单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7544 篇文献，本页显示第 3181 - 3200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3181 | 2025-06-26 |
Single cell sequencing and spatial multiomics of diabetic kidney segmentation insights zonation-specific therapeutic metabolic pathways
2025-Jun, Cell insight
DOI:10.1016/j.cellin.2025.100252
PMID:40547113
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研究论文 | 通过整合高分辨率空间多组学和单细胞转录组学，研究糖尿病肾病（DN）肾脏区域特异性代谢失调，并探索治疗代谢途径 | 首次绘制了糖尿病肾脏区域特异性代谢失调的空间图谱，并发现GPX3作为成纤维细胞富集的生物标志物与肾功能障碍密切相关 | 研究主要基于小鼠模型，临床验证仍需进一步扩展 | 探索糖尿病肾病肾脏区域特异性代谢失调及其治疗靶点 | 糖尿病肾病小鼠模型及临床患者样本 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞测序、空间多组学、空间代谢组学、空间蛋白质组学 | NA | 空间多组学数据、单细胞转录组数据 | 糖尿病小鼠模型及临床DN患者样本 |
| 3182 | 2025-06-26 |
Secreted Phosphoprotein 1 in Lung Diseases
2025-May-30, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo15060365
PMID:40559389
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review | 本文综述了分泌磷蛋白1（SPP1）在肺部疾病中的作用及其潜在的治疗靶点 | 重点探讨了SPP1在间质性肺疾病（ILDs）中的表达及其在纤维化过程中的作用，结合了单细胞RNA测序的最新数据 | 主要基于现有文献综述，缺乏新的实验数据支持 | 探讨SPP1在肺部疾病中的病理机制及其作为治疗靶点的潜力 | SPP1及其在肺部疾病中的表达和作用 | NA | lung cancer | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 3183 | 2025-06-26 |
Exploring the Role of Bifenthrin in Recurrent Implantation Failure and Pregnancy Loss Through Network Toxicology and Molecular Docking
2025-May-29, Toxics
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxics13060454
PMID:40559927
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研究论文 | 本研究探讨了双酚菊酯（BF）通过网络毒理学和分子对接在复发性着床失败（RIF）和复发性妊娠丢失（RPL）中的潜在作用 | 首次通过整合网络毒理学和分子对接方法，识别了BF与RIF和RPL相关的四个枢纽基因，并构建了诊断模型 | 缺乏体内和体外实验证据，需要进一步研究阐明BF导致RIF和RPL的具体机制 | 探究双酚菊酯（BF）与复发性着床失败（RIF）和复发性妊娠丢失（RPL）的潜在关联 | 双酚菊酯（BF）及其潜在靶点，复发性着床失败（RIF）和复发性妊娠丢失（RPL）患者 | 网络毒理学 | 生殖系统疾病 | RNA-seq, 分子对接 | 诊断模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的RIF和RPL队列数据 |
| 3184 | 2025-06-26 |
A retinoic acid:YAP1 signaling axis controls atrial lineage commitment
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115687
PMID:40343798
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research paper | 该研究揭示了视黄酸（RA）与YAP1信号轴在心脏祖细胞（CPCs）中调控心房谱系基因表达和心房细胞命运的作用机制 | 首次发现Hippo效应因子YAP1与TEAD4整合到心房转录因子增强子网络中，并证实YAP1激活CPCs中的RA增强子，揭示了YAP1与RA信号协同诱导心脏发生中心房谱系的新机制 | 研究主要基于hESC来源的CPCs和小鼠胚胎模型，人类心脏发育的复杂性可能需要更多体内模型验证 | 阐明视黄酸信号通路调控心脏祖细胞心房谱系分化的分子机制 | 人类胚胎干细胞来源的心脏祖细胞（hESC-CPCs）和小鼠胚胎第二心区CPCs | 发育生物学 | 心血管疾病 | scRNA-seq（单细胞RNA测序）, snATAC-seq（单核染色质可及性测序） | 人类胚胎干细胞分化模型、小鼠基因敲除模型、心脏类器官模型 | 基因组学数据、单细胞转录组数据、表观遗传数据 | 未明确样本量（使用hESC-CPCs和小鼠胚胎模型） |
| 3185 | 2025-06-26 |
Integrative Spatial Proteomics and Single-Cell RNA Sequencing Unveil Molecular Complexity in Rheumatoid Arthritis for Novel Therapeutic Targeting
2025-May-22, Proteomes
IF:4.0Q2
DOI:10.3390/proteomes13020017
PMID:40559990
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研究论文 | 本研究通过整合空间蛋白质组学和单细胞RNA测序技术，揭示了类风湿性关节炎(RA)的分子复杂性，并提出了新的治疗靶点 | 结合激光捕获显微切割(LCM)与质谱蛋白质组学及单细胞RNA测序技术，首次在空间和蛋白质水平上解析了RA滑膜组织的异质性 | 研究样本量有限，且仅针对滑膜组织进行分析，未考虑其他可能受影响的组织 | 深入理解RA的分子机制并发现新的治疗靶点 | 类风湿性关节炎患者的滑膜组织 | 生物医学研究 | 类风湿性关节炎 | 激光捕获显微切割(LCM)、质谱蛋白质组学、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量，但包括患病和健康对照的滑膜组织样本 |
| 3186 | 2025-06-26 |
Calbindin 2 as a Novel Biomarker and Therapeutic Target for Abdominal Aortic Aneurysm: Integrative Analysis of Human Proteomes and Genetics
2025-May-06, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.039195
PMID:40314374
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研究论文 | 本研究通过整合人类蛋白质组和遗传学数据，发现CALB2作为腹主动脉瘤的新型生物标志物和治疗靶点 | 首次将CALB2与腹主动脉瘤的发病机制联系起来，并验证了其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床试验尚未进行 | 寻找腹主动脉瘤的新型生物标志物和治疗靶点 | 腹主动脉瘤患者和小鼠模型 | 生物医学研究 | 腹主动脉瘤 | 蛋白质组范围孟德尔随机化、遗传相关性分析、共定位分析、RNA测序、单细胞/单核RNA测序、空间转录组学 | 载脂蛋白E缺陷小鼠模型 | 蛋白质组数据、遗传数据、RNA测序数据 | NA |
| 3187 | 2025-06-26 |
Candidate Biomarkers for Hard-to-Heal Wounds Revealed by Single-Cell RNA Sequencing of Wound Fluid in Murine Wound Models
2025 May-Jun, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society
IF:3.8Q1
DOI:10.1111/wrr.70038
PMID:40444294
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研究论文 | 通过小鼠伤口模型中的伤口液单细胞RNA测序，揭示了难愈性伤口的候选生物标志物 | 首次使用伤口液中的细胞进行单细胞RNA测序，探索不同病理延迟伤口模型中的共同基因表达模式 | 研究仅基于小鼠模型，结果尚未在临床环境中验证 | 探索不依赖于单一病理的难愈性伤口治疗靶点 | 小鼠伤口模型中的伤口液细胞 | 数字病理 | 伤口愈合障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 三种代表性延迟伤口模型(老年、糖尿病和脂多糖诱导的炎症伤口模型)与正常年轻小鼠的比较 |
| 3188 | 2025-06-26 |
Spatial transcriptomic analysis of HIV and tuberculosis coinfection in a humanized mouse model reveals specific transcription patterns, immune responses and early morphological alteration signaling
2025-Jan-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.29.635571
PMID:39975088
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research paper | 该研究通过空间转录组学分析，揭示了HIV和结核分枝杆菌共感染在小鼠模型中的早期转录模式、免疫反应和形态学改变信号 | 首次在人类化小鼠模型中，使用空间转录组学技术研究HIV和结核分枝杆菌共感染的早期免疫细胞浸润和转录模式 | 研究仅关注了感染后三周的早期阶段，未探讨长期感染效应 | 理解HIV和结核分枝杆菌共感染早期的表型和功能变化 | 人类化小鼠模型的肺组织 | digital pathology | lung cancer | spatial transcriptomics | humanized mouse model | spatial transcriptomic data | 多组人类化小鼠（单感染HIV、单感染结核分枝杆菌、共感染组） |
| 3189 | 2025-06-26 |
A Toolkit for Single-Nucleus Characterization of Glioblastoma
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4654-0_18
PMID:40553287
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研究论文 | 本文介绍了一个用于胶质母细胞瘤单核表征的工具包，包括核分离、计数和质量控制的详细协议 | 提供了一个优化的单核制备流程，适用于冷冻样本和难以解离的组织，如脑或脑肿瘤组织 | 未提及该工具包在不同实验室条件下的可重复性和适用性 | 开发一个高效的单核RNA测序（snRNA-seq）工具包，用于胶质母细胞瘤的表征 | 胶质母细胞瘤（GBM）的临床标本和患者来源的GBM细胞系 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 3190 | 2025-06-26 |
A CD8+ T Cell Infiltration-Driven Prognostic Signature for Gastric Cancer: Bridging Tumor Immunity and Clinical Outcomes
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/6629479
PMID:40547199
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，揭示了胃癌中CD8+ T细胞的异质性及其与临床预后的关系 | 首次系统解析了胃癌微环境中CD8+ T细胞的功能亚群，并鉴定了一个由SELL、CD79B和RAMP2组成的三基因预后标志物 | 样本量相对较小（23例胃癌组织），且需要进一步的前瞻性临床验证 | 探究胃癌微环境中CD8+ T细胞异质性及其与肿瘤进展和免疫治疗反应的关系 | 胃癌组织中的CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量转录组分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 无监督聚类、伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 23例胃癌组织（来自GEO数据库）和TCGA-STAD数据集 |
| 3191 | 2025-06-26 |
Interrogation of macrophage-related prognostic signatures reveals a potential immune-mediated therapy strategy by histone deacetylase inhibition in glioma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1554845
PMID:40548122
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研究论文 | 该研究通过分析胶质瘤相关巨噬细胞（GAMs）的基因特征，构建了一个预后模型，并筛选出Vorinostat作为潜在的治疗药物 | 结合单细胞RNA测序和WGCNA分析，识别了14个与GAMs相关的预后基因，并验证了Vorinostat在胶质瘤微环境中的抑制作用 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仅使用了胶质瘤细胞-巨噬细胞共培养模型，未进行体内实验 | 探索胶质瘤相关巨噬细胞的分子机制，寻找潜在的治疗靶点和药物 | 胶质瘤相关巨噬细胞（GAMs） | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | scRNA-seq, WGCNA, Cox回归分析, LASSO回归分析 | 预后模型 | 基因表达数据 | NA |
| 3192 | 2025-06-26 |
Development of a machine learning-derived dendritic cell signature for prognostic stratification in lung adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1621370
PMID:40552290
|
研究论文 | 开发了一种基于机器学习的树突状细胞特征，用于肺腺癌的预后分层 | 首次构建了树突状细胞相关特征（DCRS），并验证其在多个外部队列中的预后性能，同时揭示了PLEK2在肺腺癌中的功能作用 | 研究依赖于单细胞RNA测序数据，可能受到样本量和数据质量的限制 | 探索树突状细胞在肺腺癌中的转录多样性和预后价值 | 肺腺癌（LUAD）患者和正常组织的树突状细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、高维加权基因共表达网络分析（hdWGCNA）、伪时间分析 | Lasso-Cox、RSF、CoxBoost、Stepwise-Cox | RNA测序数据 | 七个外部队列的临床样本和肺腺癌细胞系 |
| 3193 | 2025-06-24 |
Kidney diseases and single-cell sequencing research: a bibliometric analysis from 2015 to 2024
2025-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2025.2521457
PMID:40545992
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研究论文 | 本文通过文献计量学方法分析了2015年至2024年间单细胞RNA测序（scRNA-seq）在肾脏疾病研究中的应用 | 揭示了scRNA-seq技术在肾脏疾病研究中的快速发展和应用趋势，包括疾病进展机制、基因调控表达等新兴研究方向 | 研究仅基于Web of Science Core Collection数据库，可能未涵盖所有相关文献 | 评估scRNA-seq在肾脏疾病研究中的应用现状和未来趋势 | 2015年至2024年间发表的关于scRNA-seq在肾脏疾病研究中应用的文献 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | scRNA-seq | NA | 文本 | 1,210篇出版物 |
| 3194 | 2025-06-24 |
Sex-specific neurotoxicity induced by long-term bisphenol A exposure: Single-cell sequencing reveals dual mechanisms involving hippocampal gliosis and neuronal apoptosis
2025-Aug-10, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2025.179810
PMID:40505511
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研究论文 | 本研究探讨了长期暴露于双酚A（BPA）对成年小鼠行为记忆和神经系统的影响，揭示了性别特异性的神经毒性机制 | 首次结合单细胞测序技术，揭示了BPA暴露引起的性别特异性神经毒性机制，包括雌性小鼠海马胶质增生和雄性小鼠海马齿状回颗粒神经元凋亡 | 研究仅在小鼠模型中进行，结果向人类外推需谨慎 | 探究长期BPA暴露对神经系统的影响及其性别特异性机制 | 成年小鼠 | 神经毒理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 行为数据、形态学数据、单细胞测序数据 | 未明确说明小鼠数量 |
| 3195 | 2025-06-24 |
Mucosal Macrophages Govern Intestinal Regeneration in Response to Injury
2025-Jul, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.01.252
PMID:40086603
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研究论文 | 本研究揭示了黏膜巨噬细胞在肠道损伤后再生过程中的关键作用 | 首次发现巨噬细胞通过分泌neuregulin 1和osteopontin分子诱导肠道上皮细胞胎儿样重编程和增殖 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的转化需要进一步验证 | 阐明辐射性肠炎后肠道再生的分子机制 | 肠道巨噬细胞与肠道干细胞 | 分子生物学 | 辐射性肠炎 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、流式细胞术、器官共培养系统 | 小鼠辐射损伤模型、人类肠道类器官模型 | 基因表达数据、细胞成像数据 | 未明确说明具体样本数量（小鼠模型和人类类器官） |
| 3196 | 2025-06-24 |
Targeting FGFR Attenuates Tumor Growth in an Anal Squamous Cell Carcinoma Patient Derived Xenograft Model
2025-Jul, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23919
PMID:40256931
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研究论文 | 通过患者来源的异种移植模型和单细胞RNA测序，研究发现FGFR抑制能有效减缓肛门鳞状细胞癌的肿瘤生长 | 首次在肛门鳞状细胞癌患者来源的异种移植模型中验证FGFR抑制剂的治疗效果，并通过单细胞RNA测序揭示了肿瘤细胞的异质性 | 研究仅基于一个转移性肛门鳞状细胞癌样本，样本量较小 | 寻找肛门鳞状细胞癌的可操作治疗靶点 | 肛门鳞状细胞癌患者来源的异种移植模型 | 肿瘤学 | 肛门鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 傅里叶变换红外光谱 | 患者来源的异种移植模型(PDX) | 基因表达数据, 光谱数据 | 1例转移性肛门鳞状细胞癌样本 |
| 3197 | 2025-05-14 |
Simultaneous single-cell sequencing of RNA and DNA at scale with DEFND-seq
2025-Jul, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00853-y
PMID:40355601
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3198 | 2025-06-22 |
Deciphering Macrophage-Fibroblast Cross Talk in Obesity-Induced Adipose Tissue Fibrosis: Insights From Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2025-Jul-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0337
PMID:40540667
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3199 | 2025-06-24 |
Deciphering the Regulatory Networks of the Migrasome-Associated Cell Subpopulation in Heterotopic Ossification via Multi-Omics Analysis
2025-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500965R
PMID:40540299
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研究论文 | 通过多组学分析解析异位骨化中迁移体相关细胞亚群的调控网络 | 识别了异位骨化中的关键细胞亚群和分子（Ppib和Tagln），并构建了它们的调控网络和空间分布 | NA | 阐明异位骨化（HO）的关键生物分子网络 | 异位骨化中的迁移体相关细胞亚群 | 多组学分析 | 异位骨化 | 单细胞转录组、批量转录组、空间转录组、hdWGCNA、机器学习 | NA | 转录组数据 | 来自GEO数据库的多个数据集和临床样本 |
| 3200 | 2025-06-24 |
Integrating Single-Cell and Experimental Analyses Uncover Macrophage Ferroptosis Is a Key Event in the Development of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501120R
PMID:40542598
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研究论文 | 本文通过整合单细胞和实验分析，揭示了巨噬细胞铁死亡在慢性阻塞性肺疾病（COPD）发展中的关键作用 | 首次发现巨噬细胞铁死亡是COPD发展的关键事件，并揭示了相关基因表达的变化 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类样本验证有限 | 探究COPD发病机制中巨噬细胞铁死亡的作用 | 巨噬细胞和COPD患者及小鼠模型 | 生物医学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞测序、免疫荧光、免疫组化、qRT-PCR、Western blotting | 小鼠COPD模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 公共数据库GSE171541和GSE173896的单细胞测序数据，RAW264.7细胞系和BMDM细胞系，COPD小鼠模型 |