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当前共找到 10542 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-06-07 |
Decoding inflammatory regulation in ovarian cancer at single-cell resolution
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1719669
PMID:41601649
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综述 | 本文综述了单细胞技术揭示卵巢癌微环境中炎症调控机制的研究进展 | 聚焦卵巢癌的“双微环境”特性，整合单细胞组学解析炎症驱动的免疫抑制、基质重编程和耐药机制 | 单细胞技术的高成本和数据整合复杂性限制了临床转化，且缺乏纵向动态研究 | 阐释单细胞技术解析卵巢癌微环境中炎症调控的机制及临床转化挑战 | 卵巢癌微环境中的免疫细胞、基质细胞及炎症信号通路 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学FFPE样本 |
| 302 | 2026-06-07 |
TRIM29 drives ulcerative colitis by disrupting lipid metabolism via lysosomal dysfunction: a multi-omics and experimental study
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1728932
PMID:41601651
|
research paper | 通过多组学和实验研究揭示TRIM29通过溶酶体功能障碍扰乱脂质代谢驱动溃疡性结肠炎 | 首次发现TRIM29通过破坏溶酶体功能并重编程脂质代谢来驱动溃疡性结肠炎，并阐明TRIM29-溶酶体-脂质代谢轴 | 依赖DSS诱导的小鼠模型和体外细胞实验，结果需在人类样本中进一步验证 | 探究溃疡性结肠炎的潜在发病机制，特别是脂质代谢和溶酶体功能障碍的作用 | 溃疡性结肠炎组织样本、DSS诱导的结肠炎小鼠模型以及结肠上皮细胞 | machine learning | ulcerative colitis | RNA-seq, single-cell RNA-seq | LASSO, SVM, XGBoost | transcriptomic data, single-cell RNA-seq data | 未明确说明样本量，涉及公开转录组数据和单细胞RNA-seq数据 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 303 | 2026-06-07 |
Multi-omics integration identifies NK cell dysregulation and a five-gene diagnostic signature in major depressive disorder
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1700629
PMID:41601671
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研究论文 | 多组学整合分析揭示重度抑郁症患者中自然杀伤细胞功能失调及五个关键诊断基因 | 首次通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，结合机器学习方法，识别出NK细胞在MDD中的核心功能失调机制，并构建了基于五个关键基因的诊断模型 | 单细胞数据样本量较小（仅3例患者和3例对照），可能限制一般化；研究主要基于外周血样本，未涉及脑组织验证 | 揭示重度抑郁症中细胞类型特异性转录失调和免疫功能障碍的分子机制，识别诊断标志物和治疗靶点 | 重度抑郁症患者和健康对照的外周血单核细胞 | 机器学习 | 抑郁症 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | 机器学习（具体算法未明确指定） | 基因表达数据 | 3例MDD患者和3例健康对照的PBMCs（scRNA-seq）；批量RNA-seq数据来自GSE39653数据集（具体样本数未说明） | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 304 | 2026-06-07 |
A multi-omics analysis of pancreatitis: bridging familial genetics and disease progression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1707821
PMID:41601670
|
研究论文 | 通过多组学分析将家族性胰腺炎的遗传学与疾病进展联系起来 | 整合了罕见家族性慢性胰腺炎和外显子组测序与急性胰腺炎公共数据集的单细胞RNA测序及批量转录组学，发现共有分子和细胞病理学，并构建了基于人工智能的预测模型 | 未明确提及局限性，但可能包括样本量有限（仅2例儿科CP患者）以及依赖公共数据集 | 阐明慢性胰腺炎和急性胰腺炎的遗传和免疫细胞基础，并识别潜在生物标志物和治疗靶点 | 两名儿科慢性胰腺炎患者及其家庭成员，以及一个包含119例急性胰腺炎患者的公共队列 | 机器学习 | 胰腺炎 | 全外显子组测序, 单细胞RNA测序, 批量转录组学, 加权基因共表达网络分析 | 人工智能驱动模型 | 基因序列, 转录组数据 | 2名儿科CP患者及其家庭成员进行WES，119例AP患者进行scRNA-seq和批量转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 305 | 2026-06-07 |
Single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization identifies mitochondrial targets in immune cells for Major Depressive Disorder
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1700604
PMID:41601681
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研究论文 | 通过单细胞转录组孟德尔随机化分析，识别免疫细胞中线粒体在重度抑郁症中的靶点 | 首次整合多组学数据与机器学习，结合细胞类型特异性孟德尔随机化方法，鉴定出五种线粒体相关基因（HK2、NDUFS4、NEU1、SOD1和UCP2）在不同免疫细胞中的表达对重度抑郁症风险具有因果效应 | 未详细说明样本量大小、平台技术等具体实验细节，且验证仅在CUMS大鼠模型中进行，缺乏人类队列的直接验证 | 识别通过特定免疫细胞表达对重度抑郁症风险有因果影响的线粒体相关基因 | 重度抑郁症患者及CUMS大鼠模型 | 机器学习 | 重度抑郁症 | 孟德尔随机化、ssGSEA、CIBERSORT | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | NA |
| 306 | 2026-06-07 |
Single-cell transcriptional profiling revealed the protective effects of Buddleoside in sepsis-associated acute liver injury
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1713180
PMID:41601688
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析，揭示木犀草苷对脓毒症相关急性肝损伤的保护作用及其免疫调节机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术解析木犀草苷在脓毒症相关肝损伤中对多种肝细胞亚群的免疫调节作用，包括抑制内皮细胞激活、调控中性粒细胞和巨噬细胞的炎症表型 | 研究主要在动物模型中进行，尚未在人类样本中验证；木犀草苷的具体分子靶点尚未完全阐明 | 评估木犀草苷对脓毒症相关急性肝损伤的保护作用并探索其免疫调节机制 | 脓毒症相关急性肝损伤小鼠模型 | 数字病理学 | 脓毒症相关急性肝损伤 | scRNA-seq | NA | scRNA-seq数据 | 小鼠肝脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 307 | 2026-06-07 |
LOXL2 labels inflammation-associated myofibroblasts predicting kidney allograft dysfunction and fibrosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1671117
PMID:41607781
|
研究论文 | 该文章研究了LOXL2作为肾移植后移植物纤维化和功能障碍的生物标志物，通过单细胞测序和成像发现LOXL2标记的间质性肌成纤维细胞在纤维化进程中扮演关键角色 | 首次发现LOXL2标记的SMA阴性、CD68阳性的间质性肌成纤维细胞亚群，并证明其可作为早期纤维化的生物标志物 | 文章未提及具体局限性，但回顾性分析中样本量有限（118例活检），且细胞数量的动态变化及长期预测价值需进一步验证 | 探索LOXL2作为肾移植后移植物纤维化和功能障碍的预测生物标志物 | 肾移植患者的活检组织，包括移植肾和天然肾中LOXL2+肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 肾移植后纤维化与功能障碍 | 单细胞测序，成像技术 | NA | 单细胞测序数据，图像数据 | 118例肾移植活检样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞测序平台 |
| 308 | 2026-06-07 |
A ligand-centered framework for γδ T cell activation in colorectal cancer revealed by single-cell and transformer-based perturbation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1715827
PMID:41607803
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA-seq数据集和基于Transformer的扰动分析，构建了结直肠癌中γδ T细胞活化的配体中心框架 | 首次将Transformer模型用于配体推断和扰动分析，系统解析结直肠癌中γδ T细胞的活化机制 | 研究主要依赖计算预测，缺乏体外或体内实验验证 | 解析结直肠癌中γδ T细胞的活化机制 | 结直肠癌浸润γδ T细胞 | 机器学习, 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, Transformer模型, 扰动分析 | Transformer | 基因表达数据 | 整合多个单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 309 | 2026-06-06 |
Revealing the Best Strategies for Rare Cell Type Detection in Multi-Sample Single-Cell Datasets
2025-Dec-29, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17010031
PMID:41595450
|
研究论文 | 系统评估多样本单细胞数据中稀有细胞类型检测的最佳分析策略 | 首次在多样本场景下系统比较不同检测策略（单样本、合并样本、批次校正合并样本）和多种工具的性能，并基于批次校正的合并检测策略取得最优效果 | 研究仅提供策略层面的比较，未深入探讨各方法在不同技术平台或更大规模数据集上的适用性 | 评估多样本单细胞RNA测序数据中稀有细胞检测方法的性能，确定最有效的分析策略 | 五款稀有细胞检测工具（CellSIUS、GapClust、GiniClust、scCAD、SCISSORS）以及基于scGPT和Isolation Forest的稀有细胞检测方法 | 自然语言处理、机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Isolation Forest, scGPT | 基因表达数据 | 多个公开可用的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 310 | 2026-06-06 |
scSelector: A Flexible Single-Cell Data Analysis Assistant for Biomedical Researchers
2025-Dec-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17010002
PMID:41595423
|
research paper | 开发了一个交互式软件工具包scSelector，允许生物医学研究者基于专业知识灵活选择和分析单细胞数据中的细胞群 | 整合了套索选择工具与大型语言模型（DeepSeek/Gemini）辅助的细胞类型预测，突破了传统聚类依赖方法的刚性限制 | 可能依赖API稳定性，且不同数据集的生物学知识指导可能需要人工调整 | 为生物医学研究者提供灵活的单细胞数据分析工具，提高细胞亚群识别和功能异质性解析的精度 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群，包括稀有细胞亚群和标准质控中丢弃的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 大型语言模型 | 大型语言模型 | 单细胞表达数据 | 多个公共数据集，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 311 | 2026-06-06 |
Emerging technologies and current challenges in intratumoral microbiota research
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1685862
PMID:41552720
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综述 | 系统总结瘤内微生物研究中的新兴技术与当前挑战，涵盖检测方法、功能解析及临床转化 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学、类器官共培养及人工智能等多技术手段，提出从描述性分析向机制研究和临床转化跨越的路径 | 瘤内微生物低生物量导致检测易受环境污染，分析流程标准化不足，跨研究比较困难 | 阐述瘤内微生物研究的技术进展和挑战，推动精准肿瘤学中微生物导向策略的发展 | 肿瘤微环境中的瘤内微生物 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 优化厌氧培养, 基因组解析分析, 酶水平分析, 类器官共培养 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 312 | 2026-06-06 |
Integration of single cell and bulk transcriptomic analyses identifies FAM189A2 as a key prognostic gene in lung cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1701806
PMID:41567189
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组分析，识别出FAM189A2作为肺癌关键预后基因 | 首次将单细胞RNA测序与TCGA批量转录组数据整合，构建八基因LASSO-Cox风险模型，并发现FAM189A2作为推定肿瘤抑制因子和潜在生物标志物 | 研究基于回顾性公共数据集，FAM189A2的功能仅在体外细胞系中验证，缺乏体内模型和前瞻性临床验证 | 阐明恶性细胞状态与患者预后和治疗脆弱性的关联，开发可行的预后风险分层模型 | 13例原发性肺肿瘤及配对正常肺组织的单细胞RNA测序数据，以及TCGA-LUAD和两个外部验证队列 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | CNN, LSTM, GAN | 图像, 文本, 视频 | 13例肺肿瘤和配对正常组织（48149个细胞）以及三个批量转录组队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 313 | 2026-06-06 |
A review of omics studies in sarcopenia: from molecular mechanisms to hepatic-gut-muscle interactions in chronic liver disease comorbidity
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1710582
PMID:41568005
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综述 | 综述了肌少症的多组学研究，从分子机制到慢性肝病共病中的肝-肠-肌肉相互作用 | 提出“共性-特异性”双层框架，在共性层面识别出蛋白质稳态失衡、线粒体功能障碍、慢性炎症和肠-肌轴失调四大核心病理支柱，在特异性层面提出“弱信号协同积累”假说解释慢性肝病中的肌少症机制 | 目前组学研究大多停留在相关性层面，向临床转化面临挑战 | 系统解析肌少症及其与慢性肝病共病的分子机制，为精准诊疗提供理论基础和发展路线图 | 肌少症及慢性肝病相关肌少症的多组学研究 | 机器学习 | 肌少症，慢性肝病 | 单细胞多组学，空间转录组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 314 | 2026-06-06 |
Elucidating the role of SHROOM4 in non-small cell lung cancer: expression patterns, clinical correlations, and potential functions
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1723844
PMID:41573567
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研究论文 | 通过生物信息学分析探索SHROOM4在非小细胞肺癌中的表达模式、临床相关性及潜在功能 | 首次系统研究SHROOM4在非小细胞肺癌中的表达特征及其与肿瘤微环境的关系，发现其与Wnt/Beta-Catenin通路和ANGPTL7/SFTPC的关联 | 基于公共数据库分析，需进一步实验验证SHROOM4在肺癌进展中的具体机制及临床实用性 | 阐明SHROOM4在非小细胞肺癌中的表达模式、临床意义及潜在功能 | SHROOM4基因在非小细胞肺癌（尤其是肺鳞癌）中的表达及其相关机制 | 生物信息学 | 肺癌 | 生物信息学分析、RNA-seq、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 肺鳞癌组织及对应正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 315 | 2026-06-06 |
Cuproptosis-driven reprogramming of fibroblast communication by GK is associated with the immune microenvironment in diabetic foot ulcers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1687806
PMID:41583446
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示铜死亡相关基因GK在糖尿病足溃疡中通过成纤维细胞重编程免疫微环境的作用 | 首次将铜死亡机制与糖尿病足溃疡的成纤维细胞-免疫细胞通讯联系起来，并鉴定GK为诊断生物标志物 | 功能验证仅基于动物实验和计算预测，缺乏直接的细胞功能实验和人类样本验证 | 探究铜死亡在糖尿病足溃疡成纤维细胞与免疫细胞相互作用中的角色及潜在生物标志物 | 糖尿病足溃疡患者和健康皮肤组织的单细胞RNA测序数据，以及大鼠模型 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | scRNA-seq | 机器学习（LASSO, SVM-RFE, 随机森林） | 基因表达数据 | 33,095个细胞（质控后25,198个），9只SD大鼠（每组3只） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 316 | 2026-06-06 |
PANoptosis in urological diseases: molecular mechanisms, pathological roles, and emerging therapeutic opportunities
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1729348
PMID:41583472
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综述 | 本文综述了PANoptosis在泌尿系统疾病中的分子机制、病理作用及新兴治疗策略 | 首次系统阐述了PANoptosis在泌尿系统疾病中的双重作用，既促进组织损伤又驱动抗肿瘤免疫，并提出了多组学生物标志物筛选、纳米材料递送系统和联合疗法等创新治疗方向 | 未提及具体局限性 | 梳理PANoptosis在泌尿系统疾病中的分子机制和调控网络，探讨其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 泌尿系统疾病，包括急性/慢性肾损伤、前列腺癌、肾癌和睾丸病变 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序，10x Visium FFPE空间转录组学 |
| 317 | 2026-06-06 |
Single-cell transcriptomics reveals a novel mechanism of RDH16 regulating immune infiltration in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1689987
PMID:41601632
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示RDH16在肝细胞癌中调控免疫浸润的新机制 | 整合单细胞RNA测序与批量转录组数据集，全面表征HCC的肿瘤细胞异质性和免疫微环境特征，并首次揭示了RDH16作为免疫调节生物标志物，通过调控CD163⁺ M2巨噬细胞浸润影响肿瘤免疫微环境 | NA | 探索肝细胞癌中免疫调节的可操作生物标志物及机制，以改善患者预后 | 肝细胞癌肿瘤细胞和免疫浸润细胞 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 318 | 2026-06-06 |
Integrated multi-omic profiling reveals macrophage-driven prognostic signatures in clear cell renal cell carcinoma through machine learning optimization
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1612262
PMID:41601657
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序与机器学习方法，揭示了肾透明细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其驱动的预后特征 | 首次通过机器学习优化整合多组学数据，鉴定出五种转录上不同的巨噬细胞亚群，并构建了基于巨噬细胞的预后签名，特别是识别出PRDX1+LA-Mac作为主要病理亚型 | 未提及具体限制，但基于摘要可推测可能包括样本量有限（仅10个肿瘤）及验证队列数量不足 | 描绘肾透明细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性，识别预后巨噬细胞特征，并表征驱动疾病进展的免疫-代谢程序 | 肾透明细胞癌肿瘤组织中的巨噬细胞亚群及其相关免疫和代谢特征 | 机器学习 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | 随机生存森林 | 基因表达数据 | 10个肾透明细胞癌肿瘤样本（scRNA-seq）及TCGA和CPTAC独立队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 319 | 2026-06-06 |
Interleukin-36 upregulates type-I interferon responses in systemic lupus erythematosus by promoting the accumulation of self-nucleic acids
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1727524
PMID:41607774
|
研究论文 | 研究揭示白介素-36通过促进自我核酸积累上调系统性红斑狼疮中的I型干扰素反应 | 首次阐明IL-36通过下调RNA酶基因和诱导单核细胞凋亡，促进自我核酸积累，从而激活I型IFN通路的新机制 | 样本量较小（scRNA-seq 5个供体，qPCR 9个供体，流式6个供体），可能限制统计效力 | 探索IL-36在系统性红斑狼疮中过度激活I型IFN反应的分子机制 | 健康人和SLE患者的外周血单核细胞 | 机器学习和单细胞转录组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、实时定量PCR、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据、流式数据 | scRNA-seq: 5个健康供体；qPCR: 9个供体；流式: 6个供体；SLE scRNA-seq数据集: 33例患者和11例对照 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 320 | 2026-06-05 |
SLC12A7 serves as a prognostic and immunotherapeutic biomarker identified by multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1712579
PMID:41668766
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研究论文 | 通过多组学分析鉴定SLC12A7作为预后和免疫治疗生物标志物 | 首次系统揭示SLC12A7在多种癌症中的预后价值和免疫治疗潜力，尤其在肝细胞癌中通过体外实验验证其促癌功能 | 未明确说明具体局限性 | 评估SLC12A7在泛癌中的表达模式、预后意义及免疫相关性，并验证其在肝细胞癌中的致癌作用 | 多种癌症组织样本及肝细胞癌细胞系 | 机器学习和生物信息学 | 肝细胞癌，多种癌症 | 转录组测序，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | TCGA、GTEx、cBioPortal、TIMER 2.0和GEO数据库中的多种癌症样本 | NA | NA | NA | NA |