单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 10572 篇文献,本页显示第 3761 - 3780 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3761 2025-12-09
Correction: Identification of novel lipid metabolism-related biomarkers of aortic dissection by integrating single-cell RNA sequencing analysis and machine learning algorithms
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
correction 本文是对先前一篇关于整合单细胞RNA测序分析和机器学习算法识别主动脉夹层新型脂质代谢相关生物标志物文章的更正 NA NA NA NA NA 主动脉夹层 单细胞RNA测序 机器学习算法 NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3762 2025-12-08
Regenerative teeth induced by in vitro mesenchymal cells in mice via repressing BMP4 and activating retinoic acid/osteopontin
2025-Dec-05, Cell regeneration (London, England)
研究论文 本研究开发了一种优化的N2B27培养基,成功在小鼠中通过抑制BMP4和激活视黄酸/骨桥蛋白,诱导了体外培养的牙间充质细胞再生牙齿 开发了能维持牙间充质细胞成牙潜能长达14天的优化培养基,显著优于传统方法(≤24小时),并揭示了BMP4抑制和骨桥蛋白/视黄酸激活在牙齿再生中的关键机制 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类细胞或临床环境中验证,且培养基的长期效果和安全性需进一步评估 研究牙齿再生中牙间充质细胞的体外培养和功能维持,以推进组织工程应用 小鼠牙间充质细胞(mDMCs) 组织工程与再生医学 牙齿疾病或缺失 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3763 2025-12-08
Human peripheral osteoclast-precursor-development patterns reveal the significance of RPS17-dependent ribosome synthesis to Ankylosing Spondylitis lesions
2025-Dec-04, Bone research IF:14.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了强直性脊柱炎(AS)患者外周血中破骨细胞前体(OCP)发育模式的改变,并发现RPS17依赖性核糖体合成在AS病变中的关键作用 首次在AS患者外周血单核细胞中系统描绘了OCP发育轨迹,并识别出RPS17依赖性核糖体合成作为AS病变的核心机制,同时提出RPS17过表达的单核性OCP具有治疗潜力 研究样本量有限,且主要基于外周血分析,未深入探讨局部关节微环境的影响 阐明AS条件下破骨细胞前体发育模式的变化及其在AS病变中的作用 健康供体和AS患者(早期、加重期和缓解期)的外周血单核细胞(PBMCs) 单细胞转录组学 强直性脊柱炎 单细胞转录组测序 轨迹分析 单细胞RNA-seq数据 健康供体和AS患者(早期、加重期和缓解期)的PBMCs样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3764 2025-12-08
Pan-cancer gene set discovery via scRNA-seq for optimal deep learning based downstream tasks
2025-Dec-02, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究提出了一种通过整合单细胞RNA测序数据和先进分析技术,为癌症基因组学下游任务进行特征选择的稳健方法 首次提出利用单细胞RNA测序数据推导的基因集在泛癌研究中优于基于批量RNA测序选择的基因集,并整合hdWGCNA和XGBoost进行特征选择 研究仅分析了13种癌症类型的181个肿瘤活检样本,样本量和癌症类型覆盖范围可能有限 开发优化的基因集选择方法以提高泛癌下游任务的预测准确性 13种癌症类型的肿瘤活检样本及TCGA泛癌RNA测序数据 机器学习 泛癌研究 单细胞RNA测序,批量RNA测序 多层感知机,图神经网络,XGBoost 转录组数据 181个肿瘤活检样本(来自13种癌症类型) NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
3765 2025-12-08
Deciphering the liver's role in pancreatic cancer metastasis: pathways and therapeutic approaches
2025-Dec-02, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
综述 本文综述了胰腺导管腺癌肝转移的机制,重点关注肝脏作为转移前微环境的形成过程及其分子通路 结合空间组织学图谱、单细胞测序等前沿技术,重新审视并批判性评估了Paget的‘种子与土壤’假说在肝转移微环境研究中的适用性 作为一篇综述文章,主要基于现有文献进行分析,未提出新的原始实验数据或临床验证 深入理解胰腺导管腺癌肝转移的生物学机制,为开发靶向治疗和改善临床预后提供理论基础 胰腺导管腺癌(PDAC)及其肝转移病灶 数字病理学 胰腺癌 空间组织学图谱、单细胞测序、分子标记物鉴定 NA 组织切片、测序数据、分子标记数据 NA NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
3766 2025-12-08
Abatacept restores dysregulated transcriptomic and proteomic profile in disorders of CTLA-4 insufficiency
2025-Dec, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过多组学方法探究了阿巴西普治疗对LRBA缺陷和CTLA-4功能不全患者免疫系统的影响 首次采用整合纵向流式细胞术、靶向及单细胞转录组学与血浆蛋白质组学的多模态方法,揭示了阿巴西普治疗逆转免疫失调的新机制 研究样本可能较小,且为罕见疾病,结果推广需谨慎 探究阿巴西普在LRBA缺陷和CTLA-4功能不全疾病中的免疫调节作用 LRBA缺陷和CTLA-4功能不全患者 生物信息学 原发性免疫失调疾病 纵向流式细胞术、靶向转录组学、单细胞RNA测序、血浆蛋白质组学 NA 转录组数据、蛋白质组数据、流式细胞数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3767 2025-12-08
Decoding immune aging at single-cell resolution
2025-Dec, Trends in immunology IF:13.1Q1
综述 本文综述了单细胞测序技术在解码免疫衰老方面的应用,重点分析了年龄相关的细胞组成和功能变化 利用单细胞多组学技术绘制人类生命周期中的免疫轨迹,揭示了外周免疫细胞中先前未被认识的异质性和功能转变 存在显著的技术和分析挑战,包括跨平台和跨人群的数据整合问题 通过单细胞分辨率解码免疫衰老,以实现免疫衰老的早期检测、个性化免疫调节和延长健康寿命的精准策略 人类外周免疫细胞 数字病理学 老年疾病 单细胞测序 NA 单细胞多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 NA NA
3768 2025-12-08
Integrated multi-omics identifies GZMA targeting NK cells as a novel therapeutic strategy for hidradenitis suppurativa
2025-Dec, SLAS technology IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过整合批量转录组学、孟德尔随机化和单细胞转录组分析,确定了GZMA作为化脓性汗腺炎(HS)的潜在治疗靶点,并揭示了NK细胞在疾病发病机制中的关键作用 首次通过多组学整合方法将GZMA确定为HS的核心治疗靶点,并利用单细胞测序技术揭示了GZMA在NK细胞中的特异性表达及其与T细胞、B细胞的通讯差异 研究主要基于生物信息学分析和公开数据集,缺乏体内或体外实验验证;样本量可能有限,且孟德尔随机化分析可能存在残留混杂因素 阐明化脓性汗腺炎的发病机制并开发基于患者免疫特征的精准干预策略 化脓性汗腺炎(HS)患者及相关生物样本 生物信息学 皮肤病 批量转录组学、孟德尔随机化、单细胞转录组测序、分子对接模拟 WGCNA、LASSO回归、IVW、加权中位数、简单模式、加权模式、贝叶斯MR 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3769 2025-12-08
Single-cell RNA sequencing reveals tumor cell and immune cell variations associated with lymphatic metastasis in papillary thyroid cancer
2025-Dec-01, Endocrine connections IF:2.6Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了甲状腺乳头状癌中与淋巴转移相关的肿瘤细胞和免疫细胞变异 首次在单细胞水平上系统分析了PTC中淋巴转移相关的细胞异质性和细胞间通讯变化,特别是识别了CD8+驻留记忆T细胞在淋巴转移中的关键调控作用 样本量较小(仅6例患者),缺乏外部验证队列,且仅基于转录组数据 探究甲状腺乳头状癌中淋巴转移的细胞分子机制 甲状腺乳头状癌患者的肿瘤组织样本 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 6例PTC患者的肿瘤样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3770 2025-12-08
Single-cell transcriptomics reveals stepwise transformation of epithelial cells into Non-Professional Phagocytes
2025-Dec, PLoS genetics IF:4.0Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学揭示了果蝇卵巢上皮细胞分化为非专业吞噬细胞的逐步转化过程 通过Notch信号激活模型,结合单细胞RNA测序和轨迹分析,首次定义了NPP成熟的三个转录阶段,并鉴定了JNK-Jra-Arp2/3轴作为细胞骨架重塑的关键调控通路 研究基于果蝇模型,其机制在哺乳动物中的保守性尚未验证,且功能实验主要聚焦于JNK通路,其他潜在调控因子可能未被全面探索 探究上皮细胞向非专业吞噬细胞分化的遗传调控机制 果蝇卵巢上皮细胞(卵泡细胞) 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序,轨迹分析,SCENIC分析,ChIP-seq,免疫染色 NA 单细胞转录组数据,染色质免疫沉淀数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3771 2025-12-08
ZBTB16 promotes the transcription of glycolytic enzyme PFKFB2 to participate in fibrogenesis in septic lung injury
2025-Dec, Molecular immunology IF:3.2Q3
研究论文 本研究探讨了转录因子ZBTB16在脓毒症肺损伤纤维化中的作用,通过单细胞测序和基因集富集分析发现ZBTB16通过促进糖酵解酶PFKFB2的转录参与纤维化过程 首次揭示ZBTB16通过调控PFKFB2介导的糖酵解途径参与脓毒症肺损伤纤维化的分子机制 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,缺乏临床样本验证,且具体信号通路细节需进一步探索 探究ZBTB16在脓毒症肺损伤纤维化中的功能及其分子机制 LPS诱导的ALI小鼠模型、MRC-5细胞和原代成纤维细胞 单细胞测序 脓毒症肺损伤 单细胞测序,基因集富集分析(GSEA) NA 基因表达数据 未明确具体样本数量,涉及小鼠模型和细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3772 2025-12-08
FLT3LG as an inflammatory hub bridging tumor immune surveillance to therapy response in breast cancer
2025-Oct-29, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和炎症基因网络分析,发现FLT3LG作为乳腺癌中关键的炎症枢纽,连接肿瘤免疫监视与治疗反应,并评估其作为预后和治疗靶点的潜力 首次基于单细胞RNA测序和炎症基因网络分析,将FLT3LG识别为乳腺癌中连接免疫监视与治疗反应的关键炎症枢纽,并揭示其与特定基因突变模式(如PIK3CA和TP53)及免疫检查点抑制剂反应的关联 研究主要基于相关性分析,缺乏直接的体内或体外功能验证实验来证实FLT3LG的因果作用机制 探索乳腺癌中炎症驱动的免疫失调机制,并寻找新的预后标志物和治疗靶点 乳腺癌患者队列及其肿瘤组织样本 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序,基因网络分析 NA RNA测序数据,基因表达数据 多个患者队列(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3773 2025-12-08
Positionally distinct interferon-stimulated dermal immune-acting fibroblasts promote neutrophil recruitment in Sweet syndrome
2025-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学技术,揭示了Sweet综合征皮肤中干扰素激活的成纤维细胞在促进中性粒细胞招募中的关键作用 首次在Sweet综合征中识别出位置不同的干扰素激活成纤维细胞亚群,并阐明其通过I型干扰素识别和趋化因子表达驱动中性粒细胞浸润的机制 研究基于存档临床样本,样本量有限;功能验证主要在体外细胞培养中进行,缺乏体内模型验证 阐明Sweet综合征的细胞和分子景观,特别是中性粒细胞浸润的机制 Sweet综合征、坏疽性脓皮症患者及健康对照的皮肤样本 数字病理学 皮肤疾病 单细胞转录组学、空间转录组学、bulk RNA-seq NA 转录组数据、空间定位数据 存档临床皮肤样本(Sweet综合征、坏疽性脓皮症患者及健康对照) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
3774 2025-12-08
Decoding the distinct immune landscape and possible regulatory mechanisms of autoimmune hepatitis through integrated single-cell and bulk RNA sequencing
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序,解码了自身免疫性肝炎的独特免疫景观和可能的调控机制 整合单细胞和批量RNA测序数据,识别了AIH中失调的免疫细胞群、信号通路及潜在治疗靶点 数据来源于公共数据库,可能受样本来源和测序技术限制,未进行实验验证 解码自身免疫性肝炎的免疫景观和调控机制 自身免疫性肝炎患者 数字病理学 自身免疫性肝炎 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
3775 2025-12-08
Single cell RNA sequencing reveals a dysbalance of proinflammatory vs. immunosuppressive dendritic cells in mouse and human aortic aneurysms
2025, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠和人类主动脉瘤中促炎性与免疫抑制性树突状细胞的失衡状态 首次通过单细胞RNA测序整合分析,系统表征了主动脉瘤中树突状细胞的异质性,并定义了新的DC3亚型及其促炎表型 研究主要基于动物模型数据向人类疾病转化,需要进一步的人类样本验证 探究树突状细胞在主动脉瘤发病机制中的具体作用 小鼠主动脉瘤模型和人类主动脉瘤组织 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 多个小鼠AA模型及人类AA样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3776 2025-12-08
Comprehensive analysis of the role of diverse programmed cell death patterns in sepsis
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合公共转录组数据与独立验证队列,系统分析了脓毒症中多种程序性细胞死亡模式的作用,并开发了诊断风险评分 首次系统整合公共微阵列、单细胞转录组数据及独立高通量测序验证,全面揭示了脓毒症中铁死亡、双硫死亡、NETosis和胞吞性死亡四种关键失调的PCD通路,并确定了单核细胞作为整合PCD、代谢重编程和免疫通讯的核心枢纽 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质或功能层面的直接验证;样本量相对有限,且部分数据来自公共数据库,可能存在批次效应 系统表征脓毒症中多样化的程序性细胞死亡模式及其临床相关性,以寻找新的诊断标志物和治疗靶点 脓毒症患者和健康对照的转录组数据(包括公共数据集和独立队列) 生物信息学 脓毒症 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 微阵列 LASSO回归 转录组数据 公共数据集:81名对照,165名脓毒症患者;单细胞数据集:4名对照,4名早期脓毒症患者,共52,315个细胞;外加一个独立的RNA-seq验证队列 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3777 2025-12-08
R3HDM4 influences kidney renal clear cell carcinoma progression, immune modulation, and potential links to the IGSF8 immune checkpoint
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了R3HDM4基因在肾透明细胞癌中的致癌作用、免疫调节功能及其与免疫检查点IGSF8的潜在联系 首次通过整合多组学数据系统评估R3HDM4在KIRC中的预后价值,并发现其通过调控EMT和免疫微环境影响肿瘤进展,同时揭示了与IGSF8免疫检查点的潜在关联 IGSF8在免疫检查点调控中的作用仍属推测,需要进一步实验验证;研究主要基于生物信息学分析,临床样本验证相对有限 阐明R3HDM4在肾透明细胞癌发病机制中的作用,探索其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 肾透明细胞癌组织样本、癌细胞系、肿瘤微环境中的免疫细胞 生物信息学 肾癌 单细胞RNA测序、免疫组化、Western印迹、RT-qPCR、siRNA敲低 NA 基因表达数据、临床数据、DNA甲基化数据、免疫浸润数据 来自TCGA、GEO、ArrayExpress、ICGC等多个数据库的KIRC样本数据,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3778 2025-12-08
Disc inflammation and intercellular communication in shaping the immune microenvironment of intervertebral disc degeneration
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组转录组和单细胞RNA-seq数据,结合生物信息学分析和体外验证,识别了与椎间盘退变相关的关键生物标志物及其免疫调控作用 整合了多种生物信息学方法(如SHAP、孟德尔随机化、CellChat分析)和单细胞RNA-seq数据,系统性地揭示了MMP9、HPGD和UCHL1作为IDD关键生物标志物的作用,并首次强调了MIF信号通路在髓核细胞与免疫细胞互作中的关键角色 研究主要基于生物信息学分析和体外验证,缺乏体内实验或临床样本的广泛验证,可能限制其直接临床转化性 探究椎间盘退变的分子和免疫机制,识别诊断和治疗潜在靶点 椎间盘退变相关的基因和免疫细胞 数字病理学 老年疾病 单细胞RNA-seq, Western blot ANN, LASSO, 随机森林, SVM-RFE 转录组数据, 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3779 2025-12-08
Prognostic differential subpopulation classification and immunotherapy response prediction in pancreatic cancer patients based on the gene features of necrotizing apoptosis
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究基于坏死性凋亡相关基因特征,对胰腺癌患者进行预后亚群分类并预测免疫治疗反应 通过多组学数据(包括单细胞数据集、孟德尔随机化和空间转录组学分析)揭示CHST11作为关键预后生物标志物与坏死性凋亡及胰腺癌恶性预后的关联 NA 探索坏死性凋亡相关基因在胰腺癌中的预后意义 胰腺癌患者 生物信息学 胰腺癌 聚类分析、差异表达分析、Spearman相关分析、孟德尔随机化、空间转录组学 预后模型 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
3780 2025-12-08
Integrated multi-omics reveals GABARAP-mediated mitophagy and pyruvate metabolism as key drivers of osteosarcoma progression
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和多组学分析,揭示了GABARAP介导的线粒体自噬与丙酮酸代谢在骨肉瘤进展中的关键驱动作用 首次系统性地将GABARAP、线粒体自噬和丙酮酸代谢在骨肉瘤中联系起来,并揭示了其通过代谢适应和免疫逃逸促进肿瘤进展的机制 研究主要基于公共数据集和体外实验,缺乏体内模型验证;样本量有限,且未涉及治疗干预的临床前评估 探究骨肉瘤中细胞异质性、肿瘤微环境特征以及线粒体自噬与代谢的相互作用机制 骨肉瘤细胞、肿瘤微环境中的免疫细胞(T细胞、NK细胞、Tregs、M2巨噬细胞) 生物信息学、肿瘤生物学 骨肉瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合分析、体外功能实验 NA 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、公共基因表达数据集 多个公共数据集(GSE162454, GSE237070, TARGET, GSE21257, GSE32981) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
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