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当前共找到 10780 篇文献，本页显示第 3041 - 3060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3041 | 2025-11-14 |
Osteoarthritis year in review 2025: Genetics, genomics, and epigenetics
2025-Nov, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.08.004
PMID:40848985
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综述 | 本文回顾了2024-2025年间骨关节炎在遗传学、基因组学和表观遗传学领域的研究进展 | 整合了迄今最大规模的骨关节炎遗传学研究，并融合了染色质可及性图谱、单细胞RNA测序和空间转录组学等多种方法 | 仅关注顶级风湿病学期刊的出版物，可能遗漏其他重要研究 | 总结骨关节炎在遗传学、基因组学和表观遗传学领域的最新研究进展 | 骨关节炎相关研究文献 | 基因组学 | 骨关节炎 | 文献检索与综述 | NA | 文献数据 | 从2240篇文献中筛选出42篇进行重点讨论 | NA | 染色质可及性图谱,单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 3042 | 2025-11-14 |
Multi-modal spatial characterization of tumor immune microenvironments identifies targetable inflammatory niches in diffuse large B cell lymphoma
2025-Nov, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02353-5
PMID:41120574
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研究论文 | 本研究通过多模态空间技术分析弥漫性大B细胞淋巴瘤的肿瘤免疫微环境，识别出七个不同的细胞生态位 | 首次结合空间转录组学、蛋白质组学和基因组分析，系统描绘DLBCL肿瘤免疫微环境的细胞生态位结构 | 样本量相对有限（78个肿瘤），且主要关注DLBCL特定亚型 | 揭示弥漫性大B细胞淋巴瘤肿瘤免疫微环境的细胞组成和空间组织结构 | 78个弥漫性大B细胞淋巴瘤肿瘤样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 基因组分析 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 基因组数据 | 78个DLBCL肿瘤样本 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 3043 | 2025-11-14 |
Integrated Multiomics Analysis and Mendelian Randomization Identify SIRT1 as a Pivotal Aging-Associated Gene in Meningioma
2025-Nov, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.70072
PMID:41208649
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和孟德尔随机化方法，揭示了SIRT1作为脑膜瘤中与衰老相关的关键基因 | 首次将衰老相关基因与脑膜瘤发病机制联系起来，并通过多种算法和单细胞RNA测序验证了SIRT1的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据集，需要进一步实验验证 | 探索脑膜瘤中与衰老相关的分子机制 | 脑膜瘤组织和健康组织 | 生物信息学 | 脑膜瘤 | 转录组测序,单细胞RNA测序,qRT-PCR,Western blot | LASSO,SVM,MCODE,ssGSEA | 基因表达数据,单细胞数据 | 多个GEO数据集(GSE43290,GSE54934,GSE77259,GSE183655) | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
| 3044 | 2025-11-14 |
ProjectSVR: mapping single-cell RNA-seq data to reference atlases by supported vector regression
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf586
PMID:41212590
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研究论文 | 提出基于支持向量回归的单细胞RNA测序数据参考图谱映射方法ProjectSVR | 将参考图谱映射重新定义为多目标回归任务，采用集成支持向量回归方法实现平台无关和集成独立的映射 | 需要依赖构建良好的参考图谱，在参考图谱质量不佳时可能影响映射效果 | 开发单细胞RNA测序数据到参考图谱的映射方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 支持向量回归(SVR) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3045 | 2025-11-14 |
A Review of Regulation of Leaf Margin Development: Integrating Genetic, Hormonal, and Environmental Controls
2025 Nov-Dec, Physiologia plantarum
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/ppl.70627
PMID:41219798
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综述 | 本文综述了叶片边缘发育的调控机制，整合了遗传、激素和环境控制因素 | 整合了发育与环境视角，提供了叶片形态多样性的概念框架，并指出空间转录组学和基因组编辑等新兴工具的应用前景 | 作为综述文章，不包含原始实验数据，主要基于已有研究进行综合分析和讨论 | 探讨叶片边缘发育的调控机制及其在植物适应和作物改良中的潜在应用 | 叶片边缘形态发育过程及相关调控因子 | 植物发育生物学 | NA | 空间转录组学、基因组编辑 | NA | 文献资料 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3046 | 2025-11-14 |
Swimming Through Dendritic Cell Biology: Insights From Fish Models
2025-Nov, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.70067
PMID:41222184
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综述 | 本文总结了鱼类树突状细胞的研究进展，特别关注斑马鱼模型在揭示树突状细胞进化起源和功能多样性方面的价值 | 整合进化免疫学与单细胞转录组学技术，系统揭示鱼类特有树突状细胞群体的进化保守性和物种特异性特征 | 主要依赖斑马鱼模型，其他鱼类树突状细胞研究相对缺乏 | 探索树突状细胞在非哺乳类脊椎动物中的进化发展和免疫功能 | 鱼类树突状细胞，特别是斑马鱼模型中的树突状细胞群体 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3047 | 2025-11-14 |
Distinct Layer 6b transcriptomic subtypes parcellate the cortical mantle
2025-Nov, Progress in neurobiology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.pneurobio.2025.102841
PMID:41083138
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、多重荧光原位杂交和单细胞空间转录组学技术，全面表征了大脑皮层第6b层神经元的细胞类型特性、分子异质性和空间分布 | 发现了多个具有独特分子特征的L6b亚型，并首次提供了迄今为止最广泛的L6b亚型空间分布图谱，揭示了L6b亚型在大脑皮层中的拼图式分布模式 | NA | 解析L6b神经元的细胞类型特异性特征和空间组织模式 | 大脑皮层第6b层神经元 | 空间转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 多重荧光原位杂交, 单细胞空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 450,496个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3048 | 2025-11-14 |
Collection of Human Follicular Fluid, Follicle Somatic Cells, and Immature Oocytes from Individuals Undergoing In Vitro Fertilization
2025-Oct-24, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69122
PMID:41212768
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研究论文 | 本文提出了一种从接受体外受精个体中系统收集和处理卵泡内容物的标准化方案 | 开发了无需酶解剥离的卵丘细胞分离方法，保持转录组完整性；建立了从新鲜卵泡液中制备单细胞悬液用于单细胞RNA测序的逐步方案 | NA | 利用废弃的生殖组织进行人类生育力和生殖生物学的转化研究 | 人类卵巢卵泡内容物，包括卵泡液、卵母细胞、卵丘细胞和体细胞 | 生殖生物学 | 生育障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)，体外成熟培养 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3049 | 2025-11-14 |
Exploring Sex Differences in Type 2 Diabetes via a Male-Dominant Beta-Cell Cluster from Single-Cell Pancreatic Sequencing of Public Datasets
2025-Oct, Endocrinology and metabolism (Seoul, Korea)
DOI:10.3803/EnM.2025.2297
PMID:40389209
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研究论文 | 通过分析公共单细胞数据集发现男性主导的β细胞簇，揭示2型糖尿病性别差异的分子机制 | 首次在2型糖尿病患者中鉴定出男性主导的β细胞亚群，该亚群具有独特的基因表达模式和细胞通讯特征 | 基于公共数据集进行二次分析，样本来源和数量受原始数据限制 | 探索2型糖尿病性别差异的分子基础 | 2型糖尿病患者的胰腺β细胞 | 单细胞基因组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序，轨迹推断，差异基因表达分析，基因集富集分析，细胞通讯分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据 | 来自四个公共数据集的2型糖尿病患者胰腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 3050 | 2025-11-14 |
Expression of marker genes to assess the spermatogenic capacity in patients with idiopathic non-obstructive azoospermia
2025-Oct, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03584-5
PMID:40681857
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研究论文 | 本研究开发了一种基于单细胞RNA测序的定量方法，用于评估特发性非梗阻性无精子症患者的睾丸生精能力 | 利用单细胞RNA测序技术开发了生精能力评分系统，并鉴定了与生精潜能相关的关键基因标记物 | 样本量相对较小（18名iNOA患者），需要在更大群体中进一步验证 | 开发评估特发性非梗阻性无精子症患者睾丸生精能力的可靠定量方法 | 特发性非梗阻性无精子症患者 | 单细胞测序分析 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR | 模糊聚类, 基因表达趋势分析 | 单细胞基因表达数据 | 18名iNOA患者，近4000个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3051 | 2025-11-14 |
Tick Extracellular Vesicles Alter Epidermal Keratinocyte Function
2025-Sep-05, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.08.037
PMID:40915408
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研究论文 | 本研究揭示蜱类通过细胞外囊泡改变表皮角质形成细胞功能，破坏皮肤伤口愈合机制以维持吸血行为的策略 | 首次发现蜱类通过细胞外囊泡调控宿主伤口愈合通路的新机制，涉及PI3K活性、角质形成细胞GF1和TGF-β水平的改变 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，在人类系统中的适用性需要进一步验证 | 探索吸血节肢动物如何通过细胞外囊泡调控宿主伤口愈合机制以维持吸血生存 | 三种医学相关蜱种（包括肩板硬蜱）及其与宿主表皮角质形成细胞的相互作用 | 分子生物学 | 节肢动物传播疾病 | 单细胞RNA测序, 小鼠遗传学, 体外划痕实验 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | 野生型动物模型和体外角质形成细胞培养 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3052 | 2025-11-14 |
CD38+ Endothelial Remodeling Defines Spatially Diverse Vasculopathy Programs in Rapidly Advancing Oral Inflammation
2025-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.29.667333
PMID:40766487
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间蛋白质组学揭示了快速进展性口腔炎症中CD38+内皮细胞重塑的空间特异性血管病变模式 | 首次发现CD38+内皮细胞在快速进展性口腔炎症中的空间特异性重塑模式，并开发了三重空间分析方法 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 揭示快速进展性口腔炎症的细胞机制和空间结构特征 | 种植体周围炎和重度牙周炎患者的口腔组织样本 | 单细胞生物学 | 口腔炎症疾病 | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学, 激光捕获显微切割, 微生物组分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间蛋白质组数据, 微生物组数据 | 总计59个样本，包括36个scRNA-seq样本(121,395个细胞)，15个空间蛋白质组学样本(337,260个细胞)，8个黏膜活检样本(225,137个细胞) | NA | 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 3053 | 2025-11-14 |
CellSP: Module discovery and visualization for subcellular spatial transcriptomics data
2025-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.12.632553
PMID:39868198
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研究论文 | 提出CellSP计算框架，用于识别、可视化和表征亚细胞空间转录组数据中的功能相关模式 | 引入“基因-细胞模块”新概念，能够识别多个细胞中具有协调亚细胞转录分布模式的基因集 | NA | 开发用于亚细胞空间转录组数据分析的计算工具 | 小鼠脑组织、肾脏癌和健康样本、阿尔茨海默病小鼠模型 | 空间转录组学 | 肾脏癌,阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 计算框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3054 | 2025-11-14 |
TransST: Transfer Learning Embedded Spatial Factor Modeling of Spatial Transcriptomics Data
2025-Apr-15, ArXiv
PMID:40321945
|
研究论文 | 提出一种名为TransST的新型迁移学习框架，用于改善空间转录组数据的细胞水平异质性推断 | 开发了自适应利用外部细胞标记信息的迁移学习框架，显著提升细胞亚群识别能力 | 未在摘要中明确说明 | 提高空间转录组数据中细胞水平异质性的推断准确性 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组技术 | 迁移学习框架 | 空间转录组数据 | 多个真实研究和模拟设置 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3055 | 2025-11-14 |
Efficient count-based models improve power and robustness for large-scale single-cell eQTL mapping
2025-Mar-05, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.01.18.25320755
PMID:40093202
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研究论文 | 提出了一种基于计数模型的高效单细胞eQTL定位框架jaxQTL，用于大规模单细胞转录组数据分析 | 开发了首个专门针对单细胞RNA-seq稀疏计数数据的高效eQTL定位框架，能够识别低表达eGenes和远端eQTLs | NA | 提高大规模单细胞eQTL定位的效率和准确性 | 单细胞转录组数据中的表达数量性状位点 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | 负二项模型 | 单细胞转录组计数数据 | 982个样本（OneK1K数据集） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3056 | 2025-11-14 |
Screening of Candidate Inflammatory Markers of Epithelial Cells in Hepatocellular Carcinoma based on Integration Analysis of TCGA/ICGC Databases and Single-cell Sequencing
2025, Recent patents on anti-cancer drug discovery
IF:2.5Q3
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研究论文 | 本研究通过整合分析TCGA/ICGC数据库和单细胞测序数据，筛选肝细胞癌中上皮细胞的炎症标志物并探索潜在治疗药物 | 首次结合TCGA/ICGC数据库和单细胞测序数据系统分析肝细胞癌上皮细胞炎症标志物，并通过虚拟筛选发现NADH和Deferoxamine可与炎症蛋白VIP稳定结合 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限，需要进一步体内实验确认药物疗效 | 研究肝细胞癌中上皮细胞在炎症刺激下的表达谱，识别潜在治疗药物 | 肝细胞癌患者样本数据、上皮细胞、HCC细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序、转录组分析、虚拟筛选、分子动力学模拟、体外细胞实验 | 预后模型、分子对接模型 | 转录组数据、单细胞测序数据、化合物数据库 | TCGA、ICGC和GEO数据库中的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq、转录组测序 | NA | NA |
| 3057 | 2025-11-14 |
Repetitive Trans-spinal Magnetic Stimulation Suppresses Microglia to Engulf Synapse and Promotes Nerve Repairment via cGAS-STING Signaling Pathway after Spinal Cord Injury
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.114428
PMID:41208875
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研究论文 | 本研究探讨重复经脊髓磁刺激通过cGAS-STING信号通路调控小胶质细胞突触吞噬功能促进脊髓损伤后神经修复的机制 | 首次揭示rTSMS通过抑制cGAS-STING通路调控小胶质细胞突触吞噬功能促进神经修复的新机制 | 研究仅使用大鼠模型，未在更高阶物种中验证；机制研究主要聚焦cGAS-STING通路，可能存在其他调控途径 | 探究重复经脊髓磁刺激在脊髓损伤修复中的作用机制 | 脊髓损伤模型大鼠 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,蛋白质印迹,免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,组织图像数据 | 研究使用大鼠脊髓损伤模型，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3058 | 2025-11-14 |
DPP7 promotes fatty acid β-oxidation in tumor-associated macrophages and determines immunosuppressive microenvironment in colorectal cancer
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.117909
PMID:41208881
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研究论文 | 本研究揭示DPP7通过增强脂肪酸β-氧化促进肿瘤相关巨噬细胞的M2极化，从而塑造结直肠癌免疫抑制微环境 | 首次发现DPP7通过结合CPT1A减少其泛素化降解，增强脂肪酸氧化代谢重编程，驱动免疫抑制表型 | 研究主要基于临床队列和动物模型，需要进一步验证在人类患者中的治疗潜力 | 探索肿瘤相关巨噬细胞中调控免疫抑制微环境的关键基因及其机制 | 结直肠癌患者样本、肿瘤相关巨噬细胞、骨髓来源巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,飞行时间流式细胞术,液相色谱-串联质谱,靶向脂质代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,代谢组数据,免疫荧光图像 | 华东医院和TCGA数据库的多个临床队列 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,蛋白质组学,代谢组学 | NA | NA |
| 3059 | 2025-11-14 |
TTC36-Mediated Tumor Suppression via YBX3/SPRED1 Axis Paradoxically Reduces Sorafenib Sensitivity in Hepatocellular Carcinoma
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.115727
PMID:41208883
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研究论文 | 本研究揭示了TTC36通过YBX3/SPRED1轴抑制肝细胞癌增殖但意外导致索拉非尼耐药的机制 | 首次发现TTC36通过稳定YBX3上调SPRED1抑制Ras/MAPK信号通路，同时揭示TTC36高表达通过PI3K/Akt过度激活导致索拉非尼耐药的新机制 | 未明确说明样本量具体数值，动物模型细节描述有限 | 探究TTC36在肝细胞癌中的肿瘤抑制功能及其对靶向治疗反应的影响 | 肝细胞癌组织、细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 质谱分析, 分子对接, RNA pulldown, 双荧光素酶报告基因检测, IHC染色, TUNEL染色 | 动物模型 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3060 | 2025-11-14 |
Comparative transcriptomic analysis of tumor- infiltrating canine natural killer cells and candidate biomarkers from first-in-dog NK immunotherapy trials
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1646849
PMID:41208961
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较犬类和人类肉瘤中肿瘤浸润自然杀伤细胞的转录组特征，并分析犬类NK免疫疗法临床试验中的候选生物标志物 | 首次在犬类模型中整合血液、组织和肿瘤样本进行单细胞RNA测序分析，建立犬类肉瘤浸润NK细胞特征，并将犬类组织特征用于解析首批犬类免疫疗法临床试验中的NK细胞变化 | 研究样本量有限，主要聚焦于肉瘤类型，需要进一步验证在其他癌症类型中的普适性 | 改善自然杀伤细胞在实体癌中的免疫治疗效果，并识别潜在的生物标志物 | 犬类和人类捐赠者的血液、组织和肿瘤样本中的自然杀伤细胞 | 单细胞转录组学 | 肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 犬类和人类捐赠者的多组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |