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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3001 | 2025-12-11 |
Multiple Machine Learning Models, Molecular Subtyping and Singlecell Analysis Identify PANoptosis-related Core Genes and their Association with Subtypes in Crohn's Disease
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究首次构建了克罗恩病(CD)的PANoptosis特征,并探讨了其与疾病亚型及免疫机制的关系 | 首次将PANoptosis与克罗恩病关联,并利用多种机器学习算法和单细胞分析构建了PANoptosis特征基因签名 | 未明确说明样本来源的具体平台细节,且研究基于现有数据集,可能需要进一步实验验证 | 探究PANoptosis在克罗恩病中的作用机制及其与疾病亚型的关联 | 克罗恩病患者的数据集 | 机器学习 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | LASSO, SVM, 随机森林, 决策树, 高斯混合模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3002 | 2025-12-11 |
Analyzing and Validating the Role of Genes Related to Glucagon-like Peptide-1 Signaling in the Prognosis of Pancreatic Cancer
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过分析GLP-1信号相关基因在胰腺癌中的表达和突变,开发了一个基于3个基因的RiskScore模型,用于评估胰腺癌预后,并验证了其预测准确性 | 首次将GLP-1信号通路基因与胰腺癌预后模型结合,开发了一个独立的RiskScore模型,并通过单细胞RNA-seq和免疫浸润分析揭示了其生物学机制 | 研究基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的普适性和临床应用价值 | 开发一个可靠的基于GLP-1信号的预后工具,以指导胰腺癌的治疗 | 胰腺癌患者 | 生物信息学 | 胰腺癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNA-seq) | LASSO回归, Cox回归, RiskScore模型, nomogram模型 | RNA-seq数据 | 来自UCSCXena和GEO数据库的胰腺癌患者样本,包括GSE156405队列用于单细胞分析 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3003 | 2025-12-11 |
Machine Learning-based Gene Biomarker Identification for Improving Prognosis and Therapy in Hepatocellular Carcinoma
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过整合基因表达数据、机器学习算法、肿瘤微环境分析和药物敏感性分析,识别了肝细胞癌(HCC)的七个关键基因生物标志物,并开发了HCC预后相关指数(HPRI)以改善预后和治疗指导 | 结合101种统计模型的机器学习算法筛选关键基因,并首次开发基于这些基因的HPRI指数,同时通过单细胞测序分析揭示基因在恶性细胞和成纤维细胞中的表达模式 | 研究依赖于公开数据库(ICGC、GEO、TCGA)的回顾性数据,未进行前瞻性临床验证,且样本异质性可能影响结果的普适性 | 识别肝细胞癌的分子生物标志物以改善预后预测和治疗指导 | 肝细胞癌患者及其基因表达数据 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞测序分析、Cox回归分析、差异表达分析 | 机器学习算法(包括101种统计模型) | 基因表达数据和临床病理信息 | 多个队列(来自ICGC、GEO、TCGA数据库),具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3004 | 2025-12-11 |
Single-Cell RNA Analysis Reveals Aberrant Expression of Immune-Related Genes and Transcriptional Regulation of NK Cells in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025, Critical reviews in immunology
IF:0.8Q4
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据分析,揭示了慢性阻塞性肺疾病(COPD)中自然杀伤(NK)细胞的异常表达及其转录调控机制 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,系统分析了COPD患者肺组织中NK细胞的免疫相关基因表达谱,并识别出EGR1、JUN和FOS等关键转录因子,提出了钙信号和TGF-β/Smad通路可能参与调控的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和数量未明确说明;机制推测需要进一步功能实验证实 | 探究慢性阻塞性肺疾病(COPD)中NK细胞的免疫相关基因表达特征及其转录调控机制 | COPD患者的肺组织样本(通过支气管镜活检获取) | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq) | 生物信息学分析流程(包括AUCell包、基因集富集分析、PPI网络分析等) | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 3005 | 2025-12-11 |
Metabolic reprogramming and M2 macrophage depletion define the microenvironment of adenomyosis
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1602814
PMID:41356013
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研究论文 | 本研究通过分析转录组数据,揭示了子宫腺肌症患者子宫内膜中代谢重编程和M2巨噬细胞减少的微环境特征,并确定了硫酸角质素生物合成失调的核心作用 | 首次将硫酸角质素生物合成失调与M2巨噬细胞减少及免疫代谢失衡联系起来,为子宫腺肌症的发病机制提供了新的分子机制见解 | 研究主要基于公开数据集和体外验证,样本量相对有限,且缺乏体内功能实验验证 | 阐明子宫腺肌症患者子宫内膜的代谢重编程和免疫失调机制,并识别潜在的治疗靶点或诊断标志物 | 子宫腺肌症患者的子宫内膜组织样本 | 数字病理学 | 子宫腺肌症 | 微阵列、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、RT-qPCR、免疫荧光染色 | NA | 转录组数据、单细胞数据 | 微阵列数据:3例腺肌症 vs 5例对照;bulk RNA-seq数据:6例腺肌症 vs 15例对照;单细胞RNA-seq数据:63名捐赠者的子宫内膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3006 | 2025-12-11 |
TREM2 Deficiency Regulates Macrophage Apoptosis and Repair in Radiation-Induced Skin Injury
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1018
PMID:41356595
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研究论文 | 本研究揭示了TREM2在辐射诱导皮肤损伤中调控巨噬细胞凋亡与修复的新机制 | 首次发现辐射通过ROS-NRF2-ADAM17轴导致TREM2蛋白脱落,并鉴定出ROS-NRF2-ADAM17-TREM2-ERK这一新的调控级联通路 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体组织中进行验证 | 阐明TREM2在辐射诱导皮肤损伤中调控巨噬细胞功能的分子机制 | 巨噬细胞、辐射诱导皮肤损伤小鼠模型 | 单细胞组学 | 皮肤损伤 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3007 | 2025-12-11 |
Telomere Length and Clear Cell Renal Cell Carcinoma: Unraveling Causal Mechanisms Through Integrative Genetic and Single-Cell Transcriptomic Analysis
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/3705788
PMID:41357133
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研究论文 | 本研究通过整合遗传流行病学和单细胞转录组学,探讨了端粒长度与透明细胞肾细胞癌风险之间的因果关系及其分子机制 | 首次采用多队列遗传学方法结合单细胞RNA测序,系统揭示了端粒长度与ccRCC风险的因果关联,并发现了近端肾小管细胞中端粒酶相关基因的复杂衰老动态 | 研究主要基于欧洲人群的遗传数据,可能限制了结果在其他人群中的普适性;单细胞测序样本量相对较小 | 探究端粒长度与透明细胞肾细胞癌发病风险之间的因果关系及潜在分子机制 | 透明细胞肾细胞癌患者及健康对照人群 | 生物信息学 | 肾癌 | 孟德尔随机化分析、多变量MR、共定位分析、单细胞RNA测序 | 逆方差加权法、多变量MR模型 | 遗传数据、单细胞转录组数据 | 发现队列472,174人(UK Biobank),验证队列438,351人(GWAS Catalog) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3008 | 2025-12-11 |
Changes in Nucleus Pulposus Cell Atlas and the Role of SPP1 During Intervertebral Disc Degeneration: Single-Cell Sequencing Analysis
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/5593429
PMID:41357134
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了椎间盘退变过程中髓核细胞的异质性变化,并发现SPP1在退变中的关键作用 | 首次在同一患者的椎间盘退变不同阶段应用单细胞测序技术,识别了六个髓核亚群和免疫细胞,并验证了SPP1作为退变关键分子的功能 | 研究样本可能有限,且动物和体外模型可能无法完全模拟人类椎间盘退变的复杂性 | 阐明椎间盘退变过程中髓核细胞的异质性及其分子机制 | 人类髓核细胞、大鼠椎间盘退变模型及体外人类髓核细胞退化模型 | 单细胞测序 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | Seurat包用于无监督聚类,UMAP用于可视化 | 基因表达谱数据 | 未明确指定样本数量,但涉及同一患者不同退变阶段的髓核样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3009 | 2025-12-11 |
Yang-deficiency constitution drives poor outcomes in clear cell renal cell carcinoma by modulating the tumour immune microenvironment
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1673579
PMID:41357186
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研究论文 | 本研究探讨了中医阳虚体质如何通过调节肿瘤免疫微环境影响肾透明细胞癌的预后 | 首次将中医体质学说(阳虚体质)与肾透明细胞癌的免疫微环境及预后联系起来,并整合了多组学数据与机器学习方法,提出了一个基于体质的生物标志物发现和中药筛选框架 | 研究样本量有限,特别是阳虚体质分类的个体数量较少;单细胞RNA-seq数据仅来自少数样本;需要进一步的体内外实验验证 | 阐明阳虚体质对肾透明细胞癌免疫景观和临床结局的影响,并识别新的预后生物标志物和潜在的中药治疗剂 | 肾透明细胞癌患者、中医阳虚体质分类个体、外周血单个核细胞、肿瘤组织 | 生物信息学, 计算生物学 | 肾透明细胞癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 差异表达分析, WGCNA, 机器学习生存建模, ESTIMATE, CIBERSORT, CellChat, GSVA, 分子对接 | 机器学习生存模型 | 转录组数据, 单细胞RNA-seq数据 | 12名阳虚体质分类个体, 530名肾透明细胞癌患者, 1个PBMC样本, 2个ccRCC肿瘤样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3010 | 2025-12-11 |
Deciphering the let-7c-5p/RRM2 axis in lung adenocarcinoma: expression, prognosis, and immune landscape implications
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1628429
PMID:41357570
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研究论文 | 本研究探讨了RRM2在肺腺癌中的表达模式、临床意义及调控机制,并揭示了let-7c-5p/RRM2轴在肿瘤进展和免疫微环境中的作用 | 首次系统性地阐明了let-7c-5p作为RRM2上游调控因子在肺腺癌中的作用,并揭示了RRM2与免疫细胞浸润的相关性 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内实验验证,且临床样本的多样性可能受限 | 阐明RRM2在肺腺癌中的表达模式、临床意义、调控机制及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 肺腺癌组织、正常肺组织、肺腺癌细胞系 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、体外细胞实验、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞RNA测序数据 | 基于公共数据库(如TCGA)的肺腺癌和正常组织样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3011 | 2025-12-11 |
Integrated Genomic and Functional Characterization of Palmitoylation in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/4647115
PMID:41357761
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与机器学习算法,构建了基于棕榈酰化相关基因的预后模型,揭示了其在透明细胞肾细胞癌预后分层和免疫治疗预测中的价值,并实验验证了关键基因ZDHHC18的促癌功能 | 首次系统性地将棕榈酰化修饰与ccRCC的预后和免疫治疗反应相关联,并整合101种机器学习算法构建稳健的预后模型,同时通过单细胞测序解析肿瘤微环境异质性 | 研究主要基于公共数据集,需要更多独立队列验证;实验验证仅针对ZDHHC18基因,其他模型基因的功能有待进一步探索 | 探究棕榈酰化修饰在透明细胞肾细胞癌中的预后价值和免疫治疗预测作用 | 透明细胞肾细胞癌患者的多组学数据、肿瘤细胞系(786-O和Caki-1) | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序、基因组分析(TMB、CNV)、机器学习算法整合 | 集成101种机器学习算法的预后模型 | 基因组数据、转录组数据、单细胞测序数据 | 多个公共ccRCC数据集(具体样本数未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3012 | 2025-12-11 |
TLR4 Induces PANoptosis in Annulus Fibrosus Cells by Activating NLRP12 in Intervertebral Disc Degeneration
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S556950
PMID:41357845
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研究论文 | 本研究揭示了TLR4通过激活NLRP12诱导纤维环细胞发生PANoptosis,从而推动椎间盘退变进程 | 首次在纤维环细胞中鉴定出PANoptosis的发生,并阐明了TLR4-NLRP12轴在这一过程中的调控作用 | 研究主要基于细胞和动物模型,其结论在人体中的普适性有待进一步验证 | 探究TLR4-NLRP12轴如何调控纤维环细胞的PANoptosis并影响椎间盘退变进展 | 纤维环细胞、大鼠椎间盘退变模型 | 单细胞组学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序、Western blot、TUNEL染色、流式细胞术、X射线成像、组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质印迹数据、成像数据、流式数据 | 健康与退变的纤维环组织(用于scRNA-seq)、体外培养的纤维环细胞、大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3013 | 2025-12-11 |
Acetylcholine in the gingival epithelium drives the pathogenesis of periodontitis
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1701252
PMID:41358003
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研究论文 | 本研究揭示了乙酰胆碱在牙周炎发病机制中的复杂作用,并提出了一个新的“神经-上皮-免疫轴”概念 | 首次利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了牙龈上皮在牙周炎状态下神经信号通路的功能重编程,并明确了乙酰胆碱在牙周炎中兼具保护上皮屏障和驱动炎症破坏的双重作用 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型,其在人体内的直接作用和临床转化效果仍需进一步验证 | 探究神经递质乙酰胆碱在牙周炎发病机制中的作用 | 人类牙龈样本、人类口腔角质形成细胞(HOKs)、小鼠牙周炎模型 | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 205,334个细胞(来自40个人类牙龈样本),46,230个25 μm²空间转录组点 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 3014 | 2025-12-11 |
Multi-omics integration analysis based on plasma circulating proteins reveals potential therapeutic targets for ulcerative colitis
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1686282
PMID:41358199
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,识别了溃疡性结肠炎的潜在诊断和治疗生物标志物 | 结合孟德尔随机化、差异表达分析和多种机器学习算法,系统筛选核心枢纽基因,并构建了诊断模型和调控网络 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证核心基因的生物学功能 | 识别溃疡性结肠炎的诊断和治疗生物标志物 | 溃疡性结肠炎患者数据和小鼠模型 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 孟德尔随机化、差异表达分析、机器学习算法、单细胞RNA测序、RT-qPCR | 机器学习算法(未指定具体类型)、列线图模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、单细胞测序数据 | 未明确指定样本数量,涉及公共数据库数据和DSS诱导的UC小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3015 | 2025-12-11 |
Prognostic model for lung adenocarcinoma based on experimental drug-resistant cell lines and clinical patients
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1654426
PMID:41358202
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研究论文 | 本研究通过整合体外耐药细胞系数据和临床患者信息,构建了一个基于免疫微环境特征和体外耐药机制的肺腺癌预后模型 | 首次将体外实验建立的EGFR-TKIs耐药细胞系(厄洛替尼、吉非替尼、奥希替尼耐药)的RNA测序数据与TCGA-LUAD临床数据相结合,构建了一个3基因(PPP1R3G, CREG2, LYPD3)风险评分模型,并利用单细胞RNA-seq数据解析了EGFR突变型与野生型肿瘤的表达模式 | 模型仅在公开数据集(TCGA)和体外细胞系中进行验证,缺乏大规模前瞻性临床队列的独立验证 | 开发一个整合免疫微环境特征和体外耐药机制的预后模型,以预测肺腺癌患者对EGFR-TKIs的治疗反应和生存结局,并指导个体化治疗策略 | 肺腺癌(LUAD)患者、HCC827肺腺癌细胞系及其EGFR-TKIs(厄洛替尼、吉非替尼、奥希替尼)耐药衍生株 | 生物信息学与计算生物学 | 肺癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、RT-PCR、LASSO-COX回归分析、基因集变异分析(GSVA) | LASSO-COX比例风险模型、列线图(Nomogram) | 基因表达数据、临床数据 | TCGA-LUAD数据集中的肺腺癌患者样本、HCC827细胞系及其耐药衍生株(厄洛替尼耐药、吉非替尼耐药、奥希替尼耐药)、单细胞RNA-seq数据集GSE241934 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3016 | 2025-12-10 |
Multi-omics reveals that genes linked to succinylation regulate the onset of epilepsy through metabolic reprogramming
2025-Dec-08, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10180-6
PMID:41361022
|
研究论文 | 本研究结合孟德尔随机化和单细胞转录组技术,揭示了琥珀酰化相关基因CTBP1通过代谢重编程和神经元异质性调控促进癫痫发生的新机制 | 首次整合多组学证据,将琥珀酰化修饰基因CTBP1、血浆代谢物失调与癫痫风险联系起来,并利用单细胞转录组学在细胞类型特异性层面解析了其调控网络 | 研究主要基于观察性数据和遗传工具变量分析,因果关系的确立仍需后续实验验证;单细胞数据仅来源于颞叶,可能无法完全代表其他脑区 | 探究琥珀酰化修饰相关基因、血浆代谢物与癫痫之间的因果关系及潜在代谢介导通路 | 癫痫患者(具体样本数未明确提及)的遗传数据、血浆代谢物数据及颞叶单细胞转录组数据 | 生物信息学,多组学整合分析 | 癫痫 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序 | NA | 遗传数据(eQTL),血浆代谢物数据,单细胞转录组数据 | NA(使用了公开数据库eQTLGen和血浆代谢物数据库,以及癫痫患者颞叶单细胞数据,但具体样本数未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3017 | 2025-12-10 |
distQTL: distribution quantitative trait loci identification by population-scale single-cell data
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf155
PMID:41323105
|
研究论文 | 本文提出了一种名为distQTL的新方法,利用Fréchet回归和群体规模单细胞RNA测序数据来识别分布定量性状位点 | 该方法首次将Fréchet回归应用于单细胞eQTL分析,使用完整的经验分布作为响应对象,而非简单的汇总统计量如均值,从而能更精细地解析转录调控异质性 | NA | 研究遗传变异如何影响基因表达,特别是通过识别分布定量性状位点来揭示细胞类型特异性调控 | 来自982名供者的外周血单个核细胞的单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | Fréchet回归 | 单细胞RNA测序数据 | 982名供者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3018 | 2025-12-10 |
Long-read sequencing transcriptome quantification with lr-kallisto
2025-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013692
PMID:41325434
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研究论文 | 本文介绍了lr-kallisto,一种用于长读长测序数据的转录本定量方法,旨在解决转录异构体准确量化的问题 | 开发了lr-kallisto,将kallisto方法适配于长读长技术,并证明外显子捕获能提高定量准确性 | 未明确提及具体样本量或实验验证范围,可能受限于长读长数据特性和遗传变异复杂性 | 实现长读长测序数据中转录异构体的快速准确定量 | RNA转录本,特别是全长转录异构体 | 自然语言处理 | NA | ONT长读长测序,外显子捕获 | kallisto适配模型 | 长读长RNA测序数据 | NA | Oxford Nanopore Technologies | 长读长RNA测序 | ONT平台 | Oxford Nanopore长读长测序技术,结合外显子捕获 |
| 3019 | 2025-12-10 |
GPC3-based circular RNA vaccine suppresses hepatocellular carcinoma progression by activating adaptive immune responses
2025-Nov-07, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001605
PMID:41201153
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研究论文 | 本研究开发了一种基于环状RNA(circRNA)的靶向GPC3的肝癌疫苗,并通过结合TLR4激动剂佐剂,在小鼠模型中验证了其抑制肿瘤进展、激活适应性免疫应答的疗效和机制 | 首次开发了靶向GPC3的circRNA癌症疫苗,克服了传统mRNA疫苗的不稳定性和递送效率问题,并通过结合TLR4佐剂增强了抗肿瘤免疫应答 | 研究主要基于小鼠模型,其疗效和安全性在人体中尚未验证;机制研究虽深入,但临床转化路径仍需探索 | 开发一种更稳定、高效的circRNA癌症疫苗,用于治疗肝细胞癌(HCC) | 肝细胞癌(HCC)及其肿瘤微环境(TME) | 免疫治疗,癌症疫苗 | 肝细胞癌 | 环状RNA疫苗设计,TLR4激动剂佐剂,多重免疫荧光,单细胞测序,空间转录组学,质谱流式细胞术 | NA | 测序数据,成像数据,流式细胞数据 | 小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 3020 | 2025-12-10 |
Atomistic TCR-ligand interactions instruct memory T-cell differentiation
2025-Nov-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.05.686789
PMID:41279151
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组测序、TCR-pMHC相互作用的生物物理测量和结构分析,揭示了T细胞受体(TCR)与配体之间的原子水平相互作用如何指导记忆T细胞的分化命运 | 首次在分子水平上系统地将TCR的机械转导特性(如力依赖性结合)与记忆T细胞亚群(TCM与TEM)的分化联系起来,并提出了“双极性”克隆型的概念 | 研究基于小鼠模型和单一的流感病毒表位(NP),其在人类其他病原体或癌症抗原中的普适性仍需验证 | 阐明初始CD8 T细胞在抗原刺激后分化为不同记忆T细胞亚群(中央记忆TCM与效应记忆TEM)的分子机制 | 242个小鼠CD8 TCRαβ克隆型,这些克隆特异性识别由H-2D呈递的流感A病毒(IAV)免疫显性表位NP | 免疫学 | 传染病(流感病毒感染) | 单细胞转录组测序、TCR测序、生物物理测量(力依赖性相互作用)、结构分析 | NA | 转录组数据、序列数据、生物物理测量数据、结构数据 | 242个小鼠CD8 TCRαβ克隆型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |