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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2581 | 2025-11-07 |
HMGB3 promotes brain metastasis of lung adenocarcinoma by recruiting SSBP1 for nuclear translocation to remodel mitochondrial metabolism
2025-Nov-05, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.70075
PMID:41194553
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研究论文 | 本研究揭示了HMGB3通过招募SSBP1进行核转位重塑线粒体代谢,从而促进肺腺癌脑转移的分子机制 | 首次发现HMGB3通过招募SSBP1诱导其核转位,重编程线粒体代谢,激活PI3K-Akt信号通路促进肺腺癌脑转移的新机制 | 研究主要基于细胞模型和回顾性队列,需要更多前瞻性临床研究验证 | 探究HMGB3在调控肿瘤细胞代谢促进肺腺癌脑转移中的作用 | 肺腺癌细胞、临床肺腺癌患者组织样本 | 癌症生物学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 免疫共沉淀, 质谱分析, Western blotting, 功能获得与缺失实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据, 临床病理数据 | 两个回顾性队列:原发性肺腺癌队列和肺腺癌脑转移队列 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2582 | 2025-11-07 |
A Single-cell and Spatially Resolved Cell Atlas of Human Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2025-Nov-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf095
PMID:41191515
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、空间转录组学和代谢组学技术构建了人类食管鳞状细胞癌的单细胞和空间分辨率细胞图谱 | 首次系统揭示了COL17A1+上皮细胞和POSTN+成纤维细胞亚群在肿瘤免疫抑制微环境中的关键作用及其相互作用机制 | NA | 阐明食管鳞状细胞癌免疫抑制微环境的分子特征和机制 | 人类食管鳞状细胞癌及匹配的非肿瘤组织 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,代谢组学 | NA | 单细胞RNA序列数据,空间转录组数据,代谢组数据 | 一系列人类食管鳞状细胞癌及匹配非肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2583 | 2025-11-07 |
Adipocyte death promotes hepatic infiltration of S100A8+ macrophages and steatotic liver disease progression in mice
2025-Nov-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI190635
PMID:41178716
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研究论文 | 本研究揭示脂肪细胞死亡通过诱导S100A8+巨噬细胞肝脏浸润促进肝细胞脂质积累和代谢功能障碍相关脂肪性肝病进展的机制 | 首次发现脂肪细胞死亡通过S100A8+巨噬细胞-CCN3-CD36轴驱动肝脏脂肪变性的新机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究脂肪细胞死亡如何促进肝脏脂肪积累和MASLD进展 | 基因修饰小鼠模型 | 分子生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | bulk RNA-Seq, single-cell RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2584 | 2025-11-07 |
Elucidating the role of SIRT2 in hepatocellular carcinoma through multi-omics and deep learning
2025-Nov-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03879-0
PMID:41182638
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和深度学习探讨SIRT2在肝细胞癌中的作用机制 | 首次结合铜死亡机制、单细胞测序、空间转录组和深度学习生存神经网络构建肝细胞癌预后模型 | 未明确说明样本量大小,机制研究仍需实验验证 | 阐明SIRT2在肝细胞癌发生发展中的作用机制 | 肝细胞癌组织样本和相关的基因表达数据 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, RNA测序, 深度学习 | DeepSurv神经网络 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2585 | 2025-11-07 |
Loss of 18q Alters TGFβ Signalling Affecting Anteroposterior Neuroectodermal Fate in Human Embryonic Stem Cells
2025-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13813
PMID:39908990
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研究论文 | 本研究探讨了18q染色体缺失如何通过改变TGFβ信号通路影响人胚胎干细胞中前后神经外胚层命运决定 | 首次揭示了18q缺失通过干扰TGFβ信号通路导致前后神经外胚层命运决定失衡的具体机制 | 研究仅针对体外培养的干细胞模型,未验证在体内环境中的表现 | 探究染色体异常对人多能干细胞分化潜能的影响机制 | 人胚胎干细胞(hESCs)及其分化产物 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,基因表达时序分析 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 具有复杂核型的人胚胎干细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2586 | 2025-11-07 |
Long-read RNA sequencing of transposable elements from single cells using CELLO-seq
2025-Nov, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01203-2
PMID:40670609
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研究论文 | 开发了一种名为CELLO-seq的单细胞长读长RNA测序协议,用于精确映射转座元件的表达 | 通过整合50个核苷酸的独特分子标识符和高PCR重复数,实现了长读长的错误校正,能够将表达数据高保真地映射到高度序列相似的年轻转座元件 | 需要用户具备分子生物学和转录组分析经验 | 开发能够精确映射转座元件表达的单细胞测序方法 | 哺乳动物转座元件 | 单细胞测序 | NA | 长读长RNA测序,单细胞测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | CELLO-seq | 整合50个核苷酸独特分子标识符和高PCR重复数的单细胞长读长RNA测序协议 |
| 2587 | 2025-11-07 |
Retrospective transcriptomic analysis indicates temporal dysregulation of mitochondrial genes and metabolic pathways after volumetric muscle loss injury
2025-Nov, Physiological reports
IF:2.2Q3
DOI:10.14814/phy2.70612
PMID:41178047
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研究论文 | 通过回顾性转录组分析研究体积性肌肉损失损伤后线粒体基因和代谢通路的时序性失调 | 首次利用现有RNA-seq数据集系统分析VML损伤后不同时间点的线粒体基因表达和代谢通路变化 | 研究为回顾性分析,依赖公开数据集,缺乏实验验证 | 探究体积性肌肉损失损伤后线粒体和代谢转录组的变化规律 | 大鼠和小鼠的肌肉组织 | 转录组学 | 肌肉损伤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因集富集分析 | NA | 转录组数据 | 包含bulk RNA-seq数据集(大鼠)和单细胞RNA-seq数据集(小鼠) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2588 | 2025-11-07 |
Exploring the Therapeutic Potential of MIR-140-3p in Osteoarthritis: Targeting CILP and Ferroptosis for Novel Treatment Strategies
2025-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70018
PMID:40044625
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研究论文 | 本研究探讨miR-140-3p通过靶向CILP调控铁死亡、炎症和氧化应激在骨关节炎中的作用机制 | 首次发现miR-140-3p/CILP轴通过调控铁死亡参与骨关节炎发病机制 | 铁死亡在OA中的具体作用和机制仍需进一步研究 | 探索骨关节炎的新型治疗策略 | C28/I2细胞、miR-140-3p、CILP蛋白、铁死亡相关基因 | 分子生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,hdWGCNA分析,生物信息学分析,qRT-PCR,双荧光素酶实验 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 细胞系研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2589 | 2025-11-07 |
Current trends in single-cell RNA sequencing applications in diabetes mellitus
2025-Nov, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.70061
PMID:40537978
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综述 | 总结单细胞RNA测序技术在糖尿病研究中的最新进展和应用 | 聚焦单细胞RNA测序技术在糖尿病研究中的最新应用趋势 | NA | 探索糖尿病发病机制并寻求新的诊断和治疗方法 | 人类胰岛细胞和免疫细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2590 | 2025-11-07 |
SLGCA: spatial cross-level graph contrastive autoencoder for multislice spatial domain identification and microenvironment exploration
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf574
PMID:41182757
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研究论文 | 提出一种基于跨层级图对比学习的空间转录组数据分析方法SLGCA,用于多切片空间域识别和微环境探索 | 采用双通道学习机制,结合基于空间邻域信息的局部层级对比学习和跨视图的全局信息对比学习 | NA | 提高空间转录组数据中空间域识别的准确性 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌,肝癌 | 空间转录组技术 | 图对比自编码器 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2591 | 2025-11-07 |
Cell Type-Specific Expression of Long Noncoding RNAs in Human Diabetic Kidneys Identifies TARID as a Key Regulator of Podocyte Function
2025-Nov-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0272
PMID:40902080
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研究论文 | 通过单核RNA测序技术识别人类糖尿病肾脏中细胞类型特异性的长链非编码RNA,并发现TARID是调控足细胞功能的关键因子 | 首次在单细胞水平系统研究肾脏中lncRNA的细胞类型特异性表达,并发现TARID在足细胞中的关键功能 | 样本量较小(5名健康个体和6名DKD患者),需要在更大队列中验证发现 | 探索长链非编码RNA在糖尿病肾病中的细胞类型特异性表达和功能 | 人类肾脏样本(健康个体和糖尿病肾病患者) | 单细胞基因组学 | 糖尿病肾病 | 单核RNA测序,eQTL分析,GWAS,基因调控网络分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 11个肾脏样本(5健康+6糖尿病肾病) | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 2592 | 2025-11-07 |
The transcription factor LbYABBY1 of Limonium bicolor raises salt sensitivity by repressing the LbSAD2 pathway
2025-Nov, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70560
PMID:41196280
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研究论文 | 本研究揭示了二色补血草转录因子LbYABBY1通过抑制LbSAD2通路负调控盐腺发育和盐敏感性的分子机制 | 首次发现LbYABBY1转录因子通过与LbKNAT7互作增强对LbSAD2的转录抑制,从而负调控盐腺发育 | NA | 探究LbYABBY1转录因子在盐腺发育和盐敏感性调控中的功能 | 二色补血草(Limonium bicolor)和拟南芥(Arabidopsis thaliana) | 植物分子生物学 | NA | RNA原位杂交, 启动子驱动GUS组织染色, 酵母双杂交, 分裂荧光素酶互补, GST pull-down | NA | 基因表达数据, 蛋白互作数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2593 | 2025-11-07 |
Extracellular cyclophilin a binding to CD146 is critical for Th17 cell differentiation in rheumatoid arthritis
2025-Oct-24, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.10.047
PMID:41137392
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研究论文 | 本研究揭示了细胞外亲环素A通过结合CD146受体促进Th17细胞分化在类风湿关节炎发病机制中的关键作用 | 首次发现细胞外亲环素A与CD146结合通过促进CD146二聚化驱动STAT3介导的Th17细胞分化,并证明抗CypA单抗治疗效果优于抗TNF-α疗法 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类临床试验中验证 | 探索类风湿关节炎发病的新机制并寻找新的治疗靶点 | 类风湿关节炎患者样本、胶原诱导性和胶原抗体诱导性关节炎小鼠模型、CD4 T细胞 | 免疫学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、条件性基因敲除、单克隆抗体治疗 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、临床数据 | 类风湿关节炎患者和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2594 | 2025-11-07 |
Limited nasal IFN production contributes to delayed respiratory virus clearance and suboptimal vaccine responses
2025-Oct-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182836
PMID:40956633
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研究论文 | 本研究揭示了鼻部干扰素产生受限导致呼吸道病毒清除延迟和疫苗应答不佳的机制 | 发现鼻部免疫环境处于静息状态,干扰素产生受限是病毒清除延迟的关键因素,并通过干扰素佐剂成功改善疫苗应答 | 主要使用小鼠模型,人类数据验证有限 | 探究鼻部免疫应答特征及其对呼吸道病毒清除和疫苗效果的影响 | 人类偏肺病毒(HMPV)感染的小鼠模型和COVID-19患者 | 免疫学 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2595 | 2025-11-07 |
Improving immunotherapy responses by dual inhibition of macrophage migration inhibitory factor and PD-1
2025-Oct-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191539
PMID:41122966
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研究论文 | 本研究探讨了联合抑制巨噬细胞移动抑制因子(MIF)和PD-1在两种小鼠肿瘤模型中的免疫治疗效果 | 首次证明抗MIF疗法可增强抗PD-1免疫检查点抑制剂的抗肿瘤效果,并发现Cd74/C1q/Aif1表达巨噬细胞的抗肿瘤表型 | 研究仅限于小鼠模型,临床转化需要进一步验证 | 评估抗MIF疗法与抗PD-1联合使用的抗肿瘤疗效 | YUMMER1.7黑色素瘤和MC38结直肠癌小鼠模型,以及人类黑色素瘤患者 | 免疫肿瘤学 | 黑色素瘤,结直肠癌 | scRNA-Seq,流式细胞术,免疫组织化学,细胞因子分析 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据,临床数据 | 多种基因型小鼠模型和人类患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2596 | 2025-11-07 |
Unraveling enteroendocrine cell lineage dynamics and associated gene regulatory networks during intestinal development
2025-Oct-15, Biology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1242/bio.062083
PMID:41117135
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研究论文 | 本研究通过小鼠胚胎和人类多能干细胞来源的肠道类器官模型,结合单细胞转录组学,揭示了肠道内分泌细胞在发育过程中的谱系动态和基因调控网络 | 首次系统性地揭示了发育过程中肠道内分泌细胞亚型特化的机制,发现其独立于完整的隐窝-绒毛结构和饮食/微生物刺激 | 研究主要基于模型系统,需要进一步在体内验证;某些EEC亚型的出现机制仍需深入探索 | 阐明肠道内分泌细胞在发育过程中的谱系动态和分化机制 | 小鼠胚胎、人类多能干细胞来源的肠道类器官 | 单细胞生物学 | 肠道发育疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠胚胎和人类肠道类器官样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2597 | 2025-11-07 |
Uncovering Cellular Interactome Drivers of Immune Checkpoint Inhibitor Response in Advanced Melanoma Patients
2025-Oct, Cellular and molecular bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s12195-025-00857-y
PMID:41185627
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据构建细胞相互作用网络,识别与免疫检查点抑制剂治疗反应相关的网络模式 | 首次将肿瘤微环境中的细胞间相互作用建模为加权有向网络,并识别与治疗反应相关的网络模式 | 依赖于公开可用的单细胞RNA测序数据,样本量有限 | 识别与免疫检查点抑制剂治疗反应相关的细胞相互作用网络驱动因素 | 晚期黑色素瘤患者 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 多元统计学习方法 | 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 | 多个黑色素瘤患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2598 | 2025-11-07 |
CCDC137 knockdown suppresses bladder cancer progression by downregulating SCD
2025-Sep-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07033-w
PMID:40993629
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证揭示了CCDC137在膀胱癌中的促癌作用及其通过调控SCD影响肿瘤进展的机制 | 首次系统表征CCDC137在膀胱癌中的表达模式和功能,发现其通过调控脂代谢酶SCD影响肿瘤进展 | 未明确CCDC137调控SCD的具体分子机制,缺乏临床前药物开发验证 | 探究CCDC家族基因在膀胱癌中的临床意义和功能机制 | 膀胱癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 机器学习算法、RNA测序、定量RT-PCR、蛋白质印迹 | 预后模型 | 多组学数据、单细胞测序、空间转录组 | TCGA-BLCA队列及组织微阵列样本 | NA | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2599 | 2025-11-07 |
PLIN2 promotes colorectal cancer progression through CD36-mediated epithelial-mesenchymal transition
2025-Jul-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07836-1
PMID:40640171
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研究论文 | 本研究揭示了PLIN2通过稳定CD36蛋白表达促进结直肠癌上皮-间质转化和肿瘤进展的分子机制 | 首次发现PLIN2通过抑制CD36蛋白的蛋白酶体降解途径稳定其表达,进而促进EMT过程和结直肠癌进展 | NA | 构建可靠的预后预测模型并阐明结直肠癌进展的关键分子机制 | 结直肠癌细胞、临床标本、组织芯片 | 生物信息学 | 结直肠癌 | WGCNA、单细胞RNA测序、空间转录组、免疫沉淀、免疫荧光 | LASSO回归、Cox回归、Kaplan-Meier生存分析 | 基因表达谱、临床数据 | 120个免疫细胞表达谱及临床标本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 2600 | 2025-11-07 |
Identification of Seven in absentia homolog 2 as a potential efferocytosis-related biomarker in diabetic foot ulcers
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0334163
PMID:41183121
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研究论文 | 本研究鉴定SIAH2作为糖尿病足溃疡中胞葬作用相关的潜在生物标志物,并探讨其在伤口愈合中的作用机制 | 首次发现SIAH2在糖尿病足溃疡中与胞葬作用相关,并揭示其通过调控角质形成细胞迁移、血管生成和细胞间通讯参与伤口愈合过程 | 样本量较小(仅20例患者),缺乏更大规模的验证研究 | 探究糖尿病足溃疡伤口愈合机制,寻找与胞葬作用相关的生物标志物 | II型糖尿病患者的血液和皮肤样本 | 生物医学研究 | 糖尿病足溃疡 | RNA-seq, 单细胞测序, 生物信息学分析, 体外实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 临床数据 | 20例II型糖尿病患者 | NA | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | NA |