单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202501-202512] [清除筛选条件]
当前共找到 10550 篇文献,本页显示第 3301 - 3320 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3301 2025-10-05
A specific gene expression program underlies antigen archiving by lymphatic endothelial cells in mammalian lymph nodes
2025-Sep-25, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了淋巴结中淋巴内皮细胞通过特定基因表达程序实现抗原长期存档的机制 首次定义了淋巴内皮细胞抗原存档的特异性转录程序,并证明该程序能跨物种预测抗原存档能力 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证仍需进一步扩展 探究淋巴内皮细胞实现持久抗原存档的分子机制及其调控特性 小鼠和人类淋巴结中的淋巴内皮细胞及树突状细胞 空间转录组学 病毒感染 单细胞测序, 空间转录组学, 机器学习 机器学习模型 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 多个时间点的免疫后淋巴结组织样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
3302 2025-10-05
Integrated spatial transcriptomic profiling to dissect the cellular characteristics of tumor-associated tertiary lymphoid structures
2025-Sep-23, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 通过整合23种癌症的空间转录组数据构建泛癌TA-TLS图谱,解析肿瘤相关三级淋巴结构的细胞特征 首次构建泛癌TA-TLS图谱,发现成熟TLS中IgG+浆细胞优先富集,鉴定CCL19+血管周细胞作为淋巴组织组织细胞,揭示动脉内皮细胞通过Notch信号抑制获得高内皮静脉样表型 研究主要基于空间转录组数据分析,需要进一步实验验证机制 解析肿瘤相关三级淋巴结构的细胞特征和形成机制 23种癌症的肿瘤相关三级淋巴结构 空间转录组学 癌症 空间转录组学 NA 空间转录组数据 23种癌症 NA 空间转录组学 NA NA
3303 2025-10-05
Lymphatic dysfunction is linked to disease pathogenesis in Duchenne muscular dystrophy animal models
2025-Sep-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过动物模型揭示了淋巴功能障碍与杜氏肌营养不良症发病机制之间的关联 首次在DMD动物模型中系统性地证明淋巴系统功能失调与疾病发病机制的直接联系 研究主要基于动物模型,尚未在人类患者中验证 探究淋巴系统在杜氏肌营养不良症发病机制中的作用 小鼠、金毛犬肌营养不良模型及淋巴肌细胞 病理生理学 杜氏肌营养不良症 单细胞RNA测序, 显微淋巴管造影, 磁共振淋巴管成像, 免疫荧光分析 NA 基因表达数据, 蛋白质数据, 影像数据 多种DMD动物模型(小鼠和大模型) NA 单细胞RNA测序 NA NA
3304 2025-10-05
SPACE: Spatially variable gene clustering adjusting for cell type effect for improved spatial domain detection
2025-Sep-23, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 提出SPACE框架,通过调整细胞类型混杂效应来基于空间模式对空间可变基因进行聚类,以改进空间域检测 无需基因簇数量、空间模式或细胞类型信息的先验知识,通过分组SVG并获取每组低维嵌入来保留特定模式、减少信号混合 未在摘要中明确说明 改进空间转录组分析中的空间域检测 空间可变基因(SVGs) 空间转录组学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
3305 2025-10-05
Constructing Gene Regulatory Network using Chatterjee's Rank Correlation with Single-cell Transcriptomic Data
2025-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出基于Chatterjee秩相关系数的单细胞转录组基因调控网络构建方法 使用非参数依赖度量Chatterjee秩相关系数,开发了数据驱动的检验阈值估计算法,并提出定向调控的新检验方法 未明确说明方法在特定生物场景下的适用性限制 从单细胞RNA测序数据中发现基因调控网络 基因调控网络 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 非参数统计模型 单细胞转录组数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
3306 2025-10-05
Single-Cell Transcriptomics in Inherited Retinal Dystrophies: Current Findings and Emerging Perspectives
2025-Sep-16, Genes IF:2.8Q2
综述 本文综述了单细胞转录组学在遗传性视网膜营养不良研究中的应用现状与前景 系统总结了单细胞转录组技术如何揭示传统批量RNA测序无法检测的视网膜特定细胞群在疾病进展中的分子变化 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献分析 探讨单细胞转录组学如何增进对遗传性视网膜营养不良疾病机制的理解并促进新治疗靶点识别 遗传性视网膜营养不良疾病模型和视网膜细胞 数字病理学 遗传性视网膜疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3307 2025-10-05
Dual Therapeutic Impact of AXL Inhibitor AB-329: Chemotherapy Sensitization and Immune Microenvironment Reprogramming in TNBC
2025-Sep-12, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究评估AXL抑制剂AB-329在三阴性乳腺癌中的双重治疗作用:化疗增敏和免疫微环境重编程 首次揭示AXL抑制剂AB-329不仅增强化疗疗效,还能通过增加NK细胞浸润重塑肿瘤免疫微环境 研究基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 评估AXL抑制剂AB-329在三阴性乳腺癌中的抗肿瘤疗效和免疫调节潜力 三阴性乳腺癌临床前模型,包括小鼠同种移植模型和人源化小鼠模型 肿瘤免疫学 三阴性乳腺癌 转录组分析,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3308 2025-10-05
Innate and adaptive immune features associated with immune-related adverse events
2025-Sep-10, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过多维度方法分析接受免疫检查点抑制剂治疗患者的免疫特征,揭示免疫相关不良事件的生物学机制 首次系统揭示irAE患者基线存在的自身免疫样促炎状态特征,并识别出驱动irAE发生的三个关键轴 样本量相对有限,研究主要关注外周免疫特征,未深入探讨组织特异性机制 探索免疫检查点抑制剂治疗中免疫相关不良事件的生物学基础 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者 免疫学 癌症 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术,多重细胞因子检测,抗核抗体分析 NA 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,细胞因子数据,抗体数据 162名患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3309 2025-10-05
Cancer Growth and Invasion Are Increased in the Tight Skin (TSK) Mouse
2025-Sep-09, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过使用紧皮(TSK)小鼠模型探究系统性硬化症微环境对癌症进展的影响 首次发现TSK小鼠可作为研究系统性硬化症与癌症关联的模型,并揭示了微环境中中性粒细胞-淋巴细胞比率升高和促纤维化细胞群富集的关键变化 研究仅使用了三种癌症细胞系,且机制研究仍需深入 探究系统性硬化症相关微环境对癌症进展的促进作用 TSK小鼠和野生型小鼠,以及乳腺癌、黑色素瘤和卵巢癌细胞系 癌症生物学 系统性硬化症 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA 基因表达数据 TSK小鼠和野生型小鼠的多组肿瘤样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
3310 2025-10-05
Predictors of response to CD19 chimeric antigen receptor T-cell therapy in large B-cell lymphoma: a consolidated review
2025-Sep-04, Current opinion in oncology IF:2.8Q2
综述 本文系统回顾了CD19 CAR-T细胞疗法在弥漫大B细胞淋巴瘤中的疗效预测因素 整合了患者特异性、肿瘤内在性和治疗相关因素对CAR-T疗效影响的综合视角,并引入免疫分析、影像组学和单细胞转录组学等新型预测工具 基于现有文献的回顾性分析,缺乏前瞻性验证数据 探讨CD19 CAR-T疗法在弥漫大B细胞淋巴瘤中的疗效预测因素 弥漫大B细胞淋巴瘤患者 医学研究 弥漫大B细胞淋巴瘤 免疫分析、影像组学、单细胞转录组学 NA 临床数据、基因组数据、转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3311 2025-10-05
Identification of ATG4B and NLRP1 as M1 Macrophage-Activating-Related Plasma Proteins in Systemic Lupus Erythematosus via Multi-Omics Approaches
2025-Sep-02, International archives of allergy and immunology IF:2.5Q3
研究论文 通过多组学方法鉴定系统性红斑狼疮中与M1巨噬细胞活化相关的血浆蛋白ATG4B和NLRP1 整合孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、贝叶斯共定位分析和体外M1巨噬细胞实验,首次系统鉴定与SLE相关的M1巨噬细胞活化血浆蛋白 研究样本来源有限,主要基于现有数据库和体外实验,需要进一步临床验证 鉴定系统性红斑狼疮相关的血浆蛋白,特别是与M1巨噬细胞活化相关的蛋白质 系统性红斑狼疮患者、原代人外周血单核细胞、THP-1细胞系 生物信息学 系统性红斑狼疮 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,贝叶斯共定位分析,分子动力学模拟,分子对接 NA 基因组数据,蛋白质组数据,单细胞转录组数据 基于GWAS数据库和FinnGen数据库的SLE患者数据,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3312 2025-10-05
NAT10 regulates tumor progression and immune microenvironment in pancreatic ductal adenocarcinoma via the N4-acetylated LAMB3-mediated FAK/ERK pathway
2025-Sep, Cancer communications (London, England)
研究论文 本研究揭示了NAT10通过N4-乙酰化修饰LAMB3增强其mRNA稳定性,进而激活FAK/ERK通路促进胰腺导管腺癌进展和免疫抑制微环境的机制 首次发现NAT10在PDAC中通过乙酰化修饰LAMB3调控FAK/ERK通路和免疫微环境的新机制 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证有限 阐明NAT10在PDAC肿瘤恶性进展和肿瘤微环境中的作用机制 胰腺导管腺癌组织和细胞系,小鼠皮下肿瘤模型 肿瘤生物学 胰腺癌 生物信息学分析,乙酰化RNA免疫沉淀,定量PCR,RNA免疫沉淀,Western blotting,单细胞RNA测序,多重免疫荧光,流式细胞术 动物肿瘤模型 基因表达数据,蛋白质数据,单细胞测序数据 PDAC组织和细胞系,小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3313 2025-10-05
Single-dose cathepsin L CRISPR nanotherapy mitigates PASC-like lung damage in hamsters
2025-Sep, Nano research IF:9.5Q1
研究论文 开发针对组织蛋白酶L的单剂量CRISPR纳米疗法,可减轻仓鼠COVID-19急性后遗症相关的肺损伤 首次利用CRISPR-CasRx纳米疗法靶向宿主酶组织蛋白酶L,兼具抗病毒和促进肺泡修复的双重机制 研究仅在叙利亚仓鼠模型中进行,尚未进行人体临床试验 开发针对COVID-19急性后遗症肺损伤的新型治疗方法 叙利亚仓鼠 基因治疗 COVID-19后遗症 CRISPR-CasRx基因编辑,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3314 2025-10-05
IL-6-Mediated Neurogenic Inflammation Regulated by the Dorsal Root Ganglion Macrophages Exacerbates Imiquimod-Induced Psoriasis-Like Skin Lesions in Mice
2025-Aug-08, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本研究揭示了背根神经节神经元通过IL-6介导神经源性炎症加剧银屑病样皮肤病变的机制 首次发现外周神经系统是IL-6的重要来源,并阐明神经元与巨噬细胞通过IL-1β/MAPK信号通路相互调控的神经免疫机制 研究仅限于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 探究神经免疫相互作用在银屑病发病机制中的具体作用 小鼠背根神经节组织和银屑病样皮肤病变 神经免疫学 银屑病 单细胞测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠背根神经节组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3315 2025-10-05
Perturb-seq reveals distinct responses to pluripotency regulator dosages underlying the control of self-renewal and differentiation
2025-Aug-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过Perturb-seq技术揭示了多能性调控因子剂量对自我更新和分化控制的独特响应模式 首次系统性地定量研究关键转录因子剂量梯度对hESC表型的影响,发现谱系特异性基因的非单调响应模式 研究仅限于hESC模型,未验证其他细胞类型;CRISPRi可能产生脱靶效应 研究转录因子表达水平梯度如何影响细胞表型 人类胚胎干细胞(hESCs) 单细胞基因组学 NA CRISPR干扰(CRISPRi), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 定量模型 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3316 2025-10-05
Spatial determinants of tumor cell dedifferentiation and plasticity in primary cutaneous melanoma
2025-Jun-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合多重循环免疫荧光成像、空间转录组学和传统组织学技术,探索早期皮肤黑色素瘤中肿瘤细胞去分化和空间异质性的决定因素 首次在早期黑色素瘤中系统揭示肿瘤可塑性和空间异质性的微环境决定因素,展示了从单个癌症到微区域再到单细胞水平的多尺度变异性 研究样本仅限于早期原发性皮肤黑色素瘤,对其他类型或晚期黑色素瘤的适用性有待验证 识别与早期黑色素瘤中肿瘤细胞去分化和真皮侵袭相关的空间决定因素 早期原发性皮肤黑色素瘤组织 数字病理学 黑色素瘤 循环免疫荧光成像, 空间转录组学, 传统组织学 NA 图像, 空间转录组数据, 组织学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
3317 2025-10-05
Deep learning inference of cell type-specific gene expression from breast tumor histopathology
2025-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种从乳腺癌组织病理学全玻片图像直接预测细胞类型特异性基因表达的深度学习工具 首次实现直接从常规组织病理学图像预测细胞类型特异性基因表达,无需进行单细胞或批量RNA测序 在9种细胞类型中仅对癌症相关成纤维细胞、癌细胞和髓系细胞的预测效果最佳 开发低成本、快速的细胞类型特异性基因表达推断方法 乳腺癌组织样本 数字病理学 乳腺癌 深度学习,单细胞RNA测序,批量RNA测序 深度学习模型 全玻片图像,基因表达数据 TCGA乳腺癌队列和160例独立队列 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
3318 2025-10-05
Niche Macrophages Recycle Iron to Tumor Cells and Foster Erythroblast Mimicry to Promote Bone Metastasis and Anemia
2025-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了骨髓转移微环境中巨噬细胞通过铁循环促进肿瘤生长和贫血的新机制 发现VCAM1+CD163+CCR3+巨噬细胞在骨转移微环境中被肿瘤细胞劫持用于铁获取,并首次报道肿瘤细胞通过模仿红系细胞产生血红蛋白的适应性机制 人类样本验证仍需进一步扩展,具体分子调控通路需要更深入研究 探究骨转移与贫血之间的机制联系及肿瘤微环境中细胞互作 骨髓转移微环境中的巨噬细胞、肿瘤细胞和红系细胞 单细胞生物学 乳腺癌骨转移 单细胞RNA测序, 微环境标记 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3319 2025-10-05
The transcription factor HHEX maintains glucocorticoid levels and protects adrenals from androgen-induced lipid depletion
2025-Apr-15, Research square
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现HHEX转录因子在肾上腺糖皮质激素生成细胞中富集,并揭示其在维持糖皮质激素水平和保护肾上腺免受雄激素诱导脂质耗竭中的关键作用 首次鉴定HHEX为糖皮质激素生成细胞中最富集的转录因子,并阐明其作为雄激素受体靶基因在肾上腺性别二态性和脂质代谢中的新功能 研究主要基于小鼠模型,人类肾上腺中的相关机制仍需进一步验证 探索维持肾上腺皮质糖皮质激素生成细胞分化响应能力的分子机制 小鼠肾上腺皮质类固醇生成谱系细胞 单细胞生物学 肾上腺功能障碍 单细胞RNA测序 遗传小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3320 2025-10-05
Chronic inflammation deters natural killer cell fitness and cytotoxicity in myeloid leukemia
2025-Feb-25, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本研究探讨慢性炎症如何通过TNFα信号通路损害自然杀伤细胞功能,从而影响慢性髓系白血病的免疫监视 首次在CML模型中系统揭示TNFα诱导的炎症信号通过上调Cish等检查点基因抑制NK细胞功能的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限,需要进一步临床研究确认治疗潜力 阐明慢性髓系白血病微环境中NK细胞功能受损的分子机制 慢性髓系白血病小鼠模型、健康供体NK细胞、CML患者样本 免疫学 慢性髓系白血病 单细胞RNA测序、体外功能实验 嵌合BCR::ABL1+ CML小鼠模型 基因表达数据、功能实验数据 CML小鼠模型、健康供体NK细胞、未治疗CML患者血浆样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部