单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202501-202512] [清除筛选条件]
当前共找到 10572 篇文献,本页显示第 3801 - 3820 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3801 2025-12-07
Endothelial cells as early therapeutic targets in chronic obstructive pulmonary disease: Insights into Tongxinluo's multiple protective mechanisms against cigarette smoke-induced lung injury
2025-Dec, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了内皮细胞作为慢性阻塞性肺疾病早期治疗靶点的潜力,并探讨了中药通心络胶囊通过Apelin/APJ/p38MAPK通路减轻香烟烟雾诱导的肺损伤的多重保护机制 首次将内皮细胞作为COPD早期治疗靶点进行研究,结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了通心络胶囊通过Apelin/APJ/p38MAPK通路促进内皮细胞增殖和内皮介导的上皮再生的新机制 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证,且通心络胶囊的具体活性成分和作用靶点需进一步明确 评估内皮细胞作为COPD早期治疗靶点的潜力,并探究中药通心络胶囊的干预效果 香烟烟雾暴露的小鼠模型,以及体外培养的内皮细胞和上皮细胞 数字病理学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据,空间分布数据 香烟烟雾暴露2、4、6、12和24周的小鼠,其中12周时进行单细胞RNA测序和空间测序 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
3802 2025-12-07
Single-Cell Transcriptomics Unravels Growth Factor Erv1-Like Mediated Ferroptosis as a Key Driver of Intestinal Epithelial Dysfunction in Ulcerative Colitis
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究利用单细胞转录组学揭示了生长因子Erv1样蛋白(GFER)通过调节铁死亡在溃疡性结肠炎肠道上皮功能障碍中的关键作用 首次证明GFER在UC中调节铁死亡的关键作用,并发现其通过与PCBP1相互作用维持铁稳态,以及通过激活PGC-1α/PPARγ通路减少脂质过氧化 NA 阐明溃疡性结肠炎中肠道上皮功能障碍的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 溃疡性结肠炎患者的肠道上皮细胞、DSS诱导的结肠炎小鼠模型、LPS诱导的体外肠道上皮细胞炎症模型 数字病理学 溃疡性结肠炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3803 2025-12-07
Targeted NAT10 Degradation by PROTAC NP1192 Suppresses Hypoxia-Adaptive Glycolysis and Reinvigorates CD8+ Effector T‑Cell Function for Synergistic Cancer Immunotherapy
2025-Nov-26, ACS central science IF:12.7Q1
研究论文 本研究开发了一种名为NP1192的PROTAC降解剂,靶向降解NAT10蛋白,通过抑制缺氧适应性糖酵解和增强CD8+效应T细胞功能,从而协同增强癌症免疫治疗效果 首次开发了靶向NAT10的PROTAC降解剂NP1192,证明了其通过双重代谢-免疫调节策略(抑制缺氧糖酵解和增强T细胞功能)来克服免疫检查点阻断疗法耐药性的新机制 研究主要在宫颈癌细胞系、肿瘤类器官和异种移植模型中进行,尚未在更广泛的癌症类型或人体临床试验中得到验证 开发一种新的治疗策略,以克服肿瘤对免疫检查点阻断疗法的耐药性,并增强癌症免疫治疗的效果 NAT10蛋白、缺氧肿瘤微环境、CD8+ T细胞、宫颈癌细胞、肿瘤类器官、小鼠异种移植模型 癌症免疫治疗 宫颈癌 PROTAC技术、单细胞RNA测序、共培养实验、异种移植模型 NA 基因表达数据、蛋白质降解数据、代谢物测量数据、细胞功能数据 三种肿瘤类器官、小鼠异种移植模型、宫颈癌细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3804 2025-12-07
Bisphenol S disrupts human sertoli cell function through NR1H3 degradation: Mechanistic insights from integrated bulk and single-cell transcriptomics
2025-Nov-15, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 本研究揭示了双酚S通过靶向降解NR1H3蛋白损害人类支持细胞功能,从而可能导致男性不育的分子机制 首次结合批量与单细胞转录组学,并通过计算模拟与实验验证,确定了NR1H3是双酚S在人类支持细胞中的直接作用靶点 研究主要基于体外永生化细胞模型,体内生理环境下的效应仍需进一步验证 探究环境污染物双酚S损害人类支持细胞功能并导致男性不育的分子机制 永生化人类支持细胞及非梗阻性无精子症睾丸组织 生物信息学 男性不育症 RNA测序,单细胞转录组测序,分子对接,分子动力学模拟,MM/GBSA结合自由能计算 NA 转录组数据,蛋白质数据 NA NA 批量RNA测序,单细胞RNA测序 NA NA
3805 2025-12-07
Therapeutic Potential of CLDN Family Proteins in Ovarian Cancer: Emerging Biomarkers and Targets
2025-Nov-11, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
研究论文 本研究通过生物信息学分析、单细胞RNA测序和功能实验,系统评估了CLDN家族成员(特别是CLDN6、CLDN9和CLDN10)在卵巢癌中的表达、预后价值及治疗潜力 首次综合多组学数据(包括单细胞RNA测序)和功能实验,明确CLDN6、CLDN9和CLDN10作为卵巢癌的新型诊断和预后生物标志物组合,并揭示CLDN6通过Wnt/β-catenin通路调控肿瘤恶性表型的关键作用 CLDN10在肿瘤细胞中高表达但其风险比小于1的机制尚不明确,且研究主要基于公共数据库和体外/体内实验,需要更多临床样本和前瞻性研究进一步验证 识别卵巢癌的新型诊断和预后生物标志物及潜在治疗靶点 CLDN家族基因(特别是CLDN6、CLDN9和CLDN10)在卵巢癌中的表达、功能及临床意义 生物信息学与癌症研究 卵巢癌 生物信息学分析、单细胞RNA测序、免疫组化、Western blot、siRNA敲低、细胞功能实验(如Transwell侵袭、伤口愈合、线粒体去极化、ROS积累、细胞周期和凋亡检测)、裸鼠体内实验 逻辑回归模型、随机效应模型、ROC曲线分析 基因表达谱、临床数据、单细胞RNA测序数据、组织微阵列图像、蛋白质印迹数据 TCGA-OV队列、两个GEO数据集(GSE18520、GSE26712)、独立组织微阵列、卵巢癌细胞系、裸鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3806 2025-12-07
ST-GCP: a graph convolutional network model with contrastive consistency and permutation for spatial transcriptomics
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为ST-GCP的自监督图表示学习框架,用于空间转录组数据,通过结合结构-特征扰动机制来提升聚类效果 ST-GCP引入了特征级随机置换和空间邻接网络中的随机边丢弃,创建两个互补的增强图视图,并利用对比一致性目标对齐视图特定表示,从而在低维空间中耦合图拓扑与转录组谱 NA 开发一种自监督图表示学习框架,以更好地利用空间转录组数据中的空间信息,提升聚类和模式发现能力 空间转录组数据 空间转录组学 NA 空间转录组技术 图卷积网络 基因表达矩阵和空间邻接网络 NA NA 空间转录组学 NA NA
3807 2025-12-07
Modeling gut inflammation using intestinal organoids: Advances, challenges, and future perspectives
2025-Sep, Best practice & research. Clinical gastroenterology
综述 本文综述了利用肠道类器官模拟肠道炎症的进展、挑战与未来展望 整合了基因编辑、单细胞与空间转录组学以及类器官芯片等微工程平台,以推进类器官在炎症建模中的应用 在实现长期免疫共培养、培养基兼容性以及标准化检测方面仍面临挑战 利用肠道类器官模拟肠道炎症,以指导转化研究 肠道类器官 NA 炎症性肠病 基因编辑技术、单细胞转录组学、空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA NA
3808 2025-12-07
Single-cell sequencing in molecular diagnostics: Transformative yet untapped potential
2025, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
综述 本文综述了单细胞测序技术在分子诊断领域的潜力、当前应用、整合挑战及其在肿瘤学、遗传学与罕见病、传染病和自身免疫性疾病等多个临床领域的发展前景 系统性地阐述了单细胞测序技术从研究工具向临床诊断转化的未开发潜力,并强调了其在解析细胞异质性、发现新生物标志物和理解复杂疾病通路方面的独特价值 文章指出单细胞测序技术在临床应用中面临数据分析、标准化和常规化整合的挑战,其全面临床转化仍需克服技术瓶颈 探讨单细胞测序技术在改善临床分子诊断方面的潜力,并分析其在多个疾病领域的应用前景与挑战 单细胞测序技术及其在临床诊断中的应用 数字病理学 肿瘤学,遗传与罕见病,传染病,自身免疫性疾病 单细胞测序 NA 单细胞遗传与转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3809 2025-12-07
Identification of Mitochondrial Unfolded Protein Response-Related Genes and Diagnostic Biomarkers in Atherosclerosis by Integrative Multidimensional Analysis and Experimental Validation
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过整合多维分析结合实验验证,识别了与动脉粥样硬化相关的线粒体未折叠蛋白反应基因及其诊断生物标志物 首次整合多维数据集、机器学习算法、单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,系统性探索UPRmt与动脉粥样硬化的关联,并识别出七个关键枢纽基因 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,样本量相对有限(101例AS和67例对照),且实验验证部分仅针对部分基因 阐明线粒体未折叠蛋白反应与动脉粥样硬化的关系,并寻找相关的诊断生物标志物和治疗靶点 动脉粥样硬化患者样本(来自GEO数据库)及相关基因表达数据 生物信息学 心血管疾病 微阵列、单细胞RNA-seq、RT-qPCR、Western blot、免疫荧光、分子模拟 12种机器学习算法(具体算法未指明)、CellChat算法 基因表达数据(微阵列和单细胞RNA-seq数据) 168个样本(101个动脉粥样硬化样本和67个对照样本) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3810 2025-12-07
Mendelian randomization integrated with multi-omics analysis identifies TNIK as a key gene in gut microbiota-induced IBD development
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合孟德尔随机化与多组学分析,识别出TNIK作为肠道菌群诱导IBD发展的关键基因 首次结合孟德尔随机化、批量RNA-seq差异表达基因、机器学习模型和单细胞RNA-seq,系统性地识别并验证了TNIK在肠道菌群与IBD相互作用中的因果角色 研究主要基于观察性数据和动物模型,人类样本中的直接因果验证有限,且单细胞数据来源单一队列 识别肠道菌群相关的IBD因果基因,并确定介导菌群-宿主互作的关键靶点和细胞类型 肠道菌群、溃疡性结肠炎(UC)、克罗恩病(CD)的GWAS数据,人类结肠组织RNA-seq数据,IL-10-/- IBD小鼠模型 生物信息学 炎症性肠病 GWAS, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组织化学染色 机器学习模型(嵌套交叉验证) 基因组数据, 转录组数据, 单细胞转录组数据, 图像数据 GWAS数据集、两个人类结肠RNA-seq数据集(GSE87473, GSE75214)、一个单细胞RNA-seq数据集(GSE116222)、IL-10-/-小鼠模型 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
3811 2025-12-07
A Machine Learning-Derived Taurine Metabolism Signature Predicts Prognosis and Immune Landscape in Lung Adenocarcinoma via Integrative Single-Cell Analysis
2025, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合批量组织和单细胞转录组数据,构建了一个基于牛磺酸代谢相关基因的预后模型(TRS),并探讨了其在肺腺癌中的功能 首次构建了基于牛磺酸代谢相关基因的预后模型(TRS),并通过整合单细胞RNA-seq数据揭示了其与肿瘤微环境及免疫逃逸的关联,同时实验验证了关键基因KIF2C的促癌功能 研究主要基于回顾性转录组数据,需要更多前瞻性临床队列验证;体外功能实验未能完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 阐明牛磺酸代谢相关通路在肺腺癌中的作用机制,并评估其与临床预后的相关性 肺腺癌(LUAD)患者样本及细胞系 机器学习 肺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq LASSO回归, 逐步Cox模型, SuperPC算法 转录组数据, 临床数据 TCGA数据库及GEO中五个LUAD数据集(具体样本数未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3812 2025-12-07
Machine learning integration identifying an eight-gene diagnostic signature for acute mountain sickness
2025, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,利用机器学习方法识别并验证了一个包含八个基因的血液生物标志物签名,用于急性高原病的诊断 首次结合单细胞和批量转录组数据,通过机器学习筛选出八个基因的签名,为急性高原病提供了可靠的生物标志物诊断模型 样本量相对有限,外部验证队列规模较小,且诊断模型在资源有限人群中的实际应用效果需进一步验证 建立急性高原病的诊断模型,以弥补当前依赖自报告问卷诊断的不足 急性高原病患者和对照组的血液样本 机器学习 急性高原病 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 定量PCR, 表观遗传分析, KEGG通路富集分析 Stepglm[both] + NaiveBayes RNA测序数据, 基因表达数据 单细胞RNA测序10例, 批量RNA测序192例, 训练队列160例, 外部验证队列GSE103940 22例和GSE75665 10例 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
3813 2025-12-06
Characteristics of cadmium's impact on lung cancer burden and its toxicological mechanisms
2025-Dec-05, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究分析了镉对全球肺癌负担的影响特征及其毒理学机制 结合NHANES和GBD数据库分析镉与肺癌预后的关联及全球负担趋势,并利用网络毒理学和单细胞测序识别关键靶基因Bcl-2 研究基于观察性数据,可能存在未测量的混杂因素,且未来负担预测依赖于模型假设 评估镉暴露对肺癌负担的全球分布、趋势及毒理学机制,为公共卫生干预提供依据 肺癌患者及全球人群镉暴露数据 公共卫生与毒理学 肺癌 网络毒理学、单细胞测序、Kaplan-Meier分析、Cox回归、限制性立方样条曲线 Cox回归模型、Nordpred预测模型 流行病学数据、基因表达数据 基于NHANES和GBD数据库的大规模人群数据 NA 单细胞测序 NA NA
3814 2025-12-06
Single-cell profiling reveals a shared proinflammatory macrophage signature across multiple organs in myopia
2025-Dec-02, Cell discovery IF:13.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了近视小鼠多个器官中巨噬细胞的促炎表型及其与缺氧通路的关联,并发现近视与多种眼外疾病存在相关性 首次在近视模型中构建跨器官(眼、脑、血、骨髓等11种组织)的单细胞转录组图谱,发现巨噬细胞在多个组织中呈现一致的促炎表型,并验证了缺氧通路在其中的调控作用及临床相关性 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仅限于血液标志物;眼外疾病与近视的因果关系尚未完全阐明 探究近视发展过程中跨器官免疫通讯的机制及其与全身性疾病的关系 近视小鼠模型(涵盖眼、脑、血液、骨髓、脾脏等11种组织)及114,661例人类患者队列 数字病理学 近视 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据、临床队列数据 小鼠多组织单细胞数据 + 114,661例患者临床数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3815 2025-12-06
Spatial omics: applications and utility in profiling the tumor microenvironment
2025-Dec-02, Cancer metastasis reviews
综述 本文综述了空间组学技术在生物医学研究中的应用,特别关注其在肿瘤微环境分析中的效用 空间组学技术能够保留组织空间结构,直接映射分子信息到组织学结构,为肿瘤微环境提供前所未有的详细表征 NA 概述空间组学技术现状及其在癌症研究中的应用,推动精准肿瘤学发展 肿瘤微环境,包括空间异质性、免疫细胞浸润模式及肿瘤进展与治疗抵抗机制 数字病理学 肺癌 空间转录组学 NA 空间基因和蛋白表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
3816 2025-12-06
SPICEiST: subcellular RNA pattern enhances cell clustering of imaging-based spatial transcriptomics
2025-Dec-02, Genomics & informatics
研究论文 本文提出了一种名为SPICEiST的图自编码器框架,通过整合亚细胞转录分布模式和细胞级基因表达谱,以增强成像空间转录组学中的细胞聚类性能 SPICEiST首次将亚细胞RNA分布模式与细胞级基因表达结合,用于提升成像空间转录组学的细胞聚类准确性,特别是在小基因面板情况下 研究主要针对癌症数据集,且在小基因面板(约300个基因)中效果更显著,对于大基因面板(超过一千个基因)的改进相对有限 旨在克服成像空间转录组学中因小基因面板和细胞分割挑战导致的细胞聚类限制 多个癌症数据集中的细胞,基于成像空间转录组学技术 空间转录组学 癌症 成像空间转录组学 图自编码器 图像和基因表达数据 多个癌症数据集,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 成像空间转录组学 NA NA
3817 2025-12-06
Genome-wide identification of the PLD gene family and its response to multiple abiotic stresses in soybean (Glycine max)
2025-Dec-02, BMC plant biology IF:4.3Q1
研究论文 本研究对大豆中的磷脂酶D(PLD)基因家族进行了全基因组鉴定,并分析了其在多种非生物胁迫下的响应机制 首次在大豆中系统鉴定了25个GmPLD基因,包括两个新发现的φ亚型(GmPLDφ1/2),并通过单细胞RNA-seq揭示了其空间表达异质性,同时通过单倍型分析鉴定了与磷效率相关的优势单倍型 研究主要基于生物信息学分析和表达谱数据,功能验证实验相对有限,且对PLD基因在具体胁迫信号通路中的分子机制尚未深入探讨 系统解析大豆PLD基因家族的结构特征、表达模式及其在非生物胁迫响应中的功能 大豆(Glycine max)中的磷脂酶D(PLD)基因家族 植物分子生物学 NA 全基因组鉴定、系统发育分析、表达谱分析、单细胞RNA-seq、单倍型分析、酶活性验证 NA 基因组序列数据、RNA-seq数据、单细胞RNA-seq数据 基于大豆基因组数据,涉及25个GmPLD基因;表达分析涵盖多种组织和非生物胁迫条件 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3818 2025-12-06
A dynamic model for Waddington's landscape accounting for cell-to-cell communication
2025-Dec, Mathematical biosciences IF:1.9Q3
研究论文 本研究提出了一个考虑细胞间通讯的细胞成熟与发育动态模型,作为Waddington景观的扩展 首次在Waddington景观框架中整合细胞间通讯机制,通过偏微分方程与常微分方程耦合系统描述细胞状态依赖的配体产生与群体动态 模型验证主要基于单细胞转录组数据,尚未在更多实验体系或体内环境中进行广泛验证 建立包含细胞间通讯的细胞发育数学模型,更准确描述生物恢复过程 细胞成熟与发育过程,重点关注肠道隐窝干细胞再生和免疫细胞对LSP刺激的响应 计算生物学 NA 单细胞转录组学分析 偏微分方程与常微分方程耦合系统 单细胞转录组数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
3819 2025-12-06
Single-cell RNA sequencing reveals immune response dynamics and infection mechanisms in PRRSV-infected porcine alveolar macrophages
2025-Dec, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了PRRSV感染猪肺泡巨噬细胞的免疫应答动态和感染机制 首次在单细胞水平上揭示了PRRSV感染过程中猪肺泡巨噬细胞的转录异质性,并发现了CD16受体在病毒进入中的作用以及SPP1蛋白的抗病毒功能 研究基于体外感染模型,可能无法完全反映体内复杂环境;样本规模未明确说明,可能影响统计效力 探究PRRSV感染过程中宿主细胞的免疫应答机制和病毒感染动力学 PRRSV感染的猪肺泡巨噬细胞 数字病理学 猪繁殖与呼吸综合征 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3820 2025-12-06
Endothelial septin 4 reduction contributes to lipopolysaccharide-induced acute lung injury by disrupting endothelial barrier integrity and promoting infiltration of ISG+ cells
2025-Dec, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究探讨了内皮细胞特异性SEPT4在脂多糖诱导的急性肺损伤中的作用机制 首次揭示了SEPT4在内皮屏障完整性中的关键作用及其缺失如何通过促进ISG+细胞浸润加剧急性肺损伤 研究主要基于小鼠模型,人类组织验证有限;机制研究尚未完全阐明SEPT4调控细胞骨架的具体分子通路 阐明内皮特异性SEPTs在急性肺损伤中的功能和分子机制 小鼠肺组织、内皮细胞、成纤维细胞 分子病理学 急性肺损伤 scRNA-seq、条件性基因敲除、组织病理学分析 条件性基因敲除小鼠模型 单细胞RNA测序数据、组织切片图像、蛋白质表达数据 未明确说明具体样本数量,但使用了基因敲除小鼠模型和scRNA-seq数据分析 NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部