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当前共找到 10572 篇文献，本页显示第 2821 - 2840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2821 | 2026-01-23 |
Integrated proteomics and metabolomics analysis revealed that macrophage-related signals may be potential biomarkers for oral squamous cell carcinoma
2025-Dec-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-31899-x
PMID:41372366
|
研究论文 | 本研究通过整合蛋白质组学、代谢组学、空间转录组学和单细胞RNA测序数据，系统比较了口腔鳞状细胞癌（OSCC）肿瘤与匹配的邻近非肿瘤组织，揭示了免疫相关蛋白ARPC4的上调与患者不良生存相关，并发现C1QC阳性巨噬细胞是这些失调蛋白的主要来源，可作为独立的预后标志物 | 首次整合多组学分析（蛋白质组学、代谢组学、空间转录组学和单细胞RNA测序）系统揭示OSCC中免疫相关蛋白ARPC4的上调及其与巨噬细胞的关联，并发现色氨酸代谢通路失调可能通过重编程巨噬细胞表型促进OSCC进展 | NA | 探究口腔鳞状细胞癌（OSCC）在蛋白质水平和代谢层面的改变，以识别潜在的生物标志物 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）肿瘤组织与匹配的邻近非肿瘤组织 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 蛋白质组学, 代谢组学, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, 代谢组数据, 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2822 | 2026-01-23 |
Microbial production of short-chain fatty acids attenuates long-term neurologic impairment after traumatic brain injury
2025-Dec-09, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03615-z
PMID:41366428
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研究论文 | 本研究探讨了通过饮食促进微生物产生短链脂肪酸（SCFAs）如何减轻创伤性脑损伤（TBI）后的长期神经功能缺损 | 在TBI模型中，首次结合高产量SCFA饮食、纵向肠道微生物组分析和单细胞转录组学，系统揭示了SCFAs通过重塑肠道菌群、促进神经发生和诱导抗炎表型来发挥神经保护作用的机制 | 研究基于小鼠模型，结果向人类转化需进一步验证；观察期为6个月，更长时期的效应尚不清楚 | 探究SCFAs在TBI后长期神经功能缺损中的保护作用及其机制 | C57BL6/J小鼠 | 数字病理学 | 创伤性脑损伤 | 16S rRNA扩增子测序，宏基因组测序，单细胞RNA测序 | NA | 序列数据，基因表达数据 | 使用C57BL6/J小鼠，具体数量未在摘要中明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Genomics | 遵循10x Genomics协议进行单细胞RNA测序 |
| 2823 | 2026-01-23 |
In vitro models to mimic tumor endothelial cell-mediated immune cell reprogramming in lung adenocarcinoma
2025-Nov-27, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03576-4
PMID:41310721
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研究论文 | 本研究通过体外模型探究了非小细胞肺癌中肿瘤内皮细胞如何调节免疫细胞，揭示了其在肿瘤微环境免疫抑制中的作用 | 利用2D和3D共培养模型结合单细胞RNA测序技术，首次在非小细胞肺癌中系统揭示了肿瘤内皮细胞的异质性及其通过MIF信号促进M2样巨噬细胞极化的机制 | 研究主要基于体外模型，可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 探究非小细胞肺癌中肿瘤内皮细胞对免疫细胞的重编程作用及其机制 | 非小细胞肺癌细胞、正常内皮细胞、免疫细胞（CD4 T细胞、CD8 T细胞、巨噬细胞） | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组、蛋白质组、激酶组数据 | 多种非小细胞肺癌细胞系及患者来源的肿瘤内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2824 | 2026-01-23 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the heterogeneity and functional characteristics of macrophage subpopulations in colon cancer
2025-Nov-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04002-z
PMID:41276730
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了结肠癌中巨噬细胞亚群的异质性和功能特征，并重点探讨了SPP1在巨噬细胞亚型中的作用 | 首次在结肠癌中利用单细胞RNA测序技术系统鉴定出五个巨噬细胞亚型，并发现Macrophages_SPP1亚型在肿瘤中显著富集，具有独特的代谢和免疫抑制功能，同时通过计算机模拟SPP1敲除揭示了其在免疫抑制肿瘤微环境形成中的关键作用 | 研究仅基于三名结肠癌患者的样本，样本量较小，且为观察性研究，缺乏体内实验验证 | 探究结肠癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其功能特征，特别是SPP1在巨噬细胞亚型中的作用 | 结肠癌患者的肿瘤组织和癌旁正常组织 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三名结肠癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2825 | 2026-01-23 |
Single-cell transcriptome atlas of adult male and female human hookworm Ancylostoma ceylanicum
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113846
PMID:41362773
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研究论文 | 本研究构建了成年雄性和雌性锡兰钩虫的单细胞转录组图谱，揭示了性别特异性基因表达和细胞多样性 | 首次提供了锡兰钩虫的全面单细胞转录组图谱，揭示了性别间细胞类型差异和新的分子标记 | 未提及样本数量或技术重复的详细信息，可能限制统计分析的稳健性 | 推进对钩虫生物学的基本理解，为开发新的治疗或疫苗靶点提供基础 | 成年雄性和雌性锡兰钩虫（Ancylostoma ceylanicum） | 单细胞组学 | 钩虫病 | 单细胞RNA测序，共聚焦显微镜，RNA荧光原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据，显微镜图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2826 | 2026-01-23 |
Segger: Fast and accurate cell segmentation of imaging-based spatial transcriptomics data
2025-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.643160
PMID:40161614
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研究论文 | 本文介绍了一种名为segger的快速准确细胞分割方法，用于成像空间转录组学数据 | 提出了一种基于异构图表示和图神经网络的细胞分割方法，将细胞分割视为转录本到细胞的链接预测任务，并利用单细胞RNA-seq信息改进转录本分配 | NA | 解决成像空间转录组学中转录本准确分配到细胞的问题 | 成像空间转录组学数据 | 计算机视觉 | NA | 成像空间转录组学 | 图神经网络 | 图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | NA |
| 2827 | 2026-01-23 |
LST1: a novel biomarker for efferocytosis in the co-occurrence of type 2 diabetes mellitus and clear cell renal cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1737749
PMID:41488617
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，识别出LST1是2型糖尿病与肾透明细胞癌共病的关键调控基因，并验证了其在巨噬细胞介导的胞葬作用及免疫调控中的核心作用 | 首次发现LST1作为T2DM与ccRCC共病的关键调控因子，揭示了其在连接两种疾病的免疫调控通路中的新作用，为研究糖尿病与恶性肿瘤共存的免疫机制提供了新框架 | 研究主要基于公共数据库的单细胞转录组数据，虽然进行了体内外验证，但样本来源和数量可能有限，且具体分子机制有待进一步深入探索 | 识别T2DM与ccRCC共病的共同分子通路和新型生物标志物 | 2型糖尿病和肾透明细胞癌的共病模型 | 生物信息学 | 肾透明细胞癌, 2型糖尿病 | 单细胞转录组测序, 机器学习算法, GSEA算法, 体内外实验验证 | 机器学习算法（未指定具体模型） | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2828 | 2026-01-23 |
scVAR: integrating genomics and transcriptomics from single-cell RNA-seq -insights from leukemia case studies
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1604484
PMID:41555915
|
研究论文 | 本文介绍了scVAR，一种利用变分自编码器从单细胞RNA测序数据中学习和整合遗传变异的计算框架，应用于白血病案例研究 | 开发了基于交叉注意力融合层的编码器-解码器架构，将转录组和变异信息整合到统一潜在表示中，增强了在噪声和稀疏条件下检测细微细胞差异的能力 | 由于使用3' scRNA-seq，变异检测仅限于捕获区域 | 整合单细胞RNA测序中的基因组和转录组信息，以更好地表征细胞状态和疾病过程 | 急性髓系白血病（AML）和急性淋巴细胞白血病（ALL） | 机器学习 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 变分自编码器（VAE） | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2829 | 2026-01-22 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Identifies a Novel OLR1+ SLC7A7+ Liver-Enriched Metastatic Subset With Immunometabolic Rewiring in Pancreatic Cancer
2025-Nov, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71345
PMID:41176774
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，识别出一种新型的OLR1+ SLC7A7+肝脏富集转移亚群（LEMS），并揭示了其在胰腺癌肝转移中的免疫代谢重编程机制 | 首次识别并验证了LEMS这一终末分化的恶性细胞亚群，其特征为代谢重编程和免疫抑制通路超活化，并发现其与SPP1+巨噬细胞通过配体-受体网络相互作用，驱动侵袭和免疫逃逸 | 需要扩大临床队列和体内模型来全面阐明LEMS与巨噬细胞之间的具体机制性相互作用 | 识别驱动PDAC肝转移的关键细胞亚群，阐明其与转移微环境的相互作用，并定义肝脏定植的潜在机制 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的原发肿瘤（PT）和肝转移（LM）样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 来自PDAC PT和LM患者的临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2830 | 2026-01-22 |
Integration of Transcriptome Profiling and Single-Cell Sequencing Analysis to Establish a CD8+ T Cell-Related Prognostic Model for Patients With NSCLC: From Assessment to Therapy
2025-Nov, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71337
PMID:41223031
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组分析和单细胞测序，构建了一个基于CD8+ T细胞的预后模型，用于非小细胞肺癌患者的精准预后评估和免疫治疗决策 | 首次结合加权基因共表达网络分析和单细胞测序技术，识别出CD52、CD69和PLIN2作为生物标志物，构建了高精度的CD8+ T细胞相关风险模型，并开发了临床预后列线图 | 研究依赖于公共数据集（TCGA-NSCLC、GSE183219、GSE42127），可能受到样本异质性和数据质量的限制，且模型需要在独立的前瞻性队列中进行进一步验证 | 开发一个CD8+ T细胞相关的预后模型，以改善非小细胞肺癌患者的预后评估和免疫治疗临床决策 | 非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组分析，单细胞测序 | LASSO回归，Cox回归，列线图 | 基因表达数据，单细胞数据 | 三个公共数据集（TCGA-NSCLC、GSE183219、GSE42127）中的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2831 | 2026-01-22 |
Role of SUV39H2 in shaping the malignant phenotype of triple-negative breast cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1679640
PMID:41551146
|
研究论文 | 本研究探讨了SUV39H2在三阴性乳腺癌中的表达模式、临床相关性及功能作用 | 首次系统分析SUV39H2在多种癌症中的表达，并验证其在TNBC中的促癌功能 | 临床实用性需进一步验证，样本量有限 | 阐明SUV39H2在TNBC恶性表型中的作用 | 三阴性乳腺癌细胞系及患者样本 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、Western印迹、功能实验 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 5对TNBC患者样本，MDA-MB-231和Hs-578T细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2832 | 2026-01-22 |
Research progress of stem cells in the treatment of atherosclerosis
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1722416
PMID:41552013
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综述 | 本文系统综述了干细胞在治疗动脉粥样硬化中的研究进展，包括其作用机制、动物实验与临床试验证据、当前面临的挑战以及未来的优化策略与应用前景 | 聚焦于2023-2025年的最新研究证据，并提出了结合单细胞测序、类器官模型和精准递送系统等前沿技术来推动干细胞临床转化的具体实施路径 | 本文为综述性文章，未报告原始实验数据，其分析基于对现有文献的总结 | 总结干细胞治疗动脉粥样硬化的研究进展，分析核心挑战，并探讨促进其临床转化的未来方向 | 间充质干细胞、诱导多能干细胞、内皮祖细胞等用于治疗动脉粥样硬化的干细胞类型 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2833 | 2026-01-22 |
Bu-Yi-Xin-Shen formula targets monocytes through PI3K-Akt/NF-κB signaling in post-percutaneous coronary intervention angina
2025, American journal of translational research
IF:1.7Q4
DOI:10.62347/CMPK4691
PMID:41552316
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，探讨了补益心肾方治疗经皮冠状动脉介入术后心绞痛的机制 | 结合生物信息学、分子对接、单细胞RNA测序和体内实验，首次系统揭示了补益心肾方通过靶向单核细胞中的PI3K-Akt/NF-κB信号通路发挥治疗作用 | 研究主要基于动物实验和生物信息学预测，缺乏临床样本的直接验证，且活性成分的具体体内药效学需进一步确认 | 探究补益心肾方治疗经皮冠状动脉介入术后心绞痛的作用机制 | 单核细胞及相关信号通路（PI3K-Akt、NF-κB） | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、分子对接、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、功能富集分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2834 | 2026-01-22 |
Visualizing stability: a sensitivity analysis framework for t-SNE embeddings
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1719516
PMID:41552665
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研究论文 | 本文提出一个计算框架，用于扩展标准t-SNE图，通过可视化线索展示t-SNE嵌入的稳定性 | 结合隐函数定理与自动微分进行敏感性分析，计算嵌入对输入数据的敏感性，并通过雅可比矩阵热图可视化特征影响和结构不稳定区域 | 未明确讨论框架的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性限制 | 开发一个框架来评估t-SNE嵌入的稳定性和可解释性，以增强生物信息学中的科学结论严谨性 | 高维生物数据，包括批量RNA-seq、蛋白质组学和单细胞转录组学数据集 | 机器学习 | NA | t-SNE, 敏感性分析, 自动微分 | t-SNE | 高维数据 | 三个不同的生物数据集 | NA | bulk RNA-seq, proteomics, single-cell transcriptomics | NA | NA |
| 2835 | 2026-01-22 |
Tumor-like characteristics of vascular smooth muscle cells in atherosclerosis
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1734123
PMID:41552822
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综述 | 本文综述了动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞表现出的类肿瘤特征，包括DNA损伤、基因组不稳定性、逃避衰老、过度增殖、迁移与侵袭激活、癌症干细胞样特性以及癌症相关信号通路激活 | 通过谱系追踪和单细胞转录组学技术，揭示了血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化中表现出高度可塑性和类肿瘤特征，这一发现挑战了传统观点 | NA | 探讨动脉粥样硬化中血管平滑肌细胞的类肿瘤特征，为针对血管平滑肌细胞的新治疗策略提供理论基础 | 血管平滑肌细胞及其衍生细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 谱系追踪，单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2836 | 2026-01-21 |
Single-cell transcriptomic datasets of the amphibious plant Water wisteria
2025-Nov-29, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-06341-6
PMID:41318588
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了水蓑衣在陆生和水生环境中的叶片细胞，以探索异叶性的分子机制 | 首次对水蓑衣这一新兴异叶性模型植物进行单细胞转录组测序，为在单细胞水平解析植物环境适应机制提供了基础数据 | 未明确提及实验样本量或技术重复次数，可能影响统计可靠性 | 探索异叶性（植物根据环境改变叶片形态的适应策略）的分子机制 | 水蓑衣（Hygrophila difformis）在陆生和水生环境中的叶片原生质体 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2837 | 2026-01-21 |
LMNA-PRKDC axis enhances DNA repair and promotes chemoresistance in glioblastoma
2025-Nov-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08226-3
PMID:41271669
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研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤中LMNA-PRKDC轴通过增强DNA修复能力驱动替莫唑胺耐药的新机制 | 首次发现LMNA-PRKDC轴通过形成DNA修复复合物增强胶质母细胞瘤的DNA修复能力，并鉴定PRKDC抑制剂可作为逆转耐药的新策略 | 研究主要基于患者来源的异种移植模型和单细胞测序数据，临床转化效果仍需进一步验证 | 探究胶质母细胞瘤对替莫唑胺产生耐药性的分子机制，并寻找逆转耐药的潜在治疗靶点 | 胶质母细胞瘤患者来源的肿瘤组织、异种移植模型以及原发和复发肿瘤标本 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析、免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 患者来源的异种移植模型和原发/复发胶质母细胞瘤标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2838 | 2026-01-21 |
Cell and molecular profiles in peripheral nerves shift toward inflammatory phenotypes in diabetic peripheral neuropathy
2025-Oct-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI184075
PMID:40828619
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研究论文 | 本研究通过转录组学和空间转录组学分析，揭示了糖尿病周围神经病变（DPN）中周围神经的细胞和分子谱向炎症表型转变，并探讨了感觉轴突mRNA转运在神经退行性变中的潜在作用 | 首次在人类DPN神经中结合转录组学和空间转录组学分析，揭示了神经类型特异性免疫特征，并发现了感觉轴突中mRNA（如SCN9A和TRPV1）的显著定位现象 | 样本主要来自截肢手术的糖尿病患者，对照组来自跨面神经移植手术，可能存在组织来源和疾病状态的异质性 | 深入探究糖尿病周围神经病变的分子机制和细胞表型变化 | 糖尿病患者的胫神经和腓肠神经，以及对照组的腓肠神经 | 数字病理学 | 糖尿病周围神经病变 | 转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 来自下肢截肢术的胫神经和腓肠神经（主要来自糖尿病患者），以及来自跨面神经移植手术的对照腓肠神经 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2839 | 2026-01-21 |
Spatia: Multimodal Model for Prediction and Generation of Spatial Cell Phenotypes
2025-Jul-07, ArXiv
PMID:40671942
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Spatia的多模态模型，用于预测和生成空间细胞表型，通过融合细胞形态、基因表达和空间上下文信息来学习统一表示 | Spatia首次提出了一种多尺度生成和预测模型，能够整合图像衍生的形态标记和转录组向量标记，并通过跨注意力机制和Transformer模块在单细胞、生态位和组织水平上捕获空间依赖性，同时利用生成扩散解码器合成高分辨率细胞图像 | NA | 学习统一的、空间感知的表示，以整合细胞形态、基因表达和空间上下文，从而理解组织功能 | 细胞形态、基因表达和空间组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | Transformer, 生成扩散模型 | 图像, 基因表达数据 | 涉及49名捐赠者、17种组织类型和12种疾病状态，包括1700万个细胞-基因对、100万个生态位-基因对和1万个组织-基因对 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2840 | 2026-01-21 |
Altered Hepatic Metabolism in Down Syndrome
2025-May-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.27.656393
PMID:40502193
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了唐氏综合征患者中肝脏代谢的改变，特别是胆汁酸水平升高和肝功能异常蛋白标志物 | 首次在唐氏综合征中系统报道了广泛的代谢变化，并利用小鼠模型和单细胞转录组学验证了胆汁酸代谢紊乱与肝脏病理的关联 | 研究样本量相对有限，且主要基于血浆分析，未深入探讨其他组织或长期临床影响 | 探究唐氏综合征中肝脏代谢的改变及其潜在机制 | 唐氏综合征患者和小鼠模型 | 代谢组学 | 唐氏综合征 | 多组学分析、bulk RNA-seq、单细胞转录组学 | Dp16小鼠模型 | 血浆、RNA序列数据 | 超过400人 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞转录组学 | NA | NA |