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当前共找到 10542 篇文献,本页显示第 241 - 260 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
241 2026-06-18
Stem cell fate decisions: Substates and attractors
2025-06-10, Stem cell reports IF:5.9Q2
综述 本文回顾了人类多能干细胞占据不同亚稳态亚状态对其分化结果影响的研究,并基于荧光标记动力学模型提出亚状态转换可能受确定性混沌和随机波动共同调控 提出亚状态转换可能受确定性混沌和随机波动共同驱动的新模型,超越了传统仅考虑随机性的观点 未明确说明具体局限性,但模型基于荧光标记分布序列,可能受限于实验观测的时空分辨率 理解干细胞命运决定中基因表达异质性的机制 人类多能干细胞及其亚稳态亚状态 机器学习 NA 单细胞转录组学 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
242 2026-06-18
Identification and Validation of Potential Immune-Related Genes for Endometriosis
2025-05, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
研究论文 通过生物信息学分析和免疫组化验证,识别并验证子宫内膜异位症中的潜在免疫相关基因 综合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,结合机器学习算法,首次识别出TGFBR1和GIMAP4分别为在位和异位子宫内膜的特征免疫基因 研究主要基于公共数据库数据,样本量有限,且免疫组化验证仅针对两个基因,可能需要更多临床样本和功能实验进一步验证 识别并验证子宫内膜异位症中潜在的免疫相关基因 子宫内膜异位症患者的在位内膜和异位内膜组织样本 机器学习 子宫内膜异位症 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫组化 机器学习模型(未具体说明类型) 基因表达数据 未明确说明样本数量,使用了GEO数据库中的公共数据 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
243 2026-06-18
Single-cell transcriptomics reveals the immune mechanisms by which tonsillectomy improves clinical outcomes of recurrent Immuoglobulin A nephropathy after kidney transplant
2025-04, Molecular immunology IF:3.2Q3
研究论文 通过单细胞转录组学揭示扁桃体切除改善肾移植后复发性IgA肾病患者临床结局的免疫机制 首次利用单细胞mRNA测序和流式细胞术,系统分析了扁桃体组织及外周血单核细胞在扁桃体切除治疗复发性IgA肾病中的细胞类型和基因表达变化,发现了TCL1A和PI3k-Akt通路在B细胞介导的免疫调节中的关键作用 样本量较小,仅包含29例患者、1份扁桃体组织和3份PBMC样本,可能限制结论的普适性;且未包含未接受扁桃体切除的对照患者,难以完全排除其他因素对结果的影响 探究扁桃体切除在治疗肾移植后复发性IgA肾病中的细胞和分子机制,尤其是B细胞相关的免疫调节作用 复发性IgA肾病患者的扁桃体组织及外周血单核细胞 数字病理学 IgA肾病 单细胞mRNA测序,流式细胞术 NA 单细胞转录组数据,流式细胞术数据 29例复发性IgA肾病患者,包括1份扁桃体组织和3份PBMC样本 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞mRNA测序采用10x Genomics平台?但文中未明确提及,仅说明单细胞mRNA测序,因此输出NA
244 2026-06-18
Leveraging programmed cell death patterns to predict prognosis and therapeutic sensitivity in OSCC
2025-02, Oral diseases IF:2.9Q1
研究论文 整合12种程序性细胞死亡模式构建细胞死亡指数,用于口腔鳞状细胞癌的预后和治疗预测 首次整合12种程序性细胞死亡模式构建新型生物标志物细胞死亡指数,用于口腔鳞状细胞癌的预后和治疗反应预测 未明确提及局限性 构建基于程序性细胞死亡模式的新型生物标志物,预测口腔鳞状细胞癌预后和治疗敏感性 口腔鳞状细胞癌患者样本及单细胞RNA测序数据 计算机视觉 口腔鳞状细胞癌 单细胞RNA-seq LASSO回归 转录组数据 多个独立患者队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
245 2026-06-18
Development of a ferroptosis-related gene prognostic model and molecular subgroups characterization in sepsis
2025-02, Molecular immunology IF:3.2Q3
研究论文 开发基于铁死亡相关基因的脓毒症预后模型并识别分子亚型 首次基于铁死亡相关基因构建脓毒症预后评分模型,并通过单细胞测序揭示该特征在不同细胞亚群中的分布,同时鉴定TFRC为抑制铁死亡的关键调控因子 未提及外部验证数据集或更大样本量的多中心验证,潜在偏倚可能影响模型普适性 探索铁死亡相关基因在脓毒症预后预测中的作用并构建预后模型 脓毒症患者样本及基因表达数据 机器学习 脓毒症 RNA-seq, 单细胞测序, siRNA转染, 丙二醛检测, 蛋白质印迹, 活性氧检测 Cox回归, LASSO分析, 列线图模型 基因表达数据, 单细胞测序数据 GSE65682数据集(具体样本数未在摘要中说明) NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
246 2026-06-18
Convergent and divergent immune aberrations in COVID-19, post-COVID-19-interstitial lung disease, and idiopathic pulmonary fibrosis
2025-01-01, American journal of physiology. Cell physiology
研究论文 研究COVID-19、COVID-19后间质性肺病和特发性肺纤维化中循环免疫细胞的转录和表型变化 首次揭示50基因特征在COVID-19和IPF中的风险预测作用,并阐明单核细胞与T细胞亚群之间的基因组失衡是疾病预后的关键 未明确提及研究局限性,但样本量相对较小(227例)且需进一步验证机制的因果关系 探讨COVID-19、COVID-19后间质性肺病和特发性肺纤维化中免疫异常的共同与差异特征 COVID-19患者、COVID-19后间质性肺病患者、特发性肺纤维化患者及健康对照者的外周血免疫细胞 数字病理学 COVID-19, 特发性肺纤维化 RNA-seq, 单细胞RNA测序, Luminex NA 基因表达数据, 蛋白质组数据 227例(包括COVID-19、COVID-19后间质性肺病、特发性肺纤维化及对照组) Nanostring, 10x Genomics 基因表达谱分析, 单细胞RNA-seq nCounter, 10x Chromium nCounter基因表达分析系统, 10x Genomics单细胞RNA测序平台
247 2026-06-18
Potential function exploration of lncRNAs in idiopathic pulmonary fibrosis: insights from whole transcriptome sequencing data analysis
2025 Jan-Dec, Clinics (Sao Paulo, Brazil)
研究论文 通过全转录组测序数据分析,探索长链非编码RNA在特发性肺纤维化中的潜在功能 首次利用整合RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,系统分析特发性肺纤维化中长链非编码RNA的差异表达及其共表达网络,并鉴定出六个关键长链非编码RNA作为潜在生物标志物 样本量较小(12名特发性肺纤维化患者和5名对照),且功能验证不足,需进一步实验确认长链非编码RNA的机制作用 阐明长链非编码RNA在特发性肺纤维化中的表达模式和功能作用,并评估其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 特发性肺纤维化患者和健康对照的肺组织样本 机器学习和生物信息学 特发性肺纤维化 RNA测序,单细胞RNA测序 加权基因共表达网络分析 转录组测序数据 12名特发性肺纤维化患者和5名对照者的肺组织样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
248 2026-06-17
Optimized protocol for processing murine tumor-bearing lung tissue for flow cytometry and single cell RNA-sequencing
2025-Dec-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种从荷瘤小鼠肺组织中处理样本用于流式细胞术和单细胞RNA测序的优化流程 针对纤维化和异质性强的荷瘤肺组织,开发了减少处理应激并获取>85%活细胞的详细分步操作方案 未明确说明局限,但可能包括对特定小鼠模型(Kras; tdTomato)的依赖和需验证的通用性 优化从健康及荷瘤小鼠肺组织中分离高质量单细胞悬液的方法 Kras; tdTomato报告基因小鼠的荷瘤肺组织 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量,涉及健康及荷瘤小鼠肺组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
249 2026-06-17
Developmental and transcriptional programs that define the initiation of the forelimb
2025-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过测序技术定义了小鼠前肢起始的四个不同阶段,识别了前肢特异性转录的基因特征并揭示了TBX5的早期转录靶点 首次利用高通量测序方法系统解析前肢起始的时序转录程序,发现神经投射和细胞粘附相关基因作为TBX5候选早期靶点的全新机制模型 未知(摘要未提供) 阐明脊椎动物前肢起始的分子机制和转录程序 小鼠胚胎的体壁侧板中胚层细胞 NA NA RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq, Ribo-ITP NA 转录组数据, 表观基因组数据 小鼠胚胎样本(未提供具体数量) NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ChIP-seq, 核糖体分析 NA NA
250 2026-06-17
Multi-site Assessment of Methods for Cell Preservation Upstream of Single Cell RNA Sequencing
2025-Oct-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 评估三种细胞保存方法在单细胞RNA测序中的性能和可重复性 首次跨平台、多站点比较10x Genomics FLEX、Parse Bioscience Evercode WT v2和Honeycomb Bio HIVE三种细胞保存方法在单细胞RNA测序中的表现,并证明保存方法能更好地保留脆弱粒细胞群体 检测的基因子集存在平台特异性差异,且研究仅针对同一位健康个体的白细胞,样本多样性有限 评估三种商业细胞保存平台在单细胞RNA测序中的性能和可重复性,为科研人员选择最佳保存工作流程提供参考 来自一位健康个体的总白细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、流式细胞术数据 1位健康个体的白细胞样本 10x Genomics, Parse Biosciences, Honeycomb Bio 单细胞RNA测序 10x Genomics FLEX, Parse Bioscience Evercode WT v2, Honeycomb Bio HIVE 10x Genomics FLEX固定保存法,Parse Bioscience Evercode WT v2固定保存法,Honeycomb Bio HIVE冷冻保存法
251 2026-06-17
Decoding the human PBMC isonome: Isoform-level resolution with single-cell long-read transcriptomics
2025-Oct-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 使用单细胞长读长转录组学解析人类PBMC异构体组,实现异构体水平分辨率 首次生成最大规模的人类外周血单核细胞(PBMC)长读长单细胞数据集,结合微流控自由PIPseq工作流程和Oxford Nanopore长读长测序,发现128种新型异构体并鉴定细胞类型特异性异构体表达模式 NA 利用单细胞长读长RNA测序在异构体水平研究人类免疫细胞的多样性和功能机制 人类外周血单核细胞(PBMC)中的免疫细胞 数字病理学 NA 单细胞长读长RNA测序(ONT) NA RNA序列数据 人类PBMC样本 Oxford Nanopore Technologies 单细胞RNA-seq Oxford Nanopore测序平台 PIPseq工作流程结合Oxford Nanopore长读长测序
252 2026-06-17
Repopulating Microglia Suppress Peripheral Immune Cell Infiltration to Promote Poststroke Recovery
2025-09, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 采用PLX5622介导的小胶质细胞耗竭再殖模型,发现再殖小胶质细胞通过抑制外周免疫细胞浸润和重塑免疫微环境促进脑卒中后神经功能恢复 首次揭示短暂小胶质细胞耗竭再殖可通过抑制外周T细胞耗竭和中性粒细胞终末分化、促进吞噬型巨噬细胞表型转化来改善卒中后修复 仅在小鼠模型中验证,且PLX5622给药方案(7天给药+7天停药)的时效性和安全性需进一步评估以转化至临床 研究小胶质细胞再殖对脑缺血后免疫微环境重塑及神经功能恢复的影响 小鼠脑缺血模型中小胶质细胞、T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞及血脑屏障 神经免疫学 缺血性脑卒中 单细胞转录组学、流式细胞术、细胞因子阵列、免疫荧光 NA 基因表达数据、细胞表型数据 小鼠脑组织样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
253 2026-06-17
Stiffness sensing fuels matrix-driven metabolic reboot for kidney repair and regeneration
2025-Jun-26, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过组织工程、遗传和药理学模型及多组学技术,揭示了微纤维相关蛋白2(Mfap2)在急性肾损伤后肾脏修复中通过感知基质刚度驱动代谢重启的关键作用 首次发现Mfap2作为细胞外基质力学传感器通过Esr2-Lats1非经典通路调控肾小管代谢重编程,将组织刚度与肾脏修复的代谢需求联系起来 NA 阐明急性肾损伤后细胞外基质驱动的肾脏修复机制,特别是Mfap2在机械信号转导和代谢调控中的作用 小鼠急性肾损伤模型中的肾脏细胞(成纤维细胞、周细胞、肾小管细胞)及脱细胞基质 机器学习和多组学分析 急性肾损伤 蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、空间转录组学、组织工程、遗传模型 NA 蛋白质组、磷酸化蛋白质组、空间转录组数据 NA NA 空间转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学 NA NA
254 2026-06-17
Single-cell transcriptomics reveal differences between chorionic and basal plate cytotrophoblasts and trophoblast stem cells
2025-Jun-11, Research square
研究论文 通过单细胞转录组学分析,比较早期和晚期妊娠早期胎盘绒毛细胞滋养层细胞、基底板和绒毛膜板细胞滋养层细胞及滋养层干细胞间的差异 首次揭示不同妊娠周龄和胎盘区域(基底板与绒毛膜板)细胞滋养层细胞的转录多样性,并发现滋养层干细胞最类似绒毛外滋养层前体细胞 研究未涉及功能验证实验,且样本量有限,可能限制结果的普适性 探究早期和晚期妊娠早期胎盘绒毛细胞滋养层细胞与滋养层干细胞的转录差异,并明确后者的细胞起源 早期(6-8周)和晚期(12-14周)妊娠早期胎盘绒毛组织,基底板和绒毛膜板区域细胞滋养层细胞,以及三种滋养层干细胞系 单细胞转录组学 正常妊娠 单细胞RNA测序,空间转录组学(GeoMx) NA 基因表达数据,空间转录组数据 多个胎盘组织样本(早期和晚期各阶段)及三种滋养层干细胞系,具体数量未说明 10x Genomics, NanoString 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, NanoString GeoMx 10x Chromium单细胞3'测序,NanoString GeoMx空间转录组学
255 2026-06-17
Aberrant STAT signaling drives T cell dysregulation in a targetable pediatric sepsis endotype
2025-May-23, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 通过整合深度免疫表型分析、血浆蛋白质组学、单细胞转录组学和磷酸流式细胞术,在88名危重症儿童的前瞻性队列中鉴定了儿童脓毒症的一个免疫亚型,其特征为IL-6/IFN-γ驱动的T细胞功能异常,并指出JAK/STAT轴作为潜在免疫调节治疗靶点 首次通过整合多组学方法在儿童脓毒症中定义了一个以IL-6/IFN-γ驱动T细胞功能障碍为特征的免疫亚型,并揭示STAT信号异常在其中的关键作用,为靶向治疗提供了新方向 样本量较小(88名儿童),且为单中心研究,可能限制结果的普适性;未对JAK/STAT抑制剂进行干预性验证 阐明儿童脓毒症中导致疾病异质性的免疫机制,并识别可靶向的免疫亚型 88名危重症儿童 机器学习 脓毒症 RNA-seq, 血浆蛋白质组学, 磷酸流式细胞术 无监督聚类 血浆细胞因子数据、单细胞转录组数据、蛋白质组数据、流式细胞术数据 88名危重症儿童 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
256 2026-06-17
Spatially Resolved Panoramic in vivo CRISPR Screen via Perturb-DBiT
2025-May-08, Research square
研究论文 提出Perturb-DBiT方法,实现在同一组织切片上同时进行空间全转录组RNA和单导向RNA的共测序,用于全景式体内CRISPR筛选 首次实现空间分辨的体内CRISPR筛选,能够同时测序全转录组总RNA和sgRNA,并检测小RNA和长链非编码RNA的调控变化 当前方法仅能检测小规模扰动面板和少量蛋白编码RNA,本文虽有所突破但可能仍存在组织处理复杂度及适用性限制 开发一种可在天然组织环境中无偏检测基因扰动对RNA调控、细胞动力学及组织结构影响的空间全转录组CRISPR筛选方法 人类癌症转移定植模型和免疫健全同源小鼠模型中的肿瘤组织切片 数字病理学 癌症 空间转录组学、CRISPR筛选、全转录组测序 NA 空间转录组数据、总RNA测序数据、sgRNA测序数据 人类癌症转移定植模型中的肿瘤集落连续组织切片,以及免疫健全同源小鼠模型的肿瘤组织切片 NA 空间转录组学 Perturb-DBiT Perturb-DBiT方法用于空间全转录组总RNA和sgRNA的碱基层面共测序
257 2026-06-17
Exploring OLR1-mediated inflammatory mechanisms in the hematoma microenvironment of acute intracerebral hemorrhage
2025-05-07, Neuroscience IF:2.9Q2
研究论文 探索OLR1介导的急性脑出血血肿微环境中的炎症机制 首次通过单细胞RNA测序和生物信息学分析揭示了OLR1在急性脑出血血肿微环境中的上调及其与单核细胞和巨噬细胞活性的相关性,提出OLR1作为潜在生物标志物和治疗靶点 未明确说明局限性 研究OLR1在急性脑出血血肿微环境中的免疫反应和疾病进展中的作用 急性脑出血患者的外周血、脑组织和血肿样本 数字病理学 脑血管疾病 单细胞RNA测序,实时定量PCR NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 来自GEO数据集的多个数据集,包括外周血、脑组织和血肿样本,具体数量未说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
258 2026-06-17
Harnessing omics data for drug discovery and development in ovarian aging
2025-05-01, Human reproduction update IF:14.8Q1
综述 本文综述了多组学数据在卵巢衰老药物发现与开发中的应用,包括基因组、转录组、蛋白质组、代谢组和微生物组数据 综合了从组织水平和单细胞视角分析卵巢衰老相关的多组学数据,并探讨如何利用这些新兴数据集识别新药靶点以指导治疗策略 未提及具体限制,但可能包括现有数据源的不足或方法的局限性 综合卵巢衰老相关的多组学数据,探索如何利用这些数据发现新药靶点并指导治疗策略 卵巢衰老相关机制及潜在药物靶点 机器学习 卵巢衰老 多组学、单细胞技术、空间转录组学 深度学习、机器学习 多组学数据 不适用 不适用 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Visium 单细胞多组学和空间转录组学平台用于组织分析
259 2026-06-17
Novel insights into kidney disease: the scRNA-seq and spatial transcriptomics approaches: a literature review
2025-04-08, BMC nephrology IF:2.2Q2
综述 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学(ST)在肾脏疾病研究中的应用与发展 创新点在于通过整合scRNA-seq与ST技术,以前所未有的分辨率揭示肾脏疾病中的细胞异质性、新型细胞亚群及其空间组织,为靶向治疗和精准医学提供新见解 文献本身未明确提及局限性,但综述类文章通常受限于当前技术的分辨率、样本量或整合分析的挑战 总结scRNA-seq结合ST在肾脏疾病中的应用,阐明其在理解肾脏发育、稳态和疾病进展中的细胞与分子机制 肾脏疾病中的细胞亚群及其在肾微环境中的动态相互作用 数字病理学 肾脏疾病 scRNA-seq, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
260 2026-06-17
Role of TGF-β/SMAD/YAP/TAZ signaling in skeletal muscle fibrosis
2025-03-01, American journal of physiology. Cell physiology
research paper 本研究探讨了TGF-β/SMAD/YAP/TAZ信号通路在骨骼肌纤维化中的作用机制 首次阐明YAP/TAZ作为机械敏感转录调控因子在TGF-β诱导的肌肉纤维化中决定纤维/脂肪祖细胞向肌成纤维细胞分化的关键作用 研究主要基于小鼠模型和体外细胞培养,其结论在人类肌肉纤维化疾病中的适用性尚需进一步验证 探究YAP/TAZ在TGF-β介导的骨骼肌纤维化中的作用及其作为治疗靶点的可能性 骨骼肌纤维/脂肪祖细胞、小鼠模型 machine learning 肌肉纤维化 空间转录组学分析 NA 空间转录组数据 小鼠模型样本 NA spatial transcriptomics NA NA
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