单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
3401	2025-01-12	Targeting SLITRK4 Restrains Proliferation and Liver Metastasis in Colorectal Cancer via Regulating PI3K/AKT/NFκB Pathway and Tumor-Associated Macrophage 2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202400367 PMID:39499724	研究论文	本文研究了SLITRK4在结直肠癌（CRC）肝转移中的作用及其通过调节PI3K/AKT/NFκB通路和肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的机制	首次发现SLITRK4在CRC肝转移中的关键作用，并通过系统性siRNA递送的脂质-聚合物杂化纳米颗粒（NPs）验证了其治疗潜力	研究主要依赖于体外和体内模型，尚未进行大规模临床试验	探索CRC肝转移的新驱动因素及其治疗策略	结直肠癌患者及其肝转移组织	癌症研究	结直肠癌	转录组分析、单细胞RNA测序、脂质-聚合物杂化纳米颗粒	体外和体内模型	RNA测序数据、细胞培养数据	人类患者的原发癌旁组织、结直肠肿瘤和转移组织
3402	2025-01-12	Identifying Multiomic Signatures of X-Linked Retinoschisis-Derived Retinal Organoids and Mice Harboring Patient-Specific Mutation Using Spatiotemporal Single-Cell Transcriptomics 2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202405818 PMID:39503290	研究论文	本文通过多组学方法结合单细胞RNA测序和时空转录组学，揭示了X连锁视网膜劈裂症（XLRS）的转录组特征，并验证了潜在的治疗靶点	首次结合高吞吐量单细胞RNA测序和时空转录组学，解析XLRS特异性转录组特征，并验证了慢性内质网应激/eIF2α信号通路的治疗潜力	研究仅限于两种XLRS样模型（基因工程小鼠和患者来源的视网膜类器官），未涉及其他XLRS突变模型	解析XLRS的分子病理机制并探索潜在治疗靶点	基因工程小鼠和患者来源的视网膜类器官	数字病理	视网膜疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、时空转录组学（ST）、蛋白质组学分析	NA	转录组数据、蛋白质数据	两种XLRS样模型（基因工程小鼠和患者来源的视网膜类器官）
3403	2025-01-12	Advances on the Role of Lung Macrophages in the Pathogenesis of Chronic Obstructive Pulmonary Disease in the Era of Single-Cell Genomics 2025, International journal of medical sciences IF:3.2Q1 DOI:10.7150/ijms.100160 PMID:39781522	综述	本文综述了肺巨噬细胞在慢性阻塞性肺疾病（COPD）发病机制中的作用，特别是在单细胞基因组学时代的新发现	利用单细胞RNA测序技术揭示了COPD中巨噬细胞的分子异质性，提供了对巨噬细胞在COPD中作用的新见解	文章主要基于已有文献综述，缺乏新的实验数据支持	探讨肺巨噬细胞在COPD发病机制中的复杂作用	肺巨噬细胞及其在COPD中的亚群	单细胞基因组学	慢性阻塞性肺疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
3404	2025-01-12	Construction and validation of prognosis and treatment outcome models based on plasma membrane tension characteristics in bladder cancer 2025, PeerJ IF:2.3Q2 DOI:10.7717/peerj.18816 PMID:39790460	研究论文	本研究基于膀胱癌患者的血浆膜张力相关基因（MTRGs）构建并验证了预后和治疗结果模型	首次揭示了MTRGs在膀胱癌肿瘤微环境中的预后意义及其与免疫浸润模式的相关性，并发现DCBLD2作为潜在的治疗靶点	研究主要依赖于TCGA和GEO数据库的数据，可能受到数据质量和样本量的限制	探讨MTRGs在膀胱癌中的具体机制及其对预后的影响	膀胱癌患者	数字病理学	膀胱癌	转录组分析、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、qRT-PCR、伤口愈合实验、Transwell实验	LASSO回归、Cox回归分析	转录组数据、临床数据、突变数据	来自TCGA和GEO数据库的膀胱癌患者数据
3405	2025-01-12	PD-1+CD8+ T Cell-Mediated Hepatocyte Pyroptosis Promotes Progression of Murine Autoimmune Liver Disease 2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202407284 PMID:39494472	研究论文	本文探讨了自身免疫性肝病中效应途径的具体机制，通过单细胞测序和体外分析，识别了肝脏中PD-1+CD8+ T细胞的一个特定致病亚群，并揭示了其通过GSDMD介导的细胞焦亡促进疾病进展的机制	本文首次识别了肝脏中PD-1+CD8+ T细胞的一个特定致病亚群，并揭示了其通过GSDMD介导的细胞焦亡促进疾病进展的机制，为自身免疫性肝病的治疗提供了新的潜在靶点	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证	探讨自身免疫性肝病中效应途径的具体机制，并寻找潜在的治疗靶点	dnTGFβRII Aire小鼠模型中的PD-1+CD8+ T细胞	免疫学	自身免疫性肝病	单细胞测序，体外分析	小鼠模型	单细胞数据，体外实验数据	dnTGFβRII Aire小鼠模型
3406	2025-01-12	Landscape of the Peripheral Immune Response Induced by Intraoperative Radiotherapy Combined with Surgery in Early Breast Cancer Patients 2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202308174 PMID:39494578	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序，分析了早期乳腺癌患者在接受术中放疗（IORT）联合手术前后的外周血单核细胞（PBMCs）的免疫反应	首次全面分析了IORT联合手术对早期乳腺癌患者外周血免疫细胞的影响，揭示了IORT对T细胞、单核吞噬细胞和浆细胞比例的调节作用，以及其对CD8Teff_GZMK细胞毒性评分和T细胞克隆扩增的显著影响	研究样本量有限，且仅针对早期乳腺癌患者，未涉及其他类型癌症或晚期患者	探讨IORT联合手术对早期乳腺癌患者外周血免疫反应的影响	早期乳腺癌患者的外周血单核细胞（PBMCs）	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序，单细胞T细胞受体测序，流式细胞术	NA	单细胞RNA测序数据，流式细胞术数据	早期乳腺癌患者的外周血单核细胞样本
3407	2025-01-12	Are oligodendrocytes bystanders or drivers of Parkinson's disease pathology? 2025-Jan, PLoS biology IF:7.8Q1 DOI:10.1371/journal.pbio.3002977 PMID:39777410	评论	本文探讨了少突胶质细胞在帕金森病病理中的潜在作用，强调了其在疾病早期阶段的重要性	提出了少突胶质细胞在帕金森病早期阶段可能扮演重要角色的新观点，挑战了传统上认为帕金森病仅是神经元疾病的观点	目前对少突胶质细胞在帕金森病中的实际功能角色仍高度推测性，需要更多科学研究来深入理解	探讨少突胶质细胞在帕金森病病理中的作用，以寻找有效的疾病修饰疗法	少突胶质细胞	神经科学	帕金森病	单细胞转录组学	NA	NA	NA
3408	2025-01-12	Inhibition of Abdominal Aortic Aneurysm Progression Through the CXCL12/CXCR4 Axis via MiR206-3p Sponge 2025-Jan, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70328 PMID:39779470	研究论文	本文研究了通过MiR206-3p海绵抑制CXCL12/CXCR4轴对腹主动脉瘤（AAA）进展的影响	提出MiR206-3p海绵作为一种创新治疗策略，通过抑制CXCL12/CXCR4信号通路来减缓AAA的进展和破裂风险	研究主要基于小鼠模型，人类样本的研究仍需进一步验证	探讨CXCL12/CXCR4信号通路在AAA发展中的具体作用及其作为治疗靶点的潜力	腹主动脉瘤（AAA）小鼠模型和人类AAA患者	生物医学	心血管疾病	单细胞RNA测序分析、血清ELISA、体内外实验	小鼠模型	RNA测序数据、血清数据	人类AAA患者和小鼠模型
3409	2025-01-11	Single-Cell RNA-seq Reveals Increased and Activated Post-Capillary Venule Endothelial Cells in Erythrodermic Psoriasis 2025-Jan-09, Inflammation IF:4.5Q2 DOI:10.1007/s10753-024-02216-x PMID:39786459	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序等技术，揭示了红皮病型银屑病（EP）中毛细血管后微静脉内皮细胞的增加和激活现象	首次在EP中观察到毛细血管后微静脉内皮细胞的显著增加和激活，并揭示了其与白细胞之间的增强相互作用	研究主要基于人类和小鼠样本，可能需要在更大样本量和更多物种中验证	探讨红皮病型银屑病的病理机制，特别是血管内皮细胞的作用	红皮病型银屑病（EP）患者和健康对照的血管内皮细胞	生物医学	银屑病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光、流式细胞术	NA	RNA测序数据、图像数据	人类和小鼠样本
3410	2025-01-11	Lessons learned from spatial transcriptomic analyses in clear-cell renal cell carcinoma 2025-Jan-09, Nature reviews. Urology DOI:10.1038/s41585-024-00980-x PMID:39789293	研究论文	本文探讨了空间转录组学在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的应用及其对肿瘤微环境异质性的洞察	首次使用空间转录组学技术研究ccRCC，揭示了肿瘤细胞、成纤维细胞、表达IL-2的巨噬细胞和透明化区域之间的空间相互作用	目前仅研究了ccRCC这一种肾细胞癌亚型，未涉及其他亚型	探索空间转录组学在ccRCC中的应用，揭示肿瘤微环境的异质性	透明细胞肾细胞癌（ccRCC）	数字病理学	肾细胞癌	空间转录组学	NA	空间转录组数据	NA
3411	2025-01-11	Tigulixostat Alleviates Hyperuricemic Nephropathy by Promoting M2 Macrophage Polarization 2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S500101 PMID:39780982	研究论文	本文研究了Tigulixostat通过促进M2巨噬细胞极化来缓解高尿酸血症肾病的效果	发现Tigulixostat比现有的别嘌呤醇更有效地降低血清尿酸水平，并改善肾脏结果，且不引起肝损伤	研究仅限于Uox-KO小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探索Tigulixostat对尿酸水平和高尿酸血症肾病的影响	Uox-KO小鼠	生物医学	高尿酸血症肾病	单细胞RNA测序、空间代谢组学、血浆代谢组学、流式细胞术	Uox-KO小鼠模型	RNA测序数据、代谢组学数据、流式细胞数据	Uox-KO小鼠
3412	2025-01-11	KLRD1 (CD94): A Prognostic Biomarker and Therapeutic Candidate in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma 2025, Journal of Cancer IF:3.3Q2 DOI:10.7150/jca.104762 PMID:39781341	研究论文	本文探讨了KLRD1（CD94）在头颈部鳞状细胞癌（HNSC）中的预后价值和作为免疫治疗靶点的潜力	首次全面分析了KLRD1在多种癌症中的表达模式及其与患者预后的关系，并探索了其在NK细胞和耗竭CD8+ T细胞中的表达及其在抗肿瘤免疫反应中的作用	研究主要依赖于公共数据库的数据，缺乏实验验证	研究KLRD1在癌症中的表达模式、预后价值及其作为免疫治疗靶点的潜力	头颈部鳞状细胞癌（HNSC）患者	生物信息学	头颈部鳞状细胞癌	单细胞RNA测序、功能富集分析、免疫浸润分析	NA	基因表达数据、单细胞RNA测序数据	来自TCGA、GTEx和GEO数据库的多组学数据
3413	2025-01-11	Single-cell analysis unveils cell subtypes of acral melanoma cells at the early and late differentiation stages 2025, Journal of Cancer IF:3.3Q2 DOI:10.7150/jca.102045 PMID:39781353	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了肢端黑色素瘤在早期和晚期分化阶段的细胞亚型	首次识别了C3 ID2+和C4 PCLAF+黑色素瘤细胞作为肢端黑色素瘤进化中的早期和晚期亚群，并揭示了C4 PCLAF+细胞在肢端黑色素瘤增殖中的关键作用	研究样本量较小，仅涉及六名黑色素瘤患者的样本	探索肢端黑色素瘤的细胞异质性及其在肿瘤进展中的作用	肢端黑色素瘤细胞	数字病理学	黑色素瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA序列数据	六名黑色素瘤患者的样本
3414	2025-01-11	Elucidating the Role of Estrogen Effects in Leukemia: Insights from Single-Cell RNA Sequencing and Mendelian Randomization 2025, Journal of Cancer IF:3.3Q2 DOI:10.7150/jca.100610 PMID:39781360	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和孟德尔随机化（MR）方法，探讨了雌激素及其受体与白血病及其相关蛋白之间的关系	首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化方法结合，为理解雌激素与白血病之间的分子关系提供了新视角	scRNA-seq和MR方法之间存在不一致性，表明需要更大的队列和更高的测序深度来进一步阐明这些相互作用的复杂性	探讨雌激素效应在白血病中的作用及其潜在抗肿瘤效果	白血病及其相关蛋白	生物信息学	白血病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），孟德尔随机化（MR）	NA	RNA测序数据	14个BMMC单核细胞亚群
3415	2025-01-11	TAGLN-RhoA/ROCK2-SLC2A3-mediated Mechano-metabolic Axis Promotes Skin Fibrosis 2025, International journal of biological sciences IF:8.2Q1 DOI:10.7150/ijbs.104484 PMID:39781462	研究论文	本文探讨了TAGLN-RhoA/ROCK2-SLC2A3介导的机械代谢轴在皮肤纤维化中的作用及其潜在机制	揭示了TAGLN通过RhoA/ROCK2通路调控SLC2A3表达，影响成纤维细胞的糖酵解和运动能力，为皮肤纤维化疾病提供了新的治疗靶点	研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体临床试验中验证	研究TAGLN在皮肤纤维化发病机制中的作用	皮肤纤维化疾病中的成纤维细胞	生物医学	皮肤纤维化	RNA-seq, 免疫荧光, Transwell, 伤口愈合实验, 胶原凝胶收缩实验	NA	基因表达数据, 细胞实验数据	NA
3416	2025-01-07	Integrative transcriptome analysis reveals Serpine2 promotes glomerular mesangial cell proliferation and extracellular matrix accumulation via activating ERK1/2 signalling pathway in diabetic nephropathy 2025-Feb, Diabetes, obesity & metabolism DOI:10.1111/dom.16069 PMID:39557806	研究论文	本文通过整合转录组分析揭示了Serpine2通过激活ERK1/2信号通路促进糖尿病肾病中肾小球系膜细胞增殖和细胞外基质积累的机制	首次通过整合批量数据集和单细胞转录组数据集，发现Serpine2在糖尿病肾病中的关键作用，并揭示了其通过ERK1/2信号通路调控的分子机制	研究主要基于动物模型和细胞模型，尚未在人类患者中进行验证	探索糖尿病肾病的发病机制，特别是Serpine2在其中的作用	糖尿病肾病模型中的肾小球系膜细胞和细胞外基质	生物信息学	糖尿病肾病	转录组分析、Western blotting、免疫荧光染色	db/db小鼠模型、肾小球系膜细胞模型	转录组数据、蛋白质表达数据	db/db小鼠和肾小球系膜细胞
3417	2025-01-07	Targeting MAPK14 in microglial cells: neuroimmune implications of Panax ginseng in post-stroke inflammation 2025-Jan-06, The Journal of pharmacy and pharmacology IF:2.8Q2 DOI:10.1093/jpp/rgae067 PMID:38902954	研究论文	本研究探讨了人参和三七皂苷（PNS）通过分子机制减轻缺血性中风后的神经炎症损伤并促进神经修复	揭示了Ginsenoside-Rc通过调节MAPK14活性抑制神经炎症的创新机制	研究主要基于实验模型，尚未进行临床试验验证	阐明人参和三七皂苷在缺血性中风后神经炎症损伤中的作用及其分子机制	小胶质细胞和神经炎症反应	神经科学	中风	单细胞测序、转录组分析、基因集富集分析、加权基因共表达网络分析	NA	基因表达数据	NA
3418	2025-01-07	Intestinal Subtype as a Biomarker of Response to Neoadjuvant Immunochemotherapy in Locally Advanced Gastric Adenocarcinoma: Insights from a Prospective Phase II Trial 2025-Jan-06, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2436 PMID:39495175	研究论文	本研究探讨了肠道亚型作为局部晚期胃腺癌新辅助免疫化疗（NAIC）反应生物标志物的潜力	发现肠道亚型是胃腺癌对NAIC敏感性增强的组织学生物标志物，并构建了基于机器学习的肠道亚型特异性特征模型	研究为单臂II期试验，缺乏对照组，且样本量相对较小	寻找能有效识别NAIC受益患者的生物标志物	局部晚期胃腺癌患者	数字病理	胃癌	RNA测序（bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq）	NaiveBayes	RNA测序数据	104个样本（来自75名患者）的bulk RNA-seq数据和105个治疗前胃腺癌的单细胞RNA-seq数据
3419	2025-01-07	A pan-immune panorama of bacterial pneumonia revealed by a large-scale single-cell transcriptome atlas 2025-Jan-06, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1 DOI:10.1038/s41392-024-02093-8 PMID:39757231	研究论文	本文通过大规模单细胞转录组图谱揭示了细菌性肺炎的全免疫全景	首次使用单细胞RNA测序技术对444,146个支气管肺泡灌洗液细胞进行分析，揭示了细菌性肺炎中免疫反应的异质性及其与疾病严重程度的关系	样本量相对较小，仅包括74名个体，且未涵盖所有可能的细菌性肺炎亚型	深入了解细菌性肺炎的发病机制，寻找潜在的治疗靶点	74名个体，包括58名轻度（n=22）和重度（n=36）细菌性肺炎患者以及16名健康捐赠者	数字病理学	细菌性肺炎	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	444,146个支气管肺泡灌洗液细胞，来自74名个体
3420	2025-01-07	Spatial Transcriptomics: Biotechnologies, Computational Tools, and Neuroscience Applications 2025-Jan-06, Small methods IF:10.7Q1 DOI:10.1002/smtd.202401107 PMID:39760243	综述	本文综述了空间转录组学（ST）技术的进展、计算工具及其在神经科学中的关键应用	空间转录组学提供了前所未有的基因表达空间组织洞察，特别是在神经科学领域的应用	挑战包括提升测序技术和开发更强大的计算工具	阐明空间转录组学技术的进展及其在神经科学中的应用	空间转录组学技术及其在神经科学中的应用	分子生物学	神经退行性疾病（如阿尔茨海默病）和神经精神疾病（如精神分裂症）	空间转录组学（ST）	NA	基因表达数据	NA