单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10572 篇文献，本页显示第 2601 - 2620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2601 | 2026-02-07 |
Accumulation of Lymphoid Progenitors with Defective B Cell Differentiation and of Putative Natural Killer Progenitors in Aging Human Bone Marrow
2025-Oct-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262110467
PMID:41226506
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了人类骨髓中淋巴祖细胞在衰老过程中积累缺陷性B细胞分化和记忆样自然杀伤祖细胞的新特征 | 首次发现衰老人类骨髓中淋巴轨迹下游积累了一个独特细胞群，该群细胞包含B细胞分化标记缺陷的细胞以及具有记忆样自然杀伤祖细胞转录组特征的细胞 | 样本量较小（15名健康受试者），年龄范围较宽（19-74岁），且仅限于骨髓样本分析 | 探究人类骨髓造血干细胞和祖细胞在衰老过程中的变化，特别是淋巴分化轨迹的年龄相关差异 | 人类骨髓中的造血干细胞和祖细胞（HSPCs，CD34阳性） | 单细胞转录组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序，功能转录组分析，发育轨迹研究 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 15名健康人类受试者的骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2602 | 2026-02-07 |
Hypertension-Induced Neurovascular and Cognitive Dysfunction at Single-Cell Resolution
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.14.648770
PMID:41000655
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在高血压小鼠模型中揭示了高血压诱导神经血管和认知功能障碍的早期分子机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示了高血压诱导的早期内皮细胞、中间神经元和少突胶质细胞脆弱性，为神经血管功能障碍和认知障碍提供了分子基础 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；样本时间点有限，未涵盖更长期的动态变化 | 探究高血压如何通过影响脑细胞导致神经血管和认知功能障碍的分子机制 | 高血压小鼠模型（由血管紧张素II诱导）中的新皮质细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 高血压小鼠模型在不同时间点（3天和42天）的新皮质样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2603 | 2026-02-07 |
DNA methylation changes during acute COVID-19 are associated with long-term transcriptional dysregulation in patients' airway epithelial cells
2025-May, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-025-00215-5
PMID:40119174
|
研究论文 | 本研究通过分析COVID-19患者急性期鼻细胞的DNA甲基化组和单细胞RNA测序数据，揭示了与长期转录失调相关的表观遗传变化 | 首次将急性COVID-19期间的DNA甲基化变化与患者气道上皮细胞长达12个月的长期转录失调联系起来，并发现纤毛功能基因的持续抑制与症状相关 | 样本量相对较小（急性期n=19，随访样本更少），且为观察性研究，无法确定甲基化变化与长期症状之间的因果关系 | 探究SARS-CoV-2感染后持续健康影响的分子机制，特别是表观遗传调控在长期转录失调中的作用 | COVID-19患者和对照组的鼻细胞（气道上皮细胞） | 表观遗传学 | COVID-19 | 酶促DNA甲基化组测序，单细胞RNA测序 | NA | DNA甲基化数据，单细胞转录组数据 | 急性期：COVID-19患者19人（其中14人进行scRNA-seq），对照组14人（其中10人进行scRNA-seq）；随访：感染后3个月7人，12个月5人；独立验证队列：感染后6个月15人 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2604 | 2026-02-07 |
FLASH radiation reprograms lipid metabolism and macrophage immunity and sensitizes medulloblastoma to CAR-T cell therapy
2025-Mar, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00905-6
PMID:39910249
|
研究论文 | 本研究揭示了FLASH放疗通过重编程巨噬细胞脂质代谢，逆转髓母细胞瘤的免疫抑制，并增强CAR-T细胞疗法疗效的机制 | 首次阐明FLASH放疗通过抑制脂质氧化酶表达和氧化低密度脂质生成，降低PPARγ活性，从而促进巨噬细胞向促炎表型极化，并增强CAR-T细胞浸润与活化的机制 | 研究基于基因工程小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证；FLASH放疗对肿瘤免疫的影响机制仍需在其他肿瘤类型中进一步探索 | 探究FLASH放疗对肿瘤免疫微环境的影响及其与CAR-T细胞疗法联合治疗的潜力 | 髓母细胞瘤的基因工程小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组分析 | 基因工程小鼠模型 | 转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2605 | 2026-02-07 |
Consequences of training data composition for deep learning models in single-cell biology
2025-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.639127
PMID:40060416
|
研究论文 | 本研究系统探讨了训练数据组成对单细胞转录组学深度学习模型行为的影响 | 首次系统研究训练数据组成对单细胞基础模型性能的影响，揭示了模型泛化能力与数据多样性的关系 | 研究主要聚焦于人类造血系统，结论在其他生物系统或疾病中的普适性有待验证 | 探究训练数据组成如何影响单细胞转录组学深度学习模型的性能 | 人类造血系统的单细胞转录组数据 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | 深度学习模型 | 单细胞转录组数据 | 包含成体和发育组织、疾病状态及扰动图谱的多种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2606 | 2026-02-07 |
Single-cell transcriptomics of X-ray irradiated Drosophila wing discs reveals heterogeneity related to cell-cycle status and cell location
2025-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627868
PMID:39990483
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析了X射线辐射对果蝇翅盘的影响，揭示了基于细胞周期状态和细胞位置的异质性 | 首次在果蝇翅盘中应用单细胞RNA测序研究X射线辐射效应，并采用Herfindahl-Hirschman Index量化基因表达异质性，发现辐射响应在区域间和区域内均存在非均匀性 | 研究仅聚焦于果蝇翅盘这一相对简单的组织，可能无法完全代表更复杂组织或哺乳动物系统的辐射响应 | 探究X射线辐射对组织细胞异质性的影响，特别是基因表达在空间和功能上的差异 | 果蝇翅盘中的上皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及果蝇翅盘细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2607 | 2026-02-07 |
Dissecting the immune evasion and therapeutic resistance mechanisms in EGFR/TP53 co-mutated non-small cell lung cancer: implications for targeted and immunotherapy strategies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1652213
PMID:40948762
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了EGFR/TP53共突变非小细胞肺癌中促进免疫逃逸和治疗抵抗的协调转录网络 | 首次在单细胞水平上解析了EGFR/TP53共突变NSCLC的免疫微环境，并发现了由STAT1/ETS1转录程序调控的关键免疫抑制和耐药基因网络 | 样本量较小（仅4个样本用于单细胞分析），需要在更大的患者队列和功能研究中进一步验证 | 探究EGFR/TP53共突变非小细胞肺癌中导致侵袭性亚型和治疗抵抗的分子机制 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，靶向二代测序 | NA | RNA测序数据 | 40例NSCLC患者样本（其中4例用于单细胞分析） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Genomics平台 | NA |
| 2608 | 2026-02-07 |
Spatial regulation of ribosomal protein gene expression revealed by spatial transcriptomic analysis in the water fern Ceratopteris richardii
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1728120
PMID:41635689
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析水蕨Ceratopteris richardii的孢子体发育，揭示了核糖体蛋白基因在组织间的空间表达调控 | 首次在水蕨中应用空间转录组学技术，并发现核糖体相关功能在几乎所有组织域中普遍富集，且核糖体蛋白基因及其旁系同源物在不同组织间存在差异表达模式 | 研究仅针对水蕨一种植物，且未深入探讨核糖体蛋白基因差异表达的具体功能机制 | 阐明植物发育过程中基因表达的空间调控机制 | 水蕨Ceratopteris richardii的孢子体发育组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2609 | 2026-02-07 |
Comprehensive analysis of IGFL1 in colorectal cancer and its promotion of tumour progression via inhibition of lipophagy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1719525
PMID:41635856
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，揭示了IGFL1在结直肠癌中的表达上调及其通过抑制脂噬促进肿瘤进展的机制 | 首次全面阐明IGFL1在结直肠癌中的致癌作用，并发现其通过抑制脂噬这一新机制促进肿瘤进展 | 研究主要基于细胞系实验和公共数据库分析，缺乏体内动物模型验证和更大规模的临床队列验证 | 阐明IGFL1在结直肠癌中的功能作用及其分子机制 | 结直肠癌组织样本、TCGA和GEO数据库数据、结直肠癌细胞系SW620和HCT116 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA测序、免疫组化、单细胞RNA测序、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库中的结直肠癌样本、临床组织样本、SW620和HCT116细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2610 | 2026-02-06 |
Single-Cell Transcriptome-Wide Mendelian Randomization and Colocalization Analyses Uncover Cell-Specific Mechanisms in Epigenetic Age Acceleration
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503032R
PMID:41378907
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞表达数量性状位点数据，结合孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析，揭示了免疫细胞特异性基因表达对四种主要表观遗传时钟的因果影响 | 首次在单细胞分辨率下，结合孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析，系统性地识别了影响表观遗传年龄加速的细胞特异性因果基因 | 研究主要聚焦于14种免疫细胞类型，可能未涵盖其他细胞类型对表观遗传年龄的影响 | 阐明表观遗传年龄加速背后的细胞特异性基因调控机制 | 14种免疫细胞类型中的基因表达与四种表观遗传时钟（IEAA, HannumAge, GrimAge, PhenoAge）的关联 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞表达数量性状位点分析, 孟德尔随机化, 贝叶斯共定位, 表型全基因组关联研究 | 孟德尔随机化模型, 贝叶斯共定位模型 | 单细胞RNA-seq数据, 表观遗传时钟数据, 全基因组关联研究数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2611 | 2026-02-06 |
Proton-Pump Inhibitor Use and Gastrointestinal Disease Risk: A Mendelian Randomization Study of Omics and Pharmacological Pathways
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503152R
PMID:41420535
|
研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化和多组学方法，系统评估了质子泵抑制剂（PPI）相关基因与24种胃肠道疾病风险的关联 | 首次整合PPI的直接作用靶点基因及其药代动力学相关基因，结合多祖先队列、单细胞测序和荟萃分析，揭示了PPI药理作用的组织特异性及其在胃肠道疾病中的双重（治疗/致癌）潜力 | 需要进一步研究PPI与良性胃肠道疾病的关系，且部分发现需在更多人群中验证 | 阐明质子泵抑制剂（PPI）使用与胃肠道疾病风险的潜在因果关系及分子机制 | 与PPI直接靶点、代谢和转运相关的基因，以及24种胃肠道疾病 | 生物信息学与多组学整合分析 | 胃肠道疾病（包括肝癌、胰腺癌、食管癌、结直肠癌、急慢性胰腺炎等） | 孟德尔随机化（两样本）、共定位分析、SMR分析、荟萃分析、单细胞测序、组织表达谱分析 | 孟德尔随机化模型、荟萃分析模型 | 基因组数据、表达数量性状位点（eQTL）数据、单细胞RNA测序数据、疾病关联统计数据 | 多祖先队列（UK Biobank 和 FinnGen） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2612 | 2026-02-06 |
Single-Cell Multi-Omics Reveals B2M-Mediated Myeloid Reprogramming and Constructs a Predictive Model for Early Hepatocellular Carcinoma Recurrence
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503144R
PMID:41427790
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了B2M介导的髓系重编程，并构建了早期肝细胞癌复发的预测模型 | 首次在单细胞分辨率下整合多组学数据探索早期HCC复发的分子机制，并识别出B2M相关的髓系细胞重编程作为关键驱动因素 | 预测模型的AUC仅大于0.65，性能中等，且研究样本量可能有限 | 探索早期肝细胞癌复发的分子机制并开发预测工具 | 肝细胞癌患者肿瘤组织及免疫微环境 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 转录组学 | LASSO回归模型 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据, 转录组数据, 临床特征数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 2613 | 2026-02-06 |
Pan cohort immune biomarker of CD8 lymphocyte activation enabling HGSOC outcome prediction and treatment response
2025-Dec-31, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04363-5
PMID:41474480
|
研究论文 | 本研究开发了一个与CD8⁺ T细胞激活相关的免疫预后特征（CIPS），用于预测晚期高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）患者的生存结局和治疗反应 | 通过整合机器学习方法，从多队列数据中识别出10个基因的CD8⁺ T细胞激活特征，该特征在预测生存和免疫治疗反应方面优于现有模型 | 研究主要基于转录组数据，未涉及蛋白质水平验证；样本来源为回顾性队列，需要前瞻性研究进一步验证 | 开发一个稳健的与CD8⁺ T细胞激活相关的生物标志物，以改善晚期HGSOC的预后预测和临床管理 | 晚期高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）患者 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单样本基因集富集分析，加权基因共表达网络分析，单细胞RNA-seq分析 | 机器学习整合方法 | 转录组数据，临床数据 | 874名晚期HGSOC患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2614 | 2026-02-06 |
Integrating multi-omics data and machine learning to identify endocrine disrupting chemicals targeting key ccRCC-related genes
2025-Dec-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04138-y
PMID:41467947
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法，识别了靶向关键ccRCC相关基因的内分泌干扰化学物及其相关基因 | 首次整合多组学数据与机器学习，系统识别与ccRCC相关的EDCs及其靶基因，并揭示了它们在肿瘤微环境中的相互作用 | 研究基于计算模型和现有数据集，需要实验验证EDCs与ccRCC之间的直接因果关系 | 识别与ccRCC发病机制相关的内分泌干扰化学物及其靶基因 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）及相关内分泌干扰化学物 | 机器学习 | 肾细胞癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | 机器学习算法（共评估101种） | RNA测序数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2615 | 2026-02-06 |
Machine learning-enabled spatial multi-omics uncovers lactate-driven targets and tumor microenvironmental reprogramming in cancer
2025-Dec-30, NPJ digital medicine
IF:12.4Q1
DOI:10.1038/s41746-025-02286-7
PMID:41469480
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、空间转录组学、空间代谢组学、免疫荧光及TCGA生存数据，结合机器学习模型，揭示了乳酸在肺腺癌微环境中的空间分布、细胞类型特异性效应及其对血管生成、免疫抑制和预后分层的调控作用 | 首次将空间代谢组学与单细胞/空间转录组学、机器学习模型整合，系统解析了乳酸在肿瘤微环境中的空间分布模式及其细胞类型特异性调控网络，并建立了乳酸驱动型内皮细胞/成纤维细胞程序与临床预后的强关联 | 研究主要聚焦于肺腺癌，结论在其他癌种中的普适性需进一步验证；空间代谢组学的分辨率仍有提升空间；机器学习模型的生物学可解释性可进一步深化 | 揭示乳酸在肿瘤代谢重编程中的空间分布规律、细胞类型特异性效应及其对肿瘤微环境重塑和临床预后的影响机制 | 肺腺癌（LUAD）组织样本及其单细胞、空间多组学数据，TCGA临床生存数据 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组学、空间代谢组学、免疫荧光、生存分析 | 随机森林、弹性网络回归、SVM、ANN、决策树 | 转录组数据、代谢组数据、空间成像数据、临床生存数据 | 未明确具体样本数量（涉及TCGA队列及空间多组学样本） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 2616 | 2026-02-06 |
Directed and efficient generation of calretinin interneurons from human pluripotent stem cells
2025-Aug-27, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04603-z
PMID:40867008
|
研究论文 | 本研究建立了一种从人多能干细胞高效生成钙视网膜蛋白中间神经元的方法 | 开发了一种高效（约80%产率）的定向分化方案，首次实现了从人多能干细胞大规模生成钙视网膜蛋白中间神经元 | 研究主要基于体外分化和小鼠移植模型，尚未在更复杂的人体环境或疾病模型中验证其长期功能和整合效果 | 建立高效生成钙视网膜蛋白中间神经元的方案，以促进对其发育和功能的研究，并为再生医学、疾病建模和药物筛选提供工具 | 人多能干细胞（hPSCs）及其分化的神经上皮干细胞（NESCs）和钙视网膜蛋白中间神经元 | 再生医学与干细胞生物学 | 精神分裂症、自闭症、癫痫 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、细胞移植 | NA | 基因表达数据（转录组）、电生理数据 | 未明确具体样本数量，涉及人多能干细胞来源的细胞群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2617 | 2026-02-06 |
Integration of phospho-signaling and transcriptomics in single cells reveals distinct Th17 cell fates
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116006
PMID:40674215
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Vivo-seq的创新平台，该平台整合了单细胞RNA测序和细胞内转录组及表位测序，以同时捕获单细胞中的转录和磷酸化信号状态 | 开发了Vivo-seq平台，首次在单细胞水平上同时捕获转录和磷酸化信号信息，揭示了Th17细胞分化中的关键信号通路和功能可塑性 | 未明确提及样本量或实验重复次数，可能限制统计效力；技术依赖于特定固定剂，可能影响某些生物分子的检测 | 研究Th17细胞分化过程中的信号网络和细胞状态，以理解其功能可塑性 | T辅助17（Th17）细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），细胞内转录组和表位测序 | NA | 转录组数据，磷酸化信号数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞多组学 | Vivo-seq | Vivo-seq平台，使用深共熔溶剂固定细胞，整合scRNA-seq和细胞内索引测序 |
| 2618 | 2026-02-06 |
A multi-omics approach combining causal inference and in vivo validation identifies key protein drivers of alcohol-associated liver disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1714502
PMID:41497980
|
研究论文 | 本研究通过整合人类遗传学与多组学数据，结合因果推断和体内验证，识别并验证了酒精相关性肝病（ALD）的四个关键因果蛋白驱动因子 | 首次系统性地将孟德尔随机化（MR）因果推断框架与单细胞转录组学和体内小鼠模型验证相结合，以区分ALD的关联性生物标志物与因果驱动因子，并揭示了由促炎性髓系细胞与稳态肝细胞功能平衡调控的新型致病轴 | 研究主要基于欧洲血统人群的遗传和蛋白质组数据，其发现可能无法直接推广到其他人群；体内验证仅在小鼠模型中进行，需要在人类组织或临床试验中进一步确认 | 旨在揭示酒精相关性肝病（ALD）的分子致病机制，并识别潜在的治疗靶点 | 人类血浆蛋白质组数据、ALD全基因组关联研究（GWAS）数据、小鼠ALD模型的肝组织 | 生物信息学，多组学整合分析 | 酒精相关性肝病 | 孟德尔随机化（MR），单细胞RNA测序（scRNA-seq），功能富集分析，汇总数据孟德尔随机化（SMR） | 因果推断模型（两样本MR），小鼠慢性加暴饮乙醇喂养模型 | 蛋白质组数据，遗传关联数据，单细胞转录组数据 | 大规模血浆蛋白质组和ALD GWAS数据（具体样本数未在摘要中提供），以及小鼠模型数据 | NA | 血浆蛋白质组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2619 | 2026-02-06 |
A multi-omics features-based approach integrating immunogenicity and inflammation enhances immunotherapy benefit in clear cell renal cell carcinoma
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1596719
PMID:41640425
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于炎症和免疫特征的多组学机器学习模型，用于预测透明细胞肾细胞癌患者对免疫检查点阻断治疗的响应和生存 | 整合炎症和免疫特征的多组学机器学习模型，相比单一生物标志物（如PD-L1表达、TMB）展现出更优的预测能力，并能将患者分为具有不同治疗响应和预后的亚型 | NA | 预测透明细胞肾细胞癌患者对免疫检查点阻断治疗的响应和生存，以指导精准免疫治疗 | 透明细胞肾细胞癌患者 | 机器学习 | 肾细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 机器学习模型 | 基因组和转录组数据 | 超过1900名自身免疫性肾病患者和超过1000名接受ICB治疗的ccRCC患者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2620 | 2026-02-06 |
Mechanistic insights into Shenqi Dihuang decoction in the treatment of immunoglobulin a nephropathy
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1714263
PMID:41640677
|
研究论文 | 本研究通过网络药理学、机器学习、单细胞RNA测序和体外实验，探讨了参芪地黄汤治疗IgA肾病的潜在分子机制 | 首次通过整合多组学数据和机器学习方法，系统性地揭示了参芪地黄汤治疗IgA肾病的关键靶点FOS、MCL1和CCND1，并构建了相关的分子调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏动物模型或临床试验的验证 | 探索参芪地黄汤治疗IgA肾病的分子作用机制 | IgA肾病（免疫球蛋白A肾病）患者数据及体外细胞模型 | 生物信息学 | 肾病 | 单细胞RNA测序，分子对接，基因集富集分析，免疫细胞浸润分析 | 机器学习特征选择，列线图 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |