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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3761 | 2025-10-05 |
Cell-weighted polygenic risk scores are associated with β-amyloid and tau biomarkers in Alzheimer's disease
2025, Brain communications
IF:4.1Q2
DOI:10.1093/braincomms/fcaf353
PMID:41040848
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据开发细胞加权多基因风险评分,探索不同细胞类型对阿尔茨海默病中β-淀粉样蛋白和tau蛋白生物标志物的影响 | 首次开发细胞特异性加权的多基因风险评分,揭示不同细胞类型对阿尔茨海默病病理的差异化贡献 | 研究样本主要来自BioFINDER队列,需要在更广泛人群中验证 | 探究不同细胞类型在阿尔茨海默病β-淀粉样蛋白和tau蛋白病理积累中的作用机制 | BioFINDER-1和BioFINDER-2研究中的认知正常个体、轻度认知障碍患者、阿尔茨海默病痴呆患者和非阿尔茨海默病神经退行性疾病患者 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq, 全基因组关联研究 | 回归模型 | 基因表达数据, 脑脊液生物标志物数据, 认知评估数据 | BioFINDER-1: 1293人(认知正常734人, 轻度认知障碍235人, 阿尔茨海默病痴呆97人, 其他神经疾病227人); BioFINDER-2: 1736人(认知正常773人, 轻度认知障碍358人, 阿尔茨海默病痴呆286人, 其他神经疾病319人) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3762 | 2025-10-05 |
Structure-guided integrative soft deep clustering analysis of scRNA-seq and scATAC-seq data
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1678891
PMID:41040877
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研究论文 | 提出一种结构引导的软深度聚类框架,用于整合分析单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据 | 开发了结构引导的软深度聚类框架,通过概率聚类分配捕捉细胞动态过渡状态,并采用对比学习对齐多模态表示 | NA | 解决单细胞聚类中硬分配方法无法捕捉细胞动态过渡状态的问题 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 对比学习, 注意力机制 | 深度学习, 软聚类 | 单细胞RNA-seq数据, 单细胞ATAC-seq数据 | 四个基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 3763 | 2025-10-05 |
Macrophage-TREM2 promotes cardiac repair by restricting the infiltration of CD8+ T cells via CXCL16-CXCR6 axis after myocardial infarction
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.118014
PMID:41041054
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研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞TREM2通过CXCL16-CXCR6轴限制CD8+ T细胞浸润并促进淋巴管生成,从而促进心肌梗死后心脏修复的机制 | 首次阐明TREM2通过调控PI3K-AKT信号通路影响CXCL16分泌,进而限制CD8+ T细胞浸润的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究巨噬细胞TREM2在心肌梗死后心脏修复中的作用机制 | 心肌梗死小鼠模型、巨噬细胞、CD8+ T细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞测序、ELISA、Transwell、Western Blot、KEGG分析 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞测序数据、蛋白质印迹数据、细胞迁移数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3764 | 2025-10-05 |
Luminal Stem-like Cells in High-Risk/Locally Advanced Prostate Cancer Promote Resistance to Hormonal Therapy
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.112496
PMID:41041045
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和患者来源类器官模型,揭示了高危/局部晚期前列腺癌中管腔干细胞样细胞在激素治疗后存活并主导肿瘤上皮细胞组成的现象 | 首次在高危/局部晚期前列腺癌中鉴定出SOX9高转录活性的管腔干细胞样细胞亚群,并发现其在激素治疗后成为主导上皮细胞成分 | 样本量较小(仅9例患者),需要更大规模研究验证 | 探究高危/局部晚期前列腺癌患者激素治疗后残留肿瘤的分子特征及高复发率原因 | 高危/局部晚期前列腺癌患者肿瘤样本 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞测序,患者来源类器官培养,药物筛选 | 患者来源类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 9例高危/局部晚期前列腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3765 | 2025-10-05 |
Kazald1 attenuates chondrocyte fibrosis to potentiate hyaline cartilage regeneration by interfering with the pro-fibrotic TGF-β signaling
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.113604
PMID:41041066
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现Kazald1是维持软骨稳态的关键分子,并验证其重组蛋白通过干扰TGF-β信号通路抑制软骨细胞纤维化,促进透明软骨再生 | 首次发现Kazald1在软骨纤维化中的关键作用,阐明其通过形成TGFBR1二聚体阻断促纤维化信号通路的分子机制 | 研究主要基于大鼠模型和人类软骨外植体,尚未进行临床验证 | 探索软骨纤维化的分子机制并开发促进透明软骨再生的治疗方法 | 大鼠软骨细胞、人类软骨外植体、大鼠骨软骨损伤模型 | 组织工程与再生医学 | 软骨损伤与骨关节炎 | 单细胞测序, 蛋白质表达与纯化, 体外细胞培养, 动物模型 | NA | 单细胞测序数据, 蛋白质结构数据, 组织学数据 | 大鼠软骨组织、人类软骨外植体(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3766 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals endothelial cell heterogeneity and Sox18-mediated EndMT in abdominal aortic aneurysm
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.110254
PMID:41041074
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示腹主动脉瘤中内皮细胞的异质性及Sox18介导的内皮-间质转化机制 | 首次在单细胞水平系统揭示腹主动脉瘤中内皮细胞的四个亚群及其转录特征,发现Sox18介导的内皮-间质转化新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究腹主动脉瘤中内皮细胞异质性及内皮-间质转化的分子机制 | 腹主动脉瘤小鼠模型及人类主动脉瘤样本 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | AngⅡ和盐诱导的AAA小鼠模型及公共人类AAA数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3767 | 2025-10-05 |
Xrcc6 coordinates cardiomyocyte repair and immune regulation in myocardial ischemia-reperfusion injury: Fisetin as a therapeutic modulator
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1653738
PMID:41041340
|
研究论文 | 本研究揭示了Xrcc6在心肌缺血再灌注损伤中的双重调控作用,并发现黄酮类化合物非瑟酮通过靶向Xrcc6发挥心脏保护作用 | 首次整合bulk和单细胞RNA测序发现Xrcc6在心肌修复和免疫调节中的双重功能,并验证非瑟酮作为Xrcc6靶向治疗剂的潜力 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 阐明Xrcc6在心肌缺血再灌注损伤中的作用机制,探索非瑟酮的心脏保护效应 | 心肌细胞亚型、巨噬细胞极化、DNA损伤修复机制 | 计算生物学 | 心血管疾病 | bulk RNA测序,单细胞RNA测序,hdWGCNA,轨迹推断,细胞通讯分析,分子对接,分子动力学模拟 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 小鼠心肌缺血再灌注损伤模型 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3768 | 2025-10-05 |
Immunotherapy strategies targeting tumor-associated macrophages and their mechanisms of action in tumor progression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680455
PMID:41041337
|
综述 | 本文综述了肿瘤相关巨噬细胞在肿瘤微环境中的作用及其作为免疫治疗靶点的研究进展 | 系统总结了单细胞测序技术揭示的TAMs功能多样性和异质性,及其在肿瘤免疫治疗中的靶向潜力 | NA | 探讨靶向肿瘤相关巨噬细胞的免疫治疗策略及其作用机制 | 肿瘤相关巨噬细胞及其在肿瘤微环境中的相互作用 | 肿瘤免疫学 | 实体肿瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3769 | 2025-10-05 |
Novel cuproptosis-related genes C1QBP and PFKP identified as prognostic and therapeutic targets in lung adenocarcinoma
2025, Open life sciences
IF:1.7Q3
DOI:10.1515/biol-2025-1142
PMID:41041346
|
研究论文 | 通过分析肺腺癌基因组数据鉴定出铜死亡相关基因C1QBP和PFKP作为预后标志物和治疗靶点 | 首次发现C1QBP和PFKP基因在肺腺癌铜死亡调控中的关键作用,并建立四基因风险预测模型 | 研究样本主要来自TCGA数据库,需要进一步实验验证 | 鉴定肺腺癌中铜死亡相关的预后标志物和治疗靶点 | 肺腺癌患者组织和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞测序、微阵列分析、功能实验 | 四基因风险模型 | 基因组数据、单细胞测序数据、微阵列数据 | 566例TCGA样本加上肺腺癌特异性数据集 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3770 | 2025-10-05 |
Molecular signatures of alveolar type II cell differentiation in acute respiratory distress syndrome
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1649108
PMID:41041455
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示了急性呼吸窘迫综合征中肺泡II型细胞分化的分子特征 | 首次发现AT2细胞在ARDS中存在两种不同分化轨迹:纤维化程序和上皮修复程序 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本,需要更大规模临床验证 | 探究ARDS中AT2细胞分化轨迹及其对疾病进展的影响 | 小鼠ARDS模型和ARDS患者的支气管肺泡灌洗液样本 | 单细胞组学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序, 微阵列, 通路富集分析 | 轨迹分析 | 转录组数据, 蛋白质数据 | 小鼠ARDS模型和患者BALF样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 3771 | 2025-10-05 |
Irf4 participates in benzene-induced hematopoietic senescence through mitochondrial ROS-dependent BCAA catabolism
2025-Dec, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2025.154271
PMID:40885242
|
研究论文 | 本研究揭示了环境剂量苯通过Irf4介导线粒体ROS依赖性BCAA代谢异常诱导造血祖细胞衰老的新机制 | 首次报道环境剂量苯通过Irf4-Bcat1-BCAA代谢轴诱导造血祖细胞衰老的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,尚未在人体样本中验证 | 探究苯暴露诱导造血祖细胞衰老的分子机制 | C57BL/6J雄性小鼠和FDC-P1小鼠造血祖细胞系 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,蛋白质组数据 | 小鼠暴露实验(0,10,50ppm苯蒸气12周),细胞系暴露实验(0,5,10μM 1,4-BQ 24h) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3772 | 2025-10-05 |
Fueling fibrosis: metabolic dysregulation in systemic sclerosis
2025-Nov-01, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000001123
PMID:40916994
|
综述 | 本综述探讨代谢重编程如何驱动系统性硬化症的纤维化和免疫失调 | 系统阐明系统性硬化症中从分解代谢向合成代谢转变的分子机制,揭示代谢通路与纤维化信号的新型关联 | NA | 研究代谢重编程在系统性硬化症发病机制中的作用 | 系统性硬化症患者的代谢通路和纤维化过程 | NA | 系统性硬化症 | 代谢组学分析、单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3773 | 2025-10-05 |
TargetPair: A Single Cell-omics Resource of Clinical Trials-derived Therapeutical Target Combinations for Cancer Therapy
2025-Nov-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169399
PMID:40840587
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研究论文 | 建立TargetPair数据库,提供临床试验来源的癌症治疗靶点组合及其单细胞组学特征 | 首次系统整合临床相关癌症靶点组合并计算其单细胞水平组学特征 | 数据来源依赖于已发表的临床试验和文献,可能存在选择偏差 | 开发癌症多靶点治疗的理性设计资源 | 癌症治疗靶点组合及其单细胞组学特征 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞组学数据 | 3,022,556个单细胞,588名患者,16种癌症类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3774 | 2025-10-05 |
Ptgs2+ CPTC Function as a "Force-Immune Axis" by Responding to Acupuncture and Mediating M2 Macrophage Activation for Anti-Inflammatory Effects
2025-Oct-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501175RR
PMID:41017691
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现Ptgs2+ CPTC作为“力-免疫轴”响应针刺刺激并通过Il6-Il6st-Stat3通路激活M2巨噬细胞发挥抗炎作用 | 首次确立Ptgs2+ CPTC作为连接机械刺激与免疫调节的关键“力-免疫轴”,揭示了针灸抗炎的细胞机制 | 研究局限于腹部中线筋膜组织,未验证其他筋膜区域的普适性 | 探索筋膜组织中特络细胞的细胞景观及其在针灸抗炎中的作用机制 | 大鼠腹部中线筋膜组织和特络细胞亚群 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞测序, 深度学习 | 深度学习模型 | 单细胞RNA测序数据, 细胞形态学数据 | 痢疾大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3775 | 2025-10-05 |
Pharmacological Inhibition of Ferroptosis Attenuates Experimental Abdominal Aortic Aneurysm Formation
2025-Oct-02, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323269
PMID:41036562
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研究论文 | 本研究通过药理学方法抑制铁死亡,证明可减轻实验性腹主动脉瘤的形成 | 首次揭示铁死亡在腹主动脉瘤形成中的关键作用,并证明liproxstatin-1通过抑制巨噬细胞铁死亡来减轻主动脉炎症和重塑 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究铁死亡在腹主动脉瘤形成中的作用机制 | 人类AAA组织、C57BL/6小鼠、巨噬细胞和平滑肌细胞 | 病理学 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序、质谱分析、组织学分析 | NA | 基因表达数据、组织图像、质谱数据 | 人类AAA组织数据库、雄性雌性C57BL/6小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3776 | 2025-10-05 |
Comprehensive bioinformatics evaluation uncovers the possible oncogenic contribution of acrylamide to endometrial cancer
2025-Oct-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03612-x
PMID:41037154
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研究论文 | 通过生物信息学方法评估丙烯酰胺在子宫内膜癌中的潜在致癌机制 | 首次整合转录组数据和单细胞RNA测序数据,结合机器学习方法系统揭示丙烯酰胺通过关键基因介导子宫内膜癌发生的分子机制 | 需要进一步的实验验证才能将这些发现转化为预防和治疗策略 | 探索丙烯酰胺在子宫内膜癌发生发展中的致癌机制 | 子宫内膜癌转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 分子对接 | LASSO回归, 支持向量机, 随机森林 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据集(GSE17025, GSE63678, GSE106191, GSE115810)和单细胞RNA测序数据(PRJNA786266) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3777 | 2025-10-05 |
Mechanisms of dexamethasone-induced bone toxicity in developing bone: a single-cell perspective
2025-Oct, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziaf146
PMID:41025095
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示地塞米松对发育中骨骼毒性的分子机制 | 首次从单细胞层面系统揭示地塞米松对发育骨骼中成骨细胞、软骨细胞和B细胞谱系的影响 | 研究仅使用C57BL/6JRj雄性小鼠模型,未涉及其他品系或雌性动物 | 阐明地塞米松诱导发育骨骼毒性的分子机制 | 骨骼未成熟的C57BL/6JRj雄性小鼠 | 单细胞生物学 | 骨骼发育障碍 | 单细胞RNA测序,微计算机断层扫描 | NA | 单细胞转录组数据,影像数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3778 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomic analyses provide insights into SPP1+ TAM-mediated immune suppression and CD8+ T cell dysfunction in lung cancer
2025-Sep-29, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04180-3
PMID:41021043
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示SPP1+肿瘤相关巨噬细胞通过A2AR信号通路介导CD8+ T细胞功能失调的免疫抑制机制 | 首次系统比较原发性和脑转移性肺癌中SPP1+ TAM与CD8+ T细胞的相互作用,并证实抗SPP1治疗可逆转T细胞耗竭 | 研究主要基于单细胞测序数据和体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 探究SPP1+肿瘤相关巨噬细胞在肺癌免疫抑制中的作用机制 | 肺癌原发灶和脑转移灶中的免疫细胞,特别是SPP1+ TAM和CD8+ T细胞 | 单细胞转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光,qPCR,Western blot,共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,免疫荧光图像 | 肺癌原发和脑转移组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3779 | 2025-10-05 |
Multi-omics analysis of ILF2 reveals its prognostic value and functional roles across pan-cancer
2025-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03609-6
PMID:41021104
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研究论文 | 通过多组学分析揭示ILF2在泛癌中的预后价值和功能作用 | 首次对ILF2进行系统性泛癌分析,涵盖表达模式、预后意义、遗传变异、免疫浸润和治疗反应等多个维度 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证功能机制 | 阐明ILF2在泛癌中的生物学功能和临床意义 | 多种癌症类型和ILF2基因 | 生物信息学 | 泛癌分析(特别关注肝细胞癌) | 多组学分析,单细胞RNA测序 | 生物信息学分析模型 | 基因组数据,转录组数据,临床数据 | 多种癌症类型的多组学数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,多组学分析 | NA | NA |
| 3780 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals NFATc1-mediated regulatory mechanisms of vascular smooth muscle cell osteogenic transformation in the osteosarcoma microenvironment
2025-Sep-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03606-9
PMID:41021149
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示骨肉瘤微环境中血管平滑肌细胞成骨转化的NFATc1介导的调控机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示NFATc1在骨肉瘤微环境中血管平滑肌细胞成骨转化中的分布特征和共表达网络 | 需要功能扰动实验来建立因果关系 | 研究骨肉瘤微环境中血管平滑肌细胞成骨转化的调控机制 | 新鲜骨肉瘤组织中的血管平滑肌细胞 | 单细胞组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | k-近邻/Louvain聚类 | 单细胞基因表达数据 | 未明确样本数量 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, NovaSeq 6000 | 10x Chromium Single Cell 3' v3试剂 |