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当前共找到 10507 篇文献，本页显示第 2601 - 2620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2601 | 2025-11-07 |
Identification of Dendritic Cell-Associated Genes in COPD Based on Bioinformatics
2025, International journal of chronic obstructive pulmonary disease
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/COPD.S543753
PMID:41185886
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证鉴定COPD患者肺组织中树突状细胞相关基因 | 首次结合单细胞RNA测序、RNA测序数据和WGCNA分析系统鉴定COPD中树突状细胞相关基因，并通过动物模型和细胞实验验证 | 研究主要基于公共数据库和动物模型，需要在人类临床样本中进一步验证 | 鉴定慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者肺组织中树突状细胞相关基因 | COPD患者肺组织、香烟烟雾诱导的肺气肿小鼠模型、骨髓来源树突状细胞 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序,RNA测序,加权基因共表达网络分析,RT-qPCR,Western blot | NA | 基因表达数据 | 多个公共数据库(GSE196638, GSE26296, GSE38974)和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 2602 | 2025-11-06 |
Decoding Xylem Development in Flowering Plants: Insights From Single-Cell Transcriptomics
2025-Dec, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70169
PMID:40905378
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综述 | 本文综述单细胞转录组测序技术在解码开花植物木质部发育中的应用进展 | 整合激光显微切割原位转录组分析技术，提供更精确的细胞类型注释并支持当前最佳的木质部发育谱系工作模型 | 存在跨研究比较的技术挑战，包括生物信息学流程不一致、原生质体化效率变异和潜在错误注释的标记基因使用 | 研究开花植物木质部发育过程 | 单子叶植物和双子叶植物的初生及次生木质部 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 激光显微切割 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2603 | 2025-11-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals T and B cell-related immune features in foot and mouth disease virus-infected mice
2025-Dec, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2025.2580141
PMID:41144693
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示口蹄疫病毒感染小鼠脾脏中T细胞和B细胞的免疫特征 | 首次在单细胞水平系统揭示口蹄疫病毒感染过程中T细胞和B细胞的组成变化、基因表达特征、细胞间通讯状态和调控网络 | 研究仅限于小鼠模型，未在自然宿主中验证 | 解析口蹄疫病毒感染过程中适应性免疫应答的特征 | 口蹄疫病毒感染小鼠脾脏中的T细胞和B细胞 | 单细胞组学 | 口蹄疫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | FMDV感染组和模拟感染对照组小鼠脾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2604 | 2025-11-06 |
Single-cell aneuploidy and chromosomal arm imbalances define subclones with divergent transcriptomic phenotypes
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf138
PMID:41179709
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研究论文 | 开发了一种整合单细胞RNA测序和单细胞DNA测序的计算框架scAlign，用于在单个细胞分辨率下定义亚克隆的细胞表型 | 开发了scAlign计算框架，首次实现了在单个细胞水平上整合scRNA-seq和scDNA-seq数据，能够基于基因剂量将细胞分配到特定亚克隆并分析其转录组表型 | 仅使用G0/G1期的细胞进行分析，可能忽略了细胞周期其他阶段的生物学信息 | 研究癌症中亚克隆的基因组不稳定性与转录组表型之间的关系 | 原发性和转移性癌症中的肿瘤细胞亚克隆 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞DNA测序, 单细胞RNA测序, 多组学整合分析 | scAlign计算框架 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞DNA测序 | NA | NA |
| 2605 | 2025-11-06 |
Single-Cell RNA Sequencing of Retina Reveals Nna1 Upregulation in Myopic Diabetic Retinopathy as a Protective Factor Against Diabetic Damage
2025-Nov-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202500438
PMID:41190783
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现近视糖尿病视网膜病变中Nna1上调，并证实其通过抑制微管过度谷氨酰化发挥保护作用 | 首次揭示Nna1在近视对糖尿病视网膜病变保护作用中的关键机制，发现其通过调节微管谷氨酰化水平影响细胞自噬和凋亡 | 研究主要基于动物模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究近视对糖尿病视网膜病变的保护机制及Nna1在此过程中的作用 | db/db糖尿病小鼠的视网膜组织及Müller细胞 | 单细胞转录组学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | db/db糖尿病小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2606 | 2025-11-06 |
A Single-Cell-Inspired Self-Enrichment Therapeutic Strategy Delays Intervertebral Disc Degeneration by Inhibiting Pyroptosis
2025-Nov-05, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202516405
PMID:41190793
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学与临床验证构建椎间盘退变细胞图谱，开发自富集纳米载体延缓椎间盘退变进程 | 首次发现STING介导的炎症通路激活髓核细胞焦亡机制，并设计具有不对称气泡推进功能的自富集纳米载体实现病变组织选择性穿透 | 未明确纳米载体在长期使用中的潜在安全性问题及临床转化可行性 | 开发靶向治疗策略延缓椎间盘退变进程 | 椎间盘退变组织及髓核细胞 | 单细胞组学与纳米医学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序, 纳米载体技术, siRNA干扰 | NA | 单细胞转录组数据, 体内外实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2607 | 2025-11-06 |
Single-cell characterization of trophoblast-epithelial interactions at the human maternal-fetal interface during early implantation
2025-Nov-04, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf246
PMID:41189328
|
研究论文 | 本研究利用输卵管异位妊娠模型通过单细胞RNA测序技术探索人早期胚胎植入过程中母胎界面滋养细胞与上皮细胞的相互作用机制 | 首次利用输卵管异位妊娠模型作为研究工具，通过单细胞转录组分析揭示母胎界面细胞间通讯网络 | 研究基于异位妊娠模型，与正常宫内妊娠存在生理环境差异 | 阐明人类早期胚胎植入过程中母胎界面的分子机制 | 输卵管异位妊娠和正常宫内妊娠的母胎界面组织 | 单细胞生物学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色 | CellPhoneDB，CellChat | 单细胞转录组数据 | 输卵管异位妊娠患者植入部位样本及公共数据库正常宫内妊娠数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2608 | 2025-11-06 |
Mouse cortical cellular diversification through lineage progression of radial glia
2025-Nov-03, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.352826.125
PMID:40774817
|
研究论文 | 通过时间序列单细胞测序技术研究小鼠皮层放射状胶质细胞的谱系进展与细胞多样化机制 | 首次构建了皮层细胞谱系进展的全面分子图谱，揭示染色质可及性通过限制转录因子表达时序驱动细胞多样化的新机制 | 研究仅限于小鼠模型，人类皮层发育可能存在物种特异性差异 | 探索皮层细胞多样化的细胞内在程序机制 | 小鼠皮层放射状胶质细胞及其衍生细胞类型 | 发育生物学 | NA | scRNA-seq, snATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据，单细胞染色质可及性数据 | 胚胎期和出生后多个发育阶段的小鼠皮层祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 2609 | 2025-11-06 |
Neoadjuvant Immunotherapy Promotes the Formation of Mature Tertiary Lymphoid Structures in a Remodeled Pancreatic Tumor Microenvironment
2025-Nov-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0387
PMID:40815230
|
研究论文 | 本研究通过构建胰腺导管腺癌的空间多组学图谱，揭示了新辅助免疫治疗促进成熟三级淋巴结构形成及其在肿瘤微环境重塑中的作用 | 首次报道了新辅助免疫治疗在胰腺癌中促进成熟三级淋巴结构形成的空间特征，并发现了与患者生存改善相关的TLS特异性空间基因表达特征 | 研究样本量有限，且主要关注特定免疫治疗方案下的反应机制 | 探究三级淋巴结构在胰腺导管腺癌免疫治疗中的作用及其空间分布特征 | 接受新辅助免疫治疗联合治疗的胰腺导管腺癌患者肿瘤组织及肿瘤邻近淋巴结 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 成像质谱流式技术,空间转录组学,无监督基因表达矩阵分解 | 机器学习分类模型,无监督学习 | 图像,基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,成像质谱流式 | NA | NA |
| 2610 | 2025-11-06 |
Highly accurate reference and method selection for universal cross-data set cell type annotation with CAMUS
2025-Nov-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280821.125
PMID:41034048
|
研究论文 | 提出一种通用参考数据和方法选择策略CAMUS，用于跨数据集细胞类型注释 | 开发了首个通用参考数据和方法选择策略，显著提升细胞类型注释准确性 | NA | 提高单细胞数据中细胞类型注释的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据和单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞测序数据 | 672对跨物种scRNA-seq数据集，80个scST数据集，5个scATAC-seq数据集 | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 2611 | 2025-11-06 |
Evaluation of Proton Minibeam Radiotherapy on Antitumor Immune Responses in a Rat Model of Glioblastoma
2025-Nov-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0902
PMID:40833465
|
研究论文 | 评估质子微束放疗在胶质母细胞瘤大鼠模型中对抗肿瘤免疫反应的影响 | 首次在临床前胶质母细胞瘤模型中系统研究质子微束放疗的免疫调节作用，发现其优于传统质子疗法的免疫激活特性 | 研究仅限于大鼠模型，尚未在人体验证；单细胞转录组学分析可能未完全捕捉所有免疫细胞亚群 | 探索质子微束放疗对胶质母细胞瘤免疫反应的调节机制 | 胶质母细胞瘤原位大鼠模型 | 放射肿瘤学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学，质子微束放疗 | NA | 基因表达数据，免疫细胞密度数据 | 胶质母细胞瘤大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2612 | 2025-11-06 |
Atlas-Guided Discovery of Transcription Factors for T Cell Programming
2025-Nov-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.03.522354
PMID:36711632
|
研究论文 | 本研究通过构建CD8+ T细胞状态图谱，系统鉴定调控T细胞分化的转录因子 | 整合转录组和表观基因组数据构建T细胞状态图谱，结合体内CRISPR筛选发现新型T细胞状态特异性转录因子 | NA | 系统定义驱动CD8+ T细胞不同分化状态的转录因子 | CD8+ T细胞的九种分化状态，特别是终末耗竭T细胞和组织驻留记忆T细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，表观遗传分析，体内CRISPR筛选 | NA | 转录组数据，表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2613 | 2025-11-06 |
Transcriptomic profiling of individual bacteria by MATQ-seq
2025-Nov, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01157-5
PMID:40204970
|
研究论文 | 开发了一种基于MATQ-seq的细菌单细胞转录组测序方法，能够高效分析单个细菌的基因表达谱 | 将真核生物MATQ-seq方法成功应用于细菌单细胞转录组分析，实现了95%的细胞保留率，显著优于现有方法 | NA | 建立高效可靠的细菌单细胞转录组测序方法 | 单个细菌细胞，以鼠伤寒沙门氏菌为模型生物 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序，荧光激活细胞分选，rRNA去除 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | MATQ-seq | 基于多重退火和dC加尾的定量单细胞RNA测序方法 |
| 2614 | 2025-11-06 |
Improving predictive accuracy in multiple myeloma using a plasma cell profile derived from single-cell RNA sequencing
2025-Nov-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2025.287586
PMID:40438979
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤肿瘤细胞异质性，发现了一个侵袭性细胞亚群并建立了七基因标志物的整合风险分层模型 | 首次在单细胞分辨率下识别出多发性骨髓瘤中具有染色体不稳定性和高耐药性的侵袭性细胞亚群，并开发了基于七基因标志物的新型风险分层模型 | 样本量相对较小（12例新诊断患者），需要在更大队列中进一步验证 | 改善多发性骨髓瘤的风险分层和预后预测准确性 | 多发性骨髓瘤患者的肿瘤细胞 | 单细胞测序分析 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，数字PCR | Cox比例风险模型，整合风险分层模型 | 单细胞转录组数据 | 12例新诊断多发性骨髓瘤患者，并在5个独立数据集中验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2615 | 2025-11-06 |
Integrative Transcriptomic Analysis Decodes the Interplay Between Aging, Senescence, and Cancer
2025-Nov, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70178
PMID:40899323
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研究论文 | 通过整合基因组学、表观基因组学及单细胞转录组学分析，揭示细胞衰老与肿瘤发生之间的反向转录特征 | 首次在单细胞分辨率下系统比较正常衰老、细胞衰老和癌症的特征，发现648个衰老依赖性衰老相关共调控模块 | 研究主要关注17种组织，可能未覆盖所有组织类型；机制研究仍需进一步实验验证 | 解析衰老、细胞衰老与癌症之间的相互作用机制 | 17种人体组织中的内皮细胞、T细胞、上皮细胞、巨噬细胞和成纤维细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 基因组学、表观基因组学、单细胞转录组学 | NA | 基因组数据、表观基因组数据、转录组数据 | 17种组织类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2616 | 2025-11-06 |
Increased AIF-1-mediated p38 MAPK phosphorylation in the mid-secretory endometrium impairs endometrial receptivity in women with recurrent implantation failure
2025-Nov-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaf174
PMID:41003697
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研究论文 | 本研究探讨了同种异体移植炎症因子-1（AIF-1）通过p38 MAPK磷酸化途径损害复发性种植失败患者子宫内膜容受性的机制 | 首次揭示AIF-1在子宫内膜基质细胞中通过p38 MAPK磷酸化途径抑制细胞增殖和蜕膜化，从而降低子宫内膜容受性的新机制 | AIF-1在子宫内膜巨噬细胞在胚胎植入过程中的作用尚不明确 | 研究AIF-1对复发性种植失败患者子宫内膜容受性的影响机制 | 复发性种植失败患者和生育能力正常女性的子宫内膜组织、人子宫内膜基质细胞、子宫内膜基质细胞系、CD-1小鼠 | 生殖医学 | 复发性种植失败 | 单细胞RNA测序、定量PCR、Western blot、免疫组织化学、免疫荧光分析、RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、组织图像数据 | 18例RIF患者、18例对照患者、30例不同月经周期阶段的额外对照患者、CD-1小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2617 | 2025-11-06 |
Identifying candidate genes for spermatogenic failure and predicting ICSI outcomes using single-cell RNA sequencing and protein-protein interaction networks
2025-Nov-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaf186
PMID:41033661
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和蛋白质-蛋白质相互作用网络，通过机器学习框架识别精子发生障碍候选基因并预测ICSI治疗结局 | 首次将单细胞转录组数据与PPI网络结合，利用机器学习算法同时实现基因优先排序和临床结局预测 | 训练数据依赖文献整理和数据库标注，可能存在错误分类或注释偏差；缺乏实验验证；外部队列样本量有限且多样性不足 | 改进精子发生障碍的基因优先排序方法并预测ICSI治疗结局 | 精子发生障碍患者（包括无精子症、弱精子症、畸形精子症） | 机器学习 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 随机森林, Node2Vec | 单细胞转录组数据, 蛋白质相互作用数据, 临床数据 | 34名精子发生障碍亚型患者 | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 2618 | 2025-11-06 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies Novel Prognostic Signatures in HNSCC Immunotherapy Response
2025-Nov, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70171
PMID:40791099
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析头颈鳞状细胞癌免疫治疗反应，开发预后风险分层模型 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序数据开发LASSO-Cox风险分层模型，识别治疗前后免疫细胞亚群变化 | 样本量较小（仅3例患者），需更大队列验证 | 分析HNSCC免疫微环境变化并建立免疫治疗预后预测模型 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 单细胞转录组学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据 | 3例HNSCC患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2619 | 2025-11-06 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Identifies a Novel OLR1+ SLC7A7+ Liver-Enriched Metastatic Subset With Immunometabolic Rewiring in Pancreatic Cancer
2025-Nov, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71345
PMID:41176774
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析识别胰腺癌肝转移中新型OLR1+SLC7A7+肝脏富集转移亚群及其免疫代谢重编程特征 | 首次发现并表征了胰腺癌肝转移中具有代谢重编程和免疫抑制通路超活化的终末分化恶性细胞亚群LEMS | 需要扩大临床队列和体内模型以全面阐明LEMS与巨噬细胞之间的具体机制相互作用 | 识别驱动PDAC肝转移的关键细胞亚群，阐明其与转移微环境的相互作用，定义肝脏定植的潜在机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)原发肿瘤和肝转移患者的临床样本 | 单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | PDAC原发肿瘤和肝转移患者的临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2620 | 2025-11-06 |
Integrated single-cell transcriptomics and spatial metabolomics unveil cellular differentiation and ginsenosides biosynthesis in Panax root tips
2025-Nov, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf202
PMID:41180020
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和空间代谢组学技术，揭示了人参属植物根尖细胞分化及人参皂苷生物合成的细胞异质性 | 首次在人参属植物中构建单细胞转录图谱，发现新型转录因子调控内皮层木栓化和人参皂苷生物合成，揭示跨物种保守及分化的配体-受体互作模式 | 研究仅聚焦于根尖发育早期阶段，未涵盖完整根系发育过程 | 探究人参属植物根尖细胞分化轨迹及人参皂苷生物合成的细胞特异性机制 | 三种人参属植物（Panax ginseng, Panax quinquefolius, Panax notoginseng）的根尖组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学, 双荧光素酶报告基因检测, 电泳迁移率实验, RNA原位杂交, 质谱成像, LC-MS/MS | NA | 单细胞转录组数据, 空间代谢组数据, 质谱数据 | 三种人参属植物的根尖样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学, 质谱成像 | NA | NA |