单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7551 篇文献，本页显示第 3841 - 3860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3841 | 2025-06-06 |
Recent Advances in Stem Cells of Corneal Epithelia
2025-May-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.5.45
PMID:40440164
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综述 | 本文综述了角膜上皮干细胞（CESCs）的最新研究进展，包括其位置、群体维持机制和异质性 | 通过角膜上皮谱系追踪、活体成像和单细胞RNA测序等新技术，揭示了CESCs的意外特性 | 讨论了当前研究的局限性，并指出CESCs领域亟待解决的关键问题 | 深入理解CESCs的特性以推动角膜疾病的再生医学治疗 | 角膜上皮干细胞（CESCs） | 再生医学 | 角膜疾病 | 谱系追踪、活体成像、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 3842 | 2025-06-06 |
Multi-Omic Insight Into the Molecular Networks in the Pathogenesis of Coronary Artery Disease
2025-Apr, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.037203
PMID:40135555
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研究论文 | 通过整合多组学数据，研究冠状动脉疾病（CAD）的分子网络机制 | 利用基于摘要数据的孟德尔随机化和共定位分析整合多组学数据，揭示了TAGLN2、APOB、GIP等基因与CAD风险的关联 | 未提及具体样本量，且部分潜在因果/风险基因仍未被识别 | 探索冠状动脉疾病的分子机制和潜在因果基因 | 冠状动脉疾病（CAD）患者 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 基因甲基化、表达和蛋白质水平的整合分析，单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化和共定位分析 | 多组学数据（基因甲基化、表达、蛋白质水平） | NA |
| 3843 | 2025-06-06 |
BubR1 Controls Heart Development by Promoting Expression of Cardiogenesis Regulators
2025-Mar-18, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.038286
PMID:40055864
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研究论文 | 该研究揭示了BubR1在心脏发育中的关键作用，通过促进心脏生成调节因子的表达来确保心脏形态发生的正确时机 | 首次揭示了BubR1通过调控关键心脏生成基因的表达和Wnt信号通路来影响心脏发育的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类心脏发育的差异可能影响结果的普适性 | 探究BubR1基因突变导致先天性心脏缺陷的分子机制 | 小鼠胚胎心脏发育过程 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序、轨迹分析、CellChat分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，使用条件性Bub1b敲除小鼠胚胎 |
| 3844 | 2025-06-06 |
Pharmacological activation of STAT1-GSDME pyroptotic circuitry reinforces epigenetic immunotherapy for hepatocellular carcinoma
2025-Mar-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332281
PMID:39486886
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研究论文 | 本研究通过药理学激活STAT1-GSDME焦亡回路，增强表观遗传免疫疗法对肝细胞癌的治疗效果 | 揭示了选择性HDAC抑制剂CXD101与ICB联合治疗通过STAT1-GSDME焦亡回路增强抗肿瘤免疫的新机制 | 研究主要基于临床前模型，临床转化效果需进一步验证 | 开发针对肝细胞癌免疫检查点阻断(ICB)耐药的新型联合治疗策略 | 肝细胞癌(HCC)患者和ICB耐药模型 | 肿瘤免疫治疗 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、单细胞多组学分析、染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq) | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | 来自pembrolizumab临床试验(NCT03419481)的HCC患者样本和4种ICB耐药模型 |
| 3845 | 2025-06-06 |
Deep learning in single-cell and spatial transcriptomics data analysis: advances and challenges from a data science perspective
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf136
PMID:40185158
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review | 本文综述了深度学习在单细胞和空间转录组数据分析中的进展与挑战，从数据科学的角度进行了系统分析 | 系统地评估了58种计算方法在21个数据集上的性能，揭示了模型性能在不同基准数据集和评估指标间的显著差异，并提出了未来发展的三个关键方向 | 高质量标注数据集仍然有限，且生物组织的复杂相关性使得准确重建细胞状态和空间环境具有挑战性 | 探讨深度学习在单细胞和空间转录组数据分析中的应用及其面临的挑战 | 单细胞和空间转录组数据 | machine learning | NA | 单细胞测序、空间转录组 | 深度学习 | 基因表达、表观遗传修饰、代谢物水平、空间位置等多模态数据 | 21个数据集来自9个基准测试 |
| 3846 | 2025-06-06 |
When is prostate cancer really cancer?
2025-Mar-01, Journal of the National Cancer Institute
DOI:10.1093/jnci/djae200
PMID:39350309
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research paper | 探讨前列腺癌（尤其是Grade Group 1）是否应被标记为'癌症'，基于其惰性特征及现代诊断路径的调整 | 提出重新定义GG1前列腺癌的标签，基于其无转移能力及在现代诊断中的'偶然发现'性质，并探讨了空间转录组学对癌症定义的挑战 | 未明确说明研究样本量及具体研究方法，更多是基于讨论和现有研究的总结 | 减少前列腺癌死亡率，同时最小化过度诊断和过度治疗带来的危害 | Grade Group 1前列腺癌及其诊断标签 | NA | prostate cancer | 空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 3847 | 2025-06-06 |
JARID1D-dependent androgen receptor and JunD signaling activation of osteoclast differentiation inhibits prostate cancer bone metastasis through demethylating H3K4
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.104135
PMID:39816691
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research paper | 该研究揭示了JARID1D通过去甲基化H3K4调控雄激素受体和JunD信号通路，抑制前列腺癌骨转移的机制 | 首次发现JARID1D通过H3K4me3去甲基化活性动态调控AR表达，并揭示其通过MAOA-RANKL通路影响破骨细胞分化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探究前列腺癌骨转移的表观遗传调控机制 | 前列腺癌细胞和骨转移过程 | 肿瘤生物学 | 前列腺癌 | ChIP, 免疫荧光, western blotting, 单细胞测序 | 小鼠模型 | 分子生物学数据 | NA |
| 3848 | 2025-06-06 |
Study on DNA Damage Gene in Spermatogonial Stem Cells from Idiopathic Nonobstructive Azoospermia: A Bioinformatics Investigation Based on scRNA-seq Data
2025, Cytogenetic and genome research
IF:1.7Q3
DOI:10.1159/000545275
PMID:40101697
|
研究论文 | 基于scRNA-seq数据，研究特发性非梗阻性无精子症中精原干细胞DNA损伤基因的生物信息学分析 | 揭示了睾丸微环境和DNA损伤在调控人类精原干细胞中的可预测机制，并提出了男性不育的潜在治疗靶点 | 需要进一步研究以确认预测的潜在机制、通路和治疗靶点 | 探究DNA损伤与男性不育之间的关系，特别是精原干细胞的基因组稳定性机制 | 特发性非梗阻性无精子症（NOA）和正常睾丸的精原干细胞 | 生物信息学 | 男性不育 | scRNA-seq, WGCNA分析, LASSO回归, MNC计算算法 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 特发性非梗阻性无精子症和正常睾丸的scRNA-seq数据集 |
| 3849 | 2025-06-06 |
Bulk and single-cell RNA-sequencing analyses revealed potential key genes and the role of CCL19/CCL21-CCR7 axis in hidradenitis suppurativa
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0322565
PMID:40455785
|
研究论文 | 通过批量RNA测序和单细胞RNA测序分析，揭示了化脓性汗腺炎(HS)中潜在的关键基因及CCL19/CCL21-CCR7轴的作用 | 整合三种机器学习方法并验证独立数据集，成功鉴定出AKR1B10、IGFL2、WNK2、SLAMF7和CCR7作为HS治疗的潜在枢纽基因和治疗靶点 | NA | 识别HS病变和周围血中的关键基因表达模式、枢纽基因，并分析CCL19/CCL21-CCR7轴的潜在作用 | 化脓性汗腺炎(HS)病变和周围血 | 生物信息学 | 化脓性汗腺炎 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习 | RNA测序数据 | NA |
| 3850 | 2025-06-06 |
Targeting myeloid cells in pancreatic ductal adenocarcinoma: from primary tumors to liver metastasis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1555036
PMID:40458409
|
综述 | 本文探讨了胰腺导管腺癌（PDAC）中原发肿瘤和肝转移中髓系细胞的靶向治疗策略 | 重点分析了PDAC不同阶段（原发肿瘤、转移前微环境和转移部位）的免疫抑制机制，并探讨了靶向髓系细胞的创新治疗策略 | 临床数据主要来自晚期疾病患者，与临床前研究主要关注原发肿瘤的情况存在差异 | 研究PDAC中髓系细胞在肿瘤微环境中的作用及靶向治疗策略 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的原发肿瘤和肝转移 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 3851 | 2025-06-06 |
CX3CR1+ Monocytes/Macrophages Promote Regional Immune Injury in Mesangial Proliferative Glomerulonephritis through Crosstalk with Activated Mesangial Cells
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0716
PMID:40458609
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研究论文 | 本研究探讨了CX3CR1+单核细胞/巨噬细胞通过与激活的系膜细胞相互作用促进系膜增生性肾小球肾炎（MsPGN）区域免疫损伤的机制 | 揭示了CX3CL1-CX3CR1轴作为MsPGN治疗新靶点的证据，并验证了CX3CL1单克隆抗体quetmolimab的治疗效果 | 研究主要基于动物模型和临床标本，尚未进行大规模临床试验 | 探究MsPGN区域免疫损伤的机制并寻找潜在治疗靶点 | 系膜增生性肾小球肾炎（MsPGN）患者和动物模型 | 免疫学 | 肾小球肾炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、细胞通讯分析（cellchat analysis）、RNA-seq、Luminex多重免疫分析 | 动物模型 | 基因表达数据、蛋白质数据 | 临床标本和MsPGN动物模型 |
| 3852 | 2025-06-06 |
CD151 Promotes Cancer Progression in Triple-Negative Breast Cancer by Inducing EMT through the MAPK Signaling Pathway
2025, Breast cancer (Dove Medical Press)
DOI:10.2147/BCTT.S518760
PMID:40458675
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研究论文 | 本研究探讨了CD151在三阴性乳腺癌（TNBC）中通过MAPK信号通路诱导上皮间质转化（EMT）从而促进癌症进展的机制 | 揭示了CD151通过与整合素α3β1结合激活MAPK信号通路进而诱导EMT的新机制 | 研究主要基于体外实验和临床样本分析，缺乏体内动物模型的验证 | 阐明CD151在TNBC中的促肿瘤作用及其分子机制 | TNBC临床样本和细胞系 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 免疫组织化学、Western blotting、RNA干扰、单细胞RNA测序、免疫共沉淀 | NA | 蛋白质表达数据、基因表达数据 | TNBC临床样本和细胞系（具体数量未明确说明） |
| 3853 | 2025-06-06 |
Cellular Heterogeneity and IL-17 Pathway Dynamics Reveal Insights into the Transition from Ulcerative Colitis to Colorectal Cancer Through scRNA-Seq Analysis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S505313
PMID:40458692
|
research paper | 通过单细胞RNA测序分析揭示了从溃疡性结肠炎到结直肠癌转变过程中的细胞异质性和IL-17通路动态 | 揭示了IL-17信号通路、Treg细胞扩增和C-MYC激活在疾病进展中的潜在作用 | 样本量较小，仅包括一名患者的组织样本 | 研究溃疡性结肠炎（UC）向结直肠癌（CACRC）转变过程中的分子和细胞变化 | UC和CACRC患者的组织样本 | digital pathology | colorectal cancer | scRNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 一名患者的正常结肠、UC病变组织和CACRC组织样本 |
| 3854 | 2025-06-06 |
[Donor T cell exhaustion and immune tolerance after allogeneic hematopoietic cell transplantation]
2025, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology
DOI:10.11406/rinketsu.66.339
PMID:40467463
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研究论文 | 本文探讨了同种异体造血细胞移植后供体T细胞耗竭与免疫耐受的机制 | 通过单细胞RNA测序发现钙调磷酸酶抑制剂（CNIs）抑制供体T细胞耗竭，同时诱导效应样耗竭T细胞，这些细胞在慢性GVHD发展中起关键作用 | 目前主要基于小鼠HCT模型，患者样本数据仍在积累和分析中 | 研究同种异体造血细胞移植后慢性GVHD的预防机制 | 供体T细胞 | 免疫学 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠HCT模型 | RNA测序数据 | 小鼠模型数据，患者样本数据正在积累 |
| 3855 | 2025-06-05 |
Cross-disease integration of single-cell RNA sequencing data from lung myeloid cells reveals TAM signature in in vitro model
2025-Dec, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2025.2502278
PMID:40448976
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序技术，整合跨疾病的肺髓系细胞数据，揭示了体外模型中肿瘤相关巨噬细胞（TAM）的特征 | 研究验证了3D人类细胞培养模型作为更接近体内环境的模型，可用于临床前测试靶向巨噬细胞的新药 | 研究受限于缺乏已验证的人类临床前模型 | 探索肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）在癌症治疗中的潜在作用 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAMs） | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 3D人类细胞培养模型 | RNA测序数据 | NA |
| 3856 | 2025-06-05 |
RETRACTED: Deciphering the prognostic landscape of osteosarcoma: Integrating the roles of hippo pathway genes, programmed cell death, and the tumor immune microenvironment
2025-Jul, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24280
PMID:38622820
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研究论文 | 本研究通过分析Hippo信号通路与肿瘤免疫微环境(TME)的相互作用，探讨了骨肉瘤的分子基础及其预后标志物 | 鉴定了131个与Hippo通路相关的基因，并从中筛选出8个关键基因(DLG5、WNT11等)与患者预后显著相关，揭示了免疫逃避模式与不良预后的关联 | 研究基于公共数据集(TARGET-OS和GTEx)，可能需要更多独立样本验证 | 探索骨肉瘤的分子机制及预后标志物 | 骨肉瘤患者样本及其转录组数据 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 转录组数据分析、单细胞测序 | Cox回归分析、Kaplan-Meier生存分析 | 转录组数据 | TARGET-OS数据集和GTEx对照样本 |
| 3857 | 2025-06-05 |
RETRACTED: Single-cell transcriptome sequencing analysis reveals intra-tumor heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Jul, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24243
PMID:38572681
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析揭示食管鳞状细胞癌的肿瘤内异质性 | 利用单细胞转录组测序技术深入探索食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境机制，并成功构建预后风险模型和筛选关键基因UPF3A | 样本量相对较小，仅包括60个肿瘤样本和4个癌旁样本 | 研究食管鳞状细胞癌的致癌机制和潜在关键分子事件 | 食管鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞转录组测序 | LASSO分析 | 单细胞RNA测序数据 | 60个肿瘤样本和4个癌旁样本 |
| 3858 | 2025-06-05 |
RETRACTED: Prediction of potential targets and toxicological insights of Astragalus in liver cancer based on network pharmacology: Integrating systems biology, drug interaction networks, and toxicological perspectives
2025-Jul, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24189
PMID:38476113
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研究论文 | 本研究利用网络药理学探讨黄芪作为原发性肝癌新型治疗选择的潜力，揭示其分子和细胞机制 | 整合系统生物学、药物相互作用网络和毒理学视角，首次在单细胞分辨率下分析黄芪对肝癌的基因表达影响 | 研究结果需要进一步的体内实验验证 | 探索黄芪作为原发性肝癌治疗药物的潜在靶点和作用机制 | 黄芪及其活性成分对原发性肝癌细胞的影响 | 网络药理学 | 肝癌 | scRNA-seq, UMAP, tSNE, 基因本体分析, KEGG通路分析, 基因集变异分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 处理组与对照组各20个基因表达变化, 15个独特的细胞簇, 9个MT1相关细胞亚群, 5个通过SingleR包指定的细胞亚群 |
| 3859 | 2025-06-05 |
Understanding psoriatic disease at single-cell resolution: an update
2025-Jul-01, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000001085
PMID:40160177
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综述 | 本文综述了单细胞技术在银屑病研究中的最新进展，包括单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学，揭示了银屑病的细胞多样性及其在疾病进展中的关键作用 | 利用单细胞技术和空间转录组学揭示了银屑病中免疫细胞、角质形成细胞和成纤维细胞亚型的作用，以及代谢失调在慢性炎症中的关键性 | NA | 探讨单细胞技术在银屑病研究中的应用及其对精准治疗的潜在影响 | 银屑病中的免疫细胞、角质形成细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3860 | 2025-06-05 |
RETRACTION: Single-Cell Transcriptome Sequencing Analysis Reveals Intra-Tumor Heterogeneity in Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2025-Jul, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24542
PMID:40358431
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撤稿声明 | 该文章因提交和同行评审过程存在问题，且作者未回应验证肿瘤样本和细胞系来源的要求而被撤稿 | NA | 提交和同行评审过程被破坏，且作者未验证样本来源 | NA | NA | NA | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞转录组测序 | NA | NA | NA |