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当前共找到 10572 篇文献，本页显示第 3481 - 3500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3481 | 2025-12-20 |
The tree labeling polytope: a unified approach to ancestral reconstruction problems
2025-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.14.638328
PMID:40027631
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研究论文 | 本文提出了一种基于树标记多面体的统一方法，用于解决系统发育树中的祖先状态重建问题，并展示了其在多种现代应用中的有效性 | 引入了树标记多面体这一几何框架，将祖先重建问题转化为线性规划问题，并支持额外全局约束的整合，相比传统动态规划方法更具灵活性和扩展性 | NA | 开发一种统一的多面体方法，以高效解决系统发育树中的祖先状态重建问题，特别是在存在额外全局约束的情况下 | 系统发育树及其祖先状态标记 | 计算生物学 | 肺癌 | 线性规划、混合整数规划 | NA | 系统发育树数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3482 | 2025-12-20 |
Decoding cardiac metabolic reprogramming through single-cell multi-omics: from mechanisms to therapeutic applications
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1710474
PMID:41403700
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综述 | 本文综述了单细胞多组学技术如何揭示心脏代谢重编程在心血管疾病中的机制，并探讨了其治疗应用前景 | 系统整合了单细胞转录组学、表观基因组学和空间转录组学等前沿技术，首次在单细胞分辨率下系统解析心脏细胞的代谢异质性、动态变化和细胞间通讯，并连接基础机制与代谢靶向干预策略 | 将研究发现转化为临床实践仍面临挑战，包括技术标准化、数据整合及临床验证等方面的障碍 | 阐明心脏代谢重编程在心血管疾病中的病理机制，并探索基于代谢干预的治疗策略 | 心脏细胞（在生理和病理条件下） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学，单细胞表观基因组学，空间转录组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 3483 | 2025-12-20 |
Integrative multi-omics analysis identifies a PTM-related immune signature and IRF9 as a driver in ccRCC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1707375
PMID:41403935
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，在透明细胞肾细胞癌中鉴定了一个与翻译后修饰相关的免疫特征，并发现IRF9作为驱动因子 | 首次构建了一个基于翻译后修饰的五基因预后特征，并实验验证了IRF9在ccRCC中的功能驱动作用 | 研究主要基于回顾性队列和生物信息学分析，需要进一步的前瞻性临床验证 | 开发ccRCC的预后生物标志物并探索其免疫治疗反应预测价值 | 透明细胞肾细胞癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肾癌 | 多组学分析，单细胞RNA-seq，免疫组化，qPCR，功能实验 | 随机生存森林模型 | 基因表达数据，单细胞RNA-seq数据，临床数据 | TCGA-KIRC队列，E-MTAB-1980队列，IMvigor210免疫治疗队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3484 | 2025-12-20 |
Pan-cancer multi-omics analysis of CCT4 in tumor progression and cancer immunity, with focus on lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1714837
PMID:41403933
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了CCT4在泛癌及肺腺癌中的表达模式、临床意义及其在肿瘤进展和免疫逃逸中的作用 | 首次在泛癌层面整合多组学数据揭示CCT4与免疫浸润的关联，并通过单细胞RNA测序发现CCT亚基在肿瘤上皮细胞中的协同过表达及CCT4在增殖亚群中的特异性富集 | 研究主要基于生物信息学分析，体外实验验证有限，且CCT4的具体分子机制仍需进一步探索 | 阐明CCT4在肿瘤进展和癌症免疫中的作用，特别是在肺腺癌中的功能 | 泛癌数据集及肺腺癌样本，包括肿瘤细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 转录组学、蛋白质组学、基因组学、表观遗传学、免疫基因组学、单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据 | 泛癌数据集及肺腺癌样本，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3485 | 2025-12-20 |
Immune dysregulation in preeclampsia: integrative analysis of peripheral transcriptomes and placental single-cell land-scapes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1638603
PMID:41403942
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研究论文 | 本研究通过整合先兆子痫高风险孕妇外周血转录组和胎盘单细胞RNA测序数据，揭示了免疫失调的分子机制并识别了潜在生物标志物 | 首次将外周血转录组与胎盘单细胞图谱整合分析，识别出在两种数据集中均稳定表达的五个候选基因，并揭示了它们在特定免疫细胞中的表达模式 | 未明确说明样本的具体数量，且候选基因名称在摘要中被省略，限制了结果的直接验证 | 探索先兆子痫中免疫失调的分子机制，并识别早期检测和机制研究的生物标志物 | 先兆子痫高风险孕妇的外周血和胎盘组织 | 生物信息学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），转录组分析 | 机器学习特征选择 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3486 | 2025-12-20 |
Upscaling: efficient generation of human lung organoids from induced pluripotent stem cells using a stirring bioreactor
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1684315
PMID:41404197
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研究论文 | 本文介绍了一种使用搅拌生物反应器高效生成人肺类器官的方法，并与手动培养方式进行了比较 | 采用配备独特膜搅拌器的搅拌罐生物反应器进行规模化、自动化培养，实现了动物成分自由的生产过程 | NA | 开发高效生成人诱导多能干细胞来源肺类器官的方法，用于疾病模拟和药物反应研究 | 人诱导多能干细胞来源的肺类器官 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3487 | 2025-12-19 |
Target Fibroblast-B cell crosstalk via MIF signaling drives pathogenic B cell differentiation and joint damage in knee osteoarthritis
2025-Dec-17, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-025-02154-w
PMID:41407905
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了膝骨关节炎中成纤维细胞与B细胞通过MIF信号传导的相互作用，驱动致病性B细胞分化并导致关节损伤 | 首次在膝骨关节炎中系统描绘了B细胞的异质性，并发现了成纤维细胞通过MIF-(CD74+CXCR4/CD44)信号通路调控致病性DERL3+B细胞分化的新机制 | 研究样本量相对有限（9名健康对照和21名KOA患者），且小鼠模型可能无法完全模拟人类KOA的复杂病理过程 | 阐明膝骨关节炎中B细胞的异质性、活化机制及其对软骨损伤的贡献，并探索潜在的治疗靶点 | 人类膝骨关节炎患者的关节组织（包括软骨下骨和滑膜）以及ACLT+DMM诱导的小鼠KOA模型 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，Western blotting，体外共培养系统，伪时间轨迹分析，配体-受体相互作用图谱 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据，组织学图像数据 | 30例人类样本（9名健康对照，21名KOA患者）及小鼠KOA模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3488 | 2025-12-19 |
cGAS-STING pathway reprograms macrophage polarization and is highly expressed in responding tumors after neoadjuvant immunotherapy in head and neck carcinoma
2025-Dec-17, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025209
PMID:41408831
|
研究论文 | 本研究探讨了cGAS-STING通路在头颈鳞状细胞癌抗肿瘤免疫中的作用，并评估了STING激动剂的治疗潜力 | 首次系统性地结合临床数据分析、体外实验和单细胞RNA测序，揭示了STING激动剂MSA-2能够重编程肿瘤相关巨噬细胞向M1表型极化，并证实该通路在免疫治疗应答患者中高表达 | 研究主要基于体外细胞实验和回顾性临床数据分析，缺乏体内动物模型验证和前瞻性临床试验数据 | 评估cGAS-STING通路在头颈鳞状细胞癌抗肿瘤免疫中的功能作用及STING激动剂的治疗潜力 | 头颈鳞状细胞癌患者临床样本、TCGA-HNSC数据集、RAW 264.7巨噬细胞系 | 肿瘤免疫学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组化、细胞共培养 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、免疫组化图像 | TCGA-HNSC数据集、临床样本（数量未明确）、单细胞RNA测序数据来自接受新辅助免疫治疗的HNSCC患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3489 | 2025-12-19 |
Single-cell transcriptomic analysis highlights specific cell types manipulated by Fusarium head blight fungus leading to wheat susceptibility
2025-Dec-15, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.07.022
PMID:40845857
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，分析了小麦胚芽鞘对适应性和非适应性镰刀菌感染的细胞类型特异性响应 | 首次应用单细胞RNA测序于小麦-真菌互作研究，揭示了不同细胞类型在非宿主抗性和易感性中的差异化免疫响应 | 研究仅关注了接种后1-3天的早期响应，未涵盖整个疾病进程；样本量虽大但限于特定时间点 | 探究小麦在适应性和非适应性镰刀菌感染下的细胞类型特异性转录组响应机制 | 小麦胚芽鞘细胞 | 植物病理学与单细胞组学 | 小麦赤霉病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 超过90,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3490 | 2025-12-19 |
scRepli-RamDA-seq: a multi-omics technology enabling the analysis of gene expression dynamics during S-phase
2025-Dec-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64688-1
PMID:41397953
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scRepli-RamDA-seq（scRR-seq）的新型单细胞多组学技术，该技术能够在同一单细胞中以单倍型特异性方式分析DNA复制谱和全长总RNA测序 | 首次开发出能够同时监测S期进展过程中基因表达动态的单细胞多组学方法，并可根据DNA复制数据确定细胞的S期阶段 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种能够分析S期基因表达动态的单细胞多组学技术 | 单细胞 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞DNA复制谱分析、全长总RNA测序 | NA | DNA复制数据、RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 3491 | 2025-12-19 |
ER-phagy and proteostasis defects prime pancreatic epithelial state changes in KRAS-mediated oncogenesis
2025-Dec-15, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.07.016
PMID:40816286
|
研究论文 | 本文揭示了KRAS介导的胰腺癌发生中，ER-phagy缺陷和蛋白稳态失调如何驱动胰腺腺泡细胞的化生状态转变 | 发现KRAS激活导致ER-phagy的零星失败，进而引发ER蛋白（如REG3B）的病理性聚集，这直接驱动了腺泡-导管化生（ADM）和癌变，揭示了蛋白聚集作为癌基因合作因子的新机制 | 研究主要基于基因工程小鼠模型，人类胰腺癌中的直接验证尚需进一步研究 | 探究KRAS介导的胰腺癌发生过程中，ER-phagy和蛋白稳态缺陷在细胞状态转变中的作用 | 胰腺腺泡细胞及其在KRAS激活下的化生转变 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 空间转录组学、蛋白质组学、高分辨率成像 | 基因工程小鼠模型 | 转录组数据、蛋白质数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3492 | 2025-12-19 |
Safety and efficacy of AAV8-aflibercept in treating choroidal neovascularization via single-cell RNA sequencing
2025-Dec-11, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2025.101625
PMID:41399432
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序评估了AAV8-aflibercept治疗小鼠脉络膜新生血管的安全性和有效性 | 利用单细胞RNA测序技术深入探究AAV8-aflibercept治疗对小鼠视网膜的细胞层面影响，并识别了12种不同的细胞类型 | 研究仅基于小鼠模型，且在高剂量（超过1×10 GC/眼）下观察到视网膜变薄和视网膜色素上皮细胞改变 | 评估AAV8-aflibercept治疗脉络膜新生血管的疗效和安全性 | 小鼠模型中的脉络膜新生血管 | 数字病理学 | 脉络膜新生血管 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3493 | 2025-12-19 |
PEGylated black-phosphorus nanosheet-alginate hydrogels enable local PRRX1 delivery to drive fibroblast reprogramming in intestinal fibrosis
2025-Dec-05, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03896-9
PMID:41350883
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定出克罗恩病肠道纤维化中的关键转录因子PRRX1，并开发了一种新型水凝胶递送系统用于局部PRRX1递送，以驱动成纤维细胞重编程 | 首次将PRRX1确定为肠道纤维化的核心调控因子，并创新性地开发了基于聚乙二醇化黑磷-海藻酸盐水凝胶的局部递送系统，用于在体内外验证其功能 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，在人体内的长期安全性和有效性仍需进一步验证 | 阐明肠道纤维化的核心调控机制并开发靶向治疗策略 | 克罗恩病患者的成纤维细胞、小鼠模型（Col1a2-Cre; Prrx1）、人类肠道成纤维细胞 | 单细胞组学与生物材料 | 克罗恩病（肠道纤维化） | 单细胞RNA测序、ChIP-seq、报告基因检测、蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质数据、基因组数据 | 来自克罗恩病患者的配对纤维化和非纤维化回肠组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3494 | 2025-12-19 |
Prehabilitation during neoadjuvant chemotherapy results in an enhanced immune response in esophageal adenocarcinoma tumors: A randomized controlled trial
2025-Dec, Journal of sport and health science
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.jshs.2025.101063
PMID:40499717
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研究论文 | 本研究通过一项随机对照试验，探讨了在新辅助化疗期间进行预康复运动训练对局部晚期食管腺癌患者肿瘤免疫反应的影响 | 首次通过随机对照试验证明，新辅助化疗期间的预康复运动训练能显著增加食管腺癌肿瘤中的CD8+淋巴细胞浸润、NK细胞比例以及三级淋巴结构的成熟度 | 样本量较小（n=22），且未观察到预康复组与对照组在生存率、治疗耐受性或肿瘤再分级等临床结局上的显著差异 | 确定预康复运动训练是否能增加肿瘤浸润淋巴细胞，并探讨其作为新辅助化疗期间免疫佐剂的潜力 | 局部晚期食管癌患者 | 数字病理学 | 食管癌 | 高分辨率多重光谱免疫组化，空间转录组学 | NA | 组织图像，基因表达数据 | 22名局部晚期食管癌患者（预康复组11人，对照组11人） | NanoString | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3495 | 2025-12-19 |
Transforming histologic assessment: artificial intelligence in cancer diagnosis and personalized treatment
2025-Dec, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03206-y
PMID:40993310
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综述 | 本文综述了人工智能在癌症组织学评估中的转型作用，从辅助诊断工具发展为临床决策的核心组成部分 | AI不仅复制并增强了病理学家的决策，还通过组织形态学表型聚类和空间转录组学等创新技术，实现了癌症分层和个性化治疗的精细化 | AI预测的验证仍面临挑战，特别是在预后应用方面，且资源有限环境中的可及性有待保障 | 探讨人工智能在癌症诊断和个性化治疗中如何变革组织学评估，并推动其临床整合 | 癌症患者的组织学图像（如全切片图像WSIs）及其相关的基因组和临床数据 | 数字病理学 | 癌症 | 深度学习 | NA | 图像、文本、临床数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3496 | 2025-12-19 |
Uncovering CD248, MMP28, and SLC16A10 in Sjögren's disease: a machine learning-driven SHAP approach for CD4+ T cell-associated biomarker discovery
2025-Dec, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/2ffdc4
PMID:41328587
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习算法、SHAP可解释建模、分子对接和单细胞分析，识别了CD248、MMP28和SLC16A10作为干燥综合征的潜在诊断标志物和治疗靶点 | 开发了一种结合多种机器学习算法、SHAP可解释性分析、分子对接和单细胞RNA测序的综合多组学框架，用于发现与CD4+ T细胞相关的生物标志物，揭示了干燥综合征发病机制中先前未被充分认识的机制 | 需要未来的实验验证来确认其转化潜力 | 促进干燥综合征的早期诊断和治疗干预 | 干燥综合征患者和健康对照的转录组数据，重点关注CD4+ T细胞亚群 | 机器学习 | 干燥综合征 | 转录组学、单细胞RNA测序、分子对接 | 多种机器学习算法、SHAP | 转录组数据 | 训练队列包含382个样本（61名健康对照，321名干燥综合征患者）和10,015个基因，并在外部数据集中进行了验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3497 | 2025-12-19 |
Single-cell transcriptomics reveals the functional trajectories of the endocarp cell clusters in the postharvest fruit senescence process of Hylocereus undatus
2025-Dec, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110623
PMID:41109014
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学结合表型和功能分析，探讨了火龙果（Hylocereus undatus）采后果实衰老过程中内果皮细胞簇的作用 | 首次在火龙果中应用单细胞RNA测序技术，揭示了内果皮细胞簇在果实衰老中的功能轨迹和分化路径，并识别了关键调控基因HuGIP2 | 研究仅聚焦于火龙果内果皮细胞，可能未涵盖其他组织或物种的衰老机制，且功能验证依赖于病毒诱导的基因沉默，可能存在脱靶效应 | 探究火龙果采后果实衰老的生理过程，特别是内果皮细胞簇在其中的功能和调控机制 | 火龙果（Hylocereus undatus）果实的内果皮细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序，荧光显微镜，病毒诱导基因沉默 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3498 | 2025-12-19 |
Aqueous Humor Exosomal Membrane Proteins: Decoding Pathogenic Molecular Signatures in Retinitis Pigmentosa
2025-Dec-01, Translational vision science & technology
IF:2.6Q2
DOI:10.1167/tvst.14.12.15
PMID:41384798
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研究论文 | 本研究通过房水外泌体膜蛋白分析，解码了色素性视网膜炎的致病分子特征 | 建立了房水外泌体膜蛋白的细胞来源追踪框架，并揭示了其在色素性视网膜炎中的病理意义 | 样本量较小（14例RP患者和7例对照），且仅针对并发白内障的RP患者，可能限制了结果的普适性 | 解码色素性视网膜炎的致病分子特征，探索房水外泌体膜蛋白作为生物标志物的潜力 | 色素性视网膜炎患者和年龄匹配的老年性白内障对照者的房水样本 | 数字病理学 | 色素性视网膜炎 | EVArray技术，单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据，单细胞RNA测序数据 | 14例色素性视网膜炎患者和7例年龄匹配的老年性白内障对照者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3499 | 2025-12-19 |
Single-cell analysis reveal cell-type-specific RNA methylation patterns in breast cancer
2025-Dec, The Journal of international medical research
IF:1.4Q4
DOI:10.1177/03000605251405638
PMID:41397449
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，揭示了乳腺癌原发灶和转移淋巴结中细胞类型特异的RNA甲基化模式及其在癌症进展和免疫调控中的作用 | 首次在单细胞水平上系统描述了乳腺癌转移过程中RNA甲基化的细胞类型特异性变化，并关联了其与细胞分化、免疫通讯和患者预后的关系 | 样本量较小（仅5名患者），且为观察性研究，需要更大队列和功能实验验证因果关系 | 探究乳腺癌原发灶和转移淋巴结中细胞类型特异的RNA甲基化模式及其在癌症进展和免疫调控中的作用 | 五名乳腺癌患者的原发癌和匹配的转移淋巴结组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | AUCell方法，Seurat | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据 | 5名乳腺癌患者的原发癌和匹配的转移淋巴结组织 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3500 | 2025-12-19 |
Machine learning-based identification of pyroptosis-related genes as biomarkers and targets in primary Sjögren's syndrome
2025-Dec, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/zpd69e
PMID:41410587
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学与机器学习方法，识别了原发性干燥综合征中与细胞焦亡相关的关键基因作为潜在的诊断生物标志物和治疗靶点 | 首次将多模型机器学习框架与SHAP解释方法结合，筛选出HADHA、JAK1、BRD4、ATG5和NRAS作为原发性干燥综合征中与细胞焦亡相关的关键基因，并构建了诊断列线图模型 | 研究主要基于公共基因表达数据集，缺乏实验验证；样本量可能有限，且未考虑疾病异质性的所有方面 | 探索细胞焦亡相关基因在原发性干燥综合征中的作用机制，并识别潜在的诊断生物标志物和治疗靶点 | 原发性干燥综合征患者与健康对照的基因表达数据 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 基因表达分析、加权基因共表达网络分析、功能富集分析、单细胞RNA测序 | 多模型机器学习框架 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |