单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
281 2025-07-12
[Analysis of the number, type, and functional heterogeneity of senescent cells in the radiation-induced skin wounds in mice]
2025-Jun-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi
研究论文 本研究通过实验和生物信息学分析,探讨了辐射诱导小鼠皮肤伤口中衰老细胞的数量、类型和功能异质性 揭示了辐射剂量和时间对衰老细胞积累的依赖性,以及不同类型衰老细胞在功能和SASP表达谱上的明显差异 研究仅针对小鼠模型,结果可能无法直接推广到人类 研究辐射诱导皮肤损伤中衰老细胞的特性和功能 p16转基因小鼠的皮肤组织 生物医学 皮肤损伤 免疫荧光法、流式细胞术、生物信息学分析 NA 实验数据、单细胞转录组测序数据 49只p16转基因小鼠(40只用于主要实验,9只用于补充实验)
282 2025-07-12
Transcriptomic profiling of vitiligo patients shows polar immune dysregulation in involved and uninvolved skin
2025-Jun-11, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 通过转录组分析揭示白癜风患者病变和非病变皮肤的免疫失调特征 发现白癜风皮肤免疫失调不仅涉及TH1/干扰素轴,还包括TH2和TH17/22轴的激活,且非病变皮肤已出现免疫异常 样本量较小(15例白癜风患者和14例健康对照) 全面了解白癜风皮肤病变的免疫学特征 白癜风患者的病变和非病变皮肤组织 皮肤病学 白癜风 RNA测序(bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq)、实时PCR、免疫组织化学 NA 转录组数据 15例白癜风患者的病变和非病变皮肤样本,14例匹配的健康对照
283 2025-07-12
Single-cell RNAseq of Angiotensin II-induced abdominal aortic tissue identifies aneurysm-associated cell clusters in C57BL/6J mice
2025-05-28, Bioscience reports IF:3.8Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序技术研究血管紧张素II诱导的腹主动脉组织中与动脉瘤相关的细胞群 识别出一种由内皮细胞转化的特殊细胞群(恶性ECs),并发现Cxcl12-Cxcr4/Ackr3轴可能在AAA形成中发挥作用 研究仅基于C57BL/6J小鼠模型,未在人类样本中验证 探究腹主动脉瘤(AAA)形成过程中特定细胞群的作用 C57BL/6J小鼠的腹主动脉组织 数字病理 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA序列数据 不同年龄和不同血管紧张素II剂量的C57BL/6J小鼠,具体数量包括14周龄(未形成AAA)、20周龄(21只中有6只形成AAA)和32周龄(7只中有4只形成AAA)
284 2025-07-12
Study on the mechanism of action of the active ingredient of Calculus Bovis in the treatment of sepsis by integrating single-cell sequencing and machine learning
2025-Apr-18, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞测序和机器学习,探讨了牛黄活性成分在治疗脓毒症中的作用机制 结合网络药理学、RNA测序和多种机器学习模型(XGBoost、SVM、决策树、KNN)分析牛黄活性成分的治疗机制,并通过分子对接和分子动力学模拟验证结合亲和力与稳定性 研究依赖于公共数据库数据,未进行实验验证 探索牛黄活性成分在脓毒症治疗中的作用机制 牛黄活性成分及脓毒症相关基因 机器学习 脓毒症 RNA测序、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟 XGBoost、SVM、Decision Tree、KNN 基因表达数据 来自中国国家基因库数据库的脓毒症数据及GSE65682数据库的预后相关基因数据
285 2025-07-12
FLASH radiation reprograms lipid metabolism and macrophage immunity and sensitizes medulloblastoma to CAR-T cell therapy
2025-Mar, Nature cancer IF:23.5Q1
研究论文 本文探讨了FLASH放疗对髓母细胞瘤中巨噬细胞免疫和脂质代谢的重编程作用,以及其对CAR-T细胞疗法的增敏效果 首次揭示了FLASH放疗通过调节巨噬细胞脂质代谢逆转肿瘤免疫抑制的机制,并展示了其与CAR-T细胞疗法的协同效应 研究仅基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 探究FLASH放疗对肿瘤免疫微环境的影响及其与免疫治疗的协同作用 髓母细胞瘤小鼠模型中的巨噬细胞和CAR-T细胞 肿瘤免疫治疗 髓母细胞瘤 单细胞转录组分析,CAR-T细胞疗法 基因工程小鼠模型 基因表达数据 未明确说明具体样本数量的小鼠模型
286 2025-07-12
Conserved patterns of transcriptional dysregulation, heterogeneity, and cell states in clear cell kidney cancer
2025-01-28, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 通过单细胞转录组学分析透明细胞肾癌中的转录失调模式和细胞状态 识别了肿瘤和血管系统中保守的转录失调模式及其上游调控因子,揭示了与转移潜力相关的Chr14q缺失的亚克隆转录后果,以及预后显著的肿瘤内转录异质性模式 样本量相对较小(75个多区域活检),且仅针对透明细胞肾癌 理解透明细胞肾癌中转录程序的保守模式和细胞状态,以推动新的癌症治疗方法 透明细胞肾癌肿瘤组织和正常肾脏组织的多区域活检样本 数字病理学 肾癌 单细胞转录组学 NA 转录组数据 75个多区域活检样本(来自肾肿瘤和正常肾脏)
287 2025-07-12
Targeting mitophagy in diabetic retinopathy: novel insights into SQSTM1/BNIP3L pathway regulated by luteolin
2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究探讨了木犀草素通过SQSTM1/BNIP3L通路激活线粒体自噬在糖尿病视网膜病变中的治疗潜力 揭示了木犀草素通过SQSTM1/BNIP3L通路激活线粒体自噬的新机制,并建立了单核细胞活性与DR进展之间的新联系 木犀草素的具体分子机制尚未完全阐明 探索木犀草素对糖尿病视网膜病变的治疗作用及其分子机制 糖尿病视网膜病变患者的外周血单核细胞和视网膜组织 医学研究 糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、分子对接模拟、DCFDA测定、H&E和PAS染色、ELISA、免疫荧光、免疫组化、Western blotting NA 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据 糖尿病视网膜病变患者的外周血单核细胞和视网膜组织样本
288 2025-07-12
Integrated single-cell and bulk RNA dequencing to identify and validate prognostic genes related to T Cell senescence in acute myeloid leukemia
2025, Frontiers in bioinformatics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,识别并验证了与急性髓性白血病(AML)中T细胞衰老相关的预后基因 结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,识别了与AML进展相关的T细胞衰老基因,并构建了一个新的AML风险模型 研究依赖于公开数据库的数据,可能受到样本量和数据质量的限制 探索T细胞衰老相关基因在AML进展中的作用,并构建预测模型 急性髓性白血病(AML)患者 生物信息学 急性髓性白血病 scRNA-seq, RNA-seq, RT-qPCR 风险模型 RNA测序数据 来自TCGA数据库的AML患者数据,以及GSE116256、GSE114868和GSE71014数据集
289 2025-07-12
Single-cell transcriptome and multi-omics integration reveal ferroptosis-driven immune microenvironment remodeling in knee osteoarthritis
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组和多组学整合揭示了铁死亡驱动的膝关节骨关节炎免疫微环境重塑 首次在单细胞分辨率下探索铁死亡与免疫功能障碍的相互作用,并鉴定出KOA的诊断生物标志物 样本量相对较小(单细胞数据n=11,批量RNA-seq队列分别为20/18和8/4) 解析铁死亡驱动的免疫重塑并鉴定KOA的诊断生物标志物 膝关节骨关节炎(KOA)患者的软骨细胞和免疫微环境 生物信息学 膝关节骨关节炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序(bulk RNA-seq) LASSO-SVM诊断模型 转录组数据 单细胞数据11例,批量RNA-seq队列分别为20例KOA/18例对照和8例KOA/4例对照
290 2025-07-12
Investigating the role of tumor cell heterogeneity and angiogenesis genes in the prognosis of multiple myeloma
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了肿瘤细胞异质性和血管生成相关基因在多发性骨髓瘤预后中的作用 通过整合转录组数据和单细胞RNA测序数据,识别了CREB3L2转录因子在抑制血管生成和肿瘤细胞增殖迁移中的关键作用,并构建了高精度的预后模型 研究依赖于公共数据库数据,未进行独立队列验证 探索肿瘤细胞异质性和血管生成相关基因对多发性骨髓瘤预后的影响 多发性骨髓瘤患者 生物信息学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序、差异基因表达分析、CNV分析、转录因子分析 预后预测模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据 公共数据库(Xena/GEO)中的多发性骨髓瘤患者样本
291 2025-07-12
A bibliometric analysis of studies related to the nuclear factor kappa B signaling pathway in knee osteoarthritis between 2004 and 2023
2025, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 本文通过文献计量学方法分析了2004至2023年间关于核因子κB(NF-κB)信号通路在膝骨关节炎(KOA)中的研究趋势和热点 首次系统性地对NF-κB信号通路在KOA领域的研究进行文献计量学分析,揭示了该领域的研究热点和发展趋势 缺乏实时可视化NF-κB活性的体内成像技术 识别NF-κB信号通路在KOA研究中的主要研究领域和趋势 2004-2023年间发表的752篇关于NF-κB信号通路在KOA中的研究文献 文献计量学分析 膝骨关节炎 文献计量学分析工具(CiteSpace、VOSviewer等) NA 文献数据 752篇研究文献
292 2025-07-12
Delineation of single-cell Altas provides new insights for development of coronary artery lesions in Kawasaki disease: bad and good signaling molecules
2025, Frontiers in pediatrics IF:2.1Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,揭示了川崎病(KD)患者冠状动脉病变(CALs)发展的新信号分子 首次在单细胞水平上描绘了KD患者CAL发展的信号分子图谱,识别了MCH-II和RESISTIN作为CAL发展的不良和保护信号 样本量较小(每组3例患者),且仅分析了外周血单个核细胞 探究KD患者CAL发展的分子机制 川崎病(KD)患者的外周血单个核细胞 数字病理 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 12例样本(3例KD非CAL患者治疗前后,3例KD CAL患者治疗前,3例KD CAL患者治疗后)
293 2025-07-12
Identification of Shared Biomarkers in Chronic Kidney Disease and Diabetic Nephropathy Using Single-Cell Sequencing
2025, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
研究论文 通过单细胞测序技术识别慢性肾病和糖尿病肾病的共享生物标志物 首次使用单细胞RNA测序技术比较慢性肾病和糖尿病肾病的基因表达差异,并识别出共享的生物标志物 样本量较小,仅包括3个对照组、3个慢性肾病和3个糖尿病肾病病例 识别慢性肾病和糖尿病肾病的共享生物标志物,探索其共同发病机制 人类血液样本中的不同细胞类型 生物信息学 慢性肾病和糖尿病肾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 9例人类血液样本(3对照、3慢性肾病、3糖尿病肾病)
294 2025-07-11
Comparison of single-cell long-read and short-read transcriptome sequencing via cDNA molecule matching: quality evaluation of the MAS-ISO-seq approach
2025-Sep, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1
研究论文 比较单细胞长读长和短读长转录组测序方法,评估MAS-ISO-seq方法的质量 通过cDNA分子匹配比较长读长和短读长测序方法,揭示了两种方法在转录本恢复和基因表达分析中的偏差 研究仅基于10x Genomics 3' cDNA样本,可能不适用于其他类型的样本或测序平台 评估长读长和短读长单细胞RNA测序方法的可比性及其在转录本恢复和基因表达分析中的偏差 单细胞RNA测序数据 基因组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),长读长测序(Pacific Biosciences),短读长测序(Illumina) NA 转录组数据 相同10x Genomics 3' cDNA样本的长读长和短读长测序数据
295 2025-07-11
Identify critical genes of breast cancer and corresponding leading natural product compounds of potential therapeutic targets
2025-Aug, Molecular diversity IF:3.9Q2
研究论文 通过多组学研究识别乳腺癌的关键基因及潜在天然产物治疗靶点 采用多组学方法(WGCNA、差异基因表达分析、ChIP-seq、scRNA-seq和空间转录组学)综合识别乳腺癌关键基因,并通过大规模虚拟筛选发现靶向SQLE的天然产物化合物 未提及具体样本量及临床验证阶段的局限性 识别乳腺癌的关键基因、治疗靶点及潜在天然产物疗法 乳腺癌细胞系及天然产物化合物 生物信息学 乳腺癌 WGCNA, ChIP-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, 虚拟筛选 NA 基因表达数据、表观遗传数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 NA
296 2025-07-11
RNA binding proteins PCBP1 and PCBP2 regulate pancreatic β cell translation
2025-Aug, Molecular metabolism IF:7.0Q1
研究论文 研究RNA结合蛋白PCBP1和PCBP2在调节胰腺β细胞翻译中的作用 揭示了PCBP1和PCBP2在维持β细胞mRNA翻译和葡萄糖稳态中的关键作用,特别是通过结合和稳定核心翻译起始因子和核糖体mRNAs 研究主要基于小鼠模型,结果在人类β细胞中的适用性尚需进一步验证 探究PCBP1和PCBP2在β细胞稳态和翻译调控中的关系 胰腺β细胞 分子生物学 糖尿病 单细胞RNA测序、qRT-PCR、western blot、RNA免疫沉淀、CRISPR-Cas9、shRNA、嘌呤霉素标记 NA RNA序列数据、蛋白质数据 小鼠β细胞特异性缺失Pcbp1和Pcbp1/2的小鼠模型
297 2025-07-11
METRNL represses beta-to-alpha cell trans-differentiation to maintain beta cell function under diabetic metabolic stress in mice
2025-Aug, Diabetologia IF:8.4Q1
研究论文 本研究探讨了METRNL蛋白在糖尿病代谢压力下维持β细胞功能和防止β细胞向α细胞转分化中的作用 首次揭示了METRNL在维持β细胞完整性和功能中的关键作用,特别是在代谢压力下防止β细胞向α细胞转分化 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证 研究METRNL在糖尿病中维持β细胞功能和身份的作用 小鼠β细胞 糖尿病研究 糖尿病 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 葡萄糖刺激胰岛素分泌(GSIS)测定 基因敲除小鼠模型 基因表达数据, 蛋白质数据 未明确说明具体数量,但使用了多种小鼠模型(正常饮食、高脂饮食、db/db小鼠)
298 2025-07-11
FAM83A Promotes the Progression and Metastasis of Head and Neck Squamous Cell Carcinoma via PKM2-Mediated Aerobic Glycolysis
2025-Jul-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究首次探讨了FAM83A与PKM2在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的关系,揭示了FAM83A通过PKM2介导的有氧糖酵解促进HNSCC的进展和转移 首次发现FAM83A通过激活Wnt/β-catenin信号通路促进PKM2的转录激活,进而调控HNSCC的糖代谢重编程 研究主要基于体外实验和动物模型,临床样本验证仍需进一步扩大 探究FAM83A在HNSCC代谢中的作用及其与PKM2的调控关系 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC) 肿瘤代谢 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序、RNA测序分析 NA 基因表达数据、临床样本数据 HNSCC临床样本及小鼠模型
299 2025-07-11
The mechanism of Akkermansia muciniphila inhibiting the proliferation of colorectal cancer cells via ferroptosis
2025-Jul-10, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
研究论文 本研究探讨了Akkermansia muciniphila通过铁死亡途径抑制结直肠癌细胞增殖的机制 首次揭示了Akkermansia muciniphila代谢物通过铁死亡途径抑制结直肠癌细胞增殖的具体机制 研究仅使用了Caco-2细胞系,未进行体内实验验证 阐明Akkermansia muciniphila抑制结直肠癌细胞增殖的分子机制 Caco-2结直肠癌细胞系 肿瘤生物学 结直肠癌 单细胞转录组分析、流式细胞术、细胞划痕实验 NA 细胞实验数据 使用Caco-2细胞系进行的体外实验
300 2025-07-11
Myeloid MAS-driven macrophage efferocytosis promotes resolution in ischemia-stressed mouse and human livers
2025-Jul-09, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究探讨了MAS受体在骨髓细胞先天免疫和维持肝组织稳态中的具体作用,特别是在肝脏缺血再灌注损伤(LIRI)中的保护机制 揭示了MAS受体通过PKA/CREB信号通路调控KLF4/MERTK轴在巨噬细胞胞葬作用中的新机制,并证明了其在人和小鼠缺血应激肝脏中的治疗潜力 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 阐明MAS受体在肝脏缺血再灌注损伤中的保护机制 小鼠和人类缺血应激肝脏中的巨噬细胞和衰老中性粒细胞 分子生物学与免疫学 肝脏疾病 单细胞RNA测序、空间转录组学、活体成像 基因敲除小鼠模型 基因表达数据、影像数据 未明确说明具体样本数量,但涉及基因修饰小鼠和人类肝脏样本
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