单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7544 篇文献，本页显示第 2881 - 2900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2881 | 2025-07-05 |
Interferon Regulatory Factor 4 Recruits Immature B Cells to Signal Tertiary Lymphoid Structure Immaturity and Progression of Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.113737
PMID:40607252
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research paper | 该研究通过整合转录组和临床数据，构建了一个与三级淋巴结构（TLS）相关的预后风险评分，并揭示了干扰素调节因子4（IRF4）在促进TLS不成熟和免疫功能障碍中的机制作用 | 构建了TLS相关的预后风险评分，揭示了IRF4在TLS不成熟和免疫功能障碍中的新机制 | 研究主要基于ccRCC患者数据，结果可能不适用于其他类型的癌症 | 探究TLS在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的预后相关性及其调控机制 | 928名ccRCC患者的转录组和临床数据，以及786-O和769-P ccRCC细胞系 | 肿瘤免疫学 | 透明细胞肾细胞癌 | 转录组分析、免疫组化、多重免疫荧光分析、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | 机器学习算法 | 转录组数据、临床数据、图像数据 | 928名ccRCC患者 |
| 2882 | 2025-07-05 |
Integrative multi-omics analysis of IFNγ-induced macrophages and atherosclerotic plaques reveals macrophage-dependent STAT1-driven transcription in atherosclerosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1590953
PMID:40607379
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research paper | 该研究通过整合多组学分析，揭示了IFNγ诱导的巨噬细胞和动脉粥样硬化斑块中STAT1驱动的转录机制在动脉粥样硬化中的作用 | 发现了STAT1与PU.1在巨噬细胞特异性IFNγ激活转录反应中的协同作用，并鉴定了新的生物标志物和治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，可能无法完全反映人类动脉粥样硬化的复杂性 | 探究巨噬细胞STAT1介导的信号在动脉粥样硬化进展中的作用 | IFNγ诱导的巨噬细胞和人类及小鼠的动脉粥样硬化病变 | digital pathology | cardiovascular disease | ATAC-seq, ChIP-seq, RNA-seq, scRNA-seq | NA | genomic data, transcriptomic data | 人类颈动脉和冠状动脉粥样硬化病变样本，以及LDLr-/-和ApoE-/-高脂饮食小鼠模型的主动脉病变样本 |
| 2883 | 2025-07-05 |
Integrative analysis of T cell-associated markers in Ewing sarcoma reveals prognostic signatures and immune dynamics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1586544
PMID:40607387
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA-seq分析，探讨了尤文肉瘤中T细胞相关标志物的预后特征和免疫动态 | 识别了CLEC11A、BDP1和ID3作为关键的T细胞相关预后标志物，并构建了一个预测模型，揭示了ID3在免疫逃逸和肿瘤增殖中的作用 | 研究样本量较小，且仅基于RNA-seq数据，未考虑其他分子层面的影响 | 探索尤文肉瘤中T细胞相关标志物的预后特征和免疫动态，以改善预后评估和免疫治疗策略 | 尤文肉瘤患者样本和细胞系 | 数字病理学 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序、批量RNA-seq、WGCNA、CIBERSORT算法 | Cox回归模型 | RNA-seq数据 | 未明确提及具体样本数量，但使用了外部数据集进行验证 |
| 2884 | 2025-07-05 |
Single-cell analysis of peripheral blood and pleural effusion reveals functional diversity of γδ T cells in tuberculosis infection
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1605827
PMID:40607390
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研究论文 | 通过单细胞测序分析结核病患者外周血和胸水中的γδ T细胞亚群，揭示其在结核感染中的功能多样性 | 首次在单细胞水平上鉴定出结核病患者外周血和胸水中的7个γδ T细胞亚群，并发现具有强效应功能的Vδ2细胞亚群 | 研究样本量有限，且仅关注了γδ T细胞，未涉及其他免疫细胞类型的相互作用 | 探究γδ T细胞在结核病免疫应答中的具体作用和分化机制 | 结核病患者的外周血单个核细胞(PBMC)和结核性胸水细胞(TPE) | 免疫学 | 结核病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量，仅提及结核病患者的外周血和胸水样本 |
| 2885 | 2025-07-05 |
Decoding neuroinflammation in Alzheimer's disease: a multi-omics and AI-driven perspective for precision medicine
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1616899
PMID:40607399
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research paper | 本文探讨了利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和AI驱动的多组学平台解码阿尔茨海默病（AD）中复杂的免疫炎症网络，以实现精准医疗 | 结合scRNA-seq和AI驱动的多组学分析，突破了传统大规模组织分析中的信号平均化限制，发现了与疾病相关的新的细胞亚群和关键分子标志物 | 尽管技术先进，但有效的治疗选择仍然有限 | 解码AD中的神经炎症，实现精准医疗 | 阿尔茨海默病（AD）患者脑组织 | 精准医疗 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq, AI-driven analytics, multi-omics platforms | AI-driven analytics | RNA-seq数据, 多组学数据 | NA |
| 2886 | 2025-07-05 |
Landscape analysis of matrix metalloproteinases reveals key prognostic markers for prostate cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1582992
PMID:40607407
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研究论文 | 本研究全面分析了基质金属蛋白酶（MMPs）在前列腺癌（PCa）中的作用，并特别强调了MMP11在肿瘤微环境重编程中的关键作用 | 首次全面评估了MMPs在PCa中的表达特征和预后价值，并发现MMP11通过重塑肿瘤微环境促进PCa进展 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仅限于细胞水平 | 探索MMPs在PCa中的预后价值和生物学功能 | 前列腺癌组织和细胞 | 肿瘤生物学 | 前列腺癌 | 生物信息学分析（UCSC/GEO数据库）、COX回归分析、单细胞转录组分析、空间转录组分析 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 来自UCSC和GEO数据库的多个前列腺癌数据集 |
| 2887 | 2025-07-05 |
The functional and clinical significance of nucleoporin NUP153 across human cancers: a systematic study based on multi-omics analysis and bench work validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1613688
PMID:40607419
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证，探讨了核孔蛋白NUP153在多种癌症中的功能和临床意义 | 首次系统研究了NUP153在多种癌症中的表达模式、突变情况、诊断价值及其与肿瘤免疫微环境的关系，并验证了其在胃癌中的高表达及其与免疫细胞浸润的相关性 | 需要进一步研究阐明NUP153在癌症中的具体分子机制及其临床应用的可行性 | 探索NUP153在癌症中的功能和临床意义 | 多种癌症类型，特别是胃癌 | 癌症研究 | 多种癌症，包括胆管癌、结直肠癌、头颈部鳞状细胞癌、胃癌等 | 多组学分析、免疫组化、RT-qPCR、单细胞分析、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、免疫细胞浸润数据、药物敏感性数据 | 来自TCGA和GTEx等公共数据库的数据，以及胃癌组织的实验验证样本 |
| 2888 | 2025-07-05 |
Identification and validation of a KRAS-macrophage-associated gene signature as prognostic biomarkers and potential therapeutic targets in melanoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1566432
PMID:40607411
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研究论文 | 本研究通过多平台方法识别并验证了一个与KRAS信号和巨噬细胞相关的基因特征（KMPAG），作为黑色素瘤的预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次构建了KRAS-巨噬细胞预后相关基因特征（KMPAG），并验证其在黑色素瘤预后和治疗反应预测中的价值 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证部分仍需进一步扩展 | 探索KRAS信号通路在黑色素瘤肿瘤微环境中的作用，并开发预后生物标志物 | 皮肤黑色素瘤（SKCM）患者样本和细胞系 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、基因集富集分析（GSEA）、免疫组化（IHC） | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA数据库的黑色素瘤样本 |
| 2889 | 2025-07-04 |
Large-scale dependency and drug screens to characterize the therapeutic vulnerabilities of multiple myeloma with 1q
2025-Jul-03, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024025102
PMID:40073369
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研究论文 | 通过大规模依赖性和药物筛选，系统性表征了1q+多发性骨髓瘤的治疗脆弱性，并发现其对MCL1和PI3K抑制剂的敏感性增加 | 首次系统性揭示了1q+多发性骨髓瘤对MCL1和PI3K抑制剂的敏感性，并阐明了其作用机制 | 研究主要基于体外实验，尚未进行临床验证 | 开发针对1q+多发性骨髓瘤的靶向治疗策略 | 1q+多发性骨髓瘤患者 | 肿瘤学 | 多发性骨髓瘤 | 大规模依赖性筛选、药物筛选、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 2890 | 2025-07-04 |
IFN-γ promotes the progression of iMCD by activating inflammatory monocytes
2025-Jul-03, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027689
PMID:40163892
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了特发性多中心Castleman病（iMCD）患者的免疫景观，揭示了IL-6和IFN-II信号通路在疾病进展中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了iMCD患者中CCL单核细胞通过IFN-II信号与NK/NKT细胞相互作用，以及IFN-γ水平与疾病严重程度和治疗抵抗的正相关性 | 样本量较小（15例iMCD患者和4例健康对照），且部分发现需要在大规模独立队列中进一步验证 | 深入了解iMCD的免疫机制，建立早期预后分层并发现新的治疗靶点 | 特发性多中心Castleman病（iMCD）患者的外周血单个核细胞（PBMCs）、淋巴结和骨髓样本 | 免疫学 | 特发性多中心Castleman病（iMCD） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 15例iMCD患者和4例健康对照的外周血单个核细胞（PBMCs），以及部分淋巴结和骨髓样本 |
| 2891 | 2025-07-04 |
Single-cell transcriptomics reveals depletion and dysregulation of Mycobacterium tuberculosis-specific Th1 and Th17 cells early after acquisition of HIV
2025-Jul-03, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf354
PMID:40605619
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组学揭示了HIV感染早期对结核分枝杆菌特异性Th1和Th17细胞的耗竭和功能失调 | 首次在HIV感染早期阶段，通过单细胞RNA测序技术揭示了结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞的耗竭和功能失调机制 | 研究样本量有限，且仅关注了HIV感染早期的变化 | 探究HIV感染如何影响对结核分枝杆菌的CD4 T细胞免疫应答 | HIV感染者和非感染者的结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞 | 免疫学 | 结核病/HIV感染 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 一组HIV感染者和非感染者的样本（具体数量未明确说明） |
| 2892 | 2025-07-04 |
Engineering a Lipid Nanoparticle with Atypical Calcium Crystal Structure for Enhanced IFNβ-Mediated Immunotherapy
2025-Jul-03, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202419870
PMID:40605669
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研究论文 | 本研究开发了一种具有非典型晶体结构和pH响应特性的纳米材料NanoCa，用于增强IFNβ介导的免疫治疗 | 发现NanoCa通过Ca-calcineurin-NFATc2-PKCβ-IRF3信号通路触发干扰素，增强抗肿瘤免疫反应 | 未明确提及具体局限性 | 探索金属离子通过干扰素激活促进树突状细胞成熟的机制，并开发新型抗肿瘤免疫治疗策略 | 钙磷酸盐脂质体纳米材料(NanoCa)及其在肿瘤模型中的免疫调节作用 | 纳米医学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | CT26肿瘤模型 | 基因表达数据 | 多种肿瘤模型(具体数量未明确) |
| 2893 | 2025-07-04 |
A Comparative Analysis Dissecting the Immune Landscape of Vitiligo and Melanoma from a single-cell Perspective: Two Sides of the Same Coin?
2025-Jul-03, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02332-2
PMID:40608219
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术比较分析白癜风和黑色素瘤的免疫微环境差异 | 首次从单细胞角度全面比较白癜风和黑色素瘤的免疫微环境，揭示两者在免疫激活与逃逸机制上的根本差异 | 样本来源和数量未明确说明，可能影响结果的普适性 | 解析白癜风和黑色素瘤免疫微环境的异同点 | 健康对照者、白癜风患者和黑色素瘤患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 皮肤病（白癜风和黑色素瘤） | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 |
| 2894 | 2025-07-04 |
Nonhuman Primates Model of Super-selective Intraarterial Ophthalmic Arterial Interventional Thrombolysis for Treatment of Ophthalmic Arterial Embolism Resulting From Hyaluronic Acid Filler Cosmetic Injection
2025-Jul-02, Aesthetic surgery journal
IF:3.0Q1
DOI:10.1093/asj/sjaf132
PMID:40601619
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研究论文 | 本研究提出了一种非人灵长类动物的视网膜缺血再灌注模型，用于研究透明质酸填充剂美容注射导致的眼动脉栓塞的治疗方法 | 首次建立了非人灵长类动物眼动脉缺血再灌注的临床相关模型，并生成了缺血损伤的视网膜细胞图谱 | 研究仅使用恒河猴作为模型，可能无法完全模拟人类临床情况 | 验证动脉内溶栓治疗对透明质酸注射导致的视力障碍的有效性 | 恒河猴眼动脉栓塞模型 | 眼科研究 | 眼动脉栓塞 | 数字减影血管造影(DSA)、眼底荧光素血管造影(FFA)、视网膜电图(ERG)、苏木精-伊红(HE)染色、透射电子显微镜(TEM)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 恒河猴动物模型 | 影像数据、电生理数据、组织学数据、单细胞测序数据 | 未明确说明具体样本数量，使用恒河猴作为研究对象 |
| 2895 | 2025-07-04 |
Pathogenic mechanism of extracranial arteriovenous malformations: insights from clinical, pathological, and genetic analyses
2025-Jul-02, Virchows Archiv : an international journal of pathology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s00428-025-04158-7
PMID:40603544
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研究论文 | 本研究通过临床、病理和遗传分析探讨了颅外动静脉畸形（AVMs）的致病机制 | 揭示了MAP2K1、KRAS和BRAF突变与AVMs的基因型-表型相关性，并发现MAP4K4在异常小血管中的高表达 | 样本量较小（30例患者），且为回顾性研究 | 阐明颅外AVMs的发病机制及其与基因突变的关系 | 30例颅外AVMs患者 | 血管病理学 | 动静脉畸形 | 免疫组织化学、空间转录组学 | NA | 临床数据、病理数据、遗传数据 | 30例颅外AVMs患者 |
| 2896 | 2025-07-04 |
Pan-cancer multi-omics profiling of MS4A2 unveils its functional landscape in lung adenocarcinoma
2025-Jul-02, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002903
PMID:40607924
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research paper | 该研究通过整合多组学数据，揭示了MS4A2在肺腺癌中的功能景观及其预后价值 | 首次在四种生存指标（OS/DSS/PFI/DFI）上全面评估了MS4A2在肺腺癌中的预后分层，并揭示了其通过双趋化因子极化调控免疫抑制微环境的机制 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要进一步实验验证MS4A2的功能机制 | 阐明MS4A2在肺腺癌中的功能角色和临床意义 | 肺腺癌（LUAD）患者 | digital pathology | lung cancer | bulk RNA-seq, 单细胞转录组学, 甲基化表观遗传分析 | Cox回归模型, Kaplan-Meier模型 | 转录组数据, 表观遗传数据, 药物敏感性数据 | TCGA/GTEx数据库中的33种癌症数据及NSCLC队列的单细胞数据 |
| 2897 | 2025-07-04 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals therapeutic mechanisms of adipose-derived stem cell exosomes in sepsis-induced lung injury
2025-Jul-02, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002894
PMID:40607951
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研究论文 | 本研究探讨了脂肪源性干细胞外泌体对脓毒症诱导的肺损伤的治疗效果及其潜在机制 | 首次使用单细胞转录组分析揭示ADSC外泌体通过调节免疫细胞功能和细胞间通讯网络治疗脓毒症肺损伤的新机制 | 样本量较小（每组仅2个样本进行单细胞RNA测序），且仅使用雄性小鼠模型 | 探索脓毒症诱导的急性肺损伤的新型治疗方法 | 脓毒症诱导的急性肺损伤小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠盲肠结扎穿孔(CLP)模型 | 转录组数据 | 每组12只小鼠用于生存率分析，5只用于肺组织病理学分析，2只用于单细胞RNA测序 |
| 2898 | 2025-07-04 |
FLI1 and GATA1 govern TLN1 transcription: new insights into FLI1-related platelet disorders
2025-Jul-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2024.286372
PMID:39744817
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研究论文 | 本研究旨在阐明FLI1变异对人类巨核细胞和血小板的影响，揭示了FLI1与GATA1在TLN1转录调控中的新机制 | 发现FLI1变异通过影响与GATA1的协同转录活性导致talin-1缺乏，从而影响血小板功能，并提出talin-1可作为FLI1变异致病性的生物标志物 | 研究仅针对四种FLI1变异，可能无法涵盖所有相关变异的影响 | 阐明FLI1变异导致血小板功能障碍的分子机制 | 人类巨核细胞和血小板 | 分子生物学 | 血小板功能障碍 | 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序、荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据、蛋白质水平数据 | 患者巨核细胞和血小板样本 |
| 2899 | 2025-07-04 |
Enhancing genetic transformation efficiency in cucurbit crops through AtGRF5 overexpression: Mechanistic insights and applications
2025-Jul, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13912
PMID:40213927
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研究论文 | 本研究通过过表达AtGRF5基因，提高了葫芦科作物的遗传转化效率，并揭示了其机制 | 发现AtGRF5过表达通过促进愈伤组织增殖和增加再生过程中的密集细胞来显著提高遗传转化效率，并开发了ABA诱导的AtGRF5表达系统以减少多效性影响 | AtGRF5过表达可能引起生长缺陷，需要进一步优化以减少副作用 | 提高葫芦科作物的遗传转化效率并揭示其分子机制 | 葫芦科作物 | 植物遗传学 | NA | DNSO方法、高分辨率时间序列转录组学、单细胞RNA测序、DAP-seq | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 |
| 2900 | 2025-07-04 |
Distinct transcriptional changes in hematopoietic progenitor subsets on LPS-induced emergency granulopoiesis
2025-Jul, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.104792
PMID:40316244
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研究论文 | 研究探讨了不同多能祖细胞（MPPs）在LPS诱导的紧急粒细胞生成早期阶段的转录变化及其作用 | 揭示了LPS暴露如何通过转录重编程影响MPPs的谱系输出，特别是发现炎症祖细胞群体的出现及其染色质可及性变化 | 研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类样本或其他感染模型 | 探究MPPs在LPS诱导的紧急粒细胞生成中的作用及其分子机制 | 野生型小鼠的多能祖细胞（MPPs） | 免疫学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、移植实验、伪时间分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 野生型小鼠的MPPs样本 |