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当前共找到 10796 篇文献,本页显示第 261 - 280 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
261 2026-01-28
Integrated single-nuclei and spatial transcriptomic profiling of human sacrococcygeal teratomas reveals heterogeneity in cellular composition and X-chromosome inactivation
2025-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术,揭示了人类骶尾部畸胎瘤的细胞组成异质性及其与X染色体失活状态的联系 首次在骶尾部畸胎瘤中结合单核RNA测序与空间转录组学分析,揭示了X染色体双等位基因激活与肿瘤细胞身份及性别偏好的关联 样本量较小(仅8个肿瘤),且未检测到假定的多能性细胞群 探究骶尾部畸胎瘤的细胞起源、临床分层机制及性别偏好的分子基础 人类骶尾部畸胎瘤组织样本(包括产后和产前样本) 单细胞组学 骶尾部畸胎瘤 单核RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 8个骶尾部畸胎瘤样本(6个产后样本:1男5女;2个产前样本:均为女性) NA 单核RNA-seq,空间转录组学 NA NA
262 2026-01-28
SpaceBF: Spatial coexpression analysis using Bayesian Fused approaches in spatial omics datasets
2025-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为SpaceBF的贝叶斯融合建模框架,用于在空间组学数据中分析分子间的空间共表达模式 开发了首个基于贝叶斯融合方法的框架,能够同时估计局部(位置特异性)和全局(组织范围)的分子共表达,相比现有主要依赖地理空间指标(如双变量Moran's和Lee's)的方法具有更高的特异性和检测能力 NA 解决空间组学数据中分子对空间共表达检测方法不足的问题,以更好地理解细胞间通讯 空间组学数据中的分子对(包括基因、肽、脂质、N-聚糖等) 空间转录组学 癌症 空间转录组学,质谱成像 贝叶斯融合模型 空间组学数据 NA NA 空间转录组学,质谱成像 NA NA
263 2026-01-28
Co-regulator activity of Mediator of DNA Damage Checkpoint 1 (MDC1) is associated with DNA repair dysfunction and PARP inhibitor sensitivity in lobular carcinoma of the breast
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了乳腺浸润性小叶癌(ILC)中MDC1蛋白作为雌激素受体共调节因子的新功能,并发现该功能与同源重组修复功能障碍及PARP抑制剂敏感性相关 首次发现MDC1在ILC细胞中作为雌激素受体的共调节因子,并揭示这种新功能导致独特的同源重组修复功能障碍(不同于经典BRCAness状态),且与PARP抑制剂敏感性相关 研究主要基于细胞系和异种移植模型,临床样本验证有限;MDC1共调节功能的具体分子机制尚未完全阐明 探究乳腺浸润性小叶癌中MDC1蛋白的双重功能(DNA修复与雌激素受体共调节)及其治疗意义 乳腺浸润性小叶癌细胞系、异种移植模型及肿瘤数据 癌症生物学 乳腺癌 单细胞转录组分析、DNA修复活性分析、蛋白质相互作用组分析、异种移植模型 NA 转录组数据、蛋白质相互作用数据、功能实验数据 多个ILC细胞系及异种移植模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
264 2026-01-28
Uncovering the Signatures of Cellular Senescence in the Human Dorsolateral Prefrontal Cortex
2025-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过空间转录组学和单核RNA测序技术,构建了人类背外侧前额叶皮层衰老和细胞衰老的转录组图谱 结合Visium空间转录组学和单核RNA测序,首次在非病理人类组织中系统揭示了背外侧前额叶皮层细胞衰老的异质性和细胞类型特异性特征 研究基于非病理组织,可能未完全反映疾病状态下的衰老特征;细胞衰老的罕见性和异质性仍带来识别挑战 探索人类背外侧前额叶皮层在衰老过程中的细胞衰老特征和转录组变化 人类背外侧前额叶皮层的非病理组织样本 数字病理学 老年疾病 空间转录组学,单核RNA测序 NA 空间转录组数据,单核RNA测序数据 NA 10x Genomics 空间转录组学,单细胞RNA测序 10x Visium,10x Chromium Visium空间转录组学用于空间基因表达分析,单核RNA测序用于细胞类型特异性转录组分析
265 2026-01-27
Cross-organ single-cell integration identifies liver-specific fibroblast programs and HGF-MET/AGT-AGTR1B axes that link fibrosis to hepatocarcinogenesis
2025-Dec-29, Neuro endocrinology letters
PMID:41565578
研究论文 本研究通过跨器官单细胞整合分析,识别了肝脏特异性成纤维细胞程序及HGF-MET/AGT-AGTR1B轴,揭示了肝纤维化与肝细胞癌发生之间的潜在联系 采用跨器官单细胞RNA-seq数据整合方法,通过减去共享的全纤维化特征来提名肝脏特异性成纤维细胞基因和通路,并识别了肝脏选择性基质环路及肝细胞-成纤维细胞轴 研究依赖于公共数据集,可能存在批次效应或数据异质性;结论为假设性,需进一步实验验证 探究肝脏选择性基质机制,以及肝纤维化如何连接到肝细胞癌的发生 纤维化心脏、肾脏、肝脏和肺脏的单细胞RNA-seq数据,以及肝细胞癌数据集 单细胞组学 肝细胞癌 单细胞RNA-seq Seurat整合工作流、Slingshot伪时间分析、CellChat配体-受体推断 单细胞RNA-seq数据 多个公共数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
266 2026-01-27
Intraperitoneal programming of tailored CAR macrophages via mRNA lipid nanoparticle to boost cancer immunotherapy
2025-Dec-24, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究开发了一种靶向巨噬细胞的mRNA脂质纳米颗粒系统,用于原位编程CAR-M,以增强对实体瘤腹膜转移的免疫治疗效果 通过mRNA-LNP系统评估了36种CAR格式,并发现CD3ζ TLR4 ICDs的CAR-M能有效激活适应性免疫,与PD-1/L1疗法协同作用,重塑肿瘤微环境 CAR设计中潜在细胞内域及其抗肿瘤机制仍需系统探索,研究可能未全面评估所有CAR格式的长期效果或副作用 开发针对实体瘤腹膜转移的免疫治疗策略,通过编程CAR-M来增强抗肿瘤免疫反应 巨噬细胞、CAR-M、肿瘤微环境、CD8 T细胞 免疫治疗 实体瘤 mRNA脂质纳米颗粒系统、单细胞RNA测序 CAR-M模型 RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
267 2026-01-27
Comprehensive analysis of malignant subtypes of lung adenocarcinoma based on multi-omics landscape and functional validation of prognostic biomarker BAIAP2L2
2025-Dec-23, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究基于多组学数据,对肺腺癌恶性亚型进行了综合分析,并通过功能实验验证了预后生物标志物BAIAP2L2的作用 整合单细胞RNA测序和RNA测序数据,结合CNV评估、细胞轨迹分析、恶性细胞识别和细胞通讯分析等多种方法,深入解析肺腺癌上皮细胞的异质性,并首次通过CoxBoost模型挖掘并实验验证了BAIAP2L2作为肺腺癌预后风险基因的功能 研究主要基于公共数据库数据,实验验证仅限于体外细胞实验,缺乏体内动物模型或临床样本的进一步验证 深入探究肺腺癌的恶性亚型特征,并寻找有效的预后生物标志物 肺腺癌上皮细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序, RNA测序 CoxBoost模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
268 2026-01-27
PLAUR, C3, and EMP3 coordinate tumor progression and immune evasion in clear cell renal cell carcinoma
2025-Dec-19, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验验证,揭示了PLAUR、C3和EMP3三个基因在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的肿瘤进展和免疫逃逸中的协同作用,并指出PLAUR是主要驱动因子 首次系统性地将PLAUR、C3和EMP3三个基因联系起来,阐明它们在ccRCC肿瘤微环境和免疫逃逸中的协同作用机制,并通过单细胞RNA-seq数据明确了这些基因在不同细胞类型中的表达模式 研究主要基于公共数据集和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接功能验证 识别驱动透明细胞肾细胞癌(ccRCC)进展和免疫逃逸的关键分子,为ccRCC的诊断和治疗提供新靶点 透明细胞肾细胞癌(ccRCC) 生物信息学 肾癌 单细胞RNA-seq, RT-qPCR, Western blotting, CCK-8, 伤口愈合实验, Transwell实验, ELISA NA 基因表达数据, 单细胞RNA-seq数据 基于GSE6344和GSE781数据集,以及正常肾细胞和ccRCC细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
269 2026-01-27
Identification of NK cell marker genes based on single-cell sequencing to establish a prognostic signature in breast cancer
2025-Dec-19, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究基于单细胞测序数据识别NK细胞标志基因,构建了一个用于乳腺癌预后预测的模型 首次结合单细胞测序数据识别NK细胞标志基因,并利用机器学习构建乳腺癌预后模型,揭示了NK细胞在乳腺癌免疫浸润中的关键作用 研究依赖于公共数据库(TCGA和GEO)的回顾性数据,缺乏前瞻性临床队列验证 阐明NK细胞在乳腺癌预后和免疫浸润中的作用,并构建预测模型 乳腺癌患者 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 机器学习模型 基因表达数据 TCGA和GEO数据库中的乳腺癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
270 2026-01-27
Celastrol suppresses bone destruction in rheumatoid arthritis by inhibiting ALOX5 expression in macrophages via the NF-κB pathway
2025-Dec-17, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验验证,揭示了中药活性成分雷公藤红素通过抑制巨噬细胞中ALOX5基因表达,进而抑制NF-κB通路活化,从而减轻类风湿关节炎骨破坏的分子机制 首次系统性地结合多组学数据(GEO数据库、单细胞RNA测序)和分子对接技术,鉴定出雷公藤红素在RA中的13个潜在靶点,并明确了ALOX5在巨噬细胞中的关键作用及其通过TNF-NFκB通路调控MMP3的机制 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内动物模型或临床样本的直接验证;单细胞分析的数据来源和样本量未具体说明 阐明雷公藤红素(Celastrol)在类风湿关节炎(RA)中抑制骨破坏的具体分子机制 类风湿关节炎(RA)相关的基因表达数据、雷公藤红素的分子靶点、巨噬细胞 生物信息学 类风湿关节炎 基因集变异分析(GSVA)、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、分子对接、免疫浸润分析、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据(微阵列/RNA-seq)、单细胞转录组数据 基于三个GEO数据集(GSE55235, GSE93777, GSE200815),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
271 2026-01-27
DNMT1 modulation of RASSF1A methylation enhances breast cancer brain metastasis
2025-Dec-11, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究探讨了DNMT1通过调控RASSF1A甲基化促进乳腺癌脑转移的机制 首次在单细胞水平利用循环肿瘤细胞(CTCs)的转录组测序,揭示了DNMT1作为乳腺癌细胞存活、迁移和侵袭的关键促进因子,并证实了RASSF1A是其直接甲基化靶点 研究主要基于原位乳腺癌模型,临床样本验证尚不充分;未探讨其他DNA甲基转移酶(如DNMT3A/B)的可能作用 阐明DNMT1调控RASSF1A甲基化在乳腺癌脑转移中的分子机制 乳腺癌细胞、循环肿瘤细胞(CTCs) 数字病理学 乳腺癌 单细胞转录组测序、DNA甲基化测序、甲基化特异性PCR、染色质免疫沉淀 NA 测序数据 未明确说明(基于原位乳腺癌模型) NA 单细胞RNA-seq NA NA
272 2026-01-27
RNASEH2C enhances TRAF3IP1 to degrade RAI14 in lysosomes thus hindering macrophage antigen presentation and advancing liver cancer
2025-Dec-08, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示了RNASEH2C通过增强TRAF3IP1表达,促进RAI14在溶酶体中的降解,从而抑制巨噬细胞抗原呈递,进而促进肝癌进展的分子机制 首次阐明了RNASEH2C在非极化巨噬细胞中通过调控RAI14的溶酶体降解来抑制抗原呈递,从而促进肝癌发展的新机制,并发现了HSC70和CMTM6在RAI14降解中的相反作用 研究主要基于体外细胞模型和小鼠肿瘤模型,尚未在临床样本中进行大规模验证;对RNASEH2C调控TRAF3IP1表达的具体分子机制阐述不够深入 探究RNASEH2C如何影响巨噬细胞抗原呈递功能及其在肝细胞癌进展中的作用 巨噬细胞(特别是非极化巨噬细胞)、肝细胞癌(HCC)细胞、小鼠肿瘤模型 肿瘤免疫学 肝癌 单细胞RNA测序、免疫印迹、免疫荧光、免疫沉淀、流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据、细胞图像数据 未明确说明具体样本数量,使用了体外细胞模型和小鼠肿瘤模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
273 2026-01-27
A decreased proportion of naïve MAIT cells is associated with the incomplete immune reconstitution in antiretroviral therapy-treated HIV-1 patients
2025-Dec, Virologica Sinica IF:4.3Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体谱分析,揭示了在抗逆转录病毒治疗后的HIV-1患者中,幼稚MAIT细胞比例降低与不完全免疫重建之间的关联 首次通过单细胞测序技术比较分析免疫无应答者、免疫应答者和健康对照的免疫谱,并识别出幼稚MAIT细胞比例降低作为不完全免疫重建的关键细胞亚群 研究样本量有限,且主要基于外周血单核细胞分析,未涉及组织特异性免疫反应 探究抗逆转录病毒治疗后HIV-1患者不完全免疫重建的免疫学机制 HIV-1感染患者(包括免疫无应答者和免疫应答者)以及健康对照个体的外周血单核细胞 免疫学 HIV感染 单细胞RNA测序,单细胞T细胞受体谱测序 NA 单细胞转录组数据,T细胞受体序列数据 未明确指定样本数量,但包括HIV患者和健康对照 NA 单细胞RNA-seq,单细胞TCR测序 NA NA
274 2026-01-27
GPR68, A Proton-sensing GPCR, Mediates Acid-induced Visceral Nociception
2025-Nov-04, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本文研究了GPR68在酸诱导的结肠伤害感受中的作用,揭示了其在结肠感觉神经元中的表达及其作为结肠炎疼痛治疗靶点的潜力 首次通过单细胞RNA测序分析发现GPR68在结肠感觉神经元中表达,并证实其在酸诱导的结肠伤害感受中的关键作用,为结肠炎疼痛治疗提供了新靶点 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证有限,且未深入探讨GPR68在其他疾病或组织中的潜在作用 探究GPR68在酸诱导的结肠伤害感受中的机制及其作为结肠炎疼痛治疗靶点的可能性 小鼠结肠感觉神经元、结肠组织、人类炎症性肠病组织样本 生物医学研究 结肠炎 单细胞RNA测序、RNA-seq分析、钙离子成像、药理学研究 NA 基因表达数据、电生理记录数据、钙离子响应数据 野生型和GPR68-/-小鼠的结肠组织及背根神经节神经元,人类炎症性肠病组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
275 2026-01-27
Targeting the ApoB100-ENO1 interaction with engineered peptides attenuates atherosclerotic inflammation and plaque progression
2025 Nov-Dec, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine IF:6.4Q1
研究论文 本研究开发了一种名为PP3m的工程化肽,通过靶向抑制ApoB100与ENO1的相互作用,有效减轻动脉粥样硬化炎症和斑块进展 首次发现并靶向ApoB100-ENO1相互作用轴,开发了稳定的肽抑制剂PP3m,该疗法在不影响血脂水平的情况下独立减轻炎症和斑块进展 研究主要基于小鼠模型(Ldlr-/-小鼠),其临床转化效果尚需在人体中进一步验证;体外模型可能无法完全模拟体内复杂的炎症微环境 开发一种通过靶向ApoB100-ENO1相互作用来减轻动脉粥样硬化炎症和斑块进展的新型治疗策略 人类动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞、体外培养的巨噬细胞模型、以及喂食致动脉粥样硬化饮食的Ldlr-/-小鼠 心血管疾病研究 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据、细胞表型数据、组织病理学数据 人类动脉粥样硬化斑块的scRNA-seq数据(具体数量未明确说明)、Ldlr-/-小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
276 2026-01-27
DeepDeconUQ estimates malignant cell fraction prediction intervals in bulk RNA-seq tissue
2025-Jun, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文介绍了一种名为DeepDeconUQ的深度神经网络模型,用于基于bulk RNA-seq数据估计恶性细胞分数的预测区间 DeepDeconUQ首次将不确定性量化整合到恶性细胞分数预测中,利用单细胞RNA测序数据和保形化分位数回归生成可靠的预测区间 未明确提及具体局限性,但可能依赖于scRNA-seq数据的质量和可用性 开发一种能够量化预测不确定性的恶性细胞分数估计方法,以改进癌症诊断、预后和治疗决策 癌症组织中的恶性细胞分数 机器学习 癌症 bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 深度神经网络, 分位数回归神经网络 基因表达数据 模拟和真实癌症数据集,具体数量未明确 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
277 2026-01-27
Evaluating genetic-ancestry inference from single-cell RNA-seq data
2025-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一个评估从单细胞RNA测序数据推断遗传祖先方法的框架 首次系统评估了从scRNA-seq数据推断遗传祖先的准确性,并证明了现有工具(如ADMIXTURE)在此类稀疏数据上的有效性 研究依赖于有限的scRNA-seq数据集(4个),且变异检测受限于测序覆盖度和准确性 评估从单细胞RNA测序数据中推断遗传祖先的方法,以提高数据集的遗传多样性表征和减少分析偏差 单细胞RNA测序数据中的遗传多态性 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 ADMIXTURE scRNA-seq测序数据 196名捐赠者,来自人类细胞图谱的4个scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
278 2025-12-22
Integrative analysis of scRNA-seq and RNA-seq to investigate the prognostic value of lactylation and fibroblast-related genes in intrahepatic cholangiocarcinoma
2025-Dec-20, Scientific reports IF:3.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
279 2026-01-26
Targeting OxLDL-mediated CD36 + CAF reprogramming potentiates PD-1 immunotherapy in osteosarcoma
2025-Dec-18, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了骨肉瘤中CD36⁺ CAF通过OxLDL-PPARG-ANGPTL4轴驱动免疫抑制代谢重编程,导致CD8⁺ T细胞耗竭并阻碍PD-1免疫治疗,并证明VitE靶向该通路可增强治疗效果 首次在骨肉瘤中鉴定出CD36⁺ CAF亚群,阐明其通过OxLDL摄取激活PPARG-FABP4轴并分泌ANGPTL4诱导CD8⁺ T细胞耗竭的新机制,提出VitE联合PD-1阻断的代谢靶向治疗策略 研究主要基于临床样本和临床前小鼠模型,尚未进行大规模临床试验验证;机制研究虽深入,但其他免疫细胞亚群在TME中的作用未充分探讨 探究骨肉瘤肿瘤微环境中CAF介导免疫抑制的具体机制,并开发增强PD-1免疫治疗效果的联合策略 骨肉瘤患者组织样本、CD36⁺ CAF亚群、CD8⁺ T细胞及小鼠肿瘤模型 单细胞组学与肿瘤免疫学 骨肉瘤 单细胞RNA测序、功能实验、pull-down结合验证、PLA-flow结合验证、体内小鼠模型 NA 单细胞RNA测序数据、基因表达谱、信号通路数据 接受新辅助化疗和抗PD-1治疗的骨肉瘤患者组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
280 2026-01-26
A chemokine-based prognostic model featuring CXCL8, ITGA5, BACE2, CCR7, CERS4, and MEI1 for cervical cancer
2025-Dec-18, European journal of medical research IF:2.8Q2
研究论文 本研究基于趋化因子相关基因构建了一个包含CXCL8、ITGA5、BACE2、CCR7、CERS4和MEI1的宫颈癌预后模型 首次基于趋化因子相关基因对宫颈癌进行分子分型,并开发了一个六基因风险评分模型,该模型能有效预测患者预后和免疫治疗反应 研究主要依赖于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能 优化宫颈癌的个性化治疗和预后评估 宫颈癌患者 生物信息学 宫颈癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR, CCK-8, 伤口愈合实验, Trans-well实验 Cox回归, Lasso算法, 风险评分模型 基因表达数据, 临床数据 TCGA-CESC和GSE52903队列数据,以及单细胞数据集GSE168652 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
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