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当前共找到 10796 篇文献,本页显示第 361 - 380 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
361 2026-01-24
Smoothie: Efficient Inference of Spatial Co-expression Networks from Denoised Spatial Transcriptomics Data
2025-Mar-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为Smoothie的方法,用于从去噪后的空间转录组数据中高效推断空间共表达网络 Smoothie通过高斯平滑技术去噪空间转录组数据,并构建和整合全基因组共表达网络,利用隐式和显式并行化实现可扩展性,能处理超过1亿个空间解析点的大数据集 NA 从高分辨率空间转录组数据中提取深层生物学见解,包括基因模块检测、功能注释、基因表达与基因组结构的关联以及多样本比较 空间转录组数据中的基因表达模式 空间转录组学 NA 空间转录组学 高斯平滑 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
362 2026-01-24
Immunomodulatory effects of traditional chinese medicine on cancer: insights from network pharmacology and single-cell RNA sequencing data on the treatment of lung adenocarcinoma with shenling baizhu powder
2025-Feb-28, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究结合网络药理学和单细胞RNA测序数据,探讨了参苓白术散治疗肺腺癌的免疫调节机制 首次整合网络药理学与单细胞RNA测序技术,系统揭示了传统中药复方通过调节巨噬细胞相关基因(ALOX5、IL2RA、MMP9、PPARG)影响肿瘤免疫微环境的分子机制 研究主要基于生物信息学分析和分子对接模拟,缺乏体内外实验验证;临床样本量未明确说明 探究参苓白术散治疗肺腺癌的免疫调节作用机制 肺腺癌患者样本(正常组与LUAD组) 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,网络药理学,分子对接 机器学习 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
363 2026-01-24
Single-cell profiling and clinical characteristics analysis of lung squamous carcinoma
2025-Feb-27, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了肺鳞状细胞癌的肿瘤微环境和临床特征,构建了预后风险评分模型 首次结合TCGA和GEO数据库对504个LUSC样本进行单细胞RNA测序,并利用计算算法分析免疫细胞浸润和免疫检查点基因特征,识别出具有不同免疫和临床特征的两个基因簇 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,缺乏前瞻性验证,且样本量虽大但可能受数据来源异质性影响 阐明肺鳞状细胞癌的肿瘤微环境景观和临床特征,并开发预后预测模型 肺鳞状细胞癌患者样本 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,q-PCR,免疫荧光 COX比例风险模型,加权基因共表达网络分析 基因表达数据,临床数据 504个肺鳞状细胞癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
364 2026-01-24
Heterogeneity analysis and prognostic model construction of HPV negative oral squamous cell carcinoma T cells using ScRNA-seq and bulk-RNA analysis
2025-Jan-23, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA-seq数据,分析了HPV阴性口腔鳞状细胞癌中T细胞的异质性,并构建了一个基于T细胞相关基因的预后风险模型 首次在HPV阴性口腔鳞状细胞癌中结合单细胞和bulk转录组数据系统分析T细胞异质性,并构建了基于T细胞相关基因的预后模型,为预测患者生存和免疫浸润水平提供了新见解 样本量相对有限(14个肿瘤样本和6个正常样本),模型需要在更大的独立队列中进行验证 评估HPV阴性口腔鳞状细胞癌中T细胞标记基因的表达谱,构建预后风险模型,并研究风险评分与免疫治疗反应的相关性 HPV阴性口腔鳞状细胞癌患者 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, qRT-PCR 预后风险模型 单细胞转录组数据, bulk转录组数据 14个HPV阴性OSCC样本和6个正常样本,共28,000个细胞 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
365 2026-01-24
Unraveling the potential mechanism and prognostic value of pentose phosphate pathway in hepatocellular carcinoma: a comprehensive analysis integrating bulk transcriptomics and single-cell sequencing data
2025-Jan-11, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究整合了批量转录组学和单细胞测序数据,构建了一个基于戊糖磷酸途径相关基因的模型,用于肝细胞癌患者的风险评估和预后预测 首次整合批量转录组学和单细胞测序数据,构建了一个与戊糖磷酸途径相关的十基因特征模型,并验证了其在预测肝细胞癌预后和免疫治疗反应方面的价值 研究主要基于回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测能力 构建一个基于戊糖磷酸途径相关基因的模型,用于肝细胞癌患者的风险评估、预后预测和个体化治疗指导 肝细胞癌患者 数字病理学 肝细胞癌 RNA-seq, 微阵列, 单细胞RNA测序 惩罚性Cox回归模型, LASSO回归 转录组数据, 单细胞测序数据 来自TCGA, GEO和ICGC数据库的多个队列数据 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
366 2026-01-24
Pig jejunal single-cell RNA landscapes revealing breed-specific immunology differentiation at various domestication stages
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了野猪、金华猪和杜洛克猪空肠组织的免疫细胞图谱,揭示了不同驯化阶段猪品种间免疫功能的差异和进化 首次在单细胞分辨率下构建了猪空肠组织的免疫细胞图谱,开发了免疫细胞评估系统,并识别了与驯化相关的品种特异性基因模式 研究仅关注空肠组织,可能未全面反映整个肠道的免疫变化;样本量相对有限,未来可扩展至更多品种和部位 探究猪在驯化过程中肠道免疫功能的进化变化和细胞异质性 野猪、中国地方品种(金华猪)和集约化品种(杜洛克猪)的空肠组织 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据 26,246个细胞,来自三个猪品种的空肠组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
367 2026-01-24
Hydrogen improves the efficacy of tetrandrine in the treatment of silicosis by inhibiting vascular endothelial mesenchymal transition caused by oxidative stress
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology IF:4.3Q2
研究论文 本研究探讨了氢气如何通过抑制氧化应激诱导的血管内皮间质转化,来提高汉防己甲素治疗矽肺的疗效 首次提出氢气通过抑制凋亡肺泡巨噬细胞释放淀粉样前体蛋白及其与血管内皮细胞CD74的相互作用,来缓解肺血管狭窄,从而提高治疗药物在肺组织中的浓度 研究基于小鼠模型,结论在人体中的有效性尚需进一步验证 探究汉防己甲素在肺组织中浓度低的原因,并提出联合氢气吸入的治疗方案以提高矽肺治疗效果 矽肺小鼠模型 数字病理学 肺病 单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
368 2026-01-24
Downregulation of OPCML is associated with activation of AKT signaling and aggressive phenotypes in glioblastoma cells
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究探讨了OPCML在胶质母细胞瘤中的下调与AKT信号通路激活及侵袭性表型的关系 首次在单细胞分辨率下定位OPCML在胶质母细胞瘤中的表达,并揭示其通过调节PI3K-AKT-mTOR信号通路影响肿瘤侵袭性 研究主要基于细胞系实验,缺乏体内模型验证;临床相关性分析依赖于公共数据库,可能存在样本偏差 阐明OPCML在胶质母细胞瘤生物学中的作用及其临床意义 胶质母细胞瘤细胞系(U87和U251)及公共数据库中的患者数据 生物信息学与分子生物学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、微阵列、Western blotting、siRNA敲低、细胞功能实验 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、临床数据 两个批量微阵列队列、单细胞RNA测序数据、TCGA和HPA数据库中的患者样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
369 2026-01-24
Integrative bulk and single-cell transcriptomic analysis reveals COL1A2-driven ECM remodeling and focal adhesion signaling associated with the transition from non-muscle-invasive to muscle-invasive bladder cancer
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过整合分析bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,揭示了COL1A2驱动的细胞外基质重塑和黏着斑信号在膀胱癌从非肌层浸润向肌层浸润转变过程中的关键作用 首次整合bulk和单细胞转录组数据,系统揭示了COL1A2介导的基质CAFs与EMT上皮细胞间的细胞通讯轴在膀胱癌进展中的机制 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内动物模型验证 探究COL1A2在膀胱癌进展中的作用机制及其作为预后生物标志物的潜力 膀胱癌(非肌层浸润型和肌层浸润型) 生物信息学 膀胱癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, ssGSEA, 细胞通讯分析 Cox回归模型, Kaplan-Meier生存分析 转录组数据 TCGA和GEO数据库中的膀胱癌样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
370 2026-01-24
Metabolic reprogramming-driven stratification and therapeutic targeting in lung adenocarcinoma: implications for prognosis and personalized treatment
2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究开发了一种基于代谢相关基因的预后评分系统(MRPs),用于肺腺癌(LUAD)患者的风险分层和个性化治疗指导 提出了一个新颖的代谢相关预后评分系统(MRPs),该系统超越了传统的临床病理参数,能够捕获LUAD的代谢和免疫异质性,并识别出WARS2作为关键功能驱动因子和治疗靶点 研究主要基于回顾性转录组和临床数据,需要进一步的前瞻性临床验证来确认MRPs系统的临床应用价值 开发一个基于代谢相关基因的预后评分系统,并研究其在肺腺癌中的生物学、免疫学和治疗学意义 肺腺癌(LUAD)患者 数字病理学 肺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, qPCR, Western blot, 免疫组织化学 LASSO-Cox回归模型 转录组数据, 临床数据 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者队列(具体样本数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
371 2026-01-24
Metabolic reprogramming in the post-metastatic tumor microenvironment: multi-omics insights into determinants of immunotherapy response
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了转移后肿瘤微环境中代谢重编程如何决定免疫治疗反应,并探讨了多组学技术在此领域的应用前景 系统整合了代谢重编程(糖酵解、脂代谢、铁死亡、铜死亡、色氨酸代谢轴)与免疫抑制微环境的关联,并强调了多组学技术(代谢组学、蛋白质组学、单细胞测序、空间组学)在解码这些复杂相互作用、发现生物标志物和治疗靶点方面的突破性作用 NA 探讨转移后肿瘤微环境(TIME)中代谢重编程如何调控免疫应答并影响免疫治疗疗效,旨在为克服治疗耐药性和开发个性化疗法提供见解 转移性肿瘤的肿瘤免疫微环境(TIME)及其代谢与免疫相互作用网络 肿瘤生物学与免疫学 转移性癌症 多组学技术(代谢组学、蛋白质组学、单细胞测序、空间组学) NA 多组学数据 NA NA 单细胞测序, 空间转录组学 NA NA
372 2026-01-24
Decidual stromal cells drive CD16+ macrophages towards an immunoregulatory phenotype via extracellular matrix-adhesion molecule interaction during early pregnancy
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了在早期妊娠中,蜕膜基质细胞通过细胞外基质-黏附分子相互作用调控CD16+巨噬细胞向免疫调节表型分化的机制 首次揭示了蜕膜基质细胞通过细胞外基质成分(如胶原IV、骨桥蛋白和透明质酸)与其受体相互作用,驱动CD16+巨噬细胞向免疫调节表型分化,并发现复发性流产患者中此调控链减弱 研究主要基于体外共培养系统和单细胞测序数据分析,体内验证和临床样本量可能有限,且具体分子机制细节需进一步探索 研究早期妊娠中蜕膜基质细胞与CD16+巨噬细胞通过细胞外基质-黏附分子相互作用的调控机制及其在复发性流产中的病理意义 蜕膜基质细胞、CD16+巨噬细胞、复发性流产患者 生殖免疫学 复发性流产 单细胞测序、共培养系统、组织与细胞水平分析 NA 单细胞测序数据、组织样本、细胞培养数据 包括子宫内膜和蜕膜组织样本,以及复发性流产患者样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
373 2026-01-24
Identify GDPD3 as a key regulator of epithelial-mesenchymal transition and prostate adenocarcinoma progression via the LPA/LPAR1/AKT axis: transcriptomic and experimental study
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和Bulk RNA测序数据,识别GDPD3作为前列腺腺癌进展的关键调控因子,并通过LPA/LPAR1/AKT轴促进上皮-间质转化 首次将GDPD3与前列腺腺癌的LPA/LPAR1/AKT信号轴联系起来,并开发了一个21基因预后模型 研究主要基于体外细胞实验(DU145细胞),缺乏体内模型验证,且临床样本验证有限 探索前列腺腺癌进展的分子机制并识别潜在治疗靶点 前列腺腺癌(PRAD) 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序,Bulk RNA测序,免疫组织化学,qPCR,体外敲低实验 预后模型(基于Cox回归和LASSO分析) RNA测序数据,临床数据,图像数据 来自GEO的单细胞RNA-seq数据和来自TCGA的Bulk RNA-seq数据,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq,Bulk RNA-seq NA NA
374 2026-01-24
Single-cell sequencing reveals the tumor immune microenvironment in thyroid cancer: a narrow review
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了利用单细胞RNA测序技术揭示甲状腺癌肿瘤免疫微环境的研究进展 通过单细胞测序技术,首次系统描绘了从PTC到PDTC再到ATC这一分化依赖的肿瘤免疫微环境重塑轨迹,揭示了传统批量分析中常被掩盖的细胞异质性、免疫互作和空间组织特征 本文为综述性文章,未涉及原始数据生成或新模型开发,主要基于现有研究进行总结和分析 阐明甲状腺癌肿瘤免疫微环境的特征及其在肿瘤进展和治疗反应中的作用 甲状腺癌的肿瘤免疫微环境,重点关注乳头状甲状腺癌(PTC)、低分化甲状腺癌(PDTC)和间变性甲状腺癌(ATC) 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
375 2026-01-24
Glutamate enhances the production of inflammatory cytokines IL-6 and IL-11, as well as chemokines CXCL2, CXCL3, and CXCL8 in keloid fibroblasts
2025, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过转录组学和代谢组学分析,揭示了谷氨酸代谢在促进瘢痕疙瘩成纤维细胞炎症功能中的关键作用 首次结合单细胞RNA测序和代谢组学,发现谷氨酸受体GRIN2D在瘢痕疙瘩成纤维细胞中特异性高表达,并证实谷氨酸能增强炎症因子和趋化因子的产生 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;样本量可能有限,未明确具体数量 探究谷氨酸代谢在瘢痕疙瘩发病机制中的作用 人类瘢痕疙瘩组织与正常皮肤组织,以及体外培养的人成纤维细胞 数字病理学 皮肤瘢痕疙瘩 RNA测序(RNA-seq)、代谢组学、单细胞RNA测序、免疫组织化学、免疫荧光、定量RT-PCR、ELISA NA 基因表达数据、代谢物数据、图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
376 2026-01-23
Transcriptome-wide Mendelian randomization and single-cell analysis during CD4+ T cell activation deciphers immunotherapeutic targets for colorectal cancer
2025-Dec-29, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过转录组范围孟德尔随机化与单细胞分析,揭示了CD4+ T细胞活化在结直肠癌进展中的关键作用,并识别出潜在的免疫治疗靶点 首次结合转录组范围孟德尔随机化、单细胞RNA测序与多组学验证,系统解析CD4+ T细胞活化相关基因与结直肠癌的因果关系,识别出PARP14和ORMDL3等关键免疫治疗靶点 研究主要基于遗传学与转录组数据,需进一步实验验证靶点的功能机制与临床转化潜力 识别结直肠癌免疫治疗的潜在靶点 CD4+ T细胞活化相关基因与结直肠癌的因果关系 生物信息学 结直肠癌 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 多组学分析 孟德尔随机化模型, 单细胞转录组分析 遗传学数据, 转录组数据, 单细胞表达数据 未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
377 2026-01-23
The Distinct Monocyte Subsets and Intercellular Communication in Primary Sjögren's Syndrome Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Dec-27, Journal of clinical immunology IF:7.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了原发性干燥综合征患者中单核细胞亚群、亚群间通讯的异常变化及其在疾病发病机制中的作用 首次在pSS患者中利用scRNA-seq全面表征单核细胞亚群和亚群的异质性,识别出新的亚群变化和潜在生物标志物 样本量有限,未进行功能验证实验,且研究仅关注单核细胞,未全面评估其他免疫细胞类型 探究原发性干燥综合征患者单核细胞亚群和亚群的变异及其功能角色 原发性干燥综合征患者和健康对照者的单核细胞样本 单细胞组学 自身免疫性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确指定具体样本数量,涉及pSS患者和健康对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
378 2026-01-23
Intrinsic and non-cell autonomous roles for a neurodevelopmental syndrome-linked transcription factor
2025-Dec-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文揭示了转录因子UNC-3在运动神经元中的细胞自主和非细胞自主功能,及其与人类EBF3综合征的关联 首次发现UNC-3作为终端选择因子,不仅通过细胞自主方式调控神经元身份,还通过胆碱能神经传递介导非细胞自主效应,影响下游GABA运动神经元的转录、形态和连接 研究基于线虫模型,人类EBF3综合征的直接机制仍需进一步验证 探究转录因子在神经元身份和电路组装中的内在与外在调控作用 线虫的胆碱能和GABA运动神经元 神经发育生物学 神经发育综合征 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
379 2026-01-23
FlashDeconv enables atlas-scale, multi-resolution spatial deconvolution via structure-preserving sketching
2025-Dec-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为FlashDeconv的框架,用于图谱规模的空间转录组学解卷积,通过结构保持的随机草图技术,在保持计算效率的同时保留稀有生物信号 采用杠杆得分重要性采样来优先处理转录组学上独特的标记,保留标准特征选择丢弃的稀有细胞类型信号,相比基于方差的方法能更准确地解卷积 未明确提及具体局限性,但可能依赖于特定数据质量或算法假设 开发一个可扩展的数学框架,用于图谱规模的空间转录组学解卷积,以快速进行患者分层和生物结构发现 人类卵巢癌队列数据,包括细胞共定位信号和Tuft细胞微环境 空间转录组学 卵巢癌 空间转录组学解卷积 结构保持随机草图框架 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
380 2026-01-23
In vivo human embryonic spinal cord atlas validates stem cell-derived human dorsal interneurons and reveals ASD spinal signatures
2025-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一种改进的方法,通过神经中胚层祖细胞状态从人类胚胎干细胞生成脊髓背侧中间神经元,并构建了人类胚胎脊髓的单细胞RNA-Seq图谱,用于验证干细胞来源的神经元并揭示与自闭症谱系障碍相关的脊髓特征 提出了一种通过生理中间体(神经中胚层祖细胞)生成人类脊髓背侧中间神经元的新方法,并首次构建了人类胚胎脊髓的单细胞RNA-Seq图谱,揭示了dI4/dI5群体的显著扩张及其与自闭症谱系障碍的关联 未明确说明样本大小或实验验证的局限性,可能依赖于体外模型,缺乏体内功能验证 开发干细胞分化协议以生成脊髓背侧中间神经元,用于脊髓损伤后的感觉恢复,并探索脊髓在自闭症谱系障碍中的作用 人类胚胎干细胞(hESCs)、人类胚胎脊髓组织、脊髓背侧中间神经元(dI1-dI6) 干细胞生物学与神经科学 脊髓损伤、自闭症谱系障碍 单细胞RNA-Seq、干细胞定向分化 NA 单细胞RNA-Seq数据、基因表达谱 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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