单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
3781 2024-12-07
Neonatal inflammation impairs developmentally-associated microglia and promotes a highly reactive microglial subset
2025-Jan, Brain, behavior, and immunity
研究论文 研究新生儿炎症对小鼠神经发育障碍模型中脑髓样细胞亚群的影响 通过单细胞RNA测序和流式细胞术,识别出表达补体受体C5ar1的特定微胶质细胞亚群,并发现其在炎症途径中高度激活 NA 探讨新生儿炎症对神经发育障碍中微胶质细胞发育轨迹的影响 小鼠神经发育障碍模型中的脑髓样细胞亚群 NA 神经发育障碍 单细胞RNA测序、流式细胞术 NA RNA 小鼠模型
3782 2024-12-06
Subtype-specific transcription factors affect polyamine metabolism and the tumor microenvironment in breast cancer
2025-Feb, Cancer innovation
研究论文 研究了转录因子对乳腺癌亚型中多胺代谢和肿瘤微环境的影响 首次确定了三个亚型特异性转录因子,它们调控高风险乳腺癌亚型中的三个多胺代谢基因,并影响肿瘤微环境 研究仅限于乳腺癌亚型,未涵盖其他癌症类型 探讨转录因子对乳腺癌亚型中多胺代谢基因的调控及其对肿瘤微环境的影响 乳腺癌亚型中的多胺代谢基因及其转录因子 数字病理学 乳腺癌 RNA测序 NA RNA 涉及四种乳腺癌亚型的RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据
3783 2024-12-05
Endothelial Angpt2 Promotes Adipocyte Progenitor Cells Maturation to Increase Visceral Adipose Tissue Accumulation
2025-Jan, Diabetes/metabolism research and reviews
研究论文 研究探讨了内皮细胞Angpt2在促进脂肪前体细胞成熟和内脏脂肪组织积累中的作用 揭示了JAK1/STAT3信号通路激活下内皮细胞分泌的Angpt2通过整合素-α5β1信号促进脂肪前体细胞从MSLN表型向CFD表型转变,从而促进内脏脂肪组织积累的新机制 研究样本量较小,且仅限于肥胖和糖尿病患者,可能影响结果的普适性 探究内脏脂肪组织积累的具体机制 内脏脂肪组织、内皮细胞、脂肪前体细胞 NA 肥胖 单细胞RNA测序(scRNAseq)、PCR、WB、免疫荧光染色、流式细胞术 NA 基因表达数据 13个内脏脂肪组织样本,来自5名肥胖和糖尿病患者、9名肥胖患者和1名正常BMI个体
3784 2024-11-27
Droplet-Based Single-Cell 3' mRNA Sequencing of Marburg Virus-Infected Samples
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 描述了一种基于液滴的单细胞3' mRNA测序方法,用于研究马尔堡病毒感染的样本 使用10× Chromium Next GEM单细胞基因组学技术,首次在体内研究马尔堡病毒感染的非人灵长类血液样本 研究在BSL-4实验室进行,操作复杂且需要严格的生物安全措施 揭示病毒与宿主相互作用的转录组复杂性 马尔堡病毒感染的单细胞样本 基因组学 NA 单细胞RNA测序 NA mRNA 非人灵长类血液样本
3785 2024-11-26
Identification of Nfel1a and Nfel3 as novel regulators for zebrafish thrombopoiesis
2025-Feb, Blood cells, molecules & diseases
研究论文 研究揭示了Nfe2I1a和Nfe2l3作为斑马鱼血栓生成的新调控因子 发现Nfe2I1a和Nfe2l3是斑马鱼血栓生成的新型转录因子,并证明了它们在血栓生成中的正调控作用 NA 探讨斑马鱼血栓生成过程中Nfe2相关基因的作用 斑马鱼的血栓生成和Nfe2相关基因 NA NA 单细胞测序 NA 基因表达数据 NA
3786 2024-11-25
The impact of cathepsins on liver hepatocellular carcinoma: Insights from genetic and functional analyses
2025-Jan-30, Gene IF:2.6Q2
研究论文 研究探讨了组织蛋白酶E在肝细胞癌中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 首次系统研究了组织蛋白酶E在肝细胞癌中的作用,并揭示了其在细胞增殖和信号传导中的关键作用 研究主要基于体外实验和现有数据库分析,缺乏临床试验验证 探讨组织蛋白酶E在肝细胞癌中的作用及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 肝细胞癌及其相关组织蛋白酶E的表达和功能 数字病理学 肝癌 RNA测序、免疫组化分析、siRNA技术 NA RNA 包括HepG2和Huh7细胞系在内的多个样本
3787 2024-11-24
Using Callus as an Ex Vivo System for Chromatin Analysis
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
综述 本文综述了下一代测序技术在表观遗传学研究中的应用,并探讨了使用子叶衍生愈伤组织作为体外系统进行染色质分析的优势 本文提出了使用子叶衍生愈伤组织作为简单、易获取且稳健的平台,用于高通量多组学分析 本文未提及具体的实验数据或结果,主要集中在方法论的讨论上 探讨表观遗传机制的复杂性及其在基因调控中的作用 DNA甲基化和组蛋白修饰谱 表观遗传学 NA 下一代测序 NA 多组学数据 NA
3788 2024-11-22
Microglia phagocytosis of PNNs mediates PV-positive interneuron dysfunction and associated gamma oscillations in neuroinflammation-induced cognitive impairment in mice
2025-Jan-01, Neuropharmacology IF:4.6Q1
研究论文 研究探讨了神经炎症通过小胶质细胞吞噬PNNs导致PV阳性中间神经元功能障碍和相关γ振荡,从而引发小鼠认知障碍的机制 首次揭示了小胶质细胞吞噬PNNs在神经炎症诱导的认知障碍中的关键作用,并提出ApoE可能介导这一过程 研究主要集中在小鼠模型上,结果的普适性有待进一步验证 探讨神经炎症导致认知障碍的具体机制 小鼠的认知功能、神经振荡、小胶质细胞基因表达 神经科学 认知障碍 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 C57BL/6J小鼠和CX3CR1-CreERT2小鼠
3789 2024-11-20
Research progress and the prospect of using single-cell sequencing technology to explore the characteristics of the tumor microenvironment
2025-Jan, Genes & diseases IF:6.9Q1
综述 本文综述了单细胞测序技术在肿瘤微环境研究中的进展和应用前景 本文提出了单细胞多组学测序技术的整合,并探讨了其在生物研究和医学调查中的潜力 本文讨论了使用单细胞测序技术探索肿瘤微环境的优缺点 解决肿瘤内异质性问题,为精准癌症治疗提供支持 肿瘤微环境中的细胞异质性 数字病理学 NA 单细胞测序技术 NA 基因组和转录组数据 NA
3790 2024-11-18
Dissection of Gene Expression at the Single-Cell Level: scRNA-seq
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文讨论了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在基因表达研究中的应用 scRNA-seq技术能够以单细胞分辨率揭示基因表达特征,识别与疾病相关的新细胞类型 NA 深入理解基因表达的单细胞分辨率 单细胞RNA测序技术及其在基因表达研究中的应用 基因组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 数千到数百万个转录本
3791 2024-11-15
A pancreatic cancer organoid incorporating macrophages reveals the correlation between the diversity of tumor-associated macrophages and cancer cell survival
2025-Mar, Biomaterials IF:12.8Q1
研究论文 本文通过构建包含巨噬细胞的胰腺癌类器官模型,研究了肿瘤相关巨噬细胞多样性与癌细胞存活之间的关联 首次在胰腺癌类器官模型中引入巨噬细胞,揭示了肿瘤相关巨噬细胞的多样性及其在血管生成和癌细胞存活中的作用 研究仅限于体外模型,未涉及体内实验验证 探讨胰腺导管腺癌微环境中巨噬细胞多样性与癌细胞存活的关系 胰腺导管腺癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞、血管内皮细胞 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 包含五个肿瘤相关巨噬细胞亚群的胰腺癌类器官模型
3792 2024-11-15
Analysis of the pluripotent and germline marker gene expression, and the state of X chromosome reactivation of primordial germ cells in pig gonads
2025-Jan-01, Theriogenology IF:2.4Q1
研究论文 研究分析了猪性腺原始生殖细胞(PGCs)的多能性和性染色体再激活状态 首次揭示了猪性腺PGCs的异质性,并鉴定了GDF3作为其特异性表面标记 NA 评估猪性腺PGCs的多能性状态、特定基因表达模式和性染色体再激活 猪性腺原始生殖细胞(PGCs) NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
3793 2024-11-09
ERP44 could serve as a bridge mediating prognosis and immunity for glioma via single-cell and bulk RNA-sequencing
2025-Jan-15, Gene IF:2.6Q2
研究论文 研究探讨了ERP44在胶质瘤中的作用及其对预后和免疫的影响 首次整合蛋白质组学、单细胞和批量RNA测序数据,研究ERP44在胶质瘤患者中的潜在功能 NA 探讨ERP44在胶质瘤中的作用及其对预后和免疫的影响 ERP44在胶质瘤中的表达及其对患者预后和免疫的影响 数字病理学 脑肿瘤 单细胞RNA测序 (scRNA-seq),批量RNA测序,蛋白质组学 NA RNA 使用了TCGA数据集、GSE50161、GSE4290以及qRT-PCR验证的数据
3794 2024-11-08
High-throughput and multimodal profiling of antigen-specific T cells with a droplet-based cell-cell interaction screening platform
2025-Jan-01, Biosensors & bioelectronics IF:10.7Q1
研究论文 开发了一种基于液滴的细胞间相互作用筛选平台DropCCI,用于高通量和多模态分析抗原特异性T细胞 提出了DropCCI方法,通过液滴封装DNA条码和抗原负载的抗原呈递细胞,结合点击化学修饰的T细胞,实现了高通量、无污染的多模态分析 NA 开发一种新的策略,用于高通量和多模态分析抗原特异性T细胞,以改进T细胞免疫疗法的设计 抗原特异性T细胞 生物技术 NA 点击化学 NA 单细胞组学数据 NA
3795 2024-10-24
High-throughput single-cell sequencing of activated sludge microbiome
2025-Jan, Environmental science and ecotechnology IF:14.0Q1
研究论文 研究通过高通量单细胞测序技术分析了活性污泥微生物群落,揭示了微生物群落中的基因组异质性和潜在的新物种 首次应用高通量单细胞测序技术分析活性污泥微生物群落,揭示了微生物暗物质的存在,并发现了大量的抗生素抗性基因、质粒片段和噬菌体基因组 研究主要集中在活性污泥微生物群落,未涉及其他环境中的微生物群落 探索活性污泥微生物群落的基因组异质性,揭示微生物暗物质和水平基因转移过程 活性污泥微生物群落 生物技术 NA 单细胞测序 NA 基因组 15,110个单细胞
3796 2024-10-21
Expression Cloning of Antibodies from Single Human B Cells
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文描述了一种从单个人类B细胞中克隆抗体的策略 该方法能够在单细胞水平上无偏差地表征人类抗体库,并通过RT-PCR技术生成重组单克隆抗体 NA 研究B细胞淋巴瘤的克隆进化和抗体反应性 人类B细胞及其抗体反应性 NA 淋巴瘤 RT-PCR NA NA 单个人类B细胞
3797 2024-10-21
Single Cell VDJ Sequencing of Normal and Malignant B and T Cells
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文介绍了单细胞VDJ测序技术在正常和恶性B细胞及T细胞中的应用和分析方法 本文扩展了单细胞测序技术的应用范围,包括表面分子表达、DNA可及性、抗原特异性以及B或T细胞受体库的分析 NA 探讨单细胞VDJ测序技术在肿瘤研究中的应用,特别是B和T细胞克隆在淋巴瘤、白血病及其他类型癌症中的作用 正常和恶性B细胞及T细胞 数字病理学 淋巴瘤 单细胞测序 NA 基因组数据 最多可达60,000个细胞
3798 2024-10-16
Profiling the cell diversity and tissue structure of aqueous humor circulatory system in human eyes using spatial single-cell RNA sequencing
2025-Jan, Genes & diseases IF:6.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
3799 2024-10-12
Single-cell sequencing revealed the microglia-activated cell distribution in gray matter heterotopia
2025-Jan, Genes & diseases IF:6.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
3800 2024-10-12
Single-cell sequencing reveals the immune microenvironment associated with gastric cancer
2025-Jan, Genes & diseases IF:6.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
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