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当前共找到 10572 篇文献，本页显示第 2841 - 2860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2841 | 2026-01-21 |
Interpretable Trajectory Inference with Single Cell Linear Adaptive Negative-binomial Expression (scLANE) Testing
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.19.572477
PMID:38187622
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研究论文 | 本文提出了一种名为scLANE的可解释轨迹推断方法，用于单细胞RNA-seq数据中的基因表达动态分析 | scLANE测试基于可解释的广义线性模型，通过经验选择的基样条处理非线性，并扩展至估计方程和混合模型，以支持复杂实验设计下的可靠轨迹测试 | NA | 开发一种可解释的轨迹推断方法，以识别与生物轨迹进展显著相关的基因表达变化 | 单细胞RNA-seq数据中的基因表达动态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | 广义线性模型（GLM）、基样条、估计方程、混合模型 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2842 | 2026-01-21 |
Cigarette smoke and biological age induce degenerative heterogeneity in retinal pigment epithelium
2025-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.27.635096
PMID:39974955
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研究论文 | 本研究探讨了香烟烟雾通过表观遗传变化诱导视网膜色素上皮细胞退行性异质性，并加速衰老的过程 | 首次结合snRNA-seq和snATAC-seq技术，揭示了香烟烟雾诱导的RPE细胞退行性异质性及其与衰老的差异，并在人类样本中验证了与早期年龄相关性黄斑变性的关联 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本，可能无法完全反映人类疾病的复杂性 | 探究香烟烟雾如何通过表观遗传机制诱导视网膜色素上皮细胞的退行性异质性，并加速衰老过程 | 年轻和老年小鼠的视网膜色素上皮/脉络膜组织，以及吸烟者、早期AMD患者和非吸烟者的人类视网膜样本 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | snRNA-seq, snATAC-seq, scRNA-seq, TUNEL标记 | NA | 单细胞转录组数据，单细胞染色质可及性数据 | 年轻和老年小鼠的RPE/脉络膜组织，以及来自吸烟者、早期AMD患者和非吸烟者的人类视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2843 | 2026-01-20 |
Hypoxia-induced USP13 expression drives ferroptosis resistance and tumor immune evasion in hepatocellular carcinoma through the stabilization of ACLY
2025-Dec-02, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02869-z
PMID:41330897
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研究论文 | 本研究揭示了缺氧诱导的USP13通过稳定ACLY蛋白，驱动肝细胞癌的铁死亡抵抗和肿瘤免疫逃逸，并验证了靶向USP13的治疗潜力 | 首次阐明了缺氧/HIF-1α/USP13/ACLY轴在肝细胞癌中介导铁死亡抵抗和免疫逃逸的分子机制，并发现USP13抑制剂2-Methoxyestradiol具有抗肿瘤疗效 | 研究主要基于临床前模型（细胞系、动物模型、PDOs），尚未进行人体临床试验；USP13抑制剂的特异性和潜在脱靶效应需进一步评估 | 探索USP13在肝细胞癌进展中的作用，并评估其作为诱导铁死亡和增强免疫反应的治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌患者来源的类器官、肝细胞癌细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术分析、蛋白质稳定性分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据、细胞表型数据 | 未明确具体样本数量，但使用了患者来源的类器官、多种细胞系和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2844 | 2026-01-20 |
Folic acid prevents inner hair cell degeneration via genomic stability
2025-Dec-02, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02880-4
PMID:41330911
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研究论文 | 本研究揭示了钙稳态破坏在内毛细胞损伤中的作用，并发现叶酸可能是一种有前景的保护毛细胞的治疗剂 | 首次揭示了低频率与高频率内毛细胞在钙清除率上的差异与PMCA1表达相关，并利用特异性敲除小鼠模型结合单细胞RNA-seq分析，发现叶酸通过降低DNA损伤标志物γ-H2A.X水平来保护内毛细胞 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证，且具体分子机制细节有待深入探索 | 探究内毛细胞损伤的机制及预防策略 | 内毛细胞，特别是Pmca1特异性敲除小鼠模型中的内毛细胞 | NA | 听力损失 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2845 | 2026-01-20 |
CHD7 regulates cardiac neural crest cell differentiation through SOX5-mediated self-activation
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113726
PMID:41210995
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了CHD7通过SOX5介导的自激活机制调控心脏神经嵴细胞分化，为CHARGE综合征相关心脏缺陷提供了新见解 | 首次发现CHD7通过SOX5介导的自激活机制调控其自身表达，并证明SOX5过表达可恢复CHD7单倍体不足细胞中的基因表达和心肌细胞分化能力 | 研究主要基于体外细胞培养模型，体内验证和临床转化潜力仍需进一步探索 | 探究CHD7在心脏神经嵴细胞分化中的作用机制及其与CHARGE综合征心脏缺陷的关联 | 心脏神经嵴细胞 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2846 | 2026-01-20 |
HNRNPA2B1 confers immune escape of non-small cell lung cancer through targeting lactate/ferroptosis
2025-Nov-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08232-5
PMID:41271615
|
研究论文 | 本研究探讨了m6A阅读蛋白HNRNPA2B1通过调控LDHA mRNA稳定性和乳酸积累，促进非小细胞肺癌免疫逃逸和铁死亡抵抗的机制 | 首次揭示了HNRNPA2B1作为m6A阅读器，通过靶向LDHA mRNA的m6A修饰位点增强其稳定性，进而通过乳酸积累和干扰素-γ分泌抑制，介导非小细胞肺癌的免疫逃逸和铁死亡抵抗 | 研究主要在体外共培养体系中进行，体内模型验证相对有限；机制研究聚焦于LDHA通路，可能存在其他下游靶点 | 探究HNRNPA2B1在非小细胞肺癌免疫逃逸和铁死亡抵抗中的作用及分子机制 | 非小细胞肺癌细胞、活化的CD8 T细胞 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序、体外共培养实验 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 非小细胞肺癌临床样本及单细胞测序数据（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2847 | 2026-01-20 |
Integrated single-cell transcriptomics and spatial metabolomics unveil cellular differentiation and ginsenosides biosynthesis in Panax root tips
2025-Nov, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf202
PMID:41180020
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和空间代谢组学分析，揭示了人参属植物根尖的细胞分化轨迹和人参皂苷生物合成的细胞异质性 | 首次在人参属植物根尖中整合单细胞转录组和空间代谢组学，识别了新的转录因子并验证了其在内皮层木栓化和人参皂苷生物合成中的调控作用 | 研究仅聚焦于三种人参属物种，可能无法完全代表该属的多样性，且功能验证实验范围有限 | 探究人参属植物根尖早期发育过程中的细胞命运转变及人参皂苷生物合成的细胞异质性 | 三种人参属植物（Panax ginseng、Panax quinquefolius和Panax notoginseng）的根尖组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间代谢组学、LC-MS/MS、RNA原位杂交、双荧光素酶报告基因检测（dual-LUC）、电泳迁移率变动分析（EMSA） | NA | 转录组数据、代谢组数据、图像数据 | 三种人参属物种的根尖样本 | NA | 单细胞RNA-seq、空间代谢组学 | NA | NA |
| 2848 | 2026-01-20 |
Numbat-multiome: inferring copy number variations by combining RNA and chromatin accessibility information from single-cell data
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf516
PMID:41104806
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Numbat-multiome的新算法，该算法通过结合单细胞RNA测序和染色质可及性数据来推断拷贝数变异 | Numbat-multiome扩展了原始Numbat算法的功能，使其能够从scRNA-seq和scATAC-seq数据中单独或整合地进行CNV推断，通过基于共同基因组坐标系统的分箱策略统一不同模态的数据 | NA | 开发一种能够从单细胞多组学数据中准确推断拷贝数变异的算法，以更好地理解癌症中的遗传和表观遗传变化 | 癌症样本，包括早期多发性骨髓瘤和由慢性淋巴细胞白血病引发的Richter综合征 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 单细胞ATAC-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2849 | 2026-01-20 |
Interpretable and integrative analysis of single-cell multiomics with scMKL
2025-Aug-06, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08533-7
PMID:40770488
|
研究论文 | 介绍一种基于多核学习（scMKL）的创新方法，用于单细胞多组学数据的可解释和整合分析 | 结合复杂模型的预测能力和线性方法的可解释性，在单细胞多组学数据整合中实现高精度且可解释的结果，识别关键转录组和表观遗传特征及多模态通路 | NA | 提供一种可解释且整合的单细胞多组学分析方法，以增强对癌症生物学和肿瘤进展的理解 | 健康与癌性细胞群体，包括乳腺癌、淋巴癌、前列腺癌和肺癌 | 机器学习 | 乳腺癌, 淋巴癌, 前列腺癌, 肺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 多组学分析 | 多核学习（MKL） | 单细胞多组学数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | 10x Multiome | NA |
| 2850 | 2026-01-20 |
Ex vivo model of functioning human lymph node reveals role for innate lymphocytes and stroma in response to vaccine adjuvant
2025-Jul-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115938
PMID:40608517
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研究论文 | 本文介绍了一种使用人淋巴结切片作为功能性模型系统，研究疫苗佐剂早期炎症反应的方法 | 开发了精确切割的人淋巴结切片作为保持组织结构完整的全器官模型系统，结合单细胞转录组学和多重成像技术，揭示了先天淋巴细胞和基质细胞在疫苗佐剂反应中的新作用 | 模型系统可能无法完全模拟体内复杂免疫环境，且研究聚焦于早期炎症反应，长期效应未涉及 | 研究人类免疫系统对疫苗佐剂的早期炎症反应机制 | 人淋巴结切片中的免疫细胞和基质细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学，多重成像 | NA | 转录组数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2851 | 2026-01-19 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling of GL261 Glioblastoma Cells Reveals Gene Expression Signatures Underlying Tumorigenicity
2025-Dec-16, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-025-01635-0
PMID:41400763
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对GL261胶质母细胞瘤细胞进行转录组分析，揭示了与肿瘤发生相关的基因表达特征 | 首次在GL261胶质母细胞瘤模型中应用单细胞RNA测序技术，全面解析了贴壁和神经球培养条件下细胞的转录组差异，并识别了与肿瘤发生相关的关键基因表达模式 | 研究仅基于GL261细胞系，未涉及患者样本或体内模型，可能无法完全反映临床胶质母细胞瘤的异质性 | 探究GL261胶质母细胞瘤细胞的转录组特征，以理解肿瘤生物学和潜在治疗靶点 | GL261胶质母细胞瘤细胞系，包括贴壁培养和神经球培养的细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | PCA, UMAP | 单细胞转录组数据 | 10715个细胞（5764个贴壁细胞和4951个神经球细胞） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2852 | 2026-01-19 |
Decreased scleral Wnt5ahi fibroblasts exacerbate myopia progression by disrupting extracellular matrix homeostasis in mice
2025-Dec-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67246-x
PMID:41402314
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了小鼠巩膜中Wnt5a高表达成纤维细胞在近视进展中的作用机制 | 首次在近视模型中识别出Wnt5a高表达巩膜成纤维细胞亚群，并揭示其通过调控细胞外基质稳态影响近视进展 | 研究仅基于雄性小鼠模型，未涉及雌性动物或人类样本，且机制研究主要依赖基因敲低技术 | 探究巩膜成纤维细胞表型异质性与形觉剥夺性近视之间的关联及其分子机制 | 雄性小鼠的巩膜组织 | 数字病理学 | 近视 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 雄性小鼠巩膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2853 | 2026-01-19 |
Establishment of a novel brainstem ischemic dysphagia model: single-cell sequencing reveals the molecular mechanisms underlying mPES intervention
2025-Dec-16, Journal of neuroengineering and rehabilitation
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12984-025-01841-3
PMID:41402839
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研究论文 | 本研究通过建立一种新型的脑干缺血性吞咽困难大鼠模型，并利用改良咽部电刺激（mPES）干预，结合单细胞转录组学揭示了其治疗机制 | 首次通过脑干缺血诱导建立稳定的吞咽困难动物模型，并应用单细胞测序技术探索mPES干预的分子机制 | 研究仅基于大鼠模型，未涉及人类样本，且单细胞测序结果需要进一步功能验证 | 建立新型脑干缺血性吞咽困难模型并探索mPES干预的治疗机制 | 大鼠脑干缺血模型 | 数字病理学 | 脑卒中后吞咽困难 | 单细胞转录组测序，光化学栓塞，磁共振成像，视频荧光吞咽研究 | NA | 转录组数据，影像数据，行为数据 | 未明确说明具体样本数量的大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2854 | 2026-01-19 |
Persistent pneumococcal colonisation in antiretroviral-treated HIV infection is associated with nasal inflammation
2025-Dec-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67258-7
PMID:41398159
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研究论文 | 本研究揭示了长期接受抗逆转录病毒治疗的HIV感染者鼻腔黏膜免疫持续失调，并与肺炎球菌定植相关 | 首次在长期ART治疗的HIV感染者中，通过单细胞转录组学等技术系统揭示了鼻腔特异性免疫失调特征，并发现上皮细胞驱动的中性粒细胞炎症与病原体定植密度间的正反馈循环 | 研究为观察性研究，未进行干预性实验验证治疗靶点；样本量相对有限；未评估其他呼吸道病原体的影响 | 探究长期ART治疗的HIV感染者鼻腔黏膜免疫失调机制及其与肺炎球菌定植的关联 | 接受抗逆转录病毒治疗超过1年的HIV感染者 | 数字病理学 | HIV感染 | 流式细胞术, 单细胞转录组学, 中性粒细胞功能检测 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, 功能实验数据 | 接受ART治疗超过1年的HIV感染者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2855 | 2026-01-19 |
PD-1/ PD-L1 bispecific antibody IBI318 combined with lenvatinib in advanced non-small cell lung cancer with acquired resistance to immune checkpoint inhibitors: a phase II trial
2025-Dec-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67262-x
PMID:41398162
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研究论文 | 本研究是一项II期临床试验，评估了双特异性抗体IBI318联合乐伐替尼在晚期非小细胞肺癌中对免疫检查点抑制剂获得性耐药患者的疗效和安全性 | 首次在获得性耐药患者中评估PD-1/PD-L1双特异性抗体联合酪氨酸激酶抑制剂的疗效，并利用单细胞RNA测序数据开发了预测模型以识别潜在生物标志物 | 单臂、开放标签的II期试验设计，样本量较小（40例患者），且为事后探索性分析 | 评估IBI318联合乐伐替尼在晚期非小细胞肺癌中对免疫检查点抑制剂获得性耐药患者的疗效和安全性，并探索预测性生物标志物 | 晚期非小细胞肺癌患者，且对一线免疫检查点抑制剂产生获得性耐药 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | XGBoost | 单细胞RNA测序数据 | 40例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2856 | 2026-01-19 |
Hic-5 drives epithelial mechanotransduction promoting a feed-forward cycle of bronchoconstriction
2025-Dec-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67210-9
PMID:41387449
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研究论文 | 本研究揭示了Hic-5作为上皮细胞机械转导的关键调节因子，在哮喘中通过促进支气管收缩的正反馈循环驱动疾病进展 | 首次发现Hic-5在气道上皮细胞机械转导中的核心作用，并阐明其通过分泌内皮素-1促进支气管收缩正反馈循环的机制 | 研究主要基于体外细胞模型和单细胞RNA-seq数据重分析，缺乏体内实验直接验证 | 探究哮喘中支气管收缩引起的机械力如何通过上皮细胞机械转导驱动疾病进展 | 人气道上皮细胞（体外模型）和哮喘患者单细胞RNA-seq数据 | 生物医学研究 | 哮喘 | 单细胞RNA-seq，基因敲低，机械压缩模拟 | 体外细胞培养模型 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 未明确样本数量，但包括体外细胞实验和哮喘患者单细胞RNA-seq数据重分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2857 | 2026-01-19 |
Functional KCC2 expression marks an evolutionarily conserved population of early-maturing interneurons in the perinatal cortex
2025-Dec-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67270-x
PMID:41365903
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研究论文 | 本研究在小鼠和人类中识别并表征了一类在胚胎期表达KCC2、出生时即具有超极化GABA反应的早期成熟皮层中间神经元 | 首次揭示了皮层中间神经元亚群中GABA能功能成熟的异质性，确立了KCC2作为早期成熟中间神经元的标志物，并证明了其在进化上的保守性 | NA | 探究皮层中间神经元GABA能反应成熟的时间模式及其分子标志 | 小鼠和人类皮层中的中间神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、差异基因表达分析 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2858 | 2026-01-19 |
A phenotype-driven data and drug repurposing strategy used to identify potential treatments targeting chondrocyte hypertrophy in osteoarthritis
2025-Dec, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118773
PMID:41223767
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞转录组学数据和药物重定位策略，识别出能够逆转骨关节炎中软骨细胞肥大表型的潜在药物 | 采用表型驱动的方法，结合单细胞转录组学数据和签名逆转原理，首次应用于骨关节炎软骨细胞肥大表型的药物筛选 | 研究主要基于体外和离体实验，尚未进行体内验证，且样本量有限 | 加速骨关节炎有效药物治疗的发现，通过靶向软骨细胞肥大表型 | 骨关节炎患者的软骨细胞和软骨组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组学数据 | 患者骨关节炎软骨样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2859 | 2026-01-19 |
Development and validation of a glycosyltransferase-associated prognostic model for melanoma and characterization of the tumor immune microenvironment using single-cell sequencing data
2025-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102237
PMID:41542167
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研究论文 | 本研究开发并验证了一个基于糖基转移酶相关基因的预后模型，用于预测皮肤黑色素瘤患者的生存时间，并利用单细胞测序数据表征肿瘤免疫微环境 | 首次构建了基于糖基转移酶相关基因的个体化预测模型，并整合单细胞分析揭示了关键基因MGAT4A与CD8 T细胞和单核/巨噬细胞浸润的关联 | 模型主要基于回顾性转录组数据，需要前瞻性临床研究进一步验证 | 开发预测皮肤黑色素瘤患者生存的预后模型并探索糖基转移酶影响预后的机制 | 皮肤黑色素瘤患者 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞测序, RNA-seq, qPCR, Western Blot, 免疫组化 | Cox回归模型, LASSO回归, 列线图 | 转录组数据, 单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库中的皮肤黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2860 | 2026-01-19 |
Deciphering the combinatorial expression pattern and genetic regulatory mechanisms of Beats and Sides in the olfactory circuits of Drosophila
2025-Aug-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.31.657193
PMID:40502011
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研究论文 | 本文通过分析果蝇嗅觉电路中Beat和Side基因家族的表达模式，探索其在嗅觉神经元组合识别和电路组装中的作用 | 利用公开单细胞RNA-seq数据集和新生成的基因陷阱转基因驱动线，首次系统揭示了Beat和Side基因在嗅觉受体神经元及其突触目标投射神经元中的类别特异性组合表达模式，并发现这种模式在昆虫进化中具有保守性 | 虽然研究了Beat-IIa-Side-IV相互作用的扰动，但未观察到显著的靶向错误，表明可能需要更广泛的基因组合扰动来验证其功能 | 探究果蝇嗅觉电路中Beat和Side基因家族的组合表达模式及其遗传调控机制，以理解它们如何贡献于嗅觉电路的组装 | 果蝇的嗅觉受体神经元和投射神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA-seq，基因陷阱转基因驱动线 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |