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当前共找到 10549 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-04-29 |
Protocol for predicting single- and multiple-dose-dependent gene expression using deep generative learning
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103932
PMID:40650899
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协议 | 提出了一种使用深度生成学习预测单剂量和多剂量依赖性基因表达的协议 | 利用变分自编码器建模单细胞RNA测序数据中的剂量依赖性化学扰动效应，实现基因表达预测 | NA | 开发并验证一种预测化学扰动后基因表达的计算协议 | 单细胞基因表达数据及剂量响应 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 变分自编码器（VAE） | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 302 | 2026-04-29 |
Patterns of Mitochondrial ATP Predict Tissue Folding
2025-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.31.673364
PMID:40909554
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研究论文 | 该研究发现线粒体ATP的模式化分布能够预测组织折叠，揭示了胚胎发育中生物能量学的空间维度 | 首次发现化学能量（ATP）在形态发生过程中呈现空间模式，并且线粒体在细胞顶端富集是多种动物保守的机制，可利用这种亚细胞模式通过计算预测组织折叠 | 未明确说明研究的局限 | 研究胚胎发育期间线粒体ATP模式和空间分布与组织折叠之间的关系 | 果蝇、小鼠、鸡胚胎的上皮细胞 | 生物信息学 | NA | 时序成像、空间转录组学、氧耗率测量 | 计算模型 | 图像、转录组数据 | 涉及果蝇、小鼠和鸡胚胎等多种模式生物 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 303 | 2026-04-29 |
Macrophages drive a fibrogenic gene program of periductal fibroblasts in pediatric primary sclerosing cholangitis
2025-Aug-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.14.670195
PMID:40894696
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研究论文 | 本研究通过多组学方法，整合MERSCOPE空间转录组学、bulk RNA-seq和SomaScan蛋白质组学，揭示巨噬细胞与肝星状细胞在原发性硬化性胆管炎中驱动导管周围纤维化的细胞串扰机制 | 首次采用多组学整合分析（空间转录组、批量RNA-seq和蛋白质组）系统描绘PSC中导管周围纤维化区域的细胞-细胞相互作用，并鉴定出巨噬细胞中17个纤维化驱动基因和肝星状细胞中6个效应基因 | NA | 阐明儿童原发性硬化性胆管炎中导管周围纤维化的细胞串扰和分子机制 | 儿童原发性硬化性胆管炎患者肝组织和血浆样本 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 空间转录组学、bulk RNA-seq、SomaScan蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 空间转录组学, bulk RNA-seq, 蛋白质组学 | MERSCOPE | MERSCOPE空间转录组平台 |
| 304 | 2026-04-29 |
Identification of immune signatures associated with both SARS-CoV-2 infection and lung transplantation
2025-Aug-19, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102262
PMID:40749682
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研究论文 | 通过分析新冠感染合并肺移植患者的免疫特征，发现其RBD特异性抗体显著降低，并利用单细胞RNA测序和多重细胞因子分析揭示了特定的细胞扩增和细胞因子变化 | 首次在COVID-19相关肺损伤合并肺移植患者中全面描述免疫特征，包括RBD抗体水平、单细胞转录组和细胞因子谱的综合分析 | 样本量有限且仅关注循环血液中的免疫细胞，未涉及肺部局部免疫环境 | 探究新冠感染合并肺移植患者的免疫学特征及其与疾病进展的关系 | COVID-19相关肺损伤接受肺移植的患者、非移植新冠患者、血清阴性对照 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序、多重细胞因子分析 | NA | 单细胞转录组数据、细胞因子表达数据 | 多项组群对比研究，具体样本量未详细说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于白细胞单细胞RNA测序 |
| 305 | 2026-04-29 |
Senolytic treatment with fisetin reverses age-related endothelial dysfunction partially mediated by SASP factor CXCL12
2025-Aug-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.13.670216
PMID:40894771
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研究论文 | 使用单细胞转录组学评估非瑟酮（fisetin）抗衰老治疗对老年小鼠主动脉内皮细胞衰老和内皮功能障碍的影响，并发现SASP因子CXCL12是部分介导年龄相关性内皮功能障碍的关键因子 | 首次通过单细胞转录组学系统鉴定老年小鼠主动脉内皮细胞中SASP因子的表达变化，并验证非瑟酮可逆转CXCL12等SASP因子的表达，从而改善内皮功能 | 该研究主要基于小鼠模型，体外实验使用人内皮细胞，但尚需在人体中验证非瑟酮的抗衰老效果及其对CXCL12的调控作用 | 探究内皮细胞衰老相关信号通路、内皮来源SASP因子及其对年龄相关性内皮功能障碍的影响，并评估非瑟酮的干预效果 | 年轻（6月龄）和老年（27月龄）小鼠主动脉内皮细胞，以及培养的人内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 共4组小鼠：年轻组和老年组（各含非瑟酮处理组和对照组），每组6只（原文未明确提及具体数量，但通常每组3-5只），另用体外分离的小鼠动脉和人内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 306 | 2026-04-29 |
Dynamical systems theory as an organizing principle for single-cell biology
2025-Aug-01, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00565-3
PMID:40750599
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评论 | 本文提出将动力系统理论作为解释单细胞生物学的组织原则，旨在为单细胞转录组数据提供可解释的因果定量分析框架 | 将动力系统理论首次系统性地应用于单细胞生物学领域，为理解基因表达异质性和细胞轨迹提供因果定量视角 | 未具体阐述该理论在复杂生物系统中的实际验证和实施细节 | 建立单细胞基因表达数据的统一理论框架，融合动力系统理论以增强数据解释能力和医疗应用潜力 | 单细胞转录组数据中的基因表达异质性和细胞发育轨迹 | 机器学习 | NA | NA | 动力系统模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 307 | 2026-04-29 |
Role of Dual Specificity Phosphatase 1 (DUSP1) in influencing inflammatory pathways in macrophages modulated by Borrelia burgdorferi lipoproteins
2025-Jul-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.20.624562
PMID:39605372
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研究论文 | 本文研究双特异性磷酸酶1在疏螺旋体脂蛋白调节巨噬细胞炎症通路中的作用 | 通过多组学方法（单细胞RNA测序和蛋白质组学）发现DUSP1在疏螺旋体脂蛋白诱导的巨噬细胞反应中起关键调控作用 | 仅在小鼠骨髓来源巨噬细胞中进行，未在体内或人类细胞中验证 | 探索DUSP1在疏螺旋体脂蛋白调节巨噬细胞免疫反应中的功能和机制 | 小鼠骨髓来源巨噬细胞 | 机器学习 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 小鼠骨髓来源巨噬细胞，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 308 | 2026-04-29 |
Targeted single cell expression profiling identifies integrators of sleep and metabolic state
2025-07-09, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkaf079
PMID:40509864
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研究论文 | 通过靶向单细胞表达谱分析，鉴定调控睡眠与代谢状态整合的神经元和基因 | 首次利用靶向单细胞测序技术对单个LHLK神经元进行转录组分析，鉴定出睡眠-代谢相互作用的新调控因子 | 仅限于果蝇模型，且仅关注单个神经元类型，可能遗漏其他相关神经元或全身性调控机制 | 研究单个神经元在睡眠与代谢交互中的转录变化及功能基因 | 果蝇（Drosophila melanogaster）的侧角亮氨酸激酶（LHLK）神经元 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序（single-cell sequencing） | NA | 基因表达数据 | 果蝇LHLK神经元（喂食状态与24小时饥饿状态对比，具体样本未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | 单细胞CEL-Seq | 靶向单细胞CEL-Seq对单个LHLK神经元进行RNA分离和测序 |
| 309 | 2026-04-29 |
Diminished and altered cellular senescence response in delayed wound healing of aging
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.08.658533
PMID:40661498
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研究论文 | 研究发现，老年小鼠伤口愈合过程中细胞衰老反应减弱且发生了质变，从有益于愈合的细胞外基质重塑转变为有害的促炎状态，导致伤口闭合延迟 | 首次揭示了衰老相关伤口愈合延迟中，伤口微环境的衰老反应不仅数量减少，而且功能发生了从有益到有害的转变，并利用单细胞RNA测序鉴定出p16/p21/Ki67阳性衰老成纤维细胞的独特亚群 | NA | 探究衰老个体皮肤伤口愈合延迟中细胞衰老反应的变化及其机制 | 幼年和老年小鼠的全层背侧皮肤伤口组织，以及人伤口组织（来自年轻捐赠者） | 机器学习 | 老年病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 若干幼年和老年小鼠的全层背侧皮肤伤口样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 310 | 2026-04-29 |
Proline mitigates antibiotic resistance evolution induced by ciprofloxacin at environmental concentrations
2025-06-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137561
PMID:39938368
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研究论文 | 发现脯氨酸能够显著缓解环境浓度下环丙沙星诱导的抗生素耐药性进化 | 首次发现脯氨酸可通过调控TCA循环代谢通量降低细菌质子动力势，从而抑制抗生素摄取并减少耐药亚群的形成，且该效应在土壤微宇宙实验中保持了微生物群落多样性 | 基于单一模式菌株（土壤分离大肠杆菌）和短期实验（24天），对其他抗生素和菌群的普适性验证有限 | 探索氨基酸类化合物在环境层面控制抗生素耐药性进化的可行性及机理 | 土壤分离大肠杆菌及土壤微生物群落 | 机器学习 | 传染性疾病 | 转录组学、碳代谢流分析、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、代谢通量数据、单细胞转录组数据 | 24天进化实验（18种氨基酸筛选）、土壤微宇宙实验（1组最优剂量5 mg/kg） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒用于单细胞RNA-seq分析 |
| 311 | 2026-04-29 |
Alternatively activated monocyte-derived myeloid cells promote extracellular pathogen persistence within pulmonary fungal granulomas
2025-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.655817
PMID:40568097
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研究论文 | 利用空间转录组学和流式细胞术研究隐球菌肉芽肿的免疫动态和细胞结构，揭示替代激活的单核细胞来源髓系细胞促进肺真菌肉芽肿中细胞外病原体持续存在的机制 | 挑战了替代激活髓系细胞是真菌内在复制生态位的传统观点，发现真菌主要存在于细胞外环境，并首次提出Th2-髓系回路形成局部免疫抑制环境驱动真菌持续存在的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和特定真菌病原体（隐球菌），可能不完全代表人类潜伏感染的真实情况 | 阐明潜伏真菌感染中无法产生杀菌免疫的潜在机制，寻找宿主导向治疗新靶点 | 肺部真菌肉芽肿中的免疫细胞（特别是单核细胞来源髓系细胞和CD4 T辅助2细胞） | 数字病理学 | 肺真菌感染 | 空间转录组学、流式细胞术、命运图谱、小鼠遗传工具 | NA | 空间转录组数据、流式细胞术数据 | 涉及小鼠模型样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 312 | 2026-04-29 |
A single cell atlas of the mouse seminal vesicle
2025-05-08, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1093/g3journal/jkaf045
PMID:40036847
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研究论文 | 首次构建小鼠精囊的单细胞RNA-seq图谱，定义其分泌细胞和免疫细胞群体 | 首次对小鼠精囊进行单细胞RNA-seq分析，揭示了该组织的主要细胞类型及其转录组特征 | 未明确说明局限性 | 理解精囊的细胞组成和功能，为精囊在生殖和后代发育中的作用提供资源 | 小鼠精囊组织 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA-seq | 不适用 | 基因表达数据 | 23只不同年龄的小鼠，暴露于多种饮食挑战 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 313 | 2026-04-29 |
Single-Cell Transcriptome Reveals the Cellular Response to PEG-Induced Stress in Wheat Leaves
2025-May-07, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c12749
PMID:40287963
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示小麦叶片在PEG诱导干旱胁迫下的细胞应答机制 | 首次在单细胞水平系统分析干旱不敏感与敏感小麦幼苗在PEG诱导胁迫下的细胞异质性反应，并识别出多个细胞类型特异基因及主调控转录因子 | 仅依赖于PEG模拟干旱条件，未在自然干旱环境中验证；此外，研究局限于小麦叶片组织，未涵盖根部等其他关键器官 | 研究小麦叶片在干旱胁迫下的细胞层面应答机制 | 干旱不敏感和敏感的小麦幼苗叶片 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种小麦品系（干旱不敏感和敏感）的幼苗，具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 314 | 2026-04-29 |
Resident synovial macrophages in synovial fluid: Implications for immunoregulation
2025-Feb, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2024.110422
PMID:39701169
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研究论文 | 研究滑液中常驻滑膜巨噬细胞在免疫调节中的作用及其与滑膜屏障完整性的关系 | 首次在人类滑液中发现常驻滑膜巨噬细胞，并建立新的外植体模型，揭示其在炎性关节炎中上调促纤维化和促破骨信号通路 | 未提及具体局限性 | 探究滑液中常驻滑膜巨噬细胞与滑膜屏障完整性的关联及其在关节炎免疫病理中的作用 | 人类滑液中的常驻滑膜巨噬细胞 | 数字病理学 | 关节炎 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 315 | 2026-04-28 |
Construction of an early diagnostic model for pulmonary hypertension based on aging-related signature genes and identification of potential therapeutic targets
2025-Dec-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28921-7
PMID:41461777
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研究论文 | 基于衰老相关特征基因构建肺动脉高压早期诊断模型并识别潜在治疗靶点 | 首次基于衰老相关基因通过LASSO回归、随机森林和支持向量机三种机器学习方法筛选特征基因，构建高精度诊断列线图，并识别TUL-XXI039作为多靶点潜在治疗化合物 | 研究基于公开数据集和体外模型，需要在更大规模临床样本和体内模型中进行验证 | 开发肺动脉高压的早期诊断生物标志物和基于衰老的靶向治疗策略 | 肺动脉高压患者转录组数据及肺动脉平滑肌细胞体外缺氧模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 转录组分析、单细胞RNA测序、qPCR、分子对接 | LASSO回归、随机森林、支持向量机、列线图 | 基因表达数据 | 多个公开数据集，包括训练队列和独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 316 | 2026-04-28 |
Exploring the expression and prognostic roles of LAD1 in lung adenocarcinoma
2025-Dec-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-33277-z
PMID:41423496
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研究论文 | 探索LAD1在肺腺癌中的表达和预后作用 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据全面分析LAD1在肺腺癌中的表达模式和预后价值，并通过实验验证LAD1敲低对细胞迁移和侵袭的影响 | 样本量有限，缺乏LAD1在肺腺癌中作用机制的深入分子生物学验证 | 鉴定肺腺癌的新型生物标志物并理解其潜在机制 | 肺腺癌患者肿瘤组织、相邻正常组织以及A549细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫组化染色、siRNA敲低实验 | 列线图模型 | 单细胞基因表达数据、批量基因表达数据、临床病理数据 | 10名肺腺癌患者（scRNA-seq），36名肺腺癌患者（免疫组化） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 317 | 2026-04-28 |
A novel zinc finger protein gene signature for prognostic prediction, tumor microenvironment characterization, and therapeutic response in uterine corpus endometrial carcinoma
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28415-6
PMID:41309884
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研究论文 | 利用锌指蛋白基因构建风险评分模型，用于子宫内膜癌的预后预测、肿瘤微环境表征及治疗反应评估 | 首次系统利用锌指蛋白基因确定子宫内膜癌患者的预后结局，并建立风险评分模型 | 基于公开数据库分析，缺乏独立外部验证队列及前瞻性临床验证 | 开发基于锌指蛋白基因的预后预测模型，评估其在子宫内膜癌中的临床应用价值 | 子宫内膜癌患者 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | 转录组测序、单细胞RNA测序、数据非依赖采集定量蛋白质组学分析 | LASSO回归、Cox比例风险回归模型 | 转录组数据、单细胞测序数据、临床数据 | 未明确说明具体样本数量（来自TCGA和GEO数据库的子宫内膜癌样本） | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 318 | 2026-04-28 |
Lactylation-related gene signatures define immune heterogeneity and provide diagnostic biomarkers for periodontitis
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-30213-z
PMID:41310117
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研究论文 | 通过系统分析牙周炎患者与健康对照的基因表达数据集和单细胞RNA测序数据，鉴定乳酸化相关基因特征，揭示免疫异质性并建立诊断标志物 | 首次系统性地将蛋白质乳酸化修饰与牙周炎的免疫微环境联系起来，通过多级整合分析（包括批量基因表达、单细胞RNA测序和机器学习）识别核心诊断标志物EAF1、NEFL和VIM，并揭示乳酸化相关基因在免疫重塑中的作用 | 数据来源于公开数据集，可能受限于样本大小和异质性；需要更大规模的临床验证来确认诊断标志物的普适性；乳酸化修饰的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究乳酸化相关基因在牙周炎免疫异质性中的作用及其作为诊断标志物的潜力 | 牙周炎患者与健康对照者的牙龈组织和外周血单核细胞 | 机器学习 | 牙周炎 | 基因表达微阵列、单细胞RNA测序、免疫组织化学 | LASSO回归、随机森林、极限梯度提升 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | GSE10334和GSE16134两个基因表达数据集，以及来自牙周炎患者和健康对照的外周血单核细胞单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 319 | 2026-04-28 |
Cross-species identification of conserved cell-type specific mechanisms during early placenta development in ruminants
2025-Nov-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-29895-2
PMID:41298965
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研究论文 | 整合绵羊和牛早期胎盘发育的单细胞RNA测序数据，跨物种鉴定保守的细胞类型特异性机制 | 首次通过跨物种单细胞转录组分析，揭示反刍动物早期胎盘中上皮-间充质转化作为保守关键过程，并发现牛特有的两种滋养层细胞亚群 | 仅依赖已发表的scRNA-seq数据，可能缺少动态时间点或空间信息；未对EMT进行功能验证实验 | 阐明反刍动物早期胎盘发育中保守的细胞类型特异性机制 | 绵羊和牛的早期胎盘组织 | 数字病理学 | 妊娠失败 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 整合绵羊和牛的scRNA-seq数据，具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 320 | 2026-04-28 |
Single-cell RNA sequencing revealed the association between proximal tubular epithelial cells and renal interstitial cells in chronic kidney disease progression
2025-Nov-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28988-2
PMID:41286490
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示近端肾小管上皮细胞与肾间质细胞在慢性肾病进展中的关联 | 首次鉴定出位于S1节段的受损近端肾小管上皮细胞亚群PT_5，并阐明其通过多种配体-受体对与巨噬细胞、成纤维细胞及免疫细胞协同作用，驱动慢性肾病进展的新机制 | 尚需进一步验证PT_5在人体组织中的存在及其与特定间质细胞协调促进疾病进展的分子机制 | 研究受损近端肾小管上皮细胞在慢性肾病发生中的特征及其与间质细胞的协同机制 | 通过腺嘌呤饮食诱导的慢性肾病小鼠模型 | 机器学习 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 共使用0.2%腺嘌呤饮食喂养2周、4周和8周的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |