单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
3521	2024-12-20	Characterisation of the tumour microenvironment and PD-L1 granularity reveals the prognostic value of cancer-associated myofibroblasts in non-invasive bladder cancer 2025-Dec, Oncoimmunology IF:6.5Q1 DOI:10.1080/2162402X.2024.2438291 PMID:39698899	研究论文	研究分析了非肌肉浸润性膀胱癌（NMIBC）的肿瘤微环境（TME）组成和PD-L1表达，并探讨了癌症相关肌成纤维细胞（myoCAF）的预后价值	首次系统分析了NMIBC的肿瘤微环境组成，并揭示了myoCAF在预测疾病进展和复发中的潜在预后价值	研究样本量有限，且仅限于NMIBC患者，结果的普适性有待进一步验证	探讨NMIBC的肿瘤微环境特征及其在治疗预后中的作用	NMIBC患者的肿瘤和非肿瘤组织样本	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组学分析、组织微阵列	NA	组织	73名NMIBC患者及888名独立队列患者
3522	2024-12-20	VNN2 regulates hepatic steroid synthesis in response to dietary changes 2025-Feb-10, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2024.149128 PMID:39613052	研究论文	研究探讨了VNN2在鸡肝脏中对脂质代谢和类固醇合成的调控作用	首次揭示了VNN2通过上调MSMO1和FDPS促进类固醇合成的机制	研究仅在鸡肝脏中进行，未涉及其他物种或组织	研究VNN2在肝脏脂质代谢和类固醇合成中的具体功能	鸡肝脏中的VNN2表达及其对脂质代谢和类固醇合成的影响	NA	NA	RNA测序、qPCR、甘油三酯和总胆固醇检测	NA	RNA测序数据	使用了多个数据集，包括GSM5764402、GSM5764403、GSE128340、GSE129840和PRJEB44038
3523	2024-12-20	Neuropilin-1 is a novel host factor modulating the entry of hepatitis B virus 2025-Jan, Journal of hepatology IF:26.8Q1 DOI:10.1016/j.jhep.2024.06.032 PMID:38960374	研究论文	本研究探讨了神经纤毛蛋白-1（NRP1）作为乙型肝炎病毒（HBV）感染的新型宿主因子，通过与HBV preS1和NTCP相互作用调节HBV进入肝细胞的过程	首次发现NRP1作为HBV感染的新型宿主因子，通过与preS1和NTCP形成复合物调节HBV进入肝细胞	研究主要基于细胞模型和动物模型，尚未在人体中进行验证	探讨其他宿主因子是否调节HBV感染过程	儿童肝活检样本、原代人肝细胞、HepG2-NTCP细胞和人肝嵌合小鼠	NA	乙型肝炎	单细胞测序	NA	细胞	儿童肝活检样本、原代人肝细胞、HepG2-NTCP细胞和人肝嵌合小鼠
3524	2024-12-20	Clinical Implications of Basic Research: Exploring the Transformative Potential of Spatial 'Omics in Uro-oncology 2025-Jan, European urology IF:25.3Q1 DOI:10.1016/j.eururo.2024.08.025 PMID:39227262	研究论文	本文探讨了空间'组学技术在泌尿肿瘤学中的临床应用潜力	本文介绍了新的空间分子技术，通过绘制肿瘤的空间分子结构，揭示了肿瘤内部和周围的复杂异质性，为疾病的发展、进展、诊断和治疗提供了新的见解	当前的挑战包括试剂成本高、协议标准化和计算需求大	探索空间'组学技术在泌尿肿瘤学中的转化潜力，推动个性化癌症治疗的未来	泌尿系统肿瘤	数字病理学	泌尿系统肿瘤	空间转录组学，空间蛋白质组学	NA	基因组，转录组，蛋白质组	NA
3525	2024-12-20	Intrahepatic Exhausted Antiviral Immunity in an Immunocompetent Mouse Model of Chronic Hepatitis B 2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.101412 PMID:39349249	研究论文	本文开发了一种免疫功能正常的慢性乙型肝炎（CHB）小鼠模型，用于研究肝内免疫动力学	本文首次开发了一种免疫功能正常的CHB小鼠模型，能够模拟患者肝内耗竭的抗病毒免疫反应，并展示了通过肝靶向TLR7激动剂恢复耗竭免疫细胞功能的可能性	本文仅在动物模型中进行了研究，尚未在人类患者中验证其结果	开发一种能够模拟慢性乙型肝炎患者肝内免疫动力学的小鼠模型，并探索潜在的治疗策略	慢性乙型肝炎小鼠模型的肝内免疫反应	NA	乙型肝炎	单细胞RNA测序	NA	RNA	C57BL/6J同源FAH敲除小鼠
3526	2024-12-20	Identification of cell-type specificity, trans- and cis-acting functions of plant lincRNAs from single-cell transcriptomes 2025-Jan, The New phytologist DOI:10.1111/nph.20269 PMID:39550625	研究论文	本文通过单细胞转录组数据识别了植物lincRNAs的细胞类型特异性及其顺反作用功能	首次利用单细胞RNA测序技术在单细胞分辨率下研究植物lincRNAs的细胞类型特异性及其在细胞分化中的作用，并构建了一个在线平台PscLncRNA用于搜索和可视化这些lincRNAs	NA	研究植物lincRNAs在单细胞水平上的细胞类型特异性及其顺反作用功能	植物lincRNAs及其在细胞分化中的作用	基因组学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	来自水稻、拟南芥、番茄和玉米等多种植物组织的单细胞转录组数据
3527	2024-12-19	Abatacept Induces Long-Term Reconstitution of the B-Cell Niche in a Patient With CTLA-4 Haploinsufficiency: A Case Report 2025-Mar, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation DOI:10.1212/NXI.0000000000200351 PMID:39689284	病例报告	本文报告了一例CTLA-4单倍体不足患者在接受abatacept治疗后，B细胞微环境长期重建的病例	首次展示了abatacept在CTLA-4单倍体不足患者中对骨髓功能的长期影响，并通过单细胞RNA测序验证了B细胞的重建	由于是单一病例报告，缺乏对照组，证据级别较低	探讨abatacept在CTLA-4单倍体不足患者中的长期疗效及其对骨髓功能的影响	一名39岁CTLA-4单倍体不足女性患者，伴有中枢神经系统受累、多器官自身免疫和淋巴细胞减少	NA	自身免疫性疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	单一病例
3528	2024-12-19	Dedifferentiation of vascular smooth muscle cells upon vessel injury 2025-Jan-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113691 PMID:39591824	综述	本文综述了血管平滑肌细胞在血管损伤后的去分化过程及其机制	利用单细胞RNA测序技术揭示了血管平滑肌细胞在健康和病理状态下的复杂多样性	NA	探讨血管损伤后血管平滑肌细胞去分化的动态过程及其机制	血管平滑肌细胞在血管损伤后的去分化过程	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
3529	2024-12-18	A bipolar disorder-associated missense variant alters adenylyl cyclase 2 activity and promotes mania-like behavior 2025-Jan, Molecular psychiatry IF:9.6Q1 DOI:10.1038/s41380-024-02663-w PMID:39003412	研究论文	本文研究了与双相情感障碍相关的单核苷酸多态性rs13166360对腺苷酸环化酶2（ADCY2）活性和小鼠狂躁样行为的影响	首次展示了ADCY2错义突变通过改变亚细胞定位降低酶生成第二信使cAMP的能力，并建立了携带该突变的小鼠模型，揭示了其与狂躁样行为和认知障碍的关系	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨ADCY2基因突变与双相情感障碍的关联及其潜在机制	ADCY2基因突变对小鼠行为和神经生物学过程的影响	NA	双相情感障碍	CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	携带ADCY2基因突变的小鼠
3530	2024-12-18	Blockade of purine metabolism reverses macrophage immunosuppression and enhances anti-tumor immunity in non-small cell lung cancer 2025-Jan, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1 DOI:10.1016/j.drup.2024.101175 PMID:39608215	研究论文	本研究探讨了非小细胞肺癌中巨噬细胞通过嘌呤代谢介导的免疫抑制作用及其对免疫治疗效果的影响	首次揭示了嘌呤代谢在巨噬细胞免疫抑制中的关键作用，并提出阻断嘌呤代谢与免疫检查点阻断联合治疗可能产生协同效应	研究主要基于小鼠模型，需进一步验证在人体中的效果	评估巨噬细胞通过与癌细胞的代谢交流调节非小细胞肺癌进展及其对免疫治疗效果的影响	非小细胞肺癌中的巨噬细胞及其代谢调控机制	数字病理学	肺癌	单细胞测序、流式细胞术、免疫荧光、ELISA、RNA测序	NA	单细胞数据、组织样本	C57BL/6 J小鼠模型
3531	2024-12-17	Diagnosis of acute lymphoblastic leukaemia: an overview of the current genomic classification, diagnostic approaches, and future directions 2025-Jan, Histopathology IF:3.9Q1 DOI:10.1111/his.15338 PMID:39403021	综述	本文综述了B-急性淋巴细胞白血病的当前基因组分类、诊断方法及未来发展方向	介绍了下一代测序、全基因组转录组测序、光学基因组图谱、甲基化分析和单细胞测序等新技术在B-ALL诊断中的应用	NA	探讨B-ALL的最新诊断标准和技术，以及新技术和生物标志物在提高诊断准确性中的重要性	B-急性淋巴细胞白血病	数字病理学	血液疾病	下一代测序、全基因组转录组测序、光学基因组图谱、甲基化分析、单细胞测序	NA	基因组数据	NA
3532	2024-12-15	Modulating Treg cell activity in prostate cancer via chitosan nanoparticles loaded with si-BATF/PRDM1 2025-Jan-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113445 PMID:39577215	研究论文	本研究探讨了通过装载si-BATF/PRDM1的壳聚糖纳米颗粒调节调节性T细胞活性以抑制前列腺癌发展的潜力	首次展示了壳聚糖纳米颗粒在体内外实验中有效递送siRNA，抑制BATF和PRDM1表达，从而抑制肿瘤生长和转移	研究主要集中在体外和体内实验，尚未进行临床试验验证其疗效	探索通过调节Treg细胞活性来抑制前列腺癌发展的方法	前列腺癌中的Treg细胞活性	数字病理学	前列腺癌	单细胞测序、基因沉默	NA	基因表达数据	具体样本数量未在摘要中提及
3533	2024-12-15	ITGB4/GNB5 axis promotes M2 macrophage reprogramming in NSCLC metastasis 2025-Jan-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113564 PMID:39577216	研究论文	研究探讨了ITGB4/GNB5轴在调节M2巨噬细胞重编程及影响非小细胞肺癌（NSCLC）转移中的作用和潜在机制	首次揭示了ITGB4/GNB5轴通过促进M2巨噬细胞极化，增强其在肿瘤微环境中的功能，从而促进NSCLC的侵袭和转移	研究主要集中在体外细胞实验和体内小鼠模型，尚未在临床样本中验证其机制	探讨ITGB4/GNB5轴在NSCLC转移中的作用及其分子机制	非小细胞肺癌（NSCLC）中的M2巨噬细胞及其相关分子ITGB4和GNB5	数字病理学	肺癌	单细胞测序技术、流式细胞术、免疫组化、RNA测序、蛋白质组分析	NA	单细胞数据、RNA数据、蛋白质数据	包括体外细胞实验和体内小鼠模型
3534	2024-12-15	Downregulation of CD36 alleviates IgA nephropathy by promoting autophagy and inhibiting extracellular matrix accumulation in mesangial cells 2025-Jan-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113672 PMID:39616852	研究论文	本研究探讨了CD36在IgA肾病中的作用，发现CD36下调通过促进自噬和抑制细胞外基质积累减轻了肾小球系膜细胞的损伤	首次揭示了CD36在IgA肾病中的关键作用，并证明了CD36下调通过抑制细胞外基质积累和恢复自噬来减轻肾小球系膜细胞的损伤	研究主要基于细胞实验和小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探讨CD36在IgA肾病中的作用及其潜在的治疗价值	IgA肾病患者肾组织和肾小球系膜细胞	NA	肾病	单细胞测序 RNA-seq	NA	基因表达数据	包括IgA肾病患者和正常对照的肾组织数据，以及小鼠肾小球系膜细胞
3535	2024-12-15	Identification of an immune-related gene panel for the diagnosis of pulmonary arterial hypertension using bioinformatics and machine learning 2025-Jan-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113694 PMID:39616855	研究论文	本研究旨在通过生物信息学和机器学习筛选与肺动脉高压（PAH）诊断相关的免疫相关基因（IRG）面板，并开发一种新的诊断方法	本研究首次通过机器学习算法筛选出与PAH诊断相关的免疫相关基因面板，并验证了其在肺组织和外周血单核细胞中的诊断效用	本研究主要基于小鼠模型和公共数据库中的基因表达数据，未来需要在更大规模的人类样本中进行验证	筛选与肺动脉高压诊断相关的免疫相关基因面板，并开发新的诊断方法	肺动脉高压（PAH）的诊断	生物信息学	肺动脉高压	机器学习	LASSO, 随机森林, 提升回归树, XGBoost, 支持向量机递归特征消除	基因表达数据	36个上调和17个下调的免疫相关基因差异表达基因（IRG-DEGs），以及来自PAH小鼠模型的肺组织样本和外周血单核细胞样本
3536	2024-12-15	SARS-CoV-2 N protein induces alveolar epithelial apoptosis via NLRP3 pathway in ARDS 2025-Jan-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113503 PMID:39591821	研究论文	本研究探讨了SARS-CoV-2核衣壳蛋白N通过NLRP3途径诱导肺泡上皮细胞凋亡，从而加重急性呼吸窘迫综合征（ARDS）的分子机制	首次揭示了SARS-CoV-2 N蛋白通过激活NLRP3信号通路，促进M1巨噬细胞极化和释放促炎因子，导致肺泡上皮细胞凋亡	研究主要集中在体外和动物模型中，尚未在人体中进行验证	探讨SARS-CoV-2 N蛋白如何通过NLRP3途径诱导肺泡上皮细胞凋亡，从而加重ARDS	SARS-CoV-2 N蛋白、肺泡巨噬细胞、肺泡上皮细胞、ARDS患者和ARDS小鼠模型	数字病理学	急性呼吸窘迫综合征	单细胞RNA测序、免疫沉淀、拉下实验、酶联免疫吸附测定（ELISA）、逆转录定量PCR（RT-qPCR）、蛋白质印迹、流式细胞术	NA	RNA	ARDS患者的单细胞RNA测序数据、MH-S巨噬细胞和MLE-12上皮细胞的体外实验、CLP手术或N蛋白给药诱导的ARDS小鼠模型
3537	2024-12-15	FAP+ gastric cancer mesenchymal stromal cells via paracrining INHBA and remodeling ECM promote tumor progression 2025-Jan-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113697 PMID:39615112	研究论文	研究探讨了FAP阳性胃癌间质细胞通过旁分泌INHBA和重塑ECM促进肿瘤进展的机制	首次揭示了FAP阳性胃癌间质细胞通过旁分泌INHBA和重塑ECM促进胃癌进展的机制	研究主要基于体外实验和临床病理数据，缺乏体内实验验证	探讨FAP阳性胃癌间质细胞在胃癌进展中的作用及其分子机制	FAP阳性胃癌间质细胞及其对胃癌细胞的影响	数字病理学	胃癌	流式细胞术、单细胞RNA测序、ELISA、免疫组化、Masson三色染色	NA	基因表达数据、蛋白质数据	临床病理数据和胃癌患者的单细胞RNA测序数据库
3538	2024-12-15	Immunogenic clearance combined with PD-1 blockade elicits antitumor effect by promoting the recruitment and expansion of the effector memory-like CD8+T cell 2025-Jan, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2024.102209 PMID:39608213	研究论文	本研究探讨了免疫原性清除与PD-1阻断联合治疗在促进效应记忆样CD8+T细胞招募和扩增中的抗肿瘤作用	本研究通过单细胞RNA测序揭示了免疫原性清除联合PD-1阻断治疗在肿瘤微环境中增加效应记忆样CD8+T细胞的机制	研究中对免疫原性清除增强ICB反应的具体机制仍不完全清楚	阐明免疫原性清除增强免疫检查点阻断反应的细胞机制	效应记忆样CD8+T细胞在肿瘤微环境中的作用	免疫学	癌症	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
3539	2024-12-14	scSFCL:Deep clustering of scRNA-seq data with subspace feature confidence learning 2025-Feb, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.compbiolchem.2024.108292 PMID:39591807	研究论文	提出了一种基于子空间特征置信度学习的深度聚类方法scSFCL，用于单细胞RNA测序数据的聚类分析	通过子空间特征置信度学习结合图卷积网络和加权方法，筛选出判别性特征子集，并利用相互监督的聚类方法融合通用结构信息和特异性信息	未提及具体限制	提高单细胞RNA测序数据的深度聚类性能	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	图卷积网络	基因表达数据	多个单细胞RNA测序数据集
3540	2024-12-14	Combined single-cell RNA sequencing and mendelian randomization to identify biomarkers associated with necrotic apoptosis in intervertebral disc degeneration 2025-Jan, The spine journal : official journal of the North American Spine Society DOI:10.1016/j.spinee.2024.09.011 PMID:39332686	研究论文	本研究结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，识别与椎间盘退变中坏死性凋亡相关的生物标志物	首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，揭示了NT5E和TMEM158作为坏死性凋亡相关生物标志物与椎间盘退变的因果关系	研究为回顾性队列研究，样本量和数据集的多样性可能限制了结果的普适性	识别与椎间盘退变中坏死性凋亡相关的生物标志物，揭示其病理机制，并为诊断和治疗提供新方向	椎间盘退变中的坏死性凋亡相关生物标志物	数字病理学	脊柱疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、孟德尔随机化分析（MR）	NA	单细胞RNA测序数据	GSE205535数据集中包含16种不同的细胞群体，进一步注释为8种细胞类型