单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 10550 篇文献，本页显示第 2981 - 3000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2981 | 2025-10-29 |
Whole-Genome Sequencing Reveals Individual and Cohort Level Insights into Chromosome 9p Syndromes
2025-Mar-30, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.03.28.25324850
PMID:40196253
|
研究论文 | 通过全基因组测序对100名9p相关综合征患者进行基因组分析，揭示了染色体9p综合征的个体和队列水平特征 | 首个大规模全基因组测序研究9p相关综合征，识别了两个新的晚复制区域，建立了基于机器学习的9p缺失综合征预测模型 | 样本量相对有限，需要进一步扩大研究队列 | 深入理解染色体9p缺失和重复综合征的基因组结构和发病机制 | 100名来自9p相关综合征家庭的个体，包括85名无关先证者 | 基因组学 | 染色体异常综合征 | 全基因组测序，空间转录组学，机器学习 | 机器学习模型 | 基因组序列数据，基因表达数据 | 100名个体（85名无关先证者） | NA | 全基因组测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 2982 | 2025-10-29 |
Altered immune landscape of cervical lymph nodes reveals Epstein-Barr virus signature in multiple sclerosis
2025-02-21, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adl3604
PMID:39982975
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研究论文 | 通过单细胞测序分析多发性硬化症患者颈深淋巴结的免疫景观，揭示EB病毒在疾病发病机制中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和细胞转录组与表位索引技术，发现多发性硬化症患者颈深淋巴结中EB病毒特征性B细胞异常 | 样本量有限，仅针对新诊断未治疗患者，需要更大规模研究验证 | 探究EB病毒感染与多发性硬化症发病机制的关联 | 多发性硬化症患者的颈深淋巴结组织和唾液样本 | 单细胞测序分析 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序, 细胞转录组与表位索引测序 | NA | 单细胞转录组数据, 表位数据, DNA数据 | 新诊断未治疗的多发性硬化症患者（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 2983 | 2025-01-23 |
Finding and Profiling Renal Cells with Spatial Transcriptomics
2025-Jan-22, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000632
PMID:39836482
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2984 | 2025-10-29 |
Identification of a distinctive gene signature in granulomatous myositis
2025-Jan-02, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.12.27.24319708
PMID:40568658
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了肉芽肿性肌炎的特异性基因特征 | 首次系统识别了肉芽肿性肌炎的特异性转录组特征，发现CHIT1基因表达与疾病严重程度密切相关 | 样本量相对有限（38例GM患者），需要更大规模研究验证 | 阐明肉芽肿性肌炎的病理生理机制 | 肌肉活检样本，包括肉芽肿性肌炎患者、其他肌病患者和健康对照 | 数字病理学 | 肉芽肿性肌炎 | RNA测序，空间转录组学，免疫组织化学 | 支持向量机 | RNA测序数据，空间转录组数据，蛋白质表达数据 | 722例肌肉活检（包括38例GM患者） | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2985 | 2025-10-28 |
EpiFoundation: A Foundation Model for Single-Cell ATAC-seq via Peak-to-Gene Alignment
2025-Sep-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.05.636688
PMID:39975086
|
研究论文 | 本文提出了首个专门针对单细胞ATAC-seq数据的预训练基础模型EpiFoundation，通过峰值到基因对齐解决数据稀疏性问题 | 开发了创新的跨模态预训练方法，专门处理非零峰值集以提高信息密度，并利用基因表达信息监督预训练过程 | NA | 开发专门针对单细胞ATAC-seq数据的基础模型，解决高维稀疏数据的表示学习问题 | 单细胞ATAC-seq数据中的细胞表示学习 | 机器学习 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | 基础模型 | 表观基因组数据, 基因表达数据 | 超过100,000个单细胞，包含配对的scRNA-seq和scATAC-seq数据 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 2986 | 2025-10-28 |
Spatial transcriptomic analysis of HIV and tuberculosis coinfection in a humanized mouse model reveals unique transcription patterns, immune responses and early morphological alterations
2025-Sep-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.29.635571
PMID:39975088
|
研究论文 | 通过人源化小鼠模型研究HIV和结核分枝杆菌共感染的早期空间转录组特征 | 首次在HIV和结核分枝杆菌共感染模型中应用空间转录组技术揭示早期免疫细胞浸润模式和转录特征 | 研究仅观察感染后三周的早期变化，未涵盖疾病全程发展 | 理解HIV和结核分枝杆菌共感染早期免疫细胞浸润的表型和功能变化 | 人源化小鼠模型的肺组织 | 空间转录组学 | HIV和结核分枝杆菌共感染 | 空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | 人源化小鼠感染模型（单感染和共感染组） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2987 | 2025-10-28 |
STAMP: Single-cell transcriptomics analysis and multimodal profiling through imaging
2025-Sep-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.05.027
PMID:40532697
|
研究论文 | 开发了一种名为STAMP的新型单细胞分析方法，通过成像平台实现转录组和蛋白质组的多模态分析 | 通过成像而非测序进行单细胞分析，消除了测序成本，支持RNA、蛋白质和H&E的多模态分析，同时保留细胞结构和形态 | NA | 克服单细胞RNA测序在可扩展性、高成本和细胞破坏方面的限制 | 外周血单核细胞、细胞系和干细胞 | 数字病理学 | NA | 转录组成像、蛋白质组成像、多模态分析 | NA | 图像、转录组数据、蛋白质组数据 | 10,962,092个高质量细胞/细胞核和6,030,429,954个转录本 | NA | 单细胞RNA-seq、蛋白质组学、空间转录组学 | NA | 成像平台，支持多模态（RNA、蛋白质和H&E）分析 |
| 2988 | 2025-10-28 |
Powerful and accurate case-control analysis of spatial molecular data
2025-Aug-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.07.637149
PMID:39975274
|
研究论文 | 提出一种结合深度学习和统计原理的空间分子数据分析方法VIMA，用于识别与疾病相关的空间特征 | 将变分自编码器与多重检验控制相结合，通过定义数据依赖的'微生态位'来发现传统方法难以识别的疾病相关空间结构 | NA | 开发更灵活精确的空间分子数据分析方法，识别与疾病相关的关键空间结构 | 空间分子数据中的组织斑块和微生态位 | 空间转录组学 | 类风湿关节炎,溃疡性结肠炎,痴呆 | 免疫荧光显微镜,CODEX,空间转录组学 | 变分自编码器 | 空间分子数据 | NA | NA | 空间转录组学,免疫荧光,CODEX | NA | NA |
| 2989 | 2025-10-28 |
CROPseq-multi: a universal solution for multiplexed perturbation in high-content pooled CRISPR screens
2025-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.17.585235
PMID:38558968
|
研究论文 | 开发了一种名为CROPseq-multi的多重CRISPR筛选系统，用于在高质量集合筛选中实现通用多重扰动 | 开发了具有多功能读出兼容性的CROPseq-inspired慢病毒系统，支持单个和组合扰动，在条形码识别和扰动性能方面表现优异 | NA | 开发兼容多种筛选方法的多重CRISPR扰动系统 | CRISPR筛选系统和遗传扰动技术 | 基因编辑技术 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑，单细胞RNA测序，光学集合筛选 | NA | 基因表达数据，条形码序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，光学集合筛选 | NA | NA |
| 2990 | 2025-10-28 |
Specific cell states underlie complex tissue regeneration in spiny mice
2025-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637521
PMID:39990382
|
研究论文 | 本研究通过细胞增殖动力学分析揭示多刺小鼠复杂组织再生的特定细胞状态机制 | 首次发现基质细胞在损伤后快速重新进入细胞周期并维持严格的时空控制，识别出CRABP1+和αSMA+等与再生特异性相关的关键细胞类型 | 未明确说明样本规模，且对年轻小鼠中类似成纤维细胞无法促进再生的机制解释有限 | 探索哺乳动物复杂组织再生过程中的细胞增殖动力学和特定细胞状态 | 多刺小鼠(Acomys spp.)和实验室小鼠的耳组织再生过程 | 发育生物学 | 组织损伤修复 | 时间脉冲追踪实验、免疫染色、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据、免疫染色图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2991 | 2025-07-17 |
Unveiling new therapeutic targets for esophageal cancer treatment through single-cell transcriptomics: pH-responsive nanobubbles enhance the efficacy of 125I radiotherapy
2025-Jul-15, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03552-2
PMID:40665303
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2992 | 2025-10-27 |
Distinct adipose progenitor cells emerging with age drive active adipogenesis
2025-Apr-25, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adj0430
PMID:40273250
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现中年小鼠内脏脂肪中出现独特的脂肪祖细胞亚群CP-A，揭示其通过白血病抑制因子受体信号驱动年龄依赖性脂肪重塑的机制 | 首次鉴定出年龄特异性富集的脂肪祖细胞亚群CP-A，并阐明其通过LIFR信号通路驱动中年期脂肪生成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证尚不充分 | 探究年龄依赖性脂肪组织重塑的细胞机制 | 小鼠脂肪祖细胞 | 单细胞生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序，谱系追踪，细胞移植，药理学和遗传学操作 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2993 | 2025-07-06 |
Combining spatial transcriptomics and AI to enhance brain tumour diagnosis
2025-Nov, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-025-00851-6
PMID:40615732
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2994 | 2025-10-26 |
Natural killer cells and IFN-γ protect against liver injury during HAV infection in mice
2025-Oct-23, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01395-25
PMID:40970716
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了自然杀伤细胞和干扰素-γ在甲型肝炎病毒感染早期对肝脏的保护作用 | 首次在免疫活性小鼠模型中证明NK细胞通过产生IFN-γ抑制HAV复制并保护肝脏，而非引起病理损伤 | 研究使用基因修饰小鼠模型，结果在人类中的直接适用性需要进一步验证 | 阐明甲型肝炎病毒感染早期NK细胞的免疫应答机制及其在肝脏保护中的作用 | 肝细胞特异性I型干扰素受体敲除小鼠和全局敲除小鼠模型 | 免疫学 | 病毒性肝炎 | 单细胞RNA测序，基因敲除技术，细胞耗竭实验 | NA | 基因表达数据，血清生化指标，组织病理学数据 | 多种基因型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2995 | 2025-10-26 |
A novel ZIKV-targeted scRNA-seq method for precise quantification of ZIKV RNA
2025-Oct-23, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01114-25
PMID:40990513
|
研究论文 | 开发了一种新型寨卡病毒靶向单细胞RNA测序方法，用于精确量化单个细胞中的寨卡病毒RNA | 开发了专门针对缺乏poly(A)尾的寨卡病毒RNA的靶向scRNA-seq方法，解决了传统方法检测寨卡病毒RNA的难题 | 研究仅使用免疫健全乳鼠模型，样本量有限，需要在更广泛的模型中验证 | 开发能够精确检测和量化寨卡病毒RNA的单细胞测序方法，并识别易感细胞类型 | 寨卡病毒感染的免疫健全乳鼠脑组织 | 单细胞测序技术 | 寨卡病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 寨卡病毒感染和对照乳鼠脑组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 2996 | 2025-10-26 |
Concerted changes in Epithelium and Stroma: a multi-scale, multi-omics analysis of progression from Barrett's Esophagus to adenocarcinoma
2025-Oct-20, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.034
PMID:40695287
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研究论文 | 通过多尺度多组学分析研究巴雷特食管向腺癌进展过程中上皮和间质的协同变化 | 整合单细胞转录组学、细胞外基质蛋白质组学、组织力学和空间蛋白质组学，首次系统揭示巴雷特食管进展为多组分协调系统 | 样本量相对有限（26名患者的107个样本），需要在更大队列中验证发现 | 阐明巴雷特食管向食管腺癌进展的分子和细胞机制 | 从鳞状上皮经化生、异型增生到腺癌的进展路径样本 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学, 空间蛋白质组学, 组织力学分析 | 多组学整合分析 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 空间定位数据, 力学数据 | 26名患者的107个样本，来自两个独立队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 2997 | 2025-10-26 |
Enzyme-converted O kidneys allow ABO-incompatible transplantation without hyperacute rejection in a human decedent model
2025-Oct-03, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01513-6
PMID:41044341
|
研究论文 | 本研究开发了一种供体导向的器官工程策略，通过酶转化将A型肾脏转化为O型肾脏，实现ABO血型不相容肾脏移植 | 首次提出供体导向的脱敏方案，在低温灌注期间通过酶处理去除肾脏A抗原，避免传统受体脱敏方案的并发症 | 研究仅在人类遗体模型中进行，观察时间仅2天，长期效果和安全性需要进一步验证 | 开发ABO血型不相容肾脏移植的新方法，提高器官分配的公平性和可及性 | 人类A型肾脏和O型脑死亡受体 | 器官移植工程 | 终末期肾病 | 酶转化技术，单细胞测序 | NA | 临床观察数据，基因表达数据 | 人类遗体模型研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2998 | 2025-10-26 |
Cholesterol metabolic reprogramming mediates microglia-induced chronic neuroinflammation and hinders neurorestoration following stroke
2025-Oct, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-025-01379-7
PMID:40987840
|
研究论文 | 本研究揭示了胆固醇代谢重编程介导小胶质细胞诱导的慢性神经炎症并阻碍脑卒中后神经修复的机制 | 首次发现缺血性损伤通过胆固醇代谢重编程诱导持续性小胶质细胞活化，并证明通过CYP46A1激活减轻胆固醇负荷可促进白质修复和功能恢复 | 研究仅使用雄性小鼠模型，未验证在雌性动物中的效果 | 探究脑卒中后慢性神经炎症的机制及胆固醇代谢在其中的作用 | 雄性小鼠和小胶质细胞 | 神经科学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2999 | 2025-10-26 |
Redox Regulation of Microvascular Physiology and Pathophysiology: Insights into Therapeutic Strategies and Limitations
2025-Oct, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1177/15230864251372607
PMID:41020442
|
综述 | 探讨氧化还原机制在微血管生理和病理生理中的作用及其治疗策略 | 强调微血管与大血管对ROS/RNS反应的差异，并指出单细胞RNA测序研究揭示不同血管床内皮细胞的独特基因特征 | 技术挑战限制了可靠关联ROS/RNS水平变化与微血管结果的能力，且缺乏针对微血管氧化还原信号的特效疗法 | 阐明氧化还原机制在微血管功能调节和疾病发病机制中的作用 | 微血管系统及其内皮细胞 | 血管生物学 | 心血管疾病，自身免疫疾病，感染性疾病，血红蛋白病，炎症性疾病，血管炎，代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3000 | 2025-10-26 |
Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix Domain Containing 1 Promotes Hepatocellular Carcinoma Progression by Regulating Transforming Growth Factor Beta Receptor 1 in the Tumor Immune Microenvironment
2025-Oct, Genetic testing and molecular biomarkers
IF:1.1Q4
DOI:10.1177/19450265251384161
PMID:41022542
|
研究论文 | 本研究探讨了CHCHD1通过调节TGF-β1信号通路促进肝细胞癌进展和免疫逃逸的机制 | 首次揭示CHCHD1在肝细胞癌中通过调节TGF-β受体1影响肿瘤免疫微环境的新功能 | 研究样本量相对有限，机制研究主要在细胞系中进行，需要更多体内实验验证 | 探究CHCHD1在肝细胞癌进展中的分子机制及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 肝细胞癌组织样本和SMMC-7721细胞系 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序,免疫浸润分析,蛋白质印迹,细胞迁移/侵袭实验 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据,临床数据 | 272例HCC组织和50例正常肝组织 | NA | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | NA |