单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10617 篇文献，本页显示第 3181 - 3200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3181 | 2025-11-16 |
Mapping early human blood cell differentiation using single-cell proteomics and transcriptomics
2025-Oct-16, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adr8785
PMID:40839704
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞蛋白质组学和转录组学技术，绘制了人类早期血细胞分化图谱 | 首次将单细胞质谱蛋白质组学与单细胞RNA测序整合，揭示了mRNA无法反映的干细胞功能相关蛋白质，并建立了推断细胞分化进程的翻译动态模型 | 研究仅针对CD34+造血干细胞和祖细胞，样本类型相对有限 | 解析人类早期血细胞分化过程中的分子机制 | 人类CD34+造血干细胞和祖细胞 | 单细胞多组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞质谱蛋白质组学 | 翻译动态模型 | 单细胞蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 超过2500个人类CD34+造血干细胞和祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 3182 | 2025-11-16 |
Tumor-draining lymph nodes respond to immune checkpoint inhibition and orchestrate tumor immune remodeling
2025-Oct-06, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04187-w
PMID:41051631
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤引流淋巴结在免疫检查点抑制剂治疗中对肿瘤免疫微环境的调控机制 | 首次通过单细胞测序技术系统阐明肿瘤引流淋巴结在免疫检查点抑制剂治疗中的具体作用机制，发现其作为肿瘤特异性T细胞的来源地 | 研究样本仅限于结直肠癌患者，需要进一步验证在其他癌症类型中的普适性 | 阐明肿瘤引流淋巴结在免疫检查点抑制剂治疗中的响应机制及其对肿瘤微环境的调控作用 | 结直肠癌患者的肿瘤引流淋巴结和肿瘤组织 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 结直肠癌患者的肿瘤引流淋巴结和肿瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 3183 | 2025-11-16 |
Unlocking novel T cell-based immunotherapy for hepatocellular carcinoma through neoantigen-driven T cell receptor isolation
2025-Jun-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334148
PMID:39832892
|
研究论文 | 本研究通过分离肝细胞癌患者中对新抗原反应的T细胞及其T细胞受体，探索基于T细胞的免疫治疗新策略 | 首次系统分析肝细胞癌微环境中新抗原反应性T细胞的功能特征，并发现肝灌洗液和淋巴结是反应性T细胞的重要来源 | 研究样本量较小（7名患者），需要在更大队列中验证结果 | 评估晚期肝细胞癌患者的T细胞反应，识别可用于免疫治疗的T细胞群体 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织、肝灌洗液和肝引流淋巴结 | 免疫肿瘤学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序，生物信息学分析 | NA | 转录组数据，蛋白质组数据，测序数据 | 7名肝细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3184 | 2025-11-16 |
Upregulated haptoglobin in classical monocytes serves as a diagnostic and immunological biomarker in myocardial infarction: a cross-sectional multi-omics study
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1707912
PMID:41229424
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现结合珠蛋白(HP)在心肌梗死中显著上调，特别是在经典单核细胞中高表达，具有诊断价值 | 首次发现HP在心肌梗死患者经典单核细胞中特异性高表达，并证实其作为诊断生物标志物的价值 | 横断面研究设计，无法确定因果关系；样本量有限 | 寻找心肌梗死的可靠诊断生物标志物并了解其在免疫微环境中的作用 | 心肌梗死患者 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，qPCR，蛋白质组学，生物信息学分析 | WGCNA，免疫细胞浸润分析 | 基因表达数据，蛋白质组数据，临床样本 | 多个GEO数据集(GSE141512，GSE95368，GSE269269)和TCGA数据，外加独立验证队列(GSE66360等) | NA | 单细胞RNA-seq，蛋白质组学 | NA | NA |
| 3185 | 2025-11-16 |
Uterine NK Cell Polarization Associates with Chronic Endometritis and Predisposition to Recurrent Implantation Failure
2025, International journal of women's health
DOI:10.2147/IJWH.S554069
PMID:41230044
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据揭示了子宫自然杀伤细胞极化与慢性子宫内膜炎及复发性种植失败的关联机制 | 首次通过单细胞RNA测序识别出两种功能不同的uNK细胞亚型，并建立了基于uNK2/uNK3特征比值的诊断模型 | 需要在前瞻性临床队列和功能实验中进一步验证临床效用 | 探究子宫内膜免疫微环境中uNK细胞极化与生殖健康障碍的关联机制 | 子宫内膜免疫细胞，特别是子宫自然杀伤细胞亚型 | 单细胞基因组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 51例子宫内膜样本（18例CE患者和33例正常对照） | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 3186 | 2025-11-15 |
GPR91 mediates low shear stress-induced endothelial ferroptosis via EGR1-dependent GPX4 repression
2025-Dec, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112127
PMID:40939914
|
研究论文 | 本研究揭示低剪切应力通过GPR91/EGR1/GPX4信号轴诱导血管内皮细胞铁死亡的分子机制 | 首次发现GPR91作为机械敏感受体连接低剪切应力与铁死亡信号通路，并阐明EGR1介导的GPX4转录抑制机制 | 研究主要基于体外细胞实验，需要进一步在体实验验证 | 探究低剪切应力诱导内皮细胞铁死亡的分子机制 | 血管内皮细胞、HEK293T细胞、动脉粥样硬化斑块 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、ChIP-qPCR、RNA测序、平行板流动腔系统 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3187 | 2025-11-15 |
Elevated P4HB expression in hepatocellular carcinoma and its role in UCA1-mediated malignant progression
2025-Dec, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112131
PMID:40945634
|
研究论文 | 本研究探讨P4HB在肝细胞癌中的表达及其通过UCA1促进恶性进展的作用机制 | 首次发现P4HB与lncRNA UCA1的相互作用机制，揭示其通过增强糖酵解促进HCC恶性行为 | NA | 研究P4HB在肝细胞癌进展中的作用及其作为诊断生物标志物的潜力 | 肝细胞癌细胞和患者血清样本 | 癌症研究 | 肝细胞癌 | 单细胞测序，ROC分析，体外和体内功能实验 | NA | 单细胞测序数据，血清蛋白数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3188 | 2025-11-15 |
YWHAG mediated epithelial-mesenchymal transition facilitates tumor progression and metastatic spread in non-small cell lung cancer
2025-Dec, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112139
PMID:40962000
|
研究论文 | 本研究揭示YWHAG通过LRRK2/PI3K/AKT轴促进非小细胞肺癌的上皮-间质转化和转移 | 首次阐明YWHAG通过调控LRRK2/PI3K/AKT信号轴驱动非小细胞肺癌EMT和转移的分子机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 阐明YWHAG在非小细胞肺癌进展中的功能和机制作用 | 非小细胞肺癌细胞系(NCI-H292, A549)、TCGA数据库、单细胞RNA测序数据、基因工程小鼠模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 过表达, 免疫共沉淀, 免疫荧光, 生物发光成像 | 基因敲除小鼠模型, 原位肿瘤模型 | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质数据, 影像数据 | TCGA泛癌数据集、2个NSCLC单细胞数据集(GSE117570 & GSE148071)、公共NSCLC小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3189 | 2025-11-15 |
Expression patterns of desmosome family members during tooth development and the role of Desmocollin-3 in cytodifferentiation of stratum intermedium
2025-Dec, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现桥粒蛋白家族成员在牙釉中间层特异性表达，并揭示Desmocollin-3对维持牙釉中间层细胞完整性和成釉细胞分化的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定牙釉中间层特异性标志物，并揭示Desmocollin-3在牙釉中间层细胞分化和成釉细胞谱系定向中的新功能 | 研究主要使用体外细胞系模型，需要进一步在体内验证；样本量有限，仅分析了出生后12天的磨牙 | 鉴定牙釉中间层特异性标志物并研究Desmocollin-3在维持牙釉中间层细胞完整性和分化中的功能 | 出生后12天小鼠磨牙和SF2牙上皮细胞系 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 出生后12天小鼠磨牙 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3190 | 2025-11-15 |
Bioinformatics Analysis and Experimental Validation of Disulphidptosis in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Dec, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103955
PMID:41106220
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证研究二硫死亡相关基因在口腔鳞状细胞癌中的表达及其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | 首次系统研究二硫死亡相关基因在口腔鳞癌中的表达模式，发现INF2和DSTN等15个关键基因与患者生存和免疫细胞浸润相关 | 需要进一步的实验室验证和临床试验来探索INF2和DSTN的治疗靶向性及其对免疫微环境的影响 | 研究二硫死亡相关基因在口腔鳞状细胞癌中的表达水平并评估其作为诊断和预后生物标志物的潜力 | 口腔鳞状细胞癌样本和相关的二硫死亡相关基因 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | RNA测序, 实时PCR, 单细胞RNA测序, 功能富集分析, 生存分析, 免疫细胞浸润分析 | 接收者操作特征分析 | RNA测序数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3191 | 2025-11-15 |
Uncovering the Molecular Networks of Extracellular Vesicles in the Pathogenesis of Periodontitis
2025-Dec, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.103936
PMID:41138693
|
研究论文 | 通过整合多种组学数据揭示牙周炎发病机制中的细胞外囊泡相关基因网络 | 首次整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和因果遗传分析系统研究牙周炎中的EV相关基因网络 | 需要进一步的实验验证 | 探索牙周炎发病机制中的细胞外囊泡相关基因网络 | 牙周炎相关基因、细胞外囊泡相关基因 | 生物信息学 | 牙周炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 因果遗传分析, 分子对接 | XGBoost | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3192 | 2025-11-15 |
Elucidating the Mechanism of Radiation Therapy on Mesenchymal Cell Fate in Preventing Heterotopic Ossification
2025-Dec-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000006366
PMID:38829115
|
研究论文 | 本研究通过动物模型探究放射治疗预防异位骨化的机制，在单细胞水平分析放射诱导的间充质细胞命运变化 | 首次在单细胞水平探索放射治疗预防创伤性异位骨化的机制，揭示放射对间充质祖细胞数量和分化的双重影响 | 研究仅限于小鼠模型，临床转化需进一步验证 | 阐明放射治疗预防异位骨化的分子机制 | C57BL6J雄性小鼠的间充质祖细胞 | 单细胞测序分析 | 异位骨化 | 单细胞RNA测序，免疫荧光显微镜，显微计算机断层扫描 | 动物模型 | 单细胞转录组数据，图像数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3193 | 2025-11-15 |
Analysis of the role of RNA regulatory networks in cancer treatment: Mechanisms, applications and future prospects (Review)
2025-Dec, Molecular and clinical oncology
IF:1.4Q4
DOI:10.3892/mco.2025.2909
PMID:41220798
|
综述 | 本文综述了RNA调控网络在癌症治疗中的作用机制、应用前景及未来发展方向 | 重点关注isomiRs的功能动态及其在精准肿瘤学中的转化潜力，整合了单细胞测序和CRISPR筛选等先进技术 | NA | 分析RNA调控网络在癌症治疗中的机制、应用和未来前景 | RNA调控网络，特别是isomiRs和竞争性内源RNA网络 | 自然语言处理 | 癌症 | 单细胞测序，CRISPR筛选 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3194 | 2025-11-15 |
A drop-based workflow for fast and robust joint profiling of transcriptome and chromatin accessibility in the same cell
2025-Dec, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000258
PMID:41221081
|
研究论文 | 开发了一种基于液滴微流控的单细胞多组学工作流程，可在同一细胞中同时分析转录组和染色质可及性 | 提出快速、稳健的液滴微流控协议，实现单细胞水平RNA和染色质可及性的同步分析 | NA | 开发单细胞多组学技术以解析细胞异质性和生物学复杂性 | 单个细胞 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 转录组数据, 染色质可及性数据 | 数万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | 液滴微流控系统, 凝胶珠乳浊液(GEM)生成技术 |
| 3195 | 2025-11-15 |
TLR4-IN-C34 attenuates the progression of osteoarthritis through inhibiting inflammation, angiogenesis and pain
2025-Dec, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112084
PMID:40854507
|
研究论文 | 本文研究TLR4抑制剂C34通过抑制炎症、血管生成和疼痛来减缓骨关节炎进展的作用机制 | 首次在单细胞水平证实TLR4在OA患者软骨中表达升高，并发现特异性TLR4抑制剂C34具有多重抗OA效应 | NA | 探讨TLR4抑制剂C34对骨关节炎的治疗作用及机制 | 人类软骨样本、小鼠骨关节炎模型 | NA | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3196 | 2025-11-15 |
Evolution and Co-occurrence of PI3K Pathway Gene Mutations in Endometrial Carcinoma Molecular Subtypes at the Single-Cell Level
2025-Nov-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-1237
PMID:40833784
|
研究论文 | 通过单细胞测序研究子宫内膜癌分子亚型中PI3K通路基因突变的进化模式和共存情况 | 首次在单细胞水平揭示不同分子亚型子宫内膜癌中PI3K通路基因突变的进化模式差异 | 样本量较小，属于探索性研究，需要进一步验证 | 探究PI3K通路基因突变在子宫内膜癌不同分子亚型中的进化模式 | 子宫内膜样子宫内膜癌组织样本 | 单细胞基因组学 | 子宫内膜癌 | 单核DNA测序 | NA | 基因组DNA序列数据 | 11个肿瘤样本（NSMP=5，MMRd=3，POLE=3），共50,009个细胞 | NA | 单细胞DNA测序 | NA | 针对64个癌症相关基因热点变异及PTEN、PIK3R1、PIK3CA编码序列的测序 |
| 3197 | 2025-11-15 |
Exploring the mediating role of potential therapeutic genes in the pathogenesis of hypopituitarism through the metabolites from a genomic perspective
2025-Nov-13, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10169-1
PMID:41233666
|
研究论文 | 通过整合基因组数据与代谢物信息，探索潜在治疗基因在垂体功能减退症发病机制中的中介作用 | 首次采用孟德尔随机化方法系统分析基因-代谢物-垂体功能减退症的因果路径，发现UBAC1基因通过1-Methyl-4-imidazoleacetate代谢物介导疾病风险的机制 | 研究主要基于公共数据库的汇总数据，缺乏实验验证；中介效应仅解释4.35%的总效应，可能存在其他未发现的机制 | 识别垂体功能减退症的潜在药物靶点并阐明其发病机制 | 垂体功能减退症相关基因和血清/脑脊液代谢物 | 基因组学 | 垂体功能减退症 | 表达数量性状位点分析、全基因组关联研究、孟德尔随机化、贝叶斯共定位 | 两样本孟德尔随机化、两步孟德尔随机化 | 基因组数据、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3198 | 2025-11-15 |
Tracing the enteric neural crest cell pathway from origin to colonization: insights into Hirschsprung's disease
2025-Nov-11, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-11211-w
PMID:41217573
|
综述 | 本文系统综述了肠道神经系统发育过程中肠神经嵴细胞的迁移路径及其在先天性巨结肠症中的作用机制 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学新技术，揭示ENS发育过程中的时空异质性和谱系多样化 | 肠道组织的固有复杂性（包括多样细胞类型、微环境相互作用和多尺度调控网络）仍阻碍机制洞察和精准治疗 | 阐明肠道神经系统发育的分子机制，重点关注肠神经嵴细胞的迁移过程 | 肠神经嵴细胞及其形成的肠道神经系统 | 发育生物学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3199 | 2025-11-15 |
Single-cell hdWGCNA identifies ICI-related-colitis key CD8 + T cells linked to immunotherapy response and prognosis in colon cancer
2025-Nov-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03891-4
PMID:41217618
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和hdWGCNA分析鉴定与免疫检查点抑制剂相关结肠炎(CIC)相关的关键CD8+T细胞，并探讨其对结肠癌预后和免疫治疗疗效的影响 | 首次使用高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)识别CIC相关基因模块，发现CIC关键CD8+T细胞在免疫治疗反应中的重要作用 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；机制研究仍需进一步实验证实 | 探索免疫检查点抑制剂相关结肠炎的免疫学机制及其对结肠癌预后的影响 | PD-1抑制剂诱导结肠炎患者和未发生结肠炎患者的单细胞RNA测序数据 | 单细胞转录组学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, 细胞间通讯分析, 伪时间分析, hdWGCNA | 预后评分模型 | 单细胞RNA测序数据 | PD-1抑制剂诱导结肠炎患者和对照患者的单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3200 | 2025-11-15 |
Deciphering cell-type-and temporally specific matrisome expression signatures in human cortical development and neurodevelopmental disorders via scRNA-seq meta-analysis
2025-Nov-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64381-3
PMID:41219193
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序荟萃分析揭示人类皮质发育过程中细胞类型特异性和时间特异性的基质组表达特征及其与神经发育障碍的关联 | 首次通过大规模scRNA-seq荟萃分析系统描绘人类皮质发育过程中细胞类型特异性和时间特异性的基质组表达动态，并揭示其与神经发育障碍的关联 | 研究仅基于转录组数据，缺乏蛋白质水平验证；样本时间窗口限于孕8-26周；数据来源于不同研究的整合 | 阐明人类皮质发育过程中细胞类型特异性基质组基因表达特征及其在神经发育障碍中的潜在作用 | 人类皮质发育过程中的各种细胞类型及其基质组基因表达 | 单细胞转录组学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | 荟萃分析 | 单细胞转录组数据 | 37个供体，孕8-26周，来自6项独立研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |