单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
301	2025-07-11	STING agonists drive recruitment and intrinsic type I interferon responses in monocytic lineage cells for optimal anti-tumor immunity 2025-Jul-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950) DOI:10.1093/jimmun/vkaf131 PMID:40633091	研究论文	本研究探讨了单核细胞谱系细胞在STING激动剂诱导的IFN-I信号传导中的作用及其在抗肿瘤免疫中的关键功能	揭示了STING激动剂通过CCR5依赖性迁移机制招募单核细胞谱系细胞，并促进其获得炎症性单核细胞表型，进而增强CD8+ T细胞抗肿瘤反应	研究主要基于小鼠模型，临床转化效果尚需进一步验证	阐明单核细胞谱系细胞在STING激动剂诱导的抗肿瘤免疫应答中的作用机制	单核细胞谱系细胞(MCs)及其与CD8+ T细胞或自然杀伤细胞的相互作用	肿瘤免疫学	黑色素瘤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	CCR2缺陷小鼠模型、Lyz2-Cre-IFNAR1fl/fl小鼠模型	基因表达数据	MC38和B16F10肿瘤小鼠模型
302	2025-07-11	Guard cells on the adaxial and abaxial leaf surfaces use different compositions of potassium ion channels to drive light-induced stomatal opening 2025-Jul-09, Nature plants IF:15.8Q1 DOI:10.1038/s41477-025-02026-5 PMID:40634560	研究论文	本研究探讨了草本植物叶片上下表面气孔对光响应差异的分子机制	揭示了上下表皮保卫细胞利用不同钾离子通道驱动光诱导气孔开放的分子机制	研究仅使用了拟南芥和烟草两种模式植物，结果在其他植物中的普适性有待验证	探究植物叶片上下表面气孔对光响应差异的分子基础	拟南芥和烟草的保卫细胞	植物分子生物学	NA	单细胞RNA测序、转录组测序、OnGuard计算机模拟	NA	基因表达数据	两种模式植物(拟南芥和烟草)的保卫细胞
303	2025-07-11	Comprehensive molecular characterization of craniopharyngiomas using whole transcriptome and spatial transcriptomics approaches 2025-Jul-09, Brain tumor pathology IF:2.7Q2 DOI:10.1007/s10014-025-00509-z PMID:40634824	研究论文	本研究通过全转录组和空间转录组学方法对颅咽管瘤进行了全面的分子特征分析	首次结合全转录组测序和高分辨率空间转录组学技术，全面分析颅咽管瘤的分子差异	样本量相对较小（24个肿瘤样本），且健康垂体数据来自公共数据库	阐明颅咽管瘤两种亚型的分子差异，为诊断和治疗提供依据	颅咽管瘤（包括ACP和PCP亚型）和健康垂体组织	分子病理学	颅咽管瘤	全转录组测序、空间转录组学、RNA测序、Sanger测序	CTAT突变分析流程	转录组数据、空间基因表达数据	24个肿瘤样本（来自患者）和GTEx数据库中的健康垂体数据
304	2025-07-11	UBE2D1 as a key biomarker in systemic juvenile idiopathic arthritis: a new perspective on diagnosis and disease activity assessment 2025-Jul-09, Arthritis research & therapy IF:4.4Q1 DOI:10.1186/s13075-025-03606-8 PMID:40635084	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序，发现UBE2D1作为系统性幼年特发性关节炎(sJIA)的潜在生物标志物，并探讨其在疾病活动性评估中的作用	首次将UBE2D1与sJIA的疾病活动性水平联系起来，并揭示其通过激活NLRs通路促进疾病进展的机制	研究结果需要进一步验证，且样本来自中国人群，可能限制结果的普适性	寻找sJIA的非侵入性生物标志物以提高早期诊断效率	系统性幼年特发性关节炎(sJIA)患者的外周血单个核细胞(PBMCs)	数字病理学	幼年特发性关节炎	scRNA-seq, Bulk RNA-seq, Western blot, Co-IP	NA	RNA测序数据, 蛋白质数据	中国sJIA队列的PBMCs样本
305	2025-07-11	KAT6A Promotes Macrophage Inflammation and Periodontitis 2025-Jul-09, Journal of clinical periodontology IF:5.8Q1 DOI:10.1111/jcpe.14203 PMID:40635126	研究论文	本研究探讨了KAT6A在牙周炎中通过调控巨噬细胞炎症反应的作用机制	首次揭示了KAT6A通过调节巨噬细胞表型影响牙周炎进展的分子机制，并发现其通过H3K27乙酰化调控炎症基因表达	研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证	探究KAT6A在牙周炎发病机制中的作用	巨噬细胞和牙周炎小鼠模型	表观遗传学与免疫学	牙周炎	单细胞RNA测序、qRT-PCR、RNA-seq、流式细胞术、Cut&tag技术	基因敲除小鼠模型	基因表达数据、表观遗传数据、细胞表型数据	未明确说明样本量，使用基因敲除小鼠和野生型对照小鼠
306	2025-07-11	Single-cell transcriptome analysis reveals the malignant characteristics of tumour cells and the immunosuppressive landscape in HER2-positive inflammatory breast cancer 2025-Jul-08, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1 DOI:10.1186/s13046-025-03454-z PMID:40624675	研究论文	通过单细胞转录组技术分析HER2阳性炎症性乳腺癌的肿瘤微环境，揭示其恶性特征和免疫抑制景观	首次使用单细胞转录组技术全面比较HER2阳性炎症性乳腺癌与非炎症性乳腺癌的肿瘤微环境，发现PTN分子在肿瘤细胞中的高表达与其高侵袭性和免疫抑制微环境的强烈相关性	样本量较小（仅3例HER2阳性炎症性乳腺癌患者），且部分数据来自公共数据库	阐明HER2阳性炎症性乳腺癌肿瘤微环境的细胞组成和分子特征，为诊断和治疗提供新方向	HER2阳性炎症性乳腺癌患者的肿瘤组织	数字病理学	乳腺癌	单细胞转录组测序（scRNA-seq）	NA	单细胞转录组数据	3例HER2阳性炎症性乳腺癌患者的15,832个细胞
307	2025-07-11	Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data to Investigate Tumor Cell Heterogeneity in Uroepithelial Bladder Cancer and Predict Immunotherapy Response 2025-Jul-08, Current cancer drug targets IF:2.3Q3 DOI:10.2174/0115680096377593250626133719 PMID:40635219	研究论文	通过分析膀胱尿路上皮癌的单细胞RNA测序数据，研究肿瘤细胞异质性并预测免疫治疗反应	识别了与血管生成和肿瘤转移相关的缺氧肿瘤亚群，并基于Ste.genes构建了预测免疫检查点抑制剂(ICI)反应的机器学习模型	研究仅基于单细胞RNA测序数据，未进行实验验证	探究膀胱尿路上皮癌中肿瘤干细胞与免疫治疗耐药性的关系	膀胱尿路上皮癌(UBC)的单细胞RNA测序数据	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	机器学习模型	RNA测序数据	NA
308	2025-07-11	Telomeric repeat-containing RNA increases in aged human cells 2025-Jul-08, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkaf597 PMID:40637232	研究论文	本研究通过TERRA-capture RNA-seq和Oxford Nanopore直接RNA测序技术，解析了人类T2T-CHM13参考基因组中TERRA的转录区域，并发现TERRA在衰老的人类细胞中增加	开发了生物信息学工具TERRA-QUANT用于量化TERRA，并首次将TERRA与人类衰老及阿尔茨海默病早期阶段联系起来	未明确说明样本的具体数量及实验设计的详细限制	探究TERRA在人类衰老和疾病中的作用	人类血液、大脑和成纤维细胞中的TERRA	基因组学	阿尔茨海默病	TERRA-capture RNA-seq, Oxford Nanopore直接RNA测序, 逆转录定量聚合酶链反应, 单细胞RNA-seq	NA	RNA-seq数据	未明确说明具体数量，涉及血液、大脑和成纤维细胞等多种样本
309	2025-07-11	Pancreatic alpha and beta cell fate choice is directed by apical-basal polarity dynamics 2025-Jul-07, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2025.02.008 PMID:40056911	research paper	该研究揭示了顶端-基底极性作为调节多潜能胰腺Neurogenin3内分泌祖细胞分化为β或α细胞命运的主要调控因子	首次发现顶端-基底极性状态决定内分泌祖细胞向α或β细胞谱系分化的命运选择	研究主要基于人类内分泌祖细胞，尚未在完整器官或体内环境中验证	探索细胞外信号如何调控动态变化微环境中多潜能祖细胞的分化机制	人类胰腺Neurogenin3内分泌祖细胞(EPs)	developmental biology	diabetes	single-cell RNA sequencing	NA	gene expression data	NA
310	2025-07-11	Genomic evolution reshapes cell-type diversification in the amniote brain 2025-Jul-07, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.014 PMID:40367951	研究论文	该研究通过构建爬行动物、鸟类和哺乳动物的单细胞图谱，揭示了羊膜动物大脑细胞类型在进化过程中的保守性和多样性	首次在单细胞分辨率下比较了多种羊膜动物大脑细胞类型的基因表达模式，并发现了鸟类特有的Purkinje细胞亚型及其相关基因通路	研究仅关注了端脑和小脑的部分区域，未涵盖整个大脑	探索羊膜动物大脑复杂性和认知能力进化的遗传机制	乌龟、斑胸草雀、鸽子、小鼠和猕猴的端脑与小脑细胞	基因组学	NA	单细胞空间转录组学	NA	单细胞基因表达数据	超过130万个细胞，来自5个不同物种
311	2025-07-11	Molecular Mechanisms of Perivascular Macrophages in Alzheimer's Disease: Insights from Single-Cell Sequencing and Mendelian Randomization 2025-Jul-07, Cellular and molecular neurobiology IF:3.6Q2 DOI:10.1007/s10571-025-01590-w PMID:40622473	研究论文	本研究通过单细胞测序和孟德尔随机化分析探讨了血管周围巨噬细胞在阿尔茨海默病中的分子机制	结合单细胞测序与孟德尔随机化分析，识别出四个与AD风险显著相关的关键基因，并揭示了PVMs在免疫调节和代谢通路中的作用	研究主要基于已有数据集分析，需要进一步实验验证	探索血管周围巨噬细胞在阿尔茨海默病发病机制中的分子作用	血管周围巨噬细胞(PVMs)及其相关基因	生物医学	阿尔茨海默病	单细胞测序, 孟德尔随机化(MR)分析	NA	单细胞测序数据, eQTL数据	基于GSE264648和eQTLGen数据集的分析
312	2025-07-11	Single-nucleus rna sequencing identifies universal camk1d upregulation and dysregulated c-ltmr subtypes as key drivers of paclitaxel-induced neuropathy 2025-Jul-07, Cell biology and toxicology IF:5.3Q1 DOI:10.1007/s10565-025-10065-z PMID:40622640	研究论文	通过单核RNA测序技术研究紫杉醇诱导的神经病变疼痛的分子机制	首次使用单核RNA测序技术揭示紫杉醇诱导神经病变疼痛的细胞类型特异性改变，特别是C_LTMR亚型的转录组变化	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证	探索紫杉醇诱导神经病变疼痛的分子机制	小鼠背根神经节(DRG)细胞	神经科学	神经病变疼痛	单核RNA测序(snRNA-seq)	NA	RNA测序数据	紫杉醇处理的小鼠背根神经节细胞
313	2025-07-11	Single-cell transcriptomic analysis identifies systemic immunosuppressive myeloid cells and local monocytes/macrophages as key regulators in polytrauma-induced immune dysregulation 2025-Jul-07, Bone research IF:14.3Q1 DOI:10.1038/s41413-025-00444-x PMID:40623986	研究论文	通过单细胞转录组分析，识别了系统性免疫抑制性髓系细胞和局部单核细胞/巨噬细胞作为多发伤诱导免疫失调的关键调节因子	首次同时研究系统性及局部免疫细胞，发现TIM细胞群体和Spp1单核细胞/巨噬细胞在免疫失调中的作用	研究基于大鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	探究多发伤诱导的免疫失调及其对骨折愈合的影响	大鼠多发伤模型中的血液、骨髓和局部缺损软组织	免疫学	多发伤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	转录组数据	NA
314	2025-07-11	Single-cell transcriptomic profiling of immune landscape in triple-negative breast cancer during neoadjuvant chemotherapy 2025-Jul-07, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1 DOI:10.1038/s41540-025-00549-3 PMID:40624003	研究论文	通过单细胞转录组测序技术研究三阴性乳腺癌在新辅助化疗期间的免疫景观	首次发现并计算了S100АMHC单核细胞群体中的髓系来源抑制细胞（MDSC）特征评分，并验证了其在非响应患者中的升高	样本量有限，且仅关注了新辅助化疗的初始阶段	探究三阴性乳腺癌患者在新辅助化疗期间的免疫系统功能状态及其对化疗效果的影响	三阴性乳腺癌患者	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	包括响应和非响应新辅助化疗的三阴性乳腺癌患者
315	2025-07-11	Integrated bioinformatics analysis identifies CHAD association with osteoporosis and in vitro chondrogenic effects of Wogonin 2025-Jul-07, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-05861-w PMID:40624035	研究论文	本研究通过整合生物信息学方法识别与骨质疏松症相关的基因，并探索中药化合物对软骨生成的体外影响	首次将CHAD基因与骨质疏松症关联，并发现汉黄芩素对软骨生成的促进作用	仅进行了体外实验，尚未进行动物或临床验证	探索骨质疏松症的新型治疗靶点和中药替代疗法	骨质疏松症相关基因和中药化合物	生物信息学	骨质疏松症	RNA测序、分子对接、qRT-PCR	ATDC5细胞模型	基因表达数据	未明确说明样本数量
316	2025-07-11	Neurogenomic and behavioral principles shape freezing dynamics and synergistic performance in Drosophila melanogaster 2025-Jul-07, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-61313-z PMID:40624091	研究论文	本研究通过大规模行为实验和GWAS分析，揭示了果蝇在面对威胁时集体行为的神经和遗传基础	发现了影响视觉神经元发育和行为的基因位点Ptp99A和kirre，并验证了遗传多样性对集体行为的促进作用	研究仅针对果蝇这一模式生物，结果在其他物种中的普适性尚待验证	探究集体行为的神经和遗传机制	黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)	神经科学	NA	GWAS、单细胞转录组学、功能实验、基于代理的模拟	NA	行为数据、基因表达数据	大规模果蝇群体
317	2025-07-11	Novel single-cell preservation and RNA sequencing technology unlocks field studies for Plasmodium natural infections 2025-Jul-07, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-08765-x PMID:40624152	研究论文	本文介绍了一种新型单细胞保存和RNA测序技术，用于疟原虫自然感染现场研究	开发了适用于低资源环境的单细胞RNA保存和测序技术，首次在自然感染疟原虫的现场研究中应用单细胞RNA测序	目前仅在P. knowlesi疟原虫中进行了验证，尚未在其他疟原虫物种或更广泛的现场环境中测试	开发适用于疟原虫自然感染现场研究的单细胞RNA测序技术	疟原虫(P. knowlesi)单细胞	基因组学	疟疾	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	单细胞转录组数据	6个样本中的22,345个P. knowlesi单细胞转录组
318	2025-07-09	Author Correction: Spatial transcriptomics reveals regionally altered gene expression that drives retinal degeneration 2025-Jul-07, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-025-08451-8 PMID:40624286	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
319	2025-07-11	Integrated analysis of polytranscriptomics reveals TNFSF ligand genes in pancreatic cancer prognosis and immune regulation 2025-Jul-07, BMC immunology IF:2.9Q3 DOI:10.1186/s12865-025-00733-4 PMID:40624624	研究论文	本研究通过整合分析多转录组数据，揭示了TNFSF配体基因在胰腺癌预后和免疫调节中的作用	首次基于TNFSF配体表达谱对胰腺癌进行分子分型，并发现TNFSF4在B细胞中的高表达与良好预后及免疫治疗反应相关	研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证TNFSF4的具体作用机制	探究TNF配体家族成员在胰腺癌中的表达模式及预后意义	胰腺癌(PC)患者样本	生物信息学	胰腺癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序(bulk RNA-seq)、qRT-PCR	非负矩阵分解(NMF)	基因表达数据	GSE212966和TCGA-PAAD数据集中的样本
320	2025-07-11	Current insight into HIV-1 persistence from single-cell transcriptome profiling in acutely treated cohorts of infection 2025-Jul-07, Current opinion in HIV and AIDS IF:4.5Q1 DOI:10.1097/COH.0000000000000962 PMID:40638066	综述	本文综述了利用单细胞转录组学技术研究急性HIV-1感染治疗队列中病毒持久性的最新进展	利用单细胞RNA测序技术揭示HIV-1感染急性期治疗队列中的免疫反应变化、新型限制因子和潜伏因子，以及病毒储存细胞的标志物	NA	研究HIV-1病毒在宿主中的持久性机制	HIV-1感染者的单细胞	基因组学	HIV感染	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	数十万个单细胞