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当前共找到 10617 篇文献，本页显示第 3541 - 3560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3541 | 2025-11-03 |
Qingre huazhuo tang regulates IgA nephropathy through immune checkpoints and ferroptosis
2025-Oct, Journal of traditional and complementary medicine
IF:3.3Q1
DOI:10.1016/j.jtcme.2024.11.005
PMID:41169938
|
研究论文 | 本研究通过网络药理学、单细胞测序和实验验证探讨清热化浊汤通过免疫检查点和铁死亡调节IgA肾病的机制 | 首次结合网络药理学、单细胞测序和实验验证系统阐明清热化浊汤治疗IgA肾病的作用机制 | 机制研究仍需进一步深入验证 | 验证清热化浊汤通过免疫检查点和铁死亡调节IgA肾病的机制 | IgA肾病患者的足细胞 | 生物医学 | IgA肾病 | 单细胞测序, 网络药理学, 实验验证 | NA | 单细胞测序数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3542 | 2025-11-03 |
Somatic TEK Mutation Identified in a Patient with Calvarial Venous Malformations
2025-Sep-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16101123
PMID:41153341
|
研究论文 | 首次报道一例儿童颅骨静脉畸形患者携带体细胞TEK L914F突变及其分子机制 | 首次在儿童颅骨静脉畸形中发现体细胞TEK L914F致病突变 | 单一样本病例，需要进一步研究确定治疗靶点 | 探索颅骨静脉畸形的遗传基础 | 16岁女性颅骨静脉畸形患者 | 数字病理 | 血管畸形 | 外显子组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组DNA,RNA测序数据 | 1例患者（病变组织和血液DNA） | NA | 单细胞RNA测序,外显子组测序 | NA | NA |
| 3543 | 2025-11-03 |
TissueFormer: a neural network for labeling tissue from grouped single-cell RNA profiles
2025-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.17.670735
PMID:40894666
|
研究论文 | 提出一种基于Transformer的神经网络TissueFormer，用于从单细胞RNA谱组中推断群体水平标签 | 首次将Transformer架构应用于分析单细胞RNA谱组，同时保留单细胞分辨率并利用细胞组成信号 | 仅在小鼠大脑空间转录组数据上验证，尚未在其他组织或疾病模型中测试 | 开发能够利用细胞组成信号预测群体水平表型的计算方法 | 小鼠大脑皮层区域的空间转录组数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | Transformer | 单细胞RNA表达谱，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 3544 | 2025-11-03 |
Cancer stem cells: landscape, challenges and emerging therapeutic innovations
2025-Aug-05, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02360-2
PMID:40759634
|
综述 | 本文综述了癌症干细胞（CSCs）的特性、挑战及新兴治疗策略 | 整合单细胞测序、空间转录组学和多组学数据揭示CSCs异质性与代谢可塑性，提出双代谢抑制、合成生物学干预等创新疗法 | 缺乏普遍可靠的CSCs生物标志物，难以在不影响正常干细胞的前提下靶向CSCs | 探讨癌症干细胞生物学特性及开发针对性治疗策略 | 癌症干细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞测序, 空间转录组学, 多组学整合, CRISPR筛选, AI驱动分析 | 3D类器官模型 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 3545 | 2025-11-03 |
CHOIR improves significance-based detection of cell types and states from single-cell data
2025-May, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02148-8
PMID:40195561
|
研究论文 | 提出CHOIR方法通过随机森林分类器和置换测试优化单细胞数据聚类，提高细胞类型和状态检测的统计显著性 | 首次将随机森林分类器和置换测试框架应用于层次聚类树，统计确定代表不同细胞群体的聚类 | NA | 解决单细胞数据聚类中过聚类或欠聚类的问题，提高细胞类型识别的有效性 | 单细胞RNA测序、ATAC测序、空间转录组和多组学数据集 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC测序, 空间转录组学, 多组学 | 随机森林, 层次聚类 | 单细胞数据 | 230个模拟数据集和5个真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 3546 | 2025-11-03 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing analysis reveals ACACA as a potential prognostic and immunotherapeutic biomarker across cancers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1599223
PMID:41169354
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序分析，揭示ACACA作为跨癌种潜在预后和免疫治疗生物标志物 | 首次在多癌种水平系统研究ACACA的表达模式及其与免疫微环境的关联 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证仅限于肺癌和肉瘤细胞 | 探索ACACA在癌症中的多组学特征和免疫学意义 | 多种癌症类型（重点关注肺癌和肉瘤） | 生物信息学 | 多癌种（重点关注肺癌和肉瘤） | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,转录组学,蛋白质组学 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,临床数据 | TCGA、CPTAC、HPA和GEO数据库中的多癌种样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 3547 | 2025-11-03 |
ADAM8 in macrophages exacerbates sepsis-induced cardiomyopathy by impeding efferocytosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1654688
PMID:41169382
|
研究论文 | 本研究揭示了ADAM8在巨噬细胞中通过阻碍胞葬作用加剧脓毒症诱发的心肌病 | 首次发现ADAM8在脓毒症心肌病中调控巨噬细胞胞葬作用的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究ADAM8在脓毒症诱发心肌病中的具体作用机制 | 小鼠模型和RAW264.7巨噬细胞系 | 分子生物学 | 脓毒症心肌病 | 单细胞转录组测序，RNA转录组测序，免疫荧光 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3548 | 2025-11-03 |
Multi-omics analysis and evidence of IL1R1 as a potential biomarker for diabetes-associated intervertebral disc degeneration
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1692185
PMID:41169383
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定IL1R1作为糖尿病相关椎间盘退变的潜在生物标志物 | 首次将IL1R1确立为连接2型糖尿病和椎间盘退变的关键分子桥梁，揭示了中性粒细胞介导的炎症机制 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探索2型糖尿病与椎间盘退变之间的共享分子机制 | 人类T2DM和IDD转录组数据集、糖尿病小鼠髓核组织 | 生物信息学 | 糖尿病相关椎间盘退变 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 分子对接 | LASSO, 随机森林, 人工神经网络 | 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 3549 | 2025-11-03 |
Comprehensive analyses of single-cell and bulk RNA-seq reveal the biological and prognostic roles of BMP4 in pancreatic adenocarcinoma
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1686938
PMID:41169612
|
研究论文 | 通过单细胞和bulk RNA-seq综合分析BMP4在胰腺腺癌中的生物学功能和预后作用 | 首次系统揭示BMP4在胰腺癌中的代谢调控功能及其作为独立预后因子的价值 | BMP4对免疫细胞浸润的影响有限，其预后作用主要独立于免疫调节机制 | 探究BMP4在胰腺腺癌中的生物学功能和临床预后意义 | 胰腺腺癌患者样本和细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3550 | 2025-11-03 |
Opportunities and challenges in the application of spatiotemporal transcriptomics in plant research
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1684057
PMID:41169728
|
综述 | 探讨时空转录组学技术在植物研究中的应用机遇与挑战 | 系统阐述空间转录组技术如何整合高通量转录组学与高分辨率组织成像，突破传统转录组学局限 | NA | 为系统揭示生命过程的时空调控提供理论和方法学支持 | 植物组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据，组织图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3551 | 2025-11-03 |
Research advances of the establishment and characterization of Helicobacter pylori infection animal models
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1683366
PMID:41170432
|
综述 | 本文综述了幽门螺杆菌感染动物模型的建立与表征研究进展 | 探讨了空间转录组学在该领域的潜在应用，并系统总结了模型建立的关键要素 | 综述性文章，不包含原始实验数据 | 支持临床前研究，建立稳定可重复的动物模型以模拟人类感染和疾病进展 | 幽门螺杆菌感染动物模型 | NA | 胃部疾病 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3552 | 2025-11-03 |
Multiplets in scRNA-seq data: Extent of the problem and efficacy of methods for removal
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0333687
PMID:41166377
|
研究论文 | 评估单细胞RNA测序数据中多重捕获问题的普遍程度及现有检测方法的有效性 | 通过细胞哈希数据确定真实多重捕获率的下限，揭示常用启发式估计系统性低估问题，并提出改进的泊松模型 | 大多数数据集缺乏多重标记技术验证，研究者只能依赖有限的工具和启发式方法 | 评估单细胞RNA测序中多重捕获问题的严重性和现有检测方法的效能 | 公共可用的单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，细胞哈希技术 | 泊松模型 | 单细胞RNA测序数据 | 多个公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 液滴式单细胞RNA测序 |
| 3553 | 2025-11-02 |
Impaired immune metabolism in COPD driven by dysfunction of CXCL16 + alveolar macrophages: multivariate causal evidence
2025-Dec, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10163-7
PMID:41028288
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了CXCL16+肺泡巨噬细胞功能障碍在慢性阻塞性肺疾病中的因果机制 | 首次通过孟德尔随机化分析确定CXCL16在COPD中的因果作用，并发现其通过破坏免疫代谢稳态驱动疾病进展 | NA | 识别COPD中肺泡巨噬细胞衍生的因果分子驱动因素 | 人类肺组织样本 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 孟德尔随机化分析, 细胞间通讯分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 3554 | 2025-11-02 |
Multi-omics dissection of RAD21-PON1 axis reveals metabolic-immune crosstalk and prognostic significance in hepatocellular carcinoma
2025-Dec, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10166-4
PMID:41143965
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了RAD21-PON1轴在肝细胞癌中连接代谢与免疫的核心调控作用 | 首次发现RAD21通过结合PON1启动子调控代谢通路活性并塑造免疫微环境，建立了RAD21-PON1风险特征用于预后分层 | 研究主要基于组学数据分析，需要进一步的实验验证机制细节 | 探究RAD21是否调控PON1以及该轴如何在肝细胞癌中整合代谢和免疫信号 | 肝细胞癌 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组学, ChIP-seq, 单细胞RNA测序, GSVA, TIDE, LASSO建模 | LASSO | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ChIP-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 3555 | 2025-11-02 |
Gain-of-function PPM1D mutations attenuate ischemic stroke
2025-Nov, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-025-01523-6
PMID:40399534
|
研究论文 | 本研究通过全基因组测序发现功能获得性PPM1D突变可减轻缺血性脑卒中，并鉴定出小分子稳定剂T2755作为潜在治疗方法 | 首次发现功能获得性PPM1D突变对缺血性脑卒中的保护作用，并鉴定出首个PPM1D小分子稳定剂T2755 | 仅在小鼠模型中验证T2755的治疗效果，尚未进行临床试验 | 探索PPM1D基因在缺血性脑卒中中的作用机制并开发新型治疗方法 | 10,241名缺血性脑卒中患者和Ppm1d基因缺陷小鼠 | 基因组学 | 缺血性脑卒中 | 全基因组测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | 集成计算建模, 虚拟筛选 | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | 10,241名患者和基因缺陷小鼠模型 | NA | 全基因组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3556 | 2025-11-02 |
Systemic activation of NRF2 contributes to the therapeutic efficacy of clinically-approved KRAS-G12C anti-cancer drugs
2025-Nov, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03162-7
PMID:40890297
|
研究论文 | 研究发现临床批准的KRAS-G12C抗癌药物通过激活NRF2通路增强其治疗效果 | 首次揭示KRAS-G12C抑制剂通过靶向KEAP1半胱氨酸传感器激活NRF2通路，这是抗癌药物正向调控通常被认为是致癌基因的独特案例 | 未明确说明研究样本的具体数量和来源 | 探索异常激活的NRF2如何影响KRASG12C抑制剂的临床反应 | KRAS突变肺癌患者，特别是伴有KEAP1-NRF2通路共突变的患者 | 癌症治疗 | 肺癌 | 基因敲除，单细胞RNA测序，表面等离子共振 | NA | 基因表达数据，蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3557 | 2025-11-02 |
Unraveling cellular dynamic changes in tumor evolution induced by long-term low dose-rate radiation
2025-Nov, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03128-9
PMID:40913060
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了长期低剂量率辐射诱导肿瘤细胞恶性演化的动态过程 | 首次发现长期低剂量率辐射通过ANGPTL4-SDC4配体-受体对促进肿瘤血管生成并增强细胞恶性表型 | 研究仅使用BEAS-2B细胞系，未涉及其他细胞类型或体内直接验证 | 探究长期低剂量率辐射对肿瘤细胞恶性演化的影响机制 | BEAS-2B细胞系及其辐射诱导的肿瘤细胞 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | scRNA-seq, FACS, 分子对接, 多重免疫组化, qRT-PCR, 免疫共沉淀 | 细胞轨迹分析, 细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据, 基因组数据, 蛋白互作数据 | BEAS-2B细胞系及其辐射处理后的衍生细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3558 | 2025-11-02 |
VEGF-D Protects the Lung in Neonatal Hyperoxia-induced Lung Injury
2025-Nov, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0544OC
PMID:40343859
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研究论文 | 本研究探讨VEGF-D在新生儿高氧诱导肺损伤中的保护作用及其机制 | 首次揭示肺泡成纤维细胞通过表达VEGF-D调控淋巴管生成和淋巴管结构在BPD中的关键作用 | 研究基于小鼠模型，临床转化需进一步验证 | 阐明VEGF-D在支气管肺发育不良发病机制中的保护作用 | 新生小鼠肺组织 | 病理生理学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序, 定量PCR, 基因敲除 | 动物疾病模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量的小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3559 | 2025-11-02 |
Reply to 'Enhancing spatial transcriptomics in clear-cell renal cell carcinoma'
2025-Nov, Nature reviews. Urology
DOI:10.1038/s41585-025-01086-8
PMID:40866723
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3560 | 2025-11-02 |
Enhancing spatial transcriptomics in clear-cell renal cell carcinoma
2025-Nov, Nature reviews. Urology
DOI:10.1038/s41585-025-01085-9
PMID:40866724
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |