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当前共找到 10570 篇文献,本页显示第 361 - 380 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
361 2026-09-19
Exploring the Role of Ccn3 in Type III Cell of Mice Taste Buds
2025-01, Journal of neurochemistry IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现Ccn3在小鼠菌状乳头III型味觉细胞中高表达,并通过基因敲除小鼠实验探究其在味觉细胞中的功能 首次发现Ccn3在III型味觉细胞中特异性高表达,并通过基因敲除实验验证其不影响基本味觉反应,同时通过生物信息学预测其在免疫反应中的潜在作用 Ccn3敲除后未观察到明显的味觉功能变化,其具体功能仍需进一步研究验证,生物信息学预测结果缺乏实验验证 探究Ccn3在小鼠味蕾细胞中的表达模式及其功能 小鼠菌状乳头中的味觉细胞,特别是III型味觉细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序, RT-PCR, 原位杂交, 免疫组织化学, 定量实时RT-PCR, 味觉神经记录, 短期舔舐实验 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
362 2026-09-19
Revealing tissue architecture through the hypercomplex Fourier analysis of spatial transcriptomics data
2025, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 本文提出了一种使用四元数域离散傅里叶变换分析空间转录组数据的方法,并展示了其在Visium HD数据中的应用 首次将四元数域离散傅里叶变换应用于空间转录组数据分析,将转录组状态变换视为三维旋转,并支持捕捉转录组不确定性的可视化 未明确说明,但可能受限于四元数表示仅能捕捉三个转录组特征,且主要基于Visium HD数据验证,泛化性需进一步评估 开发一种基于四元数傅里叶分析的空间转录组数据分析框架,以揭示组织架构 空间转录组数据,特别是Visium HD数据,以及单细胞RNA测序数据 数字病理学 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 四元数域离散傅里叶变换 图像,文本 NA 10x Genomics 空间转录组学,单细胞RNA测序 10x Visium HD NA
363 2026-09-19
Immune cell communication networks and memory CD8+ T cell signatures sustaining chronic inflammation in COVID-19 and Long COVID
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 该研究利用单细胞RNA测序分析了不同疾病状态下COVID-19和Long COVID患者的外周血单个核细胞,揭示了记忆CD8+ T细胞在维持慢性炎症中的核心作用及其与免疫细胞通讯网络的关系 首次在单细胞分辨率下系统描绘了COVID-19和Long COVID的免疫细胞通讯网络,发现记忆CD8+ T细胞在MHC-I介导的通讯网络中维持中心地位,并鉴定了7个预测慢性免疫失调的关键基因 未明确说明未考虑疫苗接种状态、病毒变异株类型及合并症等潜在混杂因素的影响,且样本量相对有限 揭示COVID-19和Long COVID中免疫细胞通讯网络及记忆CD8+ T细胞特征如何维持慢性炎症 来自健康、暴露、感染和住院四种疾病状态的个体外周血单个核细胞 数字病理学 COVID-19和Long COVID 单细胞RNA测序、批量RNA-seq XGBoost、逻辑回归、随机森林等九种机器学习模型 单细胞转录组数据、批量转录组数据 73,110个外周血单个核细胞 NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
364 2026-09-19
Fibroblast-derived interleukin-11 as a potential biomarker for intestinal fibrostenosis in Crohn's disease
2025, Therapeutic advances in gastroenterology IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过转录组分析、公共数据集整合、血清Luminex检测及体外实验,发现成纤维细胞来源的IL11在克罗恩病肠道纤维狭窄组织中高表达,可促进肠道纤维化,并可作为CD纤维狭窄的潜在生物标志物 首次系统性地揭示了IL11在克罗恩病肠道纤维狭窄中的关键作用,结合bulk RNA测序、单细胞RNA测序、血清蛋白检测和体外功能实验多层次验证了IL11作为CD纤维狭窄生物标志物的潜力 摘要中未明确提及研究的具体局限性 探究白细胞介素(IL)在检测克罗恩病相关肠道纤维狭窄中的价值 克罗恩病患者的手术切除肠段组织及血清样本 数字病理学, 机器学习 克罗恩病, 肠道纤维狭窄 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 实时定量PCR, 免疫组化, Luminex液相芯片检测 NA 转录组数据, 图像, 文本 配对克罗恩病手术切除标本(含非病变段和纤维狭窄段) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
365 2026-09-19
Single-cell multi-omics analysis reveals cellular subpopulations associated with relapse in high-risk B-ALL following intensified chemotherapy
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 该研究通过单细胞多组学分析,揭示了高危B-ALL患者强化化疗后与复发相关的细胞亚群。 结合scRNA-seq和scATAC-seq,首次在强化化疗后的高危B-ALL患者中识别出与治疗抵抗相关的HSC/MPP和Pro-B细胞亚群。 研究样本量较小,且仅分析了外周血单个核细胞,未涉及骨髓微环境。 探究高危B-ALL患者强化化疗后复发的分子机制。 儿童高危B-ALL患者和健康对照的外周血单个核细胞。 单细胞多组学 B细胞急性淋巴细胞白血病 scRNA-seq, scATAC-seq NA 单细胞转录组和染色质可及性数据 未明确说明 NA single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq NA NA
366 2026-09-18
A 30-gene classifier distinguishes low-risk MDS HSPCs from healthy HSPCs
2025-Dec, Experimental hematology IF:2.5Q3
研究论文 该研究利用单细胞转录组学表征低危骨髓增生异常综合征(LR-MDS)中造血干祖细胞至髓系分化谱系的细胞状态,并开发了一个30基因评分来区分LR-MDS HSPC与健康HSPC。 开发了一个30基因评分来分类LR-MDS HSPC,并识别了LR-MDS的新分子特征,提示囊泡运输功能障碍。 摘要中未提及 表征LR-MDS中HSPC-髓系分化景观的细胞状态,并发现LR-MDS病理生理学的转化靶点。 低危骨髓增生异常综合征(LR-MDS)患者的造血干祖细胞(HSPC)和髓系分化细胞。 单细胞转录组学 骨髓增生异常综合征 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
367 2026-09-18
Fibroblast-Specific Loss of TGF-β Signaling Mediates Lipomatous Metaplasia in the Infarcted Heart
2025-Nov-18, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究揭示了心肌梗死后成纤维细胞特异性TGF-β信号缺失通过Smad非依赖途径促进成纤维细胞向脂肪细胞转化,导致梗死心脏脂肪浸润的分子机制 首次揭示成纤维细胞特异性TGF-β信号缺失通过Smad非依赖级联介导成纤维细胞向脂肪细胞的转化,阐明了梗死后脂肪性化生的细胞机制 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅限于单细胞RNA测序分析,缺乏直接的功能性验证实验 探究心肌梗死后脂肪性化生的细胞机制,特别是成纤维细胞向脂肪细胞转化的分子通路 小鼠心脏成纤维细胞、心肌梗死小鼠模型、人类心肌梗死患者单细胞RNA测序数据 心血管疾病研究 心血管疾病 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 超声心动图, 组织学研究, 转录组分析 基因敲除小鼠模型 图像, 文本, 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
368 2026-09-18
Microvascular Endothelial Cells License APS Vasculopathy Through YAP1- and CCN2-Mediated Signaling
2025-Nov-04, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序分析APS患者皮肤微血管内皮细胞,揭示YAP1和CCN2介导的信号通路在APS血管病变中的作用 首次揭示APS微血管内皮细胞中YAP1介导的信号激活,并证明YAP1靶点CCN2在促进微血管内皮细胞与血管平滑肌细胞之间的促增殖通讯中发挥关键作用 样本量有限,且主要基于皮肤活检,对其他受累器官(如肾脏、心脏)的机制验证不够充分 阐明APS血管病变的细胞和分子机制,寻找潜在治疗靶点 APS合并网状青斑患者的皮肤活检样本、APS肾病活检样本、健康皮肤微血管内皮细胞、APS患者来源血清或IgG、小鼠模型 单细胞组学 抗磷脂综合征血管病变 单细胞RNA测序、免疫荧光显微镜、ELISA、定量PCR、免疫印迹 NA 单细胞转录组数据、图像、蛋白质定量数据 APS合并网状青斑患者的皮肤活检样本(具体数量未在摘要中说明)、APS肾病活检样本、健康皮肤微血管内皮细胞培养样本、小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
369 2026-09-18
BDNF as a Key Mediator in Eosinophilic Inflammation in CRSwNP: Insights From Transcriptomic and Functional Analysis
2025-11, International forum of allergy & rhinology IF:7.2Q1
研究论文 该研究通过转录组学和功能分析揭示了BDNF在嗜酸性粒细胞型慢性鼻窦炎伴鼻息肉中作为上皮-嗜酸性粒细胞交互关键介导因子的作用 首次系统性地将BDNF定位为CRSwNP中上皮-嗜酸性粒细胞交互的关键调控因子,揭示了Th2细胞因子通过JAK/STAT信号通路上调HNECs中BDNF表达,以及外源性BDNF通过TrkB受体增强嗜酸性粒细胞存活和迁移的机制 摘要中未明确提及研究的局限性 探究BDNF在CRSwNP嗜酸性炎症中的作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 23例鼻黏膜样本和95例鼻分泌物样本,以及原代人鼻上皮细胞(HNECs)和嗜酸性粒细胞 digital pathology 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 bulk RNA-seq, single-cell RNA sequencing, ELISA, immunofluorescence staining, flow cytometry, transwell assay NA 转录组数据, 图像, 文本 23例鼻黏膜样本(bulk RNA-seq),95例鼻分泌物样本(ELISA),单细胞RNA测序样本,原代HNECs及嗜酸性粒细胞 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
370 2026-09-18
Rationale, design and baseline characteristics of REMODEL, a mechanism-of-action trial with semaglutide in people with type 2 diabetes and chronic kidney disease
2025-Oct-30, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
研究论文 本文介绍了REMODEL试验的研究背景、设计方法和基线特征,该试验旨在探索司美格鲁肽在2型糖尿病合并慢性肾脏病患者中的肾脏保护作用机制 采用多管齐下的方法,包括基于MRI的肾脏氧合、灌注和炎症评估,以及肾脏活检组织的单细胞核和空间转录组学分析,以全面揭示司美格鲁肽的肾脏特异性作用机制 样本量相对较小(106例),肾活检亚组仅33例,可能影响统计效能和结果的普遍性 研究司美格鲁肽在2型糖尿病合并慢性肾脏病患者中的肾脏保护作用及其潜在机制 2型糖尿病合并慢性肾脏病的成年患者 数字病理学 慢性肾脏病 MRI、单细胞核转录组学、空间转录组学、病理学检查、组织学评估 NA 图像、文本 106例参与者(其中33例为肾活检亚组) 10x Genomics 单细胞核RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞核RNA测序用于单细胞核转录组学分析,10x Visium用于空间转录组学分析
371 2026-09-18
Temporal Clonal Tracing Reveals Tumor-Intrinsic IFNγ-Dependencies Driving Niche Adaptation and Early Metastatic Colonization
2025-Oct-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该研究利用MetTag单细胞条形码与转录组分析技术结合CRISPR筛选,揭示了肿瘤细胞内在IFNγ信号在转移生态位适应和早期转移定植中的时空调控作用 开发了MetTag方法,结合时间戳批次标识条形码(BC.IDs)和功能性CRISPR筛选,首次在单细胞水平实现时间分辨的克隆追踪,揭示了早期播散克隆在转移生态位中的优先富集现象以及肿瘤内在IFNγ信号驱动转移生态位适应和转移共进化的新机制 摘要中未明确提及研究局限性 解析播散肿瘤细胞(DTCs)在转移生态位中存活和定植的克隆性、时间动态及分子决定因素,阐明肿瘤内在机制与生态位驱动机制之间的相互作用 播散肿瘤细胞(DTCs)、转移生态位、腹膜转移模型、腹水来源的肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) 数字病理学 癌症转移 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CRISPR/Cas9筛选、RNA速率分析、单细胞条形码追踪、深度测序 CRISPR/Cas9敲除模型 图像、文本 NA NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
372 2026-09-18
Profibrotic monocyte-derived alveolar macrophages as a biomarker and therapeutic target in systemic sclerosis-associated interstitial lung disease
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序分析系统性硬化症相关间质性肺病(SSc-ILD)患者及健康对照者的支气管肺泡灌洗液,发现促纤维化单核细胞来源肺泡巨噬细胞(MoAM)和间质巨噬细胞增多与肺纤维化严重程度相关,并可作为SSc-ILD的生物标志物及治疗靶点 首次提出支气管肺泡灌洗液中促纤维化MoAM和间质巨噬细胞的比例可作为SSc-ILD的生物标志物,并揭示了霉酚酸酯治疗对MoAM转录组的影响,同时利用空间转录组学发现SSc-ILD肺外植体中间质巨噬细胞向肺泡腔扩展 样本量较小,仅纳入9例SSc-ILD患者和13例健康对照,需要更大规模的队列研究验证MoAM作为生物标志物的临床实用性 验证SSc-ILD患者支气管肺泡灌洗液中MoAM的存在及比例是否可作为间质性肺病严重程度的生物标志物,并探索其作为治疗靶点的可能性 9例前瞻性入组的SSc-ILD患者和13例健康对照者的支气管肺泡灌洗液样本,以及SSc-ILD肺外植体 数字病理学 间质性肺病 流式细胞术,单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,图像 9例SSc-ILD患者的支气管肺泡灌洗液样本,13例健康对照的支气管肺泡灌洗液样本,以及SSc-ILD肺外植体 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium,10x Visium 10x Chromium单细胞RNA测序平台,10x Visium空间转录组学平台
373 2026-09-18
Mapping Plasmodium transitions and interactions in the Anopheles female
2025-Oct-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 该研究利用单细胞RNA测序技术,分析了疟原虫和按蚊细胞在不同发育阶段和代谢条件下的转录组,揭示了按蚊中肠内疟原虫的发育转变及蚊虫-寄生虫相互作用 首次对疟原虫和按蚊细胞进行单细胞RNA测序,结合共享条形码分析和共聚焦显微镜,揭示了寄生虫与中肠祖细胞的优先相互作用及晚期卵囊与肌肉细胞的紧密连接,并发现转录因子SIP2对子孢子感染人类肝细胞至关重要 摘要中未明确提及研究局限性 探究疟原虫在按蚊中肠内的发育转变和蚊虫-寄生虫相互作用,寻找传播阻断策略的候选靶点 疟原虫(Plasmodium)和按蚊(Anopheles)雌蚊的中肠细胞 单细胞转录组学 疟疾 单细胞RNA测序、共聚焦显微镜 NA 单细胞转录组数据、显微图像 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
374 2026-09-18
Conformal inference for reliable single cell RNA-seq annotation
2025-10-02, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出基于保形预测框架的单细胞RNA测序注释方法,用于检测分布外细胞类型并提供可靠的统计不确定性量化 首次将保形预测框架应用于单细胞RNA测序注释,无需对数据底层分布做任何假设即可提供统计保证;同时处理两个关键挑战:检测查询数据中的分布外细胞类型,以及通过良好校准的预测集进行可靠的不确定性量化 摘要中未明确提及局限性;可能的研究限制包括仅在有限数量的批量实验中验证(10个实验),未在大规模或更多样化的数据集上评估 为单细胞RNA测序的自动细胞类型注释提供可靠的统计不确定性量化方法 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 机器学习 NA 单细胞RNA-seq 保形预测 文本 10个批量实验,来自多种组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
375 2026-09-18
DiSTect: a Bayesian model for disease-associated gene discovery and prediction in spatial transcriptomics
2025-10-02, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种名为DiSTect的贝叶斯收缩模型,通过自回归项纳入组织斑点间的空间相关性,用于空间转录组学中疾病相关基因的发现与预测 提出DiSTect贝叶斯收缩模型,通过自回归项刻画疾病状态在组织斑点间的空间相关性,采用层次结构支持多相关样本分析,并扩展以适应组织内缺失数据;针对不同样本量设计了两套贝叶斯参数估计计算框架 需要针对小样本和大样本分别采用不同的计算框架,可能在实际应用中增加使用复杂度;仅应用于HER2+乳腺癌和阿尔茨海默病两个数据集,泛化能力有待进一步验证 开发一种能够纳入空间相关性、适用于多相关样本及含缺失数据的贝叶斯模型,用于空间转录组学中疾病相关基因的发现与预测 空间转录组学数据中的组织斑点和基因表达,具体应用于HER2+乳腺癌和阿尔茨海默病研究数据 空间转录组学 乳腺癌, 阿尔茨海默病 空间转录组学 贝叶斯收缩模型, 自回归模型, 层次模型 图像, 文本 NA NA 空间转录组学 NA NA
376 2026-09-18
CLUEY enables knowledge-guided clustering and cell type detection from single-cell omics data
2025-10-02, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出知识引导的框架CLUEY,用于单细胞组学数据的细胞类型检测和聚类 将先验生物学知识整合到聚类过程中,提供最佳聚类数目的指导,增强结果的可解释性 未明确提及 解决单细胞组学数据聚类中由于降维方法和参数选择导致细胞类型数目差异大,以及手动注释主观性的问题 单细胞组学数据,包括单模态(scRNA-seq、scATAC-seq)和多模态(CITE-seq、SHARE-seq)数据集 机器学习 NA 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序,CITE-seq,SHARE-seq NA 基因表达谱,表观遗传谱,多模态数据 NA NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq,单细胞多组学 NA NA
377 2026-09-18
CREBBP Mutation as a Culprit for Negative SSTR2 PET in Neuroendocrine Tumors
2025-10, Molecular imaging and biology IF:3.0Q2
研究论文 本研究通过整合全外显子组测序和单细胞RNA测序,揭示了CREBBP突变与神经内分泌肿瘤中68Ga-DOTATATE PET阴性结果及SSTR2表达降低之间的关联 首次发现CREBBP突变在SSTR2阴性/低表达神经内分泌肿瘤中高频出现,频率接近MEN1、PTEN、RB1等已知NET驱动突变,并首次提出CREBBP突变可能改变SSTR2表达从而导致68Ga-DOTATATE PET假阴性 样本量较小(仅18例患者),为回顾性研究,CREBBP突变调控SSTR2表达的具体分子机制尚未通过功能实验验证 阐明神经内分泌肿瘤中68Ga-DOTATATE PET显像阴性的分子和遗传因素,探索PET阴性结果与基因突变之间的相互作用 18例肺、回肠或胰腺神经内分泌肿瘤患者,这些患者在初始诊断检查中接受了68Ga-DOTATATE和18F-FDG PET/CT扫描 数字病理学 神经内分泌肿瘤 全外显子组测序, 单细胞RNA测序 NA 图像, 文本 18例神经内分泌肿瘤患者 NA 全外显子组测序, 单细胞RNA测序 NA NA
378 2026-09-18
RELA Haploinsufficiency Manifesting as an Atypical Phenotype of Crohn's Disease
2025-10-01, Inflammatory bowel diseases IF:4.5Q1
研究论文 该研究报告了一例由RELA单倍剂量不足导致的非典型克罗恩病样表型患者的临床、基因组和免疫学特征 首次将RELA单倍剂量不足与非典型克罗恩病样表型联系起来,揭示了Th1/Th17极化和干扰素驱动的炎症机制 仅基于单个病例的研究,样本量有限,需要更多病例验证 描述由RELA单倍剂量不足驱动的非典型克罗恩病样表型患者的临床、基因组和免疫学特征 一名17岁男性患者,诊断为全肠型克罗恩病、肛周瘘、慢性黏膜皮肤念珠菌病和慢性淋巴细胞减少症 数字病理学 克罗恩病 全外显子组测序,Sanger测序,蛋白质建模,Western blotting,免疫荧光,基于核提取物的NF-κB激活测定,质谱流式细胞术(CyTOF),单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因组数据,蛋白质数据,图像,文本 1名患者 NA 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 NA NA
379 2026-09-18
Spatial transcriptomics elucidates localized immune responses in atherosclerotic coronary artery
2025-10, EMBO molecular medicine IF:9.0Q1
研究论文 本研究利用GeoMx和CosMx空间转录组技术分析不同动脉粥样硬化病变严重程度的人冠状动脉连续切片,揭示局部免疫反应的空间组织特征 结合GeoMx和CosMx两种空间转录组平台,在单细胞水平上无偏倚地解析人冠状动脉粥样硬化病变中免疫细胞的空间组织和分子通路 摘要中未明确说明样本量大小及具体的技术局限性 阐明免疫细胞在动脉粥样硬化进展过程中的空间组织特征和作用,以发现新的治疗靶点,减少心血管事件负担 不同动脉粥样硬化病变严重程度患者的人冠状动脉组织 空间转录组学 心血管疾病 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NanoString 空间转录组学 GeoMx, CosMx GeoMx数字空间分析平台和CosMx空间分子成像仪
380 2026-09-18
GNAS/PKA signaling promotes aberrant osteochondral differentiation of Gli1+ tendon sheath progenitors
2025-Oct, The EMBO journal
研究论文 该研究发现小鼠跟腱切断后Gli1+腱鞘细胞扩增并分化为腱性和骨软骨细胞,通过单细胞RNA测序和谱系追踪揭示其起源于Scx+肌腱干/祖细胞,并证明GNAS/PKA信号通路激活促进异位骨化 首次鉴定Gli1+腱鞘祖细胞具有骨软骨分化能力,并揭示GNAS/PKA信号通路在该过程中的关键作用,提出PKA作为治疗肌腱骨化的潜在靶点 研究主要基于小鼠模型,人类肌腱干细胞实验有限,GNAS/PKA信号通路的具体下游机制尚未完全阐明 探究肌腱损伤后异位骨化过程中腱鞘祖细胞的骨软骨分化机制 小鼠跟腱切断模型中的Gli1+腱鞘细胞、Scx+肌腱干/祖细胞及人类肌腱干细胞 单细胞转录组学, 干细胞生物学, 骨生物学 肌腱骨化, 异位骨化 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 遗传抑制 NA 单细胞转录组数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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