了其在神经发育相关疾病模型中的应用潜力 首次在单细胞分辨率上联合使用Cell Painting(CP)和单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术,对iPSC衍生的皮质神经元进行多模态表征,将形态特征与生物学功能关联,并展示了其在捕获疾病遗传性方面的能力 研究主要基于体外iPSC衍生的神经元模型,可能无法完全模拟体内神经发育的复杂性;样本虽大但仅限于特定时间点和细胞类型 探究iPSC衍生的皮质神经元在神经发育过程中的形态与基因表达关系,并评估其作为脑相关复杂性状(如精神分裂症和双相情感障碍)疾病模型的适用性 诱导多能干细胞(iPSCs)衍生的皮质神经元,包括来自Kabuki综合征患者的神经祖细胞 数字病理学 精神分裂症, 双相情感障碍, Kabuki综合征 Cell Painting(CP), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 图像, 基因表达数据 约60,000个iPSC衍生的皮质神经元,覆盖三个发育时间点 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3863 2025-12-05
Light-modulated stem cells in the camera-type eye of an annelid model for adult brain plasticity
2025-Dec-01, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了海洋环节动物Platynereis dumerilii成年眼睛和大脑中的神经源性细胞,探讨了光调节干细胞在相机型眼睛中的作用及其与脑可塑性的关联 首次在无脊椎动物(环节动物)的相机型眼睛中识别出光依赖的神经干细胞,并揭示了其与脊椎动物眼睛发育的相似性,同时展示了环境光通过c-opsin1基因调控干细胞增殖的新机制 研究基于单一物种模型,可能不适用于其他无脊椎动物或脊椎动物;光调节机制的具体分子通路尚未完全阐明;样本量相对有限,可能影响统计普适性 探究无脊椎动物相机型眼睛中干细胞的发育、调控及其与脑可塑性的关系,比较与脊椎动物眼睛进化的异同 海洋环节动物Platynereis dumerilii的成年眼睛和大脑细胞 单细胞生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但基于单细胞RNA测序分析 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3864 2025-12-05
Prognostic and immunological potential of AC012236.1/hsa-miR-30d-5p CeRNA of AVEN by integrated analysis of single-cell and bulk RNA-seq in lung adenocarcinoma
2025-Dec-01, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和bulk RNA-seq分析,探讨了lncRNA-AC012236.1/hsa-miR-30d-5p-AVEN轴在肺腺癌中的预后价值、免疫调控作用及其分子机制 首次在肺腺癌中系统揭示了AVEN通过lncRNA-AC012236.1/hsa-miR-30d-5p轴调控肿瘤进展和免疫微环境的ceRNA机制,并利用单细胞RNA-seq技术明确了其在恶性上皮细胞亚群中的特异性表达 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;临床样本验证规模有限;ceRNA调控网络的实验证据仍需进一步完善 阐明AVEN在肺腺癌中的预后意义、免疫微环境关联及其上游调控机制 肺腺癌组织、TCGA和GEO数据库、A549细胞系 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 生物信息学分析, 体外细胞实验 Cox回归模型, 列线图 RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 临床数据 TCGA和GEO数据库的肺腺癌样本,具体数量未明确说明;临床样本验证;A549细胞系 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3865 2025-12-05
N-phenylquinazolin-4-amine-based EGFR TKIs suppress pulmonary fibrosis by modulating the EGFR/ERBB3 axis in epithelial-macrophage interaction
2025-Dec-01, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究评估了基于N-苯基喹唑啉-4-胺的EGFR酪氨酸激酶抑制剂在小鼠肺纤维化模型中的作用,发现其通过调节肺泡上皮EGFR/ERBB3轴来减轻纤维化 揭示了EGFR/ERBB3信号轴在肺纤维化中通过上皮-巨噬细胞相互作用的关键作用,并证明特定EGFR TKI(如达克替尼)比现有药物(尼达尼布)更有效地抑制炎症因子 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,临床相关性需进一步验证;未详细探讨EGFR TKI的长期安全性和耐药性 评估EGFR TKI作为肺纤维化治疗策略的有效性,并探索EGFR/ERBB3信号在疾病进展中的作用机制 小鼠肺纤维化模型(博来霉素和辐射诱导)、人类肺泡上皮细胞、肺纤维化患者组织样本 NA 肺纤维化 单细胞RNA测序、基因敲低、磷酸化蛋白检测 NA 基因表达数据、蛋白质磷酸化数据、组织样本数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3866 2025-12-05
Mega-scale single-cell profiling reveals novel biomarkers associated with acute GvHD after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2025-Dec-01, Biomarker research IF:9.5Q1
研究论文 本研究通过大规模单细胞RNA测序,揭示了与急性移植物抗宿主病相关的新型生物标志物MDGA1和ADGRG1 首次利用组合条形码大规模单细胞RNA测序技术,在AML患者移植后鉴定出MDGA1和ADGRG1作为与aGvHD相关的互补生物标志物 样本量较小(仅10名AML患者),且仅分析了移植后特定时间点的血液样本 研究与异基因造血干细胞移植后急性移植物抗宿主病相关的生物标志物 AML患者移植后的CD45+白细胞,包括T细胞和NK细胞 单细胞组学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 10名AML患者的移植物样本和移植后第30天及第100天的血液样本,总计超过777,000个CD45+白细胞 NA 单细胞RNA-seq NA 基于组合条形码的大规模单细胞RNA测序
3867 2025-12-05
Bacillus amyloliquefaciens orchestrates cell type-specific responses underlying drought tolerance in Arabidopsis
2025-Dec, The Plant journal : for cell and molecular biology
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了芽孢杆菌Ba13介导的拟南芥叶片细胞类型特异性干旱耐受响应机制 首次在单细胞分辨率下解析PGPR介导的植物干旱耐受机制,发现叶片细胞亚群的功能异质性响应 研究仅针对拟南芥模型植物,田间实际干旱环境的验证尚需进一步研究 探究植物根际促生菌(PGPR)在单细胞水平上增强植物干旱耐受性的分子机制 拟南芥(Arabidopsis thaliana)叶片细胞 植物生物学 非疾病研究(植物胁迫响应) 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 基因共表达网络分析 单细胞转录组数据 未明确样本数量,但涉及接种与未接种Ba13的拟南芥植株在干旱胁迫下的比较 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3868 2025-12-05
Dysregulated B Cell Responses in Severe Fever With Thrombocytopenia Syndrome Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Dec, Journal of medical virology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和BCR谱分析,揭示了严重发热伴血小板减少综合征患者中B细胞功能失调的免疫代谢机制 首次在SFTS患者中整合单细胞RNA测序和BCR谱分析,鉴定出七种转录不同的B细胞亚群,并发现致命病例中CXCR3+Ki-67+CXCR5-卵泡外浆母细胞的扩增与代谢重编程 研究样本可能有限,且机制验证主要在体外进行,需要进一步在体实验确认 探究SFTSV感染导致B细胞功能失调的免疫代谢机制 SFTS患者的周围B细胞 数字病理学 病毒感染相关疾病 单细胞RNA测序,BCR谱分析,代谢流分析 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3869 2025-12-05
The PIK3C3/MAPK14 axis drives M1 polarization via autophagy Inhibition to exacerbate Sepsis-Induced acute lung injury
2025-Nov-29, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究揭示了PIK3C3/MAPK14信号轴通过抑制自噬驱动巨噬细胞M1极化,从而加剧脓毒症诱导的急性肺损伤的机制 首次通过机器学习转录组分析和多组学整合,鉴定出MAPK14是ALI的核心基因,并揭示了PIK3C3与MAPK14之间的高亲和力相互作用及其通过调控自噬影响巨噬细胞极化的新机制 研究主要基于体外实验和计算模拟,缺乏体内动物模型的直接验证,且临床样本量有限 阐明脓毒症诱导的急性肺损伤中巨噬细胞自噬失调的分子机制 巨噬细胞、急性肺损伤组织 机器学习 急性肺损伤 机器学习转录组分析、单细胞测序、多组学整合、分子对接、动力学模拟、Western Blot、RT-qPCR、流式细胞术、ELISA、RNA pull-down 机器学习模型(具体类型未指定) 转录组数据、单细胞测序数据、多组学数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
3870 2025-12-05
Intraductal Papillary Mucinous Neoplasm Cellular Plasticity is Linked with Repeat Element Dysregulation
2025-Nov-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,结合定制重复元件探针,探讨了胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)的组织学亚型、重复元件失调与不同细胞群分子谱之间的关系 首次在IPMN中应用单细胞空间分子成像技术,揭示了从胃型向肠型和胰胆型分支的细胞状态可塑性连续体,并发现重复元件表达与高级别异型增生相关 样本量相对较小(18例患者),且仅针对手术切除的IPMN病变进行分析,可能无法完全代表所有临床情况 探究IPMN组织学亚型、重复元件失调与分子特征之间的关联,以理解其进展机制 胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)的52个病变样本 数字病理学 胰腺癌 空间转录组学,单细胞空间分子成像,重复元件表达分析 NA 空间转录组数据,单细胞成像数据 52个病变样本来自18例患者 NA 空间转录组学,单细胞空间分子成像 GeoMx, CosMx GeoMx用于全转录组空间分析,CosMx用于单细胞空间分子成像,均使用LINE1、HSATII、HERVK和HERVH重复元件探针
3871 2025-12-05
Genetic dissection of microglia cannibalism reveals an IL10 signaling axis controls microglia lifespan
2025-Nov-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过大规模CRISPR筛选揭示了IL10信号轴如何通过调控溶酶体酸化来控制小胶质细胞的寿命和同类相食行为 首次在小胶质细胞中鉴定出IL10信号通路通过溶酶体酸化调控细胞寿命的机制,并提出了坏死性凋亡-同类相食过程作为小胶质细胞更新的质量控制机制 研究主要基于斑马鱼模型,虽然在小鼠中进行了验证,但人类小胶质细胞中的机制仍需进一步探索 探究小胶质细胞在清除细胞碎片后命运调控的遗传机制 斑马鱼和小鼠的小胶质细胞 神经免疫学 NA CRISPR筛选、单细胞RNA测序、机器人共聚焦显微镜 NA 基因表达数据、显微镜图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3872 2025-12-05
CDH3 as a Novel Therapeutic Target in Basal-like Double-Negative Prostate Cancer
2025-Nov-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了CDH3在基底样前列腺癌中的作用,并评估了针对CDH3的抗体药物偶联物和CAR T细胞治疗策略 首次将CDH3识别为基底样前列腺癌的关键标志物和功能驱动因子,并开发了针对CDH3的ADC和CAR T细胞疗法,展示了在临床前模型中的显著疗效 研究主要基于小鼠模型和临床前实验,尚未在人类临床试验中验证,且样本量有限 阐明CDH3在基底样前列腺癌中的作用,并评估CDH3靶向治疗策略的潜力 基底样(双阴性)前列腺癌 癌症研究 前列腺癌 单细胞RNA测序、转录组分析、抗体药物偶联物和CAR T细胞技术 基因工程小鼠模型、异种移植模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据 小鼠前列腺癌模型和人类前列腺癌数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3873 2025-12-05
Multiscale Cell-Cell Interactive Spatial Transcriptomics Analysis
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文提出了一种多尺度细胞-细胞交互空间转录组学分析方法,用于整合基因表达谱与空间位置信息 首次在空间转录组学分析中系统性地整合了多尺度细胞-细胞相互作用,并结合了多尺度拓扑表示与前沿空间深度学习技术 NA 开发一种能够捕捉多尺度细胞-细胞相互作用的空间转录组学分析方法 空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 空间深度学习技术 空间转录组学数据 37个基准空间转录组学数据集 NA 空间转录组学 NA NA
3874 2025-12-05
Adenylate Uridylate- (AU-) Rich Element Gene-Based Prognostic Signature and Molecular Subtypes of Prostate Adenocarcinoma: Implications for Prognosis and Immune Microenvironment
2025-Nov, Archivos espanoles de urologia IF:0.6Q4
研究论文 本研究基于腺苷酸尿苷酸富集元件基因构建了一个前列腺腺癌的预后特征和分子亚型,用于预测预后和反映免疫微环境特征 首次利用AREGs基因(ACSM3、ACTG2、DES)构建前列腺腺癌的预后模型,并关联免疫微环境分析 研究主要基于公共数据集和生物信息学分析,实验验证仅限于qRT-PCR,缺乏更深入的体内外功能验证 开发前列腺腺癌的预后预测模型并探索其与免疫微环境的关系 前列腺腺癌患者 生物信息学 前列腺癌 加权基因共表达网络分析、Cox回归、LASSO正则化、CIBERSORT免疫浸润分析、单细胞转录组学、qRT-PCR 预后风险模型 基因表达数据 基于公共PRAD数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞转录组学 NA NA
3875 2025-12-05
Acellular Tissue Engineered Vessels as Coronary Artery Bypass Grafts
2025-Oct, JACC. Basic to translational science
研究论文 本研究评估了一种小直径脱细胞组织工程血管作为冠状动脉旁路移植术替代移植物的可行性和耐久性 首次在灵长类动物模型中评估小直径脱细胞组织工程血管作为冠状动脉旁路移植术替代移植物的长期性能,并利用空间转录组学揭示了宿主细胞浸润对血管重塑的调控机制 研究样本量较小(n=5),仅评估了6个月的短期效果,未与传统自体血管进行直接比较 开发冠状动脉旁路移植术的替代血管移植物 成年狒狒的冠状动脉系统 组织工程 心血管疾病 空间转录组学,计算机断层扫描血管造影 NA 影像数据,基因表达数据,组织学数据 5只成年狒狒 NA NA NA NA
3876 2025-12-05
Direct oHSV Infection Induces DC Maturation and a Tumor Therapeutic Response
2025-Aug-19, Viruses
研究论文 本文探讨了溶瘤性单纯疱疹病毒直接感染树突状细胞如何促进其成熟并增强抗肿瘤免疫反应 揭示了oHSV直接感染DC而非仅通过肿瘤细胞感染来激活抗肿瘤免疫的新机制,为癌症免疫治疗提供了新视角 研究主要基于体外实验和小鼠模型,尚未在人体中进行验证,且oHSV感染DC为流产性感染,其长期效果和安全性需进一步评估 探究溶瘤性单纯疱疹病毒通过直接感染树突状细胞增强抗肿瘤免疫治疗的机制 溶瘤性单纯疱疹病毒、树突状细胞、CT-2A胶质瘤细胞、T细胞 免疫治疗 胶质瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3877 2025-12-05
Identification of Novel Lactylation-Related Biomarkers for COPD Diagnosis Through Machine Learning and Experimental Validation
2025-Aug-18, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过机器学习筛选和实验验证,鉴定出CBR1和PRDX1作为与乳酸化相关的慢性阻塞性肺疾病诊断生物标志物 首次将乳酸化修饰与COPD诊断生物标志物发现相结合,并采用多算法集成筛选与单细胞转录组学分析进行验证 研究主要基于公共数据集和体外CSE诱导模型,需要在更大临床队列和体内模型中进一步验证 鉴定COPD中临床相关的乳酸化相关生物标志物并探究其在疾病发病机制中的潜在作用 慢性阻塞性肺疾病患者基因表达数据、香烟烟雾提取物诱导的COPD细胞模型 机器学习 慢性阻塞性肺疾病 转录组学分析、单细胞RNA测序、qRT-PCR、免疫荧光 LASSO回归、支持向量机递归特征消除、加权基因共表达网络分析 基因表达数据、单细胞转录组数据 来自GSE21359和GSE76925数据集的COPD患者样本,以及GSE173896单细胞数据集 NA 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq NA NA
3878 2025-12-05
Linear structure unfolding : application to mouse brain in spatial transcriptomics
2025-Jul, Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. IEEE Engineering in Medicine and Biology Society. Annual International Conference
研究论文 本文提出了一种用于空间转录组学中分析细长弯曲形状或点云的方法,通过展开线性结构来研究细胞或转录本类型沿主轴的分布 结合k-means聚类和旅行商问题优化自动计算形状的中心线,实现沿中心线或垂直方向的细胞或转录本空间分布分析 NA 解决空间转录组学中特定形状区域(如细长弯曲结构)的计算分析问题 小鼠大脑组织中的细胞或RNA分子点云 空间转录组学 NA 空间转录组学 k-means聚类,旅行商问题优化 图像,点云数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
3879 2025-12-05
Single-cell resolution uncovers neighboring cell subtypes that share steroidogenic capacity during fetal testis development
2025-Jun-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞技术揭示了小鼠胎儿睾丸发育过程中类固醇生成细胞(如胎儿Leydig细胞)的异质性及其在雄激素生产中的协同作用 通过单分子荧光原位杂交和单细胞RNA测序,首次发现胎儿Leydig细胞在类固醇生成基因表达上存在不同步性和不完整性,并揭示了邻近细胞类型间的合作机制 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类或其他物种;且主要关注胎儿发育阶段,成年期变化未探讨 探究胎儿睾丸发育过程中单个及集体类固醇生成细胞对雄激素生产的贡献 小鼠胎儿睾丸中的类固醇生成细胞(包括胎儿Leydig细胞和其他间质细胞类型) 数字病理学 NA 单分子荧光原位杂交, 单细胞RNA测序 NA 图像, 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3880 2025-12-05
Unified integration of spatial transcriptomics across platforms
2025-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为Lloki的新框架,用于整合不同平台的空间转录组学数据,无需共享基因面板 Lloki通过特征对齐和批次对齐任务,利用最优传输引导的特征传播和scGPT单细胞基础模型,实现了跨平台ST数据的统一集成,克服了基因面板差异、数据稀疏性和技术变异性等挑战 NA 开发一个跨平台空间转录组学数据整合框架,以促进组织结构和细胞相互作用的深入理解 小鼠脑样本和卵巢癌数据集 空间转录组学 卵巢癌 空间转录组学,单细胞RNA测序 scGPT 空间转录组学数据,单细胞RNA测序数据 小鼠脑样本来自五种不同技术,以及五个卵巢癌数据集 NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
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