单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 3283 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2025-04-15 |
Snail1 as a key prognostic biomarker of cancer-associated fibroblasts in breast tumors
2025-Apr-11, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189316
PMID:40222423
|
review | 本文综述了乳腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的异质性及其预后标志物Snail1的作用 | 揭示了Snail1在CAFs中的表达与恶性肿瘤的关联，并提出了一个未描述的与Snail1相关的基因特征 | 主要基于患者样本和小鼠模型的研究，可能不完全反映人类肿瘤的全部复杂性 | 探讨CAFs的异质性及其在乳腺癌预后中的作用 | 乳腺癌患者样本和小鼠模型中的CAFs | digital pathology | breast cancer | single-cell RNA sequencing | NA | gene expression data | NA |
| 302 | 2025-04-15 |
The crucial role of neutrophil extracellular traps and IL-17 signaling in indomethacin-induced gastric injury in mice
2025-Apr-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-95880-4
PMID:40204883
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研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞胞外诱捕网（NETs）和IL-17信号在吲哚美辛诱导的小鼠胃损伤中的关键作用 | 揭示了NETs形成在吲哚美辛诱导胃损伤中的关键作用，并发现IL-17信号可能是NETs形成的关键细胞内机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体验证 | 探究吲哚美辛诱导胃损伤的分子机制 | 小鼠胃黏膜损伤模型 | 病理学 | 胃溃疡 | 蛋白质组学分析、ELISA、免疫荧光、TEM、Western blot、实时PCR、scRNA-seq | 小鼠胃损伤模型 | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确说明小鼠数量，但涉及体外实验使用200µL、400µL和600µL吲哚美辛处理 |
| 303 | 2025-04-15 |
Development of a fully human glioblastoma-in-brain-spheroid model for accelerated translational research
2025-Apr-04, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.03.055
PMID:40188875
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研究论文 | 开发了一种全人源胶质母细胞瘤-脑球体模型hGliCS，用于加速转化研究 | 结合患者来源的GBM细胞和诱导多能干细胞来源的成熟人类皮质神经元，克服了现有模型系统的关键限制 | NA | 研究胶质母细胞瘤生物学和肿瘤-神经元相互作用 | 胶质母细胞瘤细胞和人类皮质神经元 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | hGliCS模型 | 基因表达数据 | NA |
| 304 | 2025-04-15 |
Identification of BHLHE40-Expressing CD4+ T Cells Producing GM-CSF in Rheumatoid Arthritis
2025-Apr, International journal of rheumatic diseases
IF:2.4Q2
DOI:10.1111/1756-185X.70219
PMID:40223427
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research paper | 该研究探讨了BHLHE40和CSF2在类风湿性关节炎(RA)患者CD4+ T细胞中的表达及其与疾病的关系 | 首次在IL-1富集的炎症部位研究了BHLHE40和CSF2在CD4+ T细胞中的表达，并发现这些基因在RA患者滑膜液中的表达显著增加 | 研究主要依赖于已有的公开数据库数据，缺乏实验验证 | 研究BHLHE40和CSF2基因在RA发病机制中的作用 | 类风湿性关节炎患者和健康对照者的外周血和滑膜液中的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 类风湿性关节炎 | scRNA-seq, RNA-seq, 微阵列数据分析 | NA | 基因表达数据 | 来自RA患者和健康对照者的外周血和滑膜液样本 |
| 305 | 2025-04-15 |
Correlative analysis of metallomic gene expression and metal ion content within the mouse hippocampus
2025-Mar-28, Metallomics : integrated biometal science
IF:2.9Q3
DOI:10.1093/mtomcs/mfaf009
PMID:40175292
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研究论文 | 本研究通过多模态模板结合X射线荧光显微镜和空间转录组学，揭示了小鼠海马区金属离子含量与金属组基因表达的相关性 | 首次将元素映射与空间转录组学结合，揭示了海马区金属离子富集与特定转录本区域富集的分子基础 | 研究仅局限于小鼠海马区，未涉及其他脑区或物种 | 探究大脑金属稳态的分子机制及其对神经功能的影响 | 小鼠海马区及其亚区域的金属离子含量和基因表达 | 神经科学 | 神经发育障碍 | X射线荧光显微镜, 空间转录组学 | NA | 元素映射数据, 转录组数据 | 小鼠海马区样本 |
| 306 | 2025-04-15 |
Genome-wide association meta-analysis identifies 126 novel loci for diverticular disease and implicates connective tissue and colonic motility
2025-Mar-28, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.03.27.25324777
PMID:40196262
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研究论文 | 通过全基因组关联研究荟萃分析，识别出126个新的与憩室病相关的基因位点，并揭示了结缔组织和结肠运动在憩室病中的作用 | 首次进行了憩室病的最大规模全基因组关联研究荟萃分析，发现了126个新的基因位点，并通过多种下游分析策略验证了憩室病与结缔组织生物学和结肠运动的关联 | NA | 研究憩室病的遗传基础及其与结缔组织和结肠运动的关联 | 憩室病患者 | 基因组学 | 憩室病 | 全基因组关联研究（GWAS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据、RNA测序数据 | NA |
| 307 | 2025-04-15 |
Defining the host dependencies and the transcriptional landscape of RSV infection and bystander activation
2025-Mar-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.26.645108
PMID:40196489
|
研究论文 | 该研究通过全基因组CRISPR敲除筛选和单细胞RNA测序技术，探讨了RSV感染的宿主决定因素及宿主反应 | 结合CRISPR筛选和单细胞RNA测序技术，揭示了RSV感染细胞和旁观者激活细胞之间的转录差异，并识别了多个对病毒感染重要的宿主因子 | 未提及样本量或实验设计的局限性 | 理解RSV感染的宿主依赖性和转录特征 | RSV感染的细胞和未感染的旁观者细胞 | 基因组学 | 呼吸道合胞病毒感染 | 全基因组CRISPR敲除筛选，单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 308 | 2025-04-15 |
Using Single-Cell RNA sequencing with Drosophila, Zebrafish, and mouse models for studying Alzheimer's and Parkinson's disease
2025-Mar-26, Neuroscience
IF:2.9Q2
|
综述 | 本文综述了利用果蝇、斑马鱼和小鼠模型以及单细胞RNA测序技术研究阿尔茨海默病和帕金森病的优势和局限性 | 重点讨论了单细胞RNA测序技术如何通过提供疾病细胞和转录组景观的新见解革新该领域 | 主要关注三种模型生物，可能未涵盖其他潜在有用的模型系统 | 推进阿尔茨海默病和帕金森病的研究，以促进成功治疗干预的开发 | 果蝇、斑马鱼和小鼠模型 | 神经退行性疾病研究 | 阿尔茨海默病和帕金森病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 309 | 2025-04-06 |
A Latent Activated Olfactory Stem Cell State Revealed by Single-Cell Transcriptomic and Epigenomic Profiling
2025-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.564041
PMID:37961539
|
研究论文 | 通过单细胞转录组和表观基因组分析揭示了一种潜在的激活嗅觉干细胞状态 | 结合单细胞测序和可及染色质分析，识别了在损伤诱导再生过程中决定嗅觉上皮干细胞命运的转录级联和表观遗传过程，并发现了一种潜在的激活干细胞状态 | 研究主要关注嗅觉上皮干细胞，可能不适用于其他类型的干细胞或组织 | 研究嗅觉上皮干细胞在损伤诱导再生过程中的分子机制 | 嗅觉上皮干细胞 | 表观遗传学 | NA | 单细胞测序、可及染色质分析 | NA | 转录组数据、表观基因组数据 | 单个谱系追踪的嗅觉干细胞 |
| 310 | 2025-04-15 |
CSsingle: A Unified Tool for Robust Decomposition of Bulk and Spatial Transcriptomic Data Across Diverse Single-Cell References
2025-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.07.588458
PMID:38645128
|
research paper | 介绍了一种名为CSsingle的新方法，用于增强对大量和空间转录组数据的分解，以解决细胞异质性的关键挑战 | CSsingle通过使用ERCC spike-in控制进行细胞大小校正，能够考虑不同细胞类型间RNA含量的变化，实现准确的大量数据去卷积，并对空间转录组数据进行精细分析 | NA | 研究复杂生物系统和疾病过程，特别是巴雷特食管和食管腺癌中的细胞异质性 | 700多个正常和病变的胃食管组织样本 | digital pathology | esophageal adenocarcinoma | spatial transcriptomic (ST), scRNA-seq | NA | transcriptomic data | 700多个正常和病变的胃食管组织样本 |
| 311 | 2025-04-15 |
Chronic hyperactivation of midbrain dopamine neurons causes preferential dopamine neuron degeneration
2025-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.05.588321
PMID:38645054
|
research paper | 该研究通过化学遗传学小鼠模型探讨了慢性过度激活中脑多巴胺神经元对帕金森病中神经元退化的影响 | 揭示了中脑多巴胺神经元慢性过度激活导致的选择性神经元退化，为帕金森病的病理机制提供了新见解 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证有限 | 探讨慢性多巴胺神经元活动增加是否及如何导致神经元退化 | 中脑多巴胺神经元 | 神经科学 | 帕金森病 | 化学遗传学(DREADD)、电生理学、空间转录组学 | DREADD小鼠模型 | 电生理数据、行为数据、转录组数据 | 小鼠模型及有限的人类患者样本 |
| 312 | 2025-04-15 |
Multi-Manifolds fusing hyperbolic graph network balanced by pareto optimization for identifying spatial domains of spatial transcriptomics
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf162
PMID:40220278
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research paper | 提出了一种基于多流形融合的双曲图网络方法MManiST，用于空间转录组学中的空间域识别 | 首次在空间转录组学中引入多流形融合和双曲神经网络，通过Pareto优化平衡多种重建损失 | 未明确说明方法在计算效率方面的表现 | 开发更有效的空间转录组学空间域识别方法 | 空间转录组学数据 | computational biology | NA | spatial transcriptomics | hyperbolic graph network, attention mechanism | spatial transcriptomics data | multiple benchmark datasets |
| 313 | 2025-04-15 |
Role of TGF-β/SMAD/YAP/TAZ signaling in skeletal muscle fibrosis
2025-Mar-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00541.2024
PMID:39925133
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研究论文 | 探讨TGF-β/SMAD/YAP/TAZ信号通路在骨骼肌纤维化中的作用 | 揭示了TGF-β通过YAP/TAZ调控FAPs向肌成纤维细胞分化的新机制，并提出YAP/TAZ作为肌肉纤维增殖性疾病的潜在治疗靶点 | 对FAPs分化为肌成纤维细胞的核调控因子理解尚处于初级阶段 | 研究TGF-β信号通路在骨骼肌纤维化中的作用机制 | 骨骼肌纤维化过程中的FAPs分化和YAP/TAZ活性 | 分子生物学 | 肌肉萎缩症 | 空间转录组学分析、原代培养 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型和原代培养的FAPs |
| 314 | 2025-04-15 |
Distinct single-cell transcriptional profile in CD4+ T-lymphocytes among obese children with asthma
2025-Mar-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00270.2024
PMID:39868576
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，比较了肥胖与正常体重哮喘儿童的CD4+ T细胞转录组差异 | 首次在单细胞水平揭示了肥胖哮喘儿童CD4+ T细胞的独特转录特征，发现了与IL-7受体和Rho转录信号通路相关的新机制 | 样本量较小（仅8名参与者），需要在更大规模队列中验证发现 | 探究肥胖哮喘儿童CD4+ T细胞的分子特征及其与疾病严重程度的关系 | 肥胖与正常体重哮喘儿童的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 8名匹配的哮喘儿童（肥胖与正常体重各半） |
| 315 | 2025-04-15 |
In silico integrative scRNA analysis of human colonic epithelium indicates four tuft cell subtypes
2025-Feb-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00182.2024
PMID:39589317
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研究论文 | 本研究整合分析了四个公开可用的人类单细胞RNA测序数据集，揭示了人类结肠中簇细胞异质性的复杂景观，并识别出四种簇细胞亚型 | 首次通过整合scRNA-seq数据识别出人类结肠中四种具有不同基因表达特征的簇细胞亚型，并揭示了这些亚型在健康人群和炎症性肠病患者之间的差异 | 研究基于计算分析，需要后续实验验证这些簇细胞亚型的生物学功能 | 探索人类结肠簇细胞的异质性及其在肠道健康和疾病中的潜在作用 | 人类结肠组织中的簇细胞 | 单细胞组学 | 炎症性肠病(IBD) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 四个公开数据集的人类结肠样本 |
| 316 | 2025-04-15 |
BRD4 inhibition rewires cardiac macrophages toward a protective phenotype marked by low MHC class II expression
2025-Feb-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00438.2024
PMID:39716819
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研究论文 | 本文研究了BRD4抑制如何通过改变心脏巨噬细胞的表型，从而在心力衰竭模型中发挥保护作用 | 揭示了BRD4抑制通过调控巨噬细胞的MHC-II表达和NF-κB信号通路，促进心脏修复的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类心脏疾病的适用性尚需进一步验证 | 探索BET抑制剂JQ1改善心脏结构和功能的细胞机制 | 心脏巨噬细胞和成纤维细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 小鼠缺血/再灌注损伤模型 | 基因表达数据 | 小鼠心脏组织样本 |
| 317 | 2025-04-15 |
mTOR signaling regulates multiple metabolic pathways in human lung fibroblasts after TGF-β and in pulmonary fibrosis
2025-Feb-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00189.2024
PMID:39745695
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研究论文 | 研究mTOR信号在TGF-β处理后的人类肺成纤维细胞及肺纤维化中调节多种代谢途径的作用 | 揭示了mTOR和ATF4在肺成纤维细胞中调节氨基酸稳态、糖酵解酶和线粒体电子传递链亚基等新的代谢途径 | 研究主要基于体外实验和公开的单细胞RNA-seq数据集，未涉及动物模型验证 | 探讨mTOR和ATF4在肺成纤维细胞代谢重编程中的作用及其在肺纤维化中的潜在治疗靶点 | 人类肺成纤维细胞和肺纤维化患者的肺组织 | 代谢重编程 | 肺纤维化 | RNA测序、代谢组学分析、单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据、代谢组数据 | 人类肺成纤维细胞及公开的单细胞RNA-seq数据集中的患者肺组织样本 |
| 318 | 2025-04-15 |
Cohesin rad21 mutation dysregulates erythropoiesis and granulopoiesis output within the whole kidney marrow of adult zebrafish
2025-Jan-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00657.2024
PMID:39548947
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研究论文 | 研究cohesin复合体亚基rad21突变对成年斑马鱼肾脏骨髓中红细胞生成和粒细胞生成的影响 | 首次在成年斑马鱼模型中揭示了cohesin亚基rad21杂合突变对造血过程的转录调控紊乱和细胞输出改变 | 未观察到明显的造血细胞形态学异常，突变对造血系统的长期影响尚不明确 | 探究cohesin基因突变对造血系统发育和功能的影响 | 携带rad21杂合突变的成年斑马鱼肾脏骨髓造血系统 | 发育生物学 | 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 斑马鱼遗传模型 | 转录组数据 | 未明确说明样本量的突变型和野生型斑马鱼 |
| 319 | 2025-04-14 |
Glomerular mesangial cells derived complement factor H regulates complement activation, influences cell proliferation, and maintains actin cytoskeleton
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114544
PMID:40157080
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研究论文 | 本研究探讨了补体因子H（CFH）在肾小球系膜细胞中的功能，包括其在补体激活调节、细胞增殖影响以及肌动蛋白细胞骨架维持中的作用 | 揭示了肾小球系膜细胞衍生的CFH不仅具有经典的补体激活调节功能，还具有影响细胞增殖和维持细胞骨架的非经典功能 | 外源性补充的CFH未能影响细胞增殖和细胞骨架，其具体机制尚不明确 | 研究CFH在肾小球系膜细胞中的功能及其在补体激活、细胞增殖和细胞骨架维持中的作用 | 原代人肾小球系膜细胞（pHGMCs） | 细胞生物学 | IgA肾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 320 | 2025-04-14 |
Pan-HDAC inhibitor LAQ824 inhibits the progression of pancreatic ductal adenocarcinoma and suppresses immune escape by promoting antigen presentation
2025-May-08, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114528
PMID:40158429
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研究论文 | 本研究探讨了泛组蛋白去乙酰化酶抑制剂LAQ824在胰腺导管腺癌(PDAC)中的治疗潜力及其在调节免疫逃逸机制中的作用 | 首次揭示了LAQ824通过上调MHC-I介导的抗原提呈增强PDAC免疫原性的新机制，并确定了HDAC1是PDAC细胞中MHC-I的关键抑制因子 | 研究主要基于小鼠模型，尚未进行临床试验验证 | 评估LAQ824对PDAC的治疗效果及其免疫调节机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC) | 肿瘤免疫治疗 | 胰腺癌 | IHC、流式细胞术、RNA测序、单细胞RNA测序 | C57BL/6J小鼠皮下肿瘤模型 | 体内外实验数据 | 未明确说明样本数量 |