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当前共找到 10572 篇文献，本页显示第 3741 - 3760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3741 | 2025-12-10 |
Multi-omics reveals that genes linked to succinylation regulate the onset of epilepsy through metabolic reprogramming
2025-Dec-08, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10180-6
PMID:41361022
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研究论文 | 本研究结合孟德尔随机化和单细胞转录组技术，揭示了琥珀酰化相关基因CTBP1通过代谢重编程和神经元异质性调控促进癫痫发生的新机制 | 首次整合多组学证据，将琥珀酰化修饰基因CTBP1、血浆代谢物失调与癫痫风险联系起来，并利用单细胞转录组学在细胞类型特异性层面解析了其调控网络 | 研究主要基于观察性数据和遗传工具变量分析，因果关系的确立仍需后续实验验证；单细胞数据仅来源于颞叶，可能无法完全代表其他脑区 | 探究琥珀酰化修饰相关基因、血浆代谢物与癫痫之间的因果关系及潜在代谢介导通路 | 癫痫患者（具体样本数未明确提及）的遗传数据、血浆代谢物数据及颞叶单细胞转录组数据 | 生物信息学，多组学整合分析 | 癫痫 | 孟德尔随机化分析，单细胞RNA测序 | NA | 遗传数据（eQTL），血浆代谢物数据，单细胞转录组数据 | NA（使用了公开数据库eQTLGen和血浆代谢物数据库，以及癫痫患者颞叶单细胞数据，但具体样本数未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3742 | 2025-12-10 |
Decoding heart failure subtypes with neural networks via differential explanation analysis
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf581
PMID:41222558
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研究论文 | 本文介绍了一种基于神经网络和可解释AI的新方法，用于识别心力衰竭亚型特异性基因，以解码心力衰竭亚型 | 提出了一种基于自定义神经网络重要性评分的新方法，用于识别差异解释基因，优于传统方法，能更有效地揭示心力衰竭亚型特异性通路 | 方法可能依赖于神经网络模型的特定架构和参数，且在实际应用中需验证其泛化能力 | 解码心力衰竭亚型，通过识别差异基因签名来理解分子机制 | 单细胞转录组数据中的细胞，特别是与心力衰竭相关的细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq | 深度神经网络 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3743 | 2025-12-10 |
Single-cell RNA sequencing identifies accumulation of Fcgr2b+ virtual memory like CD8 T cells with cytotoxic and inflammatory potential in aged mouse white adipose tissue
2025-Jun-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.27.661935
PMID:40631318
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序，识别了老年小鼠白色脂肪组织中具有细胞毒性和炎症潜能的Fcgr2b+虚拟记忆样CD8 T细胞的积累 | 比较了生理衰老与高脂饮食诱导的肥胖，首次在老年小鼠白色脂肪组织中鉴定出Fcgr2b+CD49d-虚拟记忆样CD8 T细胞，并揭示了其细胞毒性和炎症功能 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证；样本量相对较小，可能影响统计效力 | 比较衰老与肥胖状态下白色脂肪组织的炎症机制，识别独特的调控靶点 | 年轻和老年小鼠的性腺白色脂肪组织（gWAT）基质血管组分（SVF） | 单细胞组学 | 肥胖相关炎症 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据 | 年轻小鼠（正常或高脂饮食）和老年小鼠（正常饮食）的白色脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3744 | 2025-12-10 |
Strain-Specific Tropism and Transcriptional Responses of Enterovirus D68 Infection in Human Spinal Cord Organoids
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.27.661907
PMID:40666885
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了人类脊髓类器官中肠道病毒D68感染的细胞嗜性和转录反应，揭示了不同病毒株的差异感染模式 | 首次在人类脊髓类器官模型中，通过单细胞RNA测序揭示了EV-D68不同毒株（B2和B3）在神经元和胶质细胞中的特异性嗜性差异 | 研究基于类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂的免疫环境和组织架构 | 探究EV-D68感染导致急性弛缓性脊髓炎的细胞机制和宿主反应 | 人类脊髓类器官（hSCOs） | 单细胞组学 | 神经系统感染性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，使用诱导多能干细胞衍生的脊髓类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3745 | 2025-12-10 |
scSwinTNet: A Cell Type Annotation Method for Large-Scale Single-Cell RNA-Seq Data Based on Shifted Window Attention
2025-Apr, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2024.3487174
PMID:39466872
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研究论文 | 本文提出了一种基于移位窗口注意力机制的大规模单细胞RNA测序数据细胞类型注释方法scSwinTNet | scSwinTNet是首个使用预训练的移位窗口注意力模型来注释单细胞RNA测序数据中细胞类型的模型，无需先验知识即可准确注释 | NA | 开发一种自动化、高精度的细胞类型注释工具，以应对单细胞数据量的指数增长并减少数据偏差影响 | 人类和小鼠组织中的单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 基于移位窗口的自注意力模型 | 基因表达数据 | 399,760个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3746 | 2025-12-10 |
Cannabidiol Reprograms Glucose Metabolism in Colorectal Adenocarcinoma by Targeting HIF-1α/LDHA Pathway
2025, The American journal of Chinese medicine
DOI:10.1142/S0192415X25500958
PMID:41219135
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研究论文 | 本研究探讨了大麻二酚通过靶向HIF-1α/LDHA通路，重编程结直肠腺癌葡萄糖代谢的抗肿瘤机制 | 首次揭示大麻二酚通过抑制HIF-1α/LDHA通路来靶向肿瘤代谢重编程，并发现其与糖酵解抑制剂2-DG具有协同作用 | 研究主要基于体外实验和单细胞转录组学分析，缺乏体内动物模型的全面验证 | 探究大麻二酚在结直肠腺癌中的抗肿瘤作用机制，特别是其对肿瘤代谢重编程的影响 | 结直肠腺癌细胞系及组织样本 | 肿瘤代谢研究 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、网络药理学、蛋白质组学、代谢测定 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、代谢数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3747 | 2025-12-10 |
Strain-specific tropism and transcriptional responses of enterovirus D68 infection in human spinal cord organoids
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1698639
PMID:41347238
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了人类脊髓类器官中肠道病毒D68感染的细胞嗜性和转录反应，揭示了不同病毒株在神经元和胶质细胞中的差异感染模式 | 首次在人类脊髓类器官模型中，通过单细胞分辨率揭示了EV-D68不同毒株（B2和B3）的细胞嗜性差异及其宿主转录响应，为急性弛缓性脊髓炎的发病机制提供了新见解 | 研究基于类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂的脊髓微环境；样本规模有限，且仅分析了两种病毒株 | 探究肠道病毒D68感染导致急性弛缓性脊髓炎的细胞嗜性和感染动力学机制 | 源自诱导多能干细胞的人类脊髓类器官 | 单细胞组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，但涉及健康及感染两种EV-D68毒株（B2和B3）的脊髓类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3748 | 2025-12-10 |
Multi-Omics Analysis and Experimental Validation Identify RAD51 as a Key Biomarker in OSCC
2025 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70048
PMID:41350246
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证，识别RAD51作为口腔鳞状细胞癌的关键生物标志物 | 整合多组学数据（包括单细胞转录组学）和实验验证，首次系统阐明RAD51在OSCC中的功能及其与免疫浸润和化疗耐药性的关联 | 研究主要基于细胞系HSC-3进行实验验证，缺乏体内模型或临床样本的直接验证 | 阐明RAD51在口腔鳞状细胞癌中的具体功能和调控机制，评估其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）细胞系HSC-3及相关的多组学数据 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 多组学分析、单细胞RNA测序、siRNA敲低、功能测定（增殖、迁移、侵袭、ROS积累、化疗敏感性） | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、实验数据 | 使用OSCC细胞系HSC-3进行实验，多组学分析涉及多个癌症数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3749 | 2025-12-09 |
CD33 drives cutaneous melanoma: mendelian randomization confirms causality, multi-omics and in vitro experiments reveal M2 macrophage polarization-mediated progression
2025-Dec-08, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004100
PMID:41346267
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、多组学分析和体外实验，揭示了CD33通过促进M2巨噬细胞极化驱动皮肤黑色素瘤发展的因果机制 | 首次综合运用孟德尔随机化、多组学转录组分析和体外实验验证，系统证实了CD33与皮肤黑色素瘤之间的因果关系，并阐明了其通过M2巨噬细胞极化介导肿瘤进展的具体机制 | 研究主要基于公共数据库的汇总数据和体外实验，缺乏体内模型或临床样本的直接验证，且对CD33调控M2极化的具体信号通路尚未完全阐明 | 探索皮肤黑色素瘤的新型治疗靶点并阐明其作用机制 | 皮肤黑色素瘤及其肿瘤微环境中的免疫细胞（特别是巨噬细胞/树突状细胞） | 生物信息学与计算生物学 | 皮肤黑色素瘤 | 孟德尔随机化、基于汇总数据的孟德尔随机化、共定位分析、批量转录组测序、单细胞转录组测序、体外细胞实验 | NA | 基因组关联研究汇总数据、蛋白质数量性状位点数据、批量转录组数据、单细胞转录组数据 | FinnGen队列（皮肤黑色素瘤：3194病例/314193对照；原位黑色素瘤：980病例/313899对照；葡萄膜黑色素瘤：293病例/345118对照）、731个免疫细胞特征（N=3757）、TCGA/GTEx/GENT2数据库转录组数据、GEO单细胞数据集 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3750 | 2025-12-09 |
[Novel progress in exploring drug resistance mechanisms of breast cancer by single-cell sequencing technology]
2025-Dec-08, Zhonghua bing li xue za zhi = Chinese journal of pathology
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3751 | 2025-12-09 |
[Fibroblast heterogeneity and functional roles in interstitial lung diseases: insights from histopathology and single-cell transcriptomics analyses]
2025-Dec-08, Zhonghua bing li xue za zhi = Chinese journal of pathology
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3752 | 2025-12-09 |
Glioblastoma-associated fibroblasts enhance vascular stiffness and confer to poor prognosis
2025-Dec-08, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004114
PMID:41355159
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，在胶质母细胞瘤中鉴定出一种独特的COL6A3+胶质瘤相关成纤维细胞亚群，并揭示了其通过COL6A3-ITGA1信号通路导致血管功能障碍和缺氧，从而促进肿瘤进展的机制 | 首次在胶质母细胞瘤中鉴定出COL6A3+胶质瘤相关成纤维细胞亚群，并阐明其通过介导内皮细胞硬度增加来驱动血管功能障碍和缺氧的新机制 | 未明确说明样本量大小及具体来源，且GAFs来源于髓系细胞的机制仍需进一步验证 | 探究胶质母细胞瘤中癌症相关成纤维细胞的功能及其在肿瘤微环境中的作用机制 | 胶质母细胞瘤组织、COL6A3+胶质瘤相关成纤维细胞、血管内皮细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学分析、CRISPR-Cas9基因敲除 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3753 | 2025-12-09 |
Ptbp1 is not required for retinal neurogenesis and cell fate specification
2025-Dec-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.108331
PMID:41342897
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研究论文 | 本研究通过条件性敲除小鼠视网膜前体细胞中的Ptbp1基因，评估其在发育性神经发生中的作用，发现Ptbp1对视网膜细胞命运决定并非必需 | 首次在体内条件下系统评估Ptbp1在视网膜神经发生中的功能，挑战了Ptbp1作为神经发生核心抑制因子的传统观点 | 研究仅聚焦于视网膜发育，未在其他神经系统或成年神经发生中验证Ptbp1的功能 | 探究RNA结合蛋白Ptbp1在发育性神经发生中的具体作用机制 | 小鼠视网膜前体细胞和Müller胶质细胞 | 发育神经生物学 | NA | 条件性基因敲除、免疫染色、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、剪接模式数据 | 突变型小鼠视网膜组织（具体数量未明确说明） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3754 | 2025-12-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals a putative lncRNA-associated ceRNA network in high-grade serous ovarian cancer
2025-Dec, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01691-2
PMID:41099994
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了高级别浆液性卵巢癌中一个由长链非编码RNA MIR100HG、微小RNA mir-224-5p和EYA4基因组成的竞争性内源RNA网络，该网络可能通过调控Wnt信号通路促进肿瘤进展 | 首次在高级别浆液性卵巢癌中结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别出癌细胞特异性的竞争性内源RNA网络，并揭示了MIR100HG可能作为mir-224-5p的分子海绵调控EYA4表达的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析和公共数据库验证，缺乏直接的实验功能验证来证实ceRNA网络的具体调控机制 | 识别高级别浆液性卵巢癌肿瘤微环境中活跃的长链非编码RNA相关竞争性内源RNA网络 | 高级别浆液性卵巢癌的癌细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量，但使用了单细胞RNA测序和批量RNA测序数据集，并利用癌症基因组图谱数据进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3755 | 2025-12-09 |
ResNet50 and Single-Cell Multi-Omics analysis identify key cellular and molecular features in pediatric acute lymphoblastic leukemia
2025-Nov, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-025-06675-6
PMID:41125957
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研究论文 | 本研究通过整合基于深度学习的图像分析与单细胞转录组学和T细胞受体测序，揭示了儿童急性淋巴细胞白血病的细胞和分子特征 | 首次将ResNet50深度学习模型用于白血病单细胞图像分类，并与单细胞多组学数据整合，以阐明疾病机制并发现潜在的复发生物标志物 | 未明确说明样本的具体数量或来源，可能限制了结果的普遍适用性 | 解决儿童急性淋巴细胞白血病早期诊断、复发预测和个体化治疗的挑战 | 儿童急性淋巴细胞白血病（ALL） | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞转录组测序, T细胞受体测序 | ResNet50, Grad-CAM | 图像, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 3756 | 2025-12-09 |
Spatiotemporal dynamics of neuron differentiation and migration in the developing human spinal cord
2025-Oct, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.08.004
PMID:40825501
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和原位测序技术，揭示了人类和小鼠脊髓发育过程中神经元分化和迁移的时空动态与调控机制 | 首次在人类脊髓发育的早期阶段（Carnegie Stages 16-21）系统描绘了神经元分化和迁移的时空动态，并识别了跨物种保守的关键转录因子 | 研究主要聚焦于胚胎发育的特定阶段（CS16-21/E8.0-11.5），未涵盖更晚期的发育或成熟过程 | 探究人类脊髓发育过程中神经元亚型特化和迁移的分子机制 | 人类和小鼠胚胎脊髓组织 | 单细胞组学 | 神经系统发育 | 单细胞转录组测序, 原位测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 空间转录组数据 | 人类脊髓样本（CS16-21阶段）和小鼠脊髓样本（E8.0-11.5阶段） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3757 | 2025-12-09 |
Metabolic reprogramming of arachidonic acid in clear cell renal carcinoma promotes an immunosuppressive microenvironment by activating MDK signaling pathway
2025-Aug-13, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01807-8
PMID:40802073
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序，探讨了透明细胞肾细胞癌中代谢重编程与免疫耗竭的关系，并揭示了花生四烯酸代谢异常通过激活MDK信号通路促进免疫抑制微环境的机制 | 首次结合单细胞和批量RNA测序技术，构建了ccRCC的代谢亚型，并发现花生四烯酸代谢异常通过MDK信号通路驱动免疫抑制，为免疫治疗提供了新的生物标志物和治疗靶点 | 研究主要基于测序数据和体外实验，缺乏大规模临床队列验证，且免疫治疗模型的体内效果需进一步确认 | 探究透明细胞肾细胞癌中代谢重编程与免疫耗竭的关联机制 | 透明细胞肾细胞癌患者样本及肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组化, Western blotting, ELISA, 细胞共培养 | Scissor算法, 细胞间通讯分析 | RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 未明确样本数量，但涉及ccRCC患者分组及细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 3758 | 2025-12-09 |
Single-cell transcriptomics unravels the early immune landscape of renal allograft rejection and nominates Ccl3-Ccr5 as a therapeutic target
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1663251
PMID:41200203
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了肾移植早期急性排斥反应的免疫景观，并识别出Ccl3-Ccr5轴作为治疗靶点 | 首次在单细胞分辨率下描绘了肾移植早期急性排斥反应的免疫细胞动态和细胞间通讯网络，并验证了Ccl3-Ccr5轴作为治疗靶点的潜力 | 研究基于大鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证；样本时间点有限，可能未覆盖所有动态变化 | 阐明肾移植早期急性排斥反应的免疫细胞动态和局部细胞间通讯机制，并探索潜在治疗靶点 | 大鼠肾移植模型中的CD45+免疫细胞 | 数字病理学 | 肾移植排斥反应 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），多重免疫荧光，治疗干预实验 | 无监督聚类，细胞轨迹推断，细胞间通讯网络分析 | 单细胞转录组数据，图像数据 | 大鼠肾移植模型在移植后第0、1、3、7天采集的CD45+免疫细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3759 | 2025-12-09 |
Identification of novel lipid metabolism-related biomarkers of aortic dissection by integrating single-cell RNA sequencing analysis and machine learning algorithms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1681989
PMID:41246346
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序分析和机器学习算法，识别了主动脉夹层中与脂质代谢相关的新型生物标志物PLIN2和PLIN3 | 采用多模态策略结合单细胞RNA测序和机器学习，首次将PLIN2和PLIN3确定为主动脉夹层中脂质代谢的关键调节因子，并探索其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于计算分析和动物模型验证，缺乏大规模临床样本的直接验证，且分子机制需进一步实验探究 | 识别主动脉夹层中与脂质代谢失调相关的新型生物标志物，以阐明其病理机制并探索潜在治疗靶点 | 主动脉夹层患者样本和Ang II诱导的主动脉夹层小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习算法, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析, 细胞间通讯分析, 伪时间轨迹重建, 分子对接 | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 主动脉夹层和对照样本的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 3760 | 2025-12-09 |
Correction: Single-cell transcriptomics unravels the early immune landscape of renal allograft rejection and nominates Ccl3-Ccr5 as a therapeutic target
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1740964
PMID:41357176
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correction | 本文是对先前发表文章的更正，涉及肾脏移植排斥早期免疫景观的单细胞转录组学研究 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |