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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3001 | 2026-01-10 |
EDNRB2 regulates fate, migration, and maturation of hair cell precursors in regenerating avian auditory epithelium explants
2025-Jul-15, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2502713122
PMID:40627393
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研究论文 | 本研究揭示了EDNRB2在鸟类听觉上皮毛细胞再生过程中对前体细胞命运、迁移和成熟的关键调控作用 | 首次发现EDNRB2在鸟类听觉上皮毛细胞再生过程中特异性高表达,并系统阐明了其信号通路在毛细胞前体细胞命运决定、迁移和成熟中的调控机制 | 研究基于鸟类模型,其发现向哺乳动物(如人类)耳蜗的转化应用仍需进一步验证 | 揭示EDNRB2在鸟类听觉上皮毛细胞再生中的具体作用机制 | 鸟类听觉上皮(基底乳头)的毛细胞前体细胞 | 发育生物学与再生医学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序,RNA测序,组织学评估 | NA | 基因表达数据,组织学图像 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3002 | 2026-01-10 |
Lysophosphatidylcholine as a Novel Diagnostic Biomarker in Kawasaki Disease: Based on Immunometabolism-Related Signature
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S567612
PMID:41497533
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研究论文 | 本研究通过代谢组学和单细胞RNA测序技术,探索川崎病中脂质代谢紊乱,并鉴定出溶血磷脂酰胆碱作为新型诊断生物标志物 | 首次将溶血磷脂酰胆碱(LPC)鉴定为川崎病的潜在诊断生物标志物,并结合单细胞RNA测序揭示了单核细胞中脂质代谢相关基因与炎症反应的关联 | 研究样本量有限,未进行大规模队列验证,且LPC作为生物标志物的敏感性和特异性有待进一步提高 | 探索川崎病的代谢紊乱机制并寻找新型诊断生物标志物 | 川崎病患者 | 数字病理学 | 川崎病 | 非靶向代谢组学、靶向脂质组学、ELISA、单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据、脂质组数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3003 | 2026-01-10 |
Single-Cell Sequencing Uncovers a TMSB10-Expressing Fibroblast Subpopulation Driving Renal Fibrosis in Diabetic Nephropathy
2025, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S559695
PMID:41497884
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,识别并验证了在糖尿病肾病中驱动肾纤维化的TMSB10高表达成纤维细胞亚群 | 首次在糖尿病肾病中鉴定出TMSB10高表达的成纤维细胞亚群,并揭示其通过TGF-β/SMAD通路调控纤维化的新机制 | 样本量有限,且使用小鼠成纤维细胞模型进行验证,需在人类原代细胞中进一步确认 | 阐明糖尿病肾病中肾纤维化的细胞和分子驱动因素 | 人类糖尿病肾病及对照肾脏样本,以及NIH-3T3成纤维细胞和糖尿病小鼠模型 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 公开可用的单细胞RNA测序数据集(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3004 | 2026-01-10 |
Single-Cell Transcriptomics Reveal Microenvironment Alterations in Canine Peri-Implantitis
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/9937505
PMID:41498023
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研究论文 | 本研究通过建立犬类种植体周围炎模型,利用单细胞RNA测序技术首次在单细胞分辨率下比较了软硬组织在疾病中的重塑过程,揭示了牙龈和牙槽骨微环境中不同的炎症相关细胞亚群扩增和信号通路 | 首次在单细胞分辨率下提供了种植体周围炎软硬组织重塑的比较图谱,发现了牙龈和牙槽骨微环境中独特的细胞亚群扩增(如IL6+/IL18BP+内皮细胞、CXCL8+成纤维细胞)以及牙槽骨中APOD+成纤维细胞驱动的C3-C3AR1信号通路 | 研究基于犬类模型,其向人类临床的转化仍需进一步验证;样本量可能有限;流式细胞术验证虽补充了发现,但功能实验有待深入 | 探究种植体周围炎在牙龈和牙槽骨微环境中的组织特异性异质性和分子细胞动力学,以寻找潜在治疗靶点并验证犬类模型的转化相关性 | 比格犬的牙龈和牙槽骨组织(来自疾病模型和健康对照) | 数字病理学 | 种植体周围炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 比格犬模型中的牙龈和牙槽骨组织样本(具体数量未在摘要中明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3005 | 2026-01-10 |
Mitochondrial Dysfunction and Immune Cell Infiltration in Diabetic Kidney Disease: A Mendelian Randomization and Multiomics Study
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/5592084
PMID:41498039
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和多组学方法,探讨了线粒体功能障碍和免疫细胞浸润在糖尿病肾病发病机制中的因果作用和复杂相互作用 | 结合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和外周血单核细胞分析,首次系统性地揭示了特定线粒体基因表达与免疫细胞特征在糖尿病肾病中的因果关联和介导作用 | 研究主要基于观察性数据和遗传学关联,需要进一步的实验验证来确认因果机制 | 阐明线粒体功能障碍和免疫细胞浸润在糖尿病肾病发病中的因果作用和分子机制 | 糖尿病肾病患者、肾脏组织中的足细胞和肾小管细胞、外周血单核细胞 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 差异基因表达分析 | NA | 遗传学数据, 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及糖尿病肾病患者的肾脏组织和外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3006 | 2026-01-09 |
Transcription factor activity-based stratification reveals prognostic subtypes and immune landscape in neuroblastoma
2025-Dec-31, Translational pediatrics
IF:1.5Q2
DOI:10.21037/tp-2025-aw-739
PMID:41502895
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研究论文 | 本研究通过转录因子活性分析,揭示了神经母细胞瘤的预后亚型及其与肿瘤免疫微环境的关联 | 首次系统性地基于转录因子活性对神经母细胞瘤进行分层,开发了TF_score预后评分,并整合了免疫微环境分析 | 研究依赖于公共数据集,样本量有限,且未进行实验验证 | 开发并验证基于转录因子活性的神经母细胞瘤预后评分系统,并探讨其与免疫微环境的关系 | 498例原发性神经母细胞瘤肿瘤样本 | 生物信息学 | 神经母细胞瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Cox回归, 共识聚类, Boruta引导的主成分分析 | 基因表达数据 | 498例原发性神经母细胞瘤肿瘤样本(GSE49710),外加223例外部验证样本(E-MTAB-8248) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3007 | 2026-01-09 |
A complete spatial map of mouse retinal ganglion cells reveals density and gene expression specializations
2025-Dec-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2515449122
PMID:41452983
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和机器学习技术,绘制了小鼠视网膜神经节细胞(RGCs)的完整空间分布图,揭示了其密度和基因表达的特化模式 | 首次整合en-face冷冻切片、空间转录组学和机器学习方法,全面映射所有已知RGC类型的空间分布,并发现基因表达在特定区域(如ART)内的独立变异 | 研究主要基于小鼠模型,与灵长类中央视觉特化的比较显示有限相关性,可能限制跨物种推论的普适性 | 探究小鼠视网膜神经节细胞的空间分布特化及其与视觉功能的关系 | 小鼠视网膜神经节细胞(RGCs) | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,机器学习 | 机器学习 | 空间转录组数据,图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3008 | 2026-01-09 |
Overcoming impaired antigen presentation in tumor-draining lymph nodes facilitates immunotherapy
2025-Dec-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013364
PMID:41469140
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研究论文 | 本研究揭示了乳腺癌如何通过降低引流淋巴结中的IL-1β细胞因子来损害树突状细胞的抗原呈递功能,并提出通过向远离肿瘤的淋巴结递送免疫佐剂或恢复IL-1β水平来克服这一障碍,从而增强抗肿瘤免疫反应 | 首次系统阐明了肿瘤通过改变引流淋巴结的细胞因子环境(特别是IL-1β减少)来损害抗原呈递的具体机制,并创新性地提出并验证了两种靶向性治疗策略:向肿瘤远端淋巴结递送免疫佐剂,以及通过瘤内注射恢复IL-1β | 研究主要基于小鼠乳腺癌模型,其结论在人类癌症中的普适性有待验证;所提出的治疗策略(如向特定淋巴结递送佐剂)的临床转化路径和可行性尚需进一步探索 | 探究肿瘤如何损害引流淋巴结的抗原呈递功能,并寻找克服此障碍以增强免疫治疗效果的方法 | 小鼠乳腺癌模型、肿瘤引流淋巴结、树突状细胞、抗原特异性T细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 流式细胞术、免疫荧光、共聚焦成像、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据、细胞表型数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3009 | 2026-01-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of the Retina During the Development of Normal Tension Glaucoma in Mice
2025-Dec-28, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02422-1
PMID:41455767
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析OPTN E50K突变小鼠视网膜,揭示了正常眼压性青光眼发展过程中视网膜神经节细胞和胶质细胞的转录特征及相互作用 | 首次在单细胞水平系统分析正常眼压性青光眼小鼠模型中视网膜细胞的基因表达谱,并识别了CD74-MIF通路在疾病进展中的关键作用 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类疾病;样本量相对有限;未涉及所有视网膜细胞类型 | 探究正常眼压性青光眼发展过程中视网膜神经节细胞退行性变的分子机制和细胞间相互作用 | OPTN E50K突变小鼠的视网膜细胞 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同年龄的OPTN E50K突变小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3010 | 2026-01-09 |
Single cell transcriptomic profiling uncovers shared inflammatory pathways and immune dysregulation underlying the asthma to lung cancer transition
2025-Dec-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04307-z
PMID:41441926
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了肺癌免疫细胞亚群的复杂空间分布特征,并识别了CXCL12-CXCR4信号轴在免疫调控中的关键作用 | 结合单细胞转录组学与空间分析技术,系统解析了肺癌免疫微环境中细胞亚群的时空动态变化及关键基因表达模式 | 研究主要基于单细胞测序数据,缺乏体内功能验证实验,且样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探究肺癌免疫微环境中免疫细胞的时空行为及关键基因表达,以揭示疾病进展机制并寻找治疗靶点 | 肺癌组织中的免疫细胞(如肿瘤相关巨噬细胞和细胞毒性T细胞)及肺癌细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR | UMAP,t-SNE | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 未明确说明样本数量,但涉及肺癌组织及细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3011 | 2026-01-09 |
MIF Regulates the Th17/Treg Ratio to Exacerbate Kidney Injury in Chronic Kidney Disease
2025-Dec-23, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02418-x
PMID:41436686
|
研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)通过调节Th17/Treg比例加剧慢性肾病肾损伤的机制 | 首次在单细胞水平上揭示了MIF通过MIF-(CD74+CXCR4)通路调控Th17/Treg比例,并证实肾组织特异性MIF抑制能逆转肾损伤 | 样本量相对较小(15例CKD患者和20例健康人进行单细胞测序),且主要基于相关性分析,需要更多机制研究验证 | 研究MIF介导的Th17/Treg比例变化对慢性肾病肾损伤的影响 | 慢性肾病患者、健康个体、5/6肾切除小鼠模型 | 免疫学 | 慢性肾病 | 单细胞测序、流式细胞术、动物模型 | 动物模型(5/6肾切除小鼠) | 单细胞测序数据、流式细胞数据、临床参数 | 15例CKD患者和20例健康人(单细胞测序),20例CKD患者和10例健康人(流式细胞分析) | NA | NA | NA | NA |
| 3012 | 2026-01-09 |
Physical activity decreases cancer burden by alleviating immunosenescence-related inflammation and improving overall immunity
2025-Dec-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102484
PMID:41406938
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研究论文 | 本研究通过队列研究和实验分析,揭示了体育锻炼通过减轻炎症、减少免疫衰老和增强整体免疫力来降低癌症风险的机制 | 首次通过大规模队列和单细胞测序等实验,系统性地证明了体育锻炼剂量依赖性地降低系统性炎症,从而减少炎症相关癌症风险和全癌死亡率,并阐明了其分子机制 | 研究主要基于观察性队列和动物模型,人类因果关系的直接证据有限,且具体运动类型和强度的优化方案需进一步探索 | 探究体育锻炼与癌症发病率及死亡率之间的关联及其潜在机制 | 英国和美国的443,768名成年人,以及小鼠和仓鼠动物模型 | 生物医学研究 | 癌症 | 单细胞测序, RNA测序, 细胞计数术, 炎症阵列 | NA | 队列数据, 基因表达数据, 细胞表型数据 | 443,768名成年人,以及小鼠和仓鼠动物模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3013 | 2026-01-09 |
A conserved differentiation programme facilitates inhibitory neuron production in the developing mouse and human cerebellum
2025-Dec-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204811
PMID:41287940
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠和人类小脑发育中表达巢蛋白的祖细胞向抑制性神经元分化的保守分子机制 | 首次在小鼠和人类小脑发育中鉴定FOXO1作为ASCL1下游关键调控因子,并揭示WNT信号通路促进ASCL1+向FOXO1+细胞状态转变的保守机制 | 研究主要基于体外培养系统,体内验证不足;人类样本可能有限,未全面评估其他细胞类型或信号通路的影响 | 探究哺乳动物小脑发育中抑制性神经元产生的分子机制和转录因子协同作用 | 新生小鼠小脑和人类原代培养的表达巢蛋白的祖细胞 | 发育生物学 | 脊髓小脑性共济失调 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,涉及小鼠和人类原代培养细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3014 | 2026-01-09 |
Identification and validation of efferocytosis-related biomarkers for the diagnosis of atherosclerosis based on bioinformatics and machine learning
2025-Dec-15, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03669-y
PMID:41392162
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和机器学习方法,识别并验证了与动脉粥样硬化诊断相关的胞葬作用生物标志物 | 结合机器学习筛选出5个潜在诊断生物标志物,并利用单细胞RNA测序和细胞实验验证其在动脉粥样硬化巨噬细胞中的特异性上调 | 研究主要基于公共数据库数据,外部验证样本有限,且未深入探讨生物标志物的具体作用机制 | 识别和验证与动脉粥样硬化诊断相关的胞葬作用生物标志物,并构建临床预测模型 | 动脉粥样硬化样本和对照样本的基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 基因表达分析、蛋白质-蛋白质相互作用分析、功能富集分析、机器学习、免疫浸润分析、单细胞RNA测序、细胞实验 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3015 | 2026-01-09 |
Exploring the role of PANoptosis in idiopathic pulmonary fibrosis based on scRNA-seq and bulk-seq
2025-Dec-10, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01990-8
PMID:41369928
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和转录组数据,探讨了PANoptosis在特发性肺纤维化发病机制中的作用 | 首次将PANoptosis(一种整合了焦亡、凋亡和坏死性凋亡的新型程序性细胞死亡形式)与特发性肺纤维化联系起来,并基于相关基因构建了诊断预测模型 | 研究主要基于公共数据集和动物模型,需要在更大规模的人类临床样本中进行验证 | 阐明PANoptosis在特发性肺纤维化发病机制中的作用 | 特发性肺纤维化患者和动物模型 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序,转录组测序,qRT-PCR | WGCNA,机器学习方法 | 基因表达数据 | 基于GEO数据集GSE227136(具体样本数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3016 | 2026-01-09 |
IL-15 signaling via cis- and trans-presentation to progenitor-exhausted CD8+ T cells enhances radio-immunotherapy efficacy in ESCC
2025-Dec-01, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03881-2
PMID:41327181
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研究论文 | 本研究探讨了IL-15信号通过顺式和反式呈递给祖细胞耗竭CD8+ T细胞,以增强食管鳞状细胞癌(ESCC)放疗-免疫联合疗法疗效的机制 | 揭示了IL-15在ESCC肿瘤微环境中的关键作用,明确了其通过顺式/反式呈递激活祖细胞耗竭CD8+ T细胞的空间依赖性机制,并首次提出IL-15可作为预测放疗联合免疫治疗疗效的生物标志物 | 研究主要基于临床队列和临床前小鼠模型,需要更大规模的前瞻性临床试验验证IL-15作为生物标志物的可靠性 | 探究IL-15在食管鳞状细胞癌(ESCC)放疗联合免疫治疗中的作用机制,并评估其作为疗效预测生物标志物的潜力 | 接受放疗和免疫治疗的ESCC患者队列、患者血液和组织样本、临床前小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 食管鳞状细胞癌 | ELISA、流式细胞术、单细胞RNA测序、空间分析 | 临床队列分析、临床前小鼠模型 | 蛋白质表达数据、细胞表型数据、单细胞转录组数据、空间分布数据 | ESCC患者临床队列(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3017 | 2026-01-09 |
Expression of Opioid Growth Factor,Opioid Growth Factor Receptor,P16,and P21 and Their Correlations With Clinicopathological Characteristics in Elderly Patients With Colorectal Cancer
2025-Dec, Zhongguo yi xue ke xue yuan xue bao. Acta Academiae Medicinae Sinicae
DOI:10.3881/j.issn.1000-503X.16518
PMID:41503646
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研究论文 | 本研究探讨了阿片样生长因子(OGF)、其受体(OGFR)以及P16和P21在老年结直肠癌患者中的表达情况,并分析了它们与临床病理特征及预后的相关性 | 首次在老年结直肠癌患者中综合分析了OGF/OGFR信号通路与细胞周期调控蛋白P16、P21的关联,并结合生物信息学分析(包括单细胞RNA测序和空间转录组学)与多种实验方法(ELISA、Western blot、免疫组化)进行验证 | 研究样本量相对有限(共167例),且为单中心回顾性研究,可能存在选择偏倚;未深入探讨OGF/OGFR通路抑制P16/P21的具体分子机制 | 探究OGF、OGFR、P16和P21在老年结直肠癌中的表达模式及其与临床病理特征和患者预后的关系 | 老年结直肠癌患者的癌组织及癌旁正常组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | ELISA, Western blot, 免疫组织化学, 生物信息学分析(差异表达分析、生存分析) | NA | 组织样本(新鲜组织、石蜡包埋组织)、基因表达数据 | 167例老年结直肠癌患者(30例新鲜组织样本,137例石蜡包埋组织样本) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3018 | 2026-01-09 |
uPAR expression in M-MDSCs under high LDHA activity in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Nov-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-29823-4
PMID:41320682
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研究论文 | 本研究探讨了胰腺导管腺癌中高LDHA活性通过调节乳酸代谢影响M-MDSCs上uPAR表达,从而促进免疫抑制肿瘤微环境的机制 | 首次揭示了LDHA驱动的乳酸代谢通过胆固醇代谢途径调控M-MDSCs中uPAR表达的具体机制,并建立了LDHA活性与uPAR阳性M-MDSCs在人类PDAC样本中的临床相关性 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,需要更大规模的临床验证;机制研究尚未完全阐明uPAR信号传导的具体下游通路 | 阐明高LDHA肿瘤微环境中乳酸代谢如何调节免疫细胞(特别是MDSCs)并促进胰腺癌免疫抑制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境中的髓源性抑制细胞(MDSCs),特别是单核细胞性MDSCs(M-MDSCs) | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光染色,基因集富集分析 | 小鼠Ldha敲低(shLdha)PDAC模型 | 单细胞转录组数据,免疫荧光图像数据 | 小鼠PDAC模型和人类PDAC样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3019 | 2026-01-09 |
Genomic heterogeneity drives distinct infiltration patterns in glioblastoma
2025-Nov-29, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02106-9
PMID:41316429
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研究论文 | 本研究利用高维空间转录组学技术,分析了胶质母细胞瘤中浸润性肿瘤细胞的基因表达谱和细胞状态,揭示了基因组异质性如何驱动不同的浸润模式 | 首次使用CosMx空间分子成像仪在单细胞分辨率下对胶质母细胞瘤的肿瘤核心和浸润边缘进行空间转录组分析,识别出一种新的胶质祖细胞样状态,并发现其在经典亚型中富集且与EGFR扩增或突变相关 | 样本量较小(仅8名患者),且研究基于福尔马林固定石蜡包埋样本,可能影响RNA质量,空间分析仅限于靶向1000个基因的panel | 表征胶质母细胞瘤中浸润性肿瘤细胞的基因表达谱和细胞状态,以理解肿瘤异质性对疾病进展的影响 | 胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织,包括肿瘤核心和浸润边缘 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 8名胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织样本 | NanoString | 空间转录组学 | CosMx Spatial Molecular Imager | CosMx空间分子成像仪,使用靶向1000个基因的panel进行单细胞分辨率空间转录组分析 |
| 3020 | 2026-01-09 |
Identification and validation of SUN modification-related anti-PD-1 immunotherapy-resistance signatures to predict prognosis and immune microenvironment status in glioblastoma
2025-Nov-29, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15345-9
PMID:41318472
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学方法识别并验证了与泛素化、SUMO化和neddylation(统称SUN修饰)及抗PD-1免疫治疗耐药相关的关键基因,构建了一个用于预测胶质母细胞瘤预后和免疫微环境状态的六基因风险模型 | 首次整合SUN修饰与抗PD-1耐药性,识别出六个关键预后基因(PLK2、CDC73、PSMC2、SOCS3、ETV4、LMO7),并构建了具有优异预测性能(AUC>0.9)的预后风险模型,同时结合单细胞RNA测序和空间转录组分析揭示了SOCS3在单核细胞/巨噬细胞中的特异性表达及其潜在功能 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞系验证,缺乏大规模临床队列的独立验证和体内实验证据 | 探究SUN修饰相关基因在胶质母细胞瘤中的预后意义及其与抗PD-1免疫治疗耐药性的关联 | 胶质母细胞瘤(GBM)细胞系及相关的公共基因组学数据 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 差异表达分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、机器学习算法、RT-qPCR、Western blotting、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组分析 | 机器学习算法(文中未指定具体模型类型) | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |