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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2801 | 2025-11-02 |
Gain-of-function PPM1D mutations attenuate ischemic stroke
2025-Nov, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-025-01523-6
PMID:40399534
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研究论文 | 本研究通过全基因组测序发现功能获得性PPM1D突变可减轻缺血性脑卒中,并鉴定出小分子稳定剂T2755作为潜在治疗方法 | 首次发现功能获得性PPM1D突变对缺血性脑卒中的保护作用,并鉴定出首个PPM1D小分子稳定剂T2755 | 仅在小鼠模型中验证T2755的治疗效果,尚未进行临床试验 | 探索PPM1D基因在缺血性脑卒中中的作用机制并开发新型治疗方法 | 10,241名缺血性脑卒中患者和Ppm1d基因缺陷小鼠 | 基因组学 | 缺血性脑卒中 | 全基因组测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | 集成计算建模, 虚拟筛选 | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | 10,241名患者和基因缺陷小鼠模型 | NA | 全基因组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2802 | 2025-11-02 |
Systemic activation of NRF2 contributes to the therapeutic efficacy of clinically-approved KRAS-G12C anti-cancer drugs
2025-Nov, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03162-7
PMID:40890297
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研究论文 | 研究发现临床批准的KRAS-G12C抗癌药物通过激活NRF2通路增强其治疗效果 | 首次揭示KRAS-G12C抑制剂通过靶向KEAP1半胱氨酸传感器激活NRF2通路,这是抗癌药物正向调控通常被认为是致癌基因的独特案例 | 未明确说明研究样本的具体数量和来源 | 探索异常激活的NRF2如何影响KRASG12C抑制剂的临床反应 | KRAS突变肺癌患者,特别是伴有KEAP1-NRF2通路共突变的患者 | 癌症治疗 | 肺癌 | 基因敲除,单细胞RNA测序,表面等离子共振 | NA | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2803 | 2025-11-02 |
Unraveling cellular dynamic changes in tumor evolution induced by long-term low dose-rate radiation
2025-Nov, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03128-9
PMID:40913060
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了长期低剂量率辐射诱导肿瘤细胞恶性演化的动态过程 | 首次发现长期低剂量率辐射通过ANGPTL4-SDC4配体-受体对促进肿瘤血管生成并增强细胞恶性表型 | 研究仅使用BEAS-2B细胞系,未涉及其他细胞类型或体内直接验证 | 探究长期低剂量率辐射对肿瘤细胞恶性演化的影响机制 | BEAS-2B细胞系及其辐射诱导的肿瘤细胞 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | scRNA-seq, FACS, 分子对接, 多重免疫组化, qRT-PCR, 免疫共沉淀 | 细胞轨迹分析, 细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据, 基因组数据, 蛋白互作数据 | BEAS-2B细胞系及其辐射处理后的衍生细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2804 | 2025-11-02 |
Tool Comparison for Detecting Tumour Cells in Endometrial Cancer via Single-Cell Copy Number Variations Analysis
2025-Nov, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70932
PMID:41160707
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研究论文 | 比较四种单细胞拷贝数变异分析工具在检测子宫内膜癌细胞方面的性能 | 首次系统比较SCEVAN、CopyKAT、InferCNV和sciCNV四种工具在子宫内膜癌单细胞数据分析中的表现 | InferCNV和sciCNV无法直接预测肿瘤细胞,CNV评分分布曲线未能清晰区分恶性和非恶性细胞群体 | 评估单细胞CNV分析工具在检测子宫内膜癌细胞中的可靠性 | 子宫内膜癌细胞 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | SCEVAN, CopyKAT, InferCNV, sciCNV | 单细胞转录组数据 | 公开可用的scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2805 | 2025-11-02 |
VEGF-D Protects the Lung in Neonatal Hyperoxia-induced Lung Injury
2025-Nov, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0544OC
PMID:40343859
|
研究论文 | 本研究探讨VEGF-D在新生儿高氧诱导肺损伤中的保护作用及其机制 | 首次揭示肺泡成纤维细胞通过表达VEGF-D调控淋巴管生成和淋巴管结构在BPD中的关键作用 | 研究基于小鼠模型,临床转化需进一步验证 | 阐明VEGF-D在支气管肺发育不良发病机制中的保护作用 | 新生小鼠肺组织 | 病理生理学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序, 定量PCR, 基因敲除 | 动物疾病模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量的小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2806 | 2025-11-02 |
Reply to 'Enhancing spatial transcriptomics in clear-cell renal cell carcinoma'
2025-Nov, Nature reviews. Urology
DOI:10.1038/s41585-025-01086-8
PMID:40866723
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2807 | 2025-11-02 |
Enhancing spatial transcriptomics in clear-cell renal cell carcinoma
2025-Nov, Nature reviews. Urology
DOI:10.1038/s41585-025-01085-9
PMID:40866724
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2808 | 2025-11-02 |
CellSNVReg: a multidimensional resource for SNV-mediated regulatory perturbations in single-cell and spatial omics
2025-Oct-31, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1076
PMID:41171131
|
研究论文 | 介绍CellSNVReg——一个系统表征单核苷酸变异在细胞类型和空间分辨率下调控扰动效应的多维资源数据库 | 首次整合单细胞和空间组学数据,在六个维度系统分析SNV介导的调控扰动,并提供定性和定量评估 | NA | 解析单核苷酸变异在多分子层面的调控扰动及其对细胞功能状态的影响 | 人类正常组织、肿瘤组织及其他疾病组织 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞测序数据, 空间转录组数据 | 460万个细胞谱 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2809 | 2025-11-02 |
SEA version 4.0: a major expansion and update of the Super-Enhancer Archive
2025-Oct-31, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1114
PMID:41171129
|
研究论文 | 介绍超级增强子数据库SEA版本4.0的重大扩展和更新 | 新增H3K4me1组蛋白标记,扩展至14个物种,引入基于香农熵的算法识别特异性SE,提供交互式调控网络和细胞特异性SE检测器 | NA | 阐明超级增强子在细胞命运和疾病中的表观遗传调控作用 | 超级增强子和增强子 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,组蛋白修饰分析 | 香农熵算法 | 基因组数据,表观遗传数据 | 12个癌症和正常样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2810 | 2025-11-02 |
connectomeDB2025: a rigorously curated, multi-species resource of experimentally supported ligand-receptor interactions
2025-Oct-31, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1108
PMID:41171146
|
研究论文 | 介绍更新版connectomeDB2025,一个经过严格筛选、包含多物种实验支持的配体-受体相互作用的开放获取数据库 | 通过AI辅助文献挖掘和手动筛选,新增827对配体-受体相互作用和718篇支持文献,其中264对为2020年后首次描述,包含2359个独有的证据链接 | 仅包含脊椎动物的肽基配体-受体相互作用,不涵盖其他类型的分子相互作用 | 构建一个经过严格筛选、具有实验支持的配体-受体相互作用参考数据库 | 脊椎动物的配体-受体相互作用 | 生物信息学 | NA | AI辅助文献挖掘,手动筛选 | NA | 文献数据,实验证据 | 3579个脊椎动物相互作用,来自2803篇研究文章,5429个证据链接 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 2811 | 2025-11-02 |
Ex Vivo Spatiotemporal Characterization of Spermatogenesis in Mouse Testicular Organoids
2025-Oct-31, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512670
PMID:41173796
|
研究论文 | 开发了一种小鼠睾丸类器官培养策略,实现了体外精子发生的时空特征表征 | 建立了单细胞悬浮液自重组形成睾丸类器官的方法,首次在体外实现了包含单倍体精子的完整精子发生过程 | 类器官中精子样细胞仅占总生殖细胞的约2.43%,效率仍有待提高 | 研究睾丸类器官中精子发生的时空特征及其在生育力保存中的应用 | 新生小鼠睾丸单细胞悬浮液和睾丸类器官 | 发育生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序,形态学分析,谱系特异性标记分析 | 小鼠睾丸类器官模型 | 单细胞RNA测序数据,图像数据 | 新生小鼠睾丸细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2812 | 2025-11-02 |
Exploration of Novel Biomarkers Through a Precision Medicine Approach Using Multi-Omics and Brain Organoids in Patients With Atypical Depression and Psychotic Symptoms
2025-Oct-31, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508383
PMID:41173797
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研究论文 | 通过整合临床数据、白细胞单细胞RNA测序、血浆蛋白质组学和脑类器官模型,探索非典型抑郁症伴精神病性症状患者的新型生物标志物 | 首次将白细胞单细胞转录组、血浆蛋白质组和患者来源脑类器官模型相结合,构建理解精神疾病病理生理学的新框架 | 白细胞计数差异在年龄校正后不显著,样本量未明确说明 | 探索非典型抑郁症伴精神病性症状的精准医学生物标志物 | 非典型抑郁症伴精神病性症状患者 | 精准医学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 脑类器官模型 | 脑类器官模型 | 临床数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 2813 | 2025-11-02 |
Systematic production of human kidney organoids for transplantation in porcine kidneys during ex vivo machine perfusion
2025-Oct-31, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01542-1
PMID:41174010
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研究论文 | 开发可规模化生产的人源肾脏类器官并将其移植到离体猪肾中的方法 | 建立了可扩展、可重复且经济高效的人多能干细胞肾脏类器官分化体系,并首次实现在离体机器灌注的猪肾中进行人源类器官移植 | 未明确说明类器官长期存活率和功能整合效果,临床试验可行性仍需进一步验证 | 开发用于移植治疗的人类肾脏类器官规模化生产技术 | 人多能干细胞衍生的肾脏类器官和离体猪肾 | 组织工程 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因编辑, 免疫组化, 流式细胞术, 共聚焦显微镜 | 类器官模型 | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2814 | 2025-10-31 |
SpateCV: cross-modality alignment regularization of cell types improves spatial gene imputation for spatial transcriptomics
2025-Oct-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07245-0
PMID:41162996
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2815 | 2025-11-02 |
Mitochondrial-activity-driven hematopoietic stem cell fate and lineage choice is first established in the aorta-gonad-mesonephros
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116296
PMID:40966086
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠胚胎主动脉-性腺-中肾区域中线粒体活性动态变化驱动造血干细胞和祖细胞功能异质性的机制 | 首次证明胚胎发育早期线粒体活性差异决定造血干细胞谱系选择倾向,并阐明了Wnt和PI3K信号通路在此过程中的作用机制 | 研究主要基于小鼠胚胎模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究线粒体代谢在胚胎造血干细胞发育过程中的作用机制 | 小鼠胚胎主动脉-性腺-中肾区域的造血干细胞和祖细胞 | 发育生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞转录组测序, 药理学干预, 遗传学方法, 体外功能实验, 体内功能实验 | NA | 基因表达数据, 功能实验数据 | 小鼠胚胎造血干细胞和祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2816 | 2025-11-02 |
Single-cell analysis uncovers preserved prostate cancer lineages and universally altered pathways in Matrigel-free patient-derived organoids
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116352
PMID:41037396
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析无基质胶的前列腺癌患者来源类器官,揭示了其细胞异质性和保留的患者特异性癌细胞谱系 | 发现无基质胶培养条件能更好地保留前列腺癌患者特异性细胞谱系,建立了前列腺类器官单细胞图谱(PPScA),重新定义了细胞类型标志物 | 研究主要关注短期培养,对长期培养效果和临床转化价值需要进一步验证 | 改进前列腺癌患者来源类器官的培养方法并研究其细胞生物学特性 | 前列腺癌患者来源类器官 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2817 | 2025-11-02 |
scRNA-seq reveals persistent aberrant differentiation of nasal epithelium driven by TNFα and TGFβ in post-COVID syndrome
2025-Oct-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64778-0
PMID:41152229
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示TNFα和TGFβ驱动的新冠后综合征患者鼻上皮持续异常分化的分子机制 | 首次发现新冠后综合征的持续症状并非由持续病毒载量驱动,而是由免疫细胞活性和慢性细胞因子产生导致,并确定了TNFα-TGFβ轴的关键作用 | 样本量相对有限(25例患者),仅针对鼻上皮组织进行研究 | 探究新冠后综合征的分子机制和潜在治疗策略 | 25名中度或重度新冠后综合征患者的鼻活检组织 | 单细胞转录组学 | 新冠后综合征 | 单细胞RNA测序,气液界面培养 | NA | 单细胞转录组数据 | 25例新冠后综合征患者鼻活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2818 | 2025-11-02 |
Mapping NK cell diversity in response to COVID-19 and mRNA vaccination
2025-Oct-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-11575-w
PMID:41152298
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了NK细胞在COVID-19重症患者和mRNA疫苗接种者中的多样性形成机制 | 发现外周NK细胞发育存在分叉路径,适应性NK细胞在COVID-19恢复期通过克隆扩增和线粒体氧化磷酸化增强形成 | 样本来源仅限于血液NK细胞,未涉及组织驻留NK细胞的研究 | 探索NK细胞功能异质性的形成机制及其在免疫应答中的作用 | COVID-19重症患者、BNT162b2疫苗接种者和健康捐赠者的血液NK细胞 | 免疫学 | COVID-19 | scRNA-seq | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | COVID-19重症患者(急性期和ICU后)、mRNA疫苗接种者、健康捐赠者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2819 | 2025-11-02 |
Deletion of cardiac fibroblast growth factor-23 beneficially impacts myocardial energy metabolism in left ventricular hypertrophy
2025-Oct-28, npj metabolic health and disease
DOI:10.1038/s44324-025-00087-w
PMID:41152461
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研究论文 | 本研究通过特异性敲除心肌细胞中的Fgf23基因,探讨心脏FGF23在左心室肥厚中的作用及其对心肌能量代谢的影响 | 首次揭示心脏特异性FGF23缺失通过调节葡萄糖转运和脂肪酸氧化改善心肌能量代谢 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 阐明心脏FGF23在左心室肥厚发展中的具体作用机制 | 心肌细胞特异性Fgf23敲除小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 空间代谢组学, 空间转录组学, 基因敲除技术 | 小鼠疾病模型 | 分子生物学数据, 代谢组学数据, 转录组学数据 | 实验小鼠模型 | NA | 空间代谢组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2820 | 2025-11-02 |
Evidence from spatial transcriptomics for the mosaic hypothesis and pure cell types in the cortex
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116363
PMID:41045459
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研究论文 | 通过空间转录组学数据验证大脑皮层中神经元类型的镶嵌假说和纯细胞类型 | 开发了针对空间转录组数据的统计点过程分析框架,首次在大脑皮层中系统验证了神经元空间回避现象 | 仅在大脑皮层中进行了验证,未涉及其他脑区;空间回避原则的普适性仍需进一步研究 | 验证大脑皮层神经元是否存在类似视网膜的镶嵌分布模式 | 大脑皮层兴奋性和抑制性神经元 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 统计点过程分析框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |