单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
3001	2025-01-16	Spatial and Single-Cell Analyses Reveal Heterogeneity of DNAM-1 Receptor-Ligand Interactions That Instructs Intratumoral γδT-cell Activity 2025-Jan-15, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1509 PMID:39514370	研究论文	本研究探讨了肿瘤细胞配体CD112和CD155与γδT细胞上的激活受体DNAM-1之间的相互作用如何调节γδT细胞的激活，并揭示了这些相互作用在肿瘤微环境中的异质性	通过空间和单细胞RNA测序以及空间代谢组学分析，揭示了CD112和CD155在肿瘤中的表达水平和定位的异质性，并发现这些异质性与疾病预后和患者生存相关	研究主要聚焦于神经母细胞瘤，可能不适用于其他类型的肿瘤	研究肿瘤细胞与γδT细胞之间的相互作用如何影响疾病进展和免疫治疗结果	神经母细胞瘤中的肿瘤细胞和γδT细胞	肿瘤免疫学	神经母细胞瘤	空间和单细胞RNA测序，空间代谢组学分析	NA	RNA测序数据，代谢组学数据	NA
3002	2025-01-16	Single cell transcriptomics in blood of patients with chronic obstructive pulmonary disease 2025-Jan-14, BMC pulmonary medicine IF:2.6Q2 DOI:10.1186/s12890-024-03475-y PMID:39810158	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者外周血中的基因表达差异	首次在COPD患者外周血中应用单细胞RNA测序技术，揭示了单核细胞/巨噬细胞中的基因表达差异	样本量较小，仅包括7名健康对照和8名COPD患者	研究COPD患者外周血中的基因表达差异	COPD患者和健康对照的外周血单核细胞	生物信息学	慢性阻塞性肺疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	7名健康对照和8名COPD患者
3003	2025-01-16	Single-cell transcriptomics unveils multifaceted immune heterogeneity in early-onset versus late-onset cervical cancer 2025-Jan-14, World journal of surgical oncology IF:2.5Q1 DOI:10.1186/s12957-025-03654-z PMID:39810181	研究论文	本文通过单细胞转录组数据分析，揭示了早发型和晚发型宫颈癌在免疫异质性上的多方面差异	首次在单细胞水平上比较了早发型和晚发型宫颈癌的免疫架构，揭示了两种亚型在免疫细胞表型和功能上的显著差异	样本量较小（4例早发型和4例晚发型宫颈癌），可能影响结果的普遍性	比较早发型和晚发型宫颈癌的免疫异质性，为年龄定制的免疫治疗策略提供依据	早发型和晚发型宫颈癌患者的单细胞转录组数据	数字病理学	宫颈癌	单细胞转录组测序	NA	单细胞转录组数据	4例早发型和4例晚发型宫颈癌样本
3004	2025-01-16	Metabolically activated and highly polyfunctional intratumoral VISTA+ regulatory B cells are associated with tumor recurrence in early-stage NSCLC 2025-Jan-14, Molecular cancer IF:27.7Q1 DOI:10.1186/s12943-024-02209-2 PMID:39810191	研究论文	本研究探讨了非小细胞肺癌（NSCLC）肿瘤微环境中B细胞表型、生物能量学及其与T细胞相互作用的复杂景观	揭示了VISTA+调节性B细胞在NSCLC肿瘤微环境中的代谢活性和多功能性，并发现其与肿瘤复发相关	研究主要基于实验数据，尚未进行临床验证	研究NSCLC肿瘤微环境中B细胞与T细胞的相互作用及其对肿瘤复发的影响	非小细胞肺癌（NSCLC）患者肿瘤微环境中的B细胞和T细胞	肿瘤免疫学	肺癌	多色流式细胞术、质谱流式细胞术、空间转录组学	NA	细胞表型数据、代谢数据、空间定位数据	NSCLC患者的肿瘤微环境样本
3005	2025-01-16	Predictive value of dendritic cell-related genes for prognosis and immunotherapy response in lung adenocarcinoma 2025-Jan-14, Cancer cell international IF:5.3Q1 DOI:10.1186/s12935-025-03642-z PMID:39810206	研究论文	本研究通过筛选树突状细胞相关基因，构建了一个预测肺腺癌患者预后和免疫治疗反应的预后标志物	创新性地建立了基于深度学习的预测模型DCRGS，用于预测肺腺癌患者的预后，并展示了其在临床管理中的潜在应用	研究依赖于特定数据集，可能需要在更广泛的患者群体中进行验证	预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应	肺腺癌患者	数字病理	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序、实时定量PCR（q-PCR）	深度学习模型	RNA测序数据、临床样本数据	未明确提及具体样本数量
3006	2025-01-16	SenPred: a single-cell RNA sequencing-based machine learning pipeline to classify deeply senescent dermal fibroblast cells for the detection of an in vivo senescent cell burden 2025-Jan-14, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-024-01418-0 PMID:39810225	研究论文	本文介绍了一种基于单细胞RNA测序的机器学习流程SenPred，用于分类深度衰老的皮肤成纤维细胞，以检测体内衰老细胞负担	SenPred是首个利用单细胞转录组学数据，结合2D和3D培养的成纤维细胞，来预测体内衰老成纤维细胞的机器学习流程	SenPred在检测人类皮肤成纤维细胞的衰老方面有效，但不适用于肺成纤维细胞或整个皮肤的衰老检测	开发一种能够准确检测体内衰老成纤维细胞负担的机器学习模型	深度衰老的皮肤成纤维细胞	机器学习	老年疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	机器学习模型	单细胞转录组数据	2D和3D培养的深度衰老成纤维细胞
3007	2025-01-16	TIMP1 Mediates Astrocyte-Dependent Local Immunosuppression in Brain Metastasis Acting on Infiltrating CD8+ T Cells 2025-Jan-13, Cancer discovery IF:29.7Q1 DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-0134 PMID:39354883	研究论文	本文通过单细胞RNA测序分析了脑转移瘤相关星形胶质细胞的异质性，并发现了一类能够阻断浸润T细胞抗肿瘤活性的星形胶质细胞群体	揭示了星形胶质细胞通过分泌TIMP1介导局部免疫抑制的新机制，并提出了结合免疫检查点阻断和抑制星形胶质细胞介导的免疫抑制的联合治疗策略	研究主要基于小鼠和人类脑转移模型，尚未在临床大规模验证	探讨脑转移瘤中星形胶质细胞对免疫反应的调节机制，并开发新的治疗策略	脑转移瘤中的星形胶质细胞和浸润的CD8+ T细胞	肿瘤免疫学	脑转移瘤	单细胞RNA测序	小鼠和人类脑转移模型	RNA测序数据	NA
3008	2025-01-16	Integrative analysis of Ewing's sarcoma reveals that the MIF-CD74 axis is a target for immunotherapy 2025-Jan-13, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1 DOI:10.1186/s12964-024-02020-y PMID:39800691	研究论文	本文通过对尤文肉瘤的综合分析，揭示了MIF-CD74轴作为免疫治疗靶点的潜力	首次通过单细胞RNA测序、细胞功能实验和人源化模型综合分析尤文肉瘤的免疫调节相互作用，并确定MIF-CD74轴为关键免疫调节靶点	研究主要基于实验室模型和初步临床样本，需要进一步的大规模临床试验验证	寻找尤文肉瘤的免疫治疗新靶点	尤文肉瘤的免疫微环境	数字病理学	骨癌	单细胞RNA测序	人源化模型	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量，但涉及配对样本分析
3009	2025-01-16	Neutrophil adhesion to vessel walls impairs pulmonary circulation in COVID-19 pathology 2025-Jan-13, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-55272-0 PMID:39805823	研究论文	本文研究了SARS-CoV-2感染引起的小鼠严重肺炎模型中，中性粒细胞与血管壁的粘附如何导致肺循环障碍	通过体内双光子成像系统揭示了中性粒细胞粘附在COVID-19严重程度中的作用机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨COVID-19严重程度与微血栓形成之间的详细机制	SARS-CoV-2感染的小鼠模型和COVID-19患者的外周血单核细胞	病理学	COVID-19	体内双光子成像系统、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	小鼠模型	图像数据、基因表达数据	SARS-CoV-2感染的小鼠模型和COVID-19患者的外周血单核细胞样本
3010	2025-01-16	Integrin α8 is a useful cell surface marker of alveolar lipofibroblasts 2025-Jan-13, Respiratory research IF:4.7Q1 DOI:10.1186/s12931-025-03103-1 PMID:39806390	研究论文	本文通过细胞表面标记物对小鼠肺成纤维细胞进行分类，并分析了不同亚群的特性，特别是肺泡脂成纤维细胞的特性	首次使用适用于野生型小鼠肺的细胞表面标记物对PDGFRα+肺成纤维细胞进行分类，并发现ITGA8+成纤维细胞与肺泡脂成纤维细胞相对应	需要进一步研究以区分肺成纤维细胞亚群的功能差异	研究小鼠肺成纤维细胞的异质性，特别是肺泡脂成纤维细胞的特性	小鼠肺成纤维细胞	细胞生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	野生型小鼠肺组织
3011	2025-01-15	Toll-like receptor agonists promote the formation of tertiary lymphoid structure and improve anti-glioma immunity 2025-Jan-12, Neuro-oncology IF:16.4Q1 DOI:10.1093/neuonc/noae167 PMID:39188155	研究论文	本研究探讨了通过Toll样受体激动剂在胶质瘤微环境中诱导三级淋巴结构形成，以增强抗胶质瘤免疫力的治疗策略	首次在胶质瘤微环境中成功诱导三级淋巴结构形成，并揭示了其增强抗胶质瘤免疫力的机制	初步临床研究样本量较小，需进一步验证	探索胶质瘤微环境中三级淋巴结构形成的治疗策略，以增强抗胶质瘤免疫力	胶质瘤微环境中的免疫细胞	肿瘤免疫学	胶质瘤	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、BCR/TCR测序	NA	基因表达数据、免疫细胞数据	胶质瘤小鼠模型及初步临床研究样本
3012	2025-01-16	Prospects of neutrophilic implications against pathobiology of chronic obstructive pulmonary disease: Pharmacological insights and technological advances 2025-Jan-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2024.113634 PMID:39577220	review	本文探讨了中性粒细胞在慢性阻塞性肺疾病（COPD）中的关键作用，强调了针对中性粒细胞的新型治疗方法的紧迫性，并探讨了利用单细胞RNA测序技术进一步研究中性粒细胞及相关风险基因作为COPD治疗潜在生物标志物的可能性	强调了针对中性粒细胞的新型治疗方法的紧迫性，并探讨了利用单细胞RNA测序技术研究中性粒细胞及相关风险基因作为COPD治疗潜在生物标志物的可能性	NA	探讨中性粒细胞在COPD中的作用，并探索新的治疗方法	中性粒细胞及其在COPD中的生物学活动	digital pathology	lung cancer	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	NA
3013	2025-01-16	Gonadal sex and temperature independently influence germ cell differentiation and meiotic progression in Trachemys scripta 2025-Jan-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2413191121 PMID:39793067	研究论文	本研究探讨了温度对红耳滑龟生殖细胞分化和减数分裂进程的直接影响，独立于性腺的性别决定	揭示了温度对生殖细胞性分化的直接影响，独立于性腺体细胞的性别决定，这在温度依赖性性别决定（TSD）物种中是一个新的发现	研究仅限于红耳滑龟这一TSD模型物种，可能不适用于其他物种	研究温度对生殖细胞分化和性别身份的直接影响	红耳滑龟的生殖细胞	生殖生物学	NA	单细胞转录组分析	NA	转录组数据	NA
3014	2025-01-16	Impact of potential biomarkers, SNRPE, COX7C, and RPS27, on idiopathic Parkinson's disease 2025-Jan, Genes & genomics IF:1.6Q3 DOI:10.1007/s13258-024-01591-x PMID:39467967	研究论文	本研究通过生物信息学方法识别了与特发性帕金森病（IPD）相关的关键基因和分子机制，并验证了潜在的生物标志物	首次在全血样本中识别出SNRPE、COX7C和RPS27作为IPD的潜在生物标志物，并通过单细胞RNA测序数据集验证了这些基因在黑质中的表达模式	研究主要依赖于生物信息学分析，需要进一步的实验验证以确认这些生物标志物的临床适用性	识别适用于特发性帕金森病（IPD）的生物标志物	特发性帕金森病（IPD）患者	生物信息学	帕金森病	基因表达分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、差异甲基化区域分析、差异表达microRNA分析、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据、甲基化数据、microRNA数据、单细胞RNA测序数据	124个差异表达基因（DEGs）
3015	2025-01-16	Efficient Predictor for Immunotherapy Efficacy: Detecting Pan-Clones Effector Tumor Antigen-Specific T Cells in Blood by Nanoparticles Loading Whole Tumor Antigens 2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202409913 PMID:39498880	研究论文	本文提出了一种通过纳米颗粒负载全肿瘤抗原来激活和检测血液中泛克隆效应肿瘤抗原特异性T细胞（ETASTs）的方法，用于预测免疫治疗的疗效	利用纳米颗粒负载全肿瘤抗原来激活和检测血液中的ETASTs，提供了一种高精度、特异性、非侵入性且高效的生物标志物，用于预测免疫治疗的疗效	NA	开发一种高效的方法来预测免疫治疗的疗效	血液中的泛克隆效应肿瘤抗原特异性T细胞（ETASTs）	生物医学工程	肺癌	纳米颗粒负载全肿瘤抗原	NA	血液样本	肺癌患者、健康个体和良性肺结节患者的血液样本
3016	2025-01-16	scPharm: Identifying Pharmacological Subpopulations of Single Cells for Precision Medicine in Cancers 2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202412419 PMID:39560158	研究论文	本文介绍了一种名为scPharm的计算框架，该框架整合了药理学特征和单细胞RNA测序数据，以识别肿瘤内的药理学亚群并优先选择定制药物	scPharm通过整合药理学特征和单细胞RNA测序数据，首次在单细胞分辨率下识别肿瘤内的药理学亚群，并优先选择定制药物	NA	研究目的是通过单细胞分辨率揭示肿瘤内的治疗异质性，为癌症精准医学提供新方法	ER阳性和HER2阳性的人类乳腺癌组织、人类PC9细胞、小鼠模型	数字病理学	癌症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞RNA测序数据	ER阳性和HER2阳性的人类乳腺癌组织、人类PC9细胞、小鼠模型
3017	2025-01-16	Cryptotanshinone alleviates immunosuppression in endometriosis by targeting MDSCs through JAK2/STAT3 pathway 2025-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2024.156227 PMID:39580997	研究论文	本研究探讨了隐丹参酮（CTS）通过JAK2/STAT3信号通路调节髓源性抑制细胞（MDSCs）在子宫内膜异位症（EMS）中的治疗潜力及其对免疫微环境和病变生长的影响	首次证明隐丹参酮通过抑制MDSCs积累和调节MDSCs介导的免疫反应，成为治疗EMS的有前景的天然化合物	研究中使用的C57BL/6J小鼠模型可能无法完全模拟人类EMS的复杂性	探讨隐丹参酮通过JAK2/STAT3信号通路调节MDSCs的治疗潜力及其对EMS免疫微环境和病变生长的影响	子宫内膜异位症（EMS）患者和小鼠模型	生物医学	子宫内膜异位症	转录组数据分析、单细胞RNA测序、网络药理学分析、表面等离子体共振（SPR）、细胞热转移实验（CETSA）、流式细胞术、免疫荧光、Western blot	C57BL/6J小鼠模型	转录组数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质数据	EMS患者样本和小鼠模型
3018	2025-01-16	Qingfei Yin alleviates Streptococcus pneumoniae pneumonia by promoting complete autophagy to suppress necroptosis 2025-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2024.156280 PMID:39637472	研究论文	本研究探讨了清肺饮（QFY）通过促进完全自噬来抑制坏死性凋亡，从而缓解肺炎链球菌引起的肺炎的机制	首次揭示了清肺饮通过下调p62表达促进完全自噬，进而缓解肺炎链球菌诱导的肺上皮细胞坏死性凋亡的分子机制	研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人体中进行验证	探索清肺饮治疗肺炎链球菌肺炎的机制	肺炎链球菌引起的肺炎	生物医学	肺炎	单细胞转录组学、HE染色、免疫荧光、AO染色、PI染色、Western blot分析	小鼠肺炎模型、TC-1细胞模型	基因表达数据、细胞图像数据	113,353个细胞
3019	2025-01-16	Decoding the role of SLC25A5 in osteosarcoma drug resistance and CD8+ T cell exhaustion: The therapeutic potential of phyllanthin 2025-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2024.156291 PMID:39752785	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序数据集全面分析肿瘤免疫微环境，探讨了SLC25A5在骨肉瘤药物耐药性和CD8+ T细胞耗竭中的作用，并提出了Phyllanthin作为潜在治疗药物的可能性	首次揭示了SLC25A5在骨肉瘤中的致病作用，并通过单细胞时空进化研究，提出了Phyllanthin作为治疗骨肉瘤的新策略	研究主要基于单细胞RNA测序数据，需要进一步的体内实验验证	探讨骨肉瘤的发病机制，特别是药物耐药性和免疫逃逸的分子机制	骨肉瘤细胞和CD8+ T细胞	数字病理学	骨肉瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	多个单细胞RNA测序数据集
3020	2025-01-16	Spatial and Single-Cell Transcriptomics Unraveled Spatial Evolution of Papillary Thyroid Cancer 2025-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202404491 PMID:39540244	研究论文	本文通过整合单细胞RNA测序和空间分辨转录组学，揭示了乳头状甲状腺癌的空间异质性、恶性和转移机制	结合单细胞RNA测序和空间分辨转录组学，首次在空间和单细胞水平上解析了乳头状甲状腺癌的肿瘤内空间异质性和进化机制	NA	研究乳头状甲状腺癌的空间异质性、恶性和转移机制	乳头状甲状腺癌细胞	数字病理学	甲状腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间分辨转录组学（SRT）	NA	转录组数据，形态学数据	NA