单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10780 篇文献，本页显示第 3621 - 3640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3621 | 2025-10-07 |
scSTD: A Swin Transformer-Based Diffusion Model for Recovering scRNA-Seq Data
2025-Oct, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3570265
PMID:40366848
|
研究论文 | 提出一种基于Swin Transformer和扩散模型的单细胞RNA测序数据恢复方法scSTD | 首次将Swin Transformer架构与潜在扩散模型相结合用于scRNA-seq数据恢复 | 未明确说明方法在特定细胞类型或实验条件下的性能限制 | 解决单细胞RNA测序数据中的dropout事件和技术噪声问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Swin Transformer, 扩散模型, 自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3622 | 2025-10-07 |
Human airway epithelial B-cell activating factor is reduced in early life but is virally induced via JAK/STAT
2025-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.04.034
PMID:40409377
|
研究论文 | 本研究揭示了人类气道上皮细胞通过JAK/STAT信号通路调控B细胞活化因子产生，影响早期生命阶段气道B细胞发育和抗病毒免疫应答的机制 | 首次发现婴儿气道上皮细胞BAFF产生减少但可通过病毒刺激激活，并阐明其通过I型和III型干扰素及JAK/STAT信号通路诱导的分子机制 | 研究主要关注儿科人群，缺乏成人对照；机制研究主要在体外进行，需要更多体内验证 | 探究人类气道B细胞发育动态及其与气道上皮细胞的相互作用，特别是在早期生命阶段和病毒感染条件下的变化 | 儿科患者的气道B细胞和气道上皮细胞 | 免疫学 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞RNA测序，PCR确认，体外刺激实验 | NA | 基因表达数据，细胞培养数据 | 不同儿科年龄组的气道样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3623 | 2025-10-07 |
Transcriptomic profiling of vitiligo patients shows polar immune dysregulation in involved and uninvolved skin
2025-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.06.002
PMID:40513622
|
研究论文 | 通过转录组分析揭示白癜风患者皮损和非皮损区域存在极化的免疫失调现象 | 首次全面揭示白癜风不仅皮损区域存在TH1/干扰素驱动的免疫异常，非皮损区域也表现出明显的TH2和TH17/22相关标志物上调 | 样本量相对有限（15例白癜风样本和14例健康对照），需要更大规模研究验证 | 获取白癜风皮损和非皮损区域的整体皮肤转录组特征 | 白癜风患者的皮损和非皮损皮肤活检样本 | 转录组学 | 白癜风 | RNA测序, 实时PCR, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据, 基因表达数据 | 15例白癜风皮损和非皮损样本，14例匹配健康对照 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3624 | 2025-10-06 |
Cell-type-directed network-correcting combination therapy for Alzheimer's disease
2025-Oct-02, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.06.035
PMID:40695276
|
研究论文 | 提出一种基于细胞类型特异性网络校正的阿尔茨海默病联合疗法 | 首次将单细胞转录组学、药物扰动数据库和临床记录整合，开发细胞类型特异性多靶点药物发现策略 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 开发针对阿尔茨海默病多因素特征的精准联合疗法 | 阿尔茨海默病小鼠模型（同时具有Aβ和tau沉积） | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据、临床记录 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3625 | 2025-10-06 |
An inducible model of human post-implantation development derived from primed and naive stem cells
2025-Oct-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.08.005
PMID:40885193
|
研究论文 | 本研究通过结合启动态和初始态人多能干细胞开发了可诱导干细胞胚胎模型，模拟人类植入后早期发育过程 | 首次通过结合启动态hPSC和初始态hPSC来源的转基因诱导胚外细胞，建立了可诱导的干细胞胚胎模型 | 模型尚不完美，存在一定局限性 | 研究人类植入后早期发育过程 | 人类干细胞胚胎模型 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 可诱导干细胞胚胎模型(iSCBEMs) | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3626 | 2025-10-06 |
Protocol for single-cell spatial transcriptomic profiling of cultured cells and engineered tissues without embedding or sectioning
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104074
PMID:40938748
|
研究论文 | 本文提出了一种无需包埋或切片即可对培养细胞和工程组织进行单细胞空间转录组分析的新方案 | 开发了适用于标准包埋切片不兼容的2D工程组织和细胞培养物的空间转录组分析新方法 | NA | 建立适用于特殊样本类型的空间转录组分析技术方案 | 2D工程组织和细胞培养物 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD空间技术 |
| 3627 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis reveals the attenuation of the interferon pathway as a driver of chemo-refractory ovarian cancer
2025-Sep-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102316
PMID:40885189
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示干扰素通路减弱是卵巢癌化疗耐药的关键驱动因素 | 首次发现化疗耐药卵巢癌中I型干扰素通路活性降低与缺氧通路增强的分子特征，并证实干扰素活性可独立预测化疗反应 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 探索卵巢高级别浆液性癌化疗耐药的分子机制 | DECIDER观察性试验中化疗耐药卵巢癌患者的治疗前活检样本 | 多组学分析 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,空间蛋白质分析,体外实验 | NA | 基因组学数据,转录组学数据,蛋白质组学数据 | DECIDER临床试验注册患者（NCT04846933） | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学分析 | NA | NA |
| 3628 | 2025-10-06 |
Appendiceal B lymphocytes contribute to the pathogenesis of experimental colitis through fueling colonic CD4+ T polarization
2025-Sep-11, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2025.09.001
PMID:40945653
|
研究论文 | 本研究揭示阑尾B淋巴细胞通过CCL20-CCR6轴迁移至结肠并促进CD4+ T细胞介导的Th1/Th17免疫反应，从而加剧实验性结肠炎 | 首次阐明阑尾B淋巴细胞通过特定迁移机制加剧结肠炎的具体病理机制，并提出阑尾口炎症可能代表溃疡性结肠炎的特殊亚型 | 研究主要基于动物模型，人类数据验证仍需进一步扩展 | 探究阑尾B淋巴细胞在实验性结肠炎发病机制中的作用 | 小鼠模型和溃疡性结肠炎患者的结肠组织 | 免疫学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序，免疫荧光共染色 | NA | 基因表达数据，组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3629 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing: enhancing the predictive accuracy of tumor immunotherapy efficacy
2025-Sep-08, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20253017
PMID:40857744
|
综述 | 本文综述单细胞RNA测序技术在肿瘤免疫治疗疗效预测中的应用现状与前景 | 系统阐述scRNA-seq技术如何提升免疫治疗疗效预测准确性，并探讨生物材料整合带来的新研究方向 | 未涉及具体实验数据验证，主要基于现有研究进行理论分析 | 探讨单细胞RNA测序技术在肿瘤免疫治疗领域的应用价值与发展方向 | 肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3630 | 2025-10-06 |
Folliculin Deletion in the Mouse Kidney Results in Cystogenesis of the Loops of Henle via Aberrant TFEB Activation
2025-Sep, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.05.010
PMID:40499782
|
研究论文 | 本研究通过构建肾单位特异性Folliculin基因敲除小鼠模型，揭示了FLCN-TFEB信号通路在肾单位发育中的关键作用 | 首次证明Folliculin基因缺失通过异常激活TFEB导致亨利氏袢囊肿形成，并阐明了FLCN-TFEB信号通路在肾单位发育中的特异性作用 | 研究仅限于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究Folliculin基因在整个肾单位中的具体功能及其在囊肿形成中的作用机制 | 肾单位特异性Folliculin基因敲除小鼠模型 | 分子生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序，基因敲除技术 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，组织形态学数据 | 基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3631 | 2025-10-05 |
Short-chain fatty acids from gut microbiota restore Th17/Treg balance in rheumatoid arthritis: Mechanisms and therapeutic potential
2025-Dec, Journal of translational autoimmunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.jtauto.2025.100316
PMID:41036443
|
综述 | 系统阐述肠道微生物来源的短链脂肪酸通过多重机制恢复类风湿关节炎中Th17/Treg平衡的作用及治疗潜力 | 首次系统整合多组学方法揭示肠道-关节轴机制，提出微生物组指导的个性化医疗新范式 | NA | 探讨短链脂肪酸调节Th17/Treg平衡的机制及其在类风湿关节炎治疗中的应用潜力 | 类风湿关节炎患者及临床前模型 | NA | 类风湿关节炎 | 代谢组学、单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序、空间转录组学、代谢组学 | NA | NA |
| 3632 | 2025-10-05 |
Loss of Prominin 2 expression inhibits AKT/mTOR signaling to limit glycolysis and drive ferroptosis in breast cancer cells
2025-Dec, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2025.120047
PMID:40818819
|
研究论文 | 本研究揭示了Prominin 2通过AKT/mTOR信号通路促进乳腺癌糖酵解和抑制铁死亡的致癌机制 | 首次发现PROM2通过与AKT相互作用激活mTOR信号通路，同时调控糖酵解和铁死亡两个关键生物学过程 | 研究主要基于细胞系和动物模型，临床转化价值需要进一步验证 | 阐明Prominin 2在乳腺癌中的致癌功能及分子机制 | 乳腺癌组织和细胞系 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,免疫组化,Western blot,RNA测序,GSEA,免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据,代谢指标数据 | 临床样本和细胞系（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 3633 | 2025-10-05 |
KANSL3 directs transcriptional programs essential for hepatic metabolism and differentiation
2025-Dec, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503238
PMID:41044006
|
研究论文 | 本研究揭示了表观遗传调控因子KANSL3在肝细胞分化和代谢中的关键作用 | 首次发现KANSL3通过组蛋白乙酰化调控肝细胞转录网络，对肝脏发育和疾病具有重要影响 | NA | 探究KANSL3在肝脏代谢和分化中的功能机制 | 肝细胞、胆管和胎儿肝脏类器官 | 表观遗传学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3634 | 2025-10-05 |
Meiotic cohesin RAD21L shapes 3D genome structure and transcription in the male germline
2025-Oct-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv2283
PMID:41032613
|
研究论文 | 本研究探讨减数分裂特异性黏连蛋白亚基RAD21L缺失对雄性生殖细胞3D基因组结构和基因表达的影响 | 首次揭示RAD21L在调控减数分裂染色质空间组织和异源染色体端粒相互作用中的关键作用 | 研究主要关注雄性生殖细胞，未涉及雌性生殖系统的相关机制 | 阐明RAD21L在精子发生过程中对3D基因组结构和转录调控的功能 | 雄性生殖细胞（精原细胞和初级精母细胞） | 基因组学 | 生殖系统疾病 | 荧光激活细胞分选, 高通量染色体构象捕获, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组三维结构数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 染色体构象捕获 | NA | NA |
| 3635 | 2025-10-05 |
Single-cell atlas of cervical organoids uncovers epithelial immune heterogeneity and intercellular cross-talk during Chlamydia infection
2025-Oct-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady1640
PMID:41042872
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示宫颈类器官在衣原体感染期间的免疫异性和细胞间通讯 | 首次整合患者来源宫颈类器官与单细胞转录组技术构建感染期间上皮细胞图谱，发现未感染旁观者细胞在免疫应答中的关键作用 | 研究主要聚焦上皮细胞，其他免疫细胞类型参与程度需进一步验证 | 解析宫颈上皮细胞在病原体感染过程中的免疫协调机制 | 患者来源宫颈类器官和天然宫颈组织 | 单细胞生物学 | 生殖道感染 | 单细胞RNA测序，三维类器官培养 | NA | 单细胞转录组数据，组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3636 | 2025-10-05 |
Padlock-designed MOFs triggers an "avalanche effect" to enhance apoptosis and suppress metastasis in central nervous system lymphoma
2025-Oct-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv2647
PMID:41042871
|
研究论文 | 开发了一种靶向肠道巨噬细胞的卡铂锁设计MOF系统，通过肠脑轴实现中枢神经系统淋巴瘤的精准治疗 | 首次利用锁设计MOF触发“雪崩效应”，通过肠道巨噬细胞迁移实现脑靶向给药，重新定义了中枢神经系统淋巴瘤的治疗策略 | NA | 克服血脑屏障障碍，开发中枢神经系统淋巴瘤的新型治疗方法 | 中枢神经系统淋巴瘤 | 生物医学工程 | 中枢神经系统淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3637 | 2025-10-05 |
Identification of prognostic genes associated with phase separation in lung adenocarcinoma and construction of prognostic models
2025-Oct-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-17884-4
PMID:41044260
|
研究论文 | 本研究通过识别与液-液相分离相关的预后基因构建了肺腺癌预后风险模型 | 首次将液-液相分离相关基因应用于肺腺癌预后预测，并整合单细胞RNA测序数据进行细胞类型特异性表达分析 | 使用公共数据库数据，缺乏外部验证队列 | 开发肺腺癌预后预测模型 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，差异表达分析，LASSO回归，多变量Cox回归 | Cox回归风险模型，列线图 | 基因表达数据，临床数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3638 | 2025-10-05 |
GWAS-informed data integration and non-coding CRISPRi screen illuminate genetic etiology of bone mineral density
2025-Oct-03, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03802-4
PMID:41044600
|
研究论文 | 本研究通过整合GWAS数据和单细胞CRISPRi筛选，揭示了骨矿物质密度遗传病因中的效应基因 | 首次将GWAS信息与单细胞CRISPRi筛选相结合，系统识别BMD GWAS位点中的效应基因 | 研究主要基于人类胎儿成骨细胞，可能无法完全代表其他骨细胞类型或体内环境 | 阐明骨矿物质密度GWAS信号中的效应基因及其作用机制 | 人类胎儿成骨细胞和89个非编码调控元件 | 功能基因组学 | 骨质疏松症 | CRISPR干扰筛选, 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 分层LD评分回归 | CRISPRi | 基因组数据, 转录组数据 | 89个非编码元件筛选 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3639 | 2025-10-05 |
MNDA promotes immunosuppression in microsatellite instability-high colorectal cancer by facilitating PMN-MDSC infiltration via H3K18 lactylation
2025-Oct-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07097-8
PMID:41044625
|
研究论文 | 本研究揭示了MNDA通过促进H3K18乳酸化修饰驱动PMN-MDSC浸润导致MSI-H结直肠癌免疫抑制的新机制 | 首次发现MNDA通过招募EP300介导CXCR2启动子H3K18乳酸化修饰，促进PMN-MDSC浸润和免疫抑制微环境形成 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本，需要更大规模的临床验证 | 探索MSI-H结直肠癌对PD-1抑制剂耐药机制并寻找新的治疗靶点 | 微卫星不稳定性高(MSI-H)结直肠癌 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, ChIP-seq, qRT-PCR, Co-IP | 小鼠MC38 MSI-H结直肠癌模型 | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 基因表达数据 | PD-1敏感和耐药结直肠癌患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3640 | 2025-10-05 |
Integrating bulk RNA-seq, scRNA-seq, and spatial transcriptomics data to identify novel post-translational modification-related molecular subtypes and therapeutic responses in hepatocellular carcinoma
2025-Oct-03, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03964-y
PMID:41044669
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |