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当前共找到 10620 篇文献,本页显示第 301 - 320 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
301 2026-03-06
Transcriptomic responses of lung mesenchymal cells during pneumonia
2025-Feb-25, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠肺炎期间肺间充质细胞的转录组响应,揭示了其多样化和特异性的免疫活动 首次系统性地鉴定了肺炎期间肺间充质细胞的五种亚型及其转录组动态变化,并发现了跨细胞类型的核心响应和亚型特异性响应 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证,且时间点有限(仅24小时和6周),可能未覆盖所有疾病阶段 探究肺间充质细胞在肺炎期间的转录组响应及其免疫功能 小鼠肺组织中的间充质细胞 单细胞转录组学 肺炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 来自小鼠肺单细胞悬液的间充质细胞,包括初始组、肺炎组和感染恢复组 NA 单细胞RNA-seq NA NA
302 2026-03-06
Ag-driven CD8 + T cell clonal expansion is a prominent feature of MASH in humans and mice
2025-Feb-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究通过单细胞测序和流式细胞术,揭示了MASH(代谢功能障碍相关脂肪性肝炎)中肝脏T细胞的表型、T细胞受体多样性及抗原驱动的克隆扩增现象 首次在人类和小鼠模型中证实MASH诱导的肝硬化导致肝脏中T细胞发生抗原依赖性克隆扩增和功能分化,并识别了PD1、TIGIT和TOX等慢性抗原刺激标志物 研究未明确驱动T细胞激活的具体抗原靶点,且样本来源限于人类肝硬化和小鼠饮食诱导MASH模型,可能无法完全代表所有MASH亚型 旨在解析MASH进展中T细胞在肝脏积累的表型、T细胞受体多样性及其功能作用 人类肝硬化患者和小鼠饮食诱导MASH模型的肝脏驻留T细胞 免疫学 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 5'单细胞测序, 流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 人类肝硬化患者和小鼠MASH模型的肝脏T细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
303 2026-03-06
Mapping cell-cell fusion at single-cell resolution
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文开发了一种名为ClonMapper Duo(CMDuo)的分子工具包,用于在单细胞分辨率下映射肿瘤细胞群体中的细胞-细胞融合事件 通过结合报告基因表达和工程化的荧光相关索引序列与随机生成的核苷酸条形码,CMDuo能够识别并追踪单个细胞融合事件的起源和结果,这是首次在单细胞水平上实现此类映射 由于依赖于特定的实验系统和条形码技术,CMDuo可能不适用于所有细胞类型或疾病模型,且需要单细胞RNA-seq数据支持 研究细胞-细胞融合在癌症进展和治疗反应中的作用,开发一种高通量单细胞数据平台来映射融合事件 三阴性乳腺癌细胞 单细胞组学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
304 2026-03-06
Meta-analyses of mouse and human prostate single-cell transcriptomes reveal widespread epithelial plasticity in tissue regression, regeneration, and cancer
2025-Jan-17, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 本文通过整合分析小鼠和人类前列腺的单细胞转录组数据,揭示了前列腺组织在稳态、退行、再生和癌症过程中上皮细胞状态的广泛可塑性 利用随机矩阵理论去噪和最优传输方法,首次系统比较了跨物种前列腺上皮细胞转录组相似性,并整合单细胞转录组与拷贝数变异分析,阐明了前列腺癌进展中的转录程序 研究主要基于已发表和新生成的scRNA-seq数据,可能受限于样本数量和技术平台的异质性,且功能验证实验较少 探究前列腺上皮细胞在组织稳态、退行、再生和癌症过程中的动态变化和可塑性 小鼠和人类前列腺组织,包括正常、雄激素剥夺后退行、良性前列腺增生和未经治疗的前列腺癌样本 单细胞转录组学 前列腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 随机矩阵理论、最优传输 单细胞转录组数据、拷贝数变异数据 整合了多个已发表和新生成的小鼠和人类前列腺scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
305 2026-03-06
Dimensionality reduction for visualizing spatially resolved profiling data using SpaSNE
2025-Jan-06, GigaScience IF:11.8Q1
研究论文 本文开发了一种名为SpaSNE的空间解析t-SNE方法,用于整合空间和分子信息,以更准确地可视化空间解析分析数据 SpaSNE是首个针对空间解析分析数据定制的降维方法,整合了空间和分子信息,相比传统方法如t-SNE和UMAP能提供更准确和有意义的数据可视化 NA 开发一种针对空间解析分析数据的降维和可视化方法,以更好地解释细胞类型和分子结构 空间解析分析数据集,包括来自不同疾病、组织和细胞类型的细胞 空间转录组学 NA 空间解析分析技术 t-SNE, UMAP, SpaSNE 空间解析分析数据 多个公共数据集,涵盖3个实验平台和不同疾病、组织及细胞类型 10x Genomics, 其他 空间转录组学, 空间解析分析 Visium, STARmap, MERFISH Visium, STARmap, MERFISH平台生成的空间解析分析数据
306 2026-03-06
Lifting the curse from high-dimensional data: automated projection pursuit clustering for a variety of biological data modalities
2025-Jan-06, GigaScience IF:11.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为自动投影追踪(APP)的无监督聚类方法,通过将高维数据顺序投影到低维表示来缓解维度诅咒,并在多种生物数据模态上验证其有效性 提出了一种替代传统高维空间聚类的方法,通过自动投影追踪技术降低维度诅咒的影响,从而更有效地揭示生物数据中的模式 未明确说明方法在极端高维或噪声数据下的鲁棒性,以及计算效率的详细评估 开发一种能缓解维度诅咒的无监督聚类方法,以改善高维生物数据的分析 高维生物数据,包括转录组学、蛋白质组学、单细胞组学数据等 机器学习 NA 自动投影追踪(APP) 无监督聚类算法 高维生物数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 质谱细胞术, 多重成像, T细胞受体库分析 NA NA
307 2026-03-06
Keeping an Eye Out for Autophagy in the Cornea: Sample Preparation for Single-Cell RNA-Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
研究论文 本文描述了利用单细胞RNA测序技术研究角膜缘上皮干细胞群及自噬对其功能影响的样本制备方法 开发了针对角膜/角膜缘组织活细胞单细胞悬液的分离协议,并结合自噬缺陷模型进行scRNA-seq分析 NA 研究自噬对角膜缘上皮干细胞功能的影响 小鼠角膜缘上皮干细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
308 2026-03-06
Characterizing the immune infiltrate in secondary syphilis: implications for transmission and pathology
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过免疫组化、bulk RNA测序和单细胞RNA测序技术,分析了二期梅毒皮肤病变中的免疫浸润特征,并探讨了梅毒螺旋体在皮肤中的免疫逃逸机制 首次结合单细胞RNA测序和免疫组化技术,系统描绘了二期梅毒皮肤病变中的免疫细胞组成和细胞间通讯网络,并揭示了表皮TLR-MYD88通路在宿主应答中的关键作用 研究样本来源于福尔马林固定石蜡包埋的组织,可能影响RNA质量和单细胞测序的灵敏度;体外实验模型可能无法完全模拟体内复杂的免疫微环境 阐明梅毒螺旋体在皮肤感染过程中的免疫逃逸机制和宿主免疫应答特征 二期梅毒患者的皮肤活检组织、健康人外周血单个核细胞(PBMCs)、原代角质形成细胞和MyD88敲除角质形成细胞 数字病理学 梅毒 免疫组化(IHC)、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 NA 图像、转录组数据 二期梅毒患者的皮肤活检样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
309 2026-03-06
Serine supplementation suppresses hypoxia-induced pathological retinal angiogenesis
2025, Theranostics IF:12.4Q1
研究论文 本研究探讨了丝氨酸补充对抑制缺氧诱导的病理性视网膜血管新生的作用及其机制 首次系统性地在氧诱导视网膜病变小鼠模型中,通过多组学分析和单细胞RNA测序,揭示了丝氨酸通过增强线粒体脂肪酸氧化和氧化磷酸化来抑制病理性血管新生的新机制,并鉴定出HMGB1蛋白作为关键介导因子 研究主要基于小鼠模型,其在人类疾病中的直接适用性尚需进一步验证;干预时间点和剂量方案有待优化;对丝氨酸代谢下游具体信号通路的解析还不够深入 探究丝氨酸代谢在抑制缺氧驱动的病理性视网膜血管新生中的作用及分子机制 野生型C57BL/6J小鼠的氧诱导视网膜病变模型 数字病理学 视网膜病变 代谢组学, 脂质组学, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 蛋白质印迹 动物模型 多组学数据, 图像, 文本 未明确具体数量的小鼠视网膜样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
310 2026-03-06
Single cell atlas of canine natural killer cells identifies distinct circulating and tissue resident gene profiles
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,构建了犬类自然杀伤细胞在不同组织中的单细胞图谱,并与人类自然杀伤细胞进行比较,揭示了跨物种的基因表达同源性 首次在犬类中系统性地绘制了自然杀伤细胞在血液、肺、肝、脾和胎盘等组织中的单细胞基因表达图谱,并进行了跨物种比较分析 研究主要基于基因表达数据,缺乏功能验证实验;样本来源可能有限,未涵盖所有犬类品种或疾病状态 旨在表征犬类自然杀伤细胞的异质性、组织特异性基因表达模式,并与人类自然杀伤细胞进行比较,以优化跨物种的自然杀伤细胞免疫治疗 犬类和人类的自然杀伤细胞,来源于血液、肺、肝、脾和胎盘等组织 单细胞组学 癌症 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 涉及犬类和人类的多组织样本,具体数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
311 2026-03-06
Perspective on recent developments and challenges in regulatory and systems genomics
2025, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
综述 本文讨论了调控和系统基因组学领域的最新进展与挑战,重点关注顺式调控代码的解码及其在人类疾病中的应用 整合了计算基因组学、3D染色质组织分析和序列到功能神经网络,以预测遗传变异对表型的影响,并展望了空间转录组学等新兴技术 存在知识空白、技术限制以及计算方法基准测试的挑战 解码顺式调控代码,预测遗传变异在生物体、细胞和分子水平上对表型的影响 顺式调控元件、3D染色质组织、基因调控网络和人类疾病相关的遗传变异 自然语言处理 NA 基因组学检测、空间转录组学 序列到功能神经网络 序列数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
312 2026-03-06
Comparative transcriptomic analysis of tumor- infiltrating canine natural killer cells and candidate biomarkers from first-in-dog NK immunotherapy trials
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序比较了犬和人类肿瘤浸润自然杀伤细胞的转录组特征,并评估了犬NK免疫疗法试验中的候选生物标志物 首次在犬类中整合血液、组织和肿瘤样本进行单细胞RNA测序分析,建立了犬肉瘤浸润NK细胞特征,并将此特征应用于首次犬免疫疗法临床试验的NK细胞变化背景分析 研究样本可能有限,且犬类模型虽与人类相似,但物种间差异仍需谨慎考虑,临床试验的规模和多样性可能不足 改善NK细胞在实体癌症中的疗效,并识别跨物种反应的潜在生物标志物 犬和人类捐赠者的血液、组织和肿瘤样本中的自然杀伤细胞 单细胞转录组学 肉瘤 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 来自犬和人类捐赠者的血液、组织和肿瘤样本,具体数量未在摘要中指定 NA 单细胞RNA测序 NA NA
313 2026-03-05
Tumor-infiltrating B cells produce tumor-specific antibodies and may contribute to suppressing tumor in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Dec, Oncoimmunology IF:6.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序等多组学技术,首次揭示了头颈部鳞状细胞癌中肿瘤浸润B细胞通过产生肿瘤特异性抗体并激活免疫细胞来抑制肿瘤的机制 首次在头颈部鳞状细胞癌中系统性地证明了肿瘤浸润B细胞能够产生肿瘤特异性抗体,并揭示了其通过激活巨噬细胞和NK细胞来增强抗肿瘤免疫的新机制 研究主要基于手术切除的肿瘤样本,缺乏对治疗过程中B细胞动态变化的纵向观察,且抗体功能验证主要在体外进行 阐明肿瘤浸润B细胞在头颈部鳞状细胞癌肿瘤免疫中的作用 头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织样本 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,B细胞受体谱分析,多重免疫荧光染色,空间转录组学分析,蛋白质微阵列 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据,蛋白质表达数据,免疫组化图像 68例头颈部鳞状细胞癌手术切除标本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
314 2026-03-05
Brain tumors induce widespread disruption of calvarial bone and alteration of skull marrow immune landscape
2025-Nov, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 本文探讨了胶质母细胞瘤如何诱导颅骨骨异常并改变颅骨骨髓免疫环境 首次揭示了脑肿瘤对颅骨骨髓免疫景观的广泛破坏作用,并发现骨吸收抑制在特定亚型肿瘤中可能促进肿瘤进展 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且未深入探讨其他脑肿瘤类型的影响 研究脑肿瘤(特别是胶质母细胞瘤)对颅骨骨结构和骨髓免疫环境的影响 小鼠模型和胶质母细胞瘤患者 数字病理学 脑肿瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型和患者样本,具体数量未明确 NA 单细胞RNA-seq NA NA
315 2026-03-05
Spatial analysis reveals the cellular microenvironments and mechanisms of inflammation and kidney injury in acute interstitial nephritis
2025-Oct-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用高分辨率成像质谱流式细胞术和单细胞空间转录组学分析急性间质性肾炎(AIN)患者肾活检组织,揭示了其独特的免疫微环境和分子机制 首次通过空间多组学技术系统解析AIN的细胞微环境,发现CXCL9-CXCR3轴是AIN的特异性免疫特征,并鉴定出烟酰胺磷酸核糖转移酶(NAMPT)在协调代谢-炎症微环境中的关键作用 样本量相对有限,且为横断面研究,未能验证潜在治疗靶点的临床疗效 阐明急性间质性肾炎的发病机制并识别潜在治疗靶点 人类肾活检组织(包括AIN、非免疫性急性肾小管损伤及对照组织) 数字病理学 肾脏疾病 成像质谱流式细胞术,单细胞空间转录组学 空间分析模型 空间多组学数据(蛋白质+转录组) 人类肾活检组织样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞空间转录组学 NA NA
316 2026-03-05
Integration of elemental imaging and spatial transcriptomic profiling for proof-of-concept metals-based pathway analysis of colon tumor microenvironment
2025-Oct-14, Metallomics : integrated biometal science IF:2.9Q3
研究论文 本研究通过整合元素成像和空间转录组学技术,探索结肠肿瘤微环境中金属元素与基因表达的相互作用 首次将元素成像与空间转录组学结合,实现组织范围内金属-基因相互作用的全面分析,突破了传统孤立研究金属或基因的限制 本研究为概念验证性质,仅基于单个结肠癌肿瘤样本,样本量有限,结果需在更大患者队列中验证 探索肿瘤微环境中金属依赖的信号通路,识别与金属相关的基因表达模式 结肠癌肿瘤微环境中的金属元素分布、基因表达、细胞组成和组织病理学特征 空间转录组学 结肠癌 元素成像,空间转录组学 NA 图像,基因表达数据 单个结肠癌肿瘤样本 NA 空间转录组学 NA NA
317 2026-03-05
p53 maintains lineage fidelity during lung capillary injury-repair in neonatal hyperoxia
2025-Sep-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究揭示了p53在新生儿高氧损伤后肺毛细血管修复过程中维持内皮细胞谱系保真性的关键作用 首次发现Cap2细胞在高氧损伤中被Cap1细胞替代,并证实EC特异性p53缺失可通过诱导过渡性内皮细胞状态改善血管表型和肺泡简化 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限;过渡性EC状态的具体调控机制仍需进一步探索 探究p53在新生儿高氧诱导肺损伤修复过程中对内皮细胞谱系保真性的调控作用 新生小鼠肺组织内皮细胞亚群(Cap1/Cap2)及人类支气管肺发育不良(BPD)伴肺动脉高压样本 单细胞组学 支气管肺发育不良(BPD) 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量(含小鼠模型和人类BPD样本) NA 单细胞RNA-seq NA NA
318 2026-03-05
Increased inflammation as well as decreased endoplasmic reticulum stress and translation differentiate pancreatic islets from donors with pre-symptomatic stage 1 type 1 diabetes and non-diabetic donors
2025-Jul, Diabetologia IF:8.4Q1
研究论文 本研究通过蛋白质组学分析比较了1型糖尿病前期(阶段1)与非糖尿病供体的胰岛蛋白质变化 首次在人类胰岛中应用无偏蛋白质组学方法,揭示1型糖尿病前期胰岛的分子变化,包括免疫反应增强和内质网应激及蛋白质翻译减少 样本量较小(n=3 vs n=3),存在供体间变异,统计分析的挑战性较大 识别胰岛中指示β细胞功能障碍的途径,了解1型糖尿病前期的分子机制 来自器官供体的胰岛组织,包括多自身抗体阳性(mAAb+)的1型糖尿病前期供体与非糖尿病(ND)对照供体 蛋白质组学 1型糖尿病 激光显微切割,质谱(MS)蛋白质组学,无标记定量,单细胞RNA-seq NA 蛋白质组数据,RNA-seq数据 10名器官供体(5名自身抗体阳性,5名非糖尿病对照),最终分析聚焦于3名多自身抗体阳性供体与3名匹配对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
319 2026-03-04
Deciphering precursor cell dynamics in esophageal preneoplasia via genetic barcoding and single-cell transcriptomics
2025-Dec-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本文通过结合遗传条形码和单细胞转录组学技术,追踪食管癌前病变细胞的谱系,揭示了高可塑性前体细胞的动态变化及其在肿瘤发生中的作用 首次将遗传条形码与单细胞RNA测序结合,用于追踪食管癌前病变细胞的谱系,并识别出具有高可塑性的独特前体细胞群体 未明确提及样本量或具体技术平台细节,可能限制结果的普遍性 阐明食管癌前病变细胞的起源和轨迹,以理解早期肿瘤发生机制 食管癌前病变细胞 数字病理学 食管鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,遗传条形码,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
320 2026-03-04
Single-cell analysis identifies PI3+S100A7+keratinocytes in early cervical squamous cell carcinoma with HPV infection
2025-Oct-20, Chinese medical journal IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,在早期宫颈鳞状细胞癌中鉴定出与HPV感染相关的PI3+S100A7+角质形成细胞,并揭示了其与肿瘤微环境中巨噬细胞和癌症相关成纤维细胞的相互作用 首次在早期HPV阳性宫颈鳞状细胞癌中鉴定出PI3+S100A7+角质形成细胞亚群,并系统揭示了该细胞亚群与巨噬细胞之间的空间邻近性和信号通路互作,以及不同HPV亚型(如HPV16与HPV66)驱动的独特肿瘤促进机制 样本量较小(仅4例患者),且研究聚焦于早期肿瘤,未涵盖晚期或转移性病例 探究HPV感染在早期宫颈鳞状细胞癌发生发展中的作用机制,特别是肿瘤微环境中细胞异质性和细胞间互作 早期宫颈鳞状细胞癌患者的肿瘤组织及配对癌旁组织 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序,病毒序列比对,轨迹分析,免疫荧光染色,CIBERSORTx分析 NA 单细胞转录组数据,临床预后数据,免疫荧光图像数据 4例早期宫颈鳞状细胞癌患者的肿瘤及配对癌旁组织 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Genomics平台(具体配置未在摘要中说明,推断为10x Chromium单细胞3'基因表达解决方案)
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