本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2681 | 2025-11-29 |
The Expression of the LDLR, LDLRAP1, and PCSK9 Genes has Prognostic Significance in Triple-negative Breast Cancer
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究探讨胆固醇摄取基因在三阴性乳腺癌中的预后意义 | 首次系统评估LDLR、LDLRAP1和PCSK9等胆固醇摄取基因在不同乳腺癌亚型中的预后价值差异 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,需要前瞻性研究验证 | 评估胆固醇摄取基因对乳腺癌患者总生存期的预后意义及其在不同亚型间的差异 | 乳腺癌患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 乳腺癌 | mRNA测序,单细胞测序 | DESeq2,Fisher检验 | 基因表达数据 | 癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的乳腺癌肿瘤样本 | NA | mRNA测序,单细胞测序 | NA | NA |
| 2682 | 2025-11-29 |
Double-Responsive Macrophage-Derived Exosomes Alleviate Acute Lung Injury
2025, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0277
PMID:41293091
|
研究论文 | 本研究开发了一种EGFR单克隆抗体修饰的巨噬细胞来源外泌体miR-126a-3p,用于治疗脓毒症引起的急性肺损伤 | 首次构建了具有巨噬细胞靶向能力的双响应外泌体递送系统,通过抑制PIK3R2/NLRP3信号通路和铁死亡发挥治疗作用 | 研究主要基于LPS诱导的小鼠急性肺损伤模型,尚未在临床患者中验证 | 探索新型外泌体治疗方法对急性肺损伤的治疗效果及机制 | 巨噬细胞、外泌体、miR-126a-3p、急性肺损伤小鼠模型 | 生物医学工程 | 急性肺损伤 | 单细胞测序、miRNA芯片、免疫荧光、电穿孔技术、小动物成像 | NA | 基因表达数据、成像数据、细胞表型数据 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2683 | 2025-11-29 |
The Strontium Ion Reprograms Monocyte Subsets via TRPM2 Channel Regulation to Enhance Osseointegration
2025, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0286
PMID:41293090
|
研究论文 | 本研究揭示了锶离子通过调控TRPM2通道重编程单核细胞亚群以增强骨整合的机制 | 首次阐明锶修饰生物材料通过TRPM2-Ca-NLRP3轴调控单核细胞亚群分布和功能的免疫调节机制 | 未明确说明样本规模,且机制研究主要集中于单核细胞,其他免疫细胞的作用未深入探讨 | 探究锶离子对单核细胞亚群动态重编程的机制及其在骨整合中的作用 | 单核细胞亚群、钛植入物、骨髓间充质基质细胞 | 免疫工程 | 骨整合障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2684 | 2025-11-29 |
Clinical application and drug resistance mechanism of gemcitabine
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1702720
PMID:41293424
|
综述 | 系统综述吉西他滨的耐药机制并探索新型递药系统和联合治疗策略的突破方向 | 整合单细胞测序和人工智能药物敏感性预测等前沿技术,提出通过动态监测多组学生物标志物构建'预防-监测-干预'全链条管理体系 | 主要基于现有文献综述,缺乏原始实验数据验证 | 探讨吉西他滨的临床应用及耐药机制 | 吉西他滨及其耐药机制 | NA | 肿瘤 | 单细胞测序,人工智能药物敏感性预测,多组学生物标志物监测 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2685 | 2025-11-29 |
Decoding IL-1 receptor 1 and 2 expression profiles across organs in sepsis
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1675870
PMID:41293423
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术验证,系统分析了脓毒症中IL-1R1和IL-1R2受体在不同器官中的细胞类型特异性表达动态 | 首次在单细胞水平揭示IL-1受体在脓毒症中具有器官特异性和细胞类型特异性的表达模式 | 研究基于小鼠模型,需在人类样本中进一步验证 | 阐明IL-1受体在脓毒症中的表达动态及其在免疫调节和组织特异性反应中的作用 | 小鼠盲肠结扎穿刺诱导的脓毒症模型中的肺、肝、心脏和小肠组织 | 单细胞生物学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 公开可用的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2686 | 2025-11-29 |
Integrative Multi-Omics and Functional Validation Reveal the Role of the TACE Refractoriness-Associated Gene ATP1B3 in Hepatocellular Carcinoma
2025, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S537990
PMID:41293558
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和功能验证,揭示了ATP1B3基因在肝细胞癌TACE耐药性和肿瘤进展中的关键作用 | 首次将ATP1B3鉴定为与TACE耐药性相关的关键基因,并通过单细胞RNA测序揭示了其在肿瘤-免疫细胞相互作用中的功能 | 样本量相对有限(104例患者),需要在更大队列中进一步验证 | 识别与肝细胞癌TACE耐药性相关的基因并探索其功能机制 | 104例接受TACE治疗的肝细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 多组学分析, 功能验证实验 | 无监督聚类, Cox回归, lasso回归 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 104例肝细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2687 | 2025-11-29 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals CCL3+ Classical Monocyte Subset Linked to Autoimmune Pathogenesis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S547283
PMID:41293646
|
研究论文 | 通过整合六种自身免疫性疾病的单细胞RNA测序数据,揭示了CCL3+经典单核细胞亚群在自身免疫发病机制中的关键作用 | 首次在多种自身免疫性疾病中发现并鉴定了一个新的CCL3+经典单核细胞亚群,该亚群具有强烈的炎症特性和趋化作用 | 研究主要基于外周血单核细胞,未深入探讨组织特异性变化 | 表征自身免疫疾病中单核巨噬细胞的共享和疾病特异性改变,以增进对自身免疫疾病免疫景观的理解 | 自身免疫疾病患者和健康对照者的外周血免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组织化学染色,免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 350,043个外周血免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2688 | 2025-11-29 |
Relationship between SPP1 (Osteopontin) and extracellular matrix dynamics: a comprehensive review
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1700652
PMID:41293726
|
综述 | 本综述系统总结了SPP1(骨桥蛋白)在细胞外基质动态调控中的核心作用及其在多种疾病中的病理机制 | 首次提出SPP1作为病理性ECM动态的主调控因子,强调保守的SPP1+巨噬细胞-ECM相互作用机制 | 缺乏体内验证数据,特别是在骨关节炎模型中的验证 | 阐明SPP1介导的细胞外基质失调机制及其作为中心病理枢纽的作用 | SPP1(骨桥蛋白)及其与胶原蛋白和其他ECM组分的相互作用 | 生物医学研究 | 纤维化疾病、转移性疾病、骨关节炎 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、机器学习、体内/体外实验 | NA | 多组学数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2689 | 2025-11-28 |
Spatially resolved single-cell transcriptome analysis of murine Salmonella infection reveals the role of distal colonocytes in the inflammatory response
2025-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2579909
PMID:41277366
|
研究论文 | 通过整合多种转录组测序技术,揭示了小鼠沙门氏菌感染期间结肠的时空单细胞转录组景观,发现远端结肠细胞在炎症反应中的关键作用 | 首次结合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间RNA-seq数据,系统描绘了肠道感染过程中的时空转录组动态,并鉴定出远端结肠细胞的关键响应作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证相对有限 | 阐明肠道对病原体感染的区室化反应的细胞和分子基础 | 小鼠结肠组织和人类肠道单细胞转录组数据 | 空间转录组学 | 肠道感染 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间RNA-seq | NA | 转录组数据 | 一周感染时间过程的小鼠结肠样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2690 | 2025-11-28 |
ENO1 promotes cancer metastasis via stimulating metabolism reprogramming in osteosarcoma
2025-Dec, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03182-3
PMID:40983627
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示ENO1基因通过刺激代谢重编程促进骨肉瘤转移的机制 | 首次在单细胞水平揭示ENO1通过调控糖酵解促进骨肉瘤转移的作用机制 | 样本量较小(仅10例儿科骨肉瘤样本),需要更大样本验证 | 阐明骨肉瘤转移的潜在分子机制 | 儿科骨肉瘤患者组织样本 | 单细胞测序分析 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 10例儿科骨肉瘤样本(分为原发无转移组、原发有转移组和转移灶组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2691 | 2025-11-28 |
Functional role of granulocytic myeloid-derived suppressor cells in CAR-T therapy: insights from single-cell RNA sequencing in multiple myeloma
2025-Dec, Immunopharmacology and immunotoxicology
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/08923973.2025.2585083
PMID:41198058
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤患者CAR-T治疗中粒细胞样髓源抑制细胞的功能作用 | 首次在CAR-T治疗背景下系统分析G-MDSCs的免疫抑制机制,发现PTGS1作为关键标志物并构建了高精度预后预测模型 | 样本量有限且患者间存在异质性,结果具有探索性,需要更大更多样化的队列验证 | 全面分析G-MDSCs在多发性骨髓瘤CAR-T治疗中的功能作用 | 多发性骨髓瘤患者 | 单细胞转录组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,基因集富集分析,体外功能实验 | 风险预测模型 | 单细胞转录组数据,RNA-seq数据,生存数据 | 7例多发性骨髓瘤患者(单细胞数据),713例多发性骨髓瘤患者(验证队列) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2692 | 2025-11-28 |
Single cell RNA seq of the major cell types in the larva of the sea star, Patiria miniata
2025-Nov-27, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.70100
PMID:41306072
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了海星Patiria miniata幼虫发育过程中的主要细胞类型及其基因表达轨迹 | 首次提供了海星幼虫发育的单细胞转录组图谱,发现原始生殖细胞与体腔囊细胞具有相似的基因表达谱,并揭示了外胚层上皮的高度异质性 | 研究主要聚焦于第3天幼虫,其他发育时间点的分析相对有限 | 研究海星发育过程中细胞类型分化和基因表达机制 | 海星Patiria miniata受精后1-4天的幼虫 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,原位RNA杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | 海星幼虫发育1-4天的细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2693 | 2025-11-28 |
DBP: Adaptive and Interpretable Factor Analysis for Single-cell RNA-seq Data with Deep Beta Processes
2025-Nov-26, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf117
PMID:41298306
|
研究论文 | 提出一种基于深度Beta过程的单细胞RNA-seq数据自适应可解释因子分析方法 | 通过stick-breaking Beta过程实现因子数量的自适应选择,并采用对抗学习策略进行批次校正 | NA | 开发自适应且可解释的因子分析方法用于单细胞转录组数据分析 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 胃腺癌 | 单细胞RNA测序 | 深度概率框架,Beta过程 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2694 | 2025-11-28 |
Rheumatoid arthritis synovial fibroblasts modulate T cell activation
2025-Nov-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.193054
PMID:41055954
|
研究论文 | 本研究揭示了类风湿关节炎滑膜成纤维细胞通过IDO1介导的色氨酸消耗调控T细胞活化的新机制 | 首次发现滑膜成纤维细胞通过IDO1介导的色氨酸消耗诱导T细胞低反应性,并证实其在滑膜微环境中的主导免疫调节作用 | 未明确说明研究样本的具体数量及实验设计的局限性 | 探究类风湿关节炎滑膜成纤维细胞对T细胞活化的调节机制 | 类风湿关节炎患者的滑膜成纤维细胞和T细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2695 | 2025-11-28 |
Multi-omics analysis reveals different cholesterol metabolism subtypes in colorectal cancer
2025-Nov-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03993-z
PMID:41283923
|
研究论文 | 通过多组学分析识别结直肠癌中不同的胆固醇代谢亚型及其临床意义 | 首次基于胆固醇代谢相关基因对结直肠癌进行分子分型,并系统揭示不同亚型的肿瘤微环境特征和免疫治疗响应差异 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 识别结直肠癌的胆固醇代谢亚型并揭示其分子和免疫学特征 | 结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 基因组分析 | 无监督聚类 | 基因表达数据, 单细胞数据, 临床数据 | TCGA数据库结直肠癌样本及单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 2696 | 2025-11-28 |
Dose-dependent effects of wheat germ oil and vitamin E on apoptosis and gene expression in breast and cervical cancer cell lines with single-cell RNA-seq profiling
2025-Nov-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-25408-3
PMID:41285842
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析探讨小麦胚芽油和维生素E对乳腺癌和宫颈癌细胞凋亡及基因表达的剂量依赖性影响 | 首次结合单细胞RNA测序技术系统评估小麦胚芽油和维生素E在乳腺癌和宫颈癌细胞中的剂量依赖性抗肿瘤效应 | 仅使用MCF-7和HeLa两种细胞系,缺乏体内实验验证 | 探究天然代谢物在癌症治疗中的潜在应用价值 | MCF-7乳腺癌细胞系和HeLa宫颈癌细胞系 | 单细胞组学 | 乳腺癌,宫颈癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,实时荧光定量PCR | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 两种癌细胞系(MCF-7和HeLa) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2697 | 2025-11-28 |
Integrated scRNA-seq and transcriptome analyses uncover the effects of UBE2H on the immune microenvironment regulation in pancreatic cancer
2025-Nov-24, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04059-4
PMID:41286881
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和转录组分析,揭示了UBE2H在胰腺癌免疫微环境调控中的作用 | 首次在胰腺导管细胞生态位中发现UBE2H+细胞群体,并系统阐明UBE2H通过抑制T细胞功能、损害抗原呈递和激活中性粒细胞胞外诱捕网等方式调控免疫微环境的机制 | NA | 探索胰腺癌'冷'肿瘤形成的关键调控分子及其功能机制 | 胰腺癌样本中的细胞群体,特别是胰腺导管细胞生态位 | 单细胞分析 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, inferCNV分析, 体内实验 | 15基因模型 | 单细胞测序数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2698 | 2025-11-28 |
Matrix metalloproteinases are hallmark early biomarkers and therapeutic targets in FSHD
2025-Nov-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195104
PMID:40966415
|
研究论文 | 本研究揭示了基质金属蛋白酶(MMPs)在面肩肱型肌营养不良症(FSHD)中作为早期生物标志物和治疗靶点的重要作用 | 首次通过单细胞RNA测序确定FAPs和巨噬细胞是肌营养不良肌肉中MMPs的主要来源,并证明泛MMP抑制剂batimastat可改善肌肉病变 | 研究主要基于动物模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究MMPs在FSHD疾病进展中的作用机制及治疗潜力 | 面肩肱型肌营养不良症(FSHD)患者活检样本和iDUX4pA FSHD小鼠模型 | 生物医学研究 | 肌营养不良症 | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2699 | 2025-11-28 |
Platelets impair the resolution of inflammation in atherosclerotic plaques in insulin-resistant mice after lipid lowering
2025-Nov-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.193593
PMID:41066197
|
研究论文 | 本研究探讨胰岛素抵抗状态下血小板如何阻碍降脂治疗期间动脉粥样硬化斑块的炎症消退 | 首次揭示血小板通过抑制Fcgr4+巨噬细胞亚群扩增阻碍斑块炎症消退的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床数据有限 | 探究血小板在胰岛素抵抗个体降脂治疗中影响动脉粥样硬化斑块炎症消退的作用机制 | 肥胖胰岛素抵抗小鼠模型及人类临床数据 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,临床数据 | 小鼠模型及患者队列(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2700 | 2025-11-28 |
Key Considerations on CITE-Seq for Single-Cell Multiomics
2025-Nov, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202400011
PMID:39924789
|
综述 | 本文聚焦CITE-Seq单细胞多组学技术的工作流程,以微孔板单细胞分析系统为例,提供抗体衍生标签染色、文库制备、测序和数据分析的关键注意事项 | 系统梳理CITE-Seq技术实施要点,首次以微孔板单细胞分析系统为范例提供全流程实用指南 | NA | 为研究人员提供执行CITE-Seq完整工作流程的实用指导 | 单细胞多组学分析技术 | 单细胞多组学 | NA | CITE-Seq, 单细胞mRNA测序, 抗体衍生标签 | NA | 基因表达数据, 蛋白质丰度数据 | NA | NA | 单细胞多组学, CITE-Seq | NA | 微孔板单细胞分析系统 |