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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3761 | 2025-10-15 |
Single-cell multi-omics analysis reveals the mechanism of action of a novel antioxidant polyphenol nanoparticle loaded with STAT3 agonist in mediating cardiomyocyte ferroptosis to ameliorate age-related heart failure
2025-Mar-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03317-x
PMID:40158134
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析探究了负载STAT3激动剂的抗氧化多酚纳米颗粒通过介导心肌细胞铁死亡改善年龄相关性心力衰竭的作用机制 | 开发了新型抗氧化多酚纳米颗粒PN@Col,首次结合单细胞RNA测序和AUCell分析揭示STAT3在心力衰竭中的关键作用,并验证其通过减轻氧化应激和铁死亡改善心脏功能 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化仍需进一步验证;样本规模有限 | 探究新型纳米颗粒治疗剂对年龄相关性心力衰竭的治疗效果及作用机制 | 心肌细胞、老年心力衰竭小鼠模型 | 单细胞多组学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序、AUCell分析、细胞实验、动物实验 | NA | 基因表达数据、实验数据 | 老年心力衰竭小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3762 | 2025-10-15 |
Data-driven fine-grained region discovery in the mouse brain with transformers
2025-Feb-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.05.592608
PMID:38766132
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研究论文 | 提出一种基于Transformer的自监督空间域检测工作流程CellTransformer,用于小鼠大脑精细区域发现 | 开发了新颖的编码器-解码器架构CellTransformer,能够分层学习组织特征,并实现多百万细胞数据集的扩展分析 | NA | 解决器官尺度空间转录组数据分析中的关键瓶颈,实现精细组织空间域的检测 | 小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,自监督学习 | Transformer,编码器-解码器架构 | 空间转录组数据 | 900万细胞,200多个组织切片,4只小鼠 | NA | 空间转录组学,MERFISH,Slide-seqV2 | NA | NA |
| 3763 | 2025-10-15 |
Resident synovial macrophages in synovial fluid: Implications for immunoregulation
2025-Feb, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110422
PMID:39701169
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术鉴定滑液中的常驻滑膜巨噬细胞,探讨其在滑膜屏障完整性评估和炎症性关节炎中的作用 | 首次在人类滑液中鉴定常驻滑膜巨噬细胞,并建立新型体外组织块模型验证发现 | 研究未明确这些细胞在滑膜屏障破坏后是否持续或引发慢性炎症 | 研究常驻滑膜巨噬细胞在滑液中的存在及其与滑膜屏障完整性的关联 | 人类滑液样本和滑膜组织 | 免疫学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序 | 体外组织块模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3764 | 2025-10-11 |
Reduced Availability of Essential Amino Acids Disrupts Differentiation of Anorexigenic POMC Neurons in the Fetal Rat Hypothalamus
2025-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05201-z
PMID:40681826
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研究论文 | 本研究探讨妊娠期蛋白质限制对胎儿下丘脑发育的影响,特别是对调节食欲和能量平衡的神经元群体形成的影响 | 首次揭示必需氨基酸减少通过mTOR信号通路和表观遗传机制选择性破坏ISL1前体细胞向POMC神经元分化 | 仅研究了特定发育窗口期,需要进一步研究其他发育阶段 | 探究宫内生长受限与长期代谢紊乱风险的机制联系 | 妊娠期蛋白质限制的大鼠模型及其胎儿下丘脑发育 | 发育生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序, EdU标记, 免疫组织化学, RNAscope, mTOR信号分析, DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据, 组织图像, 甲基化数据 | 妊娠15天和17天的大鼠胎儿下丘脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3765 | 2025-10-11 |
Epigenetic dynamics and molecular mechanisms in oncogenesis, tumor progression, and therapy resistance
2025-Oct, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04217-5
PMID:40358685
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综述 | 本文综述了癌症发生发展过程中遗传、表观遗传和分子机制的动态相互作用,重点关注肿瘤发生、转移和治疗抵抗的关键分子通路 | 整合了分子、遗传和表观遗传多维度视角,强调肿瘤微环境在癌症进展中的作用,并探讨CRISPR-Cas9表观基因组编辑和单细胞RNA测序等前沿技术的应用 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献综合分析 | 阐明癌症发生发展、转移和治疗抵抗的分子机制,为开发创新靶向治疗方法提供理论基础 | 癌症细胞及其分子调控机制,包括肿瘤微环境 | 癌症生物学 | 癌症 | CRISPR-Cas9表观基因组编辑,单细胞RNA测序 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3766 | 2025-10-11 |
Engineering CRISPR System-Based Bacterial Outer Membrane Vesicle Potentiates T Cell Immunity for Enhanced Cancer Immunotherapy
2025-Oct, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202501565
PMID:40495695
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研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPR系统的工程化细菌外膜囊泡,用于增强T细胞免疫以改善癌症免疫治疗 | 通过工程化改造大肠杆菌BL21来源的外膜囊泡,实现了多基因的高效包装和递送,显著增强了T细胞的趋化和活化能力 | 研究主要在小鼠模型中进行验证,在人类患者中的有效性和安全性仍需进一步评估 | 开发新型癌症免疫治疗策略,克服免疫检查点阻断治疗的局限性 | 细菌外膜囊泡(OMVs)、T细胞免疫、癌症免疫治疗 | 生物医学工程 | 膀胱癌、乳腺癌 | CRISPR系统、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | MB49和B16F10小鼠肿瘤模型、人源化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3767 | 2025-10-11 |
Precision Medicine in Surgery: Immunomodulation and Cellular Regeneration Strategies for Immunologic and Surgical Diseases
2025-Oct-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000006849
PMID:40698837
|
研究论文 | 本文提出了一种研究lacritin肽对β细胞增殖、胰岛存活和免疫调节作用的方法学框架 | 首次结合体外和体内模型系统研究lacritin肽在免疫调节和细胞再生中的双重作用 | 研究仍处于临床前阶段,需要进一步验证其在人类疾病治疗中的效果 | 开发针对免疫性和外科疾病的精准医疗策略 | 胰岛β细胞、免疫细胞、糖尿病小鼠模型 | 精准医疗 | 自身免疫疾病、糖尿病、克罗恩病、心力衰竭、肺纤维化、慢性肾病、神经损伤 | 质谱流式细胞术、成像质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、体外胰岛测试、体内移植 | NA | 单细胞测序数据、质谱数据、影像数据 | 非肥胖糖尿病小鼠模型和糖尿病小鼠受体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3768 | 2025-10-11 |
CRISPR for cystic fibrosis: Advances and insights from a systematic review
2025-Sep-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.06.021
PMID:40534129
|
系统综述 | 本文系统综述了基于CRISPR的基因编辑技术在囊性纤维化治疗中的应用进展 | 通过跨研究比较分析27篇研究文章,系统评估了不同CRISPR技术对CFTR基因突变的编辑效率和功能恢复效果 | 缺乏编辑效率和功能恢复的标准化报告,需要更多单细胞RNA测序和体内研究来获得临床相关结论 | 为基于CRISPR的基因编辑方法在囊性纤维化治疗中的进一步探索提供技术见解 | 囊性纤维化致病突变和CFTR基因 | 基因编辑 | 囊性纤维化 | CRISPR基因编辑技术,包括同源定向修复、碱基编辑和引物编辑 | NA | 文献数据 | 27篇研究文章,涉及超过15种CF致病突变 | NA | NA | NA | NA |
| 3769 | 2025-10-11 |
Inhibition of methylthioadenosine phosphorylase protects from experimental acute kidney injury
2025-Aug-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00138.2025
PMID:40602784
|
研究论文 | 本研究通过抑制甲基硫代腺苷磷酸化酶(MTAP)在小鼠急性肾损伤模型中展示保护作用 | 首次证明MTAP抑制在实验性急性肾损伤中的保护作用,并通过单细胞RNA测序在人类AKI活检中验证其表达特征 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅为观察性分析,缺乏临床干预验证 | 探索MTAP抑制对急性肾损伤的保护机制及治疗潜力 | 小鼠急性肾损伤模型和人类肾脏单细胞RNA测序数据 | 肾脏病学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | 基因表达数据,组织病理学数据 | 小鼠实验模型和人类肾脏活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3770 | 2025-10-11 |
Kidney organoids demonstrate that PTH1R drives a cystogenic cAMP-pPKA-pCREB axis in developmental polycystic kidney disease
2025-Aug-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00056.2025
PMID:40602764
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研究论文 | 本研究利用肾脏类器官模型揭示了PTH1R在发育性多囊肾病中驱动囊肿形成的cAMP-pPKA-pCREB信号轴 | 首次发现PTH1R作为G蛋白偶联受体在发育性多囊肾病中启动囊肿形成信号级联反应 | 研究主要基于体外类器官模型,缺乏体内验证 | 探索发育性多囊肾病的囊肿形成机制和潜在治疗靶点 | 人类诱导多能干细胞衍生的ARPKD类器官、等基因野生型类器官、人类ARPKD组织 | 发育生物学 | 多囊肾病 | 单细胞RNA测序、靶向机制研究 | 肾脏类器官模型 | 基因表达数据、组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3771 | 2025-10-08 |
The transcription factor LHX2 mediates and enhances oncogenic BMP signaling in medulloblastoma
2025-Oct, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-025-01488-6
PMID:40148468
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子LHX2在髓母细胞瘤中介导并增强致癌性BMP信号通路的分子机制 | 首次发现LHX2通过转录诱导BMP I型受体ACVR1表达,形成BMP信号的正反馈环路,并证实其在肿瘤干细胞特性和化疗耐药中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,临床转化价值需进一步验证 | 探索BMP信号通路在髓母细胞瘤中的作用机制 | 髓母细胞瘤患者来源的肿瘤样本和细胞模型 | 癌症生物学 | 髓母细胞瘤 | 空间转录组学、转录组分析、免疫组织化学、细胞移植 | 小鼠异种移植模型 | 基因表达数据、蛋白质定位数据 | 多个髓母细胞瘤亚组的患者来源肿瘤样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3772 | 2025-10-08 |
Dual states of murine Bmi1-expressing intestinal stem cells drive epithelial development utilizing non-canonical Wnt signaling
2025-Aug-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.03.014
PMID:40262610
|
研究论文 | 本研究揭示了小鼠肠道发育早期Bmi1表达干细胞通过非经典Wnt信号调控上皮发育的动态过程 | 首次发现Bmi1细胞在Lgr5+肠道干细胞出现前的发育早期作为功能干细胞存在,并揭示其通过非经典Wnt信号调控增殖状态转变 | 研究仅限于小鼠模型,人类肠道发育的相似性尚未验证 | 阐明肠道发育过程中干细胞亚型的动态调控机制 | 小鼠肠道干细胞(Bmi1+和Lgr5+ ISCs) | 发育生物学 | NA | 谱系追踪,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,细胞谱系数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3773 | 2025-10-08 |
AI-Driven Analysis Unveils Functional Dynamics of Müller Cells in Retinal Autoimmune Inflammation
2025-May-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640907
PMID:40093069
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研究论文 | 通过AI驱动的单细胞RNA测序分析揭示视网膜自身免疫炎症中Müller细胞的功能动态 | 首次使用AI辅助工具SCassist系统分析Müller细胞亚群功能,发现活化Müller细胞表达免疫检查点分子调控Th1细胞活性的新机制 | 研究基于Aire-/-小鼠模型,结果在人类视网膜中的适用性需要进一步验证 | 探究视网膜自身免疫炎症中Müller细胞的功能特性和与T细胞的相互作用 | Aire-/-小鼠视网膜中的Müller细胞和T细胞 | 单细胞转录组学 | 视网膜自身免疫炎症 | 单细胞RNA测序 | AI辅助分析工作流 | 单细胞转录组数据 | Aire-/-小鼠视网膜scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3774 | 2025-10-08 |
Machine learning predictions from unpredictable chaos
2025-Mar-19, ArXiv
PMID:40166748
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研究论文 | 本文提出了一种名为混沌学习的新型多尺度拓扑范式,能够从混沌系统中实现准确预测 | 首次引入混沌学习概念,通过多尺度拓扑拉普拉斯算子将现实世界数据嵌入混沌动力系统,实现了对混沌系统的定量预测 | 仅使用了28个数据集和两种混沌动力系统进行概念验证,需要更多样化的数据集和系统验证 | 探索混沌系统的可预测性并建立拓扑、混沌与学习之间的桥梁 | 脑电波、蛋白质数据集、单细胞RNA测序数据和图像数据 | 机器学习 | NA | 多尺度拓扑拉普拉斯算子 | 混沌学习模型 | 脑电波、蛋白质数据、单细胞RNA测序数据、图像数据 | 28个数据集(10个脑电波、4个蛋白质数据集、13个单细胞RNA测序数据集、1个图像数据集) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3775 | 2025-10-08 |
Causal differential expression analysis under unmeasured confounders with causarray
2025-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.30.635593
PMID:39975097
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研究论文 | 提出causarray框架,用于在存在未测量混杂因素的情况下进行因果差异表达分析 | 开发了双重稳健的因果推断框架,整合广义混杂调整方法和半参数推断,能有效分离处理效应与混杂因素 | NA | 解决观察性基因组数据中因果关系识别的挑战 | 阵列基因组数据,包括批量细胞和单细胞水平的数据 | 生物信息学 | 自闭症, 阿尔茨海默病 | 单细胞测序, CRISPR技术, Perturb-seq | 机器学习, 半参数推断 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3776 | 2025-10-07 |
scSTD: A Swin Transformer-Based Diffusion Model for Recovering scRNA-Seq Data
2025-Oct, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3570265
PMID:40366848
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研究论文 | 提出一种基于Swin Transformer和扩散模型的单细胞RNA测序数据恢复方法scSTD | 首次将Swin Transformer架构与潜在扩散模型相结合用于scRNA-seq数据恢复 | 未明确说明方法在特定细胞类型或实验条件下的性能限制 | 解决单细胞RNA测序数据中的dropout事件和技术噪声问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Swin Transformer, 扩散模型, 自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3777 | 2025-10-07 |
Transcriptomic profiling of vitiligo patients shows polar immune dysregulation in involved and uninvolved skin
2025-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.06.002
PMID:40513622
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研究论文 | 通过转录组分析揭示白癜风患者皮损和非皮损区域存在极化的免疫失调现象 | 首次全面揭示白癜风不仅皮损区域存在TH1/干扰素驱动的免疫异常,非皮损区域也表现出明显的TH2和TH17/22相关标志物上调 | 样本量相对有限(15例白癜风样本和14例健康对照),需要更大规模研究验证 | 获取白癜风皮损和非皮损区域的整体皮肤转录组特征 | 白癜风患者的皮损和非皮损皮肤活检样本 | 转录组学 | 白癜风 | RNA测序, 实时PCR, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据, 基因表达数据 | 15例白癜风皮损和非皮损样本,14例匹配健康对照 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3778 | 2025-10-06 |
Cell-type-directed network-correcting combination therapy for Alzheimer's disease
2025-Oct-02, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.06.035
PMID:40695276
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研究论文 | 提出一种基于细胞类型特异性网络校正的阿尔茨海默病联合疗法 | 首次将单细胞转录组学、药物扰动数据库和临床记录整合,开发细胞类型特异性多靶点药物发现策略 | 研究基于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 开发针对阿尔茨海默病多因素特征的精准联合疗法 | 阿尔茨海默病小鼠模型(同时具有Aβ和tau沉积) | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据、临床记录 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3779 | 2025-10-06 |
An inducible model of human post-implantation development derived from primed and naive stem cells
2025-Oct-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.08.005
PMID:40885193
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研究论文 | 本研究通过结合启动态和初始态人多能干细胞开发了可诱导干细胞胚胎模型,模拟人类植入后早期发育过程 | 首次通过结合启动态hPSC和初始态hPSC来源的转基因诱导胚外细胞,建立了可诱导的干细胞胚胎模型 | 模型尚不完美,存在一定局限性 | 研究人类植入后早期发育过程 | 人类干细胞胚胎模型 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 可诱导干细胞胚胎模型(iSCBEMs) | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3780 | 2025-10-06 |
Protocol for single-cell spatial transcriptomic profiling of cultured cells and engineered tissues without embedding or sectioning
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104074
PMID:40938748
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研究论文 | 本文提出了一种无需包埋或切片即可对培养细胞和工程组织进行单细胞空间转录组分析的新方案 | 开发了适用于标准包埋切片不兼容的2D工程组织和细胞培养物的空间转录组分析新方法 | NA | 建立适用于特殊样本类型的空间转录组分析技术方案 | 2D工程组织和细胞培养物 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD空间技术 |