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当前共找到 10349 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2025-12-14 |
Targeting MCM6 Enhances Melphalan Chemosensitivity in Retinoblastoma by Modulating DNA Damage Response
2025-Dec-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.15.14
PMID:41334961
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研究论文 | 本研究探讨了DNA复制许可因子MCM6在视网膜母细胞瘤进展中的作用及其对美法仑化疗敏感性的影响 | 首次利用单细胞RNA测序揭示了MCM6在视网膜母细胞瘤中的表达模式，并证明靶向MCM6可增强美法仑的化疗敏感性 | 研究主要基于细胞系和动物模型，临床样本数量有限，需要进一步临床试验验证 | 探究MCM6在视网膜母细胞瘤中的作用机制及作为化疗增敏靶点的潜力 | 视网膜母细胞瘤细胞、患者肿瘤样本、小鼠异种移植模型 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者肿瘤样本（包括美法仑治疗失败标本）及细胞系模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 302 | 2025-12-14 |
Pericyte-myofibroblast transition: a novel mechanism in peritoneal fibrosis and the effect of Asiaticoside
2025-Dec-01, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.11.072
PMID:41338386
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研究论文 | 本研究揭示了周细胞-肌成纤维细胞转化（PMT）是腹膜纤维化的关键机制，并评估了天然三萜类化合物积雪草苷（ASI）通过抑制PDGFRβ信号通路治疗纤维化的潜力 | 首次在腹膜纤维化中明确了周细胞向肌成纤维细胞转化的关键作用，并发现积雪草苷可通过靶向PDGFRβ信号通路抑制该过程，为抗纤维化治疗提供了新视角 | 研究主要基于小鼠模型，其结论在人体中的适用性仍需进一步验证；蛋白质组学分析的下游机制有待更深入探索 | 阐明腹膜纤维化的细胞起源机制，并探索针对PDGFRβ信号通路的抗纤维化治疗策略 | 氯己定葡糖酸盐诱导的腹膜纤维化小鼠模型、小鼠腹膜微血管周细胞 | 数字病理学 | 腹膜纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 303 | 2025-12-14 |
The recombinant zoster vaccine induces trained immunity in monocytes through persistent downregulation of TGFβ
2025-Dec, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013759
PMID:41348857
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研究论文 | 本研究探讨了重组带状疱疹疫苗（RZV）在单核细胞中通过持续下调TGFβ诱导训练免疫的机制 | 首次揭示RZV通过基因组水平抑制TGFβ-1产生训练免疫，并证实其对同源（VZV-gE）和异源（HCMV、HSV）抗原的交叉保护作用 | 研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证；样本时间跨度较长但样本量未明确说明 | 探究高效能重组带状疱疹疫苗诱导训练免疫的分子机制 | 疫苗接种后的单核细胞、NK细胞和树突状细胞 | 免疫学 | 带状疱疹 | ATAC-seq、scRNA-seq、免疫蛋白质组学 | NA | 基因组可及性数据、单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、ATAC测序 | NA | NA |
| 304 | 2025-12-14 |
Multi-omics integration reveals hypoxia-driven mechanisms in vascular dementia: a machine learning and single-cell sequencing approach
2025-Dec, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004296
PMID:41377395
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研究论文 | 本研究通过多组学整合、机器学习和单细胞测序方法，识别并分析了血管性痴呆中与缺氧相关的枢纽基因，揭示了其在代谢、免疫反应和细胞分化中的作用 | 结合WGCNA、机器学习（如ssGSEA）和单细胞测序技术，首次在血管性痴呆中系统鉴定出DUSP1、MAFF和TGFBI作为缺氧相关枢纽基因，并关联到代谢通路、细胞死亡途径和免疫微环境 | 研究主要基于公共数据集（GSE122063、GSE282111）和动物模型（2VO），缺乏大规模临床样本验证，且机制探索仍需进一步实验确认 | 识别血管性痴呆中的缺氧相关枢纽基因，探索其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 血管性痴呆相关的基因表达数据、慢性脑低灌注模型（2VO）的脑组织样本 | 机器学习 | 血管性痴呆 | 单细胞测序、高通量测序、免疫组化 | 机器学习方法（具体未指定，如WGCNA、ssGSEA） | 基因表达数据（RNA-seq）、单细胞数据 | 基于公共数据集GSE122063和GSE282111，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 305 | 2025-12-14 |
Unveiling the dental cellular landscape: A comprehensive review of single-cell RNA sequencing in human dental tissues
2025-Dec, The Japanese dental science review
DOI:10.1016/j.jdsr.2025.11.004
PMID:41377691
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综述 | 本文系统回顾了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在揭示人类牙组织细胞异质性和分子动态方面的应用 | 首次对scRNA-seq在人类牙组织研究中的应用进行系统性综述，比较了健康与疾病状态下以及体内与培养环境中的细胞组成差异 | 仅纳入15项符合标准的研究，样本量有限；部分细胞亚群的具体功能仍需进一步验证 | 评估scRNA-seq在解析人类牙组织细胞图谱、理解组织稳态、再生和疾病机制方面的贡献 | 人类牙组织（包括牙髓、牙周组织等） | 单细胞组学 | 牙科疾病（龋齿、牙周炎） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 15项研究（具体样本数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 306 | 2025-12-14 |
Systematic analysis of the expression profiles and prognostic values of the FAM72 family in liver cancer
2025-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102358
PMID:41378103
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析评估了FAM72家族成员在肝癌中的表达水平及其预后相关性 | 首次系统分析了FAM72A-D在肝癌中的表达谱和预后价值，并开发了基于FAM72的基因特征用于预测肝癌患者预后 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；单细胞RNA测序数据仅提示FAM72A-D主要存在于增殖性T细胞中，具体机制未深入探讨 | 探究FAM72家族在肝癌中的表达特征和预后意义 | 肝癌组织与正常组织中的FAM72A-D基因 | 生物信息学 | 肝癌 | 生物信息学分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 307 | 2025-12-14 |
ETV1 is a key regulator of enteroendocrine PYY production
2025-Dec-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.052610
PMID:41048045
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和类器官实验，揭示了ETV1作为调节肠道内分泌细胞中PYY表达的关键转录因子 | 首次发现ETV1特异性调控PYY表达而不影响GLP-1，揭示了L细胞谱系中激素转录调控的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和类器官，尚未在人体中进行验证 | 探究肠道内分泌激素PYY的转录调控机制 | 小鼠小肠和类器官培养中的L细胞 | 单细胞组学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序, 定量PCR | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 308 | 2025-12-14 |
Neutrophil-chemoattractant CXCL5 increases lung barrier permeability in acute lung injury
2025-Dec, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.10.003
PMID:41076014
|
研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞趋化因子CXCL5在急性肺损伤中对肺屏障通透性的影响 | 揭示了CXCL5除了已知的中性粒细胞招募作用外，还能独立增加肺泡上皮屏障的通透性 | NA | 研究CXCL5在肺屏障功能和炎症中的作用 | 严重肺炎患者、体外和体内急性肺损伤模型、Cxcl5缺陷小鼠、人类原代肺泡上皮细胞 | NA | 急性肺损伤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 309 | 2025-12-14 |
Aqueous Humor Exosomal Membrane Proteins: Decoding Pathogenic Molecular Signatures in Retinitis Pigmentosa
2025-Dec-01, Translational vision science & technology
IF:2.6Q2
DOI:10.1167/tvst.14.12.15
PMID:41384798
|
研究论文 | 本研究通过建立房水外泌体膜蛋白的细胞来源追踪框架，揭示了其在视网膜色素变性中的病理意义 | 首次建立房水外泌体膜蛋白的细胞来源追踪框架，并利用EVArray技术结合单细胞RNA测序数据，解码了视网膜色素变性中的免疫和胶质细胞相关分子特征 | 样本量较小（14例RP患者和7例对照），且研究对象为并发白内障的RP患者，可能限制了结果的普遍性 | 解码视网膜色素变性中房水外泌体膜蛋白的致病分子特征 | 房水外泌体膜蛋白 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | EVArray技术、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据、单细胞RNA测序数据 | 14例视网膜色素变性并发白内障患者和7例年龄匹配的老年性白内障对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 310 | 2025-12-14 |
Single-cell and spatial transcriptome landscapes reveal the spatial immune defense pattern shared by primary and brain metastatic lung adenocarcinoma
2025-Nov-30, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2025-1224
PMID:41376899
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示了原发性与脑转移性肺腺癌共有的空间免疫防御模式 | 首次通过整合单细胞和空间转录组数据，识别出原发性与脑转移性肺腺癌共有的、具有空间富集特征的肿瘤免疫防御模式（TIDP），并发现其与髓系相关的免疫抑制特征及不良预后显著相关 | 研究主要基于转录组数据，功能验证和临床转化潜力仍需进一步实验和临床试验证实 | 阐明原发性与脑转移性肺腺癌共有的免疫防御机制，识别导致免疫逃逸和治疗抵抗的空间组织化程序及分子相互作用 | 肺腺癌（LUAD）的原发性肿瘤和脑转移性肿瘤 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 非负矩阵分解（NMF） | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 311 | 2025-12-14 |
Identification of the key gene for hepatocellular carcinoma based on bioinformatics and machine learning and experimental verification
2025-Nov-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1067
PMID:41378005
|
研究论文 | 本研究结合生物信息学与机器学习方法，筛选并验证了肝细胞癌的关键基因FAM83D | 整合多个GEO数据集，应用SVM-RFE和LASSO机器学习算法筛选诊断基因，并通过单细胞和空间转录组学分析验证FAM83D在恶性细胞中的上调及其与免疫治疗反应的关联 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，实验验证部分可能受样本量限制，且未深入探讨FAM83D的具体分子机制 | 识别肝细胞癌的关键驱动基因，以辅助早期诊断和预后评估 | 肝细胞癌患者与非癌肝组织 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 生物信息学分析、机器学习算法（SVM-RFE、LASSO）、免疫组化、单细胞转录组学、空间转录组学 | SVM-RFE、LASSO | 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 三个GEO数据集（GSE78737、GSE98383、GSE121248），具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 312 | 2025-12-14 |
MCRS1 is associated with immunosuppressive microenvironments in pan-cancer and promotes hepatocellular carcinoma malignant phenotypes
2025-Nov-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1463
PMID:41378029
|
研究论文 | 本研究通过泛癌分析揭示了微球蛋白1（MCRS1）在肿瘤免疫抑制微环境中的关键作用，并重点阐明了其在肝细胞癌（HCC）恶性表型中的表观遗传驱动机制 | 首次报道了MCRS1在泛癌水平上的免疫学意义和治疗潜力，并发现其启动子低甲基化驱动的过表达与M2巨噬细胞极化的免疫抵抗微环境相关 | 研究主要基于公共数据库和体外功能验证，缺乏体内动物模型的深入机制验证 | 阐明MCRS1在泛癌中的免疫学意义和治疗潜力，并揭示其在肝细胞癌进展中的表观遗传驱动机制 | 多种癌症类型（泛癌分析），重点关注肝细胞癌（HCC） | 生物信息学，癌症免疫学 | 肝细胞癌，泛癌 | 批量转录组学，单细胞RNA测序（scRNA-seq），表观遗传分析，功能验证 | NA | 转录组数据，单细胞RNA测序数据，表观遗传数据，蛋白质表达数据 | 来自TCGA、GTEx、HPA等公共数据库的大量样本（具体数量未明确说明），包括24种恶性肿瘤 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 313 | 2025-12-14 |
NK cells undergo transcriptional and functional reprogramming following Streptococcus pneumoniae infection
2025-Nov-28, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.11.012
PMID:41320160
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了自然杀伤细胞在肺炎链球菌感染后经历转录和功能重编程，并形成具有增强活性的记忆亚群 | 首次在细菌感染背景下系统揭示NK细胞的转录重编程和记忆形成机制，为先天免疫记忆在细菌感染中的作用提供了新见解 | 研究主要基于小鼠模型，人类NK细胞的类似机制仍需验证；单细胞测序数据的功能验证有待进一步深入 | 探究NK细胞在肺炎链球菌感染中的应答机制和记忆形成过程 | 自然杀伤细胞 | 单细胞组学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 314 | 2025-12-14 |
Alterations in Resident Immune Cells in Prenatal Trisomy 21 Lungs
2025-Nov-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14231866
PMID:41369355
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间表型分析，揭示了唐氏综合征胎儿肺部免疫细胞的变化，特别是B细胞减少，这可能解释其呼吸道感染易感性增加 | 首次在产前唐氏综合征肺部中系统表征免疫细胞变化，结合单细胞测序与空间技术揭示B细胞减少的分子机制 | 样本量较小（T21组5例，非T21组4例），且仅关注产前阶段，未追踪出生后免疫发育变化 | 探究唐氏综合征胎儿肺部免疫细胞异常，以解释其呼吸道感染易感性增加的潜在原因 | 产前唐氏综合征（T21）和非唐氏综合征（非T21）胎儿肺部组织 | 单细胞组学 | 唐氏综合征 | 单细胞RNA测序，荧光原位杂交，免疫荧光染色，qRT-PCR | NA | 单细胞RNA测序数据，空间组织切片图像，基因表达数据 | T21组5例，非T21组4例产前肺部样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 315 | 2025-12-14 |
Functional Division of Insect Blood Cells by Single-Cell RNA-Sequencing and Cell-Type-Specific FISH Markers
2025-Nov-22, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14231842
PMID:41369332
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和细胞类型特异性FISH标记，揭示了昆虫血细胞的功能分化与动态变化 | 首次在鳞翅目昆虫中应用单细胞RNA测序技术解析血细胞功能分化，发现了24个功能簇和7个功能组，并开发了特异性FISH标记识别新细胞群 | 研究仅针对一种鳞翅目昆虫幼虫，结果可能不适用于其他昆虫种类或发育阶段 | 探究昆虫血细胞的功能分化类型及其在免疫应答中的动态变化 | 鳞翅目昆虫（烟草天蛾）幼虫的血细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq），荧光原位杂交（FISH） | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 未明确样本数量，使用烟草天蛾幼虫血细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 316 | 2025-12-14 |
Inferring the regulation dynamics of oscillatory networks from scRNA-seq data
2025-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.08.687360
PMID:41292720
|
研究论文 | 本文提出了一种通过整合细胞周期位置信息来改进单细胞RNA测序数据中基因调控网络推断的方法 | 将振荡过程（如细胞周期）的周期性约束纳入基因调控网络推断，相比传统基于基因相关性或时间进程的方法，能更准确地解析细胞周期调控动力学 | 仅在小鼠视网膜祖细胞单细胞基因表达数据集上进行了验证，尚未在其他细胞类型或生物系统中广泛测试 | 提高从单细胞RNA测序数据中推断振荡网络（如细胞周期）调控动力学的准确性 | 小鼠视网膜祖细胞的单细胞基因表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 基因调控网络推断方法（包括Tricycle等八种代表性方法） | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 317 | 2025-12-14 |
GPR68, A Proton-sensing GPCR, Mediates Acid-induced Visceral Nociception
2025-Nov-04, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101671
PMID:41197770
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研究论文 | 本研究探讨了质子感应G蛋白偶联受体GPR68在酸诱导的结肠痛觉中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析揭示GPR68在结肠感觉神经元中的表达，并证实其在酸诱导的结肠痛觉中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限，且未深入探讨GPR68在其他类型疼痛中的作用 | 研究GPR68在酸诱导的结肠痛觉中的介导作用及其作为治疗靶点的潜力 | 结肠感觉神经元、小鼠模型（野生型和GPR68-/-）、人类炎症性肠病组织样本 | 生物医学研究 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、钙成像、药理学研究 | NA | RNA测序数据、钙成像数据 | 小鼠模型（野生型和GPR68-/-）、人类炎症性肠病组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 318 | 2025-12-14 |
Advances in artificial intelligence for spatial transcriptomics in cancer: Special focus on Yin Yang 1 (YY1) and Raf kinase inhibitor protein (RKIP)
2025-Nov, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189456
PMID:40992707
|
综述 | 本文综述了人工智能在癌症空间转录组学中的应用，特别聚焦于YY1和RKIP基因，探讨了机器学习、人工智能和统计方法如何推动该领域的发展 | 通过整合机器学习、人工智能和统计方法来解析空间转录组数据，为癌症研究提供新视角，并特别以YY1和RKIP基因为例展示应用 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据或具体模型验证，主要基于现有研究进行总结和讨论 | 探讨人工智能和机器学习在癌症空间转录组学数据分析中的应用，以促进癌症分类、临床结果预测和个性化医疗 | 空间转录组数据，特别是与YY1和RKIP基因相关的癌症微环境研究 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学技术 | SVM, Random Forest, 聚类, PCA, t-SNE, UMAP | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 319 | 2025-12-14 |
Img2ST-Net: efficient high-resolution spatial omics prediction from whole-slide histology images via fully convolutional image-to-image learning
2025-Nov, Journal of medical imaging (Bellingham, Wash.)
DOI:10.1117/1.JMI.12.6.061410
PMID:41210922
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研究论文 | 本研究提出了一种名为Img2ST-Net的高效框架，用于从全切片组织学图像中并行预测高分辨率空间转录组数据 | 提出了首个用于高分辨率空间转录组预测的全卷积图像到图像学习框架，将任务重构为具有数百或数千个输出通道的超内容图像生成问题，并引入了针对高分辨率ST分析的基于结构相似性的评估指标SSIM-ST | 论文未明确说明模型在更广泛的组织类型或疾病中的应用局限性，也未讨论模型对极低表达基因的预测能力 | 开发一种高效、可扩展的框架，以降低高分辨率空间转录组数据获取的成本和时间，直接从常规组织学图像预测基因表达 | 乳腺癌和结直肠癌的组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌, 结直肠癌 | 空间转录组学 | 全卷积神经网络 | 图像, 基因表达数据 | 两个公共Visium HD数据集（乳腺癌和结直肠癌） | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD平台，分辨率为8 μm和16 μm |
| 320 | 2025-12-14 |
STIFT: spatiotemporal transcriptomics integration through spatially informed multi-timepoint bridging
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf644
PMID:41370630
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研究论文 | 本文提出了一种名为STIFT的时空转录组学整合框架，用于整合发育或再生过程中跨时间点的空间转录组学数据 | STIFT框架结合了发育时空最优传输、时空图构建以及基于时间三元学习的图注意力自编码器，专门为整合时空转录组学数据而设计 | NA | 整合时空转录组学数据，以去除批次效应、识别空间域、推断轨迹并探索发育动态 | 蝾螈脑再生、小鼠胚胎发育和3D涡虫再生数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图注意力自编码器 | 空间转录组学数据（2D或3D） | 数十万个spots | NA | 空间转录组学 | NA | NA |