单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10550 篇文献，本页显示第 3441 - 3460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3441 | 2025-10-05 |
Cutting-edge tools for unveiling the dynamics of plasmid-host interactions
2025-May, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.12.013
PMID:39843314
|
综述 | 本文探讨了用于揭示质粒-宿主相互作用动态的前沿技术工具 | 批判性评估单细胞测序、荧光技术和Hi-C等先进方法在质粒-宿主相互作用研究中的应用，并探讨CRISPR-based噬菌体工程等新兴技术的潜力 | NA | 研究抗生素抗性基因在复杂微生物组中的质粒介导传播机制 | 质粒-宿主相互作用和抗生素抗性基因传播动态 | 微生物组学 | 抗生素耐药性 | 单细胞测序,荧光技术,高通量染色质构象捕获,CRISPR-based噬菌体工程 | NA | 基因组数据,染色质构象数据 | NA | NA | 单细胞测序,Hi-C | NA | NA |
| 3442 | 2025-10-05 |
Local genetic covariance analysis with lipid traits identifies novel loci for early-onset Alzheimer's Disease
2025-Mar, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011631
PMID:40096060
|
研究论文 | 本研究通过局部遗传协方差分析发现早发性阿尔茨海默病与脂质性状之间存在共享遗传结构 | 首次使用SUPERGNOVA方法系统分析EOAD与脂质性状的局部遗传协方差，并识别出3个新的候选致病基因 | 样本量相对有限，EOAD病例数较少，功能验证实验不足 | 探索早发性阿尔茨海默病与脂质代谢途径的共享遗传机制 | 早发性阿尔茨海默病患者和血脂性状人群 | 遗传学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组关联分析，遗传协方差分析，eQTL共定位分析，单细胞RNA测序 | SUPERGNOVA | 基因组汇总统计数据 | EOAD: 19,668例；血脂性状: 1,320,016例 | NA | 单细胞RNA测序，DNA甲基化分析 | NA | NA |
| 3443 | 2025-10-05 |
ScLineageAtlas: a comprehensive single-cell genomics database for characterizing cellular clones in cancer
2025-Jan-18, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf046
PMID:40996711
|
研究论文 | 开发了一个综合性单细胞基因组学数据库ScLineageAtlas，用于表征多种癌症类型中的细胞克隆 | 整合了24个处理过的单细胞RNA测序数据集，涵盖13种不同癌症类型，并提供细胞克隆的空间可视化分析 | 目前仅包含24个数据集，样本规模相对有限 | 构建一个用户友好的细胞克隆数据分析平台，促进对肿瘤异质性、分化轨迹和进化的理解 | 多种癌症类型中的细胞克隆 | 单细胞基因组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 24个处理过的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3444 | 2025-10-05 |
Single-cell splicing QTL analysis in pancreatic islets
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1657895
PMID:41000275
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胰腺胰岛中的剪接数量性状位点 | 首次在单细胞水平识别胰腺胰岛α和β细胞中的剪接QTL，发现了批量分析中未观察到的CDC42基因变异 | 样本量有限，统计功效有待提升 | 探索遗传变异对单细胞水平选择性剪接的调控机制 | 胰腺胰岛α细胞和β细胞 | 单细胞基因组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 基因分型, 异构体定量分析 | sQTLseeker2 | 单细胞RNA测序数据 | 8个全长单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3445 | 2025-10-05 |
Novel diagnostic biomarkers associated with macrophage-microglia in spinal cord injury
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1634014
PMID:41000385
|
研究论文 | 本研究通过机器学习算法识别脊髓损伤中与巨噬细胞-小胶质细胞相关的诊断生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法识别脊髓损伤中巨噬细胞-小胶质细胞相关的关键枢纽基因 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于体外模型 | 探索脊髓损伤中巨噬细胞-小胶质细胞相关的诊断生物标志物 | 脊髓损伤相关的基因表达数据和巨噬细胞-小胶质细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, qPCR, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | GEO数据库中的脊髓损伤相关数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3446 | 2025-10-05 |
Integrated analysis of single-cell and bulk transcriptomics reveals the prognostic value and underlying mechanisms of crotonylation in ovarian cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1596080
PMID:41000388
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组学分析，揭示巴豆酰化在卵巢癌中的预后价值及潜在机制 | 首次系统研究巴豆酰化在卵巢癌微环境中的作用，并构建基于巴豆酰化的预后模型 | 未在独立队列中进行实验验证 | 开发基于巴豆酰化的卵巢癌预后模型并探索其治疗潜力 | 卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序，批量转录组测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 3447 | 2025-10-05 |
Integrating single-cell omics and materials science for uveal melanoma: from mechanistic insights to precision therapeutics
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1661889
PMID:41001023
|
综述 | 整合单细胞组学与材料科学前沿技术，推动葡萄膜黑色素瘤从机制研究到精准治疗的发展 | 首次系统整合单细胞多组学技术与智能生物材料在葡萄膜黑色素瘤治疗中的应用，提出跨学科协同治疗新范式 | NA | 探讨单细胞组学与材料科学协同推动葡萄膜黑色素瘤精准治疗的策略与前景 | 葡萄膜黑色素瘤的肿瘤异质性、免疫微环境及分子驱动机制 | 数字病理 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学, CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 单细胞组学数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3448 | 2025-10-05 |
Glycoprotein Ib-CD11b + monocyte-derived macrophages mediate atherosclerosis-exacerbated psoriatic inflammation
2025-Nov-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123960
PMID:40945652
|
研究论文 | 本研究揭示了糖蛋白Ib-CD11b+单核细胞来源的巨噬细胞通过GPIb-CD11b轴介导动脉粥样硬化加剧银屑病炎症的机制 | 首次发现CD11b+单核细胞来源的巨噬细胞在动脉粥样硬化合并银屑病病变中显著增加，并阐明血小板来源的GPIb通过GPIb-CD11b轴促进巨噬细胞M1极化的新机制 | 研究样本量有限，主要基于初治患者，需要更大规模研究验证 | 阐明动脉粥样硬化与银屑病之间的炎症相互作用机制 | 银屑病合并动脉粥样硬化患者的皮肤活检组织、分离的巨噬细胞和血小板、咪喹莫特诱导的银屑病小鼠模型 | 单细胞生物学 | 银屑病, 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, 体外功能实验, 动物模型 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据, 实验数据 | 初治银屑病合并动脉粥样硬化患者的皮肤活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3449 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals early cell dynamics of MSC-based therapy in long bone critical-size defects in mice
2025-Nov, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2025.08.007
PMID:40995603
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究MSC疗法在小鼠长骨临界尺寸缺损早期愈合过程中的细胞动态变化 | 首次在临界尺寸骨缺损模型中应用单细胞RNA测序技术揭示MSC治疗早期免疫微环境变化和细胞间通讯网络 | 研究仅观察了治疗后1周时间点，样本量有限，且仅在雄性小鼠中进行 | 阐明MSC在骨缺损愈合早期如何调节局部骨微环境并与其他细胞相互作用 | 10-12周龄BALB/c雄性小鼠的股骨临界尺寸缺损模型 | 单细胞组学 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三组小鼠（空组、支架组、支架+MSC组），每组具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3450 | 2025-10-05 |
Integrated multi-omics profiling identifies Cmpk1 as a monocyte-specific therapeutic target for renal ischemia-reperfusion injury
2025-Nov-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123924
PMID:40848967
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析鉴定Cmpk1作为肾脏缺血再灌注损伤中单核细胞特异性治疗靶点 | 首次揭示单核细胞特异性核苷酸代谢重编程在肾脏缺血再灌注损伤中的关键作用，并确定Cmpk1为核心调控基因 | 研究主要聚焦于单核细胞，其他肾细胞类型的作用可能未被充分探索 | 解析肾脏缺血再灌注损伤中细胞特异性代谢重编程机制并识别治疗靶点 | 肾脏缺血再灌注损伤模型中的单核细胞及其他肾细胞类型 | 多组学整合分析 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,代谢组学,转录组学 | 机器学习 | 基因表达数据,代谢物数据,空间转录数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量转录组学,代谢组学 | NA | NA |
| 3451 | 2025-10-05 |
Tectorigenin could alleviate SA-AKI via reducing M1-like polarization of macrophages through KLF4/NF-κB pathway
2025-Oct-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115300
PMID:40829320
|
研究论文 | 本研究探讨鸢尾素通过KLF4/NF-κB通路调控巨噬细胞M1样极化缓解脓毒症相关急性肾损伤的作用机制 | 首次揭示鸢尾素通过KLF4/NF-κB通路调控巨噬细胞极化在SA-AKI中的治疗作用 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验，尚未进行临床验证 | 探究鸢尾素对脓毒症相关急性肾损伤的治疗潜力及作用机制 | LPS诱导的SA-AKI小鼠模型、RAW264.7细胞、腹膜原代巨噬细胞、HK-2细胞 | 分子生物学 | 急性肾损伤 | 流式细胞术、单细胞测序、Transwell共培养、HE染色、透射电镜、siRNA转染 | 动物疾病模型、细胞共培养模型 | 单细胞测序数据、细胞表型数据、组织病理数据 | 小鼠模型、多种细胞系及原代细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | GSE 151658数据库单细胞测序数据 |
| 3452 | 2025-10-05 |
Novel role of splicing factor U2AF2 in the tumour microenvironment and its clinical prognostic value: a comprehensive pan-cancer analysis and experimental validation with a focus on COAD
2025-Oct-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115410
PMID:40854264
|
研究论文 | 通过整合多组学分析和实验验证，揭示了剪接因子U2AF2在结肠腺癌肿瘤微环境中的双重致癌机制及其临床预后价值 | 首次系统阐明U2AF2通过异常RNA剪接驱动恶性转化和通过重塑肿瘤免疫景观促进免疫抑制的双重致癌机制 | 研究主要聚焦于结肠腺癌，其他癌症类型验证相对有限 | 阐明U2AF2在结肠腺癌中的致癌机制及其作为治疗靶点和预后生物标志物的潜力 | 结肠腺癌患者样本、HCT116和HCT8结肠癌细胞系 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光，细胞功能实验 | NA | 转录组数据，临床数据，单细胞测序数据，免疫荧光图像 | 结肠腺癌患者队列和细胞系模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3453 | 2025-10-05 |
VCPIP1 ameliorates sepsis-associated encephalopathy by promoting microglia autophagy via the PI3K/AKT/mTOR pathway
2025-Oct-30, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115417
PMID:40865405
|
研究论文 | 本研究探讨VCPIP1通过调控小胶质细胞自噬改善脓毒症相关脑病的作用机制 | 首次发现VCPIP1在SAE中通过PI3K/AKT/mTOR通路调控小胶质细胞自噬的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 阐明VCPIP1在脓毒症相关脑病中的作用机制 | 小鼠海马组织和小胶质细胞 | 神经科学 | 脓毒症相关脑病 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | NA | 基因表达数据，行为学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3454 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA Sequencing Demonstrates the Heterogeneity of Different Molecular Subtypes in Gastric Cancer
2025-Oct, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-024-10922-2
PMID:39311993
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胃癌不同分子亚型的异质性特征 | 首次在单细胞水平系统解析胃癌TCGA分子亚型的细胞组成异质性，并构建了亚型特异性lncRNA-基因调控网络 | 样本量相对有限，未进行实验验证 | 探究胃癌不同分子亚型的单细胞水平异质性 | 胃癌患者的不同分子亚型细胞 | 单细胞组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 119,878个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3455 | 2025-10-05 |
Tumor necrosis facilitates perihilar cholangiocarcinoma metastasis by ANGPTL6-augmented vessel permeability and tumor dissemination
2025-Oct, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101514
PMID:40995437
|
研究论文 | 本研究探讨肿瘤坏死对肝门部胆管癌预后的影响及其通过ANGPTL6增强血管通透性促进肿瘤转移的机制 | 首次发现ANGPTL6在肿瘤坏死区域特异性富集并通过增强血管通透性促进肝门部胆管癌转移 | 研究样本量有限（306例），机制研究仍需进一步验证 | 探究肿瘤坏死在肝门部胆管癌中的预后意义及其分子调控机制 | 肝门部胆管癌患者组织样本及细胞/动物模型 | 数字病理学 | 胆管癌 | 激光捕获显微切割, 高分辨率质谱, 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 临床病理数据 | 306例肝门部胆管癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 3456 | 2025-10-05 |
Human deep subcutaneous adipose tissue is enriched for inflammatory and tissue remodeling pathways
2025-Oct-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00463.2025
PMID:40833844
|
研究论文 | 通过批量RNA测序和单细胞RNA测序比较人体皮下浅层脂肪组织与深层脂肪组织的转录组差异 | 首次系统揭示深层脂肪组织具有促炎症和组织重塑倾向的独特基因表达特征 | NA | 比较皮下浅层和深层脂肪组织的分子和细胞差异 | 人体皮下浅层脂肪组织(SAT)和深层脂肪组织(DAT) | 生物信息学 | 代谢疾病 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 3457 | 2025-10-05 |
Glioblastoma exploits ATP from leading-edge astrocytes to fuel its infiltrative growth revealed by spatially resolved chimeric analysis
2025-Sep-26, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv5673
PMID:40991701
|
研究论文 | 本研究开发了空间解析嵌合分析工具SCAR，揭示胶质母细胞瘤通过利用前导星形胶质细胞提供的ATP促进浸润性生长的代谢机制 | 开发了SCAR计算工具用于解析人鼠嵌合癌症模型中肿瘤与微环境的空间转录组互作，首次发现浸润性胶质母细胞瘤通过CKB介导的代谢重编程利用星形胶质细胞ATP的机制 | 研究基于人鼠嵌合模型，与人类真实肿瘤环境存在差异；空间转录组技术分辨率有限 | 探究胶质母细胞瘤浸润性生长的分子特征及其与脑微环境的相互作用机制 | 胶质母细胞瘤细胞、星形胶质细胞、肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学、计算分析 | SCAR（空间解析嵌合分析工具） | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3458 | 2025-10-05 |
Integrating 3D imaging, GWAS and single-cell transcriptome approaches to elucidate root system architecture in Populus
2025-Sep-26, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf432
PMID:41004703
|
研究论文 | 本研究通过整合3D成像、GWAS和单细胞转录组方法，揭示了毛白杨根系构型的遗传调控机制 | 开发了先进的图像识别方法量化杨树根系性状，建立了综合多组学框架解析根系构型的遗传基础 | 研究仅针对毛白杨特定种质资源，结果在其他树种中的普适性有待验证 | 阐明杨树根系构型的遗传结构和调控网络 | 毛白杨（Populus simonii）种质资源和84k杨树（Populus alba × Populus glandulosa）转基因材料 | 植物遗传学 | NA | 3D空间成像、全基因组关联分析(GWAS)、转录组测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、遗传转化 | NA | 图像数据、基因组数据、转录组数据 | 303份毛白杨种质资源和转基因植株 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3459 | 2025-10-05 |
Transcriptome Analysis Identifies Functional and Prognostic Hypoxia-Associated Genes in Multiple Myeloma
2025-Sep-26, International journal of laboratory hematology
IF:2.2Q3
DOI:10.1111/ijlh.70009
PMID:41013981
|
研究论文 | 通过转录组分析鉴定多发性骨髓瘤中功能性和预后相关的缺氧相关基因 | 首次系统识别多发性骨髓瘤中与缺氧相关的功能性和预后基因，并验证其在骨髓微环境中的表达模式 | 研究样本量有限，机制研究不够深入 | 探索缺氧在多发性骨髓瘤进展中的作用机制和预后价值 | 多发性骨髓瘤细胞系和患者样本 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, qRT-PCR | 差异表达分析 | 基因表达数据 | 3个MM细胞系+MMRF CoMMpass项目数据+验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3460 | 2025-10-05 |
Mechanism of Piezo1 regulating chondrocyte mitochondrial function and promoting fracture healing through β-catenin/LARS2 signaling pathway
2025-Sep-24, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00459-4
PMID:40993116
|
研究论文 | 本研究揭示了Piezo1通过β-catenin/LARS2信号通路调控软骨细胞线粒体功能并促进骨折愈合的分子机制 | 首次发现Piezo1通过β-catenin/LARS2轴调控软骨细胞线粒体生物能量学，并证实软骨细胞向成骨细胞转分化在骨折愈合中的作用 | 研究主要聚焦于分子机制，临床转化潜力仍需进一步验证 | 探究Piezo1在内软骨骨化过程中对软骨细胞的调控机制 | 软骨细胞及其线粒体功能 | 分子生物学 | 骨折 | 单细胞RNA测序,谱系追踪,蛋白互作分析 | 基因敲除模型 | 基因表达数据,蛋白互作数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |