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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3081 | 2025-10-08 |
The transcription factor LHX2 mediates and enhances oncogenic BMP signaling in medulloblastoma
2025-Oct, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-025-01488-6
PMID:40148468
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子LHX2在髓母细胞瘤中介导并增强致癌性BMP信号通路的分子机制 | 首次发现LHX2通过转录诱导BMP I型受体ACVR1表达,形成BMP信号的正反馈环路,并证实其在肿瘤干细胞特性和化疗耐药中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,临床转化价值需进一步验证 | 探索BMP信号通路在髓母细胞瘤中的作用机制 | 髓母细胞瘤患者来源的肿瘤样本和细胞模型 | 癌症生物学 | 髓母细胞瘤 | 空间转录组学、转录组分析、免疫组织化学、细胞移植 | 小鼠异种移植模型 | 基因表达数据、蛋白质定位数据 | 多个髓母细胞瘤亚组的患者来源肿瘤样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3082 | 2025-10-08 |
Dual states of murine Bmi1-expressing intestinal stem cells drive epithelial development utilizing non-canonical Wnt signaling
2025-Aug-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.03.014
PMID:40262610
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠肠道发育早期Bmi1表达干细胞通过非经典Wnt信号调控上皮发育的动态过程 | 首次发现Bmi1细胞在Lgr5+肠道干细胞出现前的发育早期作为功能干细胞存在,并揭示其通过非经典Wnt信号调控增殖状态转变 | 研究仅限于小鼠模型,人类肠道发育的相似性尚未验证 | 阐明肠道发育过程中干细胞亚型的动态调控机制 | 小鼠肠道干细胞(Bmi1+和Lgr5+ ISCs) | 发育生物学 | NA | 谱系追踪,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,细胞谱系数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3083 | 2025-10-08 |
AI-Driven Analysis Unveils Functional Dynamics of Müller Cells in Retinal Autoimmune Inflammation
2025-May-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640907
PMID:40093069
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研究论文 | 通过AI驱动的单细胞RNA测序分析揭示视网膜自身免疫炎症中Müller细胞的功能动态 | 首次使用AI辅助工具SCassist系统分析Müller细胞亚群功能,发现活化Müller细胞表达免疫检查点分子调控Th1细胞活性的新机制 | 研究基于Aire-/-小鼠模型,结果在人类视网膜中的适用性需要进一步验证 | 探究视网膜自身免疫炎症中Müller细胞的功能特性和与T细胞的相互作用 | Aire-/-小鼠视网膜中的Müller细胞和T细胞 | 单细胞转录组学 | 视网膜自身免疫炎症 | 单细胞RNA测序 | AI辅助分析工作流 | 单细胞转录组数据 | Aire-/-小鼠视网膜scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3084 | 2025-10-08 |
Mucosal tissue NK cells tune their function between optimal anti-pathogen activity and tissue protection
2025-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.04.647286
PMID:40291684
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研究论文 | 本研究揭示了阴道黏膜组织中NK细胞在抗病原体反应和组织保护之间的功能平衡机制 | 首次系统表征阴道黏膜NK细胞具有独特的效应和组织保护双重功能,并发现其能在稳态下保持功能静息状态而对炎症信号产生强烈反应 | 研究主要基于小鼠模型,人类组织样本的验证仍需进一步扩展 | 探究黏膜组织NK细胞在病原体防御和组织保护之间的平衡机制 | 人类阴道组织和小鼠模型的NK细胞 | 免疫学 | HSV-2病毒感染 | 单细胞RNA测序,高参数流式细胞术 | 小鼠感染模型 | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 人类阴道组织和实验小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3085 | 2025-10-08 |
Machine learning predictions from unpredictable chaos
2025-Mar-19, ArXiv
PMID:40166748
|
研究论文 | 本文提出了一种名为混沌学习的新型多尺度拓扑范式,能够从混沌系统中实现准确预测 | 首次引入混沌学习概念,通过多尺度拓扑拉普拉斯算子将现实世界数据嵌入混沌动力系统,实现了对混沌系统的定量预测 | 仅使用了28个数据集和两种混沌动力系统进行概念验证,需要更多样化的数据集和系统验证 | 探索混沌系统的可预测性并建立拓扑、混沌与学习之间的桥梁 | 脑电波、蛋白质数据集、单细胞RNA测序数据和图像数据 | 机器学习 | NA | 多尺度拓扑拉普拉斯算子 | 混沌学习模型 | 脑电波、蛋白质数据、单细胞RNA测序数据、图像数据 | 28个数据集(10个脑电波、4个蛋白质数据集、13个单细胞RNA测序数据集、1个图像数据集) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3086 | 2025-10-08 |
Causal differential expression analysis under unmeasured confounders with causarray
2025-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.30.635593
PMID:39975097
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研究论文 | 提出causarray框架,用于在存在未测量混杂因素的情况下进行因果差异表达分析 | 开发了双重稳健的因果推断框架,整合广义混杂调整方法和半参数推断,能有效分离处理效应与混杂因素 | NA | 解决观察性基因组数据中因果关系识别的挑战 | 阵列基因组数据,包括批量细胞和单细胞水平的数据 | 生物信息学 | 自闭症, 阿尔茨海默病 | 单细胞测序, CRISPR技术, Perturb-seq | 机器学习, 半参数推断 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3087 | 2025-10-07 |
scSTD: A Swin Transformer-Based Diffusion Model for Recovering scRNA-Seq Data
2025-Oct, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3570265
PMID:40366848
|
研究论文 | 提出一种基于Swin Transformer和扩散模型的单细胞RNA测序数据恢复方法scSTD | 首次将Swin Transformer架构与潜在扩散模型相结合用于scRNA-seq数据恢复 | 未明确说明方法在特定细胞类型或实验条件下的性能限制 | 解决单细胞RNA测序数据中的dropout事件和技术噪声问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Swin Transformer, 扩散模型, 自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3088 | 2025-10-07 |
Human airway epithelial B-cell activating factor is reduced in early life but is virally induced via JAK/STAT
2025-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.04.034
PMID:40409377
|
研究论文 | 本研究揭示了人类气道上皮细胞通过JAK/STAT信号通路调控B细胞活化因子产生,影响早期生命阶段气道B细胞发育和抗病毒免疫应答的机制 | 首次发现婴儿气道上皮细胞BAFF产生减少但可通过病毒刺激激活,并阐明其通过I型和III型干扰素及JAK/STAT信号通路诱导的分子机制 | 研究主要关注儿科人群,缺乏成人对照;机制研究主要在体外进行,需要更多体内验证 | 探究人类气道B细胞发育动态及其与气道上皮细胞的相互作用,特别是在早期生命阶段和病毒感染条件下的变化 | 儿科患者的气道B细胞和气道上皮细胞 | 免疫学 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞RNA测序,PCR确认,体外刺激实验 | NA | 基因表达数据,细胞培养数据 | 不同儿科年龄组的气道样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3089 | 2025-10-07 |
Transcriptomic profiling of vitiligo patients shows polar immune dysregulation in involved and uninvolved skin
2025-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.06.002
PMID:40513622
|
研究论文 | 通过转录组分析揭示白癜风患者皮损和非皮损区域存在极化的免疫失调现象 | 首次全面揭示白癜风不仅皮损区域存在TH1/干扰素驱动的免疫异常,非皮损区域也表现出明显的TH2和TH17/22相关标志物上调 | 样本量相对有限(15例白癜风样本和14例健康对照),需要更大规模研究验证 | 获取白癜风皮损和非皮损区域的整体皮肤转录组特征 | 白癜风患者的皮损和非皮损皮肤活检样本 | 转录组学 | 白癜风 | RNA测序, 实时PCR, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据, 基因表达数据 | 15例白癜风皮损和非皮损样本,14例匹配健康对照 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3090 | 2025-10-06 |
Cell-type-directed network-correcting combination therapy for Alzheimer's disease
2025-Oct-02, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.06.035
PMID:40695276
|
研究论文 | 提出一种基于细胞类型特异性网络校正的阿尔茨海默病联合疗法 | 首次将单细胞转录组学、药物扰动数据库和临床记录整合,开发细胞类型特异性多靶点药物发现策略 | 研究基于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 开发针对阿尔茨海默病多因素特征的精准联合疗法 | 阿尔茨海默病小鼠模型(同时具有Aβ和tau沉积) | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据、临床记录 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3091 | 2025-10-06 |
An inducible model of human post-implantation development derived from primed and naive stem cells
2025-Oct-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.08.005
PMID:40885193
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研究论文 | 本研究通过结合启动态和初始态人多能干细胞开发了可诱导干细胞胚胎模型,模拟人类植入后早期发育过程 | 首次通过结合启动态hPSC和初始态hPSC来源的转基因诱导胚外细胞,建立了可诱导的干细胞胚胎模型 | 模型尚不完美,存在一定局限性 | 研究人类植入后早期发育过程 | 人类干细胞胚胎模型 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 可诱导干细胞胚胎模型(iSCBEMs) | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3092 | 2025-10-06 |
Protocol for single-cell spatial transcriptomic profiling of cultured cells and engineered tissues without embedding or sectioning
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104074
PMID:40938748
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研究论文 | 本文提出了一种无需包埋或切片即可对培养细胞和工程组织进行单细胞空间转录组分析的新方案 | 开发了适用于标准包埋切片不兼容的2D工程组织和细胞培养物的空间转录组分析新方法 | NA | 建立适用于特殊样本类型的空间转录组分析技术方案 | 2D工程组织和细胞培养物 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD空间技术 |
| 3093 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis reveals the attenuation of the interferon pathway as a driver of chemo-refractory ovarian cancer
2025-Sep-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102316
PMID:40885189
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研究论文 | 通过多组学分析揭示干扰素通路减弱是卵巢癌化疗耐药的关键驱动因素 | 首次发现化疗耐药卵巢癌中I型干扰素通路活性降低与缺氧通路增强的分子特征,并证实干扰素活性可独立预测化疗反应 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 探索卵巢高级别浆液性癌化疗耐药的分子机制 | DECIDER观察性试验中化疗耐药卵巢癌患者的治疗前活检样本 | 多组学分析 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,空间蛋白质分析,体外实验 | NA | 基因组学数据,转录组学数据,蛋白质组学数据 | DECIDER临床试验注册患者(NCT04846933) | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学分析 | NA | NA |
| 3094 | 2025-10-06 |
Appendiceal B lymphocytes contribute to the pathogenesis of experimental colitis through fueling colonic CD4+ T polarization
2025-Sep-11, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2025.09.001
PMID:40945653
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研究论文 | 本研究揭示阑尾B淋巴细胞通过CCL20-CCR6轴迁移至结肠并促进CD4+ T细胞介导的Th1/Th17免疫反应,从而加剧实验性结肠炎 | 首次阐明阑尾B淋巴细胞通过特定迁移机制加剧结肠炎的具体病理机制,并提出阑尾口炎症可能代表溃疡性结肠炎的特殊亚型 | 研究主要基于动物模型,人类数据验证仍需进一步扩展 | 探究阑尾B淋巴细胞在实验性结肠炎发病机制中的作用 | 小鼠模型和溃疡性结肠炎患者的结肠组织 | 免疫学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序,免疫荧光共染色 | NA | 基因表达数据,组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3095 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing: enhancing the predictive accuracy of tumor immunotherapy efficacy
2025-Sep-08, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20253017
PMID:40857744
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综述 | 本文综述单细胞RNA测序技术在肿瘤免疫治疗疗效预测中的应用现状与前景 | 系统阐述scRNA-seq技术如何提升免疫治疗疗效预测准确性,并探讨生物材料整合带来的新研究方向 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于现有研究进行理论分析 | 探讨单细胞RNA测序技术在肿瘤免疫治疗领域的应用价值与发展方向 | 肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3096 | 2025-10-06 |
Folliculin Deletion in the Mouse Kidney Results in Cystogenesis of the Loops of Henle via Aberrant TFEB Activation
2025-Sep, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.05.010
PMID:40499782
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研究论文 | 本研究通过构建肾单位特异性Folliculin基因敲除小鼠模型,揭示了FLCN-TFEB信号通路在肾单位发育中的关键作用 | 首次证明Folliculin基因缺失通过异常激活TFEB导致亨利氏袢囊肿形成,并阐明了FLCN-TFEB信号通路在肾单位发育中的特异性作用 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究Folliculin基因在整个肾单位中的具体功能及其在囊肿形成中的作用机制 | 肾单位特异性Folliculin基因敲除小鼠模型 | 分子生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序,基因敲除技术 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,组织形态学数据 | 基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3097 | 2025-10-05 |
Short-chain fatty acids from gut microbiota restore Th17/Treg balance in rheumatoid arthritis: Mechanisms and therapeutic potential
2025-Dec, Journal of translational autoimmunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1016/j.jtauto.2025.100316
PMID:41036443
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综述 | 系统阐述肠道微生物来源的短链脂肪酸通过多重机制恢复类风湿关节炎中Th17/Treg平衡的作用及治疗潜力 | 首次系统整合多组学方法揭示肠道-关节轴机制,提出微生物组指导的个性化医疗新范式 | NA | 探讨短链脂肪酸调节Th17/Treg平衡的机制及其在类风湿关节炎治疗中的应用潜力 | 类风湿关节炎患者及临床前模型 | NA | 类风湿关节炎 | 代谢组学、单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序、空间转录组学、代谢组学 | NA | NA |
| 3098 | 2025-10-05 |
Loss of Prominin 2 expression inhibits AKT/mTOR signaling to limit glycolysis and drive ferroptosis in breast cancer cells
2025-Dec, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2025.120047
PMID:40818819
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研究论文 | 本研究揭示了Prominin 2通过AKT/mTOR信号通路促进乳腺癌糖酵解和抑制铁死亡的致癌机制 | 首次发现PROM2通过与AKT相互作用激活mTOR信号通路,同时调控糖酵解和铁死亡两个关键生物学过程 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床转化价值需要进一步验证 | 阐明Prominin 2在乳腺癌中的致癌功能及分子机制 | 乳腺癌组织和细胞系 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,免疫组化,Western blot,RNA测序,GSEA,免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据,代谢指标数据 | 临床样本和细胞系(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 3099 | 2025-10-05 |
KANSL3 directs transcriptional programs essential for hepatic metabolism and differentiation
2025-Dec, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503238
PMID:41044006
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研究论文 | 本研究揭示了表观遗传调控因子KANSL3在肝细胞分化和代谢中的关键作用 | 首次发现KANSL3通过组蛋白乙酰化调控肝细胞转录网络,对肝脏发育和疾病具有重要影响 | NA | 探究KANSL3在肝脏代谢和分化中的功能机制 | 肝细胞、胆管和胎儿肝脏类器官 | 表观遗传学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3100 | 2025-10-05 |
Meiotic cohesin RAD21L shapes 3D genome structure and transcription in the male germline
2025-Oct-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv2283
PMID:41032613
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研究论文 | 本研究探讨减数分裂特异性黏连蛋白亚基RAD21L缺失对雄性生殖细胞3D基因组结构和基因表达的影响 | 首次揭示RAD21L在调控减数分裂染色质空间组织和异源染色体端粒相互作用中的关键作用 | 研究主要关注雄性生殖细胞,未涉及雌性生殖系统的相关机制 | 阐明RAD21L在精子发生过程中对3D基因组结构和转录调控的功能 | 雄性生殖细胞(精原细胞和初级精母细胞) | 基因组学 | 生殖系统疾病 | 荧光激活细胞分选, 高通量染色体构象捕获, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组三维结构数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 染色体构象捕获 | NA | NA |