本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2721 | 2025-12-18 |
Large-scale single-cell profiling of stem cells uncovers redundant regulators of shoot development and yield trait variation
2025-Apr-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.04.583414
PMID:38496543
|
研究论文 | 本研究通过对玉米和拟南芥茎尖干细胞进行大规模单细胞RNA测序分析,揭示了保守的干细胞调控因子及其与产量性状的关联 | 首次成功捕获并分析了植物茎尖干细胞的大规模单细胞转录组数据,通过跨物种比较和突变体分析发现了新的干细胞调控因子家族 | 植物干细胞获取困难,实验方法需要精细的组织解剖和优化的细胞回收协议 | 揭示植物茎尖干细胞的调控因子,为作物工程提供理论基础以提高生产力 | 玉米和拟南芥的茎尖干细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 数千个表达干细胞标记基因的细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2722 | 2025-12-18 |
Spatial Transcriptomics of the Respiratory System
2025-02, Annual review of physiology
IF:15.7Q1
|
综述 | 本文综述了呼吸系统中空间转录组学技术的应用,包括常用工作流程、优势与局限,以及机器学习和人工智能在空间数据分析中的最新进展 | 整合了空间转录组学技术与计算工具(如机器学习和深度学习),以解决肺部细胞类型在三维空间中相互作用的理解挑战,并展示了在肺发育、COVID-19、肺癌和纤维化等疾病中的新见解 | NA | 理解呼吸系统中细胞类型在三维空间中的相互作用,以促进对肺部功能(如气流、气体交换和屏障功能)在健康和疾病状态下的认识 | 呼吸系统,包括肺部和气道 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | 机器学习,深度学习 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2723 | 2025-12-18 |
Single-cell RNA sequencing reveals cellular diversity and gene expression dynamics in maize root development
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1666531
PMID:41393869
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了玉米根尖发育过程中的细胞多样性和基因表达动态 | 首次在玉米根尖中应用单细胞RNA测序技术,构建了高分辨率的转录图谱,并发现了与拟南芥和水稻不同的激素相关基因表达模式 | 研究仅针对玉米根尖组织,未涵盖整个根系系统;单细胞测序技术本身存在技术噪音和细胞捕获偏差 | 阐明玉米根发育在单细胞分辨率下的分子基础 | 玉米根尖组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析、加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2724 | 2025-12-18 |
Single-cell RNA-seq reveals breast cancer heterogeneity and identifies TCP1 as a therapeutic target in breast cancer
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20451
PMID:41394417
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术解析乳腺癌异质性,识别出TCP1作为潜在治疗靶点 | 通过单细胞RNA测序高分辨率解析乳腺癌肿瘤微环境异质性,首次发现KRT17阳性亚群与患者生存相关,并验证TCP1在乳腺癌细胞迁移和侵袭中的关键作用 | 样本量相对有限(68例),且主要基于回顾性分析,需要进一步前瞻性研究验证 | 解析乳腺癌肿瘤异质性并识别新的治疗靶点 | 乳腺癌患者肿瘤样本(68例)及乳腺癌细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),拷贝数变异推断(inferCNV) | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 68例乳腺癌标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2725 | 2025-12-18 |
Single-cell profiling identifies heterogeneity of the immune microenvironment in healthy, primary and lymph node metastatic BC
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1690992
PMID:41394809
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫组化数据,揭示了乳腺癌及其淋巴结转移灶中肿瘤内皮细胞的异质性,并发现了两种新的肿瘤富集内皮细胞亚型(EC4和EC5)及其与免疫微环境的相互作用 | 首次在乳腺癌中鉴定出两种先前未被表征的、肿瘤富集的内皮细胞亚型(EC4和EC5),揭示了它们亚型特异性的功能适应和预后意义,并阐明了这些新内皮细胞亚群与免疫细胞(特别是CD8+T细胞和巨噬细胞)之间新颖且亚型特异性的通讯机制 | 研究样本量相对有限(约12个样本,98,000个细胞),且主要关注乳腺癌,结论在其他癌症类型中的普适性有待验证 | 阐明乳腺癌及其淋巴结转移灶中肿瘤内皮细胞的异质性、功能及其与肿瘤免疫微环境的相互作用,以发现新的治疗靶点 | 来自原发性乳腺癌肿瘤、ER阳性淋巴结转移灶和健康组织的细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,图像数据 | 约12个样本,共98,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 2726 | 2025-12-18 |
Efferocytosis-induced metabolic shift in bone macrophages drives lactate production and modulates inflammation and osteoclastogenesis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1650465
PMID:41394808
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了骨髓来源巨噬细胞在吞噬凋亡成骨细胞后,其代谢向糖酵解转变并产生乳酸,进而调节骨微环境中的炎症和破骨细胞生成 | 首次在单细胞水平上表征了骨微环境中执行胞葬作用的巨噬细胞亚群,并阐明了其代谢重编程(向糖酵解转变)及产生的乳酸在调节骨稳态中的关键作用 | 研究主要基于体外骨髓来源巨噬细胞模型,体内骨微环境的复杂性和其他细胞类型的相互作用可能未被完全涵盖 | 探究巨噬细胞在清除凋亡成骨细胞(胞葬作用)后发生的代谢改变及其对骨微环境(炎症和骨重塑)的调控作用 | 骨髓来源巨噬细胞、凋亡的成骨细胞、破骨细胞 | 单细胞组学 | 骨代谢疾病 | 单细胞RNA测序,qRT-PCR,代谢组学分析,乳酸ELISA | NA | 单细胞转录组数据,代谢物数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2727 | 2025-12-18 |
Unveiling the novel value of TREM1 in the proneural-mesenchymal transition of glioma via tumor-associated macrophages
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1662351
PMID:41394801
|
研究论文 | 本研究揭示了TREM1在胶质母细胞瘤肿瘤相关巨噬细胞中介导前神经-间质转化(PMT)的关键作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次通过单细胞RNA测序结合TCGA数据分析,将TREM1鉴定为肿瘤相关巨噬细胞中驱动胶质母细胞瘤PMT的关键生物标志物,并阐明了其通过TLR4/PI3K/AKT/mTOR信号通路发挥作用的机制 | 样本量相对较小(7名患者),且体内实验仅使用了腹腔给药模型,需要更大规模的临床验证和更多给药途径的探索 | 探究TREM1在胶质母细胞瘤肿瘤相关巨噬细胞中介导前神经-间质转化的作用机制及治疗潜力 | 胶质母细胞瘤患者样本(肿瘤相关巨噬细胞和恶性细胞) | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, mRNA测序, 共培养系统, 体内给药实验 | LASSO-Cox回归, 加权基因共表达网络分析 | 单细胞RNA测序数据, mRNA测序数据 | 7名胶质母细胞瘤患者的24,366个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2728 | 2025-12-18 |
Integrated multi-omics elucidates PRNP knockdown-mediated chemosensitization to gemcitabine in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1667835
PMID:41394830
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,揭示了PRNP基因在胰腺导管腺癌中对吉西他滨耐药的关键调控作用及其通过EMT和铁死亡的双重机制 | 首次系统性地将PRNP基因鉴定为PDAC吉西他滨耐药的关键调控因子,并阐明其通过促进EMT和抑制铁死亡的双重作用机制,同时利用单细胞和空间转录组学揭示了其在化疗后特定CAF亚群中的富集与免疫抑制微环境的关联 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型,临床验证尚不充分,且PRNP靶向治疗策略的实际临床转化效果有待进一步评估 | 系统研究胰腺导管腺癌中吉西他滨耐药的机制并识别新的治疗靶点 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞系、小鼠模型和临床患者数据 | 生物信息学与多组学整合分析 | 胰腺癌 | 微阵列、转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序、空间转录组学 | 机器学习算法 | 多组学数据(包括转录组、蛋白质组、单细胞和空间转录组数据) | 涉及胰腺癌细胞系、小鼠模型和临床患者数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2729 | 2025-12-18 |
Single-cell transcriptomics reveals pathogen interactions and T cell reprogramming in HIV and Mycobacterium tuberculosis co-infection
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680538
PMID:41394852
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了HIV与结核分枝杆菌共感染中病原体相互作用及T细胞重编程的机制 | 通过单细胞RNA测序结合有向无环图推断伪时间轨迹,首次系统描绘了从健康到HIV感染再到共感染的免疫细胞动态变化,并识别了Th1/Th17失衡及MHC-I偏向的T细胞信号重配置 | 研究样本来自未治疗早期状态,可能无法完全反映疾病进展或治疗后的免疫变化,且样本量相对有限 | 探究HIV与结核分枝杆菌共感染中病原体相互作用及宿主免疫重塑的机制 | 健康对照、HIV单感染及HIV-Mtb共感染参与者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | HIV感染与结核病共感染 | 单细胞RNA测序 | 有向无环图 | 单细胞转录组数据 | 健康对照、HIV单感染及HIV-Mtb共感染参与者的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2730 | 2025-12-18 |
Mechanistic Study of CD90-Positive Synovial Fibroblasts in the Invasion and Recurrence of Pigmented Villonodular Synovitis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S549953
PMID:41394900
|
研究论文 | 本研究通过整合RNA测序和微阵列分析,探讨了色素沉着绒毛结节性滑膜炎中CD90阳性滑膜成纤维细胞在侵袭和复发中的作用机制 | 首次利用单细胞RNA测序数据识别了PVNS滑膜中CD90+PDPN+滑膜成纤维细胞亚群,并揭示了其在炎症因子分泌、骨降解和侵袭特性中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证CD90+PDPN+细胞作为治疗靶点的有效性 | 阐明色素沉着绒毛结节性滑膜炎的发病机制,特别是滑膜成纤维细胞在疾病侵袭和复发中的作用 | 色素沉着绒毛结节性滑膜炎患者的滑膜组织,以及与骨关节炎滑膜组织的对比 | 数字病理学 | 色素沉着绒毛结节性滑膜炎 | RNA测序, 微阵列分析, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学染色, 免疫荧光染色, Western blot, 流式细胞术, Transwell迁移侵袭实验, 伤口愈合实验 | CIBERSORT算法, GSEA分析, KEGG通路富集分析 | 基因表达谱数据, 单细胞RNA测序数据, 组织图像数据 | 来自GSE3698、GSE175626和GSE176133数据库的PVNS和骨关节炎滑膜样本 | NA | RNA-seq, 微阵列, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2731 | 2025-12-18 |
Machine Learning and Mendelian Randomization Identify Allergic Rhinitis as Nasopharyngeal Carcinoma Risk Factor With Validated Potential Candidate Biomarkers
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/2281787
PMID:41395113
|
研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学和孟德尔随机化方法,全面绘制了鼻咽癌的细胞异质性图谱,并确立了过敏性鼻炎与鼻咽癌发病之间的潜在因果关系 | 首次整合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,揭示了过敏性鼻炎作为鼻咽癌风险因素的因果联系,并识别了遗传验证的分子通路 | 研究样本量有限,且主要基于遗传关联分析,需进一步实验验证因果机制 | 探究过敏性鼻炎与鼻咽癌之间的因果关系及分子机制 | 鼻咽癌组织及邻近正常组织样本 | 机器学习 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化 | NA | 转录组数据, 遗传变异数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2732 | 2025-12-18 |
Single-Cell Profiling Identifies Reward Behavior-Related Neurons and Alterations in the Ventral Tegmental Area Based on Arvcf-Knockout Mouse Model
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1030
PMID:41395251
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学、神经蛋白质组学和多重免疫荧光成像技术,基于Arvcf敲除小鼠模型,揭示了腹侧被盖区(VTA)中与奖励行为相关的神经元亚群及其在尼古丁诱导奖励中的关键作用 | 首次在单细胞分辨率下,结合Arvcf敲除小鼠模型和尼古丁暴露,识别出VTA中一种谷氨酸能-多巴胺能组合神经元亚群,并发现其通过Wnt信号通路与多巴胺能神经元通信,在尼古丁诱导的奖励学习中起关键调节作用 | 研究基于小鼠模型,结果向人类转化需进一步验证;单细胞测序技术可能无法捕获所有神经元类型的完整转录组信息 | 探究Arvcf基因敲除对VTA神经元亚群的影响,以及这些亚群在奖励行为(特别是尼古丁诱导的奖励)中的分子和功能角色 | 野生型和Arvcf敲除小鼠的腹侧被盖区(VTA)神经元,包括经尼古丁处理和非处理的样本 | 神经科学 | 成瘾行为 | 单核RNA测序(snRNA-seq)、神经蛋白质组学、多重免疫荧光成像、代谢物检测 | Arvcf敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、成像数据 | 96,240个细胞,来自野生型和Arvcf敲除小鼠,有或无尼古丁处理 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 2733 | 2025-12-17 |
Single Cell RNAseq Analysis of Thyroid Hormone Effects on Retinal Glial Cells
2025-Dec-15, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2025.1221
PMID:41400582
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探究了三碘甲状腺原氨酸对视网膜胶质细胞的转录组影响 | 首次在单细胞分辨率下系统分析甲状腺激素对视网膜胶质细胞转录调控的异质性 | 研究仅使用小鼠模型,未验证人类样本;实验周期较短(4周),未评估长期效应 | 揭示甲状腺激素信号如何通过调控视网膜胶质细胞转录组参与视网膜退行性病变 | C57BL/6小鼠的视网膜胶质细胞(Müller细胞、星形胶质细胞、小胶质细胞) | 单细胞转录组学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1月龄C57BL/6小鼠(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2734 | 2025-12-17 |
Uncovering functional divergence and cellular clusters with specific gene signatures in HNSCC clonal spheroids
2025-Dec-12, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02360-3
PMID:41388470
|
研究论文 | 本研究通过生成头颈鳞状细胞癌(HNSCC)的克隆球体,揭示了其功能异质性,并利用单细胞RNA测序技术鉴定了与增殖和迁移相关的不同细胞簇及其基因特征 | 首次在HNSCC克隆球体中系统识别了超增殖和低增殖球体的功能差异,并通过单细胞RNA测序揭示了与肿瘤微环境相关的特定细胞簇和基因表达谱 | 研究基于细胞系和患者肿瘤细胞生成的球体模型,可能无法完全模拟体内肿瘤的复杂性,且样本来源有限 | 探究HNSCC克隆球体的功能异质性及其与肿瘤进展的关系 | HNSCC细胞系和患者肿瘤细胞生成的克隆球体 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 来自HNSCC细胞系和患者肿瘤细胞的克隆球体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2735 | 2025-12-17 |
An updated and spatially validated somatic single-cell atlas of Hydractinia symbiolongicarpus
2025-Dec-11, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12201-9
PMID:41382277
|
研究论文 | 本研究通过整合固定细胞和活细胞数据,更新了Hydractinia symbiolongicarpus的单细胞图谱,揭示了细胞类型多样性和空间表达模式 | 整合新数据集扩展了细胞数量至超过47,000个,识别了新的免疫细胞群、神经亚型、空间不同的腺细胞群以及完整的刺细胞发育轨迹 | NA | 构建并验证Hydractinia symbiolongicarpus的更新单细胞图谱,以促进对刺胞动物细胞多样性和动态的理解 | Hydractinia symbiolongicarpus的喂养息肉和匍匐茎组织细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过47,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2736 | 2025-12-17 |
Single-cell transcriptomics reveals probiotic reversal of neonatal morphine-induced gene disruptions underlying adolescent pain hypersensitivity
2025-Dec-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09150-0
PMID:41372449
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了新生儿期吗啡暴露导致青春期小鼠中脑基因表达广泛改变,并发现益生菌Bifidobacterium infantis可逆转这些改变 | 首次提供了新生儿吗啡暴露及益生菌干预后青春期小鼠中脑的单细胞RNA测序数据集,揭示了益生菌对阿片类药物诱导的神经发育影响的逆转作用 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床中得到验证;观察时间点局限于青春期 | 探究新生儿期吗啡暴露对疼痛通路神经发育的长期影响及益生菌干预的潜在治疗作用 | 青春期小鼠的中脑单细胞 | 单细胞转录组学 | 疼痛敏感性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 107,427个中脑单细胞,来自新生儿期接受生理盐水、吗啡或吗啡加益生菌处理的小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2737 | 2025-12-17 |
Protoplast technology in woody plants: current advances and potential applications in genetic improvement
2025-Dec-03, Tree physiology
IF:3.5Q1
DOI:10.1093/treephys/tpaf138
PMID:41182256
|
综述 | 本文综述了木本植物原生质体技术的当前进展及其在遗传改良中的潜在应用 | 全面概述了木本植物原生质体分离、纯化、活力评估方法及其在基因功能分析、融合、再生、基因组编辑和单细胞测序等领域的多样化应用,并展望了未来技术突破带来的新研究方向 | NA | 总结木本植物原生质体技术的最新进展,并探讨其在遗传改良和生物技术创新中的潜力 | 木本植物 | 植物生物技术 | NA | 原生质体分离、瞬时表达系统、基因编辑、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2738 | 2025-12-17 |
Intestinal fibroblast heterogeneity - unifying RNA-seq studies and introducing consensus-driven nomenclature
2025-Dec-01, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.264147
PMID:41170756
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,识别了小鼠结肠黏膜中的六个成纤维细胞亚群,并提出了标准化的命名法 | 整合多个数据集以识别保守的成纤维细胞群体,并引入共识驱动的命名法来统一分类 | 研究主要基于小鼠模型,可能不完全适用于人类;在稳态条件下进行,未充分探讨疾病状态下的变化 | 研究肠道成纤维细胞的异质性,并建立标准化的命名体系 | 小鼠结肠黏膜中的成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2739 | 2025-12-17 |
Hub genes and common pathogenic mechanisms between COPD and H. pylori infection
2025-Dec, Journal, genetic engineering & biotechnology
DOI:10.1016/j.jgeb.2025.100622
PMID:41386886
|
研究论文 | 本文通过整合分析公共数据集,识别了慢性阻塞性肺疾病(COPD)和幽门螺杆菌(H. pylori)感染之间的共享基因和共同致病机制 | 首次通过多组学方法(包括WGCNA、SVM-RFE、单细胞RNA测序和细胞间通讯分析)系统识别了COPD和H. pylori感染之间的共享枢纽基因CCR1和CCL19,并揭示了它们在免疫细胞和成纤维细胞中的表达模式及相互作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏实验验证;样本来源和实验条件可能存在异质性;单细胞分析可能受限于数据集的细胞类型覆盖和分辨率 | 探究COPD和H. pylori感染之间的共同分子机制和共享基因,以揭示潜在的整合治疗靶点 | COPD和H. pylori感染的基因表达数据,包括差异表达基因、共表达模块、免疫细胞浸润和单细胞转录组 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 基因表达分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)、基因集富集分析(GSEA)、受试者工作特征曲线(ROC)、免疫浸润分析(CIBERSORT)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞间通讯分析 | SVM-RFE | 基因表达数据(微阵列或RNA-seq) | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2740 | 2025-12-17 |
Single-cell analysis of human thymus and peripheral blood unveils the dynamics of T cell development and aging
2025-Dec, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00990-3
PMID:41136751
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析了人类胸腺和外周血中T细胞发育与衰老的动态过程 | 首次结合单细胞测序和TCR测序,揭示了胸腺衰老对T细胞谱系潜力和外周T细胞老化的影响,并建立了基于初始T细胞的免疫年龄预测模型 | 样本量相对有限,且研究主要基于转录组数据,功能验证不足 | 探究年龄相关胸腺退化的机制及其对外周T细胞的影响 | 人类胸腺和外周血细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关免疫疾病 | 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据,TCR序列数据 | 387,762个细胞,来自年轻和年老个体的胸腺和外周血 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞TCR-seq | NA | NA |