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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2741 | 2025-11-21 |
The Role of Fibroblasts in Atopic Dermatitis: Establishing Proinflammatory Microenvironments and Mediating Cellular Crosstalk
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S558464
PMID:41243996
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综述 | 本文总结了成纤维细胞在特应性皮炎中通过建立促炎微环境和介导细胞间通讯的作用机制 | 突破传统聚焦免疫细胞和角质形成细胞的研究局限,系统阐述成纤维细胞在AD中的主动免疫调节功能 | NA | 深入理解特应性皮炎的致病机制并为常规治疗反应不佳患者提供新治疗策略 | 特应性皮炎中的成纤维细胞 | NA | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2742 | 2025-11-21 |
1-stearoyl-2-arachidonoyl-driven B Cell metabolic dysregulation in chronic rhinosinusitis with nasal polyps: insights from Mendelian randomization and single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1719897
PMID:41244838
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序研究慢性鼻窦炎伴鼻息肉中B细胞代谢失调的机制 | 首次发现HLA-DR+ CD33- B细胞和脂质代谢物1-硬脂酰-2-花生四烯酰在CRSwNP中的风险作用,并揭示代谢影响B细胞亚群塑造免疫微环境的新机制 | NA | 探讨慢性鼻窦炎伴鼻息肉的免疫代谢失调机制 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的免疫细胞和代谢物 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序,孟德尔随机化,基因集富集分析,机器学习 | 机器学习 | 单细胞RNA测序数据,代谢组数据,基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2743 | 2025-11-21 |
Decoding the immune microenvironment in osteosarcoma: new insights into checkpoints, vaccines, and CAR-T cells
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1702219
PMID:41244900
|
综述 | 本文全面概述骨肉瘤的免疫微环境特征及当前新兴的免疫治疗策略 | 整合单细胞转录组学对骨肉瘤免疫微环境的新见解,系统探讨检查点抑制剂、肿瘤疫苗和CAR-T细胞等联合治疗策略 | 作为综述文章,未提供原始实验数据验证提出的治疗策略 | 改善骨肉瘤患者临床预后的免疫治疗策略研究 | 骨肉瘤及其肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2744 | 2025-11-21 |
Spatial transcriptomics reveals an unexpected impact of tau and tau pathology on the expression of transthyretin
2025, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2025.1656850
PMID:41245137
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了tau蛋白对转甲状腺素蛋白(TTR)表达的意外调控作用 | 首次发现tau蛋白对Ttr mRNA和蛋白表达的调控作用,揭示了tau可能通过影响TTR参与Aβ疾病进展的反馈环路 | 研究仅使用小鼠模型,需要在人类样本中进一步验证 | 探究tau蛋白如何改变大脑中mRNA表达 | THY-Tau22转基因小鼠和TauKO基因敲除小鼠 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学,免疫荧光 | NA | 空间转录组数据,免疫荧光图像 | 两种小鼠模型(THY-Tau22和TauKO) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2745 | 2025-11-21 |
Fibroblast-derived interleukin-11 as a potential biomarker for intestinal fibrostenosis in Crohn's disease
2025, Therapeutic advances in gastroenterology
IF:3.9Q1
DOI:10.1177/17562848251391093
PMID:41245384
|
研究论文 | 本研究探讨白细胞介素-11作为克罗恩病肠道纤维狭窄潜在生物标志物的价值 | 首次发现成纤维细胞来源的IL-11在克罗恩病纤维狭窄组织中富集并促进肠道纤维化 | 观察性研究设计,样本量有限,需要更大规模研究验证 | 研究白细胞介素在检测克罗恩病相关肠道纤维狭窄中的价值 | 克罗恩病患者的肠道组织和血清样本 | 生物标志物研究 | 克罗恩病 | RNA测序,实时聚合酶链反应,免疫组织化学,单细胞RNA测序,Luminex血清检测 | NA | 转录组数据,血清蛋白数据,组织学数据 | 克罗恩病患者手术切除的配对组织样本(包含未受累和纤维狭窄段) | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2746 | 2025-11-21 |
Functional analysis of TWIST1 domains regulating smooth muscle cell phenotype
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1659847
PMID:41246007
|
研究论文 | 本研究通过分析TWIST1转录因子的不同结构域和二聚体组成对平滑肌细胞表型的调控机制 | 首次系统解析TWIST1不同结构域和不同二聚体组合对平滑肌细胞表型调控的独立功能 | 研究主要基于体外细胞实验,需要进一步体内验证 | 阐明TWIST1在血管疾病中调控平滑肌细胞表型的分子机制 | 人冠状动脉平滑肌细胞(HCASMCs) | 分子生物学 | 心血管疾病 | RNA测序, 增殖和迁移实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2747 | 2025-11-21 |
Regulatory T cell therapies: from patient data to biological insights
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1675114
PMID:41246323
|
综述 | 本文综述了调节性T细胞疗法的临床进展与优化策略,重点探讨如何通过临床数据和先进监测技术改进治疗效果 | 整合临床样本数据与单细胞多组学技术,提出将Treg疗法优化为能够建立免疫耐受的“活体药物” | NA | 改进调节性T细胞疗法,提升其治疗自身免疫性疾病和促进移植耐受的效果 | 调节性T细胞疗法及临床样本数据 | 自然语言处理 | 自身免疫性疾病 | 单细胞多组学分析、表观遗传分析、空间转录组学 | NA | 临床数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 2748 | 2025-11-21 |
Cholesterol metabolism shapes immune low-response states in LUAD: a multi-omics cholesterol metabolism signature predicts immunotherapy benefit and identifies DHCR7 as a therapeutic target
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1696360
PMID:41246332
|
研究论文 | 本研究开发了基于胆固醇代谢基因的特征模型,用于预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应,并鉴定DHCR7作为潜在治疗靶点 | 首次在肺腺癌中建立多组学胆固醇代谢特征模型,发现DHCR7基因与免疫抑制的关联,并验证其作为免疫治疗增敏靶点的潜力 | 研究主要基于回顾性队列分析,需要更多前瞻性研究验证 | 探究胆固醇代谢在肺腺癌免疫微环境中的作用及其对免疫治疗的影响 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 多组学分析,单细胞转录组,免疫组化,流式细胞术,体外和体内实验 | 特征模型 | 基因组数据,转录组数据,单细胞数据,实验数据 | 1,682例肺腺癌样本(包括7个初治队列和3个免疫治疗队列) | NA | 单细胞RNA-seq,多重免疫组化,流式细胞术 | NA | NA |
| 2749 | 2025-11-21 |
Single-cell and spatial transcriptomics integration reveals FAM49B promotes tumor-associated macrophages polarization in colorectal cancer via the MK pathway
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1682637
PMID:41246334
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据,揭示了FAM49B通过MDK-NCL轴促进结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞极化的机制 | 首次发现FAM49B通过MDK-NCL信号轴调控肿瘤相关巨噬细胞极化,揭示了其在塑造免疫抑制肿瘤微环境中的新功能 | 样本量相对有限(16例患者),需要更大规模的研究验证 | 探究FAM49B在结直肠癌免疫抑制肿瘤微环境形成中的作用机制 | 结直肠癌患者组织样本、恶性上皮细胞、肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学分析 | CellChat分析、伪时间轨迹分析 | 单细胞RNA-seq数据、空间转录组数据、bulk RNA数据 | 16例结直肠癌患者的33个单细胞RNA-seq样本和2对配对空间转录组样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2750 | 2025-11-21 |
Integrative multi-omics analysis of gastric cancer evolution from precancerous lesions to metastasis identifies a deep learning-based prognostic model
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680517
PMID:41246350
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和深度学习技术,构建了胃癌从癌前病变到转移的演化图谱和预后模型 | 首次在胃癌中整合多组学数据揭示肿瘤微环境动态重塑过程,并开发基于深度学习的预后预测模型 | 样本量相对有限,仅包含6种组织类型的252,399个细胞 | 解析胃癌进展过程中肿瘤微环境的细胞异质性、空间组织和细胞间通讯 | 胃炎、肠化生、原发肿瘤、癌旁正常组织和转移病灶 | 数字病理 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, WGCNA, 深度学习 | 深度学习模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床数据 | 252,399个细胞来自6种组织类型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2751 | 2025-11-20 |
Immunomodulatory effects of a short-term gluten-free diet on pediatric celiac disease: Findings from a single-cell transcriptomics study
2025-Dec, The Journal of nutritional biochemistry
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jnutbio.2025.110063
PMID:40803542
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析探讨短期无麸质饮食对儿科乳糜泻患者免疫细胞的调节作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析儿科乳糜泻患者短期无麸质饮食后的免疫细胞转录变化 | 样本量较小(仅5名患者),结果需谨慎解读,需要更大规模队列研究验证 | 研究短期无麸质饮食对儿科乳糜泻患者免疫细胞的调节机制 | 儿科乳糜泻患者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 乳糜泻 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5名儿科乳糜泻患者(治疗前后配对样本) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于液滴的单细胞RNA测序技术 |
| 2752 | 2025-11-20 |
[Single cell sequencing technology for analyzing the interaction between type 3 innate lymphoid cells and regulatory T cells in patients with fibrostenotic Crohn's disease]
2025-Nov-25, Zhonghua yi xue za zhi
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析纤维狭窄型克罗恩病患者中3型先天淋巴细胞与调节性T细胞的相互作用 | 首次在纤维狭窄型克罗恩病患者中利用单细胞测序技术系统分析ILC3与Treg细胞的相互作用及其对肠道免疫微环境的影响 | 样本量较小(共7例患者),且为回顾性研究设计 | 研究纤维狭窄型克罗恩病患者中ILC3与Treg细胞的相互作用机制 | 纤维狭窄型克罗恩病患者的肠道纤维化组织和非纤维化组织样本 | 单细胞生物学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7例纤维狭窄型克罗恩病患者(温州组1例,瑞金组6例) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2753 | 2025-11-20 |
Nerandomilast, a PDE4B inhibitor, alleviates silica-induced lung inflammation and fibrosis by inhibition of NLRP3 inflammasome and TGF-β/Smad signalling
2025-Nov-19, British journal of pharmacology
IF:6.8Q1
DOI:10.1111/bph.70240
PMID:41255094
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研究论文 | 本研究评估了PDE4B抑制剂Nerandomilast在矽肺模型中通过抑制NLRP3炎症小体和TGF-β/Smad信号通路减轻肺部炎症和纤维化的作用 | 首次发现PDE4B是矽肺发病机制的关键调控靶点,并证实其抑制剂Nerandomilast通过双重抑制经典/非经典NLRP3炎症小体通路和TGF-β/Smad信号发挥治疗作用 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,尚未在人体中进行验证 | 探究PDE4B抑制剂Nerandomilast治疗矽肺的疗效和作用机制 | 雄性C57BL/6N小鼠、THP-1巨噬细胞、MRC-5细胞 | 医学研究 | 矽肺 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、转录组分析 | 动物模型、细胞模型 | 基因表达数据、功能测试数据 | 小鼠模型和细胞系实验 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2754 | 2025-11-20 |
BM-MSC-derived migrasomes reverse stroke-induced thymic atrophy and immunosuppression via Pin1 delivery to thymic epithelial cells
2025-Nov-15, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03604-2
PMID:41241718
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研究论文 | 本研究揭示骨髓间充质干细胞通过分泌迁移体递送Pin1蛋白,逆转中风诱导的胸腺萎缩和免疫抑制 | 首次发现BM-MSC来源的迁移体能够穿越血胸屏障,通过递送细胞周期调节蛋白Pin1特异性促进胸腺上皮细胞增殖 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证 | 解决中风后神经保护与免疫抑制之间的临床困境 | 骨髓间充质干细胞、迁移体、胸腺上皮细胞、T细胞 | 细胞生物学 | 中风 | 单细胞RNA测序、液相色谱-串联质谱、体外实验 | 动物模型 | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 中风模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | NA |
| 2755 | 2025-11-20 |
Inferring pathway activity from single-cell and spatial transcriptomics data with PaaSc
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013666
PMID:41212919
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研究论文 | 开发了一种名为PaaSc的计算方法,用于从单细胞和空间转录组数据推断通路活性 | 使用多重对应分析将细胞和基因同时投影到共同潜在空间,并通过线性回归选择通路相关维度来推断通路活性得分 | NA | 将高维单细胞和空间转录组数据转化为功能性通路见解 | 单细胞和空间转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,scATAC-seq | 多重对应分析,线性回归 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,scATAC-seq | NA | NA |
| 2756 | 2025-11-20 |
Enhancing Spatial Transcriptomics via Spatially Constrained Matrix Decomposition with EDGES
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508346
PMID:40842021
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研究论文 | 本文开发了一种名为EDGES的空间约束矩阵分解框架,用于增强空间转录组数据的基因表达预测和去噪 | 通过图拉普拉斯正则化整合空间信息,同时协同整合细胞表示和基因特异性表示,确保预测基因表达与真实ST分布紧密对齐 | NA | 解决成像基空间转录组技术在基因检测能力和表达谱测量准确性方面的局限性 | 空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 非负矩阵分解 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2757 | 2025-11-20 |
stTrace: detecting spatial-temporal domains from spatial transcriptome to trace developmental path
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf606
PMID:41241818
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研究论文 | 提出一种从空间转录组数据中检测时空域以追踪发育路径的算法stTrace | 整合细胞发育程度、基因表达和空间位置信息识别时空域,并揭示其层次发育关系 | NA | 开发从空间转录组数据追踪发育路径的算法 | 小鼠胚胎和人类乳腺癌数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | stTrace算法 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2758 | 2025-11-20 |
Characterization of tertiary lymphoid structure identifies competitive binding of CD40 and STING with TRAF2 driving IRF4-mediated B cell activation in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Nov, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00944-2
PMID:40855365
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研究论文 | 本研究通过分析食管鳞状细胞癌中三级淋巴结构的特征,揭示了CD40和STING与TRAF2竞争性结合通过非经典NF-κB信号通路驱动IRF4介导的B细胞激活机制 | 首次发现CD40和STING与TRAF2的竞争性结合关系,阐明其通过调节IRF4表达促进B细胞激活的新机制 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 探索三级淋巴结构在食管鳞状细胞癌中的临床意义及其抗肿瘤作用的生物学机制 | 食管鳞状细胞癌患者样本和体外培养的B细胞 | 癌症免疫学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,体外实验 | NA | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2759 | 2025-11-02 |
Duplicated genes find their space: Spatial transcriptomics illuminates evolutionary fates
2025-Oct-31, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf265
PMID:41175099
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2760 | 2025-11-20 |
Medium-Chain Fatty Acid exposure in non-transformed mammary glands leads to pro-tumorigenic alterations associated with aging
2025-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.01.679891
PMID:41256444
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现中链脂肪酸暴露会导致非转化乳腺组织出现类似衰老的前肿瘤性改变 | 首次揭示中链脂肪酸辛酸通过改变细胞间连接和细胞外基质相互作用,诱导乳腺组织产生与衰老相关的前肿瘤性变化 | 研究主要关注非转化乳腺组织,未在肿瘤模型中验证这些变化对癌症发展的直接影响 | 探索乳腺局部环境中影响乳腺癌发生的病因学和生物学因素 | 非转化乳腺组织 | 单细胞测序分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |