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当前共找到 10779 篇文献，本页显示第 2901 - 2920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2901 | 2025-11-17 |
Integration of bulk and single-cell transcriptomic data reveals a novel signature related to liver metastasis and basement membrane in pancreatic cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1671956
PMID:41235257
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk转录组数据，构建了一个与胰腺癌肝转移和基底膜相关的预后模型 | 首次整合单细胞和bulk转录组数据识别胰腺癌肝转移和基底膜相关基因，并构建包含COL7A1等六个标志基因的创新预后模型 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证；样本来源有限，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 构建胰腺癌肝转移和基底膜相关基因的预后模型，并验证其与免疫微环境和治疗疗效的关联 | 胰腺癌患者样本数据，包括TCGA、ICGC和GEO数据库的转录组、突变和临床数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，WGCNA分析，机器学习算法，多变量Cox回归分析 | 预后模型，机器学习算法，Cox回归模型 | 转录组数据，突变数据，临床数据 | TCGA-PAAD队列（训练集）和PACA-AU队列（验证集） | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2902 | 2025-11-17 |
The single-cell revolution in transplantation: high-resolution mapping of graft rejection, tolerance, and injury
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1670683
PMID:41235239
|
综述 | 系统总结单细胞测序技术在移植生物学中的应用及其对移植排斥、免疫耐受和损伤机制的高分辨率解析 | 首次系统阐述单细胞技术如何将移植医学从形态学诊断推向分子内表型分析的新时代，揭示传统方法无法发现的细胞亚群和致病通路 | 临床转化仍面临挑战 | 阐明决定移植物命运的机制 | 实体器官和胰岛移植 | 数字病理学 | 移植相关疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2903 | 2025-11-17 |
Integrating scRNA-seq and machine learning identifies MNAT1 as a therapeutic target in OSCC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1663487
PMID:41235252
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和机器学习技术，构建了口腔鳞状细胞癌的预后模型并鉴定MNAT1为治疗靶点 | 首次构建基于T细胞相关泛素化基因的预后风险模型，并发现MNAT1在OSCC恶性进展中的关键作用 | 研究主要基于计算分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 开发口腔鳞状细胞癌的预后预测模型和寻找治疗靶点 | 口腔鳞状细胞癌患者和Cal27细胞系 | 机器学习 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序, WGCNA, LASSO算法, Spearman相关分析, 集落形成实验, Transwell实验 | 预后风险模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2904 | 2025-11-17 |
Multiomic Landscape Uncovers TRMT112 as a Central Driver of HPV-Positive Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/5308441
PMID:41235342
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示TRMT112作为HPV阳性头颈鳞状细胞癌的核心驱动因子 | 首次整合单细胞RNA测序、bulk RNA测序和空间转录组数据，发现TRMT112是HPV+HNSCC的关键风险基因并与免疫排斥微环境形成相关 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证机制 | 解析HPV阳性头颈鳞状细胞癌的分子机制和免疫景观 | 头颈鳞状细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 空间转录组, 机器学习算法 | 高维加权基因共表达网络分析, 基因非负矩阵分解, 101种机器学习算法 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | TCGA-HNSC和GSE65858队列患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 2905 | 2025-11-17 |
Glucokinase Regulatory Protein (GCKR) Links Metabolic Reprogramming With Immune Exclusion: Insights From a Pan-Cancer Analysis and Gastric Cancer Validation
2025, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/4240223
PMID:41235343
|
研究论文 | 通过泛癌分析和胃癌验证揭示了GCKR在代谢重编程与免疫排斥中的关键作用 | 首次系统描绘GCKR在泛癌中的表达和突变图谱，并发现其通过代谢重编程影响肿瘤免疫微环境的新机制 | 研究主要聚焦于胃癌验证，其他癌症类型的功能验证相对有限 | 探究GCKR在癌症中的遗传和功能作用及其与免疫微环境的关联 | 泛癌数据集和胃癌样本 | 生物信息学 | 胃癌 | 多组学分析、空间转录组学、单细胞分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞数据 | 泛癌数据集和胃癌验证样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞分析 | NA | NA |
| 2906 | 2025-11-17 |
Comprehensive Analysis of the PANoptosis-Related Genes in Stroke Based on Single-Cell RNA-Seq and Spatial Transcriptomics
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/5828665
PMID:41235394
|
研究论文 | 基于单细胞RNA测序和空间转录组学综合分析脑卒中中的PANoptosis相关基因 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据，系统研究缺血性脑卒中中的PANoptosis分子特征 | 研究样本量有限，需要进一步实验验证TNFRSF1A的功能机制 | 探索PANoptosis在脑缺血再灌注损伤中的作用机制 | 缺血性脑卒中患者的脑组织样本 | 生物信息学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,Western blot | 多模态交叉分析,高维加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,批量转录组数据 | 多个数据集（包括GSE35338和GSE137482） | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2907 | 2025-11-16 |
Cell-type deconvolution methods for spatial transcriptomics
2025-Dec, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00845-y
PMID:40369312
|
综述 | 本文系统评述了空间转录组学中细胞类型反卷积方法的类型、功能对比，并创建了在线交互式表格以促进方法选择 | 开发了基于网络的交互式表格工具，帮助研究人员更高效地选择适合的空间转录组细胞类型反卷积方法 | NA | 评述空间转录组学中细胞类型反卷积方法的现状与发展 | 空间转录组学数据中的细胞类型组成 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2908 | 2025-11-16 |
Simultaneously infer cell pseudotime, velocity field, and gene interaction from multi-branch scRNA-seq data with scPN
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf144
PMID:41229398
|
研究论文 | 提出一种名为scPN的新型高维动力学建模方法，可从单细胞RNA测序数据同时推断细胞伪时间、速度场和基因相互作用 | 首次能够在多分支数据集上同时恢复伪时间、速度场和基因相互作用，使用分段基因-基因相互作用网络建模基因调控动力学 | NA | 从单细胞RNA测序数据建模细胞动力学，理解细胞发育和基因调控关系 | 单细胞RNA测序数据中的细胞发育过程和基因相互作用网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 高维动力学模型，分段网络模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2909 | 2025-11-16 |
Allele-specific immune gene quantification and expression analysis in single-cell RNA-seq data
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf149
PMID:41229397
|
研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据中免疫基因等位基因特异性表达定量的新型计算方法 | 开发了新型R/Bioconductor数据结构，可处理多个免疫遗传注释层的表达数据，并支持免疫基因表达的交互式探索 | NA | 研究人类免疫基因组多样性中的等位基因特异性表达模式 | 人类免疫基因（如HLA和KIR基因） | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2910 | 2025-11-16 |
Clinical characteristics and target exploration via scRNA-seq and high-throughput drug screening of FOXO1 fusion positive rhabdomyosarcoma
2025-Nov-15, Pediatric surgery international
IF:1.5Q3
DOI:10.1007/s00383-025-06241-1
PMID:41240117
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高通量药物筛选探索FOXO1融合阳性横纹肌肉瘤的临床特征和治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序与高通量药物筛选系统研究FOXO1融合状态对横纹肌肉瘤的影响，并发现MET作为潜在治疗靶点 | 样本量相对有限（65例患者），且包含罕见病例类型 | 研究FOXO1融合状态对横纹肌肉瘤临床特征和治疗靶点的影响 | 65例儿童横纹肌肉瘤患者及其肿瘤组织 | 数字病理学 | 横纹肌肉瘤 | 单细胞RNA测序，高通量药物筛选，患者来源异种移植模型 | Cox回归分析，Kaplan-Meier估计 | 临床数据，单细胞转录组数据 | 65例儿童横纹肌肉瘤患者（36例胚胎型，15例腺泡型，14例其他类型） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2911 | 2025-11-16 |
Targeting the HMGB1-IL32 pathway to alleviate T cell exhaustion in epithelial ovarian cancer
2025-Nov-15, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01963-5
PMID:41240232
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了卵巢癌细胞通过HMGB1-IL32信号通路影响终末耗竭CD8+T细胞的机制 | 首次发现HMGB1-HAVCR2配体-受体对介导卵巢癌细胞与终末耗竭CD8+T细胞的通讯，并阐明HMGB1通过NFKB1和TP53调控IL32表达的新信号通路 | NA | 解析卵巢癌微环境中细胞间通讯对终末耗竭CD8+T细胞的影响机制 | 卵巢癌微环境中的癌细胞和CD8+T细胞 | 单细胞基因组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2912 | 2025-11-16 |
Identification of key diagnostic and prognostic biomarkers for aortic valve stenosis with coronary artery disease through immunological profiling integrating proteomics, single-cell sequencing, and machine learning
2025-Nov-14, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152855
PMID:41151411
|
研究论文 | 通过整合蛋白质组学、单细胞测序和机器学习的免疫学分析，识别主动脉瓣狭窄合并冠状动脉疾病的关键诊断和预后生物标志物 | 首次系统整合多组学数据和机器学习方法识别AS-CAD特异性生物标志物FGL1，并验证其诊断和预后价值 | 样本量有限，需要更大规模的多中心研究验证 | 系统识别AS-CAD的分子生物标志物并评估其临床预后相关性 | 主动脉瓣狭窄合并冠状动脉疾病患者组织样本、ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化模型、RAW264.7巨噬细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序、机器学习、LASSO回归、ELISA、免疫组化、Western blotting | LASSO回归 | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据、临床数据 | AS-CAD患者组织样本、独立临床队列、多中心前瞻性TAVI患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 2913 | 2025-11-16 |
Immunosuppression of HMOX1 contributes to metastasis and poor prognosis in glioma
2025-Nov-14, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152848
PMID:41151408
|
研究论文 | 本研究探讨HMOX1在胶质瘤免疫抑制和转移中的作用机制 | 首次系统揭示HMOX1通过促进M2巨噬细胞极化介导胶质瘤免疫抑制和转移的分子机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，需要更多临床样本验证 | 阐明HMOX1与胶质瘤免疫抑制和转移的关系 | 胶质瘤患者样本和细胞系 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 细胞实验, 异种移植模型 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | CGGA数据库693例患者, TCGA数据库702例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2914 | 2025-11-16 |
An islet-resident macrophage antioxidant program preserves β cell physiology
2025-Nov-14, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adz5181
PMID:41237222
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研究论文 | 本研究揭示了胰岛驻留巨噬细胞的抗氧化程序如何保护β细胞生理功能 | 首次发现SLC7A11驱动的转录程序在CD9阳性胰岛巨噬细胞中增强抗氧化防御，并确定这些巨噬细胞作为内分泌胰腺中专化免疫哨兵的功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类胰岛巨噬细胞的功能验证仍需进一步研究 | 探究胰岛驻留巨噬细胞的起源、异质性和功能作用 | 小鼠和人类胰岛中的驻留巨噬细胞 | 免疫学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序，命运图谱系统 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2915 | 2025-11-16 |
Hepatocyte metabolic adaptations during pregnancy and lactation
2025-Nov-13, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.08.007
PMID:40882627
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序系统揭示了小鼠在妊娠和哺乳期间肝细胞的代谢适应机制 | 发现了控制妊娠代谢变化的'妊娠时钟'周期性轨迹，并揭示了哺乳期独特的脂质合成分支轨迹 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明妊娠和哺乳期间肝细胞代谢适应的精确过程和调控机制 | 小鼠肝细胞，绵羊肝细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠妊娠和产后多个阶段的肝细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 高分辨率单细胞RNA测序 |
| 2916 | 2025-11-16 |
Stereo-seq V2: Spatial mapping of total RNA on FFPE sections with high resolution
2025-Nov-13, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.08.008
PMID:40882628
|
研究论文 | 介绍Stereo-seq V2技术，能够在FFPE组织切片上实现高分辨率全RNA空间图谱分析 | 采用随机引物策略在FFPE切片上实现原位RNA捕获测序，提供单细胞分辨率，具有无偏转录本捕获和均匀基因覆盖特性 | NA | 开发适用于FFPE样本的空间转录组技术，提升临床样本的RNA分析能力 | 三阴性乳腺癌组织切片、结核分枝杆菌感染小鼠模型、人类结核肺样本 | 空间转录组学 | 乳腺癌, 结核病 | 空间转录组测序 | NA | 空间RNA表达数据 | 临床FFPE样本、小鼠感染模型、人类结核样本 | 华大基因(BGI) | 空间转录组学 | Stereo-seq V2 | 基于随机引物的FFPE切片空间全RNA分析技术 |
| 2917 | 2025-11-16 |
Single-cell analysis of human airway epithelium identifies cell-type-specific responses to Aspergillus and Coccidioides
2025-Nov-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02121-25
PMID:41081505
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人类气道上皮细胞对两种真菌病原体的细胞类型特异性反应 | 首次报道了使用单细胞转录组分析人类气道上皮细胞对曲霉菌和球孢子菌感染的反应 | 动物模型不能完全重现人类疾病，需要更先进的模型来研究人类-真菌病原体相互作用 | 研究人类气道上皮细胞对不同真菌病原体的早期发病机制 | 原代人类气道上皮细胞 | 单细胞测序 | 呼吸道真菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2918 | 2025-11-16 |
Anti-diuretic hormone ITP signals via a guanylate cyclase receptor to modulate systemic homeostasis in Drosophila
2025-Nov-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97043
PMID:41222455
|
研究论文 | 本研究系统表征了果蝇中离子转运肽(ITP)信号系统及其通过鸟苷酸环化酶受体Gyc76C调节全身稳态的机制 | 首次鉴定Gyc76C为ITP的专一性受体，揭示了ITP信号系统在渗透调节和代谢稳态中的双重功能 | 研究主要基于果蝇模型，在哺乳动物中的保守性需要进一步验证 | 阐明果蝇中抗利尿激素ITP信号系统在维持全身稳态中的作用机制 | 果蝇(Drosophila)的神经系统、肾小管、直肠和脂肪体等组织 | 分子生物学 | 代谢性疾病 | RNA干扰、外分泌测定、异源哺乳动物细胞测定、连接组学、单细胞转录组学 | 基因敲低、过表达 | 基因表达数据、生理功能数据、行为数据 | 果蝇幼虫和成虫组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2919 | 2025-11-16 |
Age-impaired remyelination is associated with dysregulated microglial transitions
2025-Nov-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64906-w
PMID:41224757
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析脱髓鞘小鼠模型中微胶质细胞在髓鞘再生过程中的反应 | 发现髓鞘再生早期存在多种不同的微胶质细胞状态，这些状态最终汇聚为包含髓鞘转录物的解决状态，且该状态也存在于多发性硬化症患者大脑中 | 研究基于小鼠模型，结果向人类应用的转化需要进一步验证 | 探究年龄相关的髓鞘再生障碍与微胶质细胞状态转变失调的关联 | 小鼠模型中的微胶质细胞 | 单细胞基因组学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2920 | 2025-11-16 |
HPCAL1 as a novel prognostic biomarker in acute myeloid leukemia and its correlation with immune infiltrates
2025-Nov-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23386-0
PMID:41224963
|
研究论文 | 本研究探讨HPCAL1作为急性髓系白血病新型预后生物标志物的潜力及其与免疫浸润的关联 | 首次将钙结合蛋白HPCAL1确立为AML的新型预后指标，并揭示其通过免疫微环境调节和单核细胞群体动态介导不良预后的机制 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证来阐明HPCAL1在AML发病机制中的具体作用 | 探索HPCAL1在急性髓系白血病中的预后价值及其与肿瘤免疫微环境的相互作用 | 急性髓系白血病患者样本和多个独立队列数据集 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | RNA测序，单细胞RNA测序，ESTIMATE分析，GSEA/GSVA分析 | 共表达网络分析，蛋白质相互作用分析 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 多个独立队列（GSE13159，GSE34184，GSE24395，机构数据和GSE130756单细胞数据集） | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |