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当前共找到 10537 篇文献,本页显示第 3021 - 3040 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3021 2025-12-03
Single cell RNA-seq analysis associates Osm signaling in macrophages with osteogenic differentiation during heterotopic ossification
2025-Nov-28, Journal of orthopaedic surgery and research IF:2.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA-seq分析,揭示了巨噬细胞中Osm信号在异位骨化过程中与间充质祖细胞成骨分化的关联 发现巨噬细胞来源的Osm与异常软骨祖细胞分化相关,并识别Spi1作为早期巨噬细胞激活和Osm表达的新调控因子 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证,且单细胞测序技术可能受样本处理偏差影响 探究创伤诱导异位骨化中局部炎症微环境与间充质祖细胞成骨分化的关系 创伤诱导异位骨化小鼠模型中的间充质祖细胞和巨噬细胞 数字病理学 异位骨化 单细胞RNA-seq NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3022 2025-12-03
Exploring the impact of endocrine-disrupting chemicals on erectile dysfunction through network toxicology and machine learning
2025-Nov-28, BMC pharmacology & toxicology IF:2.8Q2
研究论文 本研究利用网络毒理学和机器学习方法,探索了内分泌干扰物对勃起功能障碍的影响机制 首次结合网络毒理学、单细胞测序和机器学习算法,系统性地识别了EDCs诱导ED的核心靶点CTNNB1和HIF1A,并通过分子对接验证了其结合亲和力 研究主要基于计算和体外模拟,缺乏临床或动物实验验证,且EDCs的具体暴露剂量和体内效应未充分探讨 阐明内分泌干扰物导致勃起功能障碍的分子机制和核心靶点 内分泌干扰物与勃起功能障碍相关的潜在靶点和信号通路 机器学习 勃起功能障碍 单细胞测序、网络毒理学、机器学习算法、分子对接 未指定具体模型,使用了三种机器学习算法 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3023 2025-12-03
A Metastasis-Competent CAF Subpopulation Defined by MFAP5⁷THY1⁷ Co-expression Drives Prostate Cancer Metastasis via EMT Activation
2025-Nov-26, Recent patents on anti-cancer drug discovery IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序识别并功能验证了一个由MFAP5⁺THY1⁺共表达定义的、具有转移能力的癌症相关成纤维细胞亚群,该亚群通过激活AKT/EMT通路驱动前列腺癌转移 首次通过单细胞RNA测序整合分析,在前列腺癌中鉴定出一个由MFAP5和THY1共表达定义的、具有转移能力的CAF亚群,并揭示了其通过分泌MFAP5激活AKT/EMT通路促进转移的机制 需要多中心队列进一步验证其临床独立性 识别并功能表征前列腺癌中具有转移能力的CAF亚群,并评估其作为预测转移进展的生物标志物潜力 前列腺癌组织样本中的癌症相关成纤维细胞 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光 NA 单细胞RNA测序数据, 组织图像数据 14个前列腺癌标本中的1,214个CAFs, 78个前列腺癌组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3024 2025-12-03
scATAnno: Automated Cell Type Annotation for Single-cell ATAC Sequencing Data
2025-Nov-24, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 本文介绍了一个名为scATAnno的Python软件包,用于自动注释单细胞ATAC测序数据的细胞类型 开发了首个专门用于大规模scATAC-seq参考图谱构建和自动细胞类型注释的工作流程,无需依赖scRNA-seq数据,并整合了KNN和加权距离不确定性评分以提高注释准确性 未明确说明软件在处理高度异质性或罕见细胞类型时的性能限制,以及计算资源需求 开发自动化工具以解决单细胞ATAC测序数据中细胞类型注释的挑战 单细胞ATAC测序数据 生物信息学 三阴性乳腺癌、基底细胞癌 单细胞ATAC测序 KNN、加权距离算法 表观基因组数据 多个数据集(包括PBMC、TNBC、BCC等) NA 单细胞ATAC-seq NA NA
3025 2025-12-03
Regional and cell specific bioactivity of injectable extracellular matrix biomaterials in myocardial infarction
2025-Nov-24, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学和单核RNA测序技术,探究了可注射细胞外基质水凝胶在心肌梗死治疗中的区域和细胞特异性生物活性 首次结合空间转录组学和单核RNA测序技术,系统解析细胞外基质生物材料在心脏治疗中的细胞特异性作用机制 研究仅使用雌性大鼠模型,未涉及雄性或其他物种,可能限制结果的普适性 探究细胞外基质水凝胶在心肌梗死治疗中的生物活性机制 雌性大鼠心肌梗死模型 数字病理学 心血管疾病 空间转录组学, 单核RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 空间转录组学, 单核RNA测序 NA NA
3026 2025-12-03
Neuroprotective role of DNTαβ Cell transplantation on modulating immune microenvironment in spinal cord injured mice
2025-Oct, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics IF:5.6Q1
研究论文 本研究探讨了DNTαβ细胞移植在脊髓损伤小鼠中通过调节免疫微环境发挥神经保护作用的机制 首次利用单细胞测序揭示DNT细胞的异质性,并验证DNTαβ细胞移植通过Gzmb和IFN通路调节免疫反应,促进脊髓损伤后的早期修复和神经保护 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验中验证,且具体分子机制需进一步深入探索 探究DNTαβ细胞移植对脊髓损伤后免疫微环境的调节作用及其神经保护效果 脊髓损伤小鼠模型 神经科学 脊髓损伤 流式细胞术、单细胞测序、转录组测序、免疫组织化学 NA 单细胞测序数据、转录组数据、流式细胞术数据、免疫组织化学图像 未明确指定样本数量,但使用小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3027 2025-12-03
Coxiella burnetii strains elicit distinct inflammatory responses in human macrophages
2025-Aug-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序,揭示了不同毒力Coxiella burnetii菌株感染人肺泡巨噬细胞后诱导的差异性炎症反应 首次在单细胞分辨率下比较不同毒力Coxiella burnetii菌株感染人巨噬细胞后的转录组差异,揭示了菌株特异性和细胞异质性对免疫应答的影响 研究仅使用人肺泡巨噬细胞,未涉及其他免疫细胞类型;体外感染模型可能无法完全模拟体内感染环境 阐明Coxiella burnetii不同菌株与宿主巨噬细胞相互作用的分子机制,为Q热治疗提供新见解 人肺泡巨噬细胞感染不同毒力Coxiella burnetii菌株(NMI、G、NMII、Dugway) 感染免疫学 Q热 RNA测序,单细胞RNA测序,细胞因子检测 NA 转录组数据,单细胞转录组数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
3028 2025-12-03
Uncovering the Regional and Cell Specific Bioactivity of Injectable Extracellular Matrix Biomaterials in Myocardial Infarction through Spatial and Single Nucleus Transcriptomics
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用空间转录组学和单核RNA测序技术,揭示了注射性细胞外基质生物材料在心肌梗死中的区域和细胞特异性生物活性 首次结合空间转录组学和单核RNA测序技术,系统探究细胞外基质水凝胶在心肌梗死治疗中的区域和细胞特异性生物活性,揭示了未发现的治疗靶点 未明确提及样本量或实验设计的局限性,可能缺乏长期疗效评估或临床转化验证 探究细胞外基质生物材料在心肌梗死治疗中的治疗活性和机制 心肌梗死模型中的心脏组织,包括巨噬细胞、成纤维细胞、淋巴管、血管、平滑肌细胞和心肌细胞等 数字病理学 心血管疾病 空间转录组学,单核RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 空间转录组学,单核RNA测序 NA NA
3029 2025-12-03
Eosinophils Enhance Granuloma-Mediated Control of Persistent Salmonella Infection
2025-Jan-03, Research square
研究论文 本研究通过小鼠模型揭示了嗜酸性粒细胞在控制鼠伤寒沙门氏菌持续性感染中的宿主保护作用 首次发现嗜酸性粒细胞通过CCL11依赖性机制被招募至肉芽肿,并在控制持续性细菌感染中发挥关键作用 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类感染中得到验证 探究嗜酸性粒细胞在宿主对抗持续性细菌感染中的作用机制 鼠伤寒沙门氏菌(Tm)感染的小鼠模型 感染免疫学 细菌感染 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
3030 2025-12-02
Neutrophil-enriched gene signature correlates with teplizumab therapy resistance in different stages of type 1 diabetes
2025-Dec-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了与teplizumab治疗1型糖尿病疗效相关的免疫基因特征,并开发了一个基于血液的26基因预测模型 首次在1型糖尿病中通过跨物种(小鼠和人类)单细胞转录组学分析,鉴定出与teplizumab治疗反应相关的特异性免疫细胞特征,特别是中性粒细胞富集特征与治疗抵抗的关联,并开发了高精度的血液基因预测模型 研究样本量相对有限,且主要基于观察性数据,需要在前瞻性队列中进一步验证预测模型的临床实用性 探究teplizumab治疗1型糖尿病疗效异质性的免疫学机制,并开发预测治疗反应的生物标志物 非肥胖糖尿病(NOD)小鼠和1型糖尿病患者的血液及胰腺样本 单细胞转录组学 1型糖尿病 单细胞转录组测序 弹性网络逻辑回归模型 单细胞RNA-seq数据 来自NOD小鼠的配对外周血和胰腺样本,以及来自AbATE和TN10临床试验的人类全血样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3031 2025-12-02
Heterogeneity of Acute Myeloid Leukemia patients explored through single-cell and single-sample gene regulatory networks
2025-Dec, Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序数据构建急性髓系白血病患者的基因调控网络,探索疾病异质性并揭示个性化治疗潜力 首次结合单细胞数据与单样本网络方法(LIONESS)构建患者特异性基因调控网络,实现完美患者区分并识别细胞类型特异性调控程序 网络构建依赖四种推断方法的一致性,可能受算法限制;样本量未明确说明,可能影响泛化性 探究急性髓系白血病在基因调控层面的异质性,为个性化治疗提供基础 急性髓系白血病患者与健康对照的祖细胞、单核细胞和树突状细胞 生物信息学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序 基因调控网络推断方法(ARACNE, CLR, MRNET, GENIE3)与LIONESS 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3032 2025-12-02
Integrating computational pathology and multi-transcriptomics to characterize glioblastoma heterogeneity and identify prognostic biomarkers
2025-Dec, Human pathology IF:2.7Q2
研究论文 本研究通过整合计算病理学和多转录组学数据,表征胶质母细胞瘤的异质性并识别预后生物标志物 创新性地结合了全切片图像的病理特征、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学数据,并开发了机器学习模型来识别与预后相关的关键基因和细胞亚群 模型在验证集上的C-index相对较低(0.616),样本量可能有限,且研究主要基于TCGA等公共数据集,需要进一步的外部验证 改善胶质母细胞瘤的预后评估并识别潜在的治疗靶点 胶质母细胞瘤(GBM)患者 计算病理学 胶质母细胞瘤 bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学 Lasso + plsRcox 图像, 转录组数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
3033 2025-12-02
Plasminogen activator inhibitor 1 promotes aortic aging-like pathophysiology in humans and mice
2025-Dec-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过人类遗传学分析和基因工程小鼠模型,揭示了纤溶酶原激活物抑制剂1(PAI-1)在促进主动脉衰老样病理生理中的作用及其机制 首次结合人类功能缺失性SERPINE1变异体的保护效应与对应基因工程小鼠模型,系统阐明PAI-1通过调控细胞外基质和血管平滑肌细胞可塑性影响血管衰老的机制 研究主要基于小鼠模型,人类数据来源于遗传变异分析,需进一步在人群中进行干预性验证 探究PAI-1在心血管衰老过程中的作用机制及作为治疗靶点的潜力 携带SERPINE1功能缺失变异的人类个体、Serpine1TA700/+基因工程小鼠、PAI-1过表达小鼠 心血管疾病研究 心血管疾病 单细胞转录组测序 基因工程小鼠模型 遗传学数据、生理学测量数据、转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及基因工程小鼠品系比较 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3034 2025-12-02
Ccn1 Mediates Pyroptosis and Purine Metabolism Pattern Shifts in a High-Uric Acid Microenvironment After Spinal Cord Injury
2025-Dec-01, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过空间代谢组学、Bulk-RNA测序和单细胞RNA测序,揭示了脊髓损伤后高尿酸微环境的存在,并发现Ccn1在该微环境中介导细胞焦亡和嘌呤代谢模式转变 首次利用空间代谢组学鉴定脊髓损伤后高尿酸微环境,并阐明Ccn1在调控细胞焦亡和嘌呤代谢中的关键作用 研究主要基于大鼠模型和PC12细胞系,人类临床相关性需进一步验证 探究脊髓损伤后微环境的代谢变化及Ccn1在其中的功能机制 SD大鼠脊髓组织和PC12细胞系 数字病理学 脊髓损伤 空间代谢组学, Bulk-RNA测序, 单细胞RNA测序 NA 代谢组数据, RNA测序数据 体外实验每组n=6, 体内实验每组n=6 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3035 2025-12-02
Targeting hexokinase 2 to induce breast cancer cell senescence
2025-Nov-30, British journal of pharmacology IF:6.8Q1
研究论文 本研究探讨了靶向己糖激酶2(HK2)诱导乳腺癌细胞衰老的潜力,并分析了衰老过程中HK2/HK1表达比例的变化 首次揭示HK2/HK1表达比例变化可作为乳腺癌细胞衰老的新标志物,并证明HK2基因敲低能直接诱导细胞衰老 研究主要基于细胞系和原发性小鼠乳腺癌细胞,临床样本验证有限;未深入探讨HK2/HK1比例变化的具体分子机制 探究靶向HK2是否能诱导癌细胞衰老,以及衰老癌细胞代谢变化是否与HK2状态相关 乳腺癌细胞系、原发性小鼠乳腺癌细胞、乳腺癌患者单细胞RNA测序数据 癌症生物学 乳腺癌 免疫印迹、免疫荧光分析、单细胞RNA测序 NA 蛋白质表达数据、单细胞RNA测序数据 未明确具体样本数量,涉及细胞系、原发性小鼠细胞和患者活检数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3036 2025-12-02
Intraperitoneal translocation of gut microbiota induces NETosis and promotes endometriosis
2025-Nov-30, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究揭示了肠道微生物通过腹腔易位触发腹膜中性粒细胞胞外陷阱形成,从而促进子宫内膜异位症发展的致病机制 首次发现肠道来源的假单胞菌易位至腹腔,通过LPS诱导MME阳性中性粒细胞亚群发生NETosis,直接捕获子宫内膜细胞并驱动病灶发展 研究主要基于小鼠模型和临床样本的关联分析,人类中的直接因果证据仍需进一步验证 阐明肠道微生物群通过腹膜中性粒细胞激活导致子宫内膜异位症的致病通路 临床腹膜液免疫细胞、异源和同源小鼠模型、患者队列的微生物溯源分析 单细胞组学与疾病机制研究 子宫内膜异位症 单细胞RNA测序、微生物溯源分析、粪便微生物移植、GFP标记细菌示踪 NA 单细胞转录组数据、微生物组数据、实验验证数据 患者队列及小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3037 2025-12-02
Fibroblasts promote the progression of benign prostatic hyperplasia through colony-stimulating factor 1 receptor-mediated RTK signaling in prostatic epithelial cells
2025-Nov-28, Molecular biomedicine IF:6.3Q1
研究论文 本研究揭示了成纤维细胞通过CSF1R介导的RTK信号通路促进良性前列腺增生(BPH)进展的机制 首次确定了成纤维细胞/CSF1R/RTK信号轴在BPH发病机制中的关键作用,并验证了RTK抑制剂(如舒尼替尼)作为BPH治疗策略的潜力 研究主要基于细胞系、类器官和小鼠模型,临床样本验证相对有限,且舒尼替尼的长期疗效和安全性需进一步评估 探究RTK信号通路在良性前列腺增生(BPH)发病机制中的作用,并寻找潜在治疗靶点 前列腺上皮细胞、成纤维细胞、BPH细胞系、类器官模型、雄激素诱导的BPH小鼠模型以及接受舒尼替尼治疗的BPH患者 数字病理学 前列腺癌 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 涉及BPH组织、细胞系、类器官、小鼠模型及患者临床数据,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3038 2025-12-02
Cathepsin L as a dual-target to mitigate muscle wasting while enhancing anti-tumor efficacy of anti-PD-L1
2025-Nov-28, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究探讨了抗PD-L1疗法在增强抗肿瘤效果的同时如何加剧肌肉消耗,并发现组织蛋白酶L(CTSL)作为双重靶点可同时抑制肿瘤进展和CD8 T细胞介导的肌肉消耗 首次通过单细胞RNA测序识别出导致肌肉消耗的组织驻留记忆样CD49a CD8 T细胞,并确定CTSL为双重靶点,能解耦抗肿瘤疗效与肌肉特异性免疫相关不良事件 研究仅在雄性荷瘤小鼠模型中进行,未涉及雌性动物或人类临床数据,且CTSL抑制的具体分子机制(如通过BNIP3下调)需进一步验证 旨在解决免疫检查点抑制剂(如抗PD-L1)在抗肿瘤治疗中引发的肌肉消耗副作用,寻找能同时维持疗效并减轻不良反应的双重靶点 荷瘤雄性小鼠模型中的肌肉组织和肿瘤组织,以及相关的CD8 T细胞 NA 癌症 单细胞RNA测序,整合转录组分析 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3039 2025-12-02
One section, two worlds: single-cell integration of MALDI-MSI and spatial transcriptomics on the same single tissue section
2025-Nov-28, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究提出了一种在同一组织切片上整合高分辨率MALDI-MSI与Xenium空间转录组学的工作流程,实现了单细胞水平代谢与转录组特征的空间对应分析 首次在同一组织切片上实现像素级对齐的MALDI-MSI与空间转录组学整合,避免了连续切片错位问题,实现了细胞功能与生化状态的精确关联 MALDI-MSI处理后每个细胞的转录本数量下降约30%,可能影响部分基因检测灵敏度 开发空间多组学整合方法以在单细胞分辨率下理解组织复杂性 小鼠脑组织和人类胶质母细胞瘤组织 空间多组学 胶质母细胞瘤 MALDI-MSI(基质辅助激光解吸电离质谱成像),空间转录组学 NA 质谱成像数据,空间转录组数据 小鼠脑组织和人类胶质母细胞瘤组织(具体样本数量未明确说明) 10x Genomics 空间转录组学 Xenium Xenium空间转录组学平台
3040 2025-12-02
Classifying the tumor immune microenvironment in cervical cancer based on nuclear cytoplasmic consistent genes
2025-Nov-28, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究基于核质一致性基因对宫颈癌的肿瘤免疫微环境进行分类,探索其在分子分型、预后评估和治疗反应预测中的潜力 首次利用核质一致性基因对宫颈癌进行风险分层,并验证其在多种上皮源性恶性肿瘤中的分类能力和预后相关性,同时评估了其在预测化疗和免疫治疗反应中的临床效用 研究主要基于TCGA等公共数据库数据,缺乏独立的前瞻性队列验证,且样本量相对有限 探索核质一致性基因在宫颈癌及其他上皮源性恶性肿瘤中的分子机制和临床意义,为精准医疗提供新的生物标志物和治疗靶点 宫颈癌患者及其他上皮源性恶性肿瘤患者 数字病理学 宫颈癌 单细胞测序, 单核RNA测序, Cox回归分析, 单样本基因集富集分析 NA 基因表达数据 TCGA-CESC队列及其他14种TCGA上皮源性恶性肿瘤队列 NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq NA NA
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