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当前共找到 10579 篇文献，本页显示第 3541 - 3560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3541 | 2025-10-05 |
MORPH Predicts the Single-Cell Outcome of Genetic Perturbations Across Conditions and Data Modalities
2025-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.27.661992
PMID:40631143
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研究论文 | 提出MORPH框架用于预测单细胞水平上遗传扰动的响应结果 | 结合差异变分自编码器和注意力机制，能够预测未见过的扰动、扰动组合及新细胞环境中的扰动响应 | NA | 开发能够跨条件和数据模态预测遗传扰动单细胞结果的计算模型 | 单细胞对遗传扰动的响应 | 计算生物学 | NA | 单细胞转录组学，成像技术 | 变分自编码器，注意力机制 | 单细胞转录组数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3542 | 2025-10-05 |
α7 nicotinic acetylcholine receptors regulate radial glia fate in the developing human cortex
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61167-5
PMID:40593693
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研究论文 | 本研究阐明了烟碱型乙酰胆碱受体在人类皮质发育过程中对放射状胶质细胞命运的调控机制 | 首次发现人类特异性CHRFAM7A亚基在放射状胶质细胞末端富集，并揭示YAP1作为nAChR信号通路下游关键效应分子 | 研究主要基于体外培养模型，需要进一步在体验证 | 探究产前尼古丁暴露影响人类皮质发育的细胞分子机制 | 人类皮质发育过程中的放射状胶质细胞和神经前体细胞 | 发育神经生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序，器官型切片培养，分散细胞培养，基因敲降 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3543 | 2025-10-05 |
Oncogenic drivers shape the tumor microenvironment in human gliomas
2025-May-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.16.654515
PMID:40475555
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学和空间转录组学分析，揭示致癌驱动因素如何塑造人类胶质瘤的肿瘤微环境 | 首次系统比较线性染色体扩增与ecDNA扩增对胶质瘤微环境的不同影响，发现扩增模式决定肿瘤空间结构和转录动态 | 样本量相对有限（93个样本），且仅针对特定基因突变类型进行分析 | 探究基因组改变对胶质瘤微环境的影响机制 | 人类胶质瘤样本，包括IDH突变型和IDH野生型胶质母细胞瘤 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 全基因组测序, Hi-C, RNA-seq, 单细胞空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 93个胶质瘤样本（来自69名患者），包括46个IDH突变胶质瘤和47个IDH野生型胶质母细胞瘤 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | Xenium | 10x Xenium 单细胞空间转录组平台 |
| 3544 | 2025-10-05 |
Machine learning integration of single-cell and bulk transcriptomics identifies fibroblast-driven prognostic markers in colorectal cancer
2025-Apr-22, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2025.12038
PMID:40266079
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据，识别结直肠癌中成纤维细胞驱动的预后标志物 | 首次通过机器学习整合单细胞和批量转录组数据，构建了七基因成纤维细胞相关预后特征 | 研究样本量相对有限，需要在更多独立队列中验证 | 开发结直肠癌的预后生物标志物和个性化治疗策略 | 结直肠癌肿瘤微环境中的成纤维细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 机器学习整合方法 | 基因表达数据 | 306个CRC样本（448,255个细胞），TCGA-COAD队列351例，GSE17536数据集177例 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 3545 | 2025-10-05 |
Single-cell profiling transcriptomic reveals cellular heterogeneity and cellular crosstalk in breast cancer lymphatic node, bone, and brain metastases
2025-01-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85531-z
PMID:39820531
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示乳腺癌淋巴结、骨和脑转移中的细胞异质性和细胞间通讯 | 首次在单细胞水平系统比较乳腺癌原发灶与淋巴结、骨和脑转移灶的微环境差异，发现pCAFs在转移中的主导作用及恶性上皮细胞亚群的分化轨迹 | 样本量较小（原发灶n=4，淋巴结转移n=4，脑转移n=3，骨转移n=2），数据来源于公共数据库 | 探索乳腺癌转移过程中的细胞异质性和细胞间相互作用机制 | 乳腺癌患者组织样本（原发灶和转移灶） | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组化染色，多光谱免疫组化染色 | InferCNV，CellChat，基因集变异分析 | 单细胞转录组数据，图像数据 | 13例样本（4例原发灶，4例淋巴结转移，3例脑转移，2例骨转移） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3546 | 2025-10-05 |
Cross-species analyses of thymic mimetic cells reveal evolutionarily ancient origins and both conserved and species-specific elements
2025-Jan-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.11.025
PMID:39731911
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研究论文 | 通过跨物种分析揭示胸腺模拟细胞的进化起源和物种特异性特征 | 首次对人类和斑马鱼胸腺模拟细胞进行单细胞RNA测序分析，并与小鼠数据整合比较 | 主要使用儿科供体样本，成人样本代表性可能不足 | 探索胸腺模拟细胞的进化保守性和物种特异性特征 | 人类、小鼠和斑马鱼的胸腺模拟细胞 | 单细胞生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序，成像分析 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 人类儿科供体的纯化模拟细胞区室 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3547 | 2025-10-05 |
AEnet: a practical tool to construct the splicing-associated phenotype atlas at a single cell level
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf110
PMID:40990037
|
研究论文 | 开发了一种结合基因表达和可变剪接模式的单细胞分析方法AEnet，用于构建剪接相关表型图谱 | 首次将基因表达水平与可变剪接模式相结合来定义细胞亚群，并识别关键剪接事件及其调控机制 | 单细胞测序技术固有的测序深度浅、高丢失率和批次效应等限制 | 开发单细胞水平剪接相关表型图谱构建工具 | 肿瘤细胞、泛癌免疫细胞和胚胎细胞 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3548 | 2025-10-05 |
Loss of PI5P4Kα Slows the Progression of a Pten Mutant Basal Cell Model of Prostate Cancer
2025-01-02, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-24-0290
PMID:39382632
|
研究论文 | 本研究开发了基底细胞特异性基因工程小鼠模型，发现PI5P4Kα缺失可减缓Pten突变前列腺癌模型的肿瘤进展 | 首次揭示了PI5P4Kα在前列腺基底细胞中的富集特性及其在Pten突变癌症模型中的肿瘤抑制作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 探究PI5P4Kα在前列腺基底细胞癌症进展中的作用机制 | 基因工程小鼠模型和LNCaP前列腺癌细胞 | 癌症生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，谱系追踪，转录组通路分析 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据，组织病理学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3549 | 2025-10-05 |
The immune checkpoint TIM-3/HMGB-1 axis in myocardial infarction
2025, NPJ cardiovascular health
DOI:10.1038/s44325-025-00061-x
PMID:40978514
|
研究论文 | 本研究揭示了心肌梗死后免疫检查点TIM-3/HMGB-1轴在心脏炎症中的关键作用 | 首次系统研究TIM-3通路在心肌梗死中的作用，发现TIM-3/HMGB-1相互作用是心脏炎症的新靶点 | 样本量相对有限，机制研究主要基于体外实验 | 探究免疫检查点TIM-3通路在心肌梗死后的作用机制 | 人类血清、外周血单核细胞和心脏组织 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 血清样本357例，PBMCs样本76例（38例患者+38例对照） | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3550 | 2025-10-05 |
Understanding and mitigating the impact of ambient mRNA contamination in single-cell RNA-sequencing analysis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0332440
PMID:40991648
|
研究论文 | 本研究探讨了环境mRNA污染对单细胞RNA测序分析的影响，并评估了两种校正方法的有效性 | 首次系统评估环境mRNA污染对差异基因表达和通路富集分析的影响，并比较两种校正方法的性能 | 仅使用了两个独立数据集，可能无法代表所有单细胞RNA测序场景 | 理解和减轻环境mRNA污染对单细胞RNA测序分析的影响 | 登革热患者外周血单个核细胞和人类胎儿肝组织样本 | 单细胞转录组学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | CellBender, SoupX | 单细胞转录组数据 | 10个PBMC样本和42个人类胎儿肝组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 液滴式单细胞RNA测序平台 |
| 3551 | 2025-10-05 |
The role of microglia and complement C5/C5a in the pathogenesis of rhegmatogenous retinal detachment with choroidal detachment
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.08.019
PMID:40994539
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析孔源性视网膜脱离伴脉络膜脱离的细胞和分子特征，探讨小胶质细胞和补体C5/C5a通路在疾病发病机制中的作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示RRDCD独特的细胞景观，发现小胶质细胞与树突状细胞间增强的连接性以及补体C5-C5AR1相互作用的上调 | 样本量相对有限，研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证 | 识别区分RRDCD与典型RRD的细胞和分子特征，研究小胶质细胞和补体C5/C5a通路在疾病发病机制中的作用 | 孔源性视网膜脱离伴脉络膜脱离患者的玻璃体样本，原代视网膜小胶质细胞，RF/6A内皮细胞和ARPE-19上皮细胞 | 单细胞组学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序，体外共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据 | RRD和RRDCD患者的玻璃体样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3552 | 2025-10-05 |
Single-cell multi-omics data reveal heterogeneity in liver tissue microenvironment induced by hypertension
2025-Dec-09, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2025.102696
PMID:40989794
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术揭示高血压诱导的肝组织微环境异质性 | 首次在单细胞分辨率上识别高血压相关的肝细胞亚群及其调控网络 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 探究高血压对肝脏细胞亚群和微环境的影响 | 正常和高血压肝组织 | 单细胞多组学 | 高血压 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 组蛋白ChIP测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 3553 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals a novel porcine alveolar macrophage subtype with high SLAMF7 expression promoting PRRSV infection
2025-Dec, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2025.2560894
PMID:40944943
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现猪肺泡巨噬细胞新亚型，揭示SLAMF7高表达促进PRRSV感染机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出具有高PRRSV感染率的猪肺泡巨噬细胞新亚型S5和SS6，并发现SLAMF7是促进PRRSV感染和炎症反应的关键基因 | 体外培养的PAMs可能无法完全反映体内疾病过程，仅部分GO术语和KEGG通路重合 | 研究PRRSV感染机制及猪肺泡巨噬细胞在病毒感染中的作用 | 猪肺泡巨噬细胞、T细胞、B细胞 | 单细胞转录组学 | 猪繁殖与呼吸综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3554 | 2025-10-05 |
T Cells Expressing Ras Homolog Family Member a Display Enhanced Cytotoxicity but are Reduced in Lupus Peripheral Blood
2025-Oct, Immunological investigations
IF:2.9Q3
DOI:10.1080/08820139.2025.2517364
PMID:40536306
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研究论文 | 本研究探讨系统性红斑狼疮患者T细胞亚群中RhoA的表达及其临床意义 | 首次发现RhoA+T细胞具有增强的细胞毒性功能，并可能作为SLE的早期免疫学标志物 | 样本量有限，主要关注新诊断患者，需要更大规模研究验证 | 探索RhoA在系统性红斑狼疮T细胞亚群中的表达和临床相关性 | 系统性红斑狼疮患者和健康对照者的外周血T细胞亚群 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, ROC曲线分析 | NA | 流式细胞数据, 单细胞转录组数据 | 新诊断SLE患者和年龄性别匹配的健康对照者外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3555 | 2025-10-05 |
MAN1A1 promotes colorectal cancer liver metastasis by maintaining TGFBR2 protein stability
2025-Sep-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025164
PMID:40999906
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现MAN1A1通过维持TGFBR2蛋白稳定性促进结直肠癌肝转移 | 首次揭示MAN1A1通过延长TGFBR2蛋白半衰期促进结直肠癌肝转移的分子机制 | 未详细说明MAN1A1调控TGFBR2蛋白稳定性的具体分子通路 | 探究结直肠癌肝转移的分子机制及潜在治疗靶点 | 结直肠癌细胞及肝转移组织 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, Transwell实验, 基因操作 | NA | 基因表达数据, 蛋白质稳定性数据 | 公共数据库中的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3556 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomics reveals apolipoprotein A4-mediated metabolic-immune reprogramming in lymphocytes during early obesity-related chronic kidney disease
2025-Sep-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025171
PMID:40999903
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了载脂蛋白A4在肥胖相关慢性肾病早期淋巴细胞代谢-免疫重编程中的关键调控作用 | 首次发现Apoa4通过调节淋巴细胞代谢和免疫功能在肥胖相关慢性肾病早期发挥保护作用，揭示了肾脏免疫代谢景观的重塑机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；机制研究仍需进一步深入 | 探究Apoa4在肥胖诱导的慢性肾病早期免疫细胞代谢和功能调控中的作用 | 野生型和Apoa4敲除小鼠的肾脏淋巴细胞 | 单细胞生物学 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫荧光染色，qPCR | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据，基因表达数据 | 野生型和Apoa4敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3557 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing across diverse cell types to identify PFOA-induced ovarian cellular senescence
2025-Sep-24, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119089
PMID:40997563
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究PFOA暴露诱导卵巢细胞衰老的机制 | 首次从细胞衰老角度揭示PFOA卵巢毒性的单细胞水平机制，发现卵丘细胞对PFOA诱导的耗竭特别敏感 | 研究仅使用小鼠模型，样本量相对有限 | 探究PFOA暴露导致卵巢功能障碍的细胞机制 | 雌性ICR小鼠卵巢组织 | 单细胞组学 | 生殖功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 29,000+个细胞，8个不同细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3558 | 2025-10-05 |
Inflammatory, transcriptomic, and cell fate responses underlying the mammalian transmission of avian influenza viruses
2025-Sep-23, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00647-25
PMID:40778772
|
研究论文 | 本研究通过雪貂鼻上皮细胞对H1N1禽流感病毒的反应，揭示了与病毒空气传播能力相关的宿主应答机制 | 首次在哺乳动物呼吸道关键部位识别出与禽流感病毒空气传播表型相关的特异性宿主反应特征 | 研究仅限于雪貂模型，需要进一步验证在人类中的适用性 | 探究禽流感病毒在哺乳动物呼吸道中的宿主反应与空气传播能力的关系 | 雪貂鼻上皮细胞和H1N1禽流感病毒株 | 转录组学 | 流感 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 雪貂鼻上皮细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3559 | 2025-10-05 |
Comprehensive characterization of the molecular feature of acetylation in colorectal cancer using integrated single-cell and bulk RNA sequencing
2025-Sep-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-21081-8
PMID:40987803
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序技术，全面表征结直肠癌中乙酰化的分子特征 | 首次结合单细胞RNA测序和WGCNA分析结直肠癌乙酰化特征，开发了乙酰化相关预后标志物 | 研究基于公共数据库的样本，需要进一步实验验证 | 探索结直肠癌中乙酰化特征与预后和免疫微环境的关系 | 结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, WGCNA, ssGSEA | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 两个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 3560 | 2025-10-05 |
High expression of Fgr in the left ventricle attenuates myocardial injury in the infarcted region via regulating the phosphorylation level of PI3K/Akt
2025-Sep-23, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20253737
PMID:41004172
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研究论文 | 本研究探讨Fgr基因在急性心肌梗死中的保护作用及其通过调节PI3K/Akt磷酸化的分子机制 | 首次揭示Fgr在心血管疾病特别是急性心肌梗死中的保护作用，并通过多组学数据验证其调控PI3K/Akt信号通路的机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，尚未在人类临床样本中直接验证 | 探究Fgr在心肌梗死中的保护作用及其分子机制 | 大鼠左心室心肌组织、H9C2心肌细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 转录组关联分析、bulk RNA测序、空间转录组学、单核RNA测序、siRNA敲低、药理学抑制 | 大鼠左前降支冠状动脉结扎模型、体外氧糖剥夺模型 | 转录组数据、空间转录组数据、单细胞测序数据 | 大鼠模型和细胞系，具体样本数量未明确说明 | NA | 空间转录组学,单核RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |