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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2641 | 2026-02-05 |
Unveiling the IL-1β/CXCL2 axis: a shared therapeutic target in periodontitis and inflammatory bowel disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1728773
PMID:41624856
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研究论文 | 本研究通过整合牙周炎和炎症性肠病的转录组数据,揭示了IL-1β/CXCL2轴作为两种疾病共有的炎症治疗靶点 | 首次整合牙周炎和炎症性肠病的批量与单细胞RNA-seq数据,识别出跨疾病的髓系细胞为中心的IL-1β/趋化因子炎症程序,并验证了IL-1β-CXCL2通路作为潜在治疗靶点 | 功能阻断研究尚未进行,需要进一步实验验证治疗因果关系 | 揭示牙周炎与炎症性肠病之间共享的细胞和分子机制,以寻找共同的治疗靶点 | 牙周炎患者和炎症性肠病患者的转录组数据,以及双炎症啮齿动物模型 | 生物信息学 | 牙周炎和炎症性肠病 | 单细胞RNA-seq, 批量转录组分析, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA-seq数据, 图像数据 | 两个牙周炎队列(GSE16134和GSE10334),18个炎症性肠病样本的51,322个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2642 | 2026-02-05 |
Commentary: Lactylation-related gene AKR1A1 contributes to osteoporosis via metabolic-immune regulation: evidence from multi-omics integration, single-cell transcriptomics, and in vitro validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1752400
PMID:41624851
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2643 | 2026-02-05 |
Decoding thymic development: a single-cell atlas of tree shrew immunity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1689906
PMID:41624883
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了树鼩出生后胸腺发育的全面细胞图谱,揭示了其免疫系统在物种间的保守性与特异性 | 首次通过单细胞RNA测序构建树鼩胸腺发育的细胞图谱,并识别出如ZNF683基因在CD8aa细胞发育后期表达等物种特异性变异 | 研究主要关注胸腺细胞,可能未全面覆盖树鼩整个免疫系统的复杂性;样本年龄范围可能限制了对发育全阶段的理解 | 解析树鼩作为临床前哺乳动物模型的免疫系统,特别是胸腺发育过程 | 树鼩的出生后胸腺细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,但涉及年轻和年老树鼩的胸腺细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2644 | 2026-02-03 |
Single-cell analysis of B cell dysregulation in pediatric sepsis stratified by disease severity
2025-Dec-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34126-9
PMID:41476192
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析了儿童脓毒症患者外周血白细胞,揭示了B细胞在疾病严重程度分层中的关键作用及其耗竭机制 | 首次在儿童脓毒症中应用单细胞RNA测序技术,识别并验证了自然杀伤样B细胞(NKB)等B细胞亚群的耗竭和转录重编程,拓宽了人类脓毒症中B细胞表型的认知 | 样本量较小(仅6名脓毒症患者和4名健康对照),且研究集中在儿科群体,可能限制结果的普遍性 | 探究儿童脓毒症中B细胞耗竭的机制及其与疾病严重程度的关系 | 儿童脓毒症患者(包括轻度和重度)及健康对照的外周血白细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 6名儿童脓毒症患者(3名轻度,3名重度)和4名健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2645 | 2026-02-03 |
Single-cell transcriptomics and spatial validation reveal dysfunction of keratinocytes and NK cells driving acne development
2025-Dec-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34373-w
PMID:41476262
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和空间免疫荧光技术,揭示了健康皮肤、轻度痤疮和重度痤疮中角质形成细胞与自然杀伤(NK)细胞的功能失调是驱动痤疮发展的关键机制 | 提出了“双重免疫-屏障失衡”的创新病理模型,首次系统阐述了角质形成细胞从防御到异常分化、以及NK细胞从激活到耗竭的时序性功能转变在痤疮进展中的核心作用 | 未明确说明样本的具体数量与人口统计学特征,且空间验证主要依赖免疫荧光技术,可能缺乏更高通量的空间多组学数据支撑 | 阐明痤疮发生发展的细胞与分子机制,为早期诊断和精准干预提供理论基础 | 健康皮肤、轻度痤疮和重度痤疮患者的皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病(痤疮) | 单细胞RNA测序,空间免疫荧光 | 伪时间分析,功能富集分析 | 单细胞转录组数据,空间成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 2646 | 2026-02-03 |
VAMP5 promotes glioma progression through bioinformatics analysis clinical correlation and functional validation
2025-Dec-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04375-1
PMID:41467924
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析、临床关联和功能验证,揭示了VAMP5在胶质瘤进展中的促进作用 | 首次系统性地整合多组学数据(TCGA、GEO、单细胞RNA测序)并结合体外体内实验,全面阐明了VAMP5在胶质瘤中的表达模式、临床意义、功能角色及免疫调节机制,提出其作为新型预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于公共数据库和细胞系/动物模型,缺乏大规模前瞻性临床队列验证;VAMP5的具体下游信号通路和与免疫微环境相互作用的分子细节仍需进一步探索 | 探究VAMP5在胶质瘤中的表达模式、临床意义及功能作用,以寻找新的诊断、预后和治疗靶点 | 胶质瘤组织、正常脑组织、胶质母细胞瘤(GBM)细胞系、动物模型 | 生物信息学与肿瘤生物学 | 胶质瘤 | 生物信息学分析、实时定量PCR、免疫组织化学、Western blot、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、通路富集分析、免疫浸润分析、体外功能实验、体内实验 | NA | 基因表达数据、临床病理数据、单细胞测序数据、蛋白质相互作用数据、实验数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个数据集及临床样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2647 | 2026-02-03 |
Integrated transcriptomic and single-cell analysis reveals cell cycle dysregulation and cellular heterogeneity in lung cancer
2025-Dec-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04303-3
PMID:41467951
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组学和单细胞分析,揭示了肺癌中细胞周期失调和细胞异质性 | 结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq,识别了与临床表型相关的基因模块及细胞周期关键调控因子 | 研究主要基于细胞系和有限组织样本,未在大型临床队列中进行验证 | 解析肺癌的转录景观和肿瘤微环境中的细胞异质性,以识别潜在治疗靶点和预后生物标志物 | 肺癌组织、邻近正常样本以及A549和H1299肺癌细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-qPCR | WGCNA, 伪时间轨迹分析 | RNA序列数据 | 肺癌组织与邻近正常样本,以及A549和H1299细胞系 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2648 | 2026-02-03 |
CCL20 secreted by KRT15high tumor Cells promotes tertiary lymphoid structure formation and enhances anti-PD-1 therapy response in HPV+HNSCC
2025-Dec-29, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08359-5
PMID:41462011
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研究论文 | 本研究揭示了HPV阳性头颈鳞状细胞癌中KRT15高表达肿瘤细胞通过分泌CCL20促进三级淋巴结构形成,从而增强抗PD-1疗法疗效的机制 | 首次阐明HPV感染通过KRT15高表达肿瘤细胞分泌CCL20促进三级淋巴结构形成的具体机制,并证实其对抗PD-1疗法疗效的增强作用 | 样本量相对有限(59例患者),且机制研究主要在动物模型中进行,需进一步临床验证 | 探究HPV阳性头颈鳞状细胞癌中三级淋巴结构形成的机制及其对抗PD-1免疫疗法疗效的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者组织样本、单细胞测序数据、空间转录组数据及小鼠模型 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、RNA-seq、免疫组织化学、多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、组织图像数据 | 59例头颈鳞状细胞癌患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2649 | 2026-02-03 |
Downregulated Expression of the IL7R and BACH2 Genes Is Associated with Immune Memory Loss in Adults Vaccinated Against HBV at Birth
2025-Dec-29, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48010047
PMID:41614877
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了出生时接种乙肝疫苗的成年个体中免疫记忆丧失与IL7R和BACH2基因表达下调的关联 | 首次在单细胞水平上揭示了IL7R和BACH2基因表达下调与乙肝疫苗接种后免疫记忆丧失的关联,为理解免疫记忆机制提供了新视角 | 样本量较小(仅15名参与者),且为观察性研究,无法确定因果关系 | 探究乙肝疫苗接种后免疫记忆丧失的分子机制 | 出生时接种乙肝疫苗的成年个体,包括5名无症状HBsAg携带者和10名HBsAg及抗-HBs阴性对照 | 单细胞组学 | 乙肝病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 15名参与者(5名病例,10名对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2650 | 2025-12-29 |
Exploring cellular heterogeneity: single-cell and spatial transcriptomics of Alzheimer's disease brains and iPSC-derived microglia
2025-Dec-28, Alzheimer's research & therapy
DOI:10.1186/s13195-025-01944-y
PMID:41456076
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2651 | 2026-02-03 |
Dynamic neutrophil-keratinocyte communication network centered on IL-36/TNFSF15 responses characterizes inflammatory responses in generalized pustular psoriasis
2025-Dec-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67917-9
PMID:41436466
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了泛发性脓疱型银屑病(GPP)病变中中性粒细胞与角质形成细胞之间的动态通讯网络,特别是IL-36/TNFSF15信号通路在炎症反应中的核心作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合空间转录组学,系统描绘了GPP病变中的免疫微环境,识别了中性粒细胞从炎症前状态向促炎状态转变的关键特征,并发现了以成纤维细胞和毛细血管内皮细胞为中心的动态受体-配体相互作用网络 | 样本量相对有限(GPP病变皮肤13例,健康皮肤4例),且研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证 | 探究泛发性脓疱型银屑病(GPP)病变中免疫微环境的特征,特别是中性粒细胞与角质形成细胞之间的通讯机制 | GPP患者的病变皮肤样本(13例)和健康成人皮肤样本(4例) | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 13例GPP病变皮肤样本,4例健康皮肤样本,总计约60,000个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 2652 | 2026-02-03 |
Combined HIF-1α blockade and CHIR99021 treatment reverses pulmonary fibrosis via modulation endothelial-to-mesenchymal transition
2025-Dec-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114028
PMID:41399517
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研究论文 | 本研究通过联合抑制HIF-1α和GSK-3β,逆转了辐射诱导的肺纤维化,揭示了其通过调控内皮-间质转化、DNA修复和染色质重塑的机制 | 首次提出联合靶向HIF-1α和GSK-3β(使用2-ME和CHIR99021)来逆转肺纤维化,并通过单细胞RNA测序和谱系追踪证实了其在恢复内皮细胞特性和抑制间质转化中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和患者成纤维细胞,尚未在人体临床试验中验证,且具体信号通路细节需进一步探索 | 研究旨在开发逆转辐射诱导肺纤维化的治疗策略 | 小鼠辐射诱导肺纤维化模型、患者特发性肺纤维化成纤维细胞 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、表观遗传分析 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | 小鼠模型和患者成纤维细胞样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2653 | 2026-02-03 |
Development and application of a barcoded rabies viral tracing method for mapping brain-wide inputs to single neurons
2025-Dec-15, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101244
PMID:41338190
|
研究论文 | 本研究开发了一种条形码狂犬病毒示踪方法,用于在单细胞水平上绘制全脑对单个神经元的输入连接图谱 | 将逆行病毒示踪与单细胞RNA测序相结合,创建了条形码狂犬病毒示踪方法,首次实现了在单细胞分辨率下对转录组定义的神经元进行局部和长程输入连接的同时绘制 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种能够绘制单个神经元输入连接图谱的方法,以构建细胞分辨率的大脑介观连接组 | 小鼠内侧前额叶皮层神经元 | 神经科学 | NA | 逆行病毒示踪,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,连接数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2654 | 2026-02-03 |
Decoding osteosarcoma from heterogeneity to precision therapy
2025-Dec-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04256-7
PMID:41379383
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综述 | 本文综述了骨肉瘤的分子亚型研究进展,强调了亚型特异性致癌驱动因素及其在肿瘤进展和治疗抵抗中的作用,并探讨了基于分子谱的精准医学策略潜力 | 整合了多组学数据(包括单细胞转录组学、空间分析和表观遗传图谱)来解码骨肉瘤的异质性,并识别了新的生物标志物 | NA | 解码骨肉瘤的异质性,并探索针对其分子亚型的精准治疗策略 | 骨肉瘤(OS),一种青少年中最常见的恶性骨肿瘤 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 多组学研究,包括基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、单细胞转录组学、空间分析和表观遗传图谱 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间分析, 表观遗传图谱 | NA | NA |
| 2655 | 2026-02-03 |
A molecular, spatial and regulatory atlas of the Hydra vulgaris nervous system
2025-Oct-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204983
PMID:41071669
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和ATAC-seq技术,对Hydra vulgaris神经系统进行了全面的分子和空间图谱绘制 | 首次提供了Hydra vulgaris神经系统最全面的分子和空间特征,识别了8种神经元类型和15种转录亚型,并整合了基因调控网络分析 | 研究主要基于单细胞测序数据,可能未完全覆盖所有神经元功能或动态变化 | 揭示Hydra vulgaris神经系统的发育、稳态、再生和功能的分子机制 | Hydra vulgaris的神经系统 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2656 | 2026-02-03 |
Multi-scaled transcriptomics of chronically inflamed nasal epithelium reveals immune-epithelial dynamics and tissue remodeling in nasal polyp formation
2025-Oct-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.08.009
PMID:40945518
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了慢性鼻窦炎中免疫细胞与上皮细胞之间的相互作用及组织重塑机制,特别是在鼻息肉形成过程中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学,系统解析了慢性鼻窦炎中免疫-上皮细胞互作网络,并识别了与鼻息肉形成相关的基底细胞轨迹 | 研究主要基于人类组织样本,可能受样本异质性影响,且机制验证仍需进一步功能实验 | 探究慢性鼻窦炎的病理生理机制,特别是免疫-上皮细胞相互作用在疾病进展和组织重塑中的作用 | 慢性鼻窦炎患者(伴或不伴鼻息肉)及对照个体的鼻窦组织 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 超过100名慢性鼻窦炎患者及对照个体的组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2657 | 2026-02-03 |
A replication study of novel fetal hemoglobin-associated genetic variants in sickle cell disease-only cohorts
2025-Apr-06, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf015
PMID:39886999
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研究论文 | 本研究验证了在镰状细胞病(SCD)患者中,胎儿血红蛋白(HbF)水平与五个新基因位点(ASB3、BACH2、PFAS、ZBTB7A和KLF1)的遗传变异之间的关联,并利用CRISPR抑制和单细胞转录组学技术探索了这些非编码变异在调控β-珠蛋白基因表达中的功能 | 首次在独立的SCD队列中复制了先前GWAS发现的20个HbF相关新变异中的五个,并利用CRISPR抑制和单细胞转录组学技术验证了BACH2和KLF1位点非编码变异的功能性作用 | 未能通过全外显子组测序在SCD患者中鉴定出对HbF水平有显著影响的罕见遗传变异 | 验证镰状细胞病(SCD)患者中胎儿血红蛋白(HbF)水平与新基因位点的遗传关联,并探索这些变异的功能机制 | 镰状细胞病(SCD)患者,具体包括3740名SCD患者用于遗传关联验证,以及1354名SCD患者用于全外显子组分析,同时使用红细胞系HUDEP-2细胞进行功能研究 | 遗传学 | 镰状细胞病 | 全基因组关联研究(GWAS)、CRISPR抑制、单细胞转录组学、全外显子组测序 | NA | 遗传变异数据、转录组数据、外显子组序列数据 | 3740名SCD患者用于遗传关联验证,1354名SCD患者用于全外显子组分析 | NA | 单细胞转录组学、全外显子组测序 | NA | NA |
| 2658 | 2026-02-03 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies Selective Lineage-Specific Regulation of Genes in Aortic Smooth Muscle Cells in Mice
2025-Feb, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.321482
PMID:39744838
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术,识别了小鼠主动脉平滑肌细胞中第二心场和心脏神经嵴谱系特异性基因的差异表达 | 首次在对照主动脉中探索了两种谱系来源的平滑肌细胞之间的转录组差异,并识别了谱系特异性上调基因 | 研究仅基于14周龄雄性小鼠,样本量有限,且未涉及疾病模型 | 探究主动脉平滑肌细胞中谱系特异性基因调控的差异 | 小鼠主动脉根部和升主动脉的平滑肌细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单核转座酶可及染色质测序, RNA原位杂交 | NA | 单细胞RNA测序数据, 染色质可及性数据, 空间表达数据 | 14只14周龄雄性小鼠(SHF追踪和CNC追踪各半) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2659 | 2026-02-03 |
Opportunities and challenges in the application of single-cell transcriptomics in plant tissue research
2025-Feb, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-025-01558-6
PMID:40070535
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在植物组织研究中的应用、挑战及整合多源单细胞多模态数据的方法 | 总结了整合多源单细胞RNA测序和单细胞多模态数据的方法,以构建全面的细胞图谱并探索跨模态的因果关系和基因调控机制 | 单细胞RNA测序实验通常无法全面捕获所有细胞和基因,且单模态数据不足以解释细胞状态和系统变化 | 探讨单细胞转录组学在植物组织研究中的机遇与挑战,以及整合方法在揭示生物变化中的应用和价值 | 植物组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多模态 | NA | NA |
| 2660 | 2026-02-03 |
A regularized Bayesian Dirichlet-multinomial regression model for integrating single-cell-level omics and patient-level clinical study data
2025-Jan-07, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujaf005
PMID:39887052
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研究论文 | 提出一种正则化贝叶斯狄利克雷-多项式回归框架,用于整合单细胞RNA测序数据与患者临床数据,以探究细胞类型丰度与临床变量之间的关系 | 引入新型分层树结构以识别不同细胞类型水平上的关联,并首次将正则化贝叶斯狄利克雷-多项式回归应用于单细胞与临床数据的整合分析 | 未明确说明模型对数据规模和质量的敏感性,且仅在三类疾病中验证,普适性有待进一步验证 | 开发一种整合单细胞组学数据与患者临床数据的方法,以揭示细胞类型丰度与临床变量之间的关联 | 肺纤维化、COVID-19和非小细胞肺癌患者的单细胞RNA测序数据及临床数据 | 单细胞组学 | 肺纤维化, COVID-19, 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序 | 正则化贝叶斯狄利克雷-多项式回归模型 | 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |