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当前共找到 10349 篇文献,本页显示第 281 - 300 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
281 2025-12-14
Microbial production of short-chain fatty acids attenuates long-term neurologic impairment after traumatic brain injury
2025-Dec-09, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究探讨了通过饮食促进微生物产生短链脂肪酸(SCFA)对创伤性脑损伤(TBI)后长期神经功能障碍的缓解作用及其单细胞水平的机制 首次在TBI模型中结合高SCFA饮食、纵向肠道微生物组分析和单细胞RNA测序,揭示了SCFA通过重塑肠道菌群、促进神经发生和抑制神经炎症来减轻长期神经损伤的机制 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;且仅关注了乙酸和丁酸,未涵盖其他SCFA;长期饮食干预的临床转化潜力需进一步验证 探究SCFA在TBI后长期神经功能障碍中的保护作用及其分子机制 C57BL6/J小鼠,使用控制性皮质撞击(CCI)模型模拟TBI 神经科学 创伤性脑损伤 16S rRNA扩增子测序、宏基因组测序、单细胞RNA测序 控制性皮质撞击(CCI)小鼠模型 测序数据、行为学数据、组织学数据 C57BL6/J小鼠,具体数量未在摘要中明确,但涉及多个时间点(基线、1个月、6个月)的样本收集 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 遵循10x Genomics协议进行单细胞RNA测序
282 2025-12-14
Identification of a super enhancer associated gene signature for the prognosis prediction and regulatory mechanism exploration in breast cancer
2025-Dec-08, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究构建了一个基于超级增强子相关基因的临床预测模型,用于乳腺癌患者的预后预测和调控机制探索 首次结合超级增强子相关基因、Cox回归和LASSO算法构建Super-Enhancer-Related Score (SERS),并整合临床特征建立高精度预测模型,同时利用单细胞RNA测序数据深入探索调控机制 研究主要基于生物信息学分析,实验验证部分仅通过免疫组化确认了核心基因TFF1,缺乏更深入的体内外功能实验验证 探索超级增强子相关基因对乳腺癌预后的影响及其潜在调控机制 乳腺癌患者与健康对照的基因表达数据 生物信息学 乳腺癌 RNA测序、单细胞RNA测序、免疫组化 Cox回归、LASSO算法、机器学习方法 基因表达数据 NA NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
283 2025-12-14
Uncovering the prognostic implications and immunological roles of transmembrane protein 208 in bladder cancer by multi omics analysis and experimental verification
2025-Dec-08, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过多组学分析和实验验证,探讨了跨膜蛋白208(TMEM208)在膀胱癌中的预后意义和免疫学作用 首次系统性地将TMEM208与膀胱癌的临床特征、免疫浸润、肿瘤微环境及细胞功能联系起来,并结合空间转录组学和单细胞测序技术进行验证 研究主要基于公共数据库(TCGA和GEO)的回顾性数据,需要更多前瞻性临床样本和体内实验进一步验证 揭示TMEM208在膀胱癌中的生物学功能、预后价值及作为治疗靶点的潜力 膀胱癌(BLCA) 生物信息学与计算生物学 膀胱癌 多组学分析、基因集富集分析(GSEA)、免疫浸润分析、空间转录组学、单细胞测序、细胞实验 NA 基因表达数据、临床数据、蛋白质相互作用数据 TCGA数据库及15个GEO数据集中的膀胱癌样本 NA 空间转录组学, 单细胞测序 NA NA
284 2025-12-14
CausalGenDiff: Generative causal diffusion bridges scRNA-seq and spatial transcriptomics
2025-Dec-05, Journal of biomedical informatics IF:4.0Q2
研究论文 提出了一种名为CausalGenDiff的生成式因果扩散模型,用于有效整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据 首次将扩散模型与自回归过程结合以利用基因间的因果依赖关系,并将原本用于图像生成的因果注意力Transformer扩展到高维基因表达数据处理,无需依赖预定义的基因关系即可捕捉基因调控机制 未明确说明模型的计算复杂度或对大规模数据集的可扩展性 提高单细胞RNA测序与空间转录组学数据整合的准确性和结构相似性 基因表达数据 计算生物学 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 扩散模型,自回归模型,Transformer,VAE 基因表达数据 10个组织数据集 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
285 2025-12-14
Expression of ACTR3 in cervical cancer and impact on immune cell infiltration and prognosis: A comprehensive analysis based on bulk RNA-Seq and single-cell RNA-Seq
2025-Dec-05, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,分析了ACTR3在宫颈癌中的表达及其对免疫细胞浸润和预后的影响 首次将PI3K/Akt/mTOR通路与宫颈癌肿瘤浸润免疫细胞联系起来,并利用单细胞RNA-seq技术鉴定出表达ACTR3的特定免疫细胞亚群 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证来确认ACTR3在肿瘤微环境中的具体功能机制 确定ACTR3过表达是否影响宫颈癌患者生存,并探索其对肿瘤免疫微环境的影响 宫颈鳞状细胞癌和宫颈内膜腺癌(CESC)患者 生物信息学 宫颈癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫组织化学 LASSO Cox回归, 预后模型, 列线图 基因表达数据, 临床数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
286 2025-12-14
Safranal accelerates diabetic wound healing by suppressing ferroptosis through modulation of transcription factor Forkhead Box O3
2025-Dec-05, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 本研究探讨了藏红花醛通过抑制铁死亡促进糖尿病伤口愈合的机制 首次揭示藏红花醛通过FOXO3/SLC7A11通路抑制铁死亡来促进糖尿病伤口愈合 研究主要基于细胞和动物模型,临床转化潜力尚需进一步验证 探索藏红花醛对糖尿病伤口愈合的治疗效果及其分子机制 糖尿病伤口模型、高糖刺激的人脐静脉内皮细胞 分子生物学 糖尿病并发症 单细胞测序、转录组分析、网络药理学、分子对接、基因敲除 NA 基因表达数据、细胞表型数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
287 2025-12-14
Unveiling the genetic overlap and causal links between gastroesophageal reflux disease and asthma
2025-Dec-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过遗传学方法揭示了胃食管反流病与哮喘之间的遗传重叠和因果联系 识别了GERD与哮喘之间新的共享遗传位点和候选基因,包括51个新发现的共享风险位点和3个新共享基因 研究基于GWAS汇总统计数据,可能受限于样本异质性和统计功效 探究胃食管反流病与哮喘之间的遗传关联和潜在因果机制 胃食管反流病和哮喘患者及对照人群的遗传数据 遗传学 胃食管反流病和哮喘 GWAS, LDSC, Mendelian randomization, scRNA-seq 统计遗传学模型 遗传汇总统计数据、单细胞RNA测序数据 GERD: 71,522病例和261,079对照;哮喘: 56,167病例和352,255对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
288 2025-12-14
Homocysteine Exacerbates Pulmonary Fibrosis via Orchestrating Syntaxin 17 Homocysteinylation of Alveolar Type II Cells
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了同型半胱氨酸通过诱导肺泡II型细胞中Syntaxin 17的同型半胱氨酸化,加剧肺纤维化的新机制 首次发现同型半胱氨酸通过STX17同型半胱氨酸化-泛素化级联反应,破坏自噬流并促进肺纤维化,建立了Hcy-STX17-蛋白质稳态轴 研究主要基于小鼠模型和患者样本,临床转化效果需进一步验证 探究高同型半胱氨酸血症在特发性肺纤维化发病机制中的作用 特发性肺纤维化患者样本、小鼠模型、肺泡II型上皮细胞 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学分析 NA 基因表达数据, 空间转录组数据, 蛋白质数据 特发性肺纤维化患者与健康对照的样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
289 2025-12-14
Nonalcoholic Fatty Liver Disease Exacerbates the Advancement of Renal Fibrosis by Modulating Renal CCR2+PIRB+ Macrophages Through the ANGPTL8/PIRB/ALOX5AP Axis
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了非酒精性脂肪肝病通过ANGPTL8/PIRB/ALOX5AP轴调控肾脏CCR2+PIRB+巨噬细胞,从而加剧肾纤维化的分子机制 首次阐明了NAFLD通过肝脏来源的ANGPTL8远程调控肾脏特异性巨噬细胞亚群(CCR2+PIRB+),并破坏亚油酸代谢,从而加剧肾纤维化的跨器官信号轴 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类中的普适性有待验证;机制研究虽深入,但尚未进行临床干预试验 探究非酒精性脂肪肝病加剧肾纤维化的具体作用和分子机制 小鼠模型(UUO手术结合高脂饮食诱导的NAFLD)、原代肾脏巨噬细胞、共培养模型 单细胞组学与代谢组学 非酒精性脂肪肝病、慢性肾病 单细胞RNA测序、非靶向代谢组学、流式细胞术、免疫荧光 动物模型、细胞共培养模型 单细胞转录组数据、代谢组数据、流式细胞数据、图像数据 未明确说明具体样本数量的小鼠模型及细胞实验 NA 单细胞RNA-seq, 代谢组学 NA NA
290 2025-12-14
NQO1/p65/CXCL12 Axis-Recruited Tregs Mediate Resistance to Anti-PD-1 Plus Lenvatinib Therapy in PIVKA-II-Positive Hepatocellular Carcinoma
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究探讨了高PIVKA-II表达的肝细胞癌中,NQO1/p65/CXCL12轴招募调节性T细胞介导对anti-PD-1联合乐伐替尼治疗耐药的机制 首次揭示了高PIVKA-II表达通过NQO1稳定p65、激活NF-κB/CXCL12轴并招募Tregs,从而介导治疗耐药的分子机制,并提出了Plerixafor作为潜在联合治疗策略 样本量相对有限,单细胞RNA测序仅来自22例患者,且机制验证主要在临床前模型中进行,需进一步临床验证 探究高PIVKA-II表达的肝细胞癌对anti-PD-1联合乐伐替尼治疗耐药的肿瘤微环境特征和分子机制 肝细胞癌患者(包括手术切除和接受anti-PD-1联合乐伐替尼治疗的患者)及其肿瘤组织 肿瘤免疫学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 NA 临床数据、单细胞RNA测序数据 260例患者(156例手术切除患者和104例接受联合治疗患者),其中22例进行了单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序 NA NA
291 2025-12-14
Integrating Single-Cell Transcriptome-Wide Mendelian Randomization and Differentially Expressed Gene Analyses to Prioritize Dynamic Immune-Related Drug Targets for Cancers
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究提出MR-DEG框架,整合孟德尔随机化和差异表达基因分析,以优先筛选癌症中动态免疫相关药物靶点 引入MR-DEG框架,结合单细胞转录组孟德尔随机化和差异表达基因分析,减少多效性偏倚,动态识别免疫相关药物靶点 研究基于现有单细胞数据和方法,可能受样本量和数据质量的限制,且因果推断仍需进一步实验验证 优先筛选癌症中动态免疫相关药物靶点,以支持免疫相关药物开发 CD4+ T细胞激活过程中的动态基因表达谱与六种癌症类型的风险关联 生物信息学 癌症 单细胞RNA测序,孟德尔随机化,差异表达基因分析 MR-DEG框架,结合多种孟德尔随机化和共定位方法 单细胞表达数量性状位点数据,单细胞RNA测序数据 涉及11,021个动态基因表达谱与六种癌症类型的关联分析 NA 单细胞RNA-seq NA NA
292 2025-12-14
ZFPL1 Promotes Colorectal Cancer Progression by Stabilizing ASS1 to Drive the Urea Cycle and M2 Macrophage-Mediated Metastatic Colonization
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文通过整合分析多个单细胞RNA测序数据库,发现ZFPL1在结直肠癌恶性细胞中特异性富集,并通过稳定ASS1激活尿素循环代谢,驱动肿瘤进展和M2巨噬细胞介导的转移定植 首次揭示ZFPL1通过直接结合并稳定ASS1,激活尿素循环代谢,从而驱动结直肠癌进展,并发现Salvianolic acid B可作为ZFPL1抑制剂,与抗PD-1疗法协同抑制肿瘤 研究主要基于数据库分析和体外/体内实验,临床转化潜力需进一步验证 探究结直肠癌进展的分子机制,并寻找新的治疗靶点 结直肠癌细胞、肿瘤微环境中的巨噬细胞 癌症生物学 结直肠癌 单细胞RNA测序、多组学分析、虚拟筛选 NA 单细胞RNA测序数据、多组学数据 多个单细胞RNA测序数据库中的样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
293 2025-12-14
A unified single-cell atlas of human lung provides insights into pulmonary diseases
2025-Dec, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究构建了名为uniLUNG的最全面人类肺单细胞RNA测序图谱,整合了来自1807名供体的920万个细胞数据,涵盖健康和17种疾病状态,旨在揭示不同肺部疾病中的独特细胞类型和细胞转变 创建了首个跨疾病、高分辨率的人类肺单细胞图谱,整合了大规模已发表数据集,并结合空间转录组学识别了肺癌中的过渡性恶性亚群,如NSCLC-like SCLC,为理解肿瘤进化提供了新见解 研究主要基于已发表的单细胞数据集,可能存在批次效应或技术偏差,且空间多组学分析的深度和广度可能受现有数据限制 构建统一的人类肺单细胞图谱,以揭示不同肺部疾病的细胞机制和共享致病通路 人类肺组织细胞,涵盖健康状态和17种肺部疾病条件 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 920万个细胞,来自1807名供体,涵盖62个已发表数据集 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
294 2025-12-14
Skeletal muscle-derived IL-33 mediates muscle-to-bone crosstalk and regulates bone metabolism via CD8+ T cell-secreted CCL5
2025-Dec, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究揭示了一种由骨骼肌分泌的IL-33介导的肌肉-骨骼通讯机制,该机制通过CD8+ T细胞分泌的CCL5调控骨代谢 首次发现并证实了IL-33作为一种肌因子,在肌肉与骨骼的交互作用中扮演关键角色,并阐明了其通过CD8+ T细胞-CCL5-CCR3信号轴调控骨代谢的具体分子通路 研究主要基于动物模型和体外实验,在人体中的直接因果机制验证尚不充分;临床队列研究为观察性,无法完全排除混杂因素的影响 探究肌肉与骨骼之间的交互作用机制,特别是肌肉功能障碍如何导致骨丢失,并寻找潜在的治疗靶点 老年人群(临床队列)和大鼠模型(结合负重运动、肌肉萎缩和卵巢切除模型) 肌肉骨骼生物学 骨质疏松症,肌肉减少症 单细胞RNA测序,抗体中和实验,重组蛋白处理,受体拮抗剂干预 NA 临床数据,动物模型数据,单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
295 2025-12-14
Mature tertiary lymphoid structures support B cell-mediated antitumour immunity and are disrupted by neoadjuvant therapy in rectal cancer: a multicentre, retrospective study
2025-Dec, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究是一项多中心回顾性研究,探讨了成熟三级淋巴结构(mTLS)在直肠癌抗肿瘤免疫中的作用及其受新辅助治疗的影响 首次在直肠癌中系统性地将成熟三级淋巴结构与B细胞介导的免疫特征、克隆多样性和患者预后相关联,并揭示了新辅助治疗对肿瘤免疫微环境(特别是TLS)的独特影响 研究为回顾性设计,样本量有限(特别是单细胞测序部分),且新辅助治疗队列的样本量较小,需要前瞻性研究验证 阐明成熟三级淋巴结构在直肠癌抗肿瘤免疫中的作用及其受新辅助治疗的调控机制 直肠癌患者,包括未接受治疗的患者和接受新辅助治疗的患者 数字病理学 直肠癌 bulk RNA-seq, scRNA-seq, scBCR-seq, 免疫组织化学, 多重免疫荧光 NA 基因表达数据, 单细胞数据, 图像数据 未治疗队列:bulk RNA-seq (n=123), IHC/mIF (n=161), scRNA-seq (n=10), scBCR-seq (n=10);新辅助治疗队列:bulk RNA-seq (n=19), IHC (n=125) NA 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序, 空间转录组学(通过多重免疫荧光间接评估) NA NA
296 2025-12-14
Harnessing dental stem cell-derived synovial cells for IBD therapy: dual modulation of gut immunity and crypt repair
2025-Dec, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究提出利用人脱落乳牙干细胞分化为静息成纤维样滑膜细胞,通过双重调节肠道免疫和修复隐窝来治疗炎症性肠病 首次发现SHEDs可通过β-catenin非依赖的Wnt/JNK通路分化为具有双重治疗功能的QFLSs,同时靶向上皮损伤和免疫失调 研究主要基于小鼠模型和人类组织验证,尚未开展临床人体试验 开发基于干细胞的新型IBD治疗方法 人脱落乳牙干细胞、小鼠结肠炎模型、人类IBD组织 干细胞治疗 炎症性肠病 单细胞RNA测序、类器官共培养 NA 单细胞转录组数据、组织学数据 小鼠模型(DSS/TNBS诱导)和人类IBD组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
297 2025-12-14
Guided co-clustering transfer across unpaired and paired single-cell multi-omics data
2025-Dec-01, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文提出了一种名为GuidedCoC的新框架,用于将未配对scRNA-seq源数据的结构知识迁移到配对scRNA-seq/scATAC-seq目标数据中,以改进细胞聚类和特征对齐 通过统一的信息论目标联合跨模态和跨域共聚类细胞与特征,同时隐式执行跨模态降维以减少噪声,并自动对齐未配对和配对数据集中的细胞群体,无需显式标注 未在摘要中明确提及 提高单细胞多组学数据(特别是配对scRNA-seq和scATAC-seq数据)的集成鲁棒性、可扩展性和可解释性 未配对scRNA-seq数据和配对scRNA-seq/scATAC-seq数据 机器学习 NA scRNA-seq, scATAC-seq Guided Co-clustering Transfer (GuidedCoC)框架 单细胞基因表达和染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 NA NA
298 2025-12-14
Digital twins for in vivo metabolic flux estimations in patients with brain cancer
2025-Dec-01, Cell metabolism IF:27.7Q1
研究论文 本研究开发了两种基于机器学习的框架,用于在脑癌患者体内进行代谢通量估计,克服了组织采样、肿瘤微环境异质性和非稳态条件等挑战 首次将数字孪生框架和单细胞代谢通量分析框架应用于人类患者体内代谢通量估计,结合了第一性原理模拟、卷积神经网络和单细胞RNA测序数据与C-同位素示踪技术 研究主要针对脑癌患者,可能未涵盖其他癌症类型;依赖于患者样本的可用性和质量;框架在临床应用前需进一步验证 开发能够估计人类患者体内代谢通量的方法,以促进代谢疗法和生物标志物的发现 脑癌患者和脑癌小鼠模型中的代谢活动,特别是神经胶质瘤细胞 机器学习 脑癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、C-同位素示踪 卷积神经网络(CNN) 单细胞RNA测序数据、同位素示踪数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
299 2025-12-14
Association of Neuronal Autoantibodies with Overall Survival in Patients with Gastric Cancer
2025-Dec-01, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 本研究探讨了胃癌患者中神经元自身抗体的存在及其与总生存期的关联 首次在无副肿瘤性神经综合征的胃癌患者中检测神经元自身抗体,并揭示其与较差的临床预后和肿瘤微环境中CD8+ T细胞浸润减少相关 单中心队列研究,样本量有限,单细胞测序仅使用有限肿瘤样本,需要进一步机制研究验证 探究胃癌患者神经元自身抗体的临床意义及其与生存预后的关系 胃癌患者 肿瘤免疫学 胃癌 免疫荧光、细胞实验、单细胞测序 NA 血清样本、肿瘤组织 323例胃癌患者(TBA阳性144例,TBA阴性179例) NA 单细胞测序 NA NA
300 2025-12-14
Effect of Dipyridamole on Experimental Autoimmune Uveitis: Reprogrammed Immune Cell Landscape and Reduced Th17 Pathogenicity
2025-Dec-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究探讨了双嘧达莫对实验性自身免疫性葡萄膜炎的影响,通过单细胞RNA测序分析揭示了其通过cAMP-STAT3-PIM1轴调节免疫细胞景观和降低Th17致病性的机制 首次将双嘧达莫应用于葡萄膜炎治疗研究,并利用单细胞RNA测序技术系统揭示了其通过cAMP-STAT3-PIM1信号轴调节免疫稳态的新机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人类患者中进行临床试验验证 评估双嘧达莫对自身免疫性葡萄膜炎的治疗效果并探索其免疫调节机制 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型和葡萄膜炎患者的单细胞RNA测序数据 单细胞组学 自身免疫性葡萄膜炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠和葡萄膜炎患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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